1A40A

Phosphate-binding protein with ala 197 replaced with trp
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYWYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Dominant role of local dipolar interactions in phosphate binding to a receptor cleft with an electronegative charge surface: equilibrium, kinetic, and crystallographic studies.
pubmed rcsb
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PERIPLASMIC PROTEIN PRECURSOR
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Escherichia coli
total genus 102
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-02-10
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a40A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a40A02
2YPNA 3C32A 4NE4A 3E3KA 4YKJA 2I48A 5TU0A 2O51A 4IY5A 1JW4A 2Y7PA 1A8FA 4MF3A 1B5IA 2VOZA 3PPNA 3U93A 1Y1MA 3CG1A 2DXRA 4GWOA 1MY2A 1XVXA 5K2YA 3QUJA 1EH3A 4U1ZA 3TZAA 2F7BA 3GBAA 2Q2AA 1D9YA 1ZBMA 3M3KA 3KN8A 1MXXA 3KN7A 2DOJA 4U23A 3KEIA 1M5FA 3DM0A 3FIRA 4EQ7A 3OEMA 5H8FA 2XXIA 5F7VA 1B58A 4YKIA 4YKPA 4QHQA 5ICQA 3ECRA 3TQWA 3S2VA 1JQFA 1MH4A 5DTBA 3CFXA 3UA8A 1Y4CA 4O3AA 1R9LA 3LC8A 1DTZA 3CG3A 4BDRA 4RNSA 2XXXA 1PBQA 2H98A 2F6PA 4K3FA 5JTYA 1LFIA 4ELRA 3FVGA 2O84X 3PMXA 4IO5A 4TLMB 2DE3A 1SQYA 3OO9A 2VD3A 4ZEKA 2ONSA 1HSJA 2GFEA 4RPOA 3T66A 1MQIA 2B3BA 3TTRA 1LFHA 1US5A 4BDMA 3S9LC 4R2BA 4OQOA 1LLSA 3WAFA 1NH8A 3KJTA 4YZZA 3VVEA 3O29A 4ND9A 5CMMA 3H3GA 4F2QA 1BP5A 4HTGA 4IO2A 1FQAA 3JV9A 4GFRA 1DOTA 1F9BA 3Q28A 3C36A 4AQ4A 4G68C 4DDDA 2XXRA 1AIVA 2DVCA 2Y7RA 3EPEA 4H1XA 2XXPA 3KOTA 1HSEA 4BDQA 3MP6A 3OSRA 4IGRA 2XXQA 3IO4A 3B6WA 1M5BA 4LATA 2DXYA 2GHAA 4GQOA 1MRPA 1PB7A 1FTJA 4LZ7A 4RPNA 3D4CA 3ZKLA 2ZYNA 5HM4B 1B4ZA 4UACA 4GIZA 4OZ9A 3IORA 1MDQA 1QUKA 3V8XB 4IY6A 4FE8A 