172LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNCFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 172lA00
1L26A 176LA 1L32A 1SWYA 1DYBA 1LYGA 3NYAA 1OWZA 2B6XA 1QTCA 1L61A 1CUPA 111LA 3C80A 2Q9DA 126LA 1QTZA 4OO9A 3HH4A 1L93A 1C6CA 163LA 1LI6A 1P5CA 152LA 1L47A 4LDLA 1G0MA 1OWYA 1P2RA 1L81A 137LA 1L13A 3V2YA 1T8GA 1I6SA 221LA 120LA 4I7RA 4LZMA 4W53A 3HDFA 1L95A 1C61A 3OE0A 1P7SA 1QSBA 3DN8A 1L19A 220LA 4DJHA 1C60A 155LA 168LA 1C6EA 1JTMA 196LA 1P64A 1G07A 1L99A 1PQOA 4S0WA 223LA 1L23A 1CTWA 178LA 165LA 3HUKA 1LYJA 3C83A 1L10A 1L59A 1DYCA 1D2YA 1P37A 1QS5A 4I7OA 3ODUA 1QSQA 4EPFA 3F8VA 177LA 2RH1A 4I7SA 1L94A 1L53A 1WTHA 1G1VA 2OE7X 170LA 172LA 212LA 1L71A 1L30A 2RBOA 1LYFA 187LA 1L54A 1L51A 184LA 235LA 164LA 110LA 4ARQB 4ARPA 1OVJA 1L14A 243LA 3CDTA 3SB7A 171LA 205LA 3CDVA 1XEPA 4W54A 1JQUA 3G3WA 251LA 3QAKA 1L22A 2Z6BA 3HT8A 4I7QA 1LGWA 1XJUA 3HTFA 3PDSA 2LC9A 242LA 1C6NA 222LA 4LDEA 4EPIA 1C6QA 4PJZA 4E97A 252LA 238LA 249LA 3FI5A 198LA 1QUOA 5LZMA 119LA 1L27A 3SBBC 2OU0X 206LA 1L85A 189LA 127LA 1C6IA 3C81A 1L12A 1C6KA 2B74A 1L15A 2B6TA 169LA 1CV6A 1C6JA 4I7TA 258LA 1C6LA 3GUMA 1TLAA 1CV1A 1T6HA 1L16A 1L0JA 260LA 3GUNA 1OV5A 1C63A 1L98A 122LA 1LW9A 3HTBA 4ZPUA 3HUQA 253LA 3DN4A 214LA 3NY9A 3CDOA 1L69A 3GUJA 224LA 112LA 147LA 3DMZA 1G06A 1XJTA 1L60A 158LA 1L50A 1G0QA 1L70A 2RAYX 1L38A 1C68A 1L57A 139LA 3C82A 217LA 4LDOA 226LA 246LA 3C8QA 1G0KA 3SB8A 1CUQA 3GULA 2B6ZA 4W56A 1PQJA 146LA 233LA 1QT6A 250LA 1G0JA 231LA 2B6YA 1L90A 2CUUA 1CV5A 1PQIA 1L43A 1C6HA 3G3XA 1L36A 2Q9EA 4EKSA 1ZYTA 192LA 1L0KA 1P2LA 1L42A 1T8AA 108LA 115LA 1NHBA 4GBRB 1CU6A 1L88A 143LA 1D3JA 1L02A 1L41A 247LA 3HH6A 4AQNA 3DKEX 197LA 1P56A 180LA 3NY8A 2ANVA 1QTBA 3C7YA 4IAPA 131LA 1G0PA 109LA 1L01A 1DYDA 4K5YA 3C7ZA 2RAZX 1D3NA 3DMVA 181LA 1JTNA 1D3FA 4DAJA 1L58A 4W58A 1CV3A 3DN0A 256LA 3UONA 1L52A 161LA 2RB1X 3HU8A 1PQMA 1T97A 2RBQA 4ARMB 1G0GA 175LA 1SX2A 3HTDA 188LA 3OE8A 1LWGA 4W55A 2QARC 1C6TA 244LA 1L84A 195LA 2QB0B 4I7PA 1B6IA 4I7KA 225LA 1OV7A 3GUKA 1G1WA 4I7MA 1C62A 3D4SA 1QUGA 