1A55A

Phosphate-binding protein mutant a197c
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
321
structure length
321
Chain Sequence
EASLTGAGATFPAPVYAKWADTYQKETGNKVNYQGIGSSGGVKQIIANTVDFGASDAPLSDEKLAQEGLFQFPTVIGGVVLAVNIPGLKSGELVLDGKTLGDIYLGKIKKWDDEAIAKLNPGLKLPSQNIAVVRRADGSGTSFVFTSYLAKVNEEWKNNVGTGSTVKWPIGLGGKGNDGIAAFVQRLPGAIGYVEYCYAKQNNLAYTKLISADGKPVSPTEENFANAAKGADWSKTFAQDLTNQKGEDAWPITSTTFILIHKDQKKPEQGTEVLKFFDWAYKTGAKQANDLDYASLPDSVVEQVRAAWKTNIKDSSGKPLY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Phosphotransferase
source organism Escherichia coli
publication title Crystal structure of phosphate binding protein labeled with a coumarin fluorophore, a probe for inorganic phosphate.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHATE-BINDING PROTEIN
total genus 107
structure length 321
sequence length 321
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-02-19
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a55A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1a55A02
5KDTA 2UYFA 4H1XA 3RGYA 3MZ9A 4RA1A 2XXHA 1MQJA 3T9VA 1JW4A 4WKMA 5H8NA 1UTHA 2F78A 2YLNA 4OYVA 3KN7A 3KEIA 5IAIA 1MRPA 3KN8A 4LP2B 1B40A 5H8QA 3L6HA 1B3FA 3RT6B 3PV0E 4M1VA 4H0WA 3IB2A 4OTEA 2XXPA 4X48A 3PUWE 4NF6A 4H6DA 3VXCA 1UIUA 4RK9A 1LGBC 3VVDA 4N6PA 3R26A 3IOVA 3TAJA 1H45A 3IORA 3IO6A 4EQ7A 1B2HA 2HXWA 4NEDA 4IY6A 2ZYMA 3LSXA 1L5TA 5F1QA 1N76A 4G4PA 1N7XA 2DOJA 4EQBA 1FQBA 3UIFA 1YCJA 1PDAA 4G77A 4U21A 3O6HA 3PUYE 2O68A 2NXOA 4TLMB 1N0TA 3SEWA 4E0XA 3KSJA 3RLFE 3C31A 5KCJA 2P2AA 1JEVA 3O9PA 2B3BA 3H6WA 2GRVA 4XKRA 1YAEA 4QFNA 2I3WA 3N94A 2PX1A 4ZE8A 4F2OA 2DVZA 2ONRA 1AL3A 1M5FA 2H4IA 4EDPA 3QUJA 1B32A 3TELA 4DDDA 5CBSA 3EPEA 4LZ7A 4H67A 1B7UA 4YKPA 3DP4A 4GOTA 1B0LA 4MLVA 1URSA 2I3VA 3DELB 1ZMGA 3BBRA 2ZXTA 1FTJA 4NF4A 4NWDA 3ILUB 