176LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHTLKVDGNSNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 62
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 176lA00
3HT7A 1JQUA 3SB6A 1LPYA 247LA 4E97A 1LYIA 3G3VA 1QTVA 1L58A 232LA 122LA 165LA 112LA 3F9LA 1C6TA 1C6LA 1L07A 1QUDA 1D2YA 2B70A 2B74A 1C6HA 1L19A 1C62A 1L64A 3LZMA 1QT7A 2B7XA 3C83A 1QTDA 1CV1A 1CX7A 1L55A 4ZPUA 1L05A 4LDEA 170LA 1CV3A 1L57A 3SN6R 2F47A 3DMZA 1L23A 1QT5A 3NY9A 1NHBA 3GUJA 1DYFA 2O4WA 1L46A 1G0JA 1CU2A 1OV7A 1D3FA 125LA 1L87A 1L50A 1L89A 3DN0A 1C6PA 1L28A 235LA 2B75A 259LA 138LA 1L53A 104LA 1L12A 1OVKA 2RB2X 3C82A 3V2WA 4ARJA 1L15A 1T97A 1C68A 1C6JA 3RUNA 2HUKA 1CX6A 200LA 1L52A 1L14A 1L54A 4I7RA 1EPYA 2B6WA 240LA 2B6ZA 1L73A 1L75A 2QARC 1K28A 262LA 1L10A 249LA 114LA 4EPFA 3CDTA 4I7OA 184LA 1L90A 142LA 3HH5A 111LA 1L69A 4K5YA 3HDEA 1L41A 3L2XA 1C6AA 3CDQA 3HU9A 1L79A 1DYAA 181LA 162LA 1SWZA 223LA 3DN3A 1DYDA 1QS5A 1P6YA 1XJUA 205LA 1L86A 3SB7A 1L94A 3DNAA 139LA 149LA 1CTWA 1L16A 1ZYTA 4EKPA 3SBBC 1C61A 1L97A 1L36A 3GUKA 221LA 182LA 1L35A 3C7YA 1L91A 4LDOA 1CU5A 1C6EA 4W57A 3L64A 4GRVA 4ARLA 2RAYX 1L76A 1L0JA 3C8RA 2B6YA 1C65A 1L65A 237LA 1L81A 2OU8A 3GUNA 1P2RA 190LA 171LA 113LA 2HUMA 172LA 2RAZX 229LA 1OV5A 176LA 1L26A 1L84A 1DYEA 173LA 1L72A 1L31A 108LA 3UONA 1CU0A 4YXAC 3FADA 1SWYA 1C60A 213LA 1G0GA 107LA 1LYGA 4EKQA 1L38A 3GUMA 130LA 127LA 145LA 1P3NA 224LA 3C8QA 3SB5A 1L30A 1WTHA 4I7NA 147LA 159LA 1KW5A 178LA 2OTYX 1L09A 196LA 1JTNA 1QSQA 1LGXA 5I14A 1CU3A 2F2QA 109LA 189LA 3VW7A 4DKLA 212LA 225LA 3EMLA 3PDSA 1L70A 1I6SA 3ODUA 4DJHA 1OYUA 1LYDA 2OE9X 1L92A 2RBPA 3HWLA 5LZMA 2OEAX 167LA 115LA 2RB1X 3CDVA 187LA 195LA 4I7JA 1L24A 216LA 2B72A 1L17A 3DMVA 2L78A 3JR6A 188LA 1L56A 1CVKA 1G0KA 243LA 2RBSA 3GUPA 119LA 1QUHA 3C7ZA 1L44A 1QT6A 3HDFA 198LA 118LA 1L32A 3OE6A 3HH3A 1LGUA 1SSWA 4S0WA 4EPIA 2O7AA 3GUIA 3C8SA 1SX2A 6LZMA 4GBRB 245LA 1L18A 1OWZA 222LA 230LA 157LA 4I7TA 4PK0A 143LA 4I7PA 3NYAA 1L25A 140LA 1P46A 1D3NA 2NTHA 1OWYA 1PQKA 1KY1A 1KS3A 2HULA 3DN4A 1G0LA 1KY0A 1CUQA 