1L77A 261LA 2ANXA 141LA 2B7XA 1C6DA 1CU5A 157LA 255LA 1K28A 1C6AA 1L34A 3V2WA 129LA 1L03A 2RBPA 1L45A 1LWKA 1L07A 1C6MA 2OE4X 1KY1A 2NTGA 1KW5A 114LA 125LA 160LA 107LA 3HWLA 1L39A 1L65A 1QTHA 150LA 7LZMA 1P36A 1L29A 3SB5A 1D2WA 1L17A 2OE9X 2IGCA 1CU3A 1EPYA 3DN2A 2RB0X 1QTDA 2RBRA 1L55A 3C7WA 1QT5A 2B73A 3CDQA 1CU0A 1QUDA 142LA 1C6BA 4YX7C 1L20A 1LGUA 4I7NA 3RUNA 2B72A 2HULA 103LA 241LA 3SBAA 2OU9A 1L24A 1KNIA 248LA 128LA 1L44A 1L63A 104LA 3OE9A 1OYUA 1QTVA 1L09A 1LI3A 3RZEA 2OTYX 102LA 254LA 3HTGA 1L66A 1P6YA 3GUOA 1LYHA 1T8FA 219LA 1G0LA 1CV0A 201LA 2HUKA 3HU9A 245LA 2RBSA 4ARQA 1QT4A 1L72A 1L79A 2LCBA 4EKQA 3HH5A 1L00A 4EJ4A 3F9LA 1QUHA 1C6PA 1CVKA 3VW7A 4W59A 1L21A 259LA 4DKLA 4EXMA 149LA 3PBLA 3GUIA 1SX7A 1CU2A 3OE6A 1L73A 1L74A 229LA 2O4WA 210LA 236LA 228LA 1CV4A 3HT6A 145LA 1C66A 1L64A 2B70A 1L96A 1DYFA 2L78A 140LA 1L68A 1L37A 2B6WA 4EKPA 1L11A 1PQKA 3C8SA 1L33A 162LA 2OTZX 173LA 4W57A 166LA 1SSYA 3SB9A 1DYEA 2B75A 1KY0A 2OU8A 3DN3A 4GRVA 1D9WA 174LA 1L35A 5I14A 151LA 1CX6A 1DYGA 1L18A 2F47A 148LE 3L2XA 1L48A 1L76A 1C65A 1L80A 3HT9A 3HH3A 191LA 1QS9A 118LA 3EMLA 1P46A 113LA 1QT3A 4EKRA 218LA 2RBNA 4ARJA 232LA 2F2QA 1SWZA 3LZMA 186LA 4W52A 183LA 3GUPA 3SB6A 3HDEA 1PQDA 144LA 1OVKA 1L28A 6LZMA 138LA 1C67A 1L25A 3K2RA 2RB2X 1L49A 1L82A 4I7JA 1LYIA 3DN6A 2OEAX 1LGXA 239LA 1L75A 190LA 3HUAA 1L56A 1L86A 2A4TA 237LA 209LA 2F32A 1L89A 1L91A 4PK0A 167LA 1L97A 3JR6A 130LA 1L31A 1L62A 4ARLA 156LA 1QT8A 159LA 1LLHA 227LA 3CDRA 1L06A 1QT7A 1C64A 2O79A 1KW7A 1P3NA 1C69A 4YXAC 3L64A 4W51A 1KS3A 1LI2A 2LZMA 182LA 3SN6R 1SSWA 1C6FA 230LA 1LYDA 1L08A 1L04A 4I7LA 1L87A 240LA 257LA 1ZWNA 1D3MA 185LA 3G3VA 4YXCA 1L92A 199LA 213LA 200LA 2O7AA 1ZURA 1L67A 2NTHA 211LA 1L46A 1LYEA 262LA 3DMXA 216LA 123LA 1LPYA 3HT7A 215LA 1DYAA 1L83A 1OVHA 234LA 1L05A 3DN1A 3FA0A 4ARMA 2HUMA 1L40A 3C8RA 1C6GA 3DNAA 3FADA 1CX7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L26A 176LA 1SWYA 3B0KA 1G7IC 1UIHA 4NGZA 5APDA 3QE8A 1L61A 1CUPA 4M6DA 1UIAA 2YBNA 1D0MA 1FDLY 4YM8A 4DDBA 1L93A 5DLAA 1REMA 1G0MA 