1A23A

Solution nmr structure of reduced dsba from escherichia coli, minimized average structure
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
189
structure length
189
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of reduced DsbA from Escherichia coli in solution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DSBA
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 40
structure length 189
sequence length 189
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a23A00
1XW6A 5ECIB 2M72A 1AQXA 2IN3A 4NWYA 4EE0A 3TCOA 3EU3A 1MTCA 3GTUB 1GSSA 1BG5A 1S3AA 3GA4A 1SKWB 2HE3A 1LJRA 1GH2A 1F9MA 2IMDA 5IMDA 5IO2A 1OC3A 1O73A 3ZMLA 1XW5A 3GNJA 2GT5A 2VCTA 1I5GA 4XS4B 1SJZA 3W6GA 2XPDA 4OFTA 3NIVA 1SU9A 3C8EA 1GUHA 1SL0B 5J41A 2LJRA 4MH3A 1XWBA 3GH6A 5G30A 5HR2A 4KGIA 3IAS2 1K0DA 3VURA 1NM3A 5HFGA 2HZFA 2GDRA 4WBRD 1H4OA 5E4WA 1TU7A 2K8SA 3ZYWA 3TJKA 3E9JB 1B4QA 1TTZA 5ECPB 2H6YA 1XCCA 3DXBA 4EO3A 1B9XC 3P90A 1TU8A 2MMAA 3HVXA 2WB9A 2HSYA 3CYNA 3FRCA 2GQKA 4EVMA 5CYYA 5CRHA 1E6BA 3FZAA 4L5OA 1V2AA 4K7IA 3EURA 3UBKA 2FLSA 2YNXA 4MPFA 1ACVA 3QAVA 3H1NA 3DIEA 3KP9A 4V2LA 4KCEA 2QC7A 3GFKA 4K0GA 2GSQA 1ERVA 1EOGA 1GSUA 2VAFA 4ZIJA 1QMVA 1WP0A 2LQQA 3EWLA 3KXOA 5EL8A 2PVOC 3HHVA 1Q4JA 1K0BA 3CSHA 1GRXA 3GHAA 3GRXA 1AIUA 2H0IA 1PKWA 1TK0B 4XS6A 2VL2C 4DSQA 2C4JA 2K18A 1DBYA 2V1MA 2A2SA 3W8JA 2JZRA 3RHBA 3ZVJD 4EL1A 2H6XA 2PVQA 3IHQA 3ME7A 5C04A 2EIRA 2FNOA 4MABA 1T8EB 4POKA 3Q19A 5D9WA 1DE1A 3DVWA 4ECBA 2F3MA 1GNEA 2GLRA 2MBTA 3L9VA 1IYHA 3F63A 1WWJA 3LXTA 5CRGA 2AAWA 3ZITA 1YEXA 1PD21 3QD9A 1H75A 3RBTA 4TXOA 4MPGA 2O85A 3PGTA 4TR4A 1AXDA 6GSTA 2B3SA 4MDCA 3FZ9A 2OE0A 3LSZA 5ECKB 2HRNA 5H5RA 2P5RA 3PINA 4GRFA 3IPZA 2DJKA 4RUVA 3HA9A 4LLRA 4NXIA 4ECCA 3ZZXA 2YZHA 2GSSA 2FA8A 2AJQB 3FYGA 3GSTA 4F0BA 1MEKA 5DALA 3G7YA 1T4ZA 3RAZA 3EE2A 1YF1A 4IGJA 3VLNA 2IFQB 2H6ZA 5GAND 1J9BA 2HZEB 3CSJA 1N8JA 11GSA 2VCZA 5ID2A 2VL2A 3IK7A 1FG4A 2LRTA 4QL7A 1A2LA 2CX4A 4RQXA 5LCZA 4ML6A 2H70A 