1ACVA

Dsba mutant h32s
Total Genus 63
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
63
sequence length
188
structure length
188
Chain Sequence
AQYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPSCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVPAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural analysis of three His32 mutants of DsbA: support for an electrostatic role of His32 in DsbA stability.
pubmed rcsb
molecule tags Disulfide oxidoreductase
source organism Escherichia coli
molecule keywords DSBA
total genus 63
structure length 188
sequence length 188
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-02-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1acvA00
1K3LA 3QD9A 3DKSA 1EEJA 2E7PA 4Q5QA 2EIOA 4ZB9A 1ZL9A 3GX8A 2R3XA 2WCIA 3KH9A 3TJJA 1QMVA 1USBA 1AAZA 1WIKA 1XZOA 4O92A 1V9WA 1MDJA 2MMAA 4ECJA 1WE0A 2RM5A 1HQOA 6GSUA 3BCIA 1V40A 5DAKB 4GTUA 2XPDA 3H1NA 2BJXA 4HI7A 1EEMA 2H8LA 4PNGA 5IMDA 3F3RA 4KDXA 4N0ZA 5EVOA 1K0MA 5HR2A 1TXXA 3ZYWA 1RQMA 4JU5A 4ZB6A 1FVKA 2GSSA 2YV7A 3FHKA 4WBJA 3GSTA 4G2EA 2P31A 3EU3A 4OFMA 3FZ4A 3KH7A 3VLNA 3QFAC 2XHFA 1KBNA 4KUNA 3W8SA 1TTZA 2OA7A 2YANA 1SKRB 4EDZA 1O8WA 2DMMA 5AIXA 4F82A 1OE7A 2V41A 3EMXA 3JCML 3IC4A 4MJEA 2HZEA 4ZBAA 2PWJA 4Q5NA 3TOUA 1NM3A 5G31A 1V58A 2K6VA 1RK4A 4X43A 3DGQA 4MMMA 5IMVA 3ERGA 5AN1A 5ECHB 1BEDA 2GSTA 2IN3A 1UN2A 4J2FA 5IM9A 2DJJA 2MBTA 3VPTA 4XIHA 2L59A 3F63A 5F05A 3GIXA 4MH3A 1HYUA 1F6MC 3TJKA 2OBKA 3ZIJA 3KXOA 14GSA 2FWFA 2PPTA 2DJ2A 3D22A 4NMUA 4HJ2A 1Z6MA 3QAVA 1YDKA 1EP8A 3IXRA 4IJIA 1PD21 1O8XA 4TR1A 4NHZA 3VI5A 2C80A 4G9HA 2MMOA 1DE2A 4MA9A 4ZL9A 3OR5A 4NV2A 4F0CA 3KMOA 2CX4A 4RQXA 13GSA 2YN1A 2RLIA 4G10A 2VD1A 2Z9SA 2H0IA 1SL2B 2FWHA 5ENUA 2HNLA 4OO4A 1ON4A 5DCHA 1YZXA 3EYTA 1JHBA 2VAFA 4I2UA 3C1RA 3L78A 2WJUA 3NIVA 4MF7A 3GNJA 2B5EA 3QR6A 2O7KA 1FG4A 4LMVA 4BWQA 1ZMAA 2CX3A 3WGEA 5IMFA 1JZRA 3I43A 1K0CA 4HJMA 4BA7A 4V1Ap 1R4WA 2LSTA 1PL2A 5E4WA 2JSYA 4I6XA 2WGRA 4JR6A 4IW9A 3QAGA 2CV4A 5IMAA 1N2AA 1XW5A 2E2GA 