The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
55
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
High-resolution crystal structures of human hemoglobin with mutations at tryptophan 37beta: structural basis for a high-affinity T-state,.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport
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| source organism |
Homo sapiens
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN)
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| total genus |
55
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-12-08 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1UFP A; 4FH7 A; 5HLX A; 2VEB A; 3WCU A; 2AV3 A; 1NQP A; 1NZ2 A; 5CMV A; 2BKM A; 1J7S B; 2WTG A; 2D2N C; 1SDK A; 2HBS A; 5CN7 A; 1G0B A; 2ZSN A; 2XKI A; 3WCV B; 2FRF A; 1YFF A; 1LFL B; 111M A; 1XZU A; 1Y31 A; 1A0U A; 1JEB A; 1YE0 B; 1MYT A; 1Y83 A; 2OIF A; 1NS9 B; 3LQD A; 1UFJ A; 4YU4 A; 2SPN A; 4TWU A; 1BUW B; 1O16 A; 3WCT C; 1C7B B; 1YIE B; 1YG5 A; 3IXF A; 1THB B; 5C6Y A; 1HBH B; 2B7H B; 1DXU B; 1BBB A; 4O2G A; 3UHR A; 2G0R A; 5HU6 B; 2ZLU A; 1DM1 A; 1GCW A; 2R4Z A; 1CH9 A; 3ZJN A; 1RTX A; 2G11 A; 1KR7 A; 1J3Y B; 2R1H A; 3G4V A; 1ABW B; 1Y8W A; 1C40 A; 1HJT A; 3AQ9 A; 3O89 A; 1CQ2 A; 1Y7G B; 106M A; 1J3Z A; 2M6Z B; 1MLK A; 4ODC A; 3BJ3 B; 3PIA A; 1LJW B; 1S5X B; 2ZT2 A; 1GDK A; 2G0S A; 1V5H A; 1Y0C B; 4L7Y B; 4JAC A; 1HBR A; 4MAX A; 1Y85 A; 4DC7 A; 1LFT A; 1SPG A; 2YRS A; 3UGY A; 2MHB A; 1PBX B; 1GVH A; 1YZI A; 1FN3 B; 1JF4 A; 2ZST A; 3PI9 A; 3MBA A; 1MKO B; 3PT8 B; 3HF4 B; 1BVD A; 1NPF A; 3UHG A; 4U8U C; 3DR9 A; 4YU3 A; 3WCT B; 1Y7D B; 1IBE B; 2ZSS A; 2GTL A; 3IC2 A; 2VLX A; 2ZLW A; 1HGC A; 3NML A; 1OUU B; 1NZ3 A; 4N7N A; 1CP5 A; 4ESA A; 1Y35 A; 3CIU B; 3LB4 A; 3UHW A; 3G4Q A; 1LFV B; 5JDO C; 5F2A A; 2MYC A; 1RQ4 B; 5CNG A; 1DTI A; 4NK1 A; 3QM9 A; 3S1I A; 2HBE A; 3WCU C; 4UUR A; 1YVT B; 3ZH0 A; 3D1A B; 4TYX A; 4MQJ A; 1AZI A; 5E29 B; 3BJ2 B; 1MNJ A; 1HAB A; 1OUT B; 