110LA 4DAJA 1D2WA 1PQMA 3GULA 2OU9A 218LA 1L20A 1LWGA 1PQJA 3HU8A 1L49A 4AQNA 3RZEA 1KNIA 1L99A 168LA 2LZMA 1B6IA 1C69A 1P2LA 209LA 226LA 1PQOA 3HTBA 3PBLA 241LA 236LA 4ARQB 146LA 1C6CA 166LA 211LA 4OO9A 1L04A 1T6HA 1LI2A 2B6TA 215LA 2CUUA 239LA 248LA 1T8AA 3DKEX 185LA 1L03A 4I7SA 1LI6A 1C66A 256LA 1OVJA 260LA 3QAKA 3D4SA 2RBQA 210LA 1L22A 1LLHA 1PQDA 4W52A 123LA 257LA 253LA 3C80A 3DN2A 4EXMA 174LA 155LA 1T8FA 1C67A 126LA 1L42A 169LA 1L62A 1L0KA 4IAPA 228LA 1P7SA 1QS9A 1L77A 220LA 3OE9A 1C6KA 103LA 3DMXA 4I7LA 1L93A 144LA 2RB0X 3FI5A 3DN1A 1G07A 192LA 1L06A 1QTZA 1C6FA 1L61A 1OVHA 2ANVA 1P5CA 186LA 2OE7X 2RBRA 3DN6A 3HH6A 2LC9A 1QTHA 1LWKA 148LE 129LA 1L51A 1ZURA 1TLAA 4LDLA 4I7KA 1C6IA 3GUOA 1L29A 156LA 1L74A 1L40A 4ARQA 3HUQA 2O79A 3HT8A 1L34A 227LA 251LA 1KW7A 4W59A 4W56A 1QT3A 1L82A 1DYBA 1L71A 3C7WA 252LA 2RBOA 255LA 258LA 177LA 4LZMA 4I7QA 3SB8A 1L47A 151LA 1JTMA 1DYCA 1L60A 1LI3A 1D3MA 164LA 1P36A 4EKRA 4ARMB 4W55A 1C6MA 1XEPA 3HTDA 1L21A 3HUAA 1L02A 3G3WA 3HT6A 1CV0A 1C6QA 1QUGA 1L95A 3HH4A 2B6XA 206LA 1D9WA 3HTFA 231LA 1G06A 2F32A 1G0PA 234LA 150LA 3HUKA 3SBAA 3CDOA 1QTBA 128LA 4YX7C 1CUPA 191LA 1L01A 2IGCA 1L66A 1C6NA 219LA 4YXCA 1L80A 1QT4A 3V2YA 1LYJA 1QTCA 2QB0B 1L48A 1L13A 2OE4X 4I7MA 2ANXA 7LZMA 3G3XA 1G0QA 1C6GA 1SSYA 1C6DA 1LW9A 141LA 246LA 163LA 183LA 199LA 1L67A 1LYFA 1LYHA 1L59A 1T8GA 2B73A 4W54A 1L08A 244LA 3F8VA 1QSBA 4W53A 261LA 1G1VA 1L43A 3SB9A 1L00A 1L98A 2A4TA 1P37A 131LA 1LGWA 1L45A 4ARPA 1ZWNA 1XJTA 1L88A 3HTGA 1DYGA 2Z6BA 180LA 1L37A 250LA 1C63A 1L11A 4PJZA 161LA 1L85A 4ARMA 1L96A 3CDRA 1L39A 242LA 2OTZX 1L63A 160LA 1D3JA 2Q9EA 3C81A 158LA 1QT8A 1L33A 2LCBA 3HT9A 3OE0A 1QUOA 4W51A 152LA 1PQIA 4W58A 1CV5A 254LA 175LA 1LYEA 3OE8A 238LA 1C64A 1G1WA 1P56A 3NY8A 2Q9DA 1L27A 2NTGA 102LA 137LA 1G0MA 197LA 217LA 1C6BA 1L68A 120LA 1L83A 3DN8A 3K2RA 4EKSA 214LA 1SX7A 2RH1A 1CU6A 1P64A 233LA 1CV6A 201LA 2OU0X 2RBNA 4EJ4A 3FA0A 1CV4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1UIFA 3SB6A 4WLDA 1CKDA 4E97A 4LT2A 3P65A 1GDWA 1IO5A 1IEEA 1QUDA 2A7FA 1FLUA 