2KUCA 2B7JA 2D2ZA 3HVVA 4OCEA 1XIYA 3QFBC 1F37A 2KP2A 4IKHA 4PURA 2CQ9A 5EL8A 3WT1A 4AJ8A 5ECSA 2VIMA 3DD3A 3UEMA 1TRWA 2C0EA 2V2GA 1OAZA 1M9BA 2LV3A 4KW6A 2GQMA 2J9HA 5GZZB 3FEUA 2VLVA 4GXZA 5F07A 4XS4B 2FWGA 5CP1A 4F03A 1GSSA 1XWBA 4ECIA 5A4VA 1RW1A 5CNWA 4K1FA 5DVBA 4KSOA 3RPPA 4IN0A 6GSSA 3TKPA 1B9XC 4KDYA 1ERUA 3IOSA 3LJRA 5J5NA 1GWCA 2YJHA 1OE8A 1SJIA 2GZYA 1AC1A 3RPNA 3CYNA 2PBJA 1A8LA 1PGTA 5HR3A 3UOMA 3FY7A 1ZCPA 5CRDA 3TCOA 5IPGA 4HUAA 1M2DA 1OC9A 1SK1A 1YEXA 2O85A 2GZZA 3H93A 2I9HA 1YEPA 1EOGA 4XS1A 3PGTA 4ECCA 4JR4A 4WKWA 2H74A 1BJXA 2VM2A 1GLPA 3F3QA 5A4WA 3IE3A 1ABAA 3P2AA 3L4NA 1O85A 2WFCA 4X0XA 1MDKA 1VF1A 1B4PA 3IDVA 4CHSA 2LNSA 2CA8A 5H5QA 1Y25A 1OKDA 3FZAA 2LKUA 5DDLA 3APQA 3M9KA 2HZEB 19GSA 2AB6A 2GQLA 2YZHA 5ID2B 2XBIA 2REMA 4NPBA 4MP4A 3DMLA 3G7YA 4KB3A 2GQKA 5DCGA 4PGTA 4OMVA 3GKKA 3IBHA 2IMDA 1XWKA 1T1VA 2JACA 3RAZA 2I3YA 2PVQA 2R4VA 4TXOA 2H72A 2CT6A 1G6YA 4TR0A 4IS0A 4MLYA 4EO3A 1TRSA 4TR1B 3LYKA 4ZIJA 3ME7A 2B1KA 5AISA 2EIQA 3AY8A 4HS1A 4JEDA 3ED3A 2CAQA 1A2MA 4RUVA 4GSTA 1XW6A 5CRHA 3W6GA 5D96A 2N5BA 2RIIA 4I97A 1EV9A 2GSRA 1EOHA 4L5OA 5JWQB 2DIZA 1BYEA 2RM6A 1T7PB 5DQYA 4L5LA 1B9YC 2EIRA 4OWYA 1GULA 5INYA 3C1SA 2F8FA 5ELGA 3ZTLA 3LG6A 4JRRA 1WRYA 1DBYA 1FW1A 2VL3A 4IQ1A 2YWIA 4EL1A 1AQVA 1O7UA 3ZZXA 5J4UA 4AJ6A 3ZL5A 1BAYA 2C1YA 2V6KA 4QQ7A 3LORA 4NV5A 2MYGA 1SYXA 4LMWA 2CZ3A 2VCXA 3DWVA 3LGCA 4HEA2 4EKZA 3TB2A 2FLSA 5L71A 5ECRB 5J9BA 1XPVA 1ACVA 3UIWA 2ZNMA 4I8BA 4EUYA 1DE1A 3SBCA 4BL7A 5DALA 4TR3A 3EVIA 3TKRA 1GUKA 2VL2C 1PX7A 3BJ5A 4F2IA 3HJPA 8GSSA 1FO5A 5KN1A 1WOUA 4ISDA 3HVXA 2AJQB 3C8EA 1XW9A 1JZWA 2L6CA 2DJ1A 2OJLA 1FB0A 1K3OA 3GL3A 2H6XA 2C0FA 5CRWA 4V1Ag 5G5FA 3LXTA 1N8JA 4BVXA 2GSQA 2HXKA 1WP0A 2HFDA 4O7HA 4O32A 1ML6A 1Z5YE 3PR8A 1TU7A 1YY7A 2ALBA 1WJKA 1JLWA 2HLSA 3L9UA 1ERVA 5AIVA 3QOUA 1F2EA 2AV4A 4MZBA 2BMXA 2ES7A 1OC9B 2GDRA 3HHVA 5IO0A 3UARA 3FR9A 4ULXA 1B8XA 4Q5RA 2CAIA 5G1LA 3ZITA 4K8MA 1U88A 1X9WB 6GSYA 2B1LA 1EZKA 1A8YA 2CVKA 3TRPA 2AUVA 2AYTA 4K7OA 4YAPA 4POBA 4WR5A 4XRDA 