189LA

Enhancement of protein stability by the combination of point mutations in t4 lysozyme is additive
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNLFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPDLNVAKSELDKAIGRNCNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNPKLKPVYDSLDAVRRCALINMVFQMGETGVAGFTDSLRMLQQKRWDEAAANLAKSRWYNQTPDRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Enhancement of protein stability by the combination of point mutations in T4 lysozyme is additive.
pubmed doi rcsb
molecule keywords T4 LYSOZYME
total genus 57
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 189lA00
1LWGA 4I7TA 171LA 1L65A 1XJUA 1CV3A 188LA 2B6TA 2OU8A 3DN1A 1QUOA 2Q9EA 1L09A 1L35A 1OV7A 1P46A 1L49A 2B72A 1L83A 3NYAA 3HT6A 1C68A 3PDSA 4EXMA 4YXAC 1L79A 1SWZA 3CDTA 5LZMA 1EPYA 2B6XA 1LYJA 3DMVA 240LA 4ARQA 1NHBA 3EMLA 3HT7A 102LA 1QT6A 1L73A 1P56A 156LA 1L57A 1CV5A 1QUHA 128LA 172LA 1OVJA 1L90A 218LA 231LA 3C7ZA 4ARMB 3F8VA 2LZMA 3QAKA 160LA 3C8QA 1L72A 225LA 1KY0A 1OWYA 3C7WA 1C6JA 1L52A 3C81A 4W56A 2RBQA 4OO9A 219LA 2ANVA 2OEAX 3HH4A 1QS9A 255LA 1D2YA 3HUAA 1L40A 1L47A 1L0JA 205LA 3GULA 2OU9A 1LW9A 2O7AA 1L24A 1DYFA 1C60A 1C6PA 195LA 201LA 1QS5A 1P64A 1L05A 232LA 1LI6A 1C6HA 1L99A 3PBLA 4K5YA 1P6YA 175LA 182LA 149LA 1L75A 180LA 2A4TA 1L12A 1L61A 2CUUA 187LA 3FADA 152LA 1L36A 3K2RA 1L48A 1T8FA 148LE 1L19A 147LA 237LA 244LA 3F9LA 1L25A 4ARMA 176LA 1L17A 1L27A 177LA 123LA 3HU8A 252LA 2NTHA 3SB5A 2B70A 3GUNA 1SX7A 3DMZA 1OVKA 2LC9A 3HTDA 1QTHA 1L54A 4GRVA 161LA 144LA 4I7QA 4I7RA 138LA 1C6DA 4EKRA 4S0WA 3GUOA 3SB9A 1C6QA 1CV4A 1L45A 243LA 4EJ4A 1CV1A 262LA 113LA 1L87A 2RB1X 4EPFA 3JR6A 1JTNA 1L31A 1G1WA 146LA 1CUPA 1SSYA 1L39A 215LA 1L30A 3NY8A 3GUKA 2RH1A 1L77A 165LA 1D2WA 1L94A 1L20A 3C8RA 184LA 1L63A 246LA 151LA 1L06A 2HUMA 1LWKA 3DN4A 4LDOA 1L88A 234LA 1L28A 2RB2X 159LA 1QTZA 3OE0A 4I7LA 1LGXA 228LA 3HWLA 4ARJA 183LA 131LA 1C63A 1ZURA 1CVKA 1LGUA 1L59A 3RUNA 1T97A 3UONA 1LYHA 226LA 3V2WA 2B7XA 2B6WA 1CV6A 1SX2A 3SB6A 3SBAA 2LCBA 127LA 1KS3A 1KW7A 1L93A 1C6MA 3DN3A 1L34A 1CU6A 2RAZX 1L80A 1L81A 4I7JA 1DYBA 3L2XA 199LA 1L84A 235LA 258LA 1DYDA 1ZYTA 137LA 2HULA 3DN6A 4W59A 3C80A 1L76A 220LA 3SN6R 1L41A 1P3NA 249LA 3FI5A 4DJHA 1QT4A 256LA 1C6EA 1D3JA 2RAYX 224LA 1C6KA 1L14A 3DMXA 1OWZA 2OE9X 229LA 157LA 1QSQA 1L82A 1L26A 1L71A 1JTMA 4I7PA 6LZMA 1QTBA 1CU5A 196LA 4LDLA 248LA 3OE9A 1L23A 1G0LA 1LYFA 1WTHA 223LA 1DYCA 4I7KA 1G0MA 1L58A 1P5CA 2RBOA 2O79A 3HTGA 1CU3A 1QT8A 141LA 2RBRA 3CDOA 4PJZA 167LA 114LA 2HUKA 1CU0A 222LA 163LA 1C62A 1XEPA 2OTYX 185LA 2Q9DA 1XJTA 4PK0A 3D4SA 4I7SA 3DNAA 1CV0A 2RBNA 1C66A 4W53A 214LA 3L64A 129LA 155LA 1I6SA 1L10A 3HH6A 2RBPA 1SSWA 1P2RA 1L97A 1L07A 170LA 1L02A 3HU9A 4ZPUA 1L60A 257LA 3GUIA 139LA 1T8GA 168LA 3G3VA 1G06A 174LA 2QARC 110LA 1G0JA 181LA 2RB0X 3ODUA 1D3NA 4W52A 259LA 2OU0X 1CUQA 1L04A 1C6IA 1L69A 250LA 206LA 3GUPA 1QT5A 122LA 158LA 245LA 1B6IA 1QUGA 2F2QA 1KY1A 4W57A 1KNIA 1L91A 164LA 1QSBA 3DKEX 1PQIA 1PQKA 247LA 1ZWNA 3C7YA 120LA 1L18A 3DN8A 3HUKA 7LZMA 1L22A 1D3FA 1L44A 1L32A 2OE4X 1K28A 1L67A 4YXCA 198LA 130LA 4DAJA 1L01A 1L11A 1LYGA 1L70A 216LA 1OVHA 3NY9A 4W55A 2B75A 2IGCA 3VW7A 1QTDA 103LA 1L85A 2B73A 173LA 4LDEA 3HH3A 3SB7A 1L16A 1L0KA 1L98A 1C6LA 4EKPA 3CDQA 1T6HA 2QB0B 3DN2A 1L74A 166LA 212LA 3HUQA 1PQOA 4GBRB 1G0QA 242LA 1L42A 1QTVA 1G0GA 211LA 2F47A 190LA 1PQMA 241LA 150LA 1L38A 3V2YA 4E97A 260LA 3OE6A 1D9WA 3CDVA 1L62A 1KW5A 1PQJA 1L43A 4EKQA 1QT7A 1C6FA 4I7MA 1OYUA 3GUJA 1L21A 189LA 191LA 1C64A 1L55A 1LLHA 109LA 3GUMA 1G0PA 1L68A 4I7NA 112LA 2B6ZA 1C67A 104LA 1P2LA 1L08A 3HTBA 3DN0A 1L96A 4W54A 162LA 2L78A 4YX7C 3HT8A 239LA 2B6YA 4EKSA 186LA 1PQDA 227LA 1L15A 3OE8A 1DYEA 1G1VA 1LYIA 236LA 1C6TA 3RZEA 118LA 4I7OA 1L50A 143LA 209LA 1L95A 1OV5A 1LYDA 1P36A 2O4WA 3C82A 1CTWA 107LA 233LA 2F32A 1LI3A 108LA 119LA 1CX7A 217LA 200LA 1DYAA 192LA 3SB8A 169LA 3G3XA 3LZMA 142LA 4LZMA 1DYGA 238LA 3FA0A 140LA 1L37A 1SWYA 111LA 2B74A 178LA 1G07A 1LGWA 1T8AA 2OE7X 1QTCA 3HDEA 210LA 1L56A 2ANXA 1C6GA 1LI2A 125LA 1L13A 2RBSA 3C83A 3G3WA 4ARLA 5I14A 254LA 1L89A 1L66A 145LA 1LPYA 1P37A 1L64A 2OTZX 221LA 4ARQB 1G0KA 1D3MA 3HT9A 197LA 213LA 4AQNA 1C69A 4W58A 1C65A 1C6NA 1CX6A 1C6BA 1L46A 251LA 1L00A 253LA 1QUDA 261LA 3HH5A 3HTFA 1L92A 1C6CA 1QT3A 1L33A 1C6AA 4IAPA 1CU2A 1C61A 1L53A 1L29A 4EPIA 1L86A 2NTGA 1L03A 3C8SA 3SBBC 230LA 115LA 1L51A 