1A54A

Phosphate-binding protein mutant a197c labelled with a coumarin fluorophore and bound to dihydrogenphosphate ion
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYCYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structure of phosphate binding protein labeled with a coumarin fluorophore, a probe for inorganic phosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
total genus 110
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-02-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a54A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a54A02
5FTIA 4Q5TA 4POXA 4H67A 4QF9A 5FTHA 1A55A 3IX1A 2PX1A 4OFJA 3BBRA 3G7WA 4ZZAA 3H3GA 4RNSA 3PMWA 1SDXA 2PBWA 3FATA 1B4ZA 1ZLQA 4RY1A 3Q27A 1OLCA 3HSTA 5CRYA 4GXAA 1NMUA 2M8CA 2B3BA 5I57B 1URGA 4AQ4A 1B52A 4OHNA 1S9TA 3TPAA 4MFIA 2DOJA 4NF4A 4QSDA 2F36A 4ZE8A 3OD7A 2A5TB 4O3CA 5CMKA 1QUIA 1UTHA 2DP8A 1IXHA 1LGBC 3VLUA 3O6GA 3ONMA 2PMSA 2NOOA 2XX9A 3FJMA 1I6BA 4OENA 2QMWA 2DWJA 3N6UA 3MJNA 3T9XB 3LSXA 1MQIA 2Q89A 5F1QA 3M3FA 4BDRA 1MM6A 2ZYNA 4KCCA 2B3FA 1H3DA 1SI0A 1B9JA 1LFHA 3JV9A 3MP1A 1JW4A 3EF7A 3IB2A 2XXPA 4ZEFA 1POY1 4FJPA 5AA4A 3FVGA 1N7WA 3H6UA 3EPEA 4OWDA 3FXRA 1HSLA 1EH3A 2REJA 5CC2A 4TQUQ 1PBPA 1MXVA 3HHGA 2LAOA 4F3SA 3KEIA 2I0BA 3QIMA 4F2QA 1FTKA 5L8DA 1B3LA 1MPCA 5BWJA 1Y4CA 3DELB 1OLAA 3L6HA 1S50A 3KOSA 3O28A 3K2DA 4YMBA 3TTKA 5AA2D 1I69A 3O9PA 1FTJA 4O3BA 2PT2A 3K6UA 1JVXA 4R9GA 4ZE9A 2D21A 5EHMA 3MVYA 5H8FB 5I56B 1Y3PA 5I84A 2ZYMA 3CR9A 3E13X 4U1OA 1MXZA 1US5A 2F97A 3OELA 2YPNA 4OYVA 3MP8A 5JTYA 4IY5A 2W7YA 3B6TA 2RCAA 4YICA 4Q30B 4P0GA 3UIFA 3HV1A 4KPTA 1B0HA 1XHYA 2XXWA 3SESA 2RCBA 3DP6A 4JWXA 4PP0A 1LAHE 2O6AA 2F7AA 5LOMA 5I2NB 1IZ1A 4GD5A 3DM0A 4ND9A 4F31B 3CI8A 