193LA

The 1.33 a structure of tetragonal hen egg white lysozyme
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
molecule keywords LYSOZYME
publication title High-resolution structure (1.33 A) of a HEW lysozyme tetragonal crystal grown in the APCF apparatus. Data and structural comparison with a crystal grown under microgravity from SpaceHab-01 mission.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1995-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 193lA00
1GB5A 2LZTA 4LT1A 5DL9A 3LYOA 2EPEA 3LHMA 2YBJA 1VDQA 5KXKA 3RZ4A 1QSAA 1OUJA 4DD7A 1QSWA 1JSEA 1KIQC 5FDJA 1GEZA 5IELA 3RT5X 4GLVA 2BAAA 2YBMA 4IJ4A 1HMKA 1GHLA 1NHEA 4ETBA 1YKZX 1UCOA 1LKSA 2HTXA 4QEQA 3T6UA 1O23A 1JJ0A 5LINA 1GBXA 4ET8A 4HJZA 3N9EA 4H9EA 5KJ9A 2MEDA 3LZ2A 1IP3A 1LSYA 1LSAA 1SQ2L 3F6ZA 4YEOA 3ZVQB 4YEMA 5LVGA 4LYOA 4NSHA 1DPWA 2BQAA 2HEDA 1UA6Y 1B7MA 1OUCA 4XADA 2ZILA 4Z98A 3W6DA 1H6MA 2CGIA 3MGWA 4LYCA 8LYZA 5JENB 1LHLA 2DQGY 2F30A 5ILFA 1GFJA 1LJ4A 4GN4A 2HU3A 1QTEA 1W08A 4DDCA 2G4QA 1LSGA 2FYDA 1IY4A 4J0LA 1WQQA 4PRUA 3WPJA 1LZAA 1WQNA 2BQCA 3IJUA 4LT0A 1GF9A 2BLYA 2BQKA 3A95A 9LYZA 4NHQA 5APCA 3A6BY 1LCNA 1IEEA 4UWUA 1AT6A 1XFPL 2H5ZA 2HECA 1J1XY 2YVBA 1B7NA 4GN5C 4HSFA 1LZSA 1LYOA 4ET9A 2A7FA 1IIZA 1Z55A 4GN3A 1BQLY 3HBHA 1LAAA 3A90A 3N9AA 1FBIX 5DN4A 4NY5A 4HJYA 2HU1A 5D5FA 3ULRA 4LFPA 1F10A 4M4OA 3WMKA 3FE0A 2BQDA 1AT5A 1FKVA 1WVVA 1HSWA 1HEMA 2ZWBA 4AGAA 133LA 3WPKA 1BB5A 1CJ8A 4NGJA 135LA 4OWAA 3ATOA 1GF8A 2XTHA 1LMCA 3P64A 4NGWA 4H8ZA 3LYZA 4UWVA 1G7LC 2DQEY 1GEVA 4KT3A 4DDAA 1GB8A 4LYTA 3W6AA 1HMLA 5KXMA 5J7CA 3LZTA 1LZ5A 4G4CA 1IWTA 5KXWA 5LVIA 4NWEA 3B6LA 1OUAA 4P2EA 4C3WA 2D4JA 4XJBA 4LYMA 1GFAA 207LA 4W96A 4WLTA 3GXRA 4A7DA 1GB9A 4WM1A 1GBWA 3AZ7A 1GE0A 5FSTA 4ANRA 5E9RA 1ZV5L 1GF3A 1IWXA 2NWDX 2G4PA 5LXWA 1JWRA 2YSSC 1BB7A 1D0KA 4PJ2C 2C8PA 5FHWA 1TDYA 4WG7A 1B7PA 2FBDA 7LYZA 1B5XA 1IVMA 3EMSA 2YDGA 1LTMA 3GXKA 1GB2A 1IP2A 4H92A 1GF4A 1W6ZA 4LYZA 1OUIA 1JJ1A 5M1YA 4NG1A 1OUDA 1IR7A 4PRQA 1KXYA 3CB7A 1BB6A 3A92A 3W6FA 1VDSA 3A93A 1UIHA 3AGGG 4FDYA 1T3PA 5T3FA 1GBSA 