178LA

Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWCEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFCTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords T4 LYSOZYME
publication title Protein flexibility and adaptability seen in 25 crystal forms of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
source organism Bacteriophage t4
total genus 60
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 178lA00
247LA 1QUOA 2OEAX 3HTDA 3FA0A 2RH1A 156LA 1C6FA 1NHBA 256LA 141LA 212LA 1SWYA 1L56A 3HTFA 190LA 3PDSA 4ARMB 3C83A 151LA 1G0KA 1PQJA 3HH5A 1L14A 4W57A 2NTHA 3CDOA 1L38A 4DAJA 191LA 3GUOA 2RBOA 3HUQA 177LA 1CU2A 5I14A 1L48A 1L04A 2HUMA 4E97A 1L99A 4AQNA 4EKQA 1CV0A 1C60A 243LA 3D4SA 1C6EA 3SB9A 3GUJA 170LA 239LA 2OE4X 225LA 231LA 3C7ZA 2HULA 144LA 1L47A 1QUGA 3CDTA 1C6MA 1L82A 257LA 1P7SA 1XJTA 178LA 1G0PA 152LA 2CUUA 215LA 1C6PA 223LA 1CUQA 1D3JA 1PQOA 235LA 2Q9DA 1C6DA 1QTCA 1G1WA 1OVHA 3DN8A 4EKSA 1LPYA 1LLHA 2B74A 3SB7A 1QT7A 217LA 104LA 161LA 166LA 172LA 2OU8A 2B7XA 157LA 1QUDA 1LYFA 1L62A 1L77A 1L50A 246LA 1L97A 236LA 126LA 1PQKA 1SSYA 227LA 1D3MA 1L73A 4W52A 1L33A 1L51A 1QTVA 1TLAA 1L61A 1C62A 3DKEX 4EPIA 1PQMA 260LA 4DKLA 1CU6A 146LA 1OVJA 1L35A 2ANVA 3C81A 111LA 1LYEA 218LA 248LA 4I7TA 2O79A 1CX7A 174LA 131LA 1L49A 1SX2A 148LE 1C6AA 1L45A 4S0WA 1L79A 1L10A 1CVKA 143LA 1EPYA 180LA 3F9LA 1G0QA 240LA 2F2QA 4ARMA 1CV4A 1L68A 1DYBA 3HH4A 1L17A 1WTHA 1OWYA 4GBRB 1P6YA 175LA 1DYAA 1D2YA 1L44A 3HT8A 2A4TA 3L64A 1L11A 1L67A 1L16A 1L25A 2QB0B 1T6HA 4I7PA 249LA 216LA 1QT6A 1D9WA 198LA 1C6CA 3HH3A 3L2XA 171LA 1C69A 4I7KA 1C6QA 4PJZA 2OE7X 3OE8A 2RAYX 3NYAA 1L32A 1ZYTA 1QT8A 3C82A 4I7JA 1ZURA 1L89A 3SN6R 250LA 4ZPUA 206LA 213LA 242LA 2Z6BA 3HUKA 224LA 4I7RA 1L95A 1LWGA 245LA 1L24A 1QS5A 1L72A 4ARQB 2RBPA 1CU3A 1C65A 1CTWA 233LA 255LA 103LA 2RB0X 3UONA 1OV7A 244LA 1LYGA 1L87A 183LA 1L0JA 220LA 262LA 3SB8A 3GUIA 1G06A 3FI5A 3GULA 238LA 3SB5A 3G3WA 4EKRA 1L96A 2B72A 3OE9A 3DN0A 197LA 211LA 1L60A 184LA 1L40A 1OVKA 3SBBC 1L39A 1T8FA 1C63A 1P64A 2RBRA 4LDOA 1L05A 2NTGA 1QT4A 3DNAA 1CV3A 4ARJA 3G3VA 4I7NA 3K2RA 3HUAA 3HU9A 