1OWYA 1P2RA 2I6ZA 137LA 3V2YA 1I6SA 4UWNA 1JTPL 1OUBA 3A95A 4HPIA 1L95A 3HBDA 1LZSA 1GB7A 2G4NA 196LA 4S0WA 5L9JA 2YDGA 178LA 3EMSA 3TMXA 1B7PA 1B7SA 1D2YA 1DYCA 1QS5A 4I7OA 1I1ZA 3F8VA 4HV2A 1J1OY 1WTHA 2OE7X 6LYZA 1G7HC 1LYFA 1OUJA 1YQVY 1HC0A 1YKZX 4LYOA 5B1FA 4ARQB 1LZNA 3CDTA 4OOOA 1XEPA 1FLWA 1GF5A 1QIOA 5LXWA 4WM3A 2YBLA 4PJ2C 2DQFC 4QDNA 2F4GA 5F81A 3PDSA 1IWWA 3ZEKA 1YILA 1C6NA 222LA 4EPIA 4PJZA 3AJNA 1QTEA 4WM2A 5FSTA 249LA 3FI5A 198LA 1D9UA 3SBBC 2OU0X 1L85A 1LMNA 5K7OA 4NGKA 1L12A 133LA 2B6TA 1CV6A 1C6JA 4I7TA 2VB1A 1C6LA 3WPLA 2MEIA 5HNLA 3TXDA 1L0JA 2BQNA 4YENA 1C63A 5LVGA 2F2NA 1LW9A 2HTXA 1LMTA 3HFMY 3OK0A 4OWBA 208LA 253LA 4HPEA 3AGGG 1FN5A 1L69A 1LSGA 3A34A 224LA 1NHEA 3J6KA 4N1CC 1G06A 1L60A 1L50A 1DI4A 3RNXA 5LA8A 1C68A 3TXJA 3C82A 217LA 4LDOA 226LA 1REYA 3C8QA 1G0KA 4NGYA 4DQJA 1CUQA 3GULA 5D5FA 3WVYA 3VWOA 4GN3A 146LA 1PQJA 5APCA 1G0JA 231LA 5KXRA 4DC4A 1IIZA 1L90A 4IASA 1VATA 1N4FA 5AMYA 1L36A 1HMKA 3WH1A 1ZYTA 4LT3A 4NGWA 3GXRA 108LA 2PC2A 4B4EA 1L88A 1F6SA 5LVJA 3DKEX 1GB5A 1IR7A 1WQPA 1P56A 180LA 4W96A 5LVKA 3C7YA 3IJVA 1LZ5A 1G0PA 4N0JA 1C08C 5L3IA 4XJIA 1QSAA 1DYDA 4CHXA 4ETCA 1LZTA 1AT6A 1D3FA 1L58A 1CV3A 4ZIXA 4EOFA 4KT3A 1PQMA 4NSJA 1G0GA 2ZNWY 1GFKA 1C10A 1C6TA 1KXWA 244LA 1L84A 2QB0B 1HFXA 3WPKA 4I7PA 5I5QA 225LA 4I7MA 2BAAA 1BWJA 4DD7A 4GN4A 3T36A 5I4XA 2LZTA 141LA 2B7XA 3QY4A 1L03A 1OUCA 1L45A 4NGVA 1YAMA 4L41A 1L07A 1C6MA 2OE4X 1LZRA 2NTGA 1GE3A 4WL7A 2NWDX 4HJVA 1L65A 2ZILA 3LYOA 1IVMA 4R0FA 1D2WA 1BQLY 5T3FA 5FDJA 1CU3A 1QTDA 2FYDA 1JKCA 1L55A 1LHJA 4Z98A 3TXFA 1OUGA 4I7NA 1HERA 3ZVQB 5II3A 1VDQA 1FKVA 2BQHA 1QUTA 2OU9A 1L24A 1GAYA 128LA 4DD2A 1OYUA 1JUGA 1QTVA 1OUHA 1GAZA 102LA 5KXXA 3HTGA 4ANRA 1GB0A 1IOQA 3J4GA 3A3QA 1IOSA 219LA 201LA 4ARQA 4H9BA 1L79A 1L00A 1D0LA 1LJ3A 1C6PA 2BQKA 1LHLA 5B07A 4GN5C 3OE6A 1LMCA 229LA 228LA 2Q0MX 3TXIA 1CV4A 5APFA 1BB5A 5KXMA 1I20A 145LA 1C66A 1L64A 1DKKA 3LHMA 5LIOA 1GFTA 1LSNA 4I8SA 1L33A 2OTZX 4W57A 3T6UA 1DYEA 1KY0A 2DQGY 1D9WA 174LA 1GFAA 1LZGA 3K3TA 5DN4A 1L18A 1L48A 3HT9A 4YEMA 2G4QA 4DDCA 2Z12A 