1ABAA

The structure of oxidized bacteriophage t4 glutaredoxin (thioredoxin). refinement of native and mutant proteins
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
87
structure length
87
Chain Sequence
MFKVYGYDSNIHKCGPCDNAKRLLTVKKQPFEFINIMPEKGVFDDEKIAELLTKLGRDTQIGLTMPQVFAPDGSHIGGFDQLREYFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of oxidized bacteriophage T4 glutaredoxin (thioredoxin). Refinement of native and mutant proteins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTAREDOXIN
molecule tags Electron transport
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 24
structure length 87
sequence length 87
ec nomenclature
pdb deposition date 1992-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1abaA00
2OE3A 1WMJA 4H86A 2HRFA 2C0FA 5E59A 1PN9A 3I69A 1EZKA 2PGTA 3BOAA 7GSSA 2EIRA 1XIYA 2HSYA 4KW6A 3ZITA 2NTOA 1TOFA 4HZ4A 1TU8A 2QGVA 3TJJA 14GSA 4FIWA 4WR5A 3DRNA 3GN3A 4IJ3A 1FB6A 3IBHA 3KTLA 1JLWA 3ZMKA 3G7JA 1JZOA 4NAXA 1DE1A 3FK8A 4ECCA 2QC7A 1U87A 4NV2A 4XHMA 1UVZA 3D5JA 2KP2A 3TJFA 3US3A 4KGIA 1SJ6A 3RHCA 3ZLPA 3ZREA 2E0QA 5ECNB 2VCZA 4NMUA 2HXKA 3VWWA 2PPTA 5D9TA 2IIYA 3GURA 1TK5B 8GSSA 2LJAA 5ID2B 1XVQA 4NHZA 4K0GA 3GH6A 3TDGA 2OA7A 1GUMA 3G7IA 4MCUA 1PD21 2IMDA 2GGTA 1AQWA 1PX7A 2VM2A 3GH9A 1M2DA 2OADA 2KUCA 1K0DA 2YOIA 4GF0A 1Y25A 5ABRA 2CV4A 2EIQA 3UEMA 2C0GA 2H76A 4ULXA 1J08A 4IP1A 4L0WA 1TK0B 3UAPA 4PUFC 5KN3A 3ZRDA 2PVOC 2V32A 5ID2A 1PKZA 1C72A 4RI6A 3LFLA 5J9BA 4IQAA 4LL4B 4ZXGA 4TXVA 3UBKA 1GSYA 3A2WA 3M8NA 2V1MA 4OD7A 1HD2A 1OC8A 1GSQA 3FR3A 4GSTA 1V2AA 2GDRA 1V57A 4KH7A 1GLPA 1N2AA 1V40A 1TU7A 4KE3A 3CTGA 1V9WA 2OKAA 4K0NA 1THXA 3F0IA 3KJYA 1EP7A 1SKWB 1YKAA 2WFCA 3MDKA 1TP9A 2N5BA 1XOAA 1O7UA 2CVBA 2AYTA 1X5DA 4MPFA 4I6XA 4GSSA 1FW1A 1XWGA 3EVIA 2IWTA 1URMA 4GLTA 1OAZA 2VD1A 4IKHA 6GSWA 4TKYA 1OC9B 3MSZA 5F07A 3KIJA 1XWCA 2H1GA 4XCSA 4BVXA 3DWVA 5IOWA 2F3MA 4YH2A 2K8VA 2LSTA 4XTSA 3CSJA 3D22A 4POMA 9GSSA 3UIWA 4JE1A 3DVWA 2VCXA 2VCWA 1E6BA 2GQKA 2VLTA 2AV4A 3L4NA 4NHWA 5HR3A 5G5EA 