1A23A

Solution nmr structure of reduced dsba from escherichia coli, minimized average structure
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
publication title Structure of reduced DsbA from Escherichia coli in solution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DSBA
total genus 40
structure length 189
sequence length 189
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a23A00
5KN2A 2VCXA 1U3IA 4IJIA 3TB2A 5J4UA 5AIVA 3ZFLA 4BWQA 7GSSA 1THOA 4EO3A 2I9HA 1DE2A 2X8CA 4JEDA 1AIUA 4G2EA 2LTKA 3ERWA 4Q5RA 2LRNA 5DALB 4MJEA 5A4UA 1RW1A 2J23A 2HFDA 1NW2A 4QL7A 3HVVA 3F0IA 4WF4A 3WT2A 2YN1A 3EVIA 2LS5A 5ID2B 3ZRDA 2FY6A 3J7Yk 1M9AA 3GKNA 3FW2A 3CXGA 2NBSA 5ELAA 3HA9A 4HI7A 3C8EA 1FB6A 1XIYA 3E0UA 5AGYA 2IL3A 1F37A 1HQOA 1PN9A 4KNDA 4AJ6A 4XS1A 4ZL9A 1XVWA 2PMTA 4IQAA 3ZVJD 4TOPA 1AQWA 4POMA 1ST9A 4K6XA 1V57A 3KH7A 1A2JA 1ZYEA 4TR1B 3VFIA 2VLUA 3KP8A 4HUAA 5ENUA 4I6XA 2VUPA 3QCPA 1N2AA 2B3SA 2L6DA 5CREA 4TN8A 2AHEA 2O85A 3FY7A 3P90A 3Q19A 1R26A 2AYTA 5GAPD 2JSYA 4GSTA 3GMFA 3NIVA 4EDZA 2AV4A 4PQHA 1XVQA 1ZOFA 5LNKe 1HNBA 3UVHA 1QMVA 4ECJA 3C73A 4LA1A 5A5KA 4XTSA 1HYUA 4LMVA 5L71A 1E6BA 3IDVA 2PWJA 4TXOB 4V1Ap 5EY6A 3EURA 4NHZA 2H1DA 2N5AA 5JCGA 2DMLA 4ZL8A 1K0MA 1UC7A 1M2DA 2TIRA 2BTOT 1XBSA 4HDEA 3FZ5A 5B7CA 2P5QA 3VWWA 8GSSA 3Q74A 2GSTA 1WP0A 4JZQA 2YWIA 5DVBA 1W4VA 2AUVA 5CAXA 2BMXA 2PBJA 2IWTA 2CQ9A 1I9DA 1O81A 3VPQA 1XXUA 1YEPA 2YNXA 3IAM2 2K9FA 1QQ2A 4PX1A 1FHEA 4EF0A 1Q4JA 3GL3A 12GSA 2VM2A 5JWQB 4WKWA 3H8QA 3I6AA 2LNSA 5COHA 1XOBA 4GLTA 5IMZA 5EVOA 5B8AA 2JZSA 3LG6A 4WR5A 3ZREA 1ILOA 1NHYA 5H5QA 4MF6A 2L59A 1U3AA 1QGVA 2XHFA 2CVBA 1GULA 2L4QA 2H0GA 5FWGA 2CV4A 11GSA 3ZIVA 1N8JA 5DAKA 5EPFA 1R5PA 3FR3A 5DJLA 1A23A 1ACVA 3FEUA 5J41A 3GKXA 1V98A 5D8IA 1GRXA 4MZBA 4K2DA 5ECHB 1G6WA 3F6DA 4NHWA 4WEYA 4NAXA 3GYKA 2GSSA 1K3OA 2E2GA 1M99A 5HFKA 3TJJA 3CTGA 1YJ6A 3WYWA 3M1GA 3NOFA 2GT5A 2GSRA 2OKAA 3KJYA 4Z7XA 2B5EA 3I69A 3TJGA 4I2TA 1XZOA 3NZNA 4JE1A 