1A40A

Phosphate-binding protein with ala 197 replaced with trp
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
b'EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYWYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Dominant role of local dipolar interactions in phosphate binding to a receptor cleft with an electronegative charge surface: equilibrium, kinetic, and crystallographic studies.
pubmed rcsb
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN PRECURSOR
source organism Escherichia coli
molecule tags Phosphate-binding protein
total genus 102
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-02-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a40A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a40A02
4G68A 2Z22A 4G2ZA 3VLUA 4RA1A 4NTLA 2OZZA 3IAZA 3S9MC 1B3GA 4U4XA 3LR1A 2DVZA 3B7DA 1JW4A 3VLWA 1AOVA 3KOTA 4I9DA 3UK4A 3TTLA 3EHTA 3Q25A 4O3CA 2H4IA 1LBBA 1JW5A 4TOZA 1NMUA 3TAJA 1EU8A 2Y7KA 3O97A 1MS7A 3CRBA 3DP4A 3ZKLA 5H8FA 2QMWA 4F1YA 1WDNA 1GGGA 1NNTA 1SQYA 2Q88A 3U8QA 1MDQA 4PFUA 4EQ7A 1L5TA 1FTMA 5DEXA 3IR1A 2RC8A 3LC8A 1EZ9A 5H8HB 2GH9A 1Y3PA 3GLBA 2QMXA 5ICQA 3GBBA 2XXXA 5H8SA 1A99A 2F78A 4IO6A 4JWYA 1Y1ZA 3FVNA 3C36A 4OETA 4BDQA 4JSOA 4BDNA 1AL3A 3H6WA 4JB7A 5CI5A 1GV8A 2GRVA 2Z8DA 4NWCA 2B65A 3SEXA 3MWBA 3O6IA 3C33A 2O1LA 3I3VA 3QUJA 3KJTA 5B70A 1SI1A 5F1QA 2YLNA 1HSEA 4KYEA 1H3DA 2RC9A 3RGYA 4ELQA 3KBRA 1ANFA 1SW1A 3T96B 3TEPA 4TQUQ 2HZKA 3IB1A 2KLFA 3C31A 4DCYA 3EHSA 2OBGA 3C9HA 1FQCA 1OMPA 4H67A 3H03A 2O6AA 1EH3A 3SKPA 2OK2A 5I57A 1HSLA 3H4ZA 3IJXB 2P0SA 4LUBA 5AA4A 2XXYA 5I59A 1B4HA 4NF5B 2UXAA 4KQPA 5KZTA 3TPAA 3MP1A 1N7WA 2XD3A 1B46A 3C35A 5F7VA 4R2BA 1A7LA 4RPNA 3K1MA 4UA8A 3ZSFA 3IK6B 4LZ8A 2ONKE 1QUIA 3PUYE 1M5EA 2AL5A 2ZNTA 