1NS6 B; 2V1G A; 1YE2 A; 5HY8 A; 5AZR A; 2BMM A; 3WCV D; 1XCH A; 1Y4R B; 2ZSY A; 4KMW A; 1R1X B; 2DN2 B; 1YDZ B; 2O5L X; 1CG5 B; 2GNW A; 1JWN A; 3B75 B; 3GYS A; 1Y5F B; 2EKT A; 2ZLX B; 1U7S A; 3DUT B; 3E55 A; 3UHE A; 1CLS A; 1MOH A; 1BZ0 A; 3M39 A; 4ROL A; 1FHJ A; 1OBM A; 4HRT B; 5D5R A; 5ILM A; 1AJ9 B; 1HBG A; 2LH7 A; 5CN9 A; 1Z8U B; 103M A; 3CY5 B; 4O35 A; 3OVU C; 3FH9 A; 3R5I B; 3S1J A; 3P5Q A; 3WCU B; 3G52 A; 1X3K A; 3WHM A; 1CH2 A; 4UZV A; 1MYG A; 1DTM A; 1S0H B; 1FAW B; 1NGK A; 4NXC A; 1SDK B; 1NEJ B; 1MBO A; 3NMM A; 2HBS B; 1G0B B; 3AQ8 A; 2H35 A; 1XZU B; 1Y31 B; 1JEB B; 1X9F C; 2G3H A; 5AZQ A; 3ZJQ A; 1YOI A; 1VXB A; 4YU4 B; 1HBI A; 3U3E A; 1EBT A; 1BZZ A; 3WCT D; 2GTL C; 2G0V A; 1IWH B; 4ZVA A; 4NI1 B; 1F63 A; 1A01 B; 3EOK A; 1NWI A; 1O1J B; 4F6J A; 1C7D A; 1GCV A; 3UHC A; 5CHQ A; 2AA1 A; 4KMV A; 2DN3 A; 3IC0 B; 110M A; 3ONZ A; 1UVY A; 4F6I A; 4IRO A; 4F6G A; 2R1H B; 2ZT3 A; 1YEV A; 1Y8W B; 1JW8 A; 3MJP A; 1NXF A; 3BA2 A; 1M6C A; 1O1M B; 4KN3 A; 4ODC B; 3ZJI A; 2W6V B; 1A3N A; 1Y09 A; 3PIA B; 2BLI A; 4L2M A; 2O5T X; 1YEN A; 1SPG B; 2ZFB A; 5CN8 A; 5HLU A; 1GDL A; 1MBS A; 5E6E A; 5F0B A; 1FDH G; 3ZJS A; 5B85 A; 2MGB A; 5EQM A; 1QSH B; 3QZZ A; 1A6N A; 1MLF A; 4PQB A; 1X9F B; 3QZX A; 2HZ2 A; 4MQI A; 3MOU A; 3ZJH A; 1J7S A; 1IRC A; 1AJH A; 1MLO A; 1RTE A; 3WCV A; 3OZV A; 2GTL B; 3IC2 B; 3QJC A; 1LFL A; 3D17 A; 3GDJ B; 1QXD A; 5EV5 A; 3UHQ A; 1NS9 A; 1JF3 A; 4HRR A; 3QM5 A; 1Y35 B; 2JHO A; 1BUW A; 1ABY B; 3ARJ A; 1A0Z B; 1CH1 A; 1YIE A; 2V1H A; 1LUE A; 3NFE B; 1HBH A; 1DXU A; 3HHB A; 3EU1 A; 1N9I A; 5AB8 A; 1DO3 A; 4VHB A; 1UIW B; 112M A; 3VHB A; 2MGJ A; 1VXE A; 1HAB B; 1YMC A; 2IN4 A; 1UVX A; 1MLH A; 1Y7G A; 1DUK A; 5ILE A; 1LHS A; 3BJ3 A; 4N7O B; 1LJW A; 1DKE B; 1F65 A; 3QM6 A; 4L7Y A; 1Y0C A; 2FRK X; 2DHB A; 1MDN A; 3H57 A; 1ABS A; 3GYS B; 1VXC A; 2W6X A; 3LR7 A; 1PBX A; 1MCY A; 2NSR A; 1FN3 A; 1DUO A; 5SW7 A; 4GZG A; 1CLS B; 3HF4 A; 2G0X A; 2ZSO A; 1RPS B; 2GRF A; 3KUO A; 1GDJ A; 1S69 A; 