3GX8A 1WPIA 4HZ4A 1EP7A 1SD8A 1E2YA 1V40A 2DJ1A 5C00A 2L4CA 6GSYA 4BL7A 4KSMA 2LJAA 2X64A 1HNAA 2LJRA 1GSFA 1FO5A 5IO2A 1G7EA 1BX9A 4X43A 1GSYA 2HZFA 3BCIA 3ZFBA 3J7Yb 2VD1A 5J9CA 2E2MA 4X1UA 1O7UA 3FZ9A 6GSTA 1T4YA 5GSTA 2C3TA 1MD4A 2CZ2A 5DCGA 5B8BA 1SU9A 2IMFA 3A3TA 1SJIA 5CRGA 2TRXA 1PSQA 3HJOA 4AJ7A 2VM1A 1AQXA 2V1MA 1GP1A 1OC9A 2DJ3A 2CAIA 3CYNA 1B9YC 3DEXA 4O92A 3UARA 3HD5A 2C4JA 2KHPA 1CQGA 2V6KA 4WR4A 5CP1A 5G2ZA 3G9BA 1SK1A 1OKDA 3KMNA 2I81A 3IK9A 2PPTA 5DAKB 10GSA 4NWYA 2NPBA 1T4ZA 3UAPA 1GTUA 3H1NA 2H76A 4POLA 2FCHA 2WGRA 5DBQA 5D9TA 3D4MA 2C0DA 2YCDA 2ALBA 5A4WA 2FWGA 4FYBA 1FAAA 3CRTA 2FWFA 1ABAA 3F63A 4FYCA 3TJKA 5G1LA 3LEFA 3RDWA 3GHAA 2B1KA 3HY2A 2H66A 2GZYA 3ZMKA 3APOA 4BVXA 2DJKA 1ML6A 2NDOA 5ECNB 1JZDA 4KCEA 2MYGA 2VCZA 2C0FA 1V9WA 2H6YA 1A2MA 4I8BA 1VF3A 4ID0A 5F0GA 2WDUA 3W8JA 2L6CA 1TRWA 1WJKA 2NTOA 4MLYA 5ECRB 2GVPA 2Z9SA 4JU5A 4KDYA 4EDYA 3TUEA 4NMUA 3RPPA 4ACSA 1WOUA 1S3CA 2XBQA 1SK0A 2YOIA 2G0FA 4N0ZA 1BAYA 4MA9A 3HCZA 1OC9B 1Z6NA 6GSUA 1DUGA 2CX3A 4HS1A 1A24A 5GAND 1YDKA 3TKSA 3L4NA 3DKSA 2CVKA 4GQCA 1TU8A 3VI7A 3HJMA 3CSIA 2ON7A 3LORA 1PL1A 2GQMA 1V58A 1M7TA 2XPDA 1A8LA 1TW9A 1W89A 3L9VA 3GA4A 2MMZA 4J57E 4FYUA 3HVXA 1X9WB 2XPEA 1OKTA 1C72A 2C0EA 3KH9A 4HQZA 3ZTLA 3EE2A 1TOFA 3F4RA 2AB6A 4V2LA 2YJHA 1J9BA 3US3A 1YF0A 2F51A 1PMTA 1R5AA 3KM6A 1TXXA 1EOHA 1PD21 4F03A 1OC8A 3EMPA 6GSSA 1G6YA 2YPMA 2VL2A 2B7JA 3ME7A 2GT6A 3C1RA 4KUNA 4DVCA 3FRCA 1USBA 1Z9HA 3IAS2 3ZZXA 1XW9A 1WE0A 4YAVA 4TRXA 13GSA 2R3XA 1BQ7A 5JWOB 1QUWA 3FYGA 2MMOA 4MABA 2LNTA 1RQMA 4V1Ag 5ECOB 1R7HA 1A0FA 1SD9A 1KBNA 2WFCA 1YKAA 3C1SA 3LFLA 4IGJA 2X99A 4L0WA 3UMAA 4HOJA 1BG5A 1PQNA 2YWOA 1AAZA 3KXOA 3TRQA 4L8EA 2HRNA 5KEJA 2VL9A 2YJ7A 4HZ2A 3HZ8A 4ML1A 2HSYA 2VIMA 1GSDA 1MDKA 2O89A 4LMWA 5CRHA 1XWGA 1GSSA 1Z3EA 2AAWA 3DYRA 5G30A 3HHVA 2HSHA 2EC4A 1B4QA 3HKRA 1PA3A 5G31A 3QFBC 5HR3A 3KIJA 2P0GA 3U6VA 1TI3A 1XWKA 4NV5A 4DEJA 1TK5B 3Q18A 3APSA 1PX6A 4LL1B 1JZRA 2K6VA 