4PXOA 2FCHA 1K0OA 1M7TA 4DSSA 4LA1A 5FHIA 4AF2A 3VURA 1PX6A 3GHAA 1KEBA 2GTUA 3M1GA 4IBPA 2FUG2 3DIEA 3IA1A 3ISOA 3M9JA 1U3IA 2JZRA 1EWXA 4CDOA 2H0GA 3GKNA 3H79A 3UL3A 3CMIA 3Q6OA 1GTAA 1R5AA 3RHCA 3P7XA 3GMFA 1GRXA 5J3RA 3KGKA 2VCTA 2X64A 3QPMA 1J08A 4JZQA 2GVPA 3TKSE 1U3AA 1QUWA 3D4MA 2N5AA 4K9ZA 2QSIA 4WR4A 2LTKA 4Z7XA 3ZIVA 3GRXA 3CBUA 3GH6A 2MZCA 1AIUA 2O89A 3WGDA 4DVCA 2RUEA 2I4AA 4GQFA 3IRAA 4GCIA 2H71A 2NBSA 3NOFA 1NHOA 5AGYA 4V2NA 1NW2A 4MCUA 1M0UA 2YOIA 1FVJA 3DYRA 3LWAA 20GSA 2YZUA 5F0GA 1AUCA 1WWJA 3CSIA 5DJLA 1GLQA 1H75A 1A24A 1J9BA 2HE3A 4TW5A 3H8QA 1EGRA 3EU4A 11GSA 3CTGA 4PQHA 2XBQA 2WDUA 3A2WA 2F3MA 4LL4B 2X99A 3IV4A 4PUFC 2R37A 2C3NA 5IO2A 3ERWA 4EF0A 2YV9A 4MABA 1V57A 1AW9A 4K7IA 4OCFA 3I9V2 3ZRDA 2PUKC 3CRUA 4HZ2A 4TVEA 1GSUA 3SWLA 3K8NA 1G7EA 1SYRA 2H73A 1EP7A 1T00A 3WT2A 5G2ZA 1V98A 2R5GA 3V1WA 3IHQA 2KOKA 3GL5A 12GSA 2I81A 5IMZA 3M8NA 2LEGA 2PERA 3FYGA 1R26A 4J56E 4HZ4A 1GUMA 4BVYA 2G0FA 5LD0A 1TDIA 1GL8A 2V1MA 5CREA 4I5QA 2M80A 4KE3A 3VFIA 3L9VA 4WF4A 3R2QA 5HQPA 1WMJA 5DALB 2TRXA 2KLXA 3E9JB 2P5RA 4KCEA 4WXTA 4FH8A 4N11A 5HFIA 3DXBA 4KNDA 2B6MA 2LRNA 4HU7A 2LRTA 3GH9A 3M0FA 5GAPD 1XVQA 1E6BA 3HCZA 1ZYEA 2H1BA 4DSQA 1X5EA 2YWOA 1JZDA 5ECIB 3ZREA 3GYKA 3IK7A 1B4QA 22GSA 4FO5A 1T8EB 4XTSA 4GSSA 2C4JA 2H75A 4XCSA 2C3QA 1F3BA 3P90A 3UAPA 4ILFA 1O6JA 3D0ZA 5CO3A 6GSWA 1I9DA 1W89A 3TJBA 3M3MA 4QL7A 2VM1A 4X1UA 1Z7PA 4IHUA 2X8GA 4ZILA 2VCWA 2B5YA 5ABRA 9GSSA 3A5WA 3ME8A 4D73A 2HSYA 2K8SA 1E2YA 4ZBBA 4K0GA 4YQVA 2H70A 2DJ0A 5B8AA 3EURA 5ECOB 1K0AA 2LJKA 5GSTA 2V6OA 4FIWA 4DSSB 4IVFA 1HNAA 5G5EA 1TP9A 4TR4A 2FHEA 1PSQA 1OVNA 2ZCTA 2DC5A 1A2JA 3FW2A 4YH2A 2OKAA 2FD3A 17GSA 1SD9A 4PNFA 3C7MA 2WRTA 1PMTA 1JFUA 3MDKA 4E8HA 1THOA 3ZFBA 1PN9A 2H1DA 2JL4A 4OFNA 4MZWA 4BWSA 4ACSA 1X9SB 1VF3A 1GTBA 3PH9A 3O76A 5ECLB 1B48A 3D21A 1SK0A 3GSSA 2J23A 2FGXA 1HD2A 1YQ1A 1GSYA 1M2AA 1TOFA 3EWLA 4YQUA 4BPYA 2WULA 1X0RA 4RI7A 2CVDA 3UBLA 4HQZA 5KN2A 1TKDB 3IPZA 5LCZA 4MPFA 1V2AA 2H30A 4POMA 4WETA 4ZB8A 4IJ3A 1GSQA 1GTIA 2FA4A 