1YVQ B; 2VYZ A; 3WCT A; 2GKM A; 1Y7D A; 3SZK B; 2G14 A; 1MLN A; 2ZFO D; 1MLL A; 1OUU A; 3FH9 B; 3P5Q B; 3CIU A; 1Y46 A; 4B4Y A; 4FWY A; 2ZLV B; 3ZOM A; 1MOD A; 3S65 B; 3M3A A; 3ZJR A; 1R1Y A; 3WFX A; 1A6G A; 1YIH B; 3QMA A; 3D1A A; 2XKH A; 1X9F D; 1HAC A; 5E29 A; 3BJ2 A; 3OZU A; 1BZZ B; 1NS6 A; 1MYJ A; 4M4A A; 3WCV C; 3IA3 B; 1KD2 A; 2V1E A; 1YGF A; 3GQG A; 1Y4R A; 3LR9 A; 1C7D B; 3HEO A; 2R50 A; 1Y8I B; 4C0N A; 1JY7 B; 1VXA A; 3GQR B; 2DN2 A; 3QQQ A; 1Y01 B; 1CG5 A; 3ONZ B; 5CNF A; 1UC3 A; 1MNI A; 3UGZ A; 3PI3 A; 4IRO B; 2GRH A; 1XY0 B; 2MGA A; 4PQC A; 1A3N B; 1EWA A; 1CBL A; 3WTG B; 2ZT1 A; 1HHO B; 107M A; 1CH5 A; 2AUR A; 1QI8 B; 4G1B A; 4H07 A; 3VAU A; 1PMB A; 4B3W A; 1XZ4 A; 1H97 A; 3GQP B; 5E6E B; 4XDI A; 4FC3 A; 1EBC A; 5KKK A; 3CY5 A; 1LH2 A; 1DO4 A; 1BZR A; 3ARL A; 3R5I A; 102M A; 2H8D A; 2R4W A; 4H0B A; 1IRD A; 1DXT B; 2NX0 A; 1WVP A; 1S0H A; 4BJA A; 1FAW A; 1J7W A; 4MQI B; 1GBV A; 3ZOL A; 1YH9 B; 1NEJ A; 2WTH A; 3NG6 A; 3ASE A; 108M A; 1BZP A; 3QJC B; 3D17 B; 3O7N A; 1MBD A; 2GDM A; 2QFK A; 1QXD B; 4HRR B; 1MNK A; 3W4U A; 4WCH D; 1K1K A; 1J41 B; 3QJB A; 1DXD A; 1MYI A; 1IWH A; 2GNV A; 3E5O A; 1MLS A; 2EF2 A; 4NI1 A; 1A01 A; 1T1N A; 2HBC A; 3HC9 A; 1O1J A; 1VXG A; 3HHB B; 3EU1 B; 1CG8 B; 2IG3 A; 3G4W A; 4MU5 A; 5EU2 A; 5JDO F; 104M A; 3IC0 A; 1RSE A; 2LHB A; 1XZ7 B; 3K8B B; 4WJG 1; 2VEE A; 1TES A; 1N9F A; 1O1M A; 3S66 A; 2ZFO A; 3A2G A; 2W6V A; 2RI4 A; 5EYS A; 4MBN A; 2DHB B; 4ILZ A; 2AUQ A; 1LH6 A; 1JDO A; 1Y2Z B; 4HSX A; 1ECO A; 5SW7 B; 1GBU B; 1YCB A; 1QSH A; 2ZSR A; 4AVE A; 1A6K A; 5EE4 D; 1X9F A; 3KMF A; 2ZLT A; 4MXL A; 1LFZ A; 1RQ3 A; 3UHD A; 3K3U A; 3UHH A; 3PI8 B; 2GKN A; 2Z6T A; 2FRI X; 4NXA A; 3GDJ A; 5EYJ A; 3MJU A; 1Y8H A; 2G10 A; 1ABY A; 2ZS0 B; 1A0Z A; 1Y46 B; 1F5P A; 3AT6 B; 1BVC A; 3MN0 A; 3EDA A; 2ZT0 A; 3NFE A; 2OH9 A; 4N8T B; 1G0A B; 1R1Y B; 1UIW A; 1X46 A; 1K0Y B; 2QSS B; 1HAC B; 4FWX A; 2AUO A; 2V1F A; 1N9H A; 3GKV B; 4M4A B; 1JZM A; 4F6B A; 3OZW A; 1KD2 B; 1YGF B; 