175LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRAAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 175lA00
1L34A 1C6FA 1L63A 1L99A 1G06A 157LA 1L27A 4I7MA 1LLHA 118LA 3V2WA 1SX7A 1QTZA 1D3JA 3HH6A 1L70A 1OYUA 1L18A 3SN6R 209LA 3HDFA 1LW9A 115LA 195LA 234LA 2LZMA 1L97A 165LA 212LA 2RB2X 3OE6A 1L80A 158LA 1P2RA 1L48A 2QARC 4ARMA 1DYEA 1L38A 1LGUA 3DN3A 4ZPUA 2O7AA 252LA 2O4WA 4E97A 1SSYA 233LA 1L19A 1L98A 2OEAX 1L16A 1QTHA 1DYFA 1OVJA 1L10A 3GUPA 5I14A 1L41A 1JQUA 257LA 2HUKA 2ANVA 1EPYA 1P56A 1TLAA 167LA 171LA 2HUMA 1QT4A 3DN8A 2RBPA 181LA 4W52A 3DN0A 3HTFA 2RB1X 1LYIA 1P2LA 1L31A 1DYDA 260LA 1PQMA 1LYFA 1L0KA 2ANXA 249LA 151LA 4I7TA 1P36A 254LA 1L11A 147LA 164LA 1CV6A 214LA 228LA 1CV1A 1L45A 1L57A 1L08A 2B70A 192LA 201LA 5LZMA 1L14A 1OV5A 1CV4A 4ARPA 146LA 2OTYX 3OE0A 1L93A 1XEPA 152LA 239LA 4I7PA 1QTCA 1SWZA 197LA 3OE8A 126LA 1L66A 1XJTA 1L28A 1L67A 3DNAA 183LA 1C63A 1L20A 1L36A 1L84A 210LA 4I7KA 1L30A 122LA 191LA 3RUNA 1D2YA 188LA 199LA 1CV0A 3C80A 180LA 259LA 1C6JA 1C6TA 247LA 1C62A 1G0JA 1WTHA 3NY9A 2HULA 114LA 2Q9EA 1L12A 4DKLA 3RZEA 1L13A 1L53A 1L76A 1PQIA 182LA 1L37A 2OU9A 123LA 1L32A 1L64A 4I7QA 4GBRB 1K28A 241LA 224LA 172LA 243LA 1L07A 1G0MA 1L75A 2B74A 4EKPA 1L68A 2L78A 3HH3A 4I7NA 1D3FA 2RAZX 2F32A 1L40A 170LA 1L95A 1OV7A 3NYAA 102LA 1L87A 1L15A 236LA 1CU3A 1C6CA 3SB9A 3DMZA 111LA 142LA 4ARQB 3DMXA 3CDTA 160LA 4W53A 3GUKA 1L22A 129LA 1LYGA 1QUDA 1QTBA 1L06A 3CDQA 4I7JA 1LYEA 155LA 1C6AA 130LA 1KNIA 3DN4A 1QT8A 3SBAA 250LA 4EPIA 2Z6BA 3HTBA 1OWZA 1L33A 219LA 1P64A 4LZMA 2B6ZA 3SB7A 1C6GA 1C6HA 184LA 4LDEA 4YXAC 4GRVA 3LZMA 196LA 1C66A 1L21A 3C81A 1D3MA 156LA 119LA 3G3WA 3OE9A 1L00A 1L52A 3CDVA 3HH5A 1CUQA 1C6IA 4DAJA 2F2QA 125LA 1L73A 4I7SA 1XJUA 1L74A 2B72A 3EMLA 4EJ4A 1L04A 4W54A 139LA 244LA 1L54A 2RBRA 1C6PA 1CUPA 127LA 169LA 1C6QA 1LYHA 251LA 256LA 242LA 1CV5A 3GUNA 218LA 229LA 113LA 4ARMB 3VW7A 227LA 3FA0A 1SWYA 4W55A 1L46A 3HUKA 4W51A 2RH1A 1LYDA 1L86A 3HU9A 3SBBC 2OE7X 176LA 3GUOA 159LA 2RBSA 190LA 4ARLA 109LA 110LA 1L65A 1L23A 107LA 225LA 