1YCJA 4H5FA 3GZGA 3A3UA 3LSLA 4NWDA 5I2NB 3IB0A 1NH7A 2REJA 1LAGE 1DSNA 1IXGA 1UQWA 4Z0IA 5I56A 2V3TA 2FA7A 4M1VA 1QVSA 4ESXA 4Q5TA 1B3GA 2I58A 5H8NA 3C4MA 4L17A 5CMBA 3T93B 3O6IA 3H06B 2O68A 5H8QA 5CMKA 3SEUA 5AA1A 3TCGA 1SD3A 5I57A 1XT8A 4GL0A 1UIVA 1MQJA 1ZU0A 2IA4A 3BKIB 4H0WA 2G93A 2H9BA 3VXCA 4IO3A 3OELA 3N94A 1VR5A 4YMAA 5KDTB 4GOTA 2XHDA 3MVYA 1A40A 4U21A 2V84A 2Z22A 4PFTA 4PFWA 4EDPA 4OTEA 1PB9A 4X48A 4OFOA 3PPQA 4F3GA 4THIA 4RK2A 1RKMA 4I8CA 4XTCQ 4JWOA 3LUYA 3MZBA 3TKDA 4G77A 1MG1A 1LSTA 3N5LA 1ELJA 4N13A 4MH5A 4YAHX 1PDAA 4F39A 2Y7KA 2Q88A 3S9MC 2FNCA 3IL1B 4N6PA 4IGTA 4OMBA 4GXAA 3PV0E 4LZ8A 1TWYA 3UGWA 3HSTA 4WEPA 3T9HB 1B3HA 4G68A 4LUBA 3IOUA 3O97A 3KGCA 2ALUA 3LSFB 3O2AA 4OFJA 3K01A 5J1DA 4FORA 3C35A 1UTBA 3SEVA 1MY0A 1SVXB 3MBPA 4Q8RA 4H8IA 4BDLA 3K1MA 5I58A 4G8MA 2ZNUA 3K6VA 3PUYE 4IO6A 5TP9B 1B0LA 1QW0A 4F3PA 2D21A 4GL8A 2XXWA 5AA3A 3CSBA 1Z7NE 3RLFE 1P1WA 5A5XB 5FHOA 5AA2D 4NF5B 2V3UA 4NMYA 5L8DA 3PPRA 1UTHB 5DEXA 3VVFA 1R1NA 4OERA 2RKMA 5DYHA 1S7YA 5B7DA 4H67A 4GF8A 1XC1A 3SEYA 3MPLA 3IK6B 1FQFA 4R6HA 4X9TA 1DMBA 3M3FA 3VLUA 1TT1A 4G8NA 3KSXA 4GLIA 5BWJA 3BFTA 2DSFA 5TPAA 4DXCA 2O6AA 4PETA 2PBWA 5FHNA 1O64A 1USYH 4QRZA 1QUIA 3EHUA 2F35A 3OO6A 3MW0A 5CM6A 1B7ZA 1VFDA 4KQPA 4O3BA 2XXYA 3SESA 4ELQA 1ANFA 2THIA 1LGBC 2Z8FA 4KFQA 3LBSA 2IEEA 1MQGA 2PYYA 5I2KB 1B4HA 2H4IA 1B3FA 4JB7A 4ZE9A 5CI5A 3MVZA 3UORA 3BBRA 1S50A 1SYHA 4PQJA 3FV2A 4EXKA 1LCFA 4ELPA 2F8DA 1N7WA 3F11A 3THIA 4QSDA 3B6TA 3FVKA 1SI1A 1FQCA 1OVBA 3A09A 1R9QA 5JEIA 1SDXA 3VV5A 3UP9A 5DVJA 5KCJB 2VGQA 1ZMGA 4E0WA 2Y7IA 3T9VA 3MWBA 4KD5A 2OJTA 2FYIA 1B9JA 3PD8A 1URGA 1DPPA 5H8SA 3PD9A 4OETA 1I6AA 3SEWA 4DCYA 3MUQA 2OZZA 3RNNA 3SKPA 1MPCA 2AYSA 3UN6A 2QS3A 2NOOA 2QPQA 3ZS6A 4F29A 1O63A 5AE4A 1OQHA 