3TUEA 1Z3EA 2OACA 5A4UA 1Q4JA 2IFQA 3NZNA 1M9AA 3UVTA 4AGSA 2KP1A 4KSMA 3J7Yb 1YF1A 3MSZA 4HQSA 3D6IA 2VL9A 5DQSA 4HU9A 2RUFA 2GGTA 2OBIA 3UJ1A 1URMA 3CRTA 5FT3A 3ZMLA 3WYWA 2A2RA 3VI7A 1AQXA 1SENA 2PGTA 3VWWA 1IYHA 4TXVA 2GT5A 10GSA 2LJRA 3HDCA 2PVOC 1TW9A 4YQMA 3APOA 3CSJA 4L0UA 5HFKA 3UBKA 2WS2A 1VRSD 4DSRA 1AXDA 5JCUA 2HRFA 5F06A 1Z9HA 1FAAA 2V32A 2LNTA 4EVMA 1G7OA 2FNOA 2M46A 3TRQA 4N30A 3D4TA 1GUHA 4FYUA 1TU8A 1UVZA 2P0GA 4ML6A 2NVLA 4O5RA 3HZ4A 3A2XA 1XFLA 1A23A 5JCWA 1ERWA 2H1AA 4LLRA 5ECPB 1XBSA 1Z6NA 4L0WA 3RBTA 1DUGA 4OFTA 2LQOA 3O6TA 4J57E 3ZMKA 4V2MA 2TIRA 1T4ZA 2OE3A 2QKEA 5CYYA 4TRXA 1GTUA 2JU5A 1XOBA 2L5OA 2R2JA 4ZL7A 2AHEA 1ILOA 3GKMA 3LYPA 1XVWA 4ZBDA 3Q19A 5LNKe 5B6MA 3FR6A 3VWUA 2NDOA 1QK8A 5G1KA 2BTOT 5GSSA 4JBBA 3S9FA 4HDEA 1SJ6A 1FOVA 2IMKA 3KP8A 1QFNA 3C71A 3FR3A 4EC0A 1HNBA 4RQRA 1G0TA 3TKSA 1MD3A 3GURA 7GSSA 4PQIA 1GSFA 2G2QA 2L4QA 2VCQA 3L0HA 2XC2A 3EINA 5IPHA 3KJYA 4K7NA 1T4YA 3LSZA 3GA4A 4HOJA 3BBYA 3F8UA 1ERTA 3F9UA 4XHMA 3N5OA 1TJDA 3GKXA 3TKQA 3IK9A 4MPGA 4D73B 6GSTA 4Q5FA 3GX0A 5H5RA 1UA5A 3QCPA 5B6NA 1Z7RA 2LUSA 1TK0B 1M99A 2HI7A 4N0VA 3KCMA 4EDYA 1AQWA 2EC4A 5A5KA 4KH7A 6GSVA 5HR1A 1I5GA 5D8IA 5C04A 1H4OA 1TI1A 5D73A 3ZLPA 1KTEA 1A0RP 1LBKA 4L8EA 4MDCA 1U87A 3A2VA 3A3TA 3HXSA 2E0QA 1G6WA 4NAXA 1SKWB 3DVWA 3FZ5A 4IP6A 2H01A 3ERFA 4KDUA 2A4VA 1PKZA 3FZ9A 1PRXA 4NXIA 2X8CA 3F4SA 2PU9C 4FYBA 2B7KA 3CSHA 2F9SA 4MF5A 3LQ7A 3E0UA 3L9SA 3HKRA 2HZFA 2LRCA 4MZCA 3GUSA 3HA9A 1ZYQB 4CW9A 4NWYA 1EV4A 1SK2A 5ID2A 4TXOB 1XXUA 2PN8A 1NSWA 2M72A 3RHBA 2H0HA 3RDWA 3MNGA 5KEJA 4MJCA 2DJKA 1R5PA 1K0NA 2HT9A 4MH2A 1YF0A 2IFQB 4ID0A 3TGZA 1FB6A 2QGVA 1MDIA 4MJAA 1F3AA 4KGIA 3P8WA 1XWAA 1PL1A 5EY6A 3VWVA 1VF4A 2H1GA 3GN3A 1TRVA 3KZQA 4GRFA 6GSXA 3VPQA 2HYXA 2YCDA 2IMEA 1Q98A 3EE2A 2NPBA 3QDNA 3GTUA 1YJ6A 2LJAA 2IMIA 1MD4A 2IL3A 3G7JA 4G19A 4K2DA 2DLXA 2VO4A 4F9ZA 4V2LA 4WF5A 3FRCA 2VCZA 1OKTA 1GH2A 3WD6A 5FWGA 3Q18A 2C8UA 2FY6A 2B3SA 1Y6EA 3F6DA 3I69A 3WGXA 5D9TA 3J7Yk 1EGOA 4KA0A 1X5CA 2IPAA 4XS6A 3G9BA 1GNEA 