1A2LA

Reduced dsba at 2.7 angstroms resolution
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
b'YEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structures of reduced and oxidized DsbA: investigation of domain motion and thiolate stabilization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DISULFIDE BOND FORMATION PROTEIN
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 60
structure length 186
sequence length 186
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-01-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1a2lA00
2GGTA 4MZBA 2YV9A 4ACSA 1PX6A 1FG4A 3TJBA 2GQKA 5IMZA 2PVQA 4HU7A 1T4ZA 1JFUA 3LSZA 3VPQA 2B3SA 2X8GA 3PINA 4X1UA 4JR4A 2P5QA 5G5FA 3TJKA 1GUHA 1XW9A 5E59A 2AUVA 2O85A 1HNCA 4BPYA 2E7PA 4IQ1A 1Z6NA 1TI1A 1X9WB 2KOKA 5DBQA 3HZ8A 1SKWB 4RI6A 4MLYA 1X9MB 4BL7A 3PH9A 5DQYA 4K7NA 1A24A 5C04A 3HCZA 3GSSA 4AF2A 4DVCA 2DSAA 2I3YA 1AQWA 3IK9A 5IMAA 1BJXA 1WPIA 2CZ2A 4JR6A 1TP9A 5CRWA 2MMAA 2GSQA 3PGTA 4JBBA 5JWQB 18GSA 2HI7A 4IBPA 5COHA 3I43A 2XPDA 4ULXA 1IYIA 1B8XA 5HR1A 4NWYA 3WT1A 5DDLA 5B6NA 9GSSA 4QL7A 4RQXA 1Z6MA 1EGOA 1HQOA 2H30A 2VCVA 1GL8A 1JLVA 4TXOB 2HZEA 5GZZB 1QXHA 2CV4A 4K0GA 1EWXA 2V1MA 4IP6A 3DMLA 2IN3A 4G19A 1QK8A 2OADA 5ECIB 2CVKA 2HT9A 4IELA 5DALB 3KIJA 2YV7A 1QUWA 3CSIA 1SD8A 5CO3A 3V1WA 1SL1B 2JADA 3EE2A 3GKKA 2RM6A 3APSA 3FZAA 1XW6A 5IPGA 2WULA 5D9VA 5KN2A 2YWIA 1GNEA 1V9WA 3F9UA 5IOXA 4ML1A 1UVZA 1QMVA 2BMXA 1TOFA 4KCEA 2NPBA 3P2AA 4EF0A 5IMFA 1FB0A 2O8VB 1M9BA 1USBA 2FNOA 2LRTA 3ZFBA 1PD21 1WIKA 1XPVA 2YWNA 2B1LA 3L78A 3J7Yb 1TU8A 2GQMA 5DCHA 4BA7A 1LJRA 1PKWA 1SJZA 4G2EA 4GCIA 2B1KA 2REMA 2WJUA 2RM5A 2VL2A 2GSSA 2H0HA 2C80A 1OKTA 2R4VA 3GKNA 4KX4A 4MJEA 2A2SA 4OCEA 1MD3A 3CBUA 4CW9A 3CRUA 1WP0A 4MJBA 4WBJA 4NXIA 4F0BA 2C3TA 3GMFA 2X64A 1BAYA 4ZBBA 3DVXA 3ZITA 4NPBA 3GRXA 3DYRA 1TJDA 3H79A 3WGEA 4I8BA 1AXDA 1ACVA 3UJ1A 4PQ1A 4LL1B 1A2LA 3HZ4A 6GSXA 3M8NA 2L5LA 3TCOA 2H1GA 4POBA 1J08A 3QD9A 2HSHA 3UBKA 3C8EA 2DJ0A 1THOA 2H72A 3VWWA 