1A40A

Phosphate-binding protein with ala 197 replaced with trp
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYWYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Dominant role of local dipolar interactions in phosphate binding to a receptor cleft with an electronegative charge surface: equilibrium, kinetic, and crystallographic studies.
pubmed rcsb
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN PRECURSOR
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 102
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-02-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a40A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a40A02
2H9BA 1D3KA 4FIMA 2I4CA 2IEEA 2O84X 3TTNA 4N07A 4FEDA 2I0BA 1JVXA 2H25A 4ZEIA 5F7VA 4YB5A 4R74A 3OO6A 2H99A 3IO4A 4WKMA 1A99A 3PUWE 3Q26A 5M2VA 1LB8A 3RGYA 5DVFA 3IOWA 2OZZA 4BDRA 1LCTA 3GXAA 4H8IA 1N3WA 4HS7A 3QXMA 4FATA 1B0HA 4ZDMA 1IIWA 1XC1A 4F2OA 3K0VA 2IA4A 1TFDA 1T0KA 4ZEFA 2O7UA 2OK2A 3PPQA 1UTHB 4Z0IA 3S4UA 1NNTA 1IXGA 4BLAA 5CI5A 3K6UA 3MPKA 4ZEKA 1M5BA 3O6IA 3HPIA 1AMFA 5AA3A 1A40A 3QIMA 2R9JA 1QULA 3C32A 4BDLA 3E4RA 2X7PA 2Q89A 2XX9A 4NTLA 3BBRA 2HCAA 1DTGA 5H8FB 3O2AA 3TDJA 2NUVA 3B6QA 1JEVA 4TLMB 2REGA 1TFAA 3BFTA 1POY1 3T9VA 1IXIA 3KSJA 4R72A 4N6PA 2V93A 3SEWA 1M5DA 3KEIA 3T96B 1QW0A 4O3CA 1ZIUA 4G77A 4RYAA 1DOTA 1R9QA 1B7UA 2DE4A 3VLVA 1B7HA 1LAXA 2HZKA 4HTGA 3KG2A 2Z8EA 1LAHE 1SYHA 3FVNA 4G68B 3EHUA 3ZKLA 4RPNA 2YLNA 4NF4B 1IEJA 1P1QA 1MQGA 3WAEA 2I48A 1P1NA 4IGTA 4OTEA 3VV5A 3IO6A 1B3GA 1FTMA 1NH8A 3MC2A 1TT1A 1N76A 2Z8DA 1AL3A 3A3UA 4U2RA 3MP1A 5AA2B 3H06B 3ZS6A 4AQ4A 4IO2A 4JSDA 4JBZA 2OJTA 4YKIA 3OSQA 4RNSA 3RLFE 3K6VA 1N0TA 2PVUA 3R7XA 1SBPA 3G3HA 2DXYA 4C1TA 1ZMGA 1LSTA 1R9LA 1D9YA 3Q28A 1ZLQA 