4YKJA 1LCFA 1LAHE 1PBPA 4DCYA 1JVYA 1IITA 1OQGA 1LAFE 5TP9B 4XTCQ 1R9QA 5TU0A 4ESWA 1SYHA 4IO4A 2HAVA 2FA7A 2Z8DA 5HBCA 4BDNA 3PGFA 5EHSA 1P1OA 2HCAA 1FQCA 3S9LC 3CI8A 1USYH 4OZ9A 1LBBA 2O1MA 3K1PA 2DXRA 2G93A 3PUZE 1QW0A 2QS1A 1EZOA 3M8UA 1JQFA 1LSTA 5DVFA 1QVSA 1Y3QA 3OO8A 4C1TA 4POXA 4NF8A 3KGCA 1NFTA 2V3UA 2O7UA 4F39A 2X7QA 3B6QA 1EH3A 4KQPA 3K01A 3OO6A 3U72A 2YPNA 3ILTB 5DEXA 1SW1A 5ICQA 2F36A 4MLQA 1MY3A 1RYXA 4GVOA 4H8IA 3JV9A 4R9FA 4IO3A 4Q0CA 4YKKA 2QRYA 4PFWA 5AA4A 2Y7WA 4KCDA 3KJTA 3MPKA 4X1BA 1VR5A 3IOTA 4IY5A 3O29A 4BLAA 4F1VA 4OEUA 1BLFA 3ODBA 5EHMA 1FCKA 3RPWA 1IQ7A 2UVJA 1YPNA 1OLAA 1DTGA 4G68A 3T9XB 5CC2A 3IX1A 3SEUA 5EYFA 1Y1MA 5DTBA 3R6UA 4PQJA 1IZ1A 4FJPA 4F2QA 4LQ5A 2DWAA 2ZNTA 3E4RA 1SBPA 1BTJA 1D3KA 3FATA 2O69A 1MXYA 3BFTA 3B7DA 4RY1A 3QYTA 4LUBA 2GH9A 2PVUA 5DT6A 2DWIA 2H25A 4GQOA 2A5TB 3VVFA 1QUJA 3TCGA 5J1DA 5CMCA 1B7ZA 2O1LA 4TLLB 3MQ9A 3CIJA 4JBZA 3UK4A 4P0IA 4QSEA 4U4XA 3KG2A 4QFPA 3O6GA 3VE1B 4GIZA 2REGA 1IXIA 3T66A 4OVJA 3VLWA 2ZNSA 4U4SA 1MDP1 4OETA 4R75A 3FZVA 5I59A 3V8XB 5I56B 3TTMA 3G3FA 1R1NA 3N26A 3CRBA 4G8MA 3RT8A 1FW0A 1DSNA 3DP8A 1GGGA 4YKIA 1JW5A 3U94A 2NOOA 3RQTA 3ZS6A 2AIXA 3IAZA 3VVEA 2OWTA 1H3DA 4KYEA 2OWSA 1DOTA 3GBAA 4IO7A 1QUKA 5F7VA 2RC7A 3TUSA 3K4UA 2H99A 1HSJA 3KZGA 2QMXA 1GR2A 3K1NA 5DVIA 1Y9UA 3WAEA 4RXLA 1PEBA 1D9VA 1LAXA 2AYSA 1B4ZA 3FJMA 1QULA 3JYRA 4KYDA 2RKMA 4LZ8A 2PMSA 1AMFA 1P1NA 3PMVA 1ELJA 2HEUA 4WXJA 1TXFA 3ECRA 3K0VA 3A3CA 4F19A 2UVGA 3CG3A 3G3GA 2ANJA 2IEEA 5H8HB 3GXAA 2XD2A 4F1UA 3FVOA 1NNPA 4OQOA 3RNNA 2ZYKA 4GFRA 4JXIA 1AH5A 1MPDA 3PUXE 2V84A 4TQUQ 2Y7KA 1QKAA 2O6AA 5KDTB 5BUUA 4BDRA 2QPQA 3CFLA 4O3CA 2NVUB 3EHSA 4YU0A 4EXKA 1D9YA 4OFOA 3RN8A 4NWCA 1B52A 3CSBA 1A40A 5H8NB 1UTHB 4YICA 1M5EA 1NKXA 4KYSA 4EF1A 1P1QA 3TTRA 3MVWA 5JEIA 5H8QB 2PBWA 5DYHA 3MVYA 1FQEA 3E3KA 