4ZZAA 4F2QA 4ZEDA 5EHMA 4PETA 4PFWA 4O3BA 4BDMA 4FIMA 1N0TA 4QSEA 1EZPA 4L17A 1II5A 5JK4A 3PU5A 3K01A 2F6GA 5IAIA 3IL1B 4ESXA 3KFMA 4BDRA 4H8IA 3TTMA 3TZAA 4GXSB 2F6PA 2A5TB 3PUVE 3MBPA 2I49A 2X7PA 3QK6A 4GL0A 3C4MA 4IGRA 1MXXA 3PV0E 5JEIA 1Y1MA 4YB7A 2ONSA 3PMWA 2D3IA 3WAEA 4I1DA 3EN3A 2GHBA 2DSFA 2XX8A 2ZYOA 4GVOA 3U93A 2PBWA 1B0LA 3FD3A 1J1NA 5HBCA 1QULA 1SBPA 1ZMGA 2UYEA 2WKYA 5CBRA 1LAGE 3TCHA 5I57B 2DWJA 4IO2A 4R9FA 3MPLA 4RNSA 2CZLA 4G8MA 4H5GA 2ZXTA 4F3BA 1JQFA 2F34A 3ECRA 2M8CA 4QFNA 1H44A 1POY1 1R1NA 5I2KA 2HZLA 4POXA 1MQDA 2X26A 3SEUA 3MZ9A 5FHOA 4YB5A 1FQFA 3KJ7A 3S9NC 3TQLA 2VGQA 4F1UA 5CM6A 1LFHA 3H7MA 1MM7A 2NVUB 4XKQA 1I69A 2V84A 2DWAA 2Z23A 3KG2A 1IZ1A 4N6PA 3IOTA 1CB6A 3MP8A 1SD3A 2UYFA 4IO3A 2H99A 3N5LA 3GBAA 4OQOA 1ZKBA 1US5A 4OFOA 4YKPA 1GR2A 3E13X 4U2RA 4HW8A 2OWSA 3PPRA 3W15C 4U4SA 3HV1A 2ZYKA 1B58A 1MRPA 5DVIA 1SW5A 4EDPA 1TXFA 3LSWA 4I62A 3VVDA 1OVTA 1AMFA 3G3GA 3IO6A 3A09A 3VLVA 1P1QA 2I6EA 3U1OA 4NF6A 4IB2A 5FHMA 4QF9A 3K02A 3GZGA 3TTKA 2E0SA 5TPAB 1Y9UA 1I6QA 2VD2A 2D21A 1JETA 1D3KA 4KCCA 4QFPA 5I2NA 3CFLA 3MUQA 2IA4A 2Y7WA 3FXRA 1B5JA 1MPDA 2O51A 3FJMA 4DZ1A 3DP6A 1UTBB 3O2AA 4LQ2A 4OYVA 5KCJA 3Q27A 2AL4A 5L9SA 1ATGA 3RY3A 1IEJA 2DE4A 3USDA 2UVGA 4NF4B 4ZDMA 1LB8A 1VFDA 3PUXE 3M3FA 1NNPA 4RXLA 4POWA 4F39A 2QPQA 2H9BA 2RCAA 4TLLB 1ZBMA 1ZU0A 4E0WA 4OTEA 2R9JA 3K00A 3KN7A 3KEIA 3BFUA 4R2FA 3V5AA 3UGWA 4ESWA 4F1VA 1PC3A 4Z0IA 3RT8A 3H6TA 1MY4A 4WKMA 3RTFB 1RKMA 3PPOA 5I58B 1ZIUA 4JSDA 1S50A 1B9JA 3RUMA 4G77A 1IXIA 5I56B 1MXZA 5ITOA 1PBPA 3N6UA 4JBZA 1T0KA 2DS9A 3LSLA 4PFTA 4TLMB 1MH4A 3B6WA 4ND9A 4RJZA 4YKKA 3M8UA 4H65A 1Y3QA 1QKAA 5CMKA 4OZ9A 5KDTA 1JVXA 1XVYA 4K3FA 5A5XA 2P1SA 2QS3A 5ISUA 3L6GA 5H8NB 2PVUA 4QFKA 5CBSA 5JTYA 3VFJA 3C32A 3TUSA 3WAFA 4NF8A 