1L81A 2B6YA 1QT7A 2RB0X 1QUGA 3UONA 1CU5A 1QS9A 1C68A 1ZYTA 1L60A 1B6IA 3NY8A 186LA 104LA 1C6KA 3HT7A 1ZURA 3HT6A 1P6YA 4YX7C 3SB5A 161LA 1CTWA 1L55A 1LWGA 4W56A 1P7SA 1T8GA 231LA 1QSQA 1SSWA 3FADA 1CU2A 1G0KA 1NHBA 4W57A 1PQKA 1QUOA 1CX6A 3GUMA 1SX2A 211LA 3DN6A 1L69A 248LA 1ZWNA 1CU0A 4I7RA 1CU6A 1LI2A 1OVHA 2OE4X 1CVKA 3C8SA 215LA 4EKQA 1L91A 145LA 2CUUA 3HU8A 3G3VA 148LE 1C61A 4IAPA 1L51A 1L79A 3CDOA 1QS5A 3HDEA 3K2RA 1L83A 7LZMA 1L90A 2NTGA 3QAKA 222LA 1C64A 185LA 240LA 189LA 166LA 1LI3A 3HH4A 1QTVA 4LDOA 3GUIA 108LA 1L29A 1L47A 1L44A 258LA 2RBOA 1LWKA 3PBLA 1L59A 261LA 3C83A 3HTDA 112LA 262LA 2LCBA 1C6EA 3F8VA 4LDLA 3V2YA 4ARJA 3HT9A 1L72A 3HT8A 1L01A 1D9WA 223LA 213LA 1JTNA 103LA 3C7YA 4DJHA 1L56A 1L43A 1G0PA 1LYJA 162LA 2RBNA 1L82A 144LA 3GUJA 4PJZA 4EPFA 1L03A 1C6NA 1T97A 3HUAA 1KW5A 1L85A 173LA 3F9LA 1L96A 1G1VA 1L24A 1CV3A 1QTDA 205LA 3C8QA 137LA 131LA 3HUQA 1L09A 1L88A 3L2XA 3DKEX 3SB6A 1D2WA 246LA 3HTGA 6LZMA 4I7OA 1C6DA 2OE9X 1QSBA 2Q9DA 174LA 3DN1A 1I6SA 1C6MA 1D3NA 255LA 253LA 4EXMA 216LA 175LA 150LA 1L89A 1LPYA 1L17A 1DYAA 1QUHA 128LA 3ODUA 1PQOA 2B6WA 1L62A 4AQNA 1LGXA 3CDRA 238LA 1LGWA 3JR6A 230LA 3DMVA 1T8FA 1L35A 220LA 4I7LA 4K5YA 198LA 2A4TA 2F47A 2RAYX 1C65A 3L64A 1KS3A 1KW7A 1DYCA 2B73A 3C8RA 1JTMA 4S0WA 1L39A 2B75A 4EKSA 206LA 1PQDA 1C6LA 232LA 1L92A 4EKRA 120LA 1L05A 1T6HA 3C7WA 3PDSA 1CX7A 1C69A 1DYGA 1KY1A 3G3XA 3GULA 1LI6A 141LA 1L02A 1L77A 3D4SA 2B6XA 2IGCA 3C82A 3DN2A 3C7ZA 1G1WA 1L58A 1P5CA 1L94A 237LA 4OO9A 1L25A 1QT3A 1G0QA 1DYBA 1L50A 1L61A 2NTHA 4PK0A 1G0GA 1OVKA 1T8AA 1L26A 4ARQA 1C67A 163LA 2O79A 2OU8A 200LA 140LA 245LA 143LA 177LA 221LA 187LA 2OU0X 1P37A 3HWLA 1L71A 2B7XA 1L42A 1QT6A 1C60A 217LA 1P46A 1OWYA 1L0JA 2QB0B 4YXCA 1G07A 3FI5A 1G0LA 1QT5A 1KY0A 1C6BA 138LA 1P3NA 1PQJA 149LA 4W59A 235LA 3SB8A 168LA 226LA 2RBQA 2B6TA 2OTZX 2LC9A 1L49A 178LA 4W58A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L34A 4DD9A 3WPLA 4G9SA 4I7MA 1NDGC 118LA 3V2WA 1SX7A 4NG8A 1LW9A 115LA 234LA 1L97A 2RB2X 1PZYA 4TUNA 3HFMY 5LVGA 4M6DA 4NHSA 4ARMA 