4NF6B 4LONB 3DELB 4I9DA 5EHSA 2XXHA 3LSXA 2ABHA 1OIBA 5CRYA 1OQGA 4QFLA 2HAUA 4LVQA 2ZYKA 4YMBA 1Z7ME 3KG2A 3EN3A 2XXTA 2RC9A 1IQ7A 1WDNA 3MP8A 4LZ5A 1P1UA 3IOWA 4H8JA 4GRKA 1N3WA 4OXVA 3RQTA 4IO7A 3R26A 4P0IA 1HSLA 2H99A 5EHMA 4I62A 2HZKA 4FAJA 2HAVA 4BDOA 5EYFA 3ZKKA 4Q0CA 1NNPA 3IB1A 2PT1A 3E9XA 1LBBA 4Q30B 1A54A 4DXBA 4KYEA 4RK9A 1JNFA 2LAOA 3G3FA 1H43A 1RYOA 3FGSA 1OMPA 1NNKA 3TCHA 1I6QA 2Q2CA 3RT6B 3RY3A 3N6UA 3HN0A 4F31B 5I2NA 1RYXA 4LQ5A 1LAFE 3ILTB 3U8QA 1H3DA 2HQ0A 3MP1A 3MZ1A 5AA4A 3TFLA 1ZLQA 1BIYA 3Q26A 1N84A 3D4GA 4YB6A 3N26A 3O28A 4KCDA 4AB5A 1P1OA 4AB6A 3OXNA 2ANJA 1H45A 2ZNSA 2DWJA 2RC7A 4F3SA 3QIMA 3M8UA 4OESA 3PUXE 4DZ1A 3U92A 1GGGA 3TUSA 3IOTA 1Y3NA 2ZYMA 5KDTA 1GV8A 1FTLA 2A5TB 5H8FB 2DVZA 2I6EA 1VFEA 3MVWA 5IKBA 4EF2A 3N6TA 2V93A 1ZJLA 2I3VA 2QMWA 4U4XA 1BLFA 1A99A 3G3IA 1Y4TA 2DP8A 5BUUA 3DLNA 2ESNA 4H65A 3K00A 3KBRA 3JYRA 2ONRA 2I49A 2CZLA 3OSQA 2B3FA 1AMFA 3FD3A 3G3JA 3ILUB 3M3LA 1B1XA 4KCCA 3C31A 3WAEA 1JW5A 3V83A 4IB2A 1QKBA 2XXUA 1XS5A 1LB9A 3AXFA 3K02A 5HPQA 2W7YA 1SW4A 4N07A 2DWIA 3TPAA 2ZMBA 3GXAA 1ZTYA 4KI0E 2QS4A 2PVUA 4RJZA 3TCFA 1B05A 3FJMA 3H4ZA 3OENA 3QXMA 3DP6A 4F18A 1WVJA 4YKKA 2VD2A 3KOSA 3QSLA 3VLVA 1GVCA 1YPNA 1D9VA 4HCWA 1JEVA 4R74A 3T22A 4F1UA 1ZKBA 4OHNA 5TP9A 2UVIA 3G3GA 4PE5B 2F36A 3EHTA 1LBCA 3TTLA 3S4UA 3PMWA 3W15C 1PB8A 1Y20A 4F1VA 5A5XA 4ISUA 4C1TA 4KHZE 2PMSA 2WKYA 3K1PA 4NF5A 1UTHA 4IO4A 2DWHA 1XVYA 5LOMA 3RT8A 4R9GA 3KFMA 2DS9A 4QFOA 1NMUA 3UK4A 5H8HB 1BTJA 3FZVA 4R6KA 1NNTA 2E0SA 1QJMA 4NF8B 1AOVA 1SW5A 2BJJX 2QRYA 5ITOA 4HW8A 4ZZEA 3OMBA 1S9TA 4NF4B 4PFUA 2CMOA 4M4GA 4YICA 3VDFA 2GHBA 3PUWE 4LP2B 1POTA 1EZ9A 5H8QB 2R71A 3PPOA 4DCXA 5I2KA 4DXUA 4G8HA 3FXUA 4MFIA 3B7DA 2XX9A 1FTMA 2RCAA 1JVYA 2E1SA 3TQLA 4C1UA 4XKNA 