1A54A

Phosphate-binding protein mutant a197c labelled with a coumarin fluorophore and bound to dihydrogenphosphate ion
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYCYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal structure of phosphate binding protein labeled with a coumarin fluorophore, a probe for inorganic phosphate.
pubmed doi rcsb
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
total genus 110
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-02-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a54A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a54A02
2QS2A 2F7AA 5I84A 5BUUA 4NF8B 3SEXA 4ZEFA 5I2NB 3TCFA 2ZXTA 4OQOA 2H25A 4LONB 1ZU0A 1BP5A 1B3EA 3Q27A 4QSCA 3MZ9A 3ECRA 5AA4A 4EXKA 3MP6A 3TYHA 5AA2D 2GH9A 4RXLA 3H4ZA 2FA7A 1MQGA 3KOTA 1Y1ZA 3T66A 1LAFE 3B6QA 1A55A 3H6VA 1LB8A 1TFAA 4IGRA 5DYHA 3TELA 3OEKA 5DTBA 1KWHA 2WKYA 1VFEA 1R6ZA 3KN7A 3TCGA 4F3PA 1EZ9A 3U8QA 1RYOA 5CMBA 4R6KA 1B5HA 4NF6B 4YU0A 1QKAA 5JTYB 5KCJB 1QVSA 4KPTA 4ELPA 3K6XA 5K2XA 1M5BA 1M5FA 2Q89A 1YPNA 1Z7ME 3DP8A 1EU8A 5L9SA 4FJPA 1B7ZA 3FGSA 3IL1B 5I58B 3S9NC 2OZZA 1OQGA 4XKQA 5HPQA 5I56B 4F19A 1MQIA 3KGCA 4GLIA 1JW5A 2QSXA 4OYVA 1M5DA 1HSJA 4GRKA 2OK2A 1SYIA 3IJOB 4NF4A 1URGA 1JVYA 1USYE 4QSEA 4IY5A 5H8NA 3TTRA 2F36A 3DM0A 1S9TA 5TPAB 4RK9A 3AXFA 5BWJA 3LUYA 2BJJX 3B7DA 3IR1A 4Z7EA 4BDNA 3CVGA 3RQTA 2XXYA 1ZMGA 2ZNTA 3CI8A 1N7WA 3K6WA 1B1XA 3S4UA 3PGFA 4ISUA 1MY2A 2HZKA 1P1UA 1QUJA 1MM7A 3PUYE 1T0KA 3PMXA 2DVCA 1US5A 3FIRA 4F2OA 3K2DA 2XXPA 4YKKA 4ZS9A 1Y3PA 4LP2B 3T9UA 1MPCA 3OEMA 5KDTA 2E0SA 3ONMA 4YZZA 5FTIA 4G8MA 3UORA 1SW2A 1LGBC 2X7PA 3MPLA 4KHZE 3O6GA 2H9BA 1UQWA 2ZNUA 3Q29A 2PBWA 4F3SA 3HSTA 4FEDA 1MXYA 3THIA 4NF4B 4F3GA 3G7WA 3D4GA 