1G7IC 1LZYA 4H9AA 2ZNXY 3CT1A 4OWBA 1BB3A 2YBHA 4WM3A 1ZVHL 3A34A 3AW7A 1SLYA 1LZ6A 2F4AA 4J7VA 4XJHA 1JTPL 1JTOL 2XBRA 4TSBA 4N0JA 4OWHA 1QIOA 1G7MC 1B9OA 1GAZA 4HPIA 5F9UA 3TMXA 1BVKC 1LSPA 2ZIJA 1C43A 2Q0MX 2Z2FA 4RLMA 154LA 2B5ZA 1GFGA 1RFPA 4HTKA 5LVJA 2CWIA 1GFUA 1GE2A 3G3AB 3LYTA 2D4KA 4KXIA 5I54A 1RI8B 1DI5A 4ZIXA 3LYMA 4G9SA 1NKHA 4NSJA 5D5CA 1IC5Y 2DQIY 4ETAA 4H94A 4ETDA 1AKIA 1CJ9A 3P4ZA 1QTKA 1GPQC 1UICA 2AUBA 2DQHY 4H93A 5F81A 1NBYC 1UBZA 1LZBA 4EMNA 1F6RA 1JHLA 1IWUA 1IP4A 4YENA 1HNLA 4BAFA 1EQ5A 1N4FA 4DC4A 3WU9A 1YQVY 4GCFA 1C08C 4WL6A 1GDXA 4OW1A 5L3IA 4NWHA 4ML7A 1CNSA 4H90A 1CKGA 4W94A 1HF4A 2YBLA 4H9FA 2MEAA 1VFBC 4B0DA 5A3EA 1HERA 1B5YA 2HEAA 5DN5A 1IOSA 2W1MA 1C46A 3WL2A 1VDTA 4DD1A 1LKRA 1A2YC 2BQLA 1EQ4A 4TUNA 2DBTA 4WLDA 5II3A 1LJEA 1LZEA 2MECA 2IHLA 1AZFA 4DYGA 1LMPA 1NDGC 4CGEA 5I4YA 4NIJA 3N9CA 1AM7A 1LYSA 2BQGA 1LSZA 4BS7A 1IOTA 4N8ZA 1LJGA 1LZ4A 4M6DA 5B05A 1YAPA 4WM5A 4D9ZA 1UIGA 1BGIA 5FCPA 1B5ZA 1JKAA 1LJNA 1LJKA 1WTMA 1XGTC 3K3TA 4PPOA 1CKCA 3A6CY 3A3RX 4PGJB 3TXEA 1CJ7A 1QQYA 3RW8A 1B5WA 1T6VL 5F16A 1NBZC 4BADA 6LYTA 2ZNWY 3W6BA 1XSFA 3A67Y 2A7DA 5HMVA 5HQ1A 2DQAA 1DZBX 1G7JC 4N1EI 5KXXA 1QUSA 3EBAB 4DD9A 1WQPA 4NHSA 1LJ3A 1WQRA 1GFHA 2BQOA 1HEWA 2CDSA 4CHXA 1KXXA 5ILCA 1KIPC 4HV2A 1IP7A 1LMOA 5KY1A 4LYBA 5LAFA 3WW6A 1LMAA 4DWXA 3A96A 5L9JA 1OUBA 1CKFA 3AJNA 5A3ZA 2HUBA 1LJFA 3AB6A 5IDDA 4B4EA 5HLLA 3BKHA 4N5RA 4TX7A 5E4PA 1JPOA 4NFVA 3A91A 3TXDA 2MEEA 193LA 1B2KA 4R0FA 1XEIA 1J1OY 1LYYA 4DDBA 1WQMA 2LYOA 4ETCA 1LZRA 4WM2A 2DQDY 1C45A 1C7PA 2HEBA 1NWGA 5APFA 4AXTA 1GB0A 3B0KA 4LT3A 5F14A 3TXGA 5F9XA 1P2CC 1GF6A 1LZGA 1REYA 1LJHA 1LHKA 2FYCA 1GF5A 4H9HA 4H9CA 1KXWA 3TXKA 1QUTA 1KIRC 4II8A 4NSIA 3WU7A 1BHZA 2BQBA 2MEBA 4GCCA 4RDSA 3HFMY 3J6KA 2N5ZA 3CT0A 5LVHA 4NGZA 3OJPA 2D6BA 3CSQA 5I53A 1LHMA 1YL1X 3FI7A 4TTDA 1JIYA 2MEHA 4HJVA 1B7LA 4Z41A 1YAOA 2Z37A 3W6CA 1GE3A 4RLNA 5C6IA 1OUEA 2W1XA 5B1GA 1UC0A 1B7SA 4NHIA 4UWNA 1JEFA 3CQLA 3TXBA 2DQCY 3AZ4A 2CJLA 2ZIKA 1TBYA 1REZA 2LZ2A 2ZQ3A 1D9UA 1FDLY 4L41A 2BLXA 4GCEA 4OWCA 3P65A 5HMJA 