2C3TA 2FNOA 1MDIA 2HFDA 3P2AA 4JR4A 1JFUA 2LEGA 2MMZA 1A0FA 1BYEA 3IOSA 5ECOB 3UOMA 1KBNA 2CZ3A 1FOVA 5D8IA 3W6GA 4I8BA 1MTCA 1GTBA 3HXSA 4Q5NA 3HY2A 2H1AA 3ZMLA 2DJ0A 1GSFA 1ZYEA 2VAFA 4WR4A 1FO5A 2M46A 2LRTA 3QPMA 3EMXA 2XPEA 3HDCA 1SYXA 2YWIA 4QL9A 3GTUB 1ERUA 1ZGNA 2OACA 1HQOA 3SWLA 4GQFA 1WIKA 2X64A 4N0VA 2LJKA 3U6VA 1G6WA 1PL2A 4POBA 2X8CA 2DIYA 2GTUA 4HQZA 4OWYA 1EOHA 2OBIA 3E0UA 3HZ4A 4F82A 4N11A 2FWFA 3UL3A 5ECLB 2H71A 2PMTA 2IMKA 4CHSA 3IK7A 1SL2B 1K0CA 2DBCA 5G2ZA 1OKDA 5DQSA 2WULA 2YWMA 5KN2A 1Z7RA 4RQXA 3ZYWA 1AQVA 5AN1A 2DJ1A 1NSWA 1A8YA 4D73B 1ON4A 1RW1A 1SK2A 1BAYA 2H72A 1KTEA 2VL3A 4KNDA 2YPMA 4RQRA 2C3NA 3NZNA 1GWCA 1G0TA 1GTIA 5F06A 4V1Ap 5DDLA 2YV7A 2GVPA 4WKWA 4LL1B 1WP0A 4D73A 2I4AA 3RDWA 3VI7A 1OKTA 2REMA 1DSBA 2O87A 3CSIA 1QGVA 2YZHA 2Z9SA 3A3TA 1K3LA 2CAQA 6GSSA 1XWKA 5GSSA 1M2BA 3D4TA 1T1VA 1GP1A 2P31A 2P5QA 3FW2A 1J9BA 3Q18A 4GTUA 1Z3EA 3C1SA 3ZIJA 2YWOA 4WBRD 4GXZA 3KGKA 4MLYA 2PU9C 1X9WB 4Z7XA 5D9WA 2X99A 3PGTA 4KSMA 1T4YA 1A2JA 4J2FA 1HNBA 3IK9A 4PNFA 2OE1A 2VCQA 2KLXA 3ZZXA 2PBJA 3FEUA 4PUAA 4NPBA 3EMPA 18GSA 5EPFA 1X5CA 4G2EA 1M7TA 1MDJA 5DCGA 4FYUA 5IQYA 4HS1A 1WRYA 4L5OA 4K9ZA 2VUPA 4I2UA 5DALB 4BL7A 1YY7A 4MZCA 4WF5A 1JHBA 4TOPA 4F0CA 3CBUA 2DMLA 4Q5FA 1FAAA 3APQA 5KN0A 2MMOA 3IPZA 1B8XA 4KDXA 6GSYA 4EL1A 2O85A 5H5SA 4PGTA 5HFIA 2JL4A 3O3TA 4P3YB 3IXRA 4O7HA 3TB2A 3HCZA 5IMDA 4K2DA 5J41A 1GSDA 1K0AA 1M99A 3CRTA 5LD0A 5A4WA 1VF2A 2MMNA 1K3OA 2RUFA 1R5AA 5DALA 5DVBA 2RM5A 2LQOA 4E8HA 1G7OA 1FVJA 4TXOB 4MF5A 2H1BA 3GL5A 3H79A 1X5EA 2AB6A 3KMOA 3DXBA 3LQ7A 5L71A 3FZ5A 3VFIA 1QMVA 1YJ6A 3OR5A 5B6NA 1ERTA 5C04A 4KCAA 4OO5A 1ZCPA 3S9FA 4AJ6A 1K0BA 4PNGA 2C0EA 1B48A 1PX6A 5G5FA 3IHQA 3TUEA 3C7MA 3VK9A 3F8UA 3MNGA 2YV9A 4MZWA 4TXOA 3TJKA 2MMAA 3LWAA 3KTBA 1B9XC 4ISDA 2ZCTA 4O5RA 3IRAA 3EURA 1X0RA 3TOTA 1RK4A 2YJ7A 2IMFA 1MDKA 4ILFA 4N10A 1FVKA 3D0ZA 2BMXA 3F9UA 3IR4A 5B8BA 5F05A 5IO2A 1O6JA 4IJIA 1SKRB 1XW6A 2H8LA 1VF1A 5GZZB 1A23A 5ELGA 3C71A 1WWJA 4DSSB 1F9MA 2GZPA 2H6XA 1XWAA 1GSUA 3GUSA 1PRXA 2IPAA 