1SDXA 4WEDA 1BLFA 2PX1A 3LC8A 4ONYA 5H8NB 3OO9A 1OLAA 2D5WA 4YMBA 4NTLA 1UTHA 1USYH 3JYRA 4IY6A 4ECFA 2XX9A 5ITPA 1YAEA 2VHAA 3B6WA 3SEVA 1N3WA 1H76A 3IAZA 1S7YA 3FASA 4GOTA 2I3VA 2VD3A 4I9DA 2XXRA 3DLNA 4G4PA 3TTKA 4NMYA 4JBZA 1NH7A 1LFIA 3KBRA 5HBCA 3L6GA 5ICQA 4F2QA 1DTZA 2X26A 3FJ7A 5CMCA 4FE8A 1Y1MA 3KJTA 1NFTA 4R6HA 1AIVA 3VLUA 3HPIA 3OSQA 3ODBA 4OFLA 3FZVA 3PPNA 1Y20A 2O1LA 4PE5B 4X9TA 1SYHA 1B7UA 4GWOA 4EDPA 4H1XA 4HTGA 5FTHA 5EYFA 1R1NA 2DQVA 2DE2A 1B1HA 4OENA 2ALUA 3H7MA 1UTHB 1XVYA 4PETA 3KG2A 5H8SA 2QS4A 4ZEIA 1B9JA 1MDP1 2CMOA 1OMPA 4OWDA 3C9HA 3KN3A 3C32A 1NNFA 4OERA 4XTCQ 5DVJA 5I2KA 4H6DA 4LZ8A 1JVXA 1JQFA 3V5AA 3K6UA 4HW8A 3RTFB 3A3CA 4DDDA 1B7HA 2F6GA 3JZJA 1NNTA 3OO8A 1Z7NE 1AL3A 4ELOA 4R72A 4H5GA 4Q8RA 4PFYA 3PUXE 2ZYMA 2Y7PA 3BKIB 2DS9A 2F6PA 1YTVA 2ONSA 2V84A 3ZKLA 1S50A 3BFTA 1B3HA 3OMBA 3OELA 2XXXA 3RT6B 3HCQA 1SVXB 1B05A 2Z22A 4LUBA 4C1TA 3FATA 4ZE9A 3VFJA 1SW5A 4OEUA 1B6HA 1JNFA 3VVFA 1N84A 3FXUA 3MP8A 4UACA 4DXCA 1LLSA 5DEXA 1FCKA 3RPWA 3MAMA 1OIBA 2UYFA 4BDOA 1GGGA 5L8DA 2H5YA 3VVDA 1TFDA 3IOTA 3M3LA 4IO4A 1MY4A 4KCDA 3H6UA 2FYIA 3G3HA 3Q28A 1PBPA 1FTOA 3TEPA 1LFHA 3H6TA 1IQ7A 3L6HA 3U94A 3MZBA 3PPOA 2DYXA 4QFLA 4I1DA 1DPPA 4GD5A 5DVFA 4TOZA 1BIYA 3BFUA 3V89B 4GIZA 2DWIA 4LQ2A 4MF3A 3K01A 1QKBA 4POWA 3VLWA 3K02A 4OETA 2ZYOA 3T96B 4WEPA 1XC1A 1Y3NA 2PVUA 4WKMA 1PC3A 4F22A 1EZOA 1NMUA 3EHSA 2RF1A 4DE8A 5B7DA 2Q8JA 2F34A 4IO2A 1MXZA 3HHGA 3LSWA 1II5A 3UA8A 5J1DA 1FQAA 1JEUA 3QK6A 1ANFA 4Q0CA 5DEXB 1IXCA 3E13X 4FEBA 4GXAA 3C34A 3LBSA 3RN8A 1ZLQA 1I6QA 3CIJA 4TQUQ 3CFZA 3M8UA 1MXUA 3HN0A 2F8DA 1SD3A 3ZKKA 3SERA 2HFBA 1M5EA 1LB9A 4F1YA 3RTWB 4X48A 1JEVA 4FORA 1SI1A 3QIMA 4M1VA 4ZDMA 1HSEA 4F1VA 4ZEKA 2AL4A 1LAGE 3VE1B 5I59B 4HCWA 