4QY9A 1IORA 1WVUA 2BPUA 2HEFA 4OWEA 5HNLA 1UIFA 1B5UA 1YROA 2Z19A 4MSTA 3KAMA 3RU5A 1HEQA 4MCKA 3WH1A 1GE1A 1HSXA 1OUFA 2H9JA 4H91A 4J1AA 2LHMA 1IY3A 1YAMA 2Z39A 2I25L 4N9RA 4NEBA 1LYZA 1REXA 2EQLA 4DD3A 3CT5A 3TXJA 1E8LA 1RJCB 1LSFA 5I4XA 3ZVQA 1FKQA 5DM9A 4KL7A 1D0MA 3J4GA 2ZYCA 2MEIA 1JSFA 1DXJA 1GB7A 2IFFY 3CSRA 1YIKA 4B1AA 1MELL 1QDRA 1PZYA 1DPXA 1HFZA 2W1LA 1DKKA 3TXFA 2Z18A 4LFXA 2BQEA 4H8XA 4NGVA 5K7OA 3AGHA 1IWZA 1IP5A 3M3UA 5KXRA 1LZDA 2GV0A 1XGUC 4WM4A 1JITA 5HNCA 1UIDA 4DD0A 1JISA 1QDTA 1GF7A 5C6LA 4N1CC 4XN6A 1OUHA 2BQMA 4E3UA 1D6PA 2BQFA 1YKXX 2DQJY 4LGKA 4NGYA 4BAPA 3D9AC 1PS5A 5KXNA 2BQIA 3P66A 3AZ6A 2HEEA 1BWIA 1LZ1A 1DI3A 3P68A 1UIAA 2EIZC 4XENA 2F4GA 4WOAA 4EOFA 1CKDA 2C8OA 194LA 1UUZC 1JTTL 1IX0A 1LSBA 3IJVA 4NGKA 1CJ6A 1FLYA 1IC4Y 1J1PY 2BQJA 2EKSC 3D3DA 4H8YA 5KXOA 3TMUA 1C10A 3WUNA 1XGPC 3QNGA 4IASA 3WUMA 2LYMA 3WVXA 1IWVA 1OUGA 3HBDA 1FLWA 1LSCA 4NHTA 3W3EA 1IR9A 5B07A 1YKYX 4WL7A 1LHIA 4H1PA 4QDNA 4R6CA 1LZTA 1XEJA 5KKIA 4B4JA 4B49A 4XJDA 1A4VA 1VDPA 5KXSA 1D6QA 3W6EA 1VAUA 1LSNA 153LA 3VWOA 3A3QA 2XJWA 2DQFC 3WXTA 1LMQA 1G7HC 4RW1A 4Z46A 5LYZA 1GFVA 3B72A 1LMTA 2G4NA 4YF2A 2D4IA 3G3BB 4XYYA 5L3HA 1B7QA 1YAQA 4LT2A 1EL1A 4G49A 3WU8A 2F2NA 4GLAA 1WTNA 1HFXA 4HP0A 4TWSA 3ATNA 1GFTA 4YM8A 4O34A 3TXHA 5FEKA 2W1YA 2X0AA 4I8SA 3OK0A 4NGLA 5KXZA 4C5FA 3B0OA 4XJGA 3E3DA 5LYTA 3QY4A 1D0LA 1GXXA 5LA5A 4WM6A 1DI4A 1IOCA 1RE2A 5LYMA 1F6SA 1NF5A 2H9KA 3WYHA 1IOQA 1EQEA 5APDA 2FBBA 3TXIA 2DKVA 5KXLA 2MEGA 2YBNA 4G4HA 1GF0A 3WXUA 4WO6A 3AYQA 3BKVA 4HTQA 4PHIA 4CJ2A 1NDMC 1FLUA 1GAYA 1LZ8A 3RNXA 5LIOA 1YANA 3M18B 1IP1A 4NHPA 1BWJA 4ETEA 1B7RA 2D91A 1LSEA 4WMGA 3AW6A 4B4IA 1GFRA 4CFPA 1TEWA 4WLXA 1I1ZA 1B7OA 1LJJA 132LA 4MR1A 3TMVA 4CFOA 4HPEA 2XBSA 4YOPA 1LOZA 5KXPA 3AZ5A 1GBZA 1HEOA 1I56A 1DKJA 1F0WA 1GDWA 1UACY 3CSZA 4FJRA 4GCBA 1MLCE 1TAYA 4NSGA 5APEA 5LVKA 4DT3A 4ZEEA 5C6JA 1HELA 1LJIA 1UIBA 5AMYA 3SP3A 1HFYA 3WPLA 3WUAA 5DLAA 1HEPA 1V7TA 4DD2A 1HENA 4WG1A 4HTNA 1FLQA 3A94A 1LMNA 1GFEA 5B1FA 4H9BA 4Z3MA 2ZQ4A 1INUA 1BB4A 134LA 1H87A 1GXV2 1LSDA 1REMA 3WULA 