The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
67
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sequence length |
151
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structure length |
151
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGY
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of myoglobin-ligand complexes at near-atomic resolution.
pubmed rcsb |
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| molecule tags |
Oxygen transport
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| total genus |
67
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| structure length |
151
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| sequence length |
151
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1998-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1FDH A; 1QSH B; 1CH2 A; 1IWH B; 4KJT A; 3LQD A; 2HBF B; 5CN4 A; 4C0N A; 5CNF A; 2V1F A; 3QQQ A; 3ECX A; 1WLA A; 3BJ2 B; 3DHT B; 3RGK A; 5IKS A; 1A6N A; 4B3W A; 5E83 A; 2ZS0 C; 2MGH A; 1COH B; 2G14 A; 1FAW A; 1YEO A; 1D8U A; 1Y01 B; 1Y4V B; 3HHB B; 4N7N A; 1Y8H B; 1CG5 A; 2HHD A; 1UVY A; 3EOK B; 1Y4Q B; 2MGD A; 1YH9 A; 4NI1 A; 2ZFB B; 2MGG A; 4MQC B; 1K1K A; 1NZ5 A; 1MLL A; 1NWN A; 1C7D A; 2ZSX A; 3UHN A; 1BBB A; 5HU6 B; 2D2M C; 1V75 B; 1X9F B; 3WCT A; 4L2M A; 1CP5 A; 3IC0 B; 2ZSY A; 3WCW B; 1XZV A; 4B4Y A; 4HRT B; 1VXF A; 1DO4 A; 1O1K A; 3HXN B; 4WCH D; 5HY8 B; 4O4Z A; 2C0K A; 2MGL A; 1GVH A; 1O16 A; 1JL6 A; 3LHB A; 1JL7 A; 3PEL B; 1R1Y B; 2OH8 A; 3MJU B; 5EOH A; 4F69 A; 1HGA B; 1SDK B; 2RAO A; 1Y31 B; 2FAL A; 1MNJ A; 1J40 B; 2D5X B; 1YFF B; 1HDB B; 1NEJ A; 2ZLT A; 3QJE A; 5HBI A; 1QI8 B; 1A6M A; 1DLW A; 1Y0C B; 1J41 A; 1LUE A; 1YDZ A; 3LB4 A; 3WCU A; 1SI4 A; 3UHH A; 3ZH0 A; 1CG8 B; 1EMY A; 5C6E A; 1J7W A; 5CN6 A; 1VXH A; 5MBA A; 1MLS A; 1MTI A; 1CH9 A; 1YIH A; 1J3Z A; 1VWT B; 2XKH A; 1FSX B; 1N9I A; 2HHE B; 3GQR A; 1DWT A; 1ABS A; 1G0B B; 1VXE A; 3GOU B; 1AZI A; 3BCQ B; 1LFZ A; 4F68 A; 4M4B B; 4MAX A; 5CN9 A; 1A6K A; 108M A; 4F6J A; 1X3K A; 1Y45 A; 1FLP A; 1YHU A; 1RQ4 B; 1DLY A; 1MBD A; 3GKV A; 1MBI A; 4NZI A; 3BA2 A; 1MOB A; 1QSH A; 1BIJ B; 1S5X B; 1OUU B; 5E29 A; 1F65 A; 1M9P B; 5F0B A; 1IWH A; 1LH2 A; 1B86 A; 2HBF A; 2SPN A; 2ZLV B; 3E5O A; 1NPF A; 2PGH B; 1CH5 A; 1UVX A; 