3CI8A 4NF6B 3KSJA 2VOZA 3RNNA 3VV5A 4M4GA 3C34A 4ZE9A 4OESA 5AA2A 2OLBA 3VDFA 1SVXB 3S4UA 4F19A 1RYOA 1B4ZA 4JDFA 4OFJA 3PUWE 1IXHA 3IB0A 4Q5TA 2FA7A 4IY6A 1FTKA 1AIVA 3MVYA 3ILUB 3H6VA 2V93A 1XC1A 5KCJB 2DXRA 2QSXA 1IQ7A 3IO4A 3MZ1A 3CIJA 1FQDA 3RQTA 3N26A 5DVFA 2I3VA 4KCDA 3R7XA 2O84X 3JV9A 1M5DA 4GF8A 4P0GA 2Z8EA 4WEDA 3TQWA 3PD9A 3VVFA 3TCFA 2V3TA 4FORA 2NWJA 1PB7A 4QSDA 5K2XA 5M2VA 5ICTA 3PGFA 3UP9A 1B51A 1BIYA 1OIBA 1QW0A 3PMVA 3E4RA 3VE1B 3CG1A 2NXOA 3VVEA 3HPIA 4Q0CA 1BTJA 2O1MA 2DWIA 4PP0A 4ELRA 3H3GA 3R6UA 2F7BA 4AQ4A 3CFZA 1WODA 4R74A 4R6YA 1RYXA 4ZEBA 2ZYMA 3BKIB 1MY0A 3RT6B 3OSQA 4DIGA 2O7IA 1CE2A 4U23A 1F9BA 5TP9A 1N04A 3OEMA 4EXLA 2Q2AA 1Y20A 2YJPA 4G68B 1SW4A 3TYHA 2XXPA 3PUZE 4OWDA 4LVQA 1XT8A 1LAHE 5AA2B 1QKBA 2FNCA 3CSBA 1MY1A 3K4UA 3O6HA 4P11A 5DT6A 3OD7A 3Q28A 3HN0A 3A3UA 1B3HA 1SW2A 4ZEKA 5CC2A 1KWHA 2HEUA 3TFLA 4XTCQ 3TDJA 1PBQA 1JEVA 1A8FA 4H1XA 3T9XB 5H8FB 1NNKA 2Q8JA 1B6HA 4Q30B 3IJOB 3MP6A 4OERA 1NL5A 4G4PA 3T9VA 4WEPA 1DMBA 4YU0A 5DEXB 1Z7NE 4BDLA 3MPKA 4YKIA 4GRKA 2DOJA 1N3XA 1A8EA 4HTGA 2Y7IA 2QJEA 3FJGA 4EF1A 3B6QA 1VR5A 3O66A 2HXWA 5ITPA 1O63A 4N13A 4M1VA 4OVJA 4X48A 1OVBA 5CMBA 1Z7ME 2VP1A 1DTZA 3QSLA 1SYHA 4NWDA 3KOSA 4PQJA 4RK9A 5DTBA 3UORA 2F35A 2XXVA 3FIRA 1QVSA 1FCKA 2F7CA 5HPQA 5EYFA 1LSTA 4YMAA 1N76A 1LFIA 3MZBA 4KI0E 3B6TA 4HS7A 2F36A 4LP2B 3VXBA 1LB9A 3K6WA 1XS5A 2F5XA 3OELA 4LZ5A 3DP8A 5BWJA 3QUFA 2Z8FA 2I0BA 1YPNA 1P99A 5TP9B 1USYH 2X7QA 1URSA 4F18A 3QXMA 2XXHA 2NOOA 1A40A 4R72A 1YAEA 3A3CA 4U1ZA 4ELOA 3FATA 2DE3A 1B1XA 5AA4B 2G93A 1S9TA 4EUOA 5I59B 3AXFA 3O6GA 4GFRA 4GOTA 1Q35A 5K2YA 3FUZA 3EF7A 4YB6A 3D4CA 2P2AA 3Q26A 4KPTA 3G3IA 4IY5A 1H45A 3M3KA 3FV2A 4MLQA 1YTVA 3K2DA 4FAJA 3MJNA 1MQJA 1ZTYA 3FGSA 3S9LC 1OLCA 2B3BA 3W9VA 1DPPA 1NH8A 