2L6CA 2LV3A 4E8HA 1BX9A 2CVDA 3J7Yk 4EO3A 1H75A 1XIYA 1ZZYA 2JSYA 1R4WA 1BYEA 5B7CA 3TGZA 4ZB8A 4ZXGA 3TJJA 4PUAA 4J56E 4DSSB 2CAIA 1SJIA 4MF7A 4OFTA 2OACA 1GSSA 5B6MA 3IPZA 5ECPB 2GSTA 3BD2A 4JZQA 1U6TA 1ERVA 2JL4A 2XC2A 3HJPA 1GTUA 4JE1A 1H4OA 2H6ZA 1F9MA 2YP6A 3KMOA 2V41A 3TKPA 3EMXA 2C0GA 1T7PB 3O6TA 3TRQA 3E3EA 2EIRA 1G6WA 4QL9A 2DIZA 4TXOA 2WRTA 4KB3A 4KSOA 4EE0A 2F51A 4HDEA 1Z7RA 3APOA 3FW2A 1LU4A 3G7YA 1GSYA 3VPTA 2LEGA 3IHQA 1IYHA 3ERWA 5DALA 1OKDA 2F3MA 1A8LA 1ZCPA 2MBTA 2E0QA 4H86A 4K6XA 4LMVA 2CX3A 1OC9B 4K9ZA 4TR0A 1VGLA 5KN1A 2C3QA 2K18A 4XS4B 2VOCA 1S3CA 4XIHA 2X8CA 3GX0A 3P7XA 2PGTA 2IJYA 3KXOA 2CQ9A 3GUSA 5G1KA 3BJ5A 16GSA 1GULA 2KLXA 3ZL5A 4IKHA 5DCGA 1MTCA 2N5BA 3NIVA 1OYJA 3KGKA 3UL3A 5DQSA 1EGRA 2LJKA 5CRHA 3A3TA 4GLTA 4CDOA 1GTAA 3ZIJA 3TKSC 1N8JA 3FY7A 3A5WA 1R7HA 6GSWA 4PX1A 1J0FA 4GF0A 3KH7A 5HFGA 2ES7A 1K0AA 5A4UA 3F8UA 2D2ZA 3KEBA 3QPMA 2J9HA 4YQUA 2F8AA 3RPNA 4L0WA 3Q6OA 1B4QA 1EEJA 2DMMA 8GSSA 4KE3A 3MWHA 5G2ZA 1PSQA 3US3A 1XCCA 1X5DA 2HFDA 5G5EA 1YQ1A 3SBCA 3ZFLA 3VWVA 2HE3A 4WR5A 4WETA 2E2MA 1Z5YE 2H6YA 2L6DA 4IVFA 4EDZA 4Q5QA 1O8WA 4G10A 1FOVA 4GSTA 3WYWA 1YZXA 2CA8A 2PWJA 4AJ8A 1DE2A 1G7OA 1XVWA 3Q19A 2B7JA 1JHBA 4K2DA 2V6OA 2DJ3A 3D6IA 14GSA 1W4VA 3L4NA 1ZYQB 3NOFA 3ZVJD 5ECHB 3TOTA 3KCMA 3TRPA 3LQ7A 5ELGA 2B5EA 2IMIA 4DSSA 4IQAA 5INYA 5IOWA 4KA0A 5ABRA 4TXVA 3FRCA 3DWVA 3LWAA 2VM1A 1Q4JA 1F37A 1WMJA 2H75A 5ID2A 1OE8A 2FWGA 4FH8A 2AJQB 3GFKA 3Q18A 4MF6A 2H76A 4MK3A 1BEDA 1MDJA 1PL1A 4TW5A 2B7KA 2C0EA 4QQ7A 4ZL7A 1O6JA 3CTGA 4EXJA 1M7TA 2LQOA 3RHCA 1I9DA 4IHUA 2GTUA 4TRXA 3KD0A 3I6AA 1GLPA 2IMEA 4GQFA 4AJ7A 2FY6A 5AN1A 4F9ZA 4TN8A 4MJCA 2G0FA 2GT6A 4V2MA 2N5FA 2VL3A 3QFBC 3UARA 4PUFC 1CQGA 2FWHA 6GSUA 4FYCA 3D5JA 1OC9A 3ISOA 4AJ6A 4KUNA 1O8XA 3U6VA 1G7EA 3E0UA 4XS4A 1X0RA 4EVMA 4YAPA 1J9BA 3D0ZA 3GTUB 4IJ3A 2GZPA 2K6VA 2CVBA 3H93A 4V1Ag 2B6MA 1WOUA 17GSA 1SU9A 2VCXA 3C1SA 2CZ3A 3IAM2 3TB2A 3FHKA 2GZYA 4KDUA 2QSIA 1B9XC 5JCUA 1VF1A 4WXTA 1T00A 5ECRB 3HJMA 5JWRB 