1L48A 1DYEA 4R0FA 2EKSC 4H9FA 4QGZA 1QTEA 233LA 4NWEA 3E3DA 1CKDA 1L19A 1IOQA 1YKYX 1DYFA 4NGWA 3GUPA 4NGZA 1JQUA 2HUKA 5L9JA 2HU3A 1UICA 2BQEA 5KXTA 4TX7A 3DN8A 1GF6A 1JTPL 4NY5A 1IY4A 5LA5A 1DYDA 1IP2A 4W94A 4H8ZA 2ANXA 5FEKA 249LA 1LZ9A 5M1YA 1EQEA 2YBHA 1NQIA 1CKFA 164LA 3A3RX 1LMAA 1UBZA 1VEDA 5KXRA 228LA 5F16A 5JENB 134LA 1LZTA 1GBWA 3D9AC 3FE0A 239LA 1IX0A 1SWZA 1LZ6A 2NWDX 1GWDA 4H91A 3DNAA 4GN5C 1FN5A 1C63A 1WQPA 1L20A 1KIPC 4RLNA 3WPJA 1ALCA 2Z37A 4ETEA 180LA 1LZGA 259LA 1QSAA 1C6TA 247LA 1G0JA 2DQGY 1B7OA 1YANA 4HV2A 1JSEA 2OU9A 1L32A 241LA 5FELA 3VWOA 172LA 1NHEA 2ZNXY 4CFOA 3CSZA 1G0MA 1L75A 1VDTA 2HEEA 4Z98A 1LMTA 4NGOA 2LZ2A 2RAZX 170LA 1OV7A 102LA 4WLYA 4LYZA 1IOCA 3DMZA 3AB6A 4BAPA 4B0DA 4W53A 3GUKA 5KXZA 4YM8A 1LZ8A 135LA 3WUMA 5LVIA 1NBYC 1LYGA 1LYEA 2MEFA 1ZMYL 4EPIA 2Z6BA 3SB7A 1GF7A 1P64A 2B6ZA 1LSYA 5KY1A 1REZA 4GRVA 3LZMA 1LMOA 1GF8A 1LZCA 1L21A 1D3MA 2I26L 1L00A 2HEFA 1WVVA 1C6IA 2F2QA 125LA 4I7SA 4PRUA 1OUGA 1XJUA 3W6DA 1JTOL 1I56A 1I1ZA 1TDYA 139LA 1GDXA 244LA 4NSHA 4M4OA 2ZIKA 2RBRA 5ILCA 3A67Y 4WM2A 1CUPA 1WVUA 1JKCA 1C6QA 1WQMA 1LYHA 256LA 1GB9A 3AZ7A 1LSFA 218LA 1HMLA 4H9CA 3VW7A 4UWNA 2HUBA 3FA0A 1G7JC 4W51A 1UA6Y 4IATA 5A3EA 3EBAB 1IIZA 107LA 1G7MC 1IWUA 4RDSA 2MEGA 8LYZA 3TMUA 1NBZC 1OUBA 5KKJA 1HELA 1QUSA 1ZYTA 3EMSA 2CGIA 1NF5A 1XEJA 3HT7A 3HT6A 3A95A 5KJ9A 5APCA 5FDJA 1LWGA 3TXIA 1TBYA 5DLAA 1P7SA 5LINA 3ATNA 2W1XA 1BWHA 3GUMA 4TSCA 2HU1A 1L69A 1OQMA 2XJWA 2BQCA 5I54A 4G49A 4DQ7A 4DD2A 3OJPA 2CUUA 4IAPA 3G3VA 3CDOA 1GFKA 1V7SA 222LA 1C64A 1EQ4A 1YROA 1OUIA 1LI3A 1GEZA 1QTVA 4LDOA 3GUIA 2W1LA 5IDDA 4LT3A 4YOPA 1L29A 1NKHA 258LA 1L59A 261LA 112LA 3HT8A 1L72A 3WXTA 1L01A 1D9WA 223LA 1TAYA 213LA 4DJHA 1LYYA 3A6BY 2Y8PA 4NHPA 4HPEA 1JSFA 2ZQ4A 4QEQA 5KXMA 3LYMA 1LYJA 4FJRA 4DD3A 3AJNA 1UIFA 1L82A 144LA 1L85A 173LA 1L96A 3C8QA 1HEWA 1LPIA 5HNLA 1L09A 1L88A 1JKDA 3L2XA 3T6UA 4H9IA 1D2WA 1JHLA 246LA 3HTGA 5D5CA 2Q9DA 2H5ZA 4OWAA 3DN1A 1C6MA 1D3NA 5KXNA 2GV0A 175LA 4OWHA 1JUGA 150LA 4YEOA 4WO6A 2RSCA 128LA 1MLCE 3ODUA 1YAPA 1RCMA 1L62A 1LTMA 1LGXA 