The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN)
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| publication title |
The structures of deoxy human haemoglobin and the mutant Hb Tyralpha42His at 120 K.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
58
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-01-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2D2N D; 4M4B A; 5JDO E; 3S65 B; 3UHW A; 3E5I A; 1Y0A B; 3WCU B; 4O35 A; 1AJ9 B; 1YCB A; 3VRF B; 1YEU A; 3UHI A; 2OIF A; 1S56 A; 1V9Q A; 2ZLW A; 1XXT B; 2HBC B; 4ROM B; 3PIA A; 3R0G A; 5HY8 A; 3EDA A; 1OUT A; 1X9F B; 3UHE A; 1JZL A; 2MYA A; 1DXT A; 1Y01 B; 5B85 A; 2ZFO C; 4N7P A; 2QSS A; 2RAO B; 2MGA A; 5EV5 A; 4ODC A; 3LQD A; 1AJH A; 5CN8 A; 5CHR A; 1BZ1 B; 4ESA A; 1I3D A; 1XZ7 A; 2M6Z B; 4HRT A; 3OZV A; 1HGC A; 3GQP B; 1CG5 B; 1B0B A; 3K9Z A; 2W6X A; 5HLQ A; 3WCU C; 1O1O B; 2OH9 A; 1LH6 A; 1A0Z B; 2PEG B; 2W6Y A; 4NK1 A; 1HBB A; 1LH3 A; 4U8U B; 1MLN A; 3MKB A; 1G08 A; 3AT6 B; 2AUQ A; 2O5M X; 1HDA B; 4O4T A; 1YE0 A; 4MQG B; 1LFQ A; 1X9F C; 105M A; 3LB4 A; 1RQ3 B; 3SDN A; 1UIW B; 2V1J A; 2ZSX A; 3G53 A; 3QQQ A; 1JL6 A; 1N9H A; 1S5X B; 2B7H B; 1CBL A; 1Y4P B; 3MJU B; 3A59 A; 1DM1 A; 1O1P A; 5EQM A; 1MCY A; 1MLR A; 5CN9 A; 1HLB A; 4HBI A; 3KUO A; 2O5O X; 1BAB B; 1SDL B; 2XKG A; 5EE4 C; 1S0H B; 2VRY A; 1S5Y B; 1NZ4 A; 4NS2 A; 2W72 A; 5AB8 A; 2MHB B; 3IA3 B; 1HBH A; 2ZSY A; 3DUT A; 1YG5 B; 2LH6 A; 2GTL C; 1HBA B; 2O5S X; 4XDI A; 3ZJM A; 3UHS A; 3UHN A; 1KR7 A; 3ECZ A; 1DO3 A; 2MGD A; 1MKO B; 3PT7 B; 5E6E B; 1LH2 A; 1DKE A; 2Z6T A; 2ZSP A; 1J41 A; 2OHB A; 2EB9 A; 3NML A; 1V07 A; 1MBI A; 1Y5J B; 3D1K B; 1Y83 A; 2D5X B; 3RJN B; 1J7W A; 3A0G A; 1DXU A; 1Y8I B; 1EBC A; 2LH3 A; 1MYG A; 2W6V A; 3FH9 A; 3D7O A; 3GYS A; 5HLX A; 1R1Y B; 1NEJ A; 2RI4 B; 1WMU B; 2D2M C; 2FAM A; 1FSX A; 1OFK A; 1BBB A; 1ABW A; 3HEO A; 3CIU B; 3LR7 A; 2AUO A; 1FAW A; 2GL3 A; 3HYU A; 2AV0 A; 2QFK A; 2BLI A; 1Q1F A; 3WCT B; 1HBS A; 3QZX A; 1GCW A; 2HBG A; 4YU4 B; 1OR6 A; 1HAC A; 4FWZ A; 5AZQ A; 2R80 B; 3UHC A; 1JY7 B; 1L2K A; 3U3E A; 3M3B A; 3ODQ B; 1K0Y B; 3ZJS A; 2R4X A; 5KDQ B; 1O1K B; 1BJE A; 1LH7 A; 1YGD B; 1SDK A; 2GLN A; 1A3N