5CM6A 3TQWA 3MZBA 1MQJA 2AYSA 1GTKA 1NNFA 3CG3A 3KN3A 4PFWA 1HSJA 2XXRA 2O1MA 2E0SA 4WKMA 4IO7A 4ESXA 3O66A 1LB8A 1LLSA 4G8HA 2I3VA 1ZIUA 5EYFA 4YZZA 4XKQA 4ZECA 2F5XA 3T66A 4U22A 3SEVA 4X1BA 4NF5B 1VFDA 3KBRA 2H4IA 5K2XA 3K00A 4Z7EA 4EDPA 4EQ7A 2XD2A 4R72A 1VR5A 2ONKE 1M5BA 2Q88A 3TCHA 3B6QA 1B5HA 1LFIA 4LA9A 3U1OA 3OSQA 4XKRA 2OWSA 4YKPA 3IOVA 2NXOA 4NF6B 2A5TA 3I5OA 2RC8A 4DXBA 3K6XA 2I49A 1HSEA 3SEUA 1N3WA 3KN8A 1MY2A 3O2AA 4EQ9A 3VVEA 1RYXA 5ICTA 4OQOA 2I4BA 5ICQA 1O63A 3RT6B 3S9NC 2ZNUA 1XOCA 2HZKA 1SQYA 3K1MA 4K3FA 5CMMA 1IITA 1QJMA 3SEYA 4YKJA 1JW5A 1R6ZA 1GGGA 5M2VA 2I48A 2O68A 3WAEA 5ITPA 3IJOB 3N5LA 2FYIA 4F1VA 4R6YA 1LAFE 1MY0A 1QW0A 4E0WA 5ISUA 1N3XA 4N07A 3EN3A 1M5FA 5AA2B 2OK2A 3THIA 3ZKKA 2VD3A 4QSCA 1UIUA 3Q29A 3IOUA 2DVCA 2Y7KA 1A7LA 4X48A 1IQ7A 2X7QA 4GFRA 4YB5A 1DMBA 3Q28A 1USYE 4LQ2A 2GFEA 3RN8A 3K02A 4EXLA 3PPRA 3U92A 1PB9A 4RA1A 5DEXB 4BDQA 2V3QA 3IB1A 4DLDA 5I56A 3GLBA 4IO5A 1WODA 3A3CA 1FQEA 1XS5A 1CE2A 2O7IA 2Y84A 3TYHA 5FHOA 5KDTA 1AIVA 1IXCA 3TTMA 1Y4TA 3PGFA 3MZ1A 1MQHA 4PFTA 4KI0E 3CFLA 3RLFE 3O29A 1H45A 3ILTB 2QMXA 5H8HA 4JDFA 3FVNA 1POTA 2R6GE 5BUUA 1EZOA 3HPIA 1B4HA 4F29A 4EXKA 2WKYA 3N26A 3TTLA 1FTOA 3OMBA 1LB9A 3C9HA 2F8DA 4YAHX 3K6VA 3LR1A 4X9TA 1FCKA 4ZZEA 4F3GA 3M8UA 5F7VA 2OBGA 2RF1A 3MPLA 3PD9A 4E0XA 5H8SA 4Q0CA 2HXWA 3CG1A 2XXQA 4R6KA 2F7CA 3TZAA 4JSDA 1B58A 3PV0E 1B3HA 4JSOA 3G3FA 4TOZA 1LFGA 4LZ8A 1VE4A 5AA3A 4ZEKA 4R74A 1II5A 3T9HB 2CZLA 3V89B 4UACA 1N7XA 1QUKA 4KQPA 2Q2AA 1PB7A 2ZNTA 3TDJA 3MQ9A 4DCXA 2V93A 4NWDA 5DVIA 1MM7A 5K2YA 3KSJA 1ZU0A 1F9BA 1OQHA 1B1HA 3MVWA 4IO6A 4XKNA 4Q8RA 1TFDA 4NEDA 3VVFA 3GXAA 3W9WA 1TFAA 5FHNA 3VFJA 1B51A 4ZEDA 2V3TA 4RPOA 3FIRA 3IK6B 1QULA 5H8NA 3IO4A 1B0LA 1UQWA 4YKIA 