2D5WA 4LATA 2ESNA 2AIXA 3RN8A 2PX1A 4EF2A 2ZMBA 3TELA 5ELVA 3BBRA 3CG3A 1M5CA 3OMBA 2OCUA 4JWOA 3RTWB 3K0VA 3U72A 3CVGA 2I4CA 5H8QA 4ZECA 4H5FA 4KD5A 3IX1A 2UVJA 1MG1A 2OJTA 4KR5A 3F11A 3H06B 4R6HA 1I6AA 1LAXA 3FVGA 2YPNA 4F3PA 2THIA 2H98A 3S2VA 1MXWA 3LUYA 4QFOA 3HSTA 1MPCA 4BLAA 2UVHA 3GXAA 2QL3A 3IOWA 2O7UA 2XHDA 2NUVA 3QIMA 4F22A 4QSCA 3VXCA 4C1UA 2XXRA 4FE8A 3U92A 4E0XA 3M3LA 3OOAA 3T66A 2H25A 4DXCA 4H0WA 4LONB 3MW0A 2HAVA 2Y7PA 2XX9A 5BUUA 2ZYNA 3E3KA 1S7YA 4MF3A 4GLIA 3U94A 3K1NA 1HSJA 5FHNA 3ONMA 4OHNA 3T9UA 3IOVA 2DQVA 2W7YA 5I2KB 4KYSA 3Q29A 2I0CA 1DTGA 2R6GE 3CFXA 4IGTA 4ZE8A 2ANJA 2F8DA 1QJMA 5H8HA 2O68A 3MVXA 3R26A 1MDP1 4P0IA 4GWOA 1YCJA 4YMBA 1UIVA 2UVIA 4MLVA 2QRYA 1MY2A 4Z7EA 1Y3NA 1OLAA 3S9EA 2HCAA 1MQGA 1UTHA 1N3WA 3FV1A 4ZEFA 1MXYA 1Y4CA 3G3HA 4X1DA 3TKDA 3FVKA 1B7HA 1FQEA 2Y7RA 3TODA 5L8DA 3IOUA 2REJA 1UIUA 1PB8A 1NNFA 2CMOA 4EQBA 1R6ZA 1MQHA 2XXIA 2PT2A 3G7WA 4R9GA 3SETA 2ONRA 2DWHA 2BJJX 4FEDA 1IXCA 5I2NB 2VHAA 3E9XA 5FTIA 1ZJLA 5DYHA 1H76A 1NH7A 4R6KA 2E1SA 3DM0A 4NF5A 1USYE 4ZZEA 3MVWA 1PDAA 4U1OA 2VD3A 4HCYA 4JWXA 1O64A 1IUDA 1B3EA 2RF1A 1B52A 5AA1A 3RLFE 3SDFA 1BP5A 2DXYA 1B2HA 1VFEA 3MC2A 4NE4A 1TT1A 2ALUA 4ZS9A 1JEUA 1B05A 3TTRA 5L9OA 5DVJA 4ZEIA 1NFTA 4O3AA 3W9WA 3DELB 3TCGA 2GFEA 4RK2A 4ELPA 3HO7A 3CSGA 4C1TA 1UTHB 1B7ZA 4QRZA 2V3UA 1JNFA 3EPEA 1JW1A 2A5TA 4XKNA 2Q9TA 4NEDA 5KDTB 2OWTA 1AH5A 5A5XB 5CRYA 3UA8A 1XHYA 2Y84A 3JYRA 5JTYB 5AA3A 4QHQA 1DPEA 2HQ0A 1B40A 4NF8B 1JVYA 1A54A 3SESA 1PB9A 4DCXA 3LBSA 1TFDA 1POTA 2DE2A 3RPWA 1FTLA 3HCQA 5EHSA 1SDXA 4GD5A 3ODBA 2O69A 1B3LA 1FQBA 2IEEA 2DP8A 3FXUA 1I6BA 1H43A 1FTOA 3HHGA 2ZNUA 1OQGA 3O9PA 3JZJA 1LCFA 2XX7A 3V83A 2AYSA 4JXIA 4YICA 3THIA 4KYDA 3OO9A 5FTHA 2I4BA 3O29A 1R9QA 3HHFA 1GTKA 5I84A 1NKXA 4RYAA 