2ZNXY 4GCDA 1QT3A 2Z2EA 4NGJA 2BQOA 2HEFA 3AZ7A 1C46A 2D4KA 1GBZA 1LZEA 4EMNA 2DQEY 4W94A 4PHIA 3HDEA 4G4BA 6LZMA 4B49A 1C67A 4I7JA 3ATOA 1LYIA 4NGLA 4NHIA 1RJCB 4N9RA 4HJZA 3ULRA 4H93A 1GFGA 209LA 1L91A 1KXXA 130LA 2XQOA 3CSZA 4HJYA 1QDTA 1KS3A 182LA 1UA6Y 4D9ZA 5KJ9A 4I7LA 1UICA 4H8XA 1ZWNA 3BKVA 2LYOA 3P4ZA 5KKIA 3WL2A 2W1LA 1JSEA 213LA 2O7AA 211LA 5IHGA 5F14A 123LA 4NGIA 1OVHA 3A94A 1FBIX 2HUMA 1XEJA 3A8ZA 3HBHA 1OWZA 2DQJY 3WUAA 111LA 1LZ1A 3C80A 5F16A 1B5ZA 3IJUA 1XEKA 4BAPA 152LA 1B2KA 4QEQA 1LZDA 3WXTA 3A93A 4NFVA 1L13A 4P2EA 1IWTA 193LA 4XJDA 1NWGA 3W6EA 4NY5A 2MEEA 3LZTA 4I7RA 3OE0A 1QQYA 3WU8A 1HFZA 1L19A 220LA 3CSRA 1C60A 5APEA 1UIFA 1CJ9A 4Z41A 168LA 3FE0A 3ZVQA 1L99A 1PQOA 4MCKA 1LZBA 165LA 2BQFA 1LYJA 5B05A 1L10A 2MEBA 2ZWBA 1QSQA 1DXJA 1FLQA 2RH1A 1J1PY 4IATA 1HEOA 2DQAA 1GFVA 172LA 2MEAA 2RBOA 187LA 4M4OA 184LA 2BQAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L26 A;  176L A;  1SWY A;  3B0K A;  1G7I C;  1UIH A;  4NGZ A;  5APD A;  3QE8 A;  1L61 A;  1CUP A;  4M6D A;  1UIA A;  2YBN A;  1D0M A;  1FDL Y;  4YM8 A;  4DDB A;  1L93 A;  5DLA A;  1REM A;  1G0M A;  1OWY A;  1P2R A;  2I6Z A;  137L A;  3V2Y A;  1I6S A;  4UWN A;  1JTP L;  1OUB A;  3A95 A;  4HPI A;  1L95 A;  3HBD A;  1LZS A;  1GB7 A;  2G4N A;  196L A;  4S0W A;  5L9J A;  2YDG A;  178L A;  3EMS A;  3TMX A;  1B7P A;  1B7S A;  1D2Y A;  1DYC A;  1QS5 A;  4I7O A;  1I1Z A;  3F8V A;  4HV2 A;  1J1O Y;  1WTH A;  2OE7 X;  6LYZ A;  1G7H C;  1LYF A;  1OUJ A;  1YQV Y;  1HC0 A;  1YKZ X;  4LYO A;  5B1F A;  4ARQ B;  1LZN A;  3CDT A;  4OOO A;  1XEP A;  1FLW A;  1GF5 A;  1QIO A;  5LXW A;  4WM3 A;  2YBL A;  4PJ2 C;  2DQF C;  4QDN A;  2F4G A;  5F81 A;  3PDS A;  1IWW A;  3ZEK A;  1YIL A;  1C6N A;  222L A;  4EPI A;  4PJZ A;  3AJN A;  1QTE A;  4WM2 A;  5FST A;  249L A;  3FI5 A;  198L A;  1D9U A;  3SBB C;  2OU0 X;  1L85 A;  1LMN A;  5K7O A;  4NGK A;  1L12 A;  133L A;  2B6T A;  1CV6 A;  1C6J A;  4I7T A;  2VB1 A;  1C6L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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