3UA8A 2XD3A 1S7YA 1J1NA 5I2KA 1LBCA 1O63A 1FTOA 3VFJA 2XX8A 4NF6B 2RC8A 5FTIA 4DXBA 4U1OA 3IJXB 5CMBA 5CI5A 1MXWA 4OESA 4JDFA 5KZTA 4MF3A 5I58A 1B1XA 3FVGA 4LQ2A 2XXVA 3EQ1A 1A54A 4LATA 2I6EA 4JB7A 1B1HA 3IO4A 2I48A 1MQIA 3MVXA 4M4GA 4N07A 1XHYA 5BWJA 3H6VA 2OCUA 2NUVA 4QRZA 2AL5A 4LONB 5CRYA 5JK4A 5L9MA 3IOUA 3DP6A 5CBRA 5KCJB 2ALUA 3WAFA 2RCBA 2ZMBA 1SW2A 3HHFA 4JWOA 2F97A 1B9JA 2GHBA 4DCXA 1BP5A 4PFTA 1BKAA 2RF1A 1B3EA 4YMAA 1NNKA 1NH8A 4FATA 1I6AA 1LFIA 2F35A 4MBPA 3PUVE 4R6YA 3MVZA 4GWOA 3G3JA 3T22A 1NH7A 3B6WA 4U23A 3M3KA 1LB8A 5IKBA 3EHUA 3QK6A 2DVCA 3FIRA 3RTWB 3UORA 5DVJA 2OZZA 3JZJA 4NF4B 4O3BA 1MPBA 1CB6A 1XT8A 1N04A 1N84A 3OEMA 2XXTA 1OIBA 3B6TA 1FQDA 3FXQA 3QAXA 2XXRA 1Y4CA 4F3SA 1MXVA 3U1OA 3CVGA 1A7LA 3T96B 1N3XA 2H9BA 5B7DA 1MM7A 2XXIA 1FQFA 1S50A 3KOTA 2Y7RA 4XKNA 3G7WA 4C0RA 2I0BA 1JW1A 1RYOA 4ONYA 2ABHA 2E0SA 1B5JA 1US5A 5HPQA 3MJNA 5AA1A 4ISUA 3D4GA 1MY0A 5I57A 2Z22A 4ZECA 3SEVA 3ZKKA 3G3HA 4ZZAA 3PPOA 1AOVA 4NF8B 4FAJA 4Q30B 1XC1A 4GL8A 1MQDA 4RK2A 3OELA 3MW0A 4KFQA 1B3GA 3HCQA 1WODA 4N13A 3H6UA 3ZSFA 3W9VA 1SDXA 1QKBA 5DEXB 2Y84A 1IEJA 1M5BA 5H8FA 3T93B 1M5CA 2UVIA 1PB8A 2UVHA 4AB6A 1A8EA 3S2VA 3G3IA 2DWHA 2QS3A 2XXXA 3H06B 1IUDA 3TYHA 1JVXA 3V83A 3Q29A 1MXZA 5TPAA 3IR1A 1UTBA 2F7AA 5AA4B 2XXWA 3ONMA 4HCYA 3TDJA 1DPPA 1YTVA 3MP8A 3UGWA 4U2RA 1Y3NA 4YAHX 4WEPA 3RTFB 1ZU0A 1ANFA 4R6KA 3VDFA 5A5XA 4YB5A 3TEPA 2VOZA 2VHAA 3VLVA 2F34A 5FHMA 1S9TA 3IOWA 4MH5A 5B70A 1SI0A 3T9UA 4G68B 3OD7A 3KFMA 1FTMA 2P1SA 3H6TA 4OWDA 4F31B 3OO9A 1JEUA 2F7CA 1B3LA 2OJTA 2QL3A 1TFDA 1VE4A 4G8NA 1SVXB 4BDLA 3VLUA 3Q26A 2F6GA 2CZLA 2R6GE 5FHNA 1LB9A 1VSOA 3THIA 3QXMA 4HW8A 1MG1A 3K2DA 3Q28A 2PT2A 5L9OA 1B0HA 4R2BA 4UACA 3IK6B 1Y4TA 1O64A 4DZ1A 4H8JA 4XKQA 4Q5TA 1PB9A 1SQYA 3S4UA 3SESA 3UP9A 2XX9A 1DMBA 1POY1 3OENA 1URGA 1IIWA 1MQGA 