1MYM A; 2VEE A; 2SPM A; 2GNV A; 3BJ2 A; 1YHE A; 3DHT A; 3R0G A; 1LH7 A; 1V9Q A; 3PI8 A; 1UT0 A; 1YGF B; 1BZR A; 3OZW A; 2VLY A; 3AT6 A; 1COH A; 1HBB B; 2LH1 A; 1Y4V A; 1YE2 B; 1Y8H A; 3WCU C; 1MNH A; 2DC3 A; 4UUR A; 3VRE A; 2R4Y A; 3OZU A; 4H2L B; 1Y4Q A; 1ECA A; 1HGC B; 4ZVB A; 3G53 A; 2MGC A; 2ZFB A; 2HHB A; 4F6F A; 1NQP B; 1XZ5 B; 4MQC A; 1DXC A; 4NI0 B; 1YMA A; 1JEB A; 4N8T B; 5HU6 A; 1V75 A; 1X9F A; 3WCV B; 2G10 A; 1OBM A; 1YEV B; 3IC0 A; 2MGA A; 3WCW A; 3PIA B; 4HRT A; 3WFU A; 3QMA A; 1EW6 A; 1YHU C; 3HXN A; 5HY8 A; 2R50 A; 2GTL A; 3OJ1 A; 2MGM A; 3PEL A; 1R1Y A; 1TU9 A; 2OIF A; 1G09 A; 1C40 B; 1SDK A; 1NIH A; 1Y31 A; 3UHX A; 1MYH A; 4DWU A; 1J40 A; 1B0B A; 1SHR B; 3PT7 B; 2D5X A; 3VAU A; 2BNL A; 4YU3 B; 1KD2 B; 2HZ2 A; 2QMB B; 1YFF A; 1HDB A; 2ZS1 B; 1Y7C B; 3V2V A; 1Y0C A; 1GBV A; 1Y4F B; 1BZ1 A; 2GRZ A; 2G0R A; 3A5B A; 2XKG A; 1O1O A; 4KN3 A; 3U3E A; 1THB B; 3E4N A; 3UH6 A; 1Y22 A; 4FH7 A; 1MLH A; 1VXA A; 3R5I B; 2V1G A; 1NS9 B; 3AQ7 A; 1GDL A; 5JDO D; 1O1M A; 1V4W B; 1FSX A; 1HAC B; 106M A; 1DO1 A; 3O7N A; 1G0B A; 3QZZ A; 4ODC B; 1J3Y B; 3GOU A; 4HHB A; 5EQM A; 1ABY A; 3BCQ A; 4PQC A; 2O5Q X; 2ZLW B; 4M4B A; 2ZLX A; 1X9F C; 3A9M A; 1CLS A; 1ECO A; 2MYE A; 1A00 B; 3K8B A; 3UHS A; 3WCW C; 3G4U A; 1URY A; 3BOM B; 1RQ4 A; 1SDL B; 1YVT B; 1Y4R B; 1Y8I B; 1XZU A; 4SDH A; 2ZSN A; 2GTL C; 1DTM A; 1S5X A; 3QJD B; 3G4V A; 1M9P A; 4IRO B; 2HZ3 A; 3UHY A; 1FN3 B; 2ZSP A; 3QM8 A; 2MGK A; 3G52 A; 2ZLV A; 2PGH A; 4N7O B; 1ABW B; 1IDR A; 2XYK A; 3GK9 A; 3FS4 A; 1CIK A; 2FRF A; 3O89 A; 1YGF A; 3RJN B; 3PT8 B; 1DM1 A; 1NZ4 A; 1QXD B; 1HBB A; 5EE4 D; 1YE2 A; 1CH7 A; 1O1P A; 3SDH A; 1G0A B; 2VRY A; 4H2L A; 4KMW A; 3ED9 A; 1MTJ A; 1AJ9 A; 2D60 B; 1GJN A; 3CY5 A; 2Z6T A; 2V1E A; 1YEN B; 1QSI B; 1NQP A; 2YRS B; 1CQX A; 2D5Z B; 3AQ5 A; 2HBG A; 4NI0 A; 3UHQ A; 4N8T A; 1K0Y B; 1YOH A; 4PQB A; 3GYS B; 3AT5 B; 3ODQ A; 3WHM A; 1HAB A; 3D7O B; 1FDH G; 1DXD A; 1HHO A; 3WCP B; 1J3F A; 1VXD A; 5JOM A; 1Y2Z A; 1MYI A; 1CMY B; 2OH9 A; 3LR9 A; 2ZFO B; 4O4T A; 1GDJ A; 5AB8 A; 2NSR A; 1C40 A; 3UHR A; 1Y4G B; 4U8U D; 4X0L B; 3NL7 A; 1SHR A; 2G12 A; 3PT7 A; 5EYJ A; 4NXA A; 1O1L B; 5AZQ A; 1KD2 A; 2QMB A; 3QJC A; 1CH3 A; 5KDQ B; 1YEU B; 3AQ8 A; 4JAC A; 2ZSO A; 2W6Y A; 3UHT A; 2MB5 A; 1Y09 B; 2GRF A; 1Y4F A; 