4EUYA 2AAWA 1THOA 3QFAC 1GTUA 2DIZA 3FKFA 2DMMA 1EV9A 3HJMA 4QL7A 4DSSA 2CZ2A 2LQQA 2FHEA 3KH9A 1BQ7A 3FRCA 1I9DA 4QQ7A 3ZFBA 3QAWA 5IMCA 5COHA 3Q74A 4I97A 4HJMA 5FWGA 3GKKA 3APSA 3ZIVA 2GT6A 1J0FA 1SJIA 2DLXA 4LMVA 5HFGA 1R7HA 2I3YA 2VL2A 2H73A 4HU9A 1V58A 5J5NA 5E4WA 11GSA 1JZRA 3EINA 4GQCA 2HSHA 4ZB6A 4MA9A 3HHVA 4JU5A 2I9HA 2DSAA 1H75A 4NWYA 2CVKA 1TRUA 4HQSA 4TR0A 3CXGA 1FHEA 1A2LA 3GRXA 3EYTA 2JZRA 4PQ1A 2NDOA 4ZIJA 2P5RA 4KA0A 5DQYA 3Q6OA 3GKXA 3QAGA 2LJRA 1FG4A 1ZMAA 2XPDA 2WB9A 3KP8A 2GSSA 3G9BA 22GSA 3GSTA 1AIUA 2B5EA 1R5PA 3RHBA 4MABA 4RI7A 2N5AA 3BJ5A 5ECMB 5KEJA 1NHOA 3MAKA 4E8EA 3QOUA 1O8XA 2K8SA 4EE0A 2H0IA 2JADA 2CAIA 2C8UA 10GSA 1U3AA 1WOUA 5IIZA 1A2MA 2CA8A 1KEBA 1XVWA 3WGXA 4GRFA 2WRTA 4NV5A 3W8JA 1QXHA 3ME8A 4IBPA 5INYA 2MYGA 3LXTA 2MBSA 3F3QA 4K6XA 1F3BA 4G9HA 4HUAA 2B1KA 4ACSA 1TDIA 3R2QA 1O73A 1MEKA 2R37A 4TR4A 2H74A 2VL9A 2VM1A 1HNCA 1ERWA 1T3BA 2OJLA 3ED3A 2H01A 3ZVJD 2VIMA 3VPTA 4TR1B 4HI7A 4EO3A 2KOKA 5A4UA 1TK8B 1OC9A 2L6DA 4MF6A 3FZAA 1Z6NA 4G19A 1YZXA 5CREA 3L78A 1XXUA 2VL2C 3DEXA 1M9BA 3NOFA 4CW9A 4WEYA 2CX3A 3WT1A 1GRXA 4BVYA 4F03A 4N0ZA 2F8FA 3SBCA 4DVCA 4K7IA 3DIEA 3O76A 1SK0A 3EU3A 5CAXA 2CVDA 4OFNA 2E2MA 5CRWA 4TN8A 1EV4A 4TR1A 2ES7A 4MMMA 13GSA 1YEXA 1BEDA 1SL1B 5DAKB 3LJRA 4FYBA 2XC2A 5GAPD 3QR6A 1AW9A 5HR0A 1K3YA 2M72A 3C1RA 4ID0A 3TOUA 2FWHA 2C4JA 2VOCA 2GSQA 2ALBA 2X8GA 3H93A 3U5RE 3D4MA 1A0RP 3RPPA 1DBYA 2H6YA 2DJKA 2FUG2 3DMLA 3EE2A 4HDEA 2N5FA 2IFQB 5ENUA 5LCZA 5D73A 3UVHA 1LU4A 5B8AA 2H75A 3H1NA 2OBKA 3GTUA 4DSRA 3GMFA 5DAKA 4ZBBA 2L5LA 1SYRA 3CMIA 2JU5A 4HJ2A 3ZFLA 2V6OA 4KAEA 5IMFA 5D9XA 1U6TA 2R3XA 4XS1A 4KSOA 5JWQB 2FWGA 2J9HA 2IFQA 1GSSA 1FB0A 3F3RA 1GLQA 2E7PA 1IYIA 3F4TA 2A2RA 2HI7A 2CT6A 3VI5A 1AXDA 3F4SA 3N9JA 1Z9HA 1O85A 2ZUPA 2GT5A 1HNAA 3L9UA 5ECIB 5ELAA 2R2JA 4K1FA 4X43A 1ERVA 1GNEA 2B1LA 4ECJA 5H5RA 1Z5YE 5G1KA 2H0GA 3WYWA 1KNGA 2WJUA 4PQIA 19GSA 4K7NA 3HKRA 3FR6A 5AISA 1EEJA 4IQ1A 1ZZYA 5AIVA 3D6IA 5GAND 5IPHA 1TJDA 1S3AA 4IS0A 2G0FA 2A4VA 2YZUA 1JLVA 5JCGA 4LA1A 5IM9A 