3H7MA 3CSGA 4YB7A 1IITA 1D3KA 4EUOA 2AL5A 3O6GA 3IJXB 5K2XA 2KLFA 4TQUQ 5KCJA 4FEBA 1IXIA 1PC3A 3SEXA 3S9EA 1B1HA 2O7UA 3OOAA 2OK2A 4KPTA 3IOVA 3IJOB 3CR9A 4ELOA 3H6WA 4POXA 3JZJA 3H03A 2XX7A 1B51A 4EQBA 1DTGA 4R75A 3CI8A 3CFLA 2OWSA 3RTWB 3G7WA 4HCYA 3K0VA 4FIMA 4XKPA 1MDP1 2DE2A 2PT2A 2QL3A 3FASA 4NF6A 1URSA 4FATA 1IXCA 3I5OA 2NUVA 3T9UA 3DP4A 2ZNTA 1Q1KA 4ECFA 2F7AA 1VE4A 3RPWA 4MBPA 4OYVA 3IR1A 2Q9TA 1UTBB 4GD5A 4DLDA 2QS2A 3EHSA 1KWHA 4U2RA 2QSXA 1N76A 2F78A 3FV1A 4YB5A 2I4CA 4OFLA 4OENA 4I1DA 5CC2A 3H6UA 1M5EA 4XKQA 1MM6A 5ISUA 4ZDMA 5M2VA 2G29A 3A3CA 1N7XA 4U22A 4P0GA 5B70A 1SYIA 5DEXB 1J1NA 3MVXA 3W9VA 3PUZE 3TYHA 4FEDA 1Y1ZA 1B2HA 1Q35A 1BKAA 1NNFA 4QFKA 2YJPA 4O3CA 4F1YA 2DQVA 1FTKA 3LR1A 1FW0A 4POWA 2OBGA 3SERA 1R6ZA 2NWJA 3KN3A 2QS1A 3E4RA 1O7TA 3KJ7A 5DVFA 3TTMA 1AH5A 3VVDA 4OVJA 5CBSA 1FQBA 1WODA 1YTVA 3VFJA 1AL3A 3KZGA 1SBPA 2QJEA 1B6HA 4ZS9A 4NWCA 1OLCA 3T96B 5FTHA 1MXZA 3K6XA 3CFZA 3OO8A 4G4PA 3VLWA 1URDA 4LQ2A 2A5TA 3TAJA 4DE8A 4EF1A 1PBPA 3V5AA 1B5JA 3O9PA 1IIWA 5IAIA 2H5YA 3FJ7A 3LSWA 1B7HA 2O7IA 2UVHA 2DWAA 4QFPA 3K6WA 1B3LA 3HHGA 2OWTA 5AA2B 4NEDA 4RA1A 1FCKA 5FTIA 1B7UA 2P1SA 5I59B 4BLAA 3SDFA 3IX1A 3TODA 3QAXA 3PPPA 3Q25A 4BDNA 4ZECA 4JWYA 2I0CA 2F5XA 2AIXA 3FXQA 4E0XA 1IZ1A 1USYE 3K4UA 1LB8A 1B0HA 3O66A 4OEVA 3CIJA 3TTNA 3GLBA 3K6UA 2V25A 2Z8DA 5DT6A 4LA9A 4ZEIA 3RTFB 4F22A 3RGYA 1ZIUA 3C9HA 3VXBA 1MXYA 2O69A 1NKXA 1TFDA 2H25A 1Y9UA 5ICTA 4ZEFA 2P2AA 4F2OA 2F6GA 4U4SA 3TMGA 4XXUA 3I3VA 3TTKA 3MPKA 2ZYOA 1H44A 3K1NA 2OLBA 4X1BA 3GBBA 2GRVA 2RC8A 4WKMA 3C33A 1MS7A 1FQDA 1XHYA 4ZE8A 1T0KA 4XKRA 3C34A 5ELVA 1P1QA 2PX1A 2XX8A 4ONYA 3HCQA 1NL5A 4QSEA 5CMCA 1JW1A 1Y3QA 3FXRA 3I6VA 3USDA 1TXFA 2V3QA 5L9MA 2D3IA 2I0BA 4HS7A 4WEDA 1B3EA 2OCUA 1LAHE 5JTYB 4F19A 