2IA4A 1LAXA 4JSOA 1EH3A 1FTLA 3EPEA 4QFKA 5I57A 5ICTA 4NE4A 2B3FA 2KLFA 3IX1A 4QFNA 1OVTA 3MP1A 3EF7A 4P11A 4DXUA 4R6YA 4R75A 1A99A 1MXWA 4YB5A 5AA2B 2GHAA 4AB6A 5H8QA 2Q9TA 2B3BA 2Y84A 3TTLA 3FV1A 2F78A 3E4RA 2DP8A 2E1SA 3PPQA 1FQEA 4FAJA 3TQWA 4NWDA 4KYDA 4IB2A 1FTJA 4BDQA 1N04A 3PU5A 3SKPA 5JEIA 2REJA 5AA4B 4DIGA 1QJMA 1B3GA 4LZ7A 2O51A 3S9LC 2A5TA 5CMKA 2GHBA 2F35A 4NF5A 3IB2A 2UVHA 3U1OA 3R6UA 5KZTA 3O29A 3F11A 1NL5A 4ELRA 3N6TA 3FVKA 1FQCA 4GFRA 1MY3A 3MVWA 1IZ1A 2ONRA 4U4XA 4FECA 3T93B 1CB6A 4ZZEA 1M5CA 1XHYA 4YICA 3V8XB 3K00A 5A5XA 2O68A 1I6AA 3CFLA 2RKMA 3OOAA 3RNNA 4QFOA 3T9HB 3JV9A 1H45A 2I58A 4DLDA 1NNPA 4R73A 4IGTA 3KEIA 1A8EA 3KFMA 1Y4CA 1WODA 1MS7A 5H8QB 4F1UA 2AL5A 1UIVA 1ELJA 4LZ5A 2XD3A 3PMVA 1ZJLA 1I6BA 2Y7IA 4XKNA 4IO6A 3E9XA 3FD3A 4R9FA 2XXIA 1H43A 4OXVA 3BBRA 4ELQA 3PD9A 3PPRA 4RYAA 2Z23A 1DSNA 1FQDA 2QMXA 4I8CA 2A5SA 1RYXA 4QFPA 3N6UA 3KN8A 3CRBA 4NEDA 1LBBA 4JWXA 4X1BA 4G68A 3SEYA 2A5TB 1IXHA 3ZS6A 1VR5A 5IKBA 1I69A 4HCYA 4H0WA 3B6TA 1IUDA 1P1QA 1PB7A 2UVIA 4JWYA 5AA1A 3R26A 3IO6A 3CG3A 2DWHA 3SEWA 4N13A 5A5XB 1ZBMA 3IJXB 2O69A 1FTKA 2Q2CA 3TCHA 3T9XB 2PYYA 3IK6B 3MQ9A 5KDTB 2O7IA 3N26A 3TMGA 1FQFA 3FVOA 3I6VA 1DOTA 1QUIA 3G3JA 2Z8DA 5CI5A 4OMBA 1SBPA 4KD5A 1N76A 1Y9UA 2Q2AA 5L9OA 3GZGA 2RCBA 4YKJA 3UP9A 1MH4A 2V3TA 1GVCA 2OLBA 1XVXA 4GVOA 2F97A 3EHUA 2O1MA 1VSOA 1SI0A 1HSLA 4XIGQ 2VP1A 4GF8A 4L17A 1MXVA 3T9VA 2V3QA 1IEJA 1FQBA 2XHDA 2I0BA 5EHSA 1B51A 4ESWA 1B4ZA 1ZIUA 2DE4A 2I4CA 2H4IA 4POXA 5AE4A 3TTMA 4KQPA 1TWYA 1UTBA 4MH5A 2AYSA 1CE2A 1IXIA 4THIA 5TU0A 2I3WA 4N6PA 3OENA 2RCAA 3TFLA 3TAJA 2REGA 4BDMA 1MXXA 4KYEA 2UVGA 3CSGA 4G8NA 4H8IA 4EF1A 3IOWA 1OLCA 4H67A 2RINA 3IOVA 1FTMA 2V93A 2X7QA 4F18A 3WAEA 3EN3A 4YB6A 3KZGA 1MPDA 