1D2YA 1B5XA 4UWUA 1OUBA 2F30A 2YBLA 3LZMA 3CT0A 3MGWA 1LYSA 4Z3MA 1L05A 3DMZA 1GAYA 1QT5A 1UIEA 1L46A 4OWEA 1G0JA 1CU2A 1D3FA 4DDBA 2ZWBA 1JITA 1C6PA 4KXIA 2B75A 4XJBA 1IP6A 259LA 1UIAA 3V2WA 104LA 3WPKA 1Z55A 1LJGA 1L15A 1IP1A 3RUNA 2HUKA 1CX6A 1YKYX 5DLAA 1L54A 5KKJA 1IP4A 1EPYA 3TXEA 4NWHA 1I56A 1L10A 114LA 184LA 1BVKC 1IWTA 5IHGA 2D4KA 3WXTA 2DQEY 1C6AA 1L79A 162LA 4HJVA 223LA 205LA 2CWIA 1OUGA 4HJZA 3SB7A 1GB8A 1CKGA 1CTWA 4ZIXA 2D91A 4EKPA 2HEFA 3CB7A 4ET8A 182LA 1L35A 3C7YA 1JPOA 1CU5A 3OK0A 5B59A 1LHIA 4NGLA 1VDPA 4W57A 4M4OA 1L76A 3C8RA 1HNLA 1GFTA 1L81A 1P2RA 190LA 2AUBA 1OV5A 1L72A 4TX7A 5KXOA 4WM2A 2GV0A 3G3AB 4DDAA 3ZVQB 1LYGA 2ZNXY 6LYZA 2FBDA 1GXXA 1YIKA 1LMOA 5KXSA 4PHIA 1GBXA 3TXFA 3FI7A 1IC7Y 1I20A 3A92A 3KAMA 4EOFA 1YILA 189LA 1YQVY 4N1EI 5D5CA 1IR7A 1L70A 1I6SA 2YDGA 4WL6A 1LZ8A 1LYDA 1HMLA 2OE9X 5LZMA 3HWLA 2OEAX 4YOPA 187LA 195LA 2DKVA 1L24A 216LA 2L78A 1JKCA 1REMA 3AJNA 188LA 3TXHA 2Z18A 2BQFA 3IJUA 3C7ZA 1EQ5A 1LJHA 1LSAA 1QT6A 4NHTA 2MEFA 4KPMA 4NSHA 3OE6A 2Z38A 1LGUA 3RW8A 2MEHA 245LA 5F16A 222LA 230LA 3AZ4A 3P68A 157LA 1GB0A 5LVIA 143LA 3NYAA 1L25A 1P46A 1GF5A 3LYTA 3TXIA 4RW2A 5L3IA 1KS3A 2HULA 4H9AA 3BKHA 4DAJA 1D2WA 1GBOA 1O23A 2OU9A 1LPIA 5F81A 2NWDX 1L49A 1L99A 1YAOA 1IVMA 1IOSA 1WVVA 4YF2A 1NBYC 1J1OY 2XQOA 1RFPA 2DQIY 5KXMA 133LA 4DD0A 4NFVA 5HLLA 1C6CA 1XSFA 5APCA 3BKVA 1L04A 3A93A 2BQMA 3AW7A 3DKEX 185LA 1L03A 1CKHA 4G4HA 1IWUA 1RCMA 4WO6A 1NBZC 4WLYA 1L22A 4W52A 257LA 3C80A 4NHIA 4EXMA 3A91A 5ILFA 1L42A 169LA 1J1PY 4TUNA 1L0KA 4N1CC 1G7JC 2BQLA 1QS9A 3ATOA 1LZ9A 1IOQA 3DMXA 1L93A 4WM6A 4FDYA 192LA 1L06A 1QTZA 1GF4A 1LCNA 1H87A 1D6QA 1LHMA 5LVGA 2F4GA 4I7KA 1WQOA 4ET9A 4QY9A 1L40A 1OUCA 251LA 4C3WA 1KW7A 2G4QA 4LYCA 1E8LA 1QSAA 1CJ7A 252LA 255LA 4OOTA 151LA 1LI3A 4ZFPA 2HTXA 1OUIA 4EKRA 4ARMB 1XEPA 4OWCA 1YAMA 5APDA 3G3WA 1GAZA 1CV0A 1BB7A 1C6QA 1L95A 3HH4A 4B49A 1LMPA 1V7TA 3B0OA 234LA 1BB6A 3WPJA 2RSCA 1IOTA 1L01A 2YBHA 1L66A 1GFUA 219LA 1AKIA 1JSEA 4GLVA 1L48A 5I54A 4LZTA 135LA 1B5ZA 1F6RA 1LW9A 163LA 4PRQA 1LZGA 3WUAA 5I4XA 4KT3A 1YANA 