1T00A 2LRNA 3GX0A 1UA5A 4GQFA 1TI1A 2B7JA 3QCPA 4PGTA 2C3TA 4BVYA 1FB6A 1TDIA 3GKNA 1PX7A 4K7NA 3TOTA 1HNBA 1GLPA 4EDZA 1THOA 2IIYA 2LUSA 3M9KA 2L59A 1X5CA 1GSQA 2GS3A 3ED3A 1SJIA 1BEDA 3H79A 1ST9A 5CO3A 5B8BA 2GZZA 2MMZA 1K3LA 3HVSA 3IBHA 2R3XA 1PSQA 5J3RA 5JCWA 3TRPA 5AIXA 5EY6A 2N5FA 4MCUA 2OE1A 5HFKA 1HNCA 5KEJA 2YWIA 2B7KA 2LEGA 2CA8A 2PU9C 4RI6A 3KIJA 2HRFA 4GQCA 4K1FA 1WMJA 3I9V2 3EU4A 1A2JA 4AF2A 2MMOA 4HUAA 1XWGA 2ALBA 1K3YA 1O8WA 1A8LA 4IW9A 3UJ1A 2H1AA 4XS4A 5IPGA 3VWXA 5ELAA 1OVNA 3G7IA 2VD0A 2MBSA 1BYEA 2XC2A 3BOAA 3TB2A 4K6XA 1M99A 1GSEA 3TKSE 3KZQA 3LYPA 5D9XA 1SK1A 1YKCA 2V6KA 5H5QA 3BCKA 3E0UA 3UOMA 3Q6OA 4LMWA 3N9JA 1AQVA 3VPQA 1FAAA 1BX9A 4ZB6A 2VOCA 1XWKA 3L9SA 3GUSA 1Z3EA 2PMTA 5ECHB 3ZVJA 1O8XA 2LSTA 4MLYA 4GSNA 5JCUA 1GUMA 1DUGA 3U6VA 1K3OA 3WGDA 2VM2A 4G9HA 4KX4A 1FW1A 1Z6MA 1ZYQB 1F3BA 1QK8A 2BJXA 4LL4B 1YEPA 5G5FA 3UL3A 1X9SB 2FY6A 1OC8A 3H93A 1NW2A 1UVZA 2QSIA 3F6DA 1I9DA 5D73A 1PN9A 5J5NA 2H71A 4I5QA 4TXOB 3FHKA 1OC9A 5GZZB 1A0RP 2WS2A 2KOKA 1K0CA 1WJKA 2C3NA 4ZL9A 3F3QA 1MDJA 4K2DA 4KSOA 1X9MB 4WR5A 1SKRB 4K7OA 3UEMA 2L4QA 1YDKA 1B9YC 4X1UA 5J4UA 5DBQA 1U3IA 2H1GA 2VIMA 4WF5A 2JADA 2VCQA 4MF6A 1LU4A 3FW2A 5B6NA 1VGLA 3HY2A 1RW1A 4IP6A 1G7EA 1B4PA 3DGQA 3A3TA 1GSYA 4V1Ag 4MZBA 5D96A 5JWQB 3IAM2 4DEJA 3WGEA 4MJEA 3L9UA 4EKZA 4FIWA 2YOIA 4HQSA 1XOBA 3ZRDA 4TR0A 1TRVA 4MK3A 5ID2B 3ZMKA 5IO0A 1ZCPA 4ZL7A 3LQ7A 2X8GA 1M0UA 2F51A 3O6TA 3A5WA 3TJJA 5ENUA 1DE2A 4OWYA 2O8VB 2YV9A 2XBQA 2CVDA 1SJ6A 4MF5A 5E59A 3TKRA 1MDKA 2I4AA 2R2JA 4IS0A 3ZFBA 1WPIA 1MD4A 1JLWA 1M9AA 3QFAC 2JZSA 2GQMA 2OADA 4POMA 2L4CA 4O92A 3D21A 1XXUA 4MA9A 2MYGA 5KN3A 3J7Yb 3PR8A 3LG6A 2E2MA 2HZEA 3H4KA 1THXA 4IKHA 1PGTA 5F05A 10GSA 3DD3A 2DLXA 4LMVA 2C0FA 1F37A 1A8YA 2C80A 1OYJA 5DVBA 5B6MA 4IBPA 4G10A 4EF0A 5F07A 2DJJA 2PGTA 1F2EA 4H86A 4NHZA 5IIZA 3UARA 4ISDA 2VCXA 3IK9A 3QAWA 3BBYA 2G0FA 5IMZA 2WJUA 4PURA 1ZL9A 3ERWA 2WRTA 2OACA 1F6MC 2B5XA 2C0DA 3A2VA 1ML6A 5A5KA 4K9ZA 2MZCA 9GSSA 2IMEA 