B; 1UX8 A; 2ZS1 B; 1YHU A; 5CNG A; 1LJW A; 1MLM A; 2R50 A; 1YE2 B; 1UVX A; 3UHZ A; 3DR9 A; 1LFY A; 2V1F A; 2MGF A; 1VXG A; 1BIJ A; 2ZLW B; 101M A; 3PIA B; 2ZLV A; 4MQC A; 1J3Z A; 1B86 B; 2VHB A; 1VXH A; 4N7P B; 2QSS B; 1UVY A; 3ZJL A; 1XZV A; 1R1X A; 1FDH G; 1Y09 B; 2DXM A; 2ZLT B; 4U8U D; 1O1N A; 2R4Y A; 1DWS A; 4ESA B; 1MOH A; 1URV A; 1XZ7 B; 1NXF A; 2E2Y A; 4F68 A; 1K1K A; 1MWB A; 2H8F A; 1HGC B; 1SPG A; 2IN4 A; 3UBV A; 2ZS1 C; 2NRL A; 6HBW B; 4M4A A; 2ZS0 D; 3NFE A; 1XY0 A; 5JGG A; 1JPB A; 4FH6 A; 2MYC A; 2PGH B; 3EU1 A; 1CH1 A; 1LFQ B; 1RQA B; 2AV3 A; 2FRI X; 3BCQ A; 3LB1 A; 3G4Q A; 2WTH A; 3VRG A; 3UGY A; 1Y0D B; 4MQI A; 3ZJO A; 2ZFO A; 2DN2 B; 2HBS A; 2MGI A; 1O1P B; 3PT8 B; 1V75 B; 1YHR A; 2QU0 A; 3WFT A; 3BJ1 A; 1Y7D A; 4F6D A; 3M3A A; 3HRW A; 5KER B; 2HBE A; 2W72 B; 4DC8 A; 108M A; 3CY5 B; 1HBH B; 3DUT B; 1NWN A; 1G9V B; 3S65 A; 4NI0 A; 1Y0A A; 4MXK A; 3WCU A; 1AJ9 A; 1Y31 B; 2MB5 A; 5C6E B; 1VXA A; 4IT8 A; 1THB A; 3WFW A; 1MLJ A; 3WCV D; 3VRE B; 3WCW C; 4C0N A; 3WHM B; 5F2A A; 2HBC A; 5KKK A; 1KFR A; 1I3E A; 1X9F A; 2QLS A; 5CNE A; 1DKE B; 1J41 B; 1YOH A; 5IKS A; 1W92 A; 3GK9 A; 3WTG A; 2G3H A; 1Y83 B; 1M9P A; 3ARK A; 1XZ5 A; 2HZ3 A; 1J7Y A; 1BZ1 A; 1PBX B; 1N9X A; 3D7O B; 3GYS B; 1CMY A; 4F4O B; 1Y35 B; 1A3O B; 5JOM A; 1TU9 A; 3MYN A; 1CG5 A; 3KMF A; 1FSX B; 2ZT0 A; 1BBB B; 2GTL A; 1O1O A; 1FAW B; 1IRC A; 3UH5 A; 1A0Z A; 4SDH A; 1CH3 A; 1CLS A; 1GCW B; 1HGB B; 3AT6 A; 2MGM A; 1HDA A; 3PEL A; 1CIK A; 1HAC B; 1C7D A; 2LHB A; 4TYX A; 1UIW A; 3WFX A; 1QPW A; 1ECO A; 2BKM A; 1MBD A; 2B7H A; 2ZSZ A; 2HZ2 A; 1Y4P A; 1YHU B; 3MJU A; 1LJW B; 4MPM A; 3OO4 A; 1OR4 A; 2MYD A; 1BAB A; 2D5Z B; 1Y8H A; 2BW9 M; 1S5Y A; 1H1X A; 2D2M A; 2D2N C; 4MBN A; 2MHB A; 4DC7 A; 2QRW A; 1YFF A; 1YG5 A; 2D60 A; 3ECL A; 1MNI A; 2ZLV B; 3ZJI A; 4MQC B; 2ZLX B; 1JF3 A; 1X3K A; 1EWA A; 2H35 B; 1ECD A; 1HBI A; 1R1X B; 1MKO A; 1ASH A; 5E6E A; 2DXM B; 1MYJ A; 1O1N B; 1MZ0 A; 1HDS A; 1Y4V A; 2OLP A; 1CH4 A; 1Y5J A; 3RGK A; 1Y4F B; 1K1K B; 2SPM A; 2H8F B; 3D1K A; 2D5X A; 1EBT A; 4M4A B; 4GZG A; 3G52 A; 2VYW A; 1YMB A; 2ZST A; 1CIO A; 3NFE B; 1Y8I A; 1XY0 B; 5JDO D; 2VM0 A; 3G4U A; 1EW6 A; 4MQK B; 