4K3FA 1S9TA 4OERA 3LSFB 1B3LA 3UK4A 2F35A 2OWTA 4ECFA 3BKIB 4JDFA 5EYFA 4PP0A 3UN6A 3FVKA 4U21A 4DCXA 1LFIA 3GBAA 3PUZE 4DCYA 1NL5A 4XTCQ 2R6GE 2F78A 2XX8A 5JTYB 3OO7A 3A3CA 3Q27A 4RXLA 2QSXA 2GHBA 3PD8A 1Y9UA 4I9DA 1LFHA 4GQOA 2NVUB 3IORA 3LUYA 1M5FA 1YPNA 3MZ9A 5B70A 1JETA 4GL8A 2VGQA 4EXKA 3TODA 5DVIA 2ABHA 4KYEA 3Q29A 1B51A 3LSXA 2UVJA 4IO3A 1SI1A 5I59B 1Q35A 3B7DA 4F3GA 2P0SA 3CRBA 1MM7A 3KSXA 1FQDA 5L9SA 3TCFA 5DEXB 4NF6A 3I5OA 2OCUA 1MXWA 1SW2A 4F2QA 1ZKBA 2WKYA 4NF8A 2XXIA 4QRZA 3CIJA 1MPDA 3JZJA 3UGWA 4GXAA 2ZNTA 3C35A 4YMAA 4XKQA 4YMBA 4GFRA 1OVBA 3CFXA 5TPAB 3HO7A 3P7IA 3C9HA 4Q8RA 2Q2AA 1H43A 1MXXA 5H8QB 5HM4B 3TMGA 2XXXA 1MDQA 1ZJLA 3T66A 1JVYA 1YTVA 2H5YA 2VD3A 4YKKA 5ISUA 3OXNA 3MUQA 5H8NA 2ESNA 3IJOB 4XKPA 3K00A 3BFUA 3MW0A 5JEIA 2ZNSA 3WAFA 1A8FA 2A5SA 1J1NA 2DSFA 3ODBA 4Q0CA 1S50A 3EHSA 1A7LA 4OEVA 5TP9A 4KR5A 2A5TA 3FJMA 4G8MA 3V83A 1LAFE 3D4CA 5L8DA 1EU8A 3VVDA 3U72A 3UIFA 1H44A 3Q25A 3TQLA 2YPNA 3M3LA 3MZ1A 4X1DA 4KFQA 3CVGA 3H3GA 4WEDA 3S9MC 4H0WA 5KDTB 2HFBA 2VD2A 2P1SA 2V3TA 1PEBA 2AL5A 2Q88A 3TEPA 3MP6A 4PQJA 4QFLA 4EQ7A 1MY2A 1H3DA 5I58A 2I58A 1H76A 3EQ1A 1BP5A 1A54A 2Y84A 3HSTA 4F22A 4PE5B 1LB9A 2UVHA 3OEKA 1CE2A 2ZYNA 5AA2D 1MY3A 5CBSA 3MAMA 2DE2A 2RKMA 3KZGA 3G3KA 2QS2A 3C4MA 4LA9A 3TYHA 2DE3A 5BUUA 1Y20A 4H8JA 3CG3A 3MWBA 2B3BA 3I3VA 4JB7A 3F11A 3OO8A 1ELJA 4ZEDA 1TXFA 2F7AA 2FNCA 4PFTA 1B3EA 4R6YA 4YZZA 3OENA 1SW4A 3O66A 3TELA 5BWJA 4IB2A 4G2ZA 3EF7A 1Q1KA 1MDP1 3S9EA 1XOCA 4I1DA 1B4ZA 3DP6A 1Z7ME 1RYXA 5H8HB 2VHAA 1CB6A 1Z7NE 3FGSA 3TCHA 3U1OA 2NXOA 3CFLA 2XXQA 4NWCA 3VXBA 1UTHA 2DP8A 4OZ9A 4KQPA 4ISUA 3LBSA 1A55A 1ANFA 3FD3A 3MVWA 4PFWA 1QUJA 3E3KA 3OO9A 5FHNA 3TZAA 1M5CA 1MPCA 2QPQA 5A5XB 3PMWA 3W15C 2ZYOA 4P0IA 3EPEA 3L6HA 1N7XA 