The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
58
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structure length |
58
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Chain Sequence |
GKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule keywords |
ALPHA-SPECTRIN
|
| publication title |
1H and 15N NMR assignment and solution structure of the SH3 domain of spectrin: comparison of unrefined and refined structure sets with the crystal structure.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Gallus gallus
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| molecule tags |
Cytoskeleton
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| total genus |
13
|
| structure length |
58
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| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-03-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3EGU A; 1X6G A; 1UHC A; 2FRW A; 3SHW A; 1VYT A; 3M0P A; 4GBQ A; 2LMJ A; 4OMO A; 1WLP B; 2FPD A; 2DA9 A; 2YUQ A; 1X2K A; 4Z8A A; 1WXU A; 1T3L A; 4F14 A; 3TVT A; 1AEY A; 1T3S A; 1GCQ C; 2B86 A; 3EG2 A; 4JZ4 A; 3KFV A; 1UTI A; 3UF4 A; 3QWX X; 2D8J A; 1G2B A; 1SRM A; 3RNJ A; 2LP5 A; 2YDL A; 1V1C A; 1KFZ A; 2A08 A; 2KBT A; 1HSQ A; 2J6K A; 1JQQ A; 2L3Q A; 1WYX A; 5IHI A; 2BZ8 A; 2FG0 A; 1GFC A; 3I35 A; 1H92 A; 1NEG A; 1MV3 A; 2AKK A; 3H0H A; 5GJW B; 3H0F A; 3A98 A; 4LNP A; 4RTZ A; 4JPB W; 1QCF A; 2ROL A; 2LQW A; 2DMO A; 2L3S A; 4LE9 A; 1OV3 A; 2DL5 A; 4AFQ C; 2BZY A; 1YWO A; 2RNA A; 3QWY A; 1AWJ A; 2L2P A; 1Z9Q A; 2HSP A; 4D8K A; 1YWP A; 4FSS A; 1UJY A; 4D8D A; 1I0C A; 1LCK A; 2D0N A; 2EBP A; 4J9F A; 4KRT A; 1Y0M A; 4RTV A; 2ENM A; 2LX7 A; 1AWX A; 1B07 A; 1WX6 A; 1GCQ A; 4ORZ A; 4LUD A; 1QKX A; 4Y92 A; 4AG1 C; 2KE9 A; 1Y57 A; 3SEM A; 2KGT A; 1GRI A; 5IHK A; 1KJW A; 3THK A; 1SHF A; 3TSW A; 1J3T A; 1AD5 A; 2DL4 A; 1MV0 B; 1JXO A; 2FPF A; 1PKS A; 1RLQ C; 1PHT A; 2C0I A; 3VRZ A; 3REA B; 4Z88 A; 2RQT A; 1ZUY A; 1NM7 A; 4OMM A; 2NUZ A; 2A37 A; 1EFN A; 3R6N A; 3PVL A; 2DX1 A; 5GJV B; 3TSZ A; 1K1Z A; 1H8K A; 3ZL7 C; 1WIE A; 4E6R A; 2EYY A; 2CH4 A; 2J05 A; 4A63 B; 1UE9 A; 4AG2 C; 5L23 A; 2AKL A; 3O5Z A; 2JMC A; 2ECZ A; 