1PB9A 1XS5A 2QRYA 2F5XA 3K1NA 4XKRA 4YKPA 4DCXA 4RK2A 3M3KA 3D4CA 2ANJA 4MLVA 3MPKA 3RLFE 1MRPA 3QXMA 2IEEA 1B0LA 1MDQA 3SEUA 1AOVA 3CG1A 1P99A 4RA1A 3Q26A 4RPNA 4GXSB 3N5LA 2P2AA 3OSRA 3Q25A 4NF8A 2UVJA 2G29A 4OTEA 1B0HA 5I2KB 3KOSA 1H44A 3O6IA 3PPPA 4BDLA 4YMAA 4U22A 3PV0E 1MPBA 3MVZA 3VXCA 1TT1A 1PB8A 1UTBB 4R9GA 4ESXA 3K0VA 1WDNA 5LOMA 3TODA 2XXQA 4JB7A 4N07A 1XT8A 5CC2A 2DSFA 3W9VA 2Z8EA 3S2VA 1POY1 2ESNA 4KCCA 1P1OA 3T22A 3EHTA 4I62A 3CSBA 3ILUB 1GV8A 4ZE8A 3MVXA 1YCJA 4NF6A 4F3BA 2HXWA 1PEBA 5JTYA 5KCJA 1JETA 1XOCA 4C1UA 1O7TA 4YB7A 3H6WA 4RJZA 2ABHA 1H3DA 3K1MA 2V3UA 1OQHA 2XXUA 1OVBA 2R71A 4QF9A 1MH3A 4U2RA 5I56A 1D4NA 1MM6A 2QS3A 3OD7A 3VV5A 3E3KA 1LFGA 2RC9A 1LBCA 1IXGA 4ZEDA 2VOZA 2NOOA 3UIFA 2GFEA 1IITA 2Y7KA 3MW0A 3VDFA 5HM4B 3FVNA 4JSDA 3RGYA 4F39A 3QUJA 1MQDA 3TPAA 1F9BA 1O64A 4PFWA 2XXHA 3C33A 5CRYA 5TPAA 3GBAA 2XXTA 3G3FA 3O9PA 1SW4A 3H06B 4YAHX 1O63A 4F31B 4OZ9A 2R9JA 3HV1A 4AB5A 2UXAA 4GL8A 4O3AA 2M8CA 3MJNA 1FW0A 1LSTA 5CBRA 1EZPA 4H8JA 2DXRA 2QJEA 4ZEBA 4KFQA 1MQHA 2DOJA 4DCYA 1NNKA 2XXWA 3KJ7A 3C4MA 3RUMA 4C0RA 2XD2A 3PD8A 1RKMA 3C31A 3LSFB 3GXAA 4KYSA 4XXUA 2Y7RA 1UIUA 4QSDA 4OHNA 4GQOA 1B3LA 3TDJA 4RY1A 1QW0A 4TLMB 3QUFA 3MWBA 2VGQA 3HHFA 4H5FA 1JW1A 3CFXA 5ISUA 3W15C 3P7IA 4PFUA 5B70A 4QHQA 4BDRA 3G3KA 4AQ4A 5ITOA 5EHMA 4R74A 4MFIA 2HQ0A 2I48A 2NVUB 2FNCA 4MLQA 3O2AA 3TUSA 1GR2A 4DZ1A 1B2HA 1LCFA 4PFTA 5I57B 2HEUA 3FVGA 4ZECA 3HO7A 4H65A 4JDFA 1DTGA 2I0CA 4U21A 2Q88A 4NWCA 1JW4A 3FXRA 4P0GA 1IIWA 2ONKE 3G3IA 1LAHE 3TQLA 2RC8A 1PDAA 1B46A 3V83A 3DELB 4WXJA 3LR1A 1J1NA 4PP0A 1D9YA 2GRVA 2F7BA 1B52A 2HAVA 4U1ZA 1QULA 2DXYA 3G3GA 2CZLA 2VD2A 4LATA 2I4BA 3QSLA 5L9MA 2QMWA 3R7XA 2YJPA 5H8FA 2PMSA 4RNSA 2O6AA 3I5OA 5CM6A 2I49A 4DXBA 