2DE4A 3E3KA 3OSRA 3D4GA 2GHAA 3GZGA 2XXIA 2VOZA 3MPKA 5H8QB 4U21A 3BKIB 3MVZA 4RXLA 4AB6A 1XVXA 2UVGA 3SDFA 4C1TA 3ZS6A 2I3WA 3CSBA 2XXVA 3UP9A 4U2RA 4M4GA 5FHMA 4RK2A 1IEJA 1SW4A 2ZXTA 1NKXA 3RPWA 3V5AA 1MS7A 2QJEA 1IIWA 3WAFA 4H5GA 2Y7PA 4NF8A 3MP6A 4OMBA 2OWTA 4FEBA 3DLNA 2OLBA 4JWYA 4WXJA 5AA2A 2Z8EA 2Y7WA 4MBPA 1LCFA 1ELJA 4XXUA 4HCYA 5A5XB 4DE8A 5HBCA 4MF3A 3G3HA 1D4NA 1B7UA 1UIVA 3N94A 5JEIA 5DTBA 3R26A 1P99A 4G68B 4ONYA 2XXUA 3TAJA 5B7DA 4H8JA 4OETA 1UTBB 5DEXA 5CBRA 5CBSA 4F19A 1R9QA 2DSFA 4FEDA 3CFXA 4G4PA 3M3LA 1B3FA 4GWOA 3LC8A 1Y3QA 2QL3A 4F39A 4OESA 2FA7A 4HTGA 1USYH 1NH7A 3K1NA 1SW5A 1FTLA 1JQFA 4G68C 1OIBA 3K0VA 3C4MA 3RY3A 5KCJB 2R71A 2YJPA 3EHUA 4OEUA 4GVOA 4RK9A 3TCFA 1BKAA 1Y9UA 3I6VA 3MC2A 1LBBA 5HM4B 1SD3A 3UGWA 3QUFA 5TPAB 2B65A 3KGCA 1JEVA 3O97A 3SKPA 1NH8A 5L9MA 3H6WA 3QXMA 3HO7A 2NUVA 4U1ZA 1FW0A 4YKKA 3VXCA 3Q26A 3TODA 1ATGA 2UVIA 3ODBA 4ZDMA 3Q25A 2P1SA 2ONSA 4C0RA 1US4A 4JBZA 5I2KB 4IO2A 4RPNA 1FQCA 2F34A 1B2HA 2DE2A 4O3AA 1MY4A 3QK6A 2HAUA 3TUSA 3UA8A 4F1UA 3U72A 5IKBA 4OFOA 4KFQA 5I59B 4NE4A 1I6AA 1YAEA 4BDMA 4LZ7A 4IY6A 3H6VA 5TP9B 4XIGQ 5I57A 4R9FA 4IGRA 4N6PA 2OCUA 2O69A 1PEBA 3FXQA 1J1NA 5EHSA 4ZEBA 1Y1MA 3LSFB 4PE5B 3VLVA 4QFPA 4NF4B 3SEXA 3KOTA 2OJTA 2Z22A 4IGTA 1EU8A 4PFYA 2Q9TA 2RC7A 1DPPA 3MBPA 1DTGA 2X7PA 3RT8A 1MH3A 1Q35A 1P1WA 1YPNA 4I1DA 1FTMA 1PBQA 1UTHB 4YB6A 1BP5A 4OZ9A 4NMYA 3W15C 3ILUB 4EF1A 4IO4A 3O6HA 1BIYA 1MQDA 1Z7ME 4H6DA 1B46A 3QUJA 1GV8A 3S9EA 4NTLA 4GL0A 4YU0A 3P7IA 2HFBA 3PD8A 2DVZA 4QHQA 2QRYA 3R7XA 4DDDA 4Z0IA 3S4UA 2KLFA 3HCQA 1B6HA 3KFMA 1TWYA 3C32A 4FATA 1B5IA 1MY1A 1MXUA 3CVGA 2ESNA 5AA4B 4QFNA 4ISUA 1B7HA 3IJXB 4I8CA 1LAXA 1FQBA 4LQ5A 3VDFA 1SBPA 4KHZE 4XTCQ 3CFZA 2PVUA 1NFTA 2HQ0A 