1LZBA 2CDSA 4WM3A 1GBWA 4W53A 1L98A 5B1FA 4NSIA 2A4TA 2ZYPA 1GBSA 1LGWA 1LKRA 2IFFY 4ARPA 3HBEX 1DYGA 2Z12A 4NGJA 1L11A 1GE4A 3LZTA 3LYMA 4PJZA 1YKZX 4DQ5A 4QGZA 1L63A 1XGPC 2XJWA 2HEEA 1D9UA 4HJYA 1L33A 1KXWA 1AT5A 1C7PA 1QUOA 4NSJA 1XFPL 4PJ2C 254LA 1LYEA 1LHJA 238LA 1LZ1A 154LA 1LJEA 137LA 4A7DA 197LA 1C6BA 1IR8A 3K2RA 1SX7A 3WPLA 2H9JA 1VAUA 201LA 3FA0A 1LJNA 4TSBA 4BS7A 3B6LA 2F4AA 247LA 4NGIA 4J0LA 232LA 1GPQC 1FLWA 6LYTA 1C6TA 1KXYA 1L07A 4OWBA 3QNGA 2D6BA 2B70A 1C6HA 1DQJC 4DC4A 1XGRC 3W6DA 1QT7A 1YL1X 1L55A 1C10A 4ZPUA 4LDEA 3ATNA 170LA 4N0JA 1REZA 3SN6R 1L23A 1NHBA 3GUJA 1WTNA 1LMQA 125LA 2BLYA 3WU8A 4GCEA 1UBZA 2FYDA 1EQEA 4NGKA 1ZMYL 1D0KA 1L28A 2I25L 3D3DA 1OVKA 3RT5X 1KIPC 4ARJA 1C68A 3ZVQA 5I4YA 1LHKA 1L52A 1QTKA 1IOCA 2B6WA 1L73A 1L75A 2QARC 4WM1A 4LYMA 1C43A 1LJJA 142LA 4WLTA 1LSPA 3HH5A 4QEQA 1D0LA 5HQ1A 1SLYA 3HDEA 1L41A 1CJ8A 1IWYA 1TCYA 3WU9A 3CDQA 3HU9A 4X3BA 181LA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1UIF A;  3SB6 A;  4WLD A;  1CKD A;  4E97 A;  4LT2 A;  3P65 A;  1GDW A;  1IO5 A;  1IEE A;  1QUD A;  2A7F A;  1FLU A;  1D2Y A;  1B5X A;  4UWU A;  1OUB A;  2F30 A;  2YBL A;  3LZM A;  3CT0 A;  3MGW A;  1LYS A;  4Z3M A;  1L05 A;  3DMZ A;  1GAY A;  1QT5 A;  1UIE A;  1L46 A;  4OWE A;  1G0J A;  1CU2 A;  1D3F A;  4DDB A;  2ZWB A;  1JIT A;  1C6P A;  4KXI A;  2B75 A;  4XJB A;  1IP6 A;  259L A;  1UIA A;  3V2W A;  104L A;  3WPK A;  1Z55 A;  1LJG A;  1L15 A;  1IP1 A;  3RUN A;  2HUK A;  1CX6 A;  1YKY X;  5DLA A;  1L54 A;  5KKJ A;  1IP4 A;  1EPY A;  3TXE A;  4NWH A;  1I56 A;  1L10 A;  114L A;  184L A;  1BVK C;  1IWT A;  5IHG A;  2D4K A;  3WXT A;  2DQE Y;  1C6A A;  1L79 A;  162L A;  4HJV A;  223L A;  205L A;  2CWI A;  1OUG A;  4HJZ A;  3SB7 A;  1GB8 A;  1CKG A;  1CTW A;  4ZIX A;  2D91 A;  4EKP A;  2HEF A;  3CB7 A;  4ET8 A;  182L A;  1L35 A;  3C7Y A;  1JPO A;  1CU5 A;  3OK0 A;  5B59 A;  1LHI A;  4NGL A;  1VDP A;  4W57 A;  4M4O A;  1L76 A;  3C8R A;  1HNL A;  1GFT A;  1L81 A;  1P2R A;  190L A;  2AUB A;  1OV5 A; 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