3M38 A; 1A9W E; 3GQG B; 1Y0W B; 2MBW A; 3UBV A; 3WCP A; 4N7O A; 2G0Z A; 4N7P B; 1DKE A; 1F5O A; 1BIN A; 3GOU B; 1LHT A; 3QJD A; 3QJE A; 4X0L B; 2LH6 A; 2HHD A; 3UH5 A; 1RPS A; 1YMA A; 1HBB A; 1J3F A; 2SPL A; 1LH5 A; 1YVQ A; 2BW9 M; 1Y5J B; 1HBS B; 3G46 A; 5EOH A; 1XZ4 B; 2NRM A; 3SZK A; 1Y4P A; 5MBA A; 3A5B A; 2ZFO C; 4FC3 B; 3ORD A; 1VRF A; 1S5Y A; 2W6W A; 2HCO A; 3WFT A; 2MYA A; 1XZV B; 2H8D B; 2PEG B; 1IRD B; 3TM3 A; 2BK9 A; 3ECZ A; 2EKU A; 1J7W B; 2ZLV A; 1GBV B; 1IT2 A; 3S65 A; 3MYN A; 1ASH A; 4QAU A; 3NG6 B; 1Y0T B; 1A00 A; 3UBC A; 1YIH A; 1NZ5 A; 3KMF C; 1CO9 A; 1DXC A; 1YOG A; 2MGF A; 1VXF A; 3W4U B; 4MBA A; 3AG0 A; 1K1K B; 2LH1 A; 3QJB B; 1Y4B B; 1XQ5 B; 2O5Q X; 1T1N B; 2HBC B; 2WY4 A; 1JL7 A; 1O1K A; 1O1P B; 4G51 B; 2C0K A; 1DWR A; 1Y8I A; 5CHR A; 1JY7 A; 3GQR A; 3AT5 B; 2ZS0 D; 1SI4 B; 1MTJ A; 3HYU B; 1XZ5 A; 1CQX A; 3V2V A; 2Z8A A; 1XY0 A; 3A59 A; 3S66 B; 2ZFO B; 1DO7 A; 2NSS A; 3D1K B; 3QM8 A; 3WTG A; 1HHO A; 2RI4 B; 3ZJL A; 1QI8 A; 2O5S X; 4ZVB A; 1VHB A; 2RAO A; 1NZ4 A; 3DHR A; 3GQP A; 1Y0D B; 1BIJ A; 2HHE A; 1FSL A; 5B84 A; 2BWH A; 2D6C A; 1G08 A; 2QMB B; 3S48 C; 1CO8 A; 5C6E A; 2ZLT B; 1DXT A; 1LFZ B; 1RQ3 B; 1O1N A; 3NL7 A; 1SWM A; 1YH9 A; 3HEP A; 1MYH A; 1JP9 A; 1HV4 B; 1CIO A; 4NS2 A; 2GL3 A; 1MGN A; 1MLG A; 2CMM A; 1URY A; 3MJU B; 1Y8H B; 4HSW A; 1YEU A; 4XS0 B; 1J41 A; 3OK5 A; 1UT0 A; 1RQA B; 3OO4 B; 1Y4G A; 1IOP A; 2Z85 A; 2ZSQ A; 6HBW A; 1JL6 A; 1CG8 A; 3ARK A; 2MYB A; 3OO5 A; 5KER B; 3M3B A; 1GZX B; 3AQ7 A; 4F6F A; 1XZ7 A; 3K8B A; 3PI1 A; 1D8U A; 1LTW A; 2HHB B; 3V2Z A; 2HBF B; 4TWV A; 5HLQ A; 4H2L A; 3G4U A; 3WCP B; 4HHB B; 3RGK A; 1EMY A; 5JDO E; 3A5A A; 1YEO B; 1GLI A; 1Y2Z A; 3QJD B; 3QJE B; 2HBD A; 4DC8 A; 2ZWJ A; 1GBU A; 1VXD A; 2HHD B; 1SHR B; 2MGG A; 1NIH A; 5EE4 C; 5JOM A; 1CP0 A; 3ZJM A; 4NK2 A; 1HBB B; 2LH2 A; 5CNE A; 1O1O A; 2MGE A; 4MQG B; 2HZ1 A; 3PI8 A; 1Y4P B; 5CN4 A; 1HDB B; 1S5Y B; 4UIQ A; 2HCO B; 4M4B A; 4O4Z A; 2OHB A; 4FWZ A; 1V4U B; 2QSP B; 1LA6 