3LG6A 1HYUA 1V40A 4EL1A 5DJMA 5A4WA 4O92A 1EZKA 1HNBA 1ML6A 1WE0A 2H73A 1K0DA 2TRXA 1GSQA 4NHZA 1ZL9A 4HI7A 5F0GA 1AC1A 1MDKA 4OMVA 1MD4A 4L8EA 3F6FA 3BCKA 5JCGA 2FGXA 4TR4A 4POMA 1PGTA 1OVNA 2OBIA 4MMMA 3EINA 1FW1A 3RAZA 5G1LA 1Z3EA 5F8BA 5A5KA 3DEXA 3FZ9A 3FEUA 5F06A 3Q74A 4IJIA 2ON5A 3GL3A 1A0FA 1VRSD 1A2JA 4HZ4A 3KP9A 3EU3A 2OJLA 4PNGA 2L59A 3OR5A 5EY6A 3C1RA 3HHVA 3KMNA 4D73B 2YANA 4ZBDA 4I97A 3FZ4A 3H1NA 1FHEA 3GSTA 4IGJA 2VL9A 3W6GA 1JZOA 3F4SA 4YQVA 1N2AA 1THXA 2DJJA 4KAEA 4HJMA 3WGXA 5D8IA 3F4TA 3I69A 3ZREA 1NSWA 4GTUA 4FIWA 4GRFA 5F07A 4BWQA 1K3YA 1XWCA 3WD6A 1X9SB 3TRXA 3CRTA 1C72A 4JRRA 5CAXA 3DXBA 3GN3A 2C0FA 3G7JA 4ZIJA 5IQYA 3KZQA 1TRVA 2C3NA 1M2BA 2XBQA 3LFLA 1SKRB 3ED3A 3EURA 1G0TA 1DBYA 4K0NA 2FLSA 3QDNA 3QOUA 3E9JB 2NBSA 4JEDA 4ILFA 3F3RA 1JZRA 3TJGA 2H6XA 1URMA 3EC3A 4TVEA 3U5RE 2QGVA 2JSZA 5F05A 4MJAA 4XS1A 1PQNA 3LORA 3ZRDA 4BVYA 4XCSA 3M9KA 1TU7A 1YKCA 3O3TA 5FWGA 12GSA 4Q5NA 2R5GA 1WRYA 1EP8A 4HQZA 3CSJA 1V2AA 4OCFA 1A0RP 4BVXA 5ECLB 1T4YA 1AQXA 1XWGA 1A23A 1PN9A 1YDKA 4LLRA 2OA7A 1SYXA 3LXTA 7GSSA 3C71A 2XBIA 2JZTA 3UEMA 4MABA 2O89A 2PERA 1K0CA 4KDYA 4K7OA 2IPAA 4RUVA 4NV5A 2YPMA 3HD5A 3ERGA 2MMOA 3GTUA 1XVQA 1TXXA 2CT6A 19GSA 4PXOA 1GNWA 2FA4A 1M2DA 1B9YC 1TRWA 4I2UA 4WBRD 3DGQA 3CSHA 3ME8A 3GH6A 5IO0A 1KBNA 2EIOA 4J57E 2L57A 3IAS2 1PL2A 1JZWA 3RHBA 2I81A 5G31A 5GSSA 2NTOA 4FYUA 5ECKB 3LYPA 1M2AA 2AAWA 2H70A 3IBHA 3FKFA 2TRCP 3WGDA 1KNGA 2VD1A 2HXKA 2YJHA 3HDCA 2VO4A 1ERUA 2VD0A 2H0GA 3HJOA 1XWBA 3L9VA 2VIMA 4IW9A 1R5AA 2HRNA 2I9HA 5EPFA 2WDUA 4L0UA 4O5RA 1EV4A 5DJLA 2JZSA 4FO5A 1VF3A 10GSA 2OKAA 3ZMLA 3BCIA 1TRUA 1KEBA 2RUEA 4D73A 1GP1A 3F0IA 2ON7A 1OC8A 1YF1A 2LSTA 2ZCTA 3QMXA 4DSRA 3FYGA 3MDKA 2VUPA 1O81A 3DKSA 5GAPD 1XWKA 2KP1A 2P31A 3KP8A 3JCML 2AV4A 1YEXA 1B4PA 2LKUA 1JZDA 2RLIA 1XFLA 4TKYA 4WF4A 1SYRA 3MNGA 1DSBA 4KGIA 2YZHA 3IV4A 3CTFA 1RQMA 2X8HA 2B5YA 1V98A 3BBYA 4LMWA 1UC7A 2MYGA 3K8NA 1TW9A 4MZCA 2R6KA 3MSZA 3P8WA 2HSYA 2LUSA 4YQMA 1M99A 5ELAA 2IIYA 3P90A 