2OTYX 120LA 1L58A 2B6TA 3C8RA 1C6KA 230LA 1OYUA 1CV6A 3DN2A 1L81A 2IGCA 1JQUA 1L46A 1L83A 205LA 3HDFA 1DYEA 162LA 1L91A 4W51A 125LA 7LZMA 4PK0A 1XEPA 2LC9A 1C6IA 4YXCA 4LDEA 261LA 1P5CA 2L78A 1L21A 3SB6A 1L00A 1ZWNA 4W53A 1L07A 3PBLA 1L03A 1QSQA 1KW5A 149LA 122LA 4ARLA 1C6LA 2B6XA 1QUHA 3C80A 112LA 2RB1X 4W56A 1QTBA 1CX6A 1LWKA 1QT3A 253LA 163LA 4LZMA 1C61A 1L75A 1DYCA 1L0KA 110LA 1L93A 1L18A 1SWZA 2LCBA 1L42A 4ARQA 2B70A 3CDQA 3HTBA 2B6ZA 1G1VA 3DN1A 1C68A 142LA 1L65A 160LA 1G07A 1C6JA 1L37A 3LZMA 3ODUA 2OTZX 3JR6A 2RBNA 2HUKA 4EJ4A 1L26A 2QARC 4EXMA 1L23A 1L06A 1L86A 108LA 1L34A 4LDLA 3V2YA 155LA 4W59A 145LA 3RUNA 1L59A 2RAZX 4W54A 3DMVA 1B6IA 3G3XA 234LA 1G0JA 1CU5A 164LA 2OE9X 147LA 4W58A 1DYGA 137LA 2O7AA 237LA 188LA 1OWZA 4K5YA 1LGUA 1P2LA 109LA 3HT6A 4I7QA 1CUPA 1L55A 1L88A 4IAPA 3VW7A 1L28A 123LA 3GUPA 1P3NA 3HH6A 1L22A 4DJHA 229LA 1K28A 222LA 3DMZA 1L71A 150LA 226LA 3CDRA 195LA 3NY9A 1P2RA 1QT5A 1L27A 4OO9A 1L52A 1G0LA 2B73A 1L41A 1C6HA 1LYDA 1D3NA 128LA 3DN3A 4I7OA 3NY8A 1C6TA 3C7YA 4EPFA 1L53A 259LA 1JTMA 1L54A 1L09A 4ARPA 1OV5A 3HU8A 1LYHA 3EMLA 165LA 3C8SA 1LYIA 1SX7A 107LA 158LA 210LA 1L63A 1L02A 1QTZA 1L43A 1L80A 1L90A 201LA 1C6NA 1JTNA 159LA 2LZMA 2F32A 3HDEA 1CV5A 1D3FA 1LI2A 114LA 1L29A 1L15A 199LA 4GRVA 102LA 167LA 4I7MA 3SBAA 1L20A 1KW7A 1C6GA 1C64A 4W55A 1L01A 2RBSA 2OU9A 1CU0A 1L92A 1CV1A 3DN6A 1SSWA 1I6SA 1L69A 1L74A 1QTHA 1T8AA 1L76A 254LA 3C7WA 1KS3A 1L31A 2OU0X 2O4WA 3OE6A 1L64A 173LA 228LA 1L19A 1G0GA 219LA 169LA 1L94A 1P36A 1KY1A 3CDVA 200LA 241LA 3V2WA 113LA 251LA 4EKPA 1L66A 2B6YA 127LA 1P37A 3FADA 1LYJA 185LA 2B75A 4I7LA 176LA 129LA 3OE0A 186LA 4YX7C 139LA 1T8GA 3HT9A 1L85A 1L57A 2ANXA 1C66A 1L08A 3GUKA 119LA 3GUNA 2Q9EA 3C8QA 138LA 1L84A 187LA 1D2WA 181LA 1DYDA 214LA 1QTDA 3HWLA 1G0MA 192LA 258LA 1C6BA 1PQDA 1P46A 1KNIA 1LI3A 1LGWA 140LA 1KY0A 2RB2X 4YXAC 196LA 3DMXA 1XJUA 1T97A 2B6WA 1DYFA 1P56A 3DN4A 1LW9A 221LA 3RZEA 5LZMA 1LI6A 1L98A 1L36A 2F47A 3HT7A 4I7SA 118LA 189LA 2RBQA 3GUMA 1QS9A 3F8VA 1QSBA 252LA 115LA 1C67A 232LA 1PQIA 3HTGA 1L30A 209LA 6LZMA 182LA 130LA 1L13A 1L12A 3QAKA 168LA 1LGXA 1L70A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