3GTUA 4H86A 2LRCA 3CTFA 1SK2A 2FA4A 3TKRA 2ES7A 1ZYQB 3GX0A 3BOAA 1QXHA 4OMVA 1F3BA 1O8XA 4TKYA 3LQ7A 2FA8A 2GZZA 5ECMB 4ZL7A 4XIHA 3A5WA 1U87A 2RUEA 3F4TA 3M9JA 3KEBA 2K18A 4ML6A 4F0CA 2LKUA 2WJUA 4Q5QA 1WMJA 1ZZYA 3ED3A 4GXZA 3WGEA 1K3LA 1XFLA 1TJDA 5CNWA 6GSXA 2H70A 2O8VB 1XPVA 3PINA 1GUHA 1K0DA 4RUVA 3A2WA 2JZTA 3TRXA 3DGQA 4X0XA 3QPMA 5DCHA 2GQKA 2F3MA 1YY7A 4PURA 2H6XA 3RBTA 4L5LA 4MP4A 1GTIA 2LQQA 1THXA 4P3YB 1CQHA 2IMEA 1QFNA 2H73A 3CBUA 4KB3A 1PL2A 1WWJA 4K8MA 3JCML 2B6MA 2VCWA 1T1VA 4KCAA 1Y6EA 2HZEA 1YKCA 2C3NA 1JHBA 1DE1A 22GSA 4BVYA 1VF1A 3TGZA 5ECLB 4MJAA 3SWLA 3GV1A 3GSTA 4MPGA 4O7HA 4MJCA 3LWAA 4KAEA 4E8EA 3GSSA 3GIXA 5AN1A 2B1LA 2MBSA 4IP1A 4FH8A 2H74A 3RPNA 2HI7A 14GSA 3WT1A 2C8UA 3FR6A 1H75A 3GTUB 3QOUA 4GSNA 3KCMA 5HR2A 2MMNA 4N10A 3WD6A 2E0QA 1SKWB 2FWHA 4GCIA 20GSA 2RM6A 1FG4A 5IM9A 3LJRA 5J9BA 4ECIA 3IOSA 3DRNA 1X5CA 1ON4A 3GKKA 4L5OA 3G7IA 2WRTA 5GZZB 4WBRD 4DSQA 3TKSE 3RHBA 3EU3A 1MTCA 2H19A 1WRYA 2YZHA 1AXDA 2YZUA 6GSVA 3IRAA 4ULXA 4J56E 1ERWA 4MZCA 2ZCTA 2WB9A 2OE3A 4BA7A 4F82A 5HR0A 6GSWA 4HU9A 2PU9C 2JADA 3A2XA 2N5FA 3QAVA 2GDRA 5E4WA 4DSRA 2V2GA 2CT6A 3GH6A 3FZ4A 1SYRA 3A2VA 5CYYA 2R37A 2O7KA 3CSJA 2M72A 1GNEA 2B5YA 2IJYA 4ZIJA 1Y25A 2OE1A 5ECKB 4IVFA 1EZKA 2LJKA 4N11A 3GURA 1XOAA 2V41A 2JU5A 4O5RA 2YWMA 4K0GA 2HT9A 3OR5A 3E9JB 4ZBBA 3HDCA 1GNWA 3GL5A 4EKZA 5IMVA 1XW5A 3D6IA 5IIZA 2HZEB 2L57A 4F9ZA 1EGOA 2IFQA 1X9SB 2VO4A 3TKPA 4IN0A 2C0GA 1SKRB 2DMMA 2X8HA 4IKHA 2E7PA 1EEMA 4CW9A 3F6FA 1EOGA 5AISA 1G0TA 1EGRA 2D2ZA 3GH9A 1NHOA 3SBCA 3LXTA 3DD3A 2H72A 3BCKA 1SJZA 4TXVA 2EIQA 1GWCA 1JZWA 1G7OA 3D21A 4XRAA 4YAPA 4WF5A 3P8WA 4MDCA 3ZITA 3AY8A 1K0NA 3UJ1A 1I5GA 1PX7A 2I3YA 1XWAA 3L9SA 1S3DA 4ZILA 4G10A 3ZIJA 2LRTA 3F4SA 4PQ1A 5ECIB 3ZVJA 5DDLA 3HJPA 2HRFA 2OJLA 1BYEA 4ILFA 4OCFA 2OA7A 1BEDA 3PGTA 3M8NA 3RHCA 5KN3A 1EWXA 3VURA 2A2SA 5JCWA 4BPYA 1GL8A 4K0NA 4MMMA 3BBYA 5AIXA 3W6GA 4V2MA 5F07A 1X5DA 2JSZA 2GSQA 1YF1A 3WGDA 3GN3A 3DWVA 2FUG2 