2Q8JA 4JXIA 3MC2A 1B32A 1CB6A 3H6VA 3R7XA 2HCAA 2X26A 1A8EA 3G3KA 4XIGQ 5H8HA 3TDJA 5L9OA 3SETA 4OWDA 4NF8A 2X7PA 4H6DA 5JK4A 1B5HA 3ONMA 5AA4B 2UXAA 2VP1A 4NF4A 1UIUA 5HBCA 1LFGA 3FVNA 1JVXA 3UIFA 3PMVA 4RYAA 1SI0A 4R72A 5ITPA 2HFBA 1DPEA 3R6UA 4QFNA 3FATA 1IEJA 3E13X 4QSCA 3W9WA 1M5DA 3MQ9A 4RY1A 3U94A 2XD3A 3ODBA 5DVIA 1B46A 3PUVE 4ZEDA 1ATGA 2F7CA 1OLAA 1LCTA 4F3BA 3T9XB 1D4NA 1Y3PA 1N04A 3BFUA 4JBZA 4MLQA 4PP0A 1FTOA 2RF1A 3EF7A 1QUJA 4KR5A 4TOZA 1JEUA 1P99A 3U1OA 2ONKE 2Q89A 4GVOA 4ZZAA 3CRBA 3H6TA 1B52A 2UYFA 1MH3A 2F34A 4NTLA 2Z23A 2X7QA 2VHAA 1NFTA 4R73A 1VSOA 2O1MA 4PFYA 4KYDA 3G3HA 4KYSA 2UYEA 1N3XA 5I56B 4EQ9A 1POY1 1A7LA 3QYTA 2GH9A 3S9NC 1I69A 3HPIA 1II5A 4EXLA 2UVGA 3P7IA 3O6HA 4UA8A 4C0RA 5H8NB 2RCBA 2AL4A 1GTKA 3K2DA 3FVOA 1MXUA 3ZSFA 3PGFA 5F1QA 3RUMA 2HEUA 4QF9A 5I57B 4JSDA 2HXWA 3IAZA 1MXVA 1L5TA 2REGA 4Z7EA 1EZOA 1OVTA 3MZ9A 4OEUA 4JSOA 4R2FA 2QMXA 1B40A 4TLLB 1QULA 4R9FA 3TEPA 1PEBA 2RINA 5I84A 1LAXA 3EQ1A 3L6HA 3HO7A 2HZLA 1P1NA 4JDFA 3FUZA 2F97A 4U1OA 1IUDA 1TFAA 1FQEA 3VE1B 1A55A 1CE2A 5CBRA 5KZTA 2NVUB 2YLNA 3U72A 1N0TA 4RXLA 4ESWA 3V89B 3B6QA 3KSJA 4R6YA 1EZPA 3MAMA 3OEKA 4GXSB 1MY1A 1MPDA 2B65A 3Q29A 1SW1A 3IO6A 1GR2A 1MQDA 3OO7A 1QKAA 1MY4A 1XOCA 4FECA 4YU0A 4G68B 2Y84A 3IB2A 2ZXTA 1JETA 3RN8A 2Y7WA 4H5GA 1H76A 3HHFA 1EU8A 3OD7A 2XD2A 3L6GA 1I6BA 3CVGA 4DIGA 3PU5A 2XXVA 1US4A 1MXWA 4JWXA 1MM7A 5FHMA 4WXJA 1MQHA 2NXOA 5I58B 3QUFA 3DP8A 2DE4A 1YAEA 3TELA 4MLVA 4FJPA 2DYXA 1MPBA 2R9JA 3QK6A 3FJGA 4ZEBA 2UVJA 1M5CA 2A5SA 2M8CA 4G2ZA 3Q27A 4P11A 1IXHA 5AA2A 2D5WA 2O1LA 5L9SA 2P0SA 3MJNA 5I59A 2I3WA 2R6GE 3HV1A 4X1DA 1SW2A 1MY3A 5TPAB 2I4BA 2Z8EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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