5LCZA 1BG5A 3A2WA 2K8VA 4OFNA 4GWRA 3GIXA 1GSFA 4LA1A 5KN0A 4MA9A 1WWJA 1W89A 1FB6A 2YWMA 1A8YA 3GKMA 1TKDB 5CYYA 5H5RA 1X5CA 2C4JA 2H1BA 3A2XA 5IMCA 5AIXA 4XHMA 3HA9A 4TOPA 3N5OA 3HKRA 3F4RA 3RBTA 1TK8B 3G9BA 1U87A 4RQRA 4Z7XA 3M3MA 5FHIA 3KTBA 2PBJA 3DVWA 2B5XA 3KM6A 4ECJA 2H01A 6GSYA 1YY7A 2PN8A 3G7IA 4V2NA 4TR1B 5H5SA 2F9SA 3H8QA 2PPTA 5IMDA 3L9SA 2PVOC 3UVTA 1OE7A 1EV9A 2WZ9A 3TKSE 1SL2B 2L5OA 3GX8A 1GUKA 2Z9SA 1FVJA 1K3LA 4O7HA 3TKSA 1U3IA 1U88A 3TJFA 3LJRA 3FR6A 4LL4B 5J4UA 4PNFA 2OBKA 1XOBA 1M9AA 2LTKA 3HVVA 5CP1A 2C8UA 1AUCA 1DE1A 1S3AA 3HVSA 1EOGA 5LD0A 4MPFA 4WR4A 2DLXA 6GSVA 4XS6A 4KDXA 2V2GA 1ZMAA 5J3RA 1K0NA 1K0OA 1TDIA 1GTIA 2YZUA 3LXZA 2AYTA 4HS1A 2H74A 3ERFA 1E6BA 4ISDA 3VFIA 1E2YA 2E2GA 3EWLA 3C7MA 5IO2A 4K8MA 1NHOA 3ZVJA 2HZFA 2PUKC 2K9FA 3PR8A 4IN0A 3IDVA 5L71A 3KJYA 5IIZA 2XPEA 4YH2A 13GSA 2FUG2 1YJ6A 2VCWA 4K7IA 4TR3A 2H0IA 5E4WA 3VK9A 4NHWA 1AW9A 1SK2A 2FWEA 3EU4A 1XWAA 4ZILA 4IS0A 4NAXA 3ZYWA 3H4KA 3TDGA 3F63A 1R26A 1PX7A 1OC3A 2IWTA 3O76A 5JCWA 1PRXA 1QFNA 1MDIA 1UN2A 1PA3A 2R2JA 2LQQA 4CHSA 1TK0B 2BTOT 3ZIVA 2HRFA 3GL5A 2WFCA 1G6YA 1V57A 2FD3A 5ECNB 3ME7A 2WS2A 3M9JA 3LEFA 1GTBA 5D9XA 3QAGA 5DAKB 3S9FA 3N9JA 3QAVA 2H19A 3IRAA 5AISA 2A2RA 5CREA 3UIWA 3TKQA 3VI5A 1OAZA 1I5GA 4FYBA 4I2TA 4AGSA 2VCZA 20GSA 3CXGA 5KN3A 3D4TA 5AGYA 3R2QA 3IOSA 3KTLA 2RIIA 1GUMA 2GSRA 1FVKA 2AHEA 5GSTA 3LYKA 5HR0A 3FK8A 2M46A 1SK1A 22GSA 2FWFA 2K8SA 4ECBA 2PU9C 4WKWA 1LBKA 4X0XA 3F6DA 2LNSA 2HYXA 3GKXA 2DJ1A 2EC4A 2DBCA 2C1YA 4NV2A 2GDRA 2RUFA 2M72A 2GQLA 3ZLPA 3C73A 2VL2C 4POKA 4N10A 4P3YB 2YWOA 1K0BA 4ZB6A 4POLA 4V2LA 3QR6A 3UAPA 4TR1A 5ECMB 1EP7A 3TUEA 1T8EB 2R3XA 1GWCA 2F8FA 2LS5A 4MDCA 1HD2A 2HLSA 4HJ2A 2EIQA 3M1GA 4ML6A 4HOJA 1O85A 1F6MC 1ERTA 3GURA 1Y25A 4MZWA 1M0UA 2WGRA 1PKZA 3ZZXA 2CAQA 3W8JA 5ECSA 1Z9HA 3VURA 1TRSA 5ECQB 2WCIA 4ECCA 2IL3A 2YNXA 4GSSA 1K0MA 1SD9A 3UBLA 4WEYA 1F2EA 5CNWA 2H71A 3LGCA 1R5PA 2YCDA 3VWUA 4N11A 4WF5A 2C0DA 3FZ5A 1U3AA 1YF0A 4L5LA 1Q98A 3HY2A 3M0FA 