2RI4 A; 1WMU A; 1Y7C B; 3EU1 B; 1DXC A; 5CN6 A; 3BCQ B; 1TES A; 4H2L B; 2XYK A; 3WCT A; 2HBS B; 2R80 A; 1Y7G B; 3ODQ A; 1Z8U B; 1OJ6 A; 1YHR B; 1K0Y A; 3NL7 B; 1BZ0 B; 1LFT B; 1O1K A; 2QU0 B; 3HRW B; 2HBF B; 1BIN A; 1OFJ A; 2ZS1 A; 3W4U B; 1Y8W A; 4JAC A; 3GKV B; 1YE2 A; 4NI0 B; 4PQB A; 1DTM A; 3MYM A; 2BNL A; 2FRJ X; 2V1I A; 1THB B; 2ZSQ A; 1NZ3 A; 4WJG A; 4F6F A; 3OO5 A; 4ZVA A; 1QSH B; 5EU2 A; 2ZSO A; 1MTI A; 2QLS B; 1B86 A; 3OVU C; 4L7Y B; 1XZ4 B; 3WTG B; 1MLQ A; 1Y09 A; 4DWU A; 1M9P B; 1XZ5 B; 2ZLT A; 1J7Y B; 1FSL A; 2V1E A; 1MLF A; 3D17 B; 4BJA A; 1CMY B; 2HHB B; 1Y8K B; 5CNB A; 2CMM A; 6HBW A; 2Z8A A; 3UHQ A; 111M A; 2GTL B; 3ZHW A; 1YHU D; 4N7N B; 3B75 B; 3P5Q B; 4KN3 A; 3WCW A; 4MQJ B; 3VAU A; 1CLS B; 1VXC A; 1NGK A; 1JP8 A; 3PEL B; 2PGH A; 1FHJ B; 1YOG A; 1YMA A; 1GBU B; 1MBN A; 4MU5 A; 3OK5 A; 1T1N B; 1LH5 A; 1RQA A; 2NSR A; 2BK9 A; 1C7D B; 1MNO A; 1YVT B; 5CMV A; 1QXD B; 1MLH A; 1Y0D A; 1RPS A; 1QPW B; 1SPE A; 2DN2 A; 2Z6N A; 1JEB B; 5HAV A; 1A4F B; 1DTI A; 3PT8 A; 3OO4 B; 2ZT2 A; 1JL7 A; 1V75 A; 1Y5K B; 1Y8H B; 5KER A; 2D2M B; 4FH7 A; 3CY5 A; 3ZH0 A; 1YFF B; 1Y0C B; 2D60 B; 1G9V A; 1D8U A; 3OZU A; 1Y31 A; 2EVK A; 102M A; 5C6E A; 1NS9 B; 4O1T A; 1KD2 B; 3VRE A; 3WHM A; 1IOP A; 1VRE A; 1LHS A; 3ARL A; 3BOM A; 1F5O A; 5HLU A; 1YHE B; 1HDS B; 1Y4V B; 1YGF B; 4ROL B; 1CPW A; 1Y2Z B; 1VWT A; 2ZFO D; 2LH5 A; 2MGE A; 1F5P A; 1PBX A; 1MLO A; 3GLN A; 3AQ6 A; 5CN5 A; 1JWN A; 1GJN A; 4F4O A; 3ORD A; 3WI8 A; 1Y46 B; 2ZT3 A; 2D2N A; 1Y35 A; 1A3O A; 4F69 A; 4NK2 A; 3ASE A; 2ZS0 C; 1Y0W B; 2YRS A; 1MBC A; 1UFJ A; 3WCU D; 1C7C B; 1MOC A; 1DO1 A; 2EF2 A; 3V2Z A; 2G0S A; 1FCS A; 1MOB A; 1LFL B; 1HGB A; 103M A; 1XYE B; 1SI4 B; 3UHR A; 5EYJ A; 1X46 A; 112M A; 5EUI B; 1EMY A; 1N9I A; 1NWI A; 1X9F D; 1ABS A; 3HF4 B; 1YEV A; 1Y8W B; 1N9F A; 1GDK A; 3GQG B; 3PI4 A; 2D6C A; 2G11 A; 3K8B A; 2D5Z A; 4VHB A; 1JP9 A; 3WCP B; 3EOK A; 1J40 B; 1DO7 A; 4F6I A; 4FWX A; 3OO5 B; 4MAX A; 4KMW A; 1SHR B; 2DN1 B; 2ZLX A; 3UHG A; 1G09 B; 2HHE B; 1BUW A; 1C40 B; 2H35 A; 2G0X A; 1YEN A; 2AA1 B; 1GDJ A; 1J52 A; 1O1M A; 4AVE A; 1HBG A; 3UGZ A; 2IG3 A; 3ZJQ A; 1MTK A; 1Y0T B; 3HXN B; 1UT0 A; 5SW7 B; 1Y4F