3DLNA 4ZS9A 4ZEBA 2M8CA 5H8FA 1MY1A 4XKNA 3ECRA 1LBBA 4Q30B 1SDXA 3N5LA 1GVCA 5EHMA 1QVSA 3MVXA 1PBQA 3LSLA 2Y7PA 3CR9A 2F7CA 5I2KB 2F8DA 1B0LA 3N6TA 3K1MA 1OQGA 2THIA 4ELQA 2CMOA 4YB7A 3RUMA 4F39A 4R2BA 2XD2A 3VVEA 4G68A 1D9VA 4OWDA 1B3FA 4TOZA 4NF4A 3TUSA 4H6DA 1IXCA 1OLAA 3KN3A 4QFKA 1USYH 2RCBA 1DMBA 1USYE 1Y4CA 1JEUA 5DTBA 3IOVA 1I69A 1R6ZA 1I6QA 3MZBA 4ZE9A 4LZ5A 1VR5A 3SEYA 1Y1MA 5KZTA 2OBGA 1PC3A 5AA1A 2Z23A 3T9XB 2DOJA 4EF2A 4KYSA 3JYRA 3H6WA 1FQCA 1TWYA 4IO4A 1OIBA 3OD7A 3JV9A 4IO7A 4OEUA 1I6AA 4R75A 5CRYA 4ONYA 4H1XA 4U4XA 3V5AA 2DWAA 2AIXA 1JNFA 4XKRA 4F1YA 1SYIA 4OQOA 3G3FA 1B05A 1B40A 2ANJA 1XVXA 2V25A 2Y7RA 4IY6A 4RPOA 3THIA 5JTYA 1FQEA 4MLQA 5I84A 3OEMA 1FTJA 4LZ7A 1ATGA 2RC7A 4EDPA 4OXVA 4YICA 5FTIA 1YCJA 1A8EA 3KOSA 5CBRA 2W7YA 4GRKA 4ZZAA 1B1HA 2I49A 1NKXA 5ICQA 1XT8A 4KCCA 5I59A 4BDQA 4WXJA 1JQFA 4YU0A 3FV2A 1MRPA 2V84A 1MS7A 3QYTA 5DEXA 3QSLA 4Z7EA 2RCAA 1JW4A 1US4A 4PFYA 3G7WA 3RTWB 3DELB 5HBCA 3MP8A 4JWYA 1URGA 3R6UA 3FXUA 1N7WA 4LQ5A 2HZLA 1F9BA 2Z8FA 1N84A 4R6KA 3PUXE 3M3FA 2UYFA 2HQ0A 4U4SA 5I56B 5TPAA 5FHOA 1OLCA 1NNKA 2Z22A 1GTKA 3N6UA 1GR2A 2O7IA 5H8QA 1PDAA 4BDMA 5ITPA 1URDA 4E0WA 2F97A 4OFOA 3KN8A 1GV8A 3SEUA 1JW1A 3B6WA 3IB0A 2H4IA 3HN0A 4OETA 5AA4B 3PMVA 3M8UA 4NF5B 2XXHA 3N94A 5I2NB 1B52A 4TQUQ 1N04A 3VDFA 4YAHX 3K6XA 2I6EA 3TFLA 1HSJA 5CC2A 1SQYA 1MY4A 3MJNA 1RKMA 2UXAA 1ZU0A 4RK2A 3AXFA 4GOTA 1B5IA 5F1QA 4DXCA 1KWHA 1LAGE 3K01A 3RNNA 4OFLA 1FTOA 3FXQA 5J1DA 1IZ1A 3IAZA 3KN7A 2B65A 5CMBA 4GLIA 5I57A 2DVZA 2DVCA 1IQ7A 1OVTA 3H7MA 3C33A 4I8CA 2QS1A 2O51A 1LFGA 4LZ8A 1BLFA 5IAIA 3U94A 2ALUA 2G29A 5KDTA 2UVIA 1BKAA 2XD3A 4DXUA 3IR1A 1DSNA 1Y3PA 4P11A 3ZKKA 2V3UA 2VP1A 2FA7A 1OMPA 2HEUA 1SD3A 2I3WA 1VFDA 3E13X 4IY5A 4ESWA 4H5GA 3MVZA 