1IR8A 4HV1A 4NG8A 4ZFPA 1CKHA 1OQMA 1XGQC 1HC0A 1LZCA 2LYZA 4G4BA 5LA8A 5KXTA 4WLYA 5EBHA 1XEKA 2BQNA 1JKDA 1JJ3A 1LHJA 3EO5A 1IC7Y 4IATA 1LZ9A 1ALCA 1I20A 1GB3A 1BWHA 5B06A 2WARA 2Z38A 1GE4A 4I0CA 5I5QA 3A8ZA 1TCYA 4H9IA 208LA 2BQHA 3AGIA 1NQIA 1HHLA 1OP9B 1VEDA 6LYZA 1LHHA 4OOOA 1LSMA 2Z2EA 4RW2A 4X3BA 5KXYA 1LZNA 5KKJA 4WO9A 1NMMA 1ZVYB 5IHGA 1BVXA 1VATA 4J1BA 2MEFA 3ZEKA 5FELA 4OOTA 1IWYA 1RCMA 3HBEX 1GD6A 1LPIA 1IP6A 1GBYA 1GFKA 2RSCA 1GBOA 2Z12A 5B59A 1GB6A 1B5VA 1V7SA 1XGRC 1JKBA 2I6ZA 1JUGA 4XJIA 4QGZA 2PC2A 1IWWA 3T36A 3LN2A 4LZTA 2I26L 4NGOA 1JKCA 4XJFA 5I4WA 3WVYA 1YILA 3IWRA 4NGIA 5LAGA 3WW5A 3TMWA 1DQJC 4U3XB 4GCDA 1UIEA 1B0DA 1WQOA 2VB1A 2Y8PA 3EXDA 3QE8A 1IO5A 2YBIA 3B0IA 4KPMA 1YL0X 1ZMYL 1FN5A 1GWDA 2ZYPA 4TSCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RZEA 5DL9A 3LYOA 2EPEA 1L23A 1VDQA 5KXKA 1L65A 1GEZA 5IELA 4GLVA 2YBMA 1GHLA 1NHEA 1YKZX 4EKPA 3T6UA 1JJ0A 4EKRA 2Z6BA 1IP3A 3ZVQB 4YEOA 1DPWA 2BQAA 1B7MA 2B6WA 1G0LA 2ZILA 142LA 4YX7C 1GFJA 1QTCA 161LA 4DDCA 4J0LA 1LZAA 1WQNA 119LA 2BQCA 2BQKA 3A6BY 1XFPL 2H5ZA 1B7NA 1LYOA 4GN3A 162LA 3HBHA 3A90A 1L06A 4NY5A 4LFPA 3DN2A 2ANXA 2BQDA 187LA 1HSWA 1L25A 1BB5A 1GF8A 4W52A 4NGWA 1G7LC 4KT3A 4DDAA 1GB8A 4LYTA 5J7CA 3LZTA 1LZ5A 1OUAA 3HU8A 4LYMA 4W96A 107LA 4A7DA 1CV6A 1LWGA 1L59A 1IWXA 1P6YA 190LA 1BB7A 1L97A 2O4WA 4WG7A 1B5XA 1IP2A 5M1YA 1JJ1A 3FI5A 1IR7A 1QT5A 3A93A 1GBSA 1T8GA 4H9AA 2RBPA 1L46A 1ZVHL 3A34A 3AW7A 1LZ6A 3DNAA 4J7VA 1L95A 3DN3A 1L26A 1KY1A 4N0JA 4OWHA 3OE6A 154LA 1L63A 2OU8A 1CUPA 4RLMA 4HTKA 1GE2A 4I7KA 4W51A 1DI5A 235LA 1IC5Y 2DQIY 3P4ZA 1QTKA 1GPQC 4AQNA 3GUNA 4H93A 1NBYC 1UBZA 1QT8A 148LE 4DQ7A 4EMNA 1F6RA 1JHLA 1IP4A 1IWUA 1L96A 1N4FA 3WU9A 1YQVY 1GDXA 4OW1A 1VFBC 2HEAA 210LA 3WL2A 1LKRA 1A2YC 2BQLA 5II3A 2MECA 2IHLA 1AZFA 4DYGA 175LA 3SB5A 125LA 6LZMA 1WTMA 3K3TA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GB5 A;  2LZT A;  4LT1 A;  5DL9 A;  3LYO A;  2EPE A;  3LHM A;  2YBJ A;  1VDQ A;  5KXK A;  3RZ4 A;  1QSA A;  1OUJ A;  4DD7 A;  1QSW A;  1JSE A;  1KIQ C;  5FDJ A;  1GEZ A;  5IEL A;  3RT5 X;  4GLV A;  2BAA A;  2YBM A;  4IJ4 A;  1HMK A;  1GHL A;  1NHE A;  4ETB A;  1YKZ X;  1UCO A;  1LKS A;  2HTX A;  4QEQ A;  3T6U A;  1O23 A;  1JJ0 A;  5LIN A;  1GBX A;  4ET8 A;  4HJZ A;  3N9E A;  4H9E A;  5KJ9 A;  2MED A;  3LZ2 A;  1IP3 A;  1LSY A;  1LSA A;  1SQ2 L;  3F6Z A;  4YEO A;  3ZVQ B;  4YEM A;  5LVG A;  4LYO A;  4NSH A;  1DPW A;  2BQA A;  2HED A;  1UA6 Y;  1B7M A;  1OUC A;  4XAD A;  2ZIL A;  4Z98 A;  3W6D A;  1H6M A;  2CGI A;  3MGW A;  4LYC A;  8LYZ A;  5JEN B;  1LHL A;  2DQG Y;  2F30 A;  5ILF A;  1GFJ A;  1LJ4 A;  4GN4 A;  2HU3 A;  1QTE A;  1W08 A;  4DDC A;  2G4Q A;  1LSG A;  2FYD A;  1IY4 A;  4J0L A;  1WQQ A;  4PRU A;  3WPJ A;  1LZA A;  1WQN A;  2BQC A;  3IJU A;  4LT0 A;  1GF9 A;  2BLY A;  2BQK A;  3A95 A;  9LYZ A;  4NHQ A;  5APC A;  3A6B Y;  1LCN A;  1IEE A;  4UWU A;  1AT6 A;  1XFP L;  2H5Z A;  2HEC A; 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 3WPL A;  3WUA A;  5DLA A;  1HEP A;  1V7T A;  4DD2 A;  1HEN A;  4WG1 A;  4HTN A;  1FLQ A;  3A94 A;  1LMN A;  1GFE A;  5B1F A;  4H9B A;  4Z3M A;  2ZQ4 A;  1INU A;  1BB4 A;  134L A;  1H87 A;  1GXV 2;  1LSD A;  1REM A;  3WUL A;  1IR8 A;  4HV1 A;  4NG8 A;  4ZFP A;  1CKH A;  1OQM A;  1XGQ C;  1HC0 A;  1LZC A;  2LYZ A;  4G4B A;  5LA8 A;  5KXT A;  4WLY A;  5EBH A;  1XEK A;  2BQN A;  1JKD A;  1JJ3 A;  1LHJ A;  3EO5 A;  1IC7 Y;  4IAT A;  1LZ9 A;  1ALC A;  1I20 A;  1GB3 A;  1BWH A;  5B06 A;  2WAR A;  2Z38 A;  1GE4 A;  4I0C A;  5I5Q A;  3A8Z A;  1TCY A;  4H9I A;  208L A;  2BQH A;  3AGI A;  1NQI A;  1HHL A;  1OP9 B;  1VED A;  6LYZ A;  1LHH A;  4OOO A;  1LSM A;  2Z2E A;  4RW2 A;  4X3B A;  5KXY A;  1LZN A;  5KKJ A;  4WO9 A;  1NMM A;  1ZVY B;  5IHG A;  1BVX A;  1VAT A;  4J1B A;  2MEF A;  3ZEK A;  5FEL A;  4OOT A;  1IWY A;  1RCM A;  3HBE X;  1GD6 A;  1LPI A;  1IP6 A;  1GBY A;  1GFK A;  2RSC A;  1GBO A;  2Z12 A;  5B59 A;  1GB6 A;  1B5V A;  1V7S A;  1XGR C;  1JKB A;  2I6Z A;  1JUG A;  4XJI A;  4QGZ A;  2PC2 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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