A; 4HSW A; 1MNH A; 1XCH A; 1MBA A; 1YEO B; 5E83 B; 4IRO B; 1GDI A; 1HCO A; 4MQK A; 3WCW B; 1BZZ B; 4F6J A; 2EKT A; 1BVD A; 2QMB A; 1Y7C A; 1G0B A; 2BLH A; 4ILZ A; 3ZOL A; 4O4Z A; 2O5B X; 3SZK B; 3UHD A; 1Y22 B; 4H2L A; 1RPS B; 1YDZ B; 3QJC A; 2Z6N B; 3GDJ B; 2BLJ M; 1Y7G A; 3G4Y A; 4NZI A; 2GNV A; 3IC0 B; 1F65 A; 4KMV A; 3NG6 B; 1BZR A; 3NL7 A; 1RVW B; 1VXE A; 1BZ0 A; 1LFT A; 3A5A A; 2EB8 A; 2HBF A; 3O7N A; 2DC3 A; 2EVP A; 3W4U A; 3GKV A; 5CND A; 2W31 A; 4MQH B; 2GRH A; 2GKM A; 1VHB A; 1NQP B; 1XZU B; 1LTW A; 1LH1 A; 1Y4Q B; 1QSH A; 3BOM B; 4ZVB A; 2R1H A; 1J7S A; 5JDO F; 2DHB B; 4L7Y A; 1XZ4 A; 4X0L B; 1VWT B; 3WCT D; 2ZLU A; 3O89 A; 3PI2 A; 4NI1 A; 3BJ3 B; 3A2G A; 1HAB B; 1A6K A; 1MWD A; 1NIH A; 3D17 A; 5B84 A; 2HHB A; 2D2N B; 3K3U A; 1Y8K A; 1URY A; 2MGL A; 5E29 A; 2XKH A; 1A6N A; 2YRS B; 2ZS1 D; 1V4U A; 4N7N A; 3B75 A; 3P5Q A; 3ONZ B; 4JYQ A; 1GLI B; 1ECA A; 2GDM A; 1WVP A; 4MQJ A; 3ZJJ A; 1CH7 A; 1CP0 A; 2HHD B; 3HC9 A; 1FHJ A; 3R5I A; 1GBU A; 1T1N A; 3S66 B; 1MTJ A; 1YVT A; 1QXD A; 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3MOU A; 1YH9 B; 4C44 A; 2ZSS A; 2WTG A; 1OUU A; 3GQG A; 3M38 A; 1WLA A; 1G0A B; 1MBS A; 6HBI A; 2SPL A; 3WCP A; 1UMO A; 1A6G A; 2SPO A; 1J40 A; 1YIE B; 4L2M A; 1DLY A; 1M6C A; 3ZJP A; 1Y45 B; 3FS4 B; 1SHR A; 1J7S B; 2DN1 A; 2R1H B; 1Y5F A; 4NXC A; 3IC2 B; 4TWU A; 4UUR A; 3UHU A; 1G09 A; 2HHE A; 1C40 A; 1MWC A; 3BJ2 B; 2AA1 A; 3G4W A; 1LA6 B; 2KSC A; 4XS0 B; 1LUE A; 2ZLU B; 4NI1 B; 1MLL A; 3PI9 A; 4G51 A; 1Y0T A; 1RTX A; 3HXN A; 1NIH B; 3D4X A; 5SW7 A; 2OHA A; 3LB3 A; 1MYM A; 5E29 B; 1YEO A; 3G4V A; 5E83 A; 1V5H A; 4IRO A; 1HRM A; 4B4Y A; 1PMB A; 1ABY B; 1V4U B; 3MN0 A; 1VRF A; 3RJ6 A; 1Y4G A; 2V1H A; 1BZZ A; 110M A; 1IRD A; 1O1I A; 2EKU A; 1IWH B; 3R5I B; 3G46 A; 1XZ2 B; 3SZK A; 2ZSR A; 1O16 A; 1Y22 A; 1O1J B; 1YDZ A; 1U7R A; 3PI3 A; 3D1A A; 5CNF A; 3GDJ A; 2Z85 A; 1A0U B; 3IC0 A; 3NG6 A; 2MYB A; 5C6Y A; 1RVW A; 4O2G A; 3HHB B; 1DO4 A; 2HCO B; 1QXE A; 3QJE B; 2HZ1 A; 3GOU B; 3SDH A; 1HHO B; 2ZS0 B; 3VHB A; 1MLG A; 2MGB A; 3M39 A; 1HGA B; 1J3Y B; 1M6M A; 1VXF A; 4MQH A; 1V4W B; 1QSI B; 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