247LA 4WM4A 2Z39A 3WU9A 4WOAA 2OEAX 4WO9A 1GF4A 3HTDA 2RH1A 1HEOA 4TX7A 1LHHA 4Z41A 4HTQA 3AW6A 1YAQA 3AGGG 4W57A 2DQCY 3FI7A 2BQGA 4XYYA 4DAJA 5M1YA 1H87A 2RBOA 2ZWBA 3CT0A 1CU2A 1L04A 2HUMA 4NG1A 1GF0A 1HMLA 1LZBA 2BQJA 3WYHA 2CWIA 3GUJA 5DLAA 170LA 239LA 4H8ZA 4YF2A 1VAUA 225LA 2YSSC 1HENA 3C7ZA 1L47A 1IP5A 4GCBA 1P7SA 4GN4A 1G0PA 1IEEA 223LA 1C6PA 5HNCA 1CUQA 1PQOA 235LA 4N1CC 2B74A 3SB7A 4H91A 1LCNA 3OK0A 4N1EI 1B7SA 1AKIA 4OOOA 2OU8A 4GCFA 3W3EA 1LYFA 2ZNXY 1DZBX 1RCMA 1IWXA 1L51A 3AB6A 4NGOA 1QTVA 5KXZA 1C62A 260LA 4G4HA 4FJRA 154LA 1CU6A 2MEDA 4PPOA 1OVJA 4NFVA 1L35A 1B5UA 1HEQA 1VDPA 218LA 4I7TA 2O79A 4L41A 1C6AA 2DQAA 1L79A 1EPYA 2WARA 2F2QA 5KXLA 1CV4A 1DPXA 2EKSC 1XGPC 1WTHA 1LSPA 1P6YA 3FE0A 175LA 1BHZA 1OUDA 1WQOA 1UIGA 2YBIA 4PJZA 1C6QA 4R0FA 4YEMA 1AM7A 2W1MA 206LA 242LA 3P64A 1B2KA 1QS5A 2RBPA 2I25L 1CU3A 1C65A 2YBNA 103LA 3UONA 1LZ1A 1OV7A 244LA 1LYGA 4H93A 1H6MA 1L0JA 262LA 1DI5A 1LMNA 4DD1A 1G06A 3AYQA 3J4GA 1VFBC 1GB8A 2LZTA 3EBAB 4LT2A 4OWBA 4CJ2A 3DN0A 197LA 1LZ8A 1L40A 3SBBC 4IATA 4LDOA 1GFHA 1LJFA 4QEQA 4KXIA 1PZYA 3G3VA 4H9HA 3HU9A 4ANRA 2B6TA 3C8RA 1CV6A 1JKAA 205LA 1DYEA 5AMYA 194LA 1YAMA 4NGWA 1IP3A 1I1ZA 1UIEA 4PK0A 1XEPA 4ETBA 4ETCA 2L78A 1L21A 1LZRA 4H9IA 3WUAA 4W53A 2ZQ4A 2N5ZA 4WMGA 2MEBA 1C6LA 2B6XA 5I4XA 1LJ3A 3RNXA 1UBZA 1D6QA 5LYZA 253LA 1OUAA 2X0AA 4DDAA 4AGAA 4ARQA 4R6CA 4OW1A 1V7TA 4LYZA 1C6JA 1L37A 1UACY 3ODUA 5I4YA 4HPEA 2HU1A 4EXMA 4GLVA 1L06A 3CSRA 4WO6A 5II3A 1GB7A 4HP0A 1AT6A 2LYMA 4NIJA 153LA 2W1XA 1L59A 2BQCA 3A90A 5ILCA 1GFJA 1QUTA 3G3XA 1EQ4A 1A2YC 164LA 2OE9X 5ILFA 4W58A 137LA 1NBYC 2I26L 3HBHA 188LA 4K5YA 4H9AA 1LGUA 1GEVA 1FKQA 4P2EA 3HT6A 1L88A 4IAPA 4BAPA 2ZYPA 2GV0A 2LHMA 4KPMA 1REZA 1L71A 1YILA 226LA 2ZIKA 3A3QA 1WTNA 1HSWA 1L27A 1DXJA 4B4JA 2B73A 4M4OA 1G7JC 1C6TA 5J7CA 4EPFA 1L53A 4H9BA 4H94A 4G49A 1LKSA 2MECA 4Z3MA 1OV5A 5C6JA 1NBZC 5LIOA 1J1XY 1C43A 4RW2A 1BVXA 1B5WA 1G7IC 1QTEA 4GCEA 1L63A 1VATA 1L80A 5F81A 4LYBA 1C6NA 3LYMA 4ET9A 1LSDA 2LZMA 4H8YA 1LI2A 1LSEA 114LA 3A94A 4G4BA 3WVYA 1L20A 1C6GA 1L01A 1KXXA 4AXTA 1LHJA 1CKDA 1I6SA 