2GHAA 3EN3A 1MDQA 4FECA 2A5SA 1Q35A 1NMUA 2OBGA 4ZEFA 1WVJA 3VV5A 1B4HA 2Q8JA 1F9BA 4YMBA 5I59B 4F29A 3OXNA 4QFOA 5HM4B 4ZEBA 3TODA 5H8SA 1UQWA 1GVCA 4EUOA 1VFEA 3TZAA 4WEDA 3SKPA 3TCHA 4DXCA 4PP0A 3SEYA 2DWJA 5AA2D 5AA2A 2HZLA 4ELPA 2B3FA 3KBRA 4KCCA 1M5DA 1ZTYA 2UYEA 1H44A 4OFLA 5I2NA 4IO5A 2O7IA 5ITOA 3SETA 2RINA 4TOZA 3OSQA 3Q27A 1CE2A 1MH4A 3IL1B 1XVYA 5AA3A 3MC2A 4GD5A 3U8QA 3HSTA 2V93A 4EF2A 4X9TA 3M3FA 2PT1A 1TFAA 2VD2A 1VFDA 3RUMA 4R73A 3KJ7A 4NF5A 2Y7IA 1TWYA 1JETA 4KI0E 3A09A 2X26A 4F3BA 1SW5A 1OVTA 4I62A 3BFUA 4NMYA 3TQWA 3C32A 4GXAA 3TCFA 1Y3PA 3FVNA 1A99A 4ZDMA 3HHGA 1LFGA 1O7TA 4QFLA 2Z23A 4C1UA 3LUYA 3TTKA 1USYE 3IJOB 3N6UA 4FEBA 1Y20A 3AXFA 2FYIA 1MQHA 2E1SA 4L17A 2PYYA 3CG1A 1SD3A 1XOCA 2ZNUA 2XXYA 1H76A 5CMKA 5ISUA 1SI1A 2V25A 4GF8A 3C9HA 3M3LA 4ND9A 1I6BA 3FV2A 1EZ9A 3K1MA 4ZS9A 1IXCA 2DE4A 5I2KB 1MH3A 4F3PA 2F5XA 5M2VA 2DS9A 4OERA 1MM6A 5JTYA 2V3TA 2ZYNA 4R2FA 2WKYA 5FHOA 2Z8FA 4AB5A 4HS7A 4JWXA 3QIMA 3IB1A 2H5YA 2KLFA 4KPTA 2OLBA 2QMWA 3CSGA 3N5LA 3T9HB 4OHNA 5I58B 3N6TA 3S9EA 4KR5A 1US4A 4X1DA 3TFLA 2DE2A 2O84X 3PD8A 1POTA 3HO7A 3TMGA 3TTNA 3PD9A 2D21A 1LAGE 3MWBA 2V3QA 4HCWA 4I8CA 2HFBA 3L6GA 1FTLA 3MP1A 3K6VA 4R74A 3DM0A 3QUFA 3PMXA 3PPQA 1PBQA 2DXYA 1P1UA 1SYIA 2CMOA 3I5OA 1Q1KA 3F11A 4ELOA 4R6HA 2Q2AA 3V89B 5CM6A 4BDOA 3U92A 4U22A 1QUIA 3O2AA 4P11A 3GZGA 4AQ4A 4OXVA 1N3WA 2VD3A 3C34A 3P7IA 3OO7A 3GLBA 1ZIUA 4ZEIA 4G2ZA 2LAOA 2RCAA 1I69A 1MXUA 1UIVA 1B51A 4DE8A 3KN3A 4OMBA 4G68C 1MY4A 3UN6A 4KD5A 2DYXA 5K2YA 2Y7PA 4RJZA 2F8DA 2M8CA 3I3VA 1R6ZA 3PU5A 1BIYA 1IXGA 3TKDA 1KWHA 4PETA 1FQAA 2Z8EA 5ITPA 2I0CA 4ZEKA 1AIVA 4IB2A 4DLDA 1EZPA 1FTKA 1ATGA 2Q2CA 5LOMA 3CR9A 1DTZA 3MUQA 3O28A 3OMBA 3C33A 5L9SA 3LBSA 2F6PA 2HZKA 1R9LA 2X7PA 1EU8A 2QS4A 4YB7A 4GXSB 4JSOA 1PC3A 4LVQA 1Y1ZA 3HV1A 3DLNA 1LFHA 4G8HA 3MAMA 2Q89A 