3B6WA 4U4XA 1LAGE 5DVFA 2FNCA 4KR5A 2PYYA 1GVCA 1B1XA 4RYAA 4F18A 2IEEA 2V25A 5H8FA 1M5EA 4OEVA 2YLNA 1MPBA 3FXUA 3OEKA 4G8NA 3EHSA 3C34A 3VVDA 1M5DA 2G93A 3PPOA 5B70A 2V3UA 2XD3A 3QSLA 4FIMA 4PETA 3R6UA 3FGSA 3EHTA 2VHAA 2ZNSA 3IAZA 5JTYB 3TMGA 2Z8DA 1ZMGA 1GR2A 1EZPA 5L9OA 1MXWA 3FD3A 2DQVA 1Y20A 1Z7NE 5I2NA 1MQGA 1O64A 3FVOA 2RINA 5I58B 2X26A 4R6HA 4XKPA 3TELA 3OO9A 3TTNA 3FVKA 3FZVA 1MG1A 4FORA 3H06B 5JK4A 2O7UA 2F35A 2RKMA 4H5FA 4JXIA 2UVJA 2DE3A 3C35A 4DXCA 4F2OA 2ZYKA 3ECRA 3FV1A 3W9VA 3U93A 1R1NA 3MWBA 1P1OA 2O1LA 4NF5A 4U4SA 5AE4A 3PU5A 4POWA 2QS3A 4BLAA 2DXYA 4EUOA 3SERA 3KJTA 5I59A 3K01A 2AL5A 3EQ1A 3RUMA 1OVBA 2RC9A 4OERA 2H5YA 4GL8A 5TP9A 3T9UA 2DXRA 4KYDA 2Q2CA 3QAXA 1MRPA 2XXYA 3TQLA 1A54A 4YMAA 2ABHA 1FQFA 3BFTA 4EF2A 4NF6A 3E4RA 3KN7A 1PDAA 1WDNA 2Z8FA 2VP1A 5DT6A 3LBSA 4GOTA 3MW0A 1QVSA 2P2AA 1JETA 1DSNA 1URSA 2QPQA 4C1UA 3N6TA 2DS9A 4KYSA 1LCTA 4R73A 3PUYE 4DZ1A 2AL4A 3IR1A 4KYEA 2XHDA 1S7YA 3H03A 3I3VA 4DIGA 1SW2A 2A5SA 1IXIA 3SEWA 4F1YA 3T93B 2O84X 2E1SA 1FQDA 2VGQA 5HPQA 4ESWA 3MUQA 4MLVA 5ITOA 2QS4A 1R9LA 1H43A 1URDA 1A99A 3S9MC 4QSEA 4H0WA 4LVQA 4QFOA 1LSTA 3FJGA 1P1UA 3RTWB 2CMOA 3T22A 5J1DA 4R2BA 4HCWA 1RYOA 4YB7A 1ZTYA 1AMFA 3H7MA 4H65A 2NWJA 3A3UA 4WEDA 3JZJA 3LSWA 3OO7A 4ZS9A 4X1DA 1OVTA 1P1NA 3FASA 4G8MA 3RGYA 3V83A 3IO6A 1RKMA 3G3KA 4FECA 1P1QA 3FV2A 3PUWE 4H8IA 3F11A 1ANFA 2XXXA 1Q1KA 1D9YA 1OQGA 3ZKLA 3UORA 1DPEA 1SYIA 2I6EA 2GH9A 4PFUA 1AOVA 1JEUA 4JWOA 3BFUA 3DP4A 1N0TA 3PUXE 1B7ZA 3TCGA 3K6WA 4BDNA 1I6QA 3LSLA 5KDTB 3O6IA 1MXYA 3K1PA 4PQJA 3MAMA 4BDLA 4KD5A 1FQAA 3KSXA 1JVYA 3RTFB 4OVJA 3FUZA 2XXHA 5H8HB 3VE1B 1YTVA 4ELPA 3TEPA 4LONB 4I9DA 4DCYA 4QRZA 3B7DA 3IORA 1YCJA 4KCDA 1H44A 2DWAA 3VV5A 5I58A 4ELOA 1QKBA 