1P7SA 3HDFA 1JQUA 4DKLA 4W51A 1LYEA 1TLAA 3CDRA 126LA 4ARPA 2Z6BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XJUA 188LA 4J1BA 2OU8A 1QUOA 1P46A 1L83A 1C68A 3PDSA 4YXAC 1L79A 1GFUA 1GFGA 4NGOA 1LYJA 3EMLA 4ZIXA 4WM3A 1VAUA 1XGPC 1YL1X 2LYMA 1DXJA 4NWHA 4NSIA 172LA 5KXWA 4NGVA 1OVJA 218LA 3WPLA 3QAKA 4HTQA 3A34A 3WU9A 1OWYA 2DQEY 4W56A 3HH4A 1AM7A 2ZQ3A 1QS9A 1UC0A 1FLWA 1FLUA 1VDQA 2O7AA 1L24A 1LYSA 1DYFA 4QDNA 2F2NA 195LA 3GXKA 201LA 4NIJA 1QS5A 4OWBA 232LA 1IY3A 4NGYA 4O34A 3PBLA 1DKKA 2LYZA 2A4TA 1ALCA 2F30A 1B5YA 5LXWA 187LA 5E9RA 4NSGA 4KPMA 1L36A 3K2RA 1L19A 5JENB 4LYTA 4CHXA 3F9LA 1GAYA 4ARMA 177LA 1CKFA 252LA 2NTHA 1VDTA 1LZ1A 1DI4A 4H9IA 2ZWBA 1JKAA 3DMZA 1OVKA 3HTDA 1QTHA 1L54A 5F14A 4H8XA 2Z12A 144LA 4GLAA 5LAFA 3SB9A 1D0MA 5APEA 1CV4A 1L45A 1CV1A 2RB1X 4HP0A 1G1WA 1JTTL 1GBZA 2BQAA 3B0IA 1GE4A 134LA 1JUGA 1L30A 3GUKA 2RH1A 1L77A 1LOZA 4H93A 1H87A 4HJYA 1NDMC 2MEDA 1L63A 246LA 3M3UA 1FKVA 1L88A 5HQ1A 1L28A 3OE0A 2DQHY 4ARJA 1RCMA 131LA 2FYCA 1CVKA 1LGUA 4WO6A 4DD1A 5I4YA 3V2WA 3SB6A 1CV6A 1XGQC 1LSNA 3CSZA 1LYZA 1KS3A 4OWCA 194LA 1KW7A 1FDLY 1CU6A 1L34A 4EOFA 5I4XA 3L2XA 1L84A 2F4AA 1CKHA 1C7PA 1B7QA 4HSFA 1JJ3A 1ZYTA 5KXSA 2XJWA 2BQGA 4W59A 4L41A 1OP9B 1I1ZA 3SN6R 1L41A 2ZYCA 3AZ7A 256LA 1SQ2L 1HFXA 1C6EA 1GFJA 1IWYA 5DN5A 4X3BA 1GEVA 1L14A 3DMXA 4LT2A 1LJJA 4NFVA 5C6IA 1JTMA 1QTBA 4IJ4A 1IWWA 4LDLA 2DQCY 1HFZA 3A91A 2HEEA 5LIOA 223LA 1L58A 2O79A 1IOQA 2Z19A 1CJ6A 2YBLA 1UICA 4XYYA 4PJZA 114LA 4B49A 2ZNXY 4XADA 1GD6A 3A90A 2OTYX 3W6DA 2Q9DA 3TXGA 4J1AA 1TDYA 1CV0A 1LSGA 1IP7A 4XJFA 129LA 4G4BA 1SSWA 2MEIA 4E3UA 153LA 4HJVA 3WPKA 1DI3A 1REYA 1L02A 3HU9A 3BKVA 3M18B 139LA 1T8GA 3HBEX 1GDWA 1OUHA 4EMNA 5KXXA 7LYZA 1D6PA 3TXIA 2OU0X 2W1MA 2PC2A 1IEEA 1A4VA 4WLTA 5AMYA 2BQLA 2MEBA 3T36A 4B4JA 4BAFA 245LA 3W6CA 4A7DA 4W57A 2Z38A 1AKIA 164LA 3WVXA 3CT5A 120LA 1B7NA 3DN8A 1XEJA 5KJ9A 1L44A 1K28A 4YXCA 198LA 130LA 4PRQA 1HEOA 2B75A 1L85A 2Z2FA 2G4PA 1WTNA 3SB7A 1T6HA 2QB0B 3RW8A 1IOTA 2HUBA 3DN2A 212LA 1LMNA 2ZIJA 4GBRB 1JIYA 1LYYA 2XQOA 1L42A 1GBXA 2H9KA 1QTVA 1BHZA 4WO9A 1QSWA 2LHMA 5B1FA 4MSTA 3OE6A 4WM6A 3TXKA 4EKQA 1LJFA 1OYUA 3G3BB 4RLNA 1L21A 189LA 1LZ6A 1YILA 1XEKA 4LT1A 4I7NA 