3GBBA 3TTLA 5I57B 4Q8RA 4FE8A 3PPNA 4I9DA 3FJ7A 1B3HA 3FVKA 1WDNA 4UA8A 2DSFA 1A55A 3K6XA 1ZJLA 4IO6A 1HSLA 2XX7A 1I6QA 1B6HA 3G3KA 1JNFA 5CMMA 1SW4A 4XKPA 4LA9A 5TP9A 1LLSA 3LR1A 3U93A 1ZKBA 4MFIA 4RPNA 2D5WA 2R9JA 3C4MA 1GTKA 4R72A 2ONKE 3FV1A 5H8FB 4PFYA 3SEXA 4K3FA 4H5GA 4DXUA 3CFXA 1MY1A 1OMPA 4KHZE 3H03A 5TPAB 1UTBB 4GL0A 3USDA 1NNTA 5AE4A 3CFZA 1PB7A 3KOSA 2I49A 4OENA 2ZYOA 3MBPA 3MPLA 4GRKA 2DQVA 1Z7NE 3TPAA 4NTLA 4ELQA 4JWYA 4H5FA 5A5XB 2NWJA 3FGSA 2DP8A 3H7MA 3HN0A 1T0KA 4O3AA 4EXLA 2Q88A 1QJMA 1MY2A 2QSXA 1NL5A 2XXUA 4I1DA 2H98A 3LSLA 2VP1A 2HQ0A 3ZKLA 2BJJX 3O97A 3V5AA 4QF9A 1B5HA 4QSDA 3FUZA 4RYAA 1IXHA 4NE4A 2OK2A 3W9WA 3C36A 3QSLA 4HTGA 3SDFA 4IGRA 4ZEDA 2QS2A 4FORA 1ZBMA 3Q25A 4FIMA 3MZBA 1B05A 4IGTA 2I4CA 3OEKA 4IO2A 2IA4A 1B58A 1ZLQA 3OOAA 4OFJA 1P1WA 1OVBA 3I6VA 4XIGQ 1XS5A 2GFEA 1II5A 5ICTA 3S9NC 4F18A 3E9XA 4F3GA 4E0WA 3PPPA 4ECFA 4FEDA 2P0SA 4PE5B 3H4ZA 1TT1A 4QHQA 3IB0A 3MZ1A 3RY3A 4OEVA 3K02A 1B46A 1D4NA 2AL4A 2XHDA 4PFUA 2ONSA 3FJGA 3KSXA 3C35A 3S9MC 3R7XA 2ESNA 2I58A 4H65A 5K2XA 2A5TA 1B7HA 4BDMA 3K6UA 4F1YA 3SERA 3E13X 2YJPA 3K6WA 4GLIA 5FTHA 5AA2B 4BDQA 4THIA 1OLCA 5L8DA 2VGQA 4Z7EA 5I2NB 1DPEA 1RKMA 1LCTA 5I84A 2DE3A 4YB6A 3O6IA 2REJA 2G29A 3A3UA 1H43A 3HPIA 4ZE9A 3BKIB 3LSWA 3D4CA 4NF5B 5I56A 1N7WA 4P0GA 1URDA 4RNSA 4QSCA 2F7BA 3FASA 4JSDA 4LZ5A 4QFKA 3MP6A 3FD3A 3EF7A 4EQ9A 3FXRA 4YZZA 2RC9A 2D3IA 3PPRA 4ZZEA 3EHTA 3PMWA 3OSRA 3W15C 4POWA 1MPCA 4RPOA 3VXBA 4U1ZA 2UXAA 1NNFA 4ELRA 2THIA 3TQLA 2W7YA 1A8FA 2XXQA 4ESXA 4Z0IA 4XXUA 2I4BA 1XVXA 3K00A 3O66A 2QJEA 1Z7ME 1B5IA 3LC8A 3FXUA 5H8HA 3LSFB 4F22A 1HSEA 1MXXA 2FNCA 5JTYB 1P99A 2B65A 3H3GA 1OQHA 4R9GA 4DIGA 2R71A 2Q9TA 2O51A 2HAUA 5ELVA 1MS7A 1GV8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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