2QL3A 1UTBB 4NF6B 2ONSA 3TPAA 1EZOA 3S2VA 4X9TA 5TU0A 3KGCA 4GVOA 1I6BA 2XXYA 2D3IA 1YAEA 2V3QA 1S7YA 2DWJA 4G68C 3HCQA 2BJJX 2PT1A 4DZ1A 3O28A 2XXRA 1GGGA 3KJTA 4MF3A 4DDDA 3IK6B 1XVYA 3OSRA 3I6VA 3VFJA 2AL4A 2PBWA 3L6GA 3TKDA 2E0SA 5AE4A 3PU5A 3C34A 5HPQA 5JK4A 2DWIA 2XXVA 3TAJA 2F7BA 3CFZA 4DE8A 4LATA 2ONRA 5H8HA 4ND9A 1QKBA 4NWDA 3PV0E 1VSOA 2QMWA 4OHNA 2REJA 1AH5A 4DIGA 4OESA 3K2DA 1Y3QA 2XXWA 1VFEA 3MPLA 1QUKA 2G93A 3H03A 2F5XA 3LSWA 3TCGA 1WVJA 4N13A 5A5XA 3G3JA 4KHZE 4C0RA 4R2FA 3TTMA 2DXRA 3CSBA 2ZMBA 2XXTA 2Y7IA 3TTKA 2Q8JA 2PX1A 3T9HB 2O6AA 4EQBA 5K2YA 4RY1A 4BDOA 2F6GA 3GBBA 1UIVA 2HXWA 4H67A 4F1UA 4F3BA 4RJZA 1FW0A 4C1UA 3G3GA 4Q5TA 5FHMA 1MXYA 1B32A 4GD5A 3G3IA 2DWHA 5L9OA 1MQDA 4IGRA 1L5TA 3H6TA 5KCJB 3RT8A 4GWOA 1DPPA 4F29A 4QSDA 1II5A 5I2KA 3K02A 3LR1A 2D5WA 3PPNA 3QAXA 4EUOA 4OFJA 1HSEA 1QJMA 1H45A 1PB7A 1POTA 4HCYA 1NMUA 3SEVA 2UYEA 2HAVA 3N26A 3HV1A 3VE1B 1B6HA 1EZPA 4MH5A 4RK9A 4YKPA 4OVJA 5L9MA 2RINA 4NEDA 3PUYE 4DLDA 3FJ7A 2CZLA 1MG1A 2VOZA 4QFPA 2P2AA 2Y7KA 2O1MA 5ITOA 4GF8A 4WEPA 3RPWA 4EXLA 1PB9A 2RC9A 1MH4A 3D4GA 2D21A 3CI8A 1NFTA 3FJGA 2XXUA 3T9UA 5IKBA 4POWA 4GIZA 3RQTA 4QHQA 4LP2B 4FAJA 1PB8A 2I4BA 5DVJA 4ZZEA 2O69A 2F34A 1P1OA 3GZGA 2GRVA 2DYXA 3HHFA 3CSGA 3TTRA 3S9LC 5AA2A 3O29A 1MH3A 1EH3A 2PMSA 4U1OA 4R73A 2ZYMA 1NNFA 5FTHA 1Y4TA 4O3BA 4PFUA 3FIRA 1D4NA 3SETA 1WDNA 4ELPA 4EF1A 4RA1A 1M5EA 2XXPA 2O1LA 4F3PA 2OWSA 4THIA 3W9WA 4MBPA 4QF9A 4F19A 3FXRA 3K1NA 5B7DA 5LOMA 3OMBA 2Q2CA 2XHDA 3KBRA 1HSLA 1SW1A 4FJPA 4QFOA 1LGBC 4ELRA 3QUJA 4MFIA 4KPTA 3ONMA 2ZXTA 4G8NA 4HW8A 1VE4A 5H8SA 3IB1A 3PD9A 4FEBA 3K1PA 2O68A 3B6TA 4UA8A 4L17A 5DYHA 3RN8A 1O63A 2PYYA 3QK6A 2NWJA 4XXUA 5I56A 2Q9TA 3RTFB 4R6HA 1IXHA 4QFNA 2QMXA 3FVOA 4OENA 3HHGA 4M4GA 