2VCQA 6GSSA 1TK5B 1V58A 5AIVA 1QQ2A 4PURA 3QCPA 5KEJA 4ZB9A 5HR2A 4EC0A 5IMVA 5J41A 3F3QA 1NM3A 3I9V2 2IFQB 3CYNA 3NZNA 1CQHA 4GQCA 2KP2A 4O32A 4Q5FA 2H8LA 3DRNA 2IMKA 1XZOA 1X5EA 1HNAA 5GAND 1T3BA 2X99A 5CRDA 2JACA 5J9CA 1S3DA 1AQVA 4MH2A 3ZMKA 2G2QA 3EMPA 2V32A 2QKEA 2O7KA 5B8AA 4K1FA 4DEJA 4YAVA 4BWSA 1VF2A 3GNJA 1FAAA 5JWOB 3DIEA 2DIYA 2LNTA 5DAKA 2H66A 2FCHA 3GV1A 2GT5A 3VI7A 3KH9A 4V1Ap 5D96A 2N5AA 3DD3A 5LNKe 5D73A 4XRAA 2ZUPA 1F3BA 2A4VA 6GSTA 2GVPA 4EDYA 1YEPA 4E8EA 4KCAA 5ENUA 4PGTA 2GLRA 1RW1A 1TTZA 2DJ2A 2GS3A 2MMNA 2VLTA 4L5OA 3EYTA 1SJ6A 3TOUA 3FR3A 5HFKA 5ID2B 2HNLA 3RDWA 5HFIA 4ZL8A 1ILOA 2VLVA 2LJRA 3IC4A 2IMFA 1PMTA 4HQSA 2MZCA 4JU5A 2DJKA 3EVIA 3D4MA 4KH7A 1ZYEA 2WB9A 1WJKA 2IMDA 2MBSA 2FA8A 3AY8A 3GHAA 2O87A 2GZZA 4PQIA 2L4QA 1F3AA 2VLUA 2BJXA 2J23A 3CMIA 4G9HA 1ZGNA 3HVXA 4EUYA 4ZL9A 2I1UA 3GYKA 1GSEA 5D9TA 2LRNA 4ID0A 1A2MA 2DC5A 2KHPA 2R37A 1ST9A 4F2IA 1NHYA 4PQHA 3UOMA 4HEA2 3ZTLA 2H1AA 4J2FA 5CRGA 2JU5A 2LJAA 2VM2A 2M80A 4MPGA 4N0ZA 1XBSA 2OE1A 1XOAA 3GA4A 4RI7A 1DUGA 1JLWA 4F0CA 3SWLA 1GSUA 5D9WA 5IM9A 3IR4A 5H5QA 1UA5A 3W8SA 1O73A 1Y6EA 2P0GA 1GRXA 1MEKA 2OE3A 2OE0A 1GLQA 4OO5A 3APQA 1T1VA 1GSDA 2L4CA 2YJ7A 11GSA 2MMZA 3IXRA 5A4VA 5EVOA 2XHFA 4I6XA 2NDOA 2QC7A 1AIUA 1ABAA 1RK4A 5B8BA 1KTEA 2YOIA 4N30A 1SKSB 2IFQA 1K3OA 4ECIA 4XTSA 1ERWA 2HZEB 2DMLA 2H1DA 4N0VA 2ZNMA 3HXSA 4Q5RA 2VCTA 1VF4A 3D22A 3IA1A 4MCUA 3RPPA 3BOAA 2ALBA 1SL0B 1YKAA 2FHEA 3L0HA 4OD7A 5G30A 1AAZA 3QFAC 5C00A 4OWYA 1O7UA 4IP1A 5HR3A 2NVLA 1QGVA 4HZ2A 5J9BA 3WT2A 4OFMA 2VAFA 3QAWA 4MH3A 2P5RA 3UVHA 1SENA 1NW2A 1XW5A 4MF5A 5IPHA 2YN1A 4ZBAA 3MAKA 1BQ7A 3L9UA 4KSMA 1ZOFA 2CX4A 2V6KA 3IK7A 5FT3A 4HU9A 3TKRA 3VWXA 4EKZA 1ON4A 1XXUA 2KUCA 4GXZA 1GH2A 4KW6A 3VLNA 5ECOB 4F82A 4XRDA 1EOHA 5HQPA 5J5NA 3GH9A 2TIRA 4GSNA 3D21A 1SK0A 3FR9A 3HYPA 4OO4A 2I4AA 4DSQA 5EL8A 3A2VA 3UMAA 2LRCA 1EEMA 2AB6A 1Z7PA 3IE3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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