1ZLQA 3PD8A 4BDOA 2A5SA 3SEWA 1US4A 3G3KA 3L6HA 2QS4A 3SERA 3K6UA 4LZ7A 4NMYA 2Q89A 4YAHX 1EZOA 4OMBA 4DDDA 3N94A 4OEVA 3OEKA 3O28A 4AB5A 4DXBA 4KHZE 4LA9A 2XXTA 4LQ5A 4R73A 2RCBA 4U22A 4XXUA 3SEVA 4FATA 1FW0A 2PMSA 5J1DA 2REGA 3SEYA 3N6TA 3K1PA 1B1HA 4DE8A 3K6VA 4AB6A 1P1OA 3OO6A 5CMCA 4N07A 3EQ1A 3QAXA 4DLDA 3FJ7A 1TWYA 1MPBA 1FTJA 3DLNA 5IKBA 1B32A 5AE4A 4ISUA 2XXUA 2DVCA 1URDA 4PFYA 4X9TA 1DSNA 4YKJA 2ZNSA 2Q2CA 5TPAA 2R71A 4YZZA 1XOCA 1B7UA 4XKRA 3I6VA 4EXKA 3PPPA 4H6DA 1UTBA 4F3SA 3LSXA 4OXVA 1QUKA 4R75A 3KSXA 4NF4A 1B5HA 4IO7A 4OENA 1TFAA 3D4GA 3UN6A 4F3GA 2I3WA 4FJPA 3OO7A 1MY3A 1M5FA 3ZS6A 5HM4B 1LCTA 3FVOA 3MQ9A 4OFLA 1VE4A 2F7AA 3FXQA 3MAMA 4RPOA 1URGA 1M5BA 4G8NA 1FQAA 1VSOA 3P7IA 1WVJA 4WXJA 1LGBC 3KN3A 4U21A 5I58A 1D4NA 1SYIA 5AA2D 3IORA 3UIFA 3OXNA 1LBCA 3ZKKA 1P1NA 5I56A 2XXQA 1XVXA 1OQHA 1QUJA 3OO8A 3FZVA 4QFLA 2GHAA 2XXWA 2DYXA 4H8JA 3IB2A 3I5OA 5H8NA 4ECFA 4G68C 4UACA 3T9HB 5TU0A 1BKAA 1B0HA 1LFGA 3LSFB 1P1WA 5LOMA 4MFIA 1IITA 3ILTB 1MH3A 3TTNA 1MXUA 4XIGQ 2RC7A 4GQOA 3QYTA 2PYYA 2RINA 4F31B 5B7DA 1N7XA 4GL8A 2PT1A 1Y4TA 2HAUA 3OSRA 3OENA 3CR9A 4OEUA 2FYIA 2G29A 4FECA 1DOTA 1R9LA 4PE5B 4IO5A 1N84A 2ABHA 4FEBA 1P1UA 3TMGA 3PPQA 3BFTA 1O7TA 2V3QA 1MXVA 2H5YA 4F29A 4F2OA 3EHUA 3V89B 1Q1KA 4I8CA 1LAFE 4HCWA 3KZGA 3PPNA 1ELJA 1MQIA 4Q8RA 3T22A 3KN8A 2F97A 1BLFA 3G3FA 5L9MA 3K6XA 3V8XB 3FASA 1PEBA 2V25A 1GVCA 2HFBA 4IO4A 2RKMA 1B5IA 2LAOA 2B3FA 5H8QB 4EQ9A 1MM6A 3H6UA 3G3JA 1D9YA 5CMMA 1UQWA 3PMXA 2I58A 4GIZA 2I48A 4MH5A 4KFQA 1IXGA 4DXUA 4X1BA 1IIWA 3T93B 1SI0A 4G8HA 1LLSA 2XD2A 4XKPA 1D9VA 1B3FA 1A55A 4C0RA 4GXAA 3MVZA 4RY1A 2QS2A 4ONYA 4MBPA 2QS1A 4THIA 3KGCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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