176LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 62
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHTLKVDGNSNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 62
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 176lA00
1EPYA 2OE4X 4IAPA 1L33A 4EKRA 125LA 1L38A 4ARLA 3QAKA 1LLHA 2B75A 1C6NA 1PQDA 4I7NA 138LA 1CV1A 1XJUA 254LA 1L98A 1LGXA 1OV7A 4LZMA 3CDRA 1C6TA 2OE7X 3CDVA 1L15A 1OWYA 145LA 1LGWA 171LA 1SSWA 1C65A 1C68A 4LDOA 1KW5A 174LA 3CDOA 4E97A 1L06A 200LA 1D3JA 177LA 4I7TA 2OTZX 1L43A 3G3WA 2HULA 2B6WA 1L44A 3V2WA 1LI2A 217LA 1T97A 1CVKA 1QUDA 4EPIA 4EXMA 3HDEA 3DMXA 1L88A 2O4WA 3FA0A 226LA 3C7WA 3DKEX 1LYHA 250LA 1SX7A 149LA 5I14A 4W52A 1C69A 1D3NA 175LA 1L22A 1JTMA 1SWZA 1L81A 2OEAX 3OE0A 1L00A 1L62A 3F8VA 1C6HA 4W57A 1LW9A 3C7ZA 1L75A 1P46A 1P7SA 2NTHA 1C6PA 3SB8A 2LC9A 238LA 4ARMB 1SX2A 1L46A 3FI5A 108LA 1L35A 112LA 1C6LA 1WTHA 3PBLA 181LA 2B6ZA 4W56A 1P36A 1L07A 1CV6A 1L53A 1L13A 3DN3A 199LA 3HTBA 3GUIA 1L60A 3DN4A 1CTWA 1L58A 1C6MA 1QT8A 1G0GA 1L57A 2RAZX 4PJZA 2RBOA 210LA 3FADA 4I7RA 1L68A 1L64A 211LA 196LA 195LA 1L71A 1L28A 1L39A 1L69A 3GULA 4S0WA 2B70A 3G3XA 3GUKA 3SB7A 3HH3A 2OU9A 3SB6A 3F9LA 4I7LA 4ARQB 3DN2A 1CX6A 1L82A 1L27A 1JTNA 1L54A 1PQMA 2B73A 1G06A 1QUGA 1L42A 1L24A 252LA 191LA 155LA 1QT6A 1L50A 187LA 3C80A 3SBAA 1L26A 3SB5A 2OTYX 1L97A 4I7OA 1C6QA 1CX7A 1XEPA 1C6FA 3ODUA 3HTFA 4YXAC 256LA 3DN0A 3DN8A 102LA 1QTDA 3DMZA 1P64A 2B72A 3HUKA 3C8QA 241LA 212LA 1G0QA 1QSQA 169LA 130LA 1L21A 2IGCA 3C82A 4I7SA 1L34A 3DN1A 185LA 1DYDA 2F32A 140LA 1KS3A 1C6IA 2OE9X 1C6BA 1L93A 3D4SA 3RZEA 3CDTA 2RBNA 1L73A 1OV5A 261LA 1L03A 1OYUA 184LA 1L85A 1QUOA 188LA 243LA 1L08A 3L64A 206LA 1L95A 1D2WA 4PK0A 1C6KA 163LA 1B6IA 240LA 3C8RA 2RAYX 3GUNA 4EKSA 1G0PA 245LA 1T8AA 183LA 1KW7A 115LA 143LA 1L94A 2HUKA 242LA 137LA 190LA 127LA 2Q9EA 1PQIA 189LA 4W54A 1C6CA 1JQUA 1LI3A 1L0JA 3HT8A 1L74A 1L05A 1L99A 129LA 111LA 1C60A 1L49A 2B6XA 1DYFA 1D3FA 262LA 1CU2A 1DYEA 237LA 2RB1X 216LA 1DYGA 2O79A 107LA 109LA 4EPFA 1L90A 4I7KA 3NY9A 1ZWNA 3K2RA 2RH1A 3HDFA 104LA 2QARC 2OU0X 1L0KA 4DAJA 