3DYRA 4NV2A 1GTUA 2KP1A 2PERA 2LQOA 4TR1A 3HDCA 1SYXA 4GWRA 3WT1A 4POLA 1VF4A 3KCMA 4JBBA 2JU5A 2R5GA 3VI7A 1J08A 4F82A 2HNLA 4KUNA 3IOSA 5D93A 16GSA 5HR0A 2GQLA 2A4VA 2X64A 5GSTA 2O7KA 2VLTA 3SBCA 2BTOT 3APOA 3RPPA 4JZQA 1A2MA 2WGRA 4HJMA 3KMNA 1WE0A 1FVJA 2XBIA 3F4RA 3GH9A 1EGOA 4L5LA 5KN1A 1EGRA 1VRSD 2CZ2A 1NSWA 1UN2A 2L6CA 3D4TA 3HCZA 2NDOA 1JZOA 2DMMA 1PQNA 4ACSA 1G7OA 2PN8A 5IMFA 1OC9B 2VL9A 5G1LA 4N30A 2R37A 1R4WA 1V98A 2OKAA 1ZZYA 2VD1A 1E2YA 5G31A 1U87A 1HYUA 4MP4A 3TOUA 4AJ8A 2ZCTA 2IMKA 1XWCA 1TXXA 1XBSA 2CV4A 2I3YA 1Z9HA 1JZDA 2AUVA 3TRXA 4IQAA 2IL3A 5B8AA 1BAYA 4TVEA 4ZB8A 2H19A 3UIWA 4PXOA 3F6FA 1GSFA 3KP8A 4EDYA 4QL9A 5ECLB 1JLVA 3GIXA 2FWFA 1R5PA 2L5OA 4KDUA 3IXRA 4ULXA 3US3A 5A4VA 2TIRA 2P31A 1EEMA 5IMCA 4ZBBA 4O5RA 2LS5A 2CAIA 1JHBA 4GXZA 4GF0A 2DIZA 3M0FA 4ZBDA 4QQ7A 3M3MA 4YQMA 2OJLA 4WBJA 2KP2A 22GSA 5DCGA 2LJKA 1T3BA 1OKTA 4O7HA 4TKYA 2VCVA 4OO5A 3WYWA 6GSSA 3HKRA 4POBA 2C8UA 3P2AA 5JWOB 19GSA 2KLXA 1EZKA 2P5QA 4ID0A 2L6DA 3TJGA 3BD2A 3KEBA 3KH7A 3L4NA 4HZ2A 3CTGA 4FYUA 5ELGA 4PUFC 1O6JA 4TRXA 4GLTA 4XS1A 2C3QA 3ZL5A 4EC0A 1X5DA 3QAGA 1XFLA 3KJYA 3L78A 3ZFLA 4Q5RA 1ON4A 5IMVA 2FWHA 3VPTA 2YZUA 2FD3A 2TRXA 3LWAA 2PBJA 2GZYA 6GSWA 4TN8A 1B48A 2YN1A 4OO4A 4D73B 1U6TA 4TR1B 5CAXA 3TKSC 2H76A 3I6AA 3BCIA 5COHA 4DSRA 1S3DA 3GL3A 3K8NA 4K0NA 2HT9A 2I1UA 3FY7A 3DRNA 3CRTA 1OE8A 2GT6A 2J23A 1Z6NA 2YJHA 1ERTA 3KH9A 4G19A 2MMNA 4IELA 3NOFA 2I81A 1K0NA 3HVVA 2C1YA 2NPBA 3D22A 3WD6A 1GL8A 3GX8A 2RM5A 3TKQA 5J9BA 3HZ4A 1OAZA 4MJAA 4KE3A 1M2AA 1PRXA 2GSTA 4HZ4A 3F8UA 2B1LA 1GTIA 2GZPA 4JR4A 3F9UA 1TKDB 4P3YB 4MZCA 4YAVA 1JFUA 2WFCA 3GKMA 2H8LA 4NPBA 3TDGA 1PL2A 2OA7A 3QR6A 3U5RE 2YWOA 1URMA 2H30A 3RPNA 3UVTA 2N5AA 3F0IA 5ECOB 1T7PB 4OD7A 2K9FA 4IJIA 3TJFA 3J7Yk 4ILFA 4JEDA 4ZILA 1TW9A 2L57A 1ZMAA 3HD5A 3HJMA 4NHWA 3TKSA 2LNSA 5F0GA 18GSA 5ECQB 1FB0A 2HXKA 4KSMA 1F3AA 1QUWA 3P8WA 6GSUA 4IP1A 4J56E 4N11A 1W4VA 1AC1A 5AISA 3DVXA 4F2IA 1PMTA 3LEFA 1YY7A 4LA1A 5L71A 3R2QA 1G6YA 