2QPQA 4OFOA 2D3IA 4NF5B 3M3FA 3O6HA 2DE3A 2UYEA 4JWOA 3GBBA 4ZZAA 1MY1A 3WAFA 3UN6A 1A8FA 3GLBA 4QRZA 3SETA 1LCTA 3LSXA 4U1OA 5H8HA 1B4HA 4UA8A 1QUKA 2ZMBA 2G93A 5FHMA 3PUZE 2NUVA 3N94A 4JXIA 4F29A 1B3FA 4XKPA 1A54A 4Z0IA 3QYTA 5FHOA 4FATA 2PT1A 4MBPA 1L5TA 4PQJA 4LQ5A 5TP9A 2OBGA 2H98A 3OO6A 3A3UA 3VVEA 3ZSFA 4BLAA 4G68C 3EQ1A 3FXQA 4EQ7A 1US4A 2YLNA 4EXLA 4EQBA 1R9QA 3FV2A 1DMBA 2ZNSA 1MG1A 2DWAA 2HZLA 3OO7A 5AA3A 4OESA 3SDFA 3KSJA 2XX7A 3FJGA 3FJMA 3USDA 5H8FB 1SW1A 2OJTA 4X1DA 4LA9A 3K1PA 4Q5TA 1GTKA 1BKAA 4G68B 1D3KA 2OWSA 2Y7WA 3KSXA 3SESA 3QAXA 3ILTB 1P1WA 3U93A 4M4GA 4IO5A 4Q30B 1A7LA 3LSLA 4OVJA 2HCAA 4FIMA 2P0SA 2OWTA 1VFDA 2QS1A 1URSA 2HAUA 1Y4TA 1N3XA 2YPNA 4EQ9A 5DT6A 1PBQA 2W7YA 2DVZA 4O3BA 1AH5A 3RT8A 5H8HB 2AIXA 1A40A 1ZTYA 5CMMA 1N7XA 1URDA 3IORA 1P1NA 2QL3A 2XX8A 3DP6A 4EUOA 5M2VA 3C35A 1WVJA 2NXOA 4OFJA 4IO7A 4YKIA 5TP9B 2OCUA 2H99A 1POTA 1Q35A 2THIA 1Y3QA 1B40A 3TTNA 3H3GA 1BTJA 2ZYNA 5CBSA 4P0IA 1MY0A 5K2YA 1NKXA 2DWJA 1TXFA 2O7UA 4ND9A 3C36A 4O3CA 1VE4A 5ELVA 2D21A 3UGWA 2F7CA 2R6GE 5JK4A 3MVYA 1DPEA 3O66A 3VXBA 1MQJA 3U92A 2LAOA 3O28A 1SQYA 3CR9A 3MC2A 1Q1KA 3IOUA 5I2NA 1ZKBA 3PUVE 2RC7A 3OXNA 3TZAA 3A09A 4G8HA 4R2FA 4EF2A 5F1QA 4E0WA 4KR5A 3MUQA 4U23A 4KI0E 5DVIA 4R2BA 1N0TA 5IAIA 3MZ1A 1ATGA 3FUZA 2PT2A 3MBPA 3S9MC 3W9WA 3VLVA 1R9LA 3IO4A 1NH8A 1B5IA 2ZYKA 3K6VA 3I3VA 1AMFA 4TLLB 3S9EA 3UK4A 5F7VA 1D9VA 4G2ZA 4RPOA 5I59A 3TKDA 2Z8FA 3IB0A 2O84X 2I6EA 3O97A 4GL0A 2P1SA 2V25A 3H03A 1B58A 3PUWE 4E0XA 5I58A 4U4SA 3DP4A 1B5JA 4K3FA 2NWJA 2XXVA 3IB1A 4HS7A 3RY3A 5AA2A 4OEVA 1B32A 5FHNA 4IO3A 3PMWA 3U72A 3K4UA 4LVQA 4G77A 2B65A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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