3GV1A 4LMWA 4FH8A 1TW9A 4EXJA 4MF7A 1XPVA 4XS6A 3RAZA 5CRGA 5A4VA 3FZ9A 2RUEA 3J7Yk 3L9SA 2M80A 2GSTA 1BG5A 3IE3A 2H0HA 1NM3A 2TIRA 3GYKA 3IV4A 2FA8A 4L0UA 1PA3A 4MJBA 4TW5A 3KP9A 2DJJA 2YWNA 4XRDA 3HVXA 3M0FA 2L57A 4HOJA 3LXZA 2YCDA 3L9VA 16GSA 1GUHA 2O89A 1WPIA 2HNLA 2PWJA 1DE2A 1Q4JA 5CNWA 4TR3A 2YJHA 1G6YA 2B5YA 1F37A 2LRNA 5F0GA 2GZZA 3UBLA 1PGTA 2D2ZA 5H5QA 1GUKA 1UA5A 1GH2A 3C73A 4IHUA 4KUNA 3LSZA 1BX9A 1XW9A 2H70A 1OYJA 4LLRA 1O8WA 4GCIA 3GHAA 4OO4A 4ZL7A 3G7YA 4F2IA 1ILOA 1LBKA 4JZQA 3J7Yb 2PERA 2R5GA 2HZEB 1YDKA 2JSZA 1EGOA 5LNKe 3BD2A 4J57E 1AUCA 2FCHA 2FA4A 5KN1A 2LRCA 3ERFA 2GSRA 3H4KA 1TI3A 4MH2A 1ST9A 3IDVA 2TRCP 4JBBA 4X1UA 2PUKC 4BPYA 2ZNMA 3KH7A 2WDUA 4L5LA 2EIOA 4EF0A 2IMEA 4EDZA 2HZEA 2XBIA 4I5QA 4X0XA 1T7PB 4TVEA 3PINA 2H1DA 4YAPA 5IMZA 2YP6A 5D93A 3GIXA 3C8EA 3DVXA 3W8SA 1SL0B 4YQMA 3F4RA 3HJPA 4JEDA 2C80A 3GFKA 4MPGA 4POLA 3BCKA 1AQXA 3A5WA 1XZOA 2MZCA 3APOA 5FT3A 1K0MA 2E2GA 2AHEA 3M9KA 3FZ4A 2JACA 3MWHA 2BTOT 4MJEA 1ZL9A 3HA9A 1YEPA 4MJCA 2F8AA 3VWVA 3EU4A 3QCPA 2B3SA 4XRAA 1B4PA 1E2YA 1PMTA 1RQMA 2FD3A 1OE8A 4WBJA 3O6TA 2VCVA 2RIIA 4ZBDA 3CSHA 1B4QA 1A8LA 1O81A 1QQ2A 4EVMA 1T4ZA 4KB3A 4IW9A 2WS2A 3GKNA 3LYKA 2LNTA 3ZVJA 3WD6A 2HT9A 2I1UA 2K9FA 2V41A 3P8WA 5JWRB 6GSUA 4ZL8A 5JCWA 2HYXA 4KCEA 3VWXA 2YANA 3CRUA 4ML1A 3NIVA 2H66A 1HYUA 3A2VA 3GKMA 5G31A 1Z7PA 4OMVA 5A5KA 3LGCA 1XCCA 3TKRA 1N8JA 1TKDB 2B6MA 2NVLA 5C00A 1YF1A 2JZTA 2K18A 1T00A 3F63A 5AIXA 3EC3A 1TTZA 5ECHB 1SD8A 1UN2A 1NHYA 3AY8A 3M9JA 2X8HA 4AF2A 3HZ8A 5CYYA 1QK8A 3KZQA 1GSEA 1EP8A 4O92A 5IMVA 5DCHA 5ECQB 4Q5RA 2RLIA 1ACVA 2IMIA 4V2NA 2JZSA 5IPGA 1F3AA 2AUVA 2VO4A 4N30A 1NW2A 3LORA 1GTAA 3TRXA 1EGRA 2H19A 2QKEA 1XBSA 5DJMA 3KEBA 4GSNA 3GSSA 3TKSA 4BA7A 2C0DA 2I81A 3GA4A 1R26A 4IELA 5D96A 1ZYQB 1SK1A 1H4OA 5J9CA 1A24A 2HZFA 17GSA 5ECPB 5HR1A 2YN1A 1SKSB 3GX0A 1OE7A 3E3EA 4PXOA 2L4CA 4OFTA 2FLSA 4AJ7A 2JSYA 1V98A 2B7JA 2WCIA 2ON7A 1F6MC 3HVSA 4EDYA 1EOGA 1IYHA 1GNWA 4AJ8A 2HLSA 2VCTA 2B5XA 2IL3A 4OCEA 4RUVA 3FY7A 2B7KA 3LYPA 1OVNA 1PKWA 1CQGA 