1OP9B 1B7LA 238LA 1LGWA 3JR6A 3DMVA 1LKRA 5KXPA 1XEKA 198LA 2A4TA 1C65A 3L64A 208LA 3GXRA 1KW7A 1B7QA 1JTMA 4GCEA 1L39A 1IP3A 2B75A 5B05A 3RU5A 232LA 1LSAA 3PDSA 1IEEA 4QDNA 1UC0A 5HQ1A 1XSFA 2Z2EA 2IGCA 1SLYA 3DN2A 2EIZC 1QT3A 1G0QA 1L61A 1GPQC 1LZSA 2HEAA 1GBYA 4QY9A 1C67A 2DQAA 200LA 2Q0MX 221LA 3TXKA 1P37A 3HWLA 1L71A 1HEPA 1QT6A 2Z18A 4PPOA 1OWYA 4YXCA 1G0LA 3ATOA 1F6RA 2WARA 1FKQA 3HBDA 149LA 1JKAA 3SB8A 168LA 1D9UA 3TXGA 2RBQA 1B7PA 2OTZX 2LC9A 207LA 178LA 4W58A 1HEOA 1L63A 3QNGA 157LA 1LAAA 1L27A 2BQGA 1DPXA 1HC0A 1CJ7A 209LA 4II8A 195LA 4R6CA 4OWBA 165LA 212LA 3OE6A 3A96A 1G7LC 4WL7A 2QARC 4ZPUA 1VATA 3AZ6A 2O4WA 4WG1A 1NWGA 1GB5A 1BVKC 1CKGA 1LSMA 1GB3A 1IP7A 1YAMA 4XJHA 5I14A 1L41A 2ANVA 1EPYA 1P56A 1WQOA 1WQQA 1REMA 4NHTA 181LA 5D5FA 4W52A 5F9UA 1P2LA 1L31A 1BWJA 4LZTA 3RZ4A 1L0KA 5HLLA 1XGRC 1P36A 3AW6A 1GF4A 1L11A 4XYYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1L34 A;  4DD9 A;  3WPL A;  4G9S A;  4I7M A;  1NDG C;  118L A;  3V2W A;  1SX7 A;  4NG8 A;  1LW9 A;  115L A;  234L A;  1L97 A;  2RB2 X;  1PZY A;  4TUN A;  3HFM Y;  5LVG A;  4M6D A;  4NHS A;  4ARM A;  1L48 A;  1DYE A;  4R0F A;  2EKS C;  4H9F A;  4QGZ A;  1QTE A;  233L A;  4NWE A;  3E3D A;  1CKD A;  1L19 A;  1IOQ A;  1YKY X;  1DYF A;  4NGW A;  3GUP A;  4NGZ A;  1JQU A;  2HUK A;  5L9J A;  2HU3 A;  1UIC A;  2BQE A;  5KXT A;  4TX7 A;  3DN8 A;  1GF6 A;  1JTP L;  4NY5 A;  1IY4 A;  5LA5 A;  1DYD A;  1IP2 A;  4W94 A;  4H8Z A;  2ANX A;  5FEK A;  249L A;  1LZ9 A;  5M1Y A;  1EQE A;  2YBH A;  1NQI A;  1CKF A;  164L A;  3A3R X;  1LMA A;  1UBZ A;  1VED A;  5KXR A;  228L A;  5F16 A;  5JEN B;  134L A;  1LZT A;  1GBW A;  3D9A C;  3FE0 A;  239L A;  1IX0 A;  1SWZ A;  1LZ6 A;  2NWD X;  1GWD A;  4H91 A;  3DNA A;  4GN5 C;  1FN5 A;  1C63 A;  1WQP A;  1L20 A;  1KIP C;  4RLN A;  3WPJ A;  1ALC A;  2Z37 A;  4ETE A;  180L A;  1LZG A;  259L A;  1QSA A;  1C6T A;  247L A;  1G0J A;  2DQG Y;  1B7O A;  1YAN A;  4HV2 A;  1JSE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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