1QTCA 2LCBA 3GUOA 3HH6A 4GRVA 3C81A 1L65A 2QB0B 1L63A 113LA 2NTGA 1D3MA 1L61A 1L87A 1CU3A 1L56A 232LA 3PDSA 1CU6A 1L76A 156LA 4EKQA 1C62A 4GBRB 2RBSA 167LA 4W51A 1C6EA 225LA 3NYAA 231LA 249LA 1QS5A 3OE9A 3OE6A 1CU0A 1QT5A 259LA 3HU9A 128LA 1L51A 4ZPUA 2L78A 1L20A 4YXCA 151LA 122LA 1T8FA 3LZMA 1CV3A 3JR6A 1PQJA 1CU5A 1L04A 148LE 1L19A 1OVKA 1P3NA 214LA 1C6AA 1LYEA 1QTVA 2F2QA 1T8GA 1DYBA 1DYAA 2B74A 173LA 164LA 1G1VA 223LA 222LA 244LA 1LYFA 1L40A 180LA 126LA 1L31A 2O7AA 230LA 2ANVA 4W58A 1QT3A 197LA 1C66A 1P2LA 3HUAA 2ANXA 3SN6R 1L16A 141LA 4I7PA 220LA 131LA 168LA 1LYIA 162LA 3HT6A 258LA 1SSYA 1LWGA 3HUQA 4LDLA 2OU8A 1T6HA 3HTDA 3CDQA 186LA 213LA 3HH4A 3C8SA 2RBQA 170LA 1L70A 255LA 3VW7A 1L23A 4EKPA 1L86A 1L09A 120LA 215LA 2B6YA 1L45A 1L79A 2RBRA 2RB0X 1C64A 1L11A 1L17A 4DJHA 1D2YA 227LA 219LA 3RUNA 2A4TA 2HUMA 1C67A 1C6DA 1L55A 1C6GA 1L01A 1C63A 1L02A 150LA 3HTGA 1L10A 1LYDA 2F47A 2CUUA 1PQKA 3SBBC 1L48A 1G0LA 1L83A 3UONA 159LA 3C7YA 1QTBA 4I7MA 1G0KA 4ARJA 1P5CA 1L41A 1K28A 3GUPA 1L77A 1L32A 3DMVA 146LA 1G0JA 3HT7A 4OO9A 1QS9A 235LA 1NHBA 236LA 233LA 4EJ4A 1L18A 158LA 172LA 229LA 218LA 166LA 103LA 239LA 2B6TA 4W55A 2Q9DA 1L84A 192LA 6LZMA 1LYJA 1L67A 160LA 1L30A 1D9WA 3HU8A 1L25A 4W59A 4DKLA 1I6SA 3G3VA 1LPYA 5LZMA 4AQNA 234LA 4I7QA 1L91A 1L80A 161LA 4LDEA 1CUPA 1OWZA 1CV4A 1QTHA 3DN6A 1QTZA 1P6YA 1QSBA 1OVHA 1LI6A 246LA 3L2XA 2LZMA 1CUQA 1PQOA 228LA 1P37A 3HH5A 123LA 3HT9A 1TLAA 1L96A 1CV0A 3GUJA 1CV5A 114LA 142LA 201LA 4ARMA 1LGUA 3DNAA 1L36A 224LA 4ARPA 1C61A 165LA 1LWKA 1LYGA 3SB9A 4YX7C 2B7XA 3C83A 3GUMA 1C6JA 3OE8A 1L52A 147LA 1OVJA 253LA 4I7JA 198LA 1G0MA 1KY1A 3NY8A 1ZYTA 119LA 1ZURA 1P56A 1L37A 1L72A 182LA 1QT4A 260LA 2RBPA 248LA 144LA 110LA 1KY0A 1SWYA 1QT7A 221LA 7LZMA 247LA 1XJTA 1L29A 1QUHA 257LA 152LA 118LA 4ARQA 4K5YA 1L66A 1DYCA 1G07A 4W53A 3V2YA 3HWLA 176LA 178LA 1P2RA 1L14A 1G1WA 3EMLA 1L59A 1KNIA 1L92A 205LA 2RB2X 1L47A 2Z6BA 1L12A 209LA 251LA 139LA 1L89A 157LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IP3A 1DXJA 4IAPA 5D5FA 4C3WA 9LYZA 5APFA 1C10A 5B1GA 1PQDA 3B0KA 1XJUA 