1OUJA 1L69A 254LA 3C7WA 1SSWA 1WQNA 4HTKA 1LZYA 1LHIA 2OU0X 2O4WA 5APDA 228LA 1L19A 2G4QA 2W1YA 3B72A 2D4IA 1P36A 2YBMA 3CDVA 3V2WA 113LA 1IWVA 3D3DA 185LA 176LA 129LA 1B5ZA 3OE0A 3HT9A 1L85A 4MCKA 3GUKA 1L08A 3GUNA 2FBBA 1GDXA 1B7QA 138LA 1L84A 1DYDA 1GBOA 3QNGA 3HWLA 5D5FA 2A7FA 4QGZA 1XFPL 1PQDA 1P46A 2A7DA 5L3IA 1B5YA 1LGWA 140LA 4IJ4A 4OWHA 3A92A 5FHWA 4DD3A 5DN4A 1DYFA 1GBWA 3TXIA 4ZIXA 3AGHA 5B07A 1LI6A 1LMPA 2RSCA 2F47A 1W08A 1KXYA 4I7SA 2C8PA 4LYOA 3TXHA 115LA 2H5ZA 232LA 1LZAA 1LJHA 2BQLA 5KKIA 5APEA 1L12A 4DD7A 1BB7A 168LA 3OJPA 2Z12A 1LGXA 1CJ6A 1IR9A 4YOPA 5D5CA 3P4ZA 1HEWA 4EOFA 1EQ5A 3WU7A 5KXNA 3A91A 256LA 212LA 1CKGA 1KIRC 1UC0A 2BQDA 1JEFA 1B5XA 151LA 1PQJA 3HH5A 1IR8A 1G7MC 3CDOA 1HSXA 1GBSA 1WVVA 4C5FA 133LA 4LT1A 1IC4Y 177LA 1L48A 2HTXA 4E97A 4EKQA 4AQNA 1CV0A 1N4FA 5KXPA 1C6EA 3E3DA 3SB9A 2OE4X 1IP2A 1GF5A 3EMSA 1OUEA 1B7MA 4IASA 5HQ1A 1L82A 1BGIA 2EPEA 178LA 152LA 1JTTL 1IP4A 2Q9DA 1C6DA 1QTCA 1G1WA 5F9UA 1QT7A 1NQIA 2B7XA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 247L A;  4WM4 A;  2Z39 A;  3WU9 A;  4WOA A;  2OEA X;  4WO9 A;  1GF4 A;  3HTD A;  2RH1 A;  1HEO A;  4TX7 A;  1LHH A;  4Z41 A;  4HTQ A;  3AW6 A;  1YAQ A;  3AGG G;  4W57 A;  2DQC Y;  3FI7 A;  2BQG A;  4XYY A;  4DAJ A;  5M1Y A;  1H87 A;  2RBO A;  2ZWB A;  3CT0 A;  1CU2 A;  1L04 A;  2HUM A;  4NG1 A;  1GF0 A;  1HML A;  1LZB A;  2BQJ A;  3WYH A;  2CWI A;  3GUJ A;  5DLA A;  170L A;  239L A;  4H8Z A;  4YF2 A;  1VAU A;  225L A;  2YSS C;  1HEN A;  3C7Z A;  1L47 A;  1IP5 A;  4GCB A;  1P7S A;  4GN4 A;  1G0P A;  1IEE A;  223L A;  1C6P A;  5HNC A;  1CUQ A;  1PQO A;  235L A;  4N1C C;  2B74 A;  3SB7 A;  4H91 A;  1LCN A;  3OK0 A;  4N1E I;  1B7S A;  1AKI A;  4OOO A;  2OU8 A;  4GCF A;  3W3E A;  1LYF A;  2ZNX Y;  1DZB X;  1RCM A;  1IWX A;  1L51 A;  3AB6 A;  4NGO A;  1QTV A;  5KXZ A;  1C62 A;  260L A;  4G4H A;  4FJR A;  154L A;  1CU6 A;  2MED A;  4PPO A;  1OVJ A;  4NFV A;  1L35 A;  1B5U A;  1HEQ A;  1VDP A;  218L A;  4I7T A;  2O79 A;  4L41 A;  1C6A A;  2DQA A;  1L79 A;  1EPY A;  2WAR A;  2F2Q A;  5KXL A;  1CV4 A; 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