B; 1HBA A; 5CNB A; 2ZS0 A; 3RJ6 A; 3UHI A; 3AT6 A; 3PT7 B; 1MNO A; 5EUI A; 4N8T A; 1A00 B; 1G0A A; 1SDL A; 1HCO A; 3WCW D; 1MOA A; 1K0Y A; 2QSS A; 3WFU A; 1IDR A; 1Y7C A; 5KDQ B; 4MPM A; 4NI0 A; 1A3O B; 3GKV A; 3UH3 A; 1Y4F B; 1O1K B; 1Y0W A; 3HEN A; 4N7P A; 4G1V A; 1S61 A; 1HLB A; 1M6M A; 1H1X A; 1Y4V A; 3MKB A; 1YHU D; 1BZ6 A; 1XZ5 B; 2O58 X; 3GOU A; 1M9P B; 1XZ2 B; 4X0L A; 2VHB A; 3H58 A; 3A59 B; 2VYY A; 1COH A; 5JGG B; 1B86 B; 3KUN A; 1Y5J A; 1V75 A; 1HBS A; 3BJ1 A; 3UH7 A; 4ROM B; 1QPW B; 2RAO B; 1BAB A; 2QU0 B; 5E83 B; 3MVC A; 1KFR A; 3DHR B; 1BIJ B; 1OR4 A; 2HHE B; 2ZS1 B; 2D60 B; 4O1T A; 5MBN A; 1XZV A; 2D5Z A; 1G08 B; 3ECX A; 1OJ6 A; 1UX9 A; 2PEG A; 1DXV A; 3DHT A; 5C6E B; 1V4X B; 3VRE B; 1O1N B; 2V1J A; 1MWB A; 2D2M B; 3NL7 B; 3TM9 A; 1JP8 A; 1O1L B; 3FS4 A; 1Y0T A; 2DXM A; 3GK9 A; 1MTI A; 1CH7 A; 1Y7Z A; 1XYE A; 1ECN A; 3D7O A; 5CND A; 1YEU B; 5ILP A; 3PEL B; 1Y4B A; 1XQ5 A; 3HRW B; 1J40 B; 3RJN B; 1DLW A; 1Y4G B; 2BLH A; 6HBW B; 1MYM A; 1O1P A; 1MZ0 A; 4F4O A; 2XYK A; 4G51 A; 1B0B A; 1URV A; 4MQC A; 3OO5 B; 4FH6 A; 1Y22 B; 2ZS0 C; 1QSI A; 3AT5 A; 1SI4 A; 3UHY A; 3HYU A; 1GDI A; 1IT3 A; 1MBC A; 3ODQ B; 2H8F A; 2EB8 A; 2MB5 A; 4H2L B; 3EDB A; 3D1K A; 3TLD A; 3WR1 B; 2DN1 A; 1QXE A; 1Y8K B; 1Y45 A; 1MOC A; 3OJ1 A; 1C7C A; 2QLS A; 3UHT A; 2MGH A; 4PQ6 A; 2EB9 A; 1GLI B; 5HAV A; 1N9X A; 1HGB B; 1XXT B; 1Y0D A; 2HBD B; 1Q1F A; 3A0G A; 1NIH B; 3LHB A; 3WCW A; 1FSX A; 2QMB A; 1ECA A; 1FCS A; 1O1O B; 1Y4Q A; 1LFY A; 3AQ5 A; 2DC3 A; 3UI0 A; 4SDH A; 4NZI A; 2D2N B; 1DWS A; 1CPW A; 2PGH B; 2BLJ M; 1HDS A; 2EVK A; 2MGD A; 1HV4 A; 3G4R A; 1YCA A; 1ECD A; 4M4B B; 2R80 B; 1HBA B; 2AUP A; 4XS0 A; 1YEQ A; 6HBI A; 1YHU A; 1RQA A; 1JZK A; 3OO4 A; 1CMY A; 1MBI A; 5EUI B; 5EET A; 2ZS1 D; 1A4F B; 2GRZ A; 5CN5 A; 1SDL B; 1HCO B; 5KER A; 1V4W B; 2EVP A; 1NAZ A; 1GZX A; 3WFW A; 1Y7C B; 1BJE A; 2FAL A; 2Z6N B; 4NI0 B; 3ZHW A; 2D2M D; 3LB3 A; 1DWT A; 2HHB A; 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