1UIUA 4FE8A 3O97A 4KD5A 1US5A 2I3VA 2GHAA 1QKAA 4U23A 1LBCA 4MLVA 2QS4A 3CG1A 1Y1ZA 2GH9A 4M1VA 3VVFA 1MXUA 3O6GA 2GFEA 5AA4A 4NF5A 4LONB 1FQFA 5I2NA 4HCWA 4AB6A 1MQJA 1P1UA 2NOOA 3IOTA 5EHSA 1FTLA 1B5HA 2OLBA 3DM0A 4H5FA 1SW5A 3C31A 4YKJA 1JW5A 1R1NA 1SVXB 3MQ9A 3KOTA 2F6PA 3K6WA 3O9PA 4P0GA 3EN3A 2QRYA 1FTKA 1BIYA 4F18A 3GLBA 3DP8A 1ZBMA 4NE4A 2E1SA 1XS5A 3IX1A 2HAUA 4GXSB 1AOVA 4X1BA 1B1XA 3FZVA 3SERA 3PGFA 3K4UA 1UQWA 2ZYKA 1IITA 5ICTA 1P1WA 5K2XA 3OOAA 4H65A 3S9NC 1SI0A 4UACA 2DS9A 3TTLA 2RF1A 2F36A 4IO6A 4LQ2A 3UP9A 1UTBA 3A09A 1B58A 1B5JA 1BTJA 3RY3A 5DT6A 3SDFA 4BDNA 3DP4A 3O6HA 4F1VA 2LAOA 3UORA 1FQBA 3VLUA 4LUBA 2DQVA 1OQHA 2Y7WA 1EZ9A 1MXVA 5CMMA 3OELA 1B3HA 1PBPA 4U22A 4YB6A 2PT2A 4G4PA 2ZNUA 3MVYA 3KJ7A 1MY0A 3FV1A 2RC8A 1AIVA 3PUVE 2AYSA 1NH7A 4F3SA 2H98A 3KFMA 1O7TA 3M3KA 1MPBA 4XIGQ 3PMXA 4PETA 4R9GA 3RT6B 4FECA 3SKPA 3UA8A 3ILUB 4NF8B 3VLWA 2R71A 1B7ZA 3IOUA 4OMBA 3PPOA 1MQHA 4QSCA 4U1ZA 1FQAA 5CMKA 4JSOA 4KI0E 3SESA 3H4ZA 1MQIA 3FASA 4R9FA 5I57B 4JWOA 4IO5A 4AB5A 4JXIA 2FYIA 4OYVA 3T93B 1QUIA 4F31B 4JWXA 3U93A 1MM6A 4KYDA 1ZTYA 3E9XA 5ELVA 2KLFA 3U92A 2QJEA 4ZECA 4POXA 5H8NB 1MXZA 4G8HA 4GL0A 3W9VA 3FATA 4TLLB 3PPPA 3LC8A 2X26A 3QUFA 5CM6A 4FORA 4X48A 4ELOA 3H6UA 3IJXB 1DTZA 3EHTA 3FVGA 1B9JA 4ESXA 4LVQA 1N3XA 3USDA 5TP9B 2A5TB 4QSEA 1URSA 1P99A 1B2HA 1RYOA 3SEXA 3IL1B 2I0CA 2B3FA 2QS3A 3R26A 4DXBA 5KCJA 4ZE8A 3VXCA 2YJPA 1Y3NA 4EQ9A 3FUZA 4NMYA 3TQWA 1FCKA 3ZSFA 3V89B 2ONKE 3T22A 1NNPA 3ILTB 4KCDA 1WODA 5I58B 3PPRA 4E0XA 5CMCA 1LLSA 3IB2A 3U8QA 1B46A 2XX7A 4I62A 4O3AA 3H6VA 3MBPA 1DPEA 1B4HA 2UVGA 3C36A 1IUDA 2X7QA 3V8XB 1LCFA 1XHYA 1O64A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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