2D2N D; 4MBN A; 1JDO A; 4MQH B; 2GL3 A; 1THB A; 4FH6 A; 5CMV A; 3M39 A; 4YU4 B; 3DUT A; 3MYM A; 3R5I A; 1LH6 A; 1NS9 A; 1J7S A; 3W4U B; 101M A; 1RSE A; 1V4W A; 2OLP A; 1HAC A; 1LTW A; 1A4F B; 5B84 A; 1YIE B; 1HLB A; 1Y8W A; 3OO5 B; 3QJB B; 1DO3 A; 1Y4B B; 4ODC A; 1J3Y A; 1Y0W B; 2ZLW A; 2MGI A; 3ZOL A; 2ZS1 D; 3WCV C; 1BUW B; 1A00 A; 2G3H A; 3UHE A; 2ZSR A; 1SDL A; 2FRI X; 1YVT A; 1Y8I A; 1Y4P B; 4F6B A; 1PBX B; 3HYU B; 3P5Q B; 1CQ2 A; 1RPS B; 1FN3 A; 1BAB B; 1A3O B; 1MBO A; 4N7O A; 1ABW A; 1YCB A; 2W72 B; 1DXU B; 107M A; 1UIW B; 2ZS1 C; 2R80 B; 2MGJ A; 3PT8 A; 1GZX B; 1LFY B; 1LFV A; 3S66 B; 1QXD A; 1MGN A; 5CNG A; 1LFT B; 1OR6 A; 2MYA A; 2GRH A; 1Z8U B; 2BLJ M; 1F5P A; 2WTG A; 3TLD A; 3UHD A; 3OK5 A; 3CIU B; 4F6D A; 1G9V B; 1YEN A; 3AQ6 A; 1QSI A; 4UZV A; 1GCW B; 2D5Z A; 4ROL A; 2QU0 B; 2DN2 B; 2R4W A; 1QXE B; 1GDI A; 1K0Y A; 3TM9 A; 3GYS A; 2ZSS A; 3AT5 A; 2Z8A A; 5HLU A; 1X46 A; 3S65 B; 3UGY A; 3HF4 B; 1HRM A; 3MVC A; 5EUI B; 3M3B A; 3KUO A; 1MYF A; 1OUT B; 2AV3 A; 1UC3 A; 1JY7 A; 1FSL A; 1MZ0 A; 1Y4G A; 1ASH A; 2BLH A; 1RTE A; 1O1L A; 3V2Z A; 1MLU A; 2BK9 A; 2V1I A; 1HV4 B; 1H97 A; 2FRK X; 1YEU A; 2QSP B; 2QSS B; 1JPB A; 5EU2 A; 1Y09 A; 7HBI A; 1DWS A; 4MQH A; 1SPG B; 1S61 A; 2VLX A; 5E6E B; 2ZT4 A; 4YU4 A; 1Y83 A; 5C6Y A; 2MYB A; 2MYC A; 1Y7G A; 1JZL A; 2ZFO D; 3W4U A; 2SPL A; 3A0G B; 5ILM A; 3G4Q A; 5JDO E; 5F2A A; 3UBC A; 3OO5 A; 3QJB A; 1Y4B A; 4MQI B; 1V4X B; 1MWB A; 3HEO A; 4H07 A; 1NZ3 A; 1WVP A; 2QRW A; 1OJ6 A; 4M4A B; 3IA3 B; 1O1N A; 1BUW A; 2DXM B; 1Y5J B; 3UHI A; 1MKO A; 1HDS B; 1A0Z B; 3KUN A; 2H8D B; 1LHT A; 1Y4P A; 1XXT B; 3HYU A; 3P5Q A; 1A01 B; 3WFW A; 2O5L X; 2V1K A; 2JHO A; 1HBR B; 3TM3 A; 1L2K A; 1BAB A; 4JYQ A; 1JZK A; 2W72 A; 1I3E A; 5EV5 A; 3E55 A; 1OFK A; 4HSW A; 1UIW A; 3HHB A; 2D6C A; 2HBC B; 1XQ5 B; 1GZX A; 3EOK A; 3S66 A; 1A3N B; 1ECN A; 1WMU B; 1EBT A; 1BJE A; 4DC8 A; 3UI0 A; 1DXV B; 4G1B A; 1YOI A; 4U8U B; 2EVK A; 1GBU B; 1Y46 B; 3QM9 A; 5KER B; 3G4Y A; 3K9Z A; 5CND A; 3CIU A; 3NG6 B; 1Y0A B; 1ITH A; 1G9V A; 2GKN A; 3WTG B; 2AUR A; 5CHQ A; 1GCW A; 4TYX A; 4ZVA A; 2DN2 A; 1CO8 A; 3BJ3 B; 4N7P B; 2D2N B; 3WFX A; 1QPW B; 1YEQ B; 3UHV A; 2R1H B; 3WFT A; 2GLN A; 1XYE B; 3BJ1 B; 1O1J B; 1HBS B; 3S48 C; 1LJW B; 1J52 A; 1IRD B; 1DXT B; 3MJU A; 1HGA A; 