4OFTA 1KTEA 2ON5A 4OD7A 1K0CA 3KTBA 2FLSA 2H1BA 3KD0A 1VGLA 3KP9A 4I5QA 4EC0A 3TJBA 2CX4A 2WS2A 4MF7A 3KZQA 1FW1A 5IOXA 3GUSA 1O8WA 3IPZA 3LSZA 3H93A 2KUCA 1O6JA 2QKEA 4KSOA 2IMDA 1TRVA 3VWUA 4IS0A 4IHUA 5IOWA 5IMFA 2JZRA 4MK3A 1FVKA 3TJFA 1HNCA 3M3MA 3QD9A 4JR6A 1JFUA 4N0VA 4WBJA 4TR1A 4QL9A 2IFQB 4PGTA 1XW6A 1SENA 3FK8A 2H30A 2KP2A 2P5RA 2REMA 4KE3A 4EUYA 2VCTA 4JRRA 5IMCA 2IN3A 3M9KA 2HLSA 5D9WA 1ERUA 2R4VA 3TDGA 2R5GA 4ZB8A 2H01A 5E59A 2MBTA 2QSIA 2K8SA 2ZUPA 5G5EA 2N5BA 3WGXA 1EV4A 2EIRA 2YANA 1A0RP 3APQA 2HE3A 2TRCP 2B7KA 2AJQB 3H79A 1GH2A 3P7XA 4GRFA 2WULA 4G9HA 2IMKA 5D9VA 1LBKA 1DBYA 3F8UA 1Z6MA 2B5XA 2VAFA 2HNLA 3U5RE 5CRWA 3O76A 4GTUA 3L9UA 3ZMLA 2H8LA 2VL2C 1SL1B 3IR4A 2LSTA 2CAQA 2PGTA 4XHMA 3FR9A 1EEJA 3V1WA 2OE0A 4RQRA 3LXZA 1URMA 2M80A 3DIEA 3PH9A 3PR8A 2YV9A 2YV7A 1GUKA 3P2AA 1GSEA 1JLWA 1PRXA 4V2NA 5GSSA 4ZBDA 2H0IA 1MDJA 5EL8A 4I2UA 4K1FA 1RK4A 1M9BA 2JACA 2FWEA 1SJ6A 4POKA 4ZB9A 4MH3A 3QAWA 1GSQA 3HYPA 2H1GA 5JCUA 2XC2A 2CVDA 4K9ZA 2YWNA 4GSSA 1OYJA 1TK8B 4TVEA 5DQSA 2FGXA 4G19A 1NSWA 3HZ4A 3UBKA 1OE7A 4WXTA 1R4WA 1TRUA 1KNGA 3O6TA 2C1YA 1LU4A 1A2LA 2O87A 1DSBA 4O32A 2YP6A 3EU4A 3DVWA 2DJ2A 1XWBA 2OBIA 3EMXA 4TR0A 2DIYA 5FT3A 3G7YA 5CRDA 1X0RA 4OO5A 3DXBA 4YH2A 2RLIA 5LCZA 4PXOA 2DC5A 1A8YA 3FHKA 4NV2A 1NM3A 1Q98A 2ZNMA 3MNGA 1GSUA 4GWRA 3EINA 4IW9A 1GLQA 2VL3A 2LUSA 2LQOA 2PN8A 4OWYA 3IA1A 1MD3A 2GS3A 1K0OA 3HXSA 2OACA 4J2FA 4CHSA 4GF0A 4PUAA 5HFGA 3I9V2 2F8FA 4OFMA 3MAKA 2DIZA 1XCCA 2QGVA 1OVNA 1Z7PA 1X9MB 3ZYWA 2H1AA 3C71A 4D73A 4ZXGA 5D9XA 4DSSA 19GSA 4KDXA 4IJ3A 4MZWA 1T00A 2J9HA 1ERVA 2GZPA 3E3EA 4KA0A 3L78A 2EIOA 3TOTA 1U88A 2IIYA 4FO5A 3VK9A 3VPTA 2K8VA 1FB0A 5F05A 1VRSD 4F0BA 2V6OA 2BJXA 2WCIA 1YEXA 1TU7A 1VF2A 1TTZA 2V32A 4YQUA 3IE3A 1YZXA 4NXIA 3QAGA 4XS6A 5ECPB 4OFNA 5H5RA 3MSZA 3ZL5A 3LYPA 1AQVA 3TRPA 5D93A 16GSA 3ZLPA 1Z5YE 1HD2A 3CMIA 1MEKA 1AC1A 4OO4A 5INYA 1EP8A 4KX4A 5G5FA 2FHEA 5DJMA 1BJXA 1F3AA 4N30A 1O73A 2VD0A 4K7NA 2C3QA 