3TJBA 3VWVA 2CAQA 2H1DA 4IJ3A 1S3CA 4I97A 2B6MA 2X8HA 1HQOA 1N2AA 4RI7A 1IYIA 2FWGA 3GSSA 4IN0A 4FH8A 2RM6A 4KNDA 3C1SA 4O32A 1RQMA 1YJ6A 3GYKA 4L8EA 2FA4A 3LORA 2EIOA 5B7CA 1PL1A 1GP1A 2IMIA 3FZ5A 4XIHA 4KB3A 2O87A 4MJBA 2JSZA 2H01A 5D8IA 2CT6A 1TRWA 2DJ3A 4BWQA 1ZGNA 2X8CA 2E7PA 2YP6A 4NV5A 1K0MA 2H74A 3OR5A 4KW6A 3CXGA 2RLIA 6GSVA 2OE3A 1ABAA 1ERUA 3M8NA 2I9HA 2XPEA 4OCEA 4HQZA 3ISOA 4HJ2A 2FGXA 20GSA 3ERFA 1M2BA 3DKSA 1EP7A 3LYKA 2O89A 2H0GA 3TUEA 1FHEA 4WF4A 4J2FA 2EC4A 5LD0A 1Y6EA 4OMVA 3D0ZA 4PQHA 2OBIA 4NAXA 4ECIA 2TRCP 5A4WA 4HOJA 7GSSA 5EPFA 2ON5A 2CVBA 4CDOA 5G5EA 3I43A 2VCWA 2VUPA 2YPMA 1A24A 1X9WB 1AUCA 2PWJA 2HSHA 3LJRA 3D5JA 3VWUA 5KN0A 2Z9SA 1GWCA 5IQYA 4FO5A 3D6IA 2V2GA 5DDLA 4MJCA 1FVKA 2RUFA 1SD8A 1XVQA 5JWRB 1W89A 4DVCA 1J0FA 1PKZA 2H1BA 5DAKA 2YWMA 4HU9A 5FHIA 4DSSA 5AGYA 3C1RA 1AQWA 2P0GA 2REMA 5C00A 1GTBA 3KD0A 4E8EA 1R7HA 4OFNA 3EC3A 1V57A 3VK9A 3ZIJA 4HDEA 2DC5A 2AYTA 1K0OA 4JU5A 2PUKC 1EP8A 2JL4A 4HS1A 1KNGA 4D73A 3IA1A 2LJAA 2B5YA 4Q5FA 2WCIA 3QOUA 5CREA 3WT2A 4PNGA 2B1KA 3M1GA 5J9CA 2EIQA 4BPYA 5G2ZA 1XVWA 2HI7A 1O81A 2GVPA 2H72A 2CZ3A 1Q98A 2V6OA 4MZWA 4BL7A 4FYCA 4N0ZA 1ZOFA 1Z7RA 1QQ2A 1Z5YE 2D2ZA 2WDUA 1HD2A 4OFMA 2GGTA 12GSA 1KEBA 2YANA 3F4TA 2CVKA 2KUCA 1EV4A 4X0XA 3APQA 1GNWA 2H66A 4MH2A 3UAPA 2DSAA 2YWNA 1O85A 2NTOA 4PUAA 4I8BA 3QFBC 1YQ1A 1TOFA 4CHSA 2QGVA 1ZYEA 2M80A 4V1Ap 2YJ7A 1XIYA 1OE7A 3Q74A 1V9WA 3KTBA 1XWAA 1JZRA 4KH7A 4F0CA 3ME8A 3QPMA 3CTFA 1TP9A 3W8SA 4AJ7A 1TI3A 2R4VA 3TRQA 2CX3A 4TOPA 1R5AA 2IPAA 5A4UA 1SL1B 4N0VA 1ERWA 2J9HA 3LXZA 2ON7A 4ZB9A 2AHEA 2CQ9A 1BQ7A 3A2XA 5IM9A 3PH9A 1T1VA 1X5EA 2BMXA 5AN1A 2DBCA 2K8VA 5IOWA 1SKSB 1M7TA 3P7XA 3LFLA 3C7MA 3EYTA 3VI5A 1UC7A 5D9TA 4I6XA 4E8HA 2LRCA 2JZTA 4YQUA 4ZXGA 1T4YA 2E0QA 3FKFA 3F3RA 2VL3A 4JR6A 2RIIA 1O7UA 2VO4A 4PQIA 3H8QA 1VF2A 5IMAA 5IOXA 2WULA 1TRSA 3G9BA 4F03A 1EV9A 2KHPA 4YH2A 1SK2A 2FWEA 3MAKA 2NVLA 4PX1A 3HXSA 3SWLA 5LNKe 1MD3A 1M2DA 2VM1A 1Z7PA 3BJ5A 1FOVA 1WIKA 5KN2A 4AGSA 