3OO4 B; 1R1X B; 1TES A; 1OUT A; 4AVE A; 2MGF A; 1FHJ B; 1HDA B; 1QI8 A; 1DKE B; 3PI3 A; 1PMB A; 4OF9 A; 1V5H A; 2W72 C; 2IN4 A; 4UIQ A; 3QM6 A; 1V4U B; 1HV4 A; 2EKT A; 2MGB A; 1CG8 A; 2QSS A; 2ZS0 B; 2O5S X; 2EVP A; 3IXF A; 2H8F B; 3UHK A; 1RQA B; 2DN1 B; 1SPG A; 2HBD B; 6HBI A; 1VWT A; 2IG3 A; 5E6E A; 2HHE A; 1S5Y B; 3ASE A; 2H35 B; 3A0G A; 3ZJO A; 1HCO B; 2Z6S A; 1MDN A; 1V4X A; 4MQI A; 2PEG B; 1SWM A; 2ZST A; 1W92 A; 1S6A A; 2DXM A; 4HRR B; 1A0Z A; 1UMO A; 2H8D A; 3ARJ A; 2LH2 A; 4MQG B; 1VHB A; 1BIJ A; 3MJP B; 1OUU A; 5JDO C; 3HEN A; 5D1V A; 5MBN A; 1A01 A; 1XZ7 B; 3VHB A; 1SPE A; 2DN3 B; 1HBR A; 1LH3 A; 2ZT2 A; 1MLF A; 2W6W A; 1N9F A; 3LQD B; 2CMM A; 4HSX A; 2O5B X; 2VM0 A; 1Y0D B; 5ILE A; 5CN7 A; 2GNW A; 1Y7D B; 3G4R A; 5E83 B; 1WMU A; 5ILP A; 1YEO B; 1HGC A; 1KFR A; 1YG5 B; 4NS2 A; 4U8U A; 1I3D A; 4MBA A; 1GBU A; 1XZ5 A; 1Y46 A; 5KER A; 2MHB B; 3GDJ B; 3NG6 A; 1Y0A A; 4NI1 B; 2HZ1 A; 3WTG A; 2EKU A; 2B7H B; 1CBM A; 3ZJR A; 3OVU C; 1C7B B; 3H57 A; 2BW9 M; 3MBA A; 1CH1 A; 3NML A; 3WCV A; 2Z6N B; 3BJ3 A; 1YE0 B; 1C7D B; 2RI4 B; 1MBS A; 1YEV A; 2G11 A; 2D2N A; 5EE4 C; 3VRF B; 3PIA A; 1QPW A; 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1JZM A; 1UFP A; 1B86 B; 1XZ2 B; 1YHR B; 3B75 B; 3D1K B; 3LR7 A; 2NX0 A; 1YHE B; 1Y0D A; 1UX8 A; 3PI8 B; 1JW8 A; 2D2M D; 1G0A A; 1Y7D A; 3S1I A; 3AT6 B; 1Y8K B; 1RQ3 B; 1MLM A; 2D60 A; 6HBW B; 2VYZ A; 3AQ9 A; 1YG5 A; 2ZSQ A; 1YMC A; 3VRE B; 1S69 A; 2ZT3 A; 1U7S A; 2YRS A; 2O58 X; 2MHB A; 2VHB A; 5CHR A; 3VRG B; 2EB8 A; 3GDJ A; 4F4O B; 3PI1 A; 2HHB B; 2O5T X; 2B7H A; 1G08 B; 4ILZ A; 1BVC A; 1C7B A; 2LH3 A; 4MPM A; 2LH7 A; 2O5M X; 2Z6N A; 4DC7 A; 1YE0 A; 2RI4 A; 5CNB A; 5D5R A; 3FH9 B; 1JEB B; 2ZSZ A; 3ONZ B; 3D7O A; 1MLR A; 1T1N B; 2XKI A; 3VRF A; 3WCP A; 4XS0 A; 1H1X A; 1JF4 A; 3LB3 A; 4MQJ A; 1OFJ A; 1RTX A; 1MBN A; 3D17 B; 1J7Y B; 1LFL A; 1YVQ A; 1GLI A; 1EWA A; 4C44 A; 1CMY A; 2ZFO A; 1Y5K B; 3AG0 A; 3ZJM A; 4X0L A; 2GTL B; 1BZ6 A; 1G09 B; 2G0X A; 1LA6 A; 1Y7Z B; 1Y35 A; 1NIH B; 5KDQ A; 1MBA A; 4BJA A; 5CN5 A; 3EU1 B; 3NMM A; 2SPO A; 2HBE B; 4ROM A; 3ZHW A; 2OHA A; 1YZI A; 5SW7 A; 1GBV B; 4FWY A; 3WCT D; 2VEB A; 1XZ4 B; 1BZ1 B; 1NAZ A; 2AA1 A; 111M A; 104M A; 2MYD A; 1O1O B; 2DHB A; 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