2KP1A 5B6MA 4ECIA 4EC0A 4CDOA 4HZ2A 2LUSA 3K8NA 4HEA2 1M0UA 4WXTA 1R4WA 3VPQA 2XHFA 4KDYA 3CTFA 2CX4A 4PX1A 4F9ZA 1TRWA 3JCML 2IN3A 3E9JB 3QMXA 3TKPA 2G2QA 3PR8A 4YQUA 1Y6EA 4ZBAA 2LKUA 1W89A 3GNJA 4O32A 5EVOA 3I43A 2DC5A 3HD5A 1S3DA 3H8QA 4MK3A 3F6FA 4BWQA 4Q5QA 3QAVA 3TGZA 1X9MB 3EWLA 2J23A 2CQ9A 4MJAA 5AGYA 1BJXA 3P7XA 1EWXA 3I9V2 4L8EA 2EC4A 4IN0A 3IAM2 4ML6A 2RM6A 4F0BA 1PL1A 1EEMA 4EKZA 4ECBA 5J4UA 3N5OA 2V6KA 1DUGA 2DJ2A 1WJKA 3M3MA 4MZBA 2NPBA 5ECKB 3GL3A 5G30A 3KCMA 2VD0A 1VF4A 3KD0A 4POKA 3RBTA 2FWEA 3DKSA 4YQVA 5F8BA 3TKSC 3DD3A 1T8EB 4AGSA 3DGQA 1USBA 4FO5A 1SJZA 3KM6A 1ZOFA 1YKCA 1Q98A 4JRRA 5DBQA 3ERGA 3FYGA 1GULA 3WGEA 3L0HA 1OC3A 3GX8A 3A2XA 3HVVA 4V2MA 2AJQB 1AAZA 1YF0A 3TCOA 3HJOA 4PQHA 2V2GA 3BBYA 2FGXA 4MDCA 1XOBA 2XBQA 6GSTA 1SENA 3ISOA 1GL8A 3KXOA 3TRPA 4XS4B 1AC1A 1W4VA 2GQLA 2OE0A 4WETA 3DYRA 2KHPA 2LNSA 3CYNA 4OFMA 1JZDA 2PVQA 5CP1A 1JZWA 1PQNA 4GWRA 1CQHA 1ABAA 1QUWA 2F51A 1TRSA 5IMAA 5HQPA 3ZL5A 2A2SA 3UARA 2R6KA 5DJLA 3QD9A 5CRDA 2YNXA 2GS3A 2MBTA 2BJXA 2H6ZA 2O7KA 4MP4A 2DJ3A 4XS4A 3VURA 3HYPA 1UC7A 1TI1A 1M9AA 4HU7A 1I5GA 2GLRA 2GQMA 5CO3A 3TJBA 5ECSA 5D9VA 5HFKA 5IOXA 5JCUA 2FY6A 3IA1A 12GSA 3VLNA 5FHIA 3RPNA 2L59A 3F6DA 2HE3A 4ZL9A 5JWOB 1K0OA 4NXIA 3FR9A 1B9YC 5EL8A 3KMNA 2QSIA 3IC4A 1K0NA 1SD9A 2ON5A 1TRVA 1F2EA 3TRQA 2K6VA 2P0GA 5J3RA 3LG6A 4K7OA 4I2TA 2H30A 3PH9A 2F9SA 4DEJA 3BCIA 1U88A 4K8MA 1XW5A 4KX4A 6GSVA 3VWUA 4MH3A 5B7CA 4BWSA 2L4QA 4KDUA 3IAS2 1SU9A 5EY6A 3V1WA 3ZTLA 1WE0A 3TJGA 3WT2A 6GSXA 1TXXA 4ZB9A 5ECRB 20GSA 4ZB8A 3I6AA 3QDNA 1XFLA 1VF3A 4ZILA 1M2AA 3TKSE 1Z6MA 5CRHA 2GZYA 3UJ1A 4IGJA 1S3CA 1X9SB 2WZ9A 4WF4A 4G10A 5G1LA 5GSTA 2L5OA 4TRXA 2PN8A 3FHKA 4J56E 3UVTA 5IO0A 2L6CA 1PSQA 3D21A 1MD4A 3M1GA 2C1YA 4IP6A 1VGLA 1QFNA 2LV3A 1ML6A 2LS5A 5HR2A 4OCFA 3LEFA 3WGDA 2VLUA 4JR6A 4DSQA 3P90A 3Q19A 2IJYA 1VRSD 2O8VB 2NBSA 2TRXA 1XWBA 1G7EA 3UMAA 3QFBC 3TKQA 4V1Ag 4XIHA 1MD3A 2WGRA 4FYCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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