5J9CA 2IWTA 3KMNA 1ZOFA 1SU9A 2YWNA 2ON5A 3W8JA 1K0BA 1VGLA 2VLTA 2GLRA 2XPEA 2WB9A 1DSBA 2OE0A 1PA3A 1A0FA 4P3YB 1QQ2A 1GSEA 3TJGA 3EMPA 3PINA 3APSA 3KTLA 1LJRA 5ELAA 4IP1A 4XRAA 5G30A 3VWXA 2YJ7A 1C72A 4QL9A 2DJ3A 1SJZA 3KEBA 2H19A 5IOWA 1W4VA 1QGVA 2OE1A 4RI6A 2F51A 2K18A 5D9VA 4GQCA 3LFLA 1QXHA 4GLTA 3HD5A 3KP9A 3IR4A 4IGJA 4GWRA 1LU4A 2L6DA 3I6AA 16GSA 2IIYA 3N9JA 2CZ2A 2LQQA 4MK3A 3TDGA 2N5FA 5HFGA 1TK5B 5IQYA 1ZGNA 1GSDA 5GAND 5IOXA 3HVSA 3U6VA 4E8EA 4JE1A 3EC3A 4MF6A 4WBRD 4ZXGA 2YWMA 4DEJA 2TRCP 4K0NA 5CRGA 3UMAA 1JLVA 4OO5A 3CTFA 2B5XA 3LEFA 4PQ1A 3KIJA 3O3TA 2GS3A 1PQNA 1K3YA 2VUPA 2MMZA 1OC8A 5B8BA 1IYIA 3TRXA 3KM6A 4OD7A 3LXZA 3ZVJD 2KHPA 5DAKA 4EE0A 3DRNA 4I2TA 2JSZA 4LL1B 1UC7A 4GF0A 2H76A 2DBCA 4ZL8A 3VK9A 1SL1B 2F8AA 3HJMA 3KTBA 4POLA 3F0IA 2O87A 1XCCA 1U6TA 1PKWA 3US3A 4TOPA 3F6FA 1YKAA 3IAM2 1BG5A 4ML1A 4KX4A 3C73A 5ECQB 3BOAA 3FK8A 5DJMA 3GV1A 2O8VB 1YKCA 2ZUPA 1F9MA 2FA8A 1XWCA 1JZOA 2A2SA 2AAWA 4FYCA 1A2LA 5KN3A 4IELA 2ON7A 1TK8B 5CAXA 3QAWA 2VLUA 3UVHA 5JWRB 2PMTA 5HR0A 5JWOB 4YAVA 4MJBA 1NHYA 1FHEA 4POKA 2VD0A 2GZPA 4AJ7A 1BQ7A 1KNGA 1XOAA 3TOTA 5KN0A 5C00A 3CXGA 1ZZYA 2IJYA 3F4TA 4KCAA 5H5SA 3DEXA 3GTUB 3HY2A 2HRNA 2OADA 2VOCA 1THXA 4H86A 1SKSB 3TJFA 2H6YA 3F4RA 2FWEA 3FKFA 4IQAA 2K8VA 1T3BA 1O81A 3H4KA 3IAS2 5D9XA 1S3AA 5ECNB 4F0BA 3HYPA 1VF2A 1OYJA 1S3DA 2L5LA 2L57A 2K9FA 2X8HA 1GNWA 4ECBA 2QC7A 3ZVJA 1TI3A 5EPFA 1X9MB 3DVXA 3E3EA 5ECKB 1CQHA 1CQGA 1MEKA 1BX9A 3KD0A 4KAEA 4WEYA 1S3CA 18GSA 5COHA 2LS5A 1SD8A 2H66A 5ECMB 2JZTA 2DIYA 3HZ8A 5DBQA 2C0GA 2JZSA 2IMFA 1GP1A 3D5JA 5B7CA 2NTOA 4PX1A 3MAKA 1R7HA 5D93A 2YNXA 2HSHA 2E2MA 3U5RE 1K0DA 2C0DA 2GT6A 3G7IA 1O73A 1OC3A 2VL2A 5E59A 3MWHA 1J0FA 5IMCA 2VCVA 4NHWA 3ZFLA 5D9WA 2CVBA 1M2BA 2R6KA 4TN8A 3BD2A 4K6XA 3Q74A 1TRUA 2DMLA 2YPMA 3GFKA 2P5QA 2WZ9A 2DSAA 1WPIA 2H6ZA 4EXJA 4N10A 2YP6A 1XWGA 2MMNA 4XS4A 5IIZA 1ST9A 5J41A 4GSNA 3TKSC 2C3TA 2JADA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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