1JKBA 1IWXA 1LJHA 4W54A 162LA 4GCDA 2B6YA 4ET9A 2MEFA 5KXYA 3AZ4A 1RFPA 186LA 2I25L 2BQHA 3RZEA 1L15A 1DYEA 5KXMA 236LA 4NWEA 2GV0A 1QSAA 1OV5A 3WU8A 3A95A 1LYDA 4ETEA 5KKJA 3C82A 2F32A 1IR7A 1GAZA 3W6AA 1ZV5L 1IP2A 200LA 1DYAA 3G3XA 3LZMA 1LZGA 4H9CA 1KXYA 4WLYA 3FA0A 1HEQA 3W6FA 1CNSA 4TUNA 2B74A 1IIZA 178LA 1T8AA 2OE7X 2D6BA 4XJGA 5A3ZA 3TXJA 1LI2A 3WXTA 1C43A 2RBSA 1D0LA 4HV1A 3IJUA 1L89A 3SP3A 2OTZX 1LPIA 251LA 1JITA 253LA 261LA 4P2EA 2I26L 1LZTA 4GCBA 1XGRC 3AB6A 1L29A 4XJDA 1REMA 5C6LA 1YL0X 4RLMA 1TCYA 5E4PA 1L51A 3TXEA 1TLAA 126LA 171LA 1B9OA 1CV3A 1B7OA 1IORA 3DN1A 4DD2A 2Q9EA 1L09A 1L35A 3NYAA 4EXMA 3CT1A 1NMMA 1SWZA 4RW1A 5LZMA 240LA 2MEGA 1I56A 4LYBA 1AZFA 2YBJA 1L57A 1JTPL 4G9SA 5LA8A 2BQFA 3RNXA 1L90A 3C7ZA 1KXWA 2LZMA 4NG8A 160LA 3C8QA 3B0OA 3CB7A 225LA 5B06A 3C81A 4OO9A 1MLCE 4FJRA 2OEAX 2C8OA 4N8ZA 4OWHA 1L40A 1TAYA 1L47A 3HBDA 1B7PA 5L3HA 1NBYC 1C6PA 2G4NA 1LCNA 3QY4A 4DQJA 1P64A 1L05A 1LHLA 1OUJA 1GFTA 1H6MA 1NF5A 4K5YA 1LZDA 3ATNA 1L75A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1XJU A;  188L A;  4J1B A;  2OU8 A;  1QUO A;  1P46 A;  1L83 A;  1C68 A;  3PDS A;  4YXA C;  1L79 A;  1GFU A;  1GFG A;  4NGO A;  1LYJ A;  3EML A;  4ZIX A;  4WM3 A;  1VAU A;  1XGP C;  1YL1 X;  2LYM A;  1DXJ A;  4NWH A;  4NSI A;  172L A;  5KXW A;  4NGV A;  1OVJ A;  218L A;  3WPL A;  3QAK A;  4HTQ A;  3A34 A;  3WU9 A;  1OWY A;  2DQE Y;  4W56 A;  3HH4 A;  1AM7 A;  2ZQ3 A;  1QS9 A;  1UC0 A;  1FLW A;  1FLU A;  1VDQ A;  2O7A A;  1L24 A;  1LYS A;  1DYF A;  4QDN A;  2F2N A;  195L A;  3GXK A;  201L A;  4NIJ A;  1QS5 A;  4OWB A;  232L A;  1IY3 A;  4NGY A;  4O34 A;  3PBL A;  1DKK A;  2LYZ A;  2A4T A;  1ALC A;  2F30 A;  1B5Y A;  5LXW A;  187L A;  5E9R A;  4NSG A;  4KPM A;  1L36 A;  3K2R A;  1L19 A;  5JEN B;  4LYT A;  4CHX A;  3F9L A;  1GAY A;  4ARM A;  177L A;  1CKF A;  252L A;  2NTH A;  1VDT A;  1LZ1 A;  1DI4 A;  4H9I A;  2ZWB A;  1JKA A;  3DMZ A;  1OVK A;  3HTD A;  1QTH A;  1L54 A;  5F14 A;  4H8X A;  2Z12 A;  144L A;  4GLA A;  5LAF A;  3SB9 A;  1D0M A;  5APE A;  1CV4 A;  1L45 A;  1CV1 A;  2RB1 X;  4HP0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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