3CSGA 1IUDA 2F6GA 1OMPA 2IA4A 1EZ9A 3UN6A 1DOTA 1SVXB 4THIA 3TKDA 1AL3A 3K4UA 4TLMB 2D5WA 2HEUA 4OFLA 1VSOA 2DWIA 4GQOA 4BDOA 3PUVE 2VD2A 4LP2B 1B05A 1DTZA 3IOTA 3CRBA 2AIXA 2NVUB 1H76A 1QKAA 2Y7IA 3KG2A 1Y1ZA 5IAIA 2Z23A 2ZYOA 2HZLA 3IB0A 1XT8A 1L5TA 1B3EA 3C33A 2XX8A 3A09A 1Y3NA 2V84A 2ZMBA 4WEPA 2BJJX 2O51A 1A8FA 4L17A 3T9VA 1MDQA 1MY3A 3PMXA 5CI5A 4U23A 4OTEA 3OOAA 3IOWA 5ELVA 1TXFA 3PPPA 5H8NB 3T96B 3OXNA 3TFLA 4FE8A 2UYFA 4G77A 5H8QA 3GBAA 4GRKA 1MDP1 3MZ9A 3PPQA 4P0IA 2QS1A 2XX7A 3UK4A 3SETA 2ONRA 2UXAA 4ZEIA 2R9JA 1B5JA 3U8QA 5DVJA 4P11A 1SW1A 1PB8A 2H99A 3TTRA 3D4CA 1ZJLA 2F7BA 3PPNA 3VXBA 4DXUA 4LZ5A 4EQBA 3AXFA 3G3GA 4F3BA 3S9LC 3IL1B 2Y7RA 3KJ7A 5DYHA 2I58A 3HHFA 1B40A 1PC3A 4LATA 1NL5A 2H9BA 3OENA 3FJ7A 4HS7A 4IB2A 4MLQA 4FAJA 5TU0A 1T0KA 3RQTA 3E9XA 2REGA 1ZBMA 4F3PA 1D3KA 4GIZA 2QS2A 1NNTA 2H98A 2HAVA 1SYHA 4UA8A 5L9SA 4R75A 4NF8B 3V8XB 1M5CA 4LUBA 1TT1A 4GLIA 3HN0A 3MVXA 1N76A 5A5XA 3L6GA 1D9VA 3OEMA 3USDA 1SI1A 3OO8A 1QUJA 1B32A 1MXXA 3GBBA 3C36A 4GF8A 4HW8A 4OXVA 3CIJA 4G68A 2GRVA 2P0SA 3QYTA 3KZGA 2DWHA 2THIA 1WVJA 3PMVA 3H4ZA 4MH5A 2F6PA 4JB7A 4AB5A 1BTJA 3OO6A 1UTBA 3RNNA 2XXTA 4H1XA 5CMCA 2QSXA 3VLWA 4ELQA 4R2FA 1XVYA 3ZSFA 4M1VA 1MH4A 1NNPA 5AA1A 4GXSB 1BLFA 2F78A 3S2VA 3H6TA 3U94A 3DP8A 1JW1A 3G3IA 2H25A 1MPDA 1A40A 4I62A 2Q8JA 3M3KA 2DYXA 2HCAA 5KCJA 5KZTA 2I0CA 3C31A 1CB6A 1XC1A 1LBCA 1N04A 5TPAA 2G29A 2OZZA 2GHBA 1B3GA 4N13A 1N84A 4NWCA 1AH5A 2PT1A 4QFLA 2UVHA 1NNKA 4ECFA 2UYEA 4TLLB 2D3IA 1JNFA 2ANJA 1A8EA 4RJZA 3LUYA 4ELRA 1ZKBA 3G3JA 3PUZE 5CMBA 4IO3A 4QFKA 1VFEA 3JYRA 5I2KA 1IXGA 1O7TA 4F22A 2I4CA 2ALUA 4G2ZA 1KWHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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