3CMIA 3HYPA 4XRAA 4WETA 1GTAA 1SK0A 4XTSA 3UVHA 5DQSA 3TGZA 2N5BA 3FK8A 2ZNMA 3G7JA 3RHCA 2GTUA 4NMUA 3S9FA 5CNWA 3V1WA 5ABRA 2C0EA 2GSRA 3MWHA 5DAKB 1U88A 3GV1A 4PQ1A 1EOHA 4J57E 2B5EA 2LKUA 3HJOA 4DSSB 3JCML 2LNTA 1YZXA 4GTUA 2LV3A 13GSA 2IWTA 5DCHA 3RDWA 2RUEA 1PX6A 3VWWA 5ECNB 4L0WA 3QDNA 1MDIA 2DJ2A 3IR4A 1TJDA 3IE3A 3FR3A 3UBLA 3M9JA 4KAEA 3KGKA 1OKDA 4WKWA 1YF0A 3HZ8A 2AB6A 4BWSA 1GULA 4L0UA 1TK8B 2IJYA 3TKPA 3KTLA 3FR6A 3ZLPA 4ZBAA 1PA3A 1CQHA 4XCSA 4IQ1A 2M46A 3N5OA 3EVIA 1VF1A 4XHMA 5DQYA 1K0AA 2HFDA 1V58A 3FZ4A 1KTEA 4IHUA 3IV4A 2F9SA 4K8MA 1QGVA 1R26A 5H5SA 4TW5A 5DJLA 17GSA 1SENA 1SD9A 3Q18A 1C72A 2E2GA 4F9ZA 3WGXA 3HJPA 5GSSA 2H75A 4RQRA 3KM6A 3GTUA 2JSYA 2AV4A 1EWXA 1USBA 2H73A 6GSYA 8GSSA 4BVXA 4XRDA 1JZWA 3L0HA 4Q5QA 2ZUPA 1BJXA 3IC4A 1Y25A 3ERGA 2LTKA 4HI7A 2V41A 5ECSA 2JACA 1NHYA 3GKXA 1FO5A 4OCFA 3ZTLA 3MNGA 1U3AA 1QFNA 3EMPA 14GSA 1YKAA 2FUG2 4AJ6A 1RK4A 2F8FA 2X99A 4MF7A 3ZREA 4YQVA 1QXHA 3GL5A 1G6WA 4ECJA 2QKEA 2XHFA 4N10A 4HEA2 4BA7A 4GCIA 5DJMA 4FYBA 4KA0A 1NHOA 2IMFA 2ES7A 3DMLA 4MMMA 3IDVA 3VFIA 4JRRA 3C71A 3GURA 1TRUA 4TXVA 3AY8A 4KCAA 4X43A 4IVFA 1CQGA 2G2QA 3IRAA 1WOUA 2H0HA 1ILOA 2OBKA 2F8AA 2NBSA 3FEUA 3O3TA 4PNFA 5GAPD 2PPTA 5FT3A 1XPVA 5ECMB 2DIYA 4WEYA 2DMLA 4CW9A 1LBKA 5CP1A 1WRYA 5HR1A 4G2EA 3MSZA 3EINA 4LL1B 3CRUA 1V40A 3CSIA 2WZ9A 2DJ0A 1X0RA 1KBNA 3NZNA 2YCDA 4YAPA 3DWVA 4WR4A 4KDXA 1GUKA 3GN3A 1G0TA 2FHEA 5HFIA 2YV7A 1GSDA 4I2TA 2V32A 2K6VA 1XOAA 3I69A 4KDYA 5EVOA 1A23A 4GSSA 4V2NA 3ZIVA 5DALB 3CBUA 1GLQA 1B8XA 3APSA 2C0GA 3D4MA 5D9VA 4WXTA 3UMAA 3LGCA 3A2WA 5HR3A 6GSXA 4TR3A 2FCHA 3F4SA 1VF3A 3O76A 5G1KA 5AIVA 1HNAA 3DEXA 5F06A 3E3EA 5FWGA 5CRWA 2VLUA 2R6KA 1DSBA 3FR9A 5ECRB 5HQPA 4HU7A 5F8BA 2A2RA 2VLVA 1AAZA 3KMOA 4V2MA 4ZL8A 3QMXA 1SYRA 1TK5B 1AW9A 5INYA 5IPHA 3GKKA 2DJ1A 4EUYA 1M9BA 2HYXA 3EMXA 2IFQA 5CRDA 3GMFA 4Q5NA 2HLSA 1XZOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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