4POBA 2F9SA 3MDKA 1UA5A 3EC3A 1GLPA 3RAZA 2FNOA 4MF5A 3FZAA 4HQSA 2X8GA 5ECQB 1J08A 1JZOA 3VWVA 3EWLA 4KDUA 4ECCA 3IBHA 5F06A 5IPHA 1F6MC 1Z7RA 3D0ZA 3EYTA 1SL2B 1YQ1A 3IXRA 1WIKA 1ZL9A 1FOVA 1TK0B 2VLVA 4AGSA 3VI5A 2KOKA 2RUFA 4PQIA 3UOMA 1MDIA 2PERA 3LGCA 1M2AA 3IK7A 1OE8A 4MCUA 1LJRA 4NPBA 2KP1A 2P31A 3N9JA 4PNFA 4ZB6A 5JWRB 1ZGNA 2VOCA 5IO0A 1ZCPA 3CRUA 1JLVA 3F3QA 2GLRA 1FVJA 1SL0B 3R2QA 3M0FA 2IMIA 2H75A 4EE0A 2DBCA 4D73B 3UL3A 4MH2A 3GFKA 4DSSB 1XWCA 4Q5FA 3C7MA 2HYXA 4K7IA 1OC3A 3Q6OA 5B6NA 5D96A 3D22A 4XS4A 1SYXA 3GRXA 1GUMA 1T3BA 4GQFA 5H5SA 1VF4A 1F2EA 2IPAA 9GSSA 1X5EA 1V2AA 1TI1A 2H6ZA 4PNGA 4YQMA 5B6MA 4CDOA 4K7OA 5IQYA 4EXJA 4HJ2A 4LLRA 1K3YA 2KLXA 1UN2A 4KW6A 4TW5A 3L0HA 4IQ1A 1IYIA 5F8BA 5J3RA 4XRDA 3ERGA 3UVTA 1S3AA 3CSHA 1F9MA 5D73A 18GSA 2HXKA 3FKFA 3O3TA 4QQ7A 4AF2A 2CZ3A 3F3RA 2DLXA 3BD2A 5FHIA 1B48A 1PKWA 4MJBA 1ERTA 3TCOA 4I97A 2I4AA 1TP9A 5IMDA 2A2RA 4RI6A 2WZ9A 2RM5A 2PVOC 3IC4A 2NVLA 2GGTA 4JBBA 2QC7A 3UIWA 4RQXA 4XCSA 2M46A 1PGTA 3DMLA 2GQLA 3K8NA 2R2JA 3TKQA 3UEMA 4WETA 3S9FA 3IHQA 5KN1A 5KN0A 4HU7A 1AUCA 4TR3A 1KEBA 2I1UA 3BJ5A 2RIIA 3ME8A 4PUFC 4ZBAA 1TDIA 5IMAA 5J5NA 1OAZA 4HEA2 2DSAA 1TKDB 1M2BA 1UVZA 4ISDA 5CO3A 17GSA 2C80A 2FD3A 4BWSA 3I43A 2DJJA 3LYKA 4FIWA 1U6TA 3D5JA 4E8HA 3GKMA 5ECSA 4F2IA 2PVQA 5HQPA 3VLNA 1EV9A 3GNJA 2G2QA 1H4OA 2OADA 4LL4B 5HFIA 5DALA 1ZMAA 2GTUA 1QK8A 2VLTA 2H71A 5C04A 5G1KA 4XS4B 3KTLA 1TRSA 3KMOA 1AW9A 4EL1A 4YQVA 4RI7A 5ID2A 1O85A 3KGKA 2DJ0A 4L0UA 3HVSA 4EVMA 3VWXA 2H0HA 5ABRA 1J0FA 4KGIA 4AJ8A 3MWHA 4Q5NA 3UBLA 4IELA 3G7JA 2CA8A 3TOUA 5IPGA 2LV3A 3W8SA 1B4PA 2A4VA 2R6KA 3N5OA 1T8EB 3F9UA 2XBIA 2PUKC 1M0UA 3ERFA 3H4KA 3ISOA 1K0BA 5A4VA 3QDNA 4TR4A 2OBKA 4JR4A 2LEGA 3TKSC 1B9XC 4MPFA 5HR1A 1PKZA 1IYHA 2JL4A 1GTAA 2L5LA 2MZCA 4HJMA 4OCEA 2VCVA 2L5OA 3D4TA 3IV4A 3DVXA 4ECBA 1SKSB 4IP6A 1K0AA 4IBPA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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