3A90A 4LZMA 4H9CA 3CT1A 1WTNA 2F4AA 4MR1A 1IR7A 3CSQA 171LA 2RSCA 1BGIA 1SSWA 2FBBA 6LYZA 5LVIA 1UIAA 3QNGA 1TCYA 1UIGA 1L06A 200LA 4HJZA 1D3JA 1HFXA 3A3QA 1UIDA 2BQHA 4WL6A 177LA 4I7TA 4TWSA 1VDPA 4OWAA 1IEEA 1L43A 4HTKA 4RDSA 5C6JA 4NHTA 4YM8A 1LI2A 217LA 1LMTA 1GEVA 1QUDA 4EXMA 1JEFA 1YKXX 4NGJA 2O4WA 1OQMA 5KXSA 3P66A 3WW5A 3WUNA 1C69A 3WU9A 1L22A 1WQNA 4WLXA 1B2KA 1JPOA 132LA 3OE0A 1WVUA 4W57A 4OWCA 3WULA 3MGWA 2NTHA 4H8ZA 108LA 4EOFA 1C6LA 181LA 5E9RA 4N5RA 1CV6A 3DN3A 3GUIA 1IOTA 1L58A 1LMCA 1GB8A 5FELA 4PJZA 3WU8A 1L68A 1L64A 2ZIKA 1D0LA 1LSDA 4ETAA 3AGIA 2LYZA 2B70A 3G3XA 2HEDA 1LZEA 4XYYA 2I26L 4NGYA 4B4JA 3SB6A 2BQBA 4ARQB 1CKCA 4Z98A 1ZMYL 1L82A 1QUGA 1L42A 1L24A 1OP9B 155LA 3TXFA 1L50A 4GN5C 5LYTA 3C80A 4LYTA 1C6FA 2LZ2A 1GFTA 256LA 2HEFA 102LA 3DMZA 2BQFA 2B72A 1BWJA 5HNCA 241LA 1IWVA 1B0DA 5I4WA 1JSEA 2BLXA 3AYQA 169LA 1JKBA 1C7PA 2IGCA 1LOZA 3C82A 1L34A 3EO5A 3AZ6A 1NDMC 1TAYA 140LA 5F16A 1C6BA 5KXZA 5J7CA 3CDTA 5KKIA 1NF5A 1L73A 3HBEX 1OUFA 1L03A 4Z41A 1BB7A 1GF5A 1NBYC 184LA 1L85A 1YANA 3WPLA 1LZ9A 1CJ6A 1LZGA 5LAGA 3C8RA 4NHQA 3GUNA 1WQMA 1G0PA 245LA 2BQJA 1T8AA 1KW7A 5F9UA 143LA 1L94A 4AXTA 4NSIA 2I6ZA 4ML7A 1C6CA 3ATNA 1KIQC 1LI3A 1XGUC 2BAAA 262LA 1CU2A 1DYEA 237LA 216LA 2O79A 107LA 1XGPC 1JKCA 2RH1A 1F0WA 4GCDA 4WM3A 1DKKA 1L0KA 1QTCA 5T3FA 4UWVA 2MEDA 4NG1A 3G3AB 2QB0B 1B7QA 1LZAA 4A7DA 4B4EA 4OOTA 1D3MA 1LZTA 1L61A 1NDGC 1L87A 1CU3A 1L56A 2FYCA 232LA 1C62A 1LJIA 225LA 1QT5A 1GBSA 1F6RA 4ZPUA 1W6ZA 1XFPL 4YXCA 151LA 1GBZA 5E4PA 1L04A 3B72A 1LKSA 1T8GA 222LA 5DL9A 2DQDY 4QY9A 1L40A 180LA 126LA 2ZIJA 1L31A 2O7AA 1ALCA 1DPWA 2CJLA 230LA 4NWEA 1GB3A 1IP6A 197LA 1C66A 1SLYA 4I7PA 1LPIA 3ULRA 4WM5A 5L9JA 168LA 4HSFA 1LWGA 3HUQA 1QSWA 3HTDA 4G4HA 1GB6A 2RBQA 1L70A 1IOSA 1L23A 4XJHA 1C64A 4WM2A 2CDSA 1D2YA 227LA 2ZQ4A 1LHKA 4DDCA 4HJYA 4GN4A 1SQ2L 1GBXA 1REXA 3HTGA 2ZYCA 1FLQA 1GFGA 2CUUA 4WG1A 4M4OA 4DD0A 159LA 4LYMA 2D6BA 4NGIA 4I7MA 1G0KA 5HMVA 4W96A 1L77A 2XBRA 146LA 3HT7A 1GFHA 236LA 4EJ4A 4H8XA 1ZV5L 218LA 239LA 4W55A 1QUTA 192LA 4J0LA 1T3PA 1L30A 5L3HA 4W59A 1LTMA 3G3VA 5LZMA 1N4FA 1NQIA 1JTOL 3ZVQB 2I25L 3RW8A 1IX0A 4LDEA 1LSFA 1QTHA 3DN6A 1QTZA 5AMYA 4BADA 1NBZC 1LMNA 1TDYA 2HEAA 246LA 1B5UA 3LYZA 5LYZA 2LZMA 3WMKA 1G7MC 4HPEA 4WM1A 5DN5A 1REZA 3HT9A 1HEQA 1LSYA 2A7DA 1CV0A 3GUJA 1XEIA 3DNAA 3KAMA 1LJFA 4ARPA 3AGGG 1LWKA 1HEMA 4RLMA 4NHSA 3GUMA 1C6JA 3OE8A 3AZ4A 1KY1A 4YENA 119LA 1IOCA 1P56A 1AZFA 1LSMA 4MCKA 260LA 5LVKA 2RBPA 248LA 2ZWBA 1B7OA 4XENA 2HU1A 1SWYA 4H9HA 7LZMA 4DQJA 1L29A 4HP0A 1G7JC 4ET8A 118LA 4AGAA 3BKVA 4XJDA 1DYCA 5KXWA 1G07A 4W53A 3HWLA 1B5VA 178LA 1L59A 3A95A 1L92A 5FCPA 1IY4A 1BB3A 3B0OA 4XN6A 1L89A 3A34A 4N1EI 125LA 4PRUA 1GF8A 1GE2A 1MLCE 2B75A 1CKGA 1I1ZA 1L98A 1LGXA 1OV7A 3CDVA 1L15A 3FE0A 4B49A 145LA 1LGWA 1BVXA 4LDOA 1GFKA 1LZCA 2BQEA 4NGKA 2OTZX 1LZ4A 4LYOA 1IO5A 1GFJA 1GF0A 1IR9A 2B6WA 2IFFY 1L44A 1T97A 1IP5A 3WU7A 4EPIA 3WL2A 3BKHA 1LMOA 5LIOA 6LYTA 1LYHA 1GAZA 2XJWA 2YBNA 4W52A 1GE0A 5KY1A 3WXUA 4X3BA 5DM9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IP3 A;  1DXJ A;  4IAP A;  5D5F A;  4C3W A;  9LYZ A;  5APF A;  1C10 A;  5B1G A;  1PQD A;  3B0K A;  1XJU A;  3A90 A;  4LZM A;  4H9C A;  3CT1 A;  1WTN A;  2F4A A;  4MR1 A;  1IR7 A;  3CSQ A;  171L A;  2RSC A;  1BGI A;  1SSW A;  2FBB A;  6LYZ A;  5LVI A;  1UIA A;  3QNG A;  1TCY A;  1UIG A;  1L06 A;  200L A;  4HJZ A;  1D3J A;  1HFX A;  3A3Q A;  1UID A;  2BQH A;  4WL6 A;  177L A;  4I7T A;  4TWS A;  1VDP A;  4OWA A;  1IEE A;  1L43 A;  4HTK A;  4RDS A;  5C6J A;  4NHT A;  4YM8 A;  1LI2 A;  217L A;  1LMT A;  1GEV A;  1QUD A;  4EXM A;  1JEF A;  1YKX X;  4NGJ A;  2O4W A;  1OQM A;  5KXS A;  3P66 A;  3WW5 A;  3WUN A;  1C69 A;  3WU9 A;  1L22 A;  1WQN A;  4WLX A;  1B2K A;  1JPO A;  132L A;  3OE0 A;  1WVU A;  4W57 A;  4OWC A;  3WUL A;  3MGW A;  2NTH A;  4H8Z A;  108L A;  4EOF A;  1C6L A;  181L A;  5E9R A;  4N5R A;  1CV6 A;  3DN3 A;  3GUI A;  1IOT A;  1L58 A;  1LMC A;  1GB8 A;  5FEL A;  4PJZ A;  3WU8 A;  1L68 A;  1L64 A;  2ZIK A;  1D0L A;  1LSD A;  4ETA A;  3AGI A;  2LYZ A;  2B70 A;  3G3X A;  2HED A;  1LZE A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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