3JV3 A; 2AZV A; 2KT8 A; 4OMQ A; 1I07 A; 1QWF A; 4OML A; 1U3O A; 2F2V A; 4R0K A; 3NPF A; 2BZX A; 4DEY A; 2LJ0 A; 2XMF A; 4RTW A; 1K4U S; 1W70 A; 1QWE A; 1X69 A; 1TUD A; 1WFW A; 5IXF A; 3EG3 A; 2VKN A; 2YUO A; 2VWF A; 3FJ5 A; 3EHQ A; 2RQR A; 2DE0 X; 2EYZ A; 1I1J A; 3VS3 A; 2K6D A; 1W1F A; 4J9E A; 2JM8 A; 4CC3 A; 1CSK A; 3PE0 A; 4J9B A; 3REB B; 3VS4 A; 5I22 A; 2X3W D; 1ZLM A; 3ULR B; 2J6O A; 2EKH A; 4JJC A; 2O9V A; 3U23 A; 1NEB A; 3VS2 A; 1SRL A; 2EGA A; 3M0T A; 2DIL A; 4J9H A; 1ZUU A; 1G83 A; 3NMZ C; 1ZUK A; 2C0O A; 2BTT A; 1KIK A; 2DL8 A; 2DRK A; 4AFZ C; 1PWT A; 1AOJ A; 5IXB A; 2F2X A; 1JEG A; 1M27 C; 2EGC A; 4OMP A; 2CT3 A; 2V1R A; 1BU1 A; 1AZG B; 2FO0 A; 1B3Q A; 1JXM A; 1WXT A; 2J7I A; 1VA7 A; 1JO8 A; 1YNZ A; 2JT4 A; 1AWO A; 1NYG A; 4DEX A; 2DRM A; 2DYB A; 3UA7 A; 4HCK A; 2KT1 A; 2SEM A; 2X3X D; 1UDL A; 2LQN A; 1OPL A; 1M8M A; 1U06 A; 2DBK A; 2YT6 A; 1VYV A; 4J9D A; 2RPN A; 2LZ6 B; 4JZ3 A; 1AWW A; 2L3P A; 1RUW A; 2MCN A; 1BBZ A; 4J9I A; 1PKT A; 4RTU A; 1IO6 A; 2F2W A; 4LUE A; 1SEM A; 3H41 A; 1X43 A; 4IIM A; 3M0U A; 5FW9 A; 1YCS B; 2KXD A; 4CC7 A; 5IHN A; 2DNU A; 2MIO A; 1WXB A; 2GTO A; 2KNB B; 1WI7 A; 2EW3 A; 2M51 A; 2DL3 A; 1M30 A; 2MOX A; 2CRE A; 4J9G A; 2CSQ A; 4RUG A; 2DBM A; 1OEB A; 2RQU A; 1QLY A; 2FEI A; 2JXB A; 1X6B A; 3M0R A; 3VS0 A; 1UG1 A; 4J9C A; 3VRY A; 3VS1 A; 1SHG A; 4CC4 B; 1ARK A; 2PTK A; 5ECA A; 1M3C A; 1BK2 A; 2QDL A; 2SRC A; 2CUD A; 2KYB A; 1ABQ A; 1N5Z A; 1BB9 A; 1NLP C; 1PNJ A; 1UHF A; 4HXJ A; 1GCP A; 2DLP A; 2DL7 A; 2GBQ A; 1W6X A; 2IIM A; 5FWC A; 1VYU A; 4RTX A; 4ZNX A; 4ESR A; 1AZE A; 2JTE A; 4CC2 A; 1UUE A; 4M4Z A; 3LH5 A; 2LCS A; 3NHN A; 4IIO A; 1K0S A; 3M0Q A; 2LJ1 A; 4HVU A; 1CKA A; 1NLO C; 2VVK A; 4OMN A; 2K79 A; 2HDA A; 1KSW A; 1UJ0 A; 2PZ1 A; 2GQI A; 3I9Q A; 1GBQ A; 1OPK A; 4K11 A; 3EHR A; 1A0N B; 1T0J A; 2V1Q A; 5HCK A; 1QKW A; 1U5S A; 1WDX A; 1M3B A; 4RTT A; 2YSQ A; 1HJD A; 4RTY A; 3C0C A; 4HVW A; 2YUP A; 1E6H A; 2KRS A; 4HVV A; 1H3H A; 2DF6 A; 3H0I A; 2KR3 A; 1PRM C; 3NGP A; 5IH2 A; 2A28 A; 2KRO A; 4AFU C; 3VS7 A; 1UEC A; 2E5K A; 2FRY A; 1MUZ A; 4JJB A; 3VS5 A; 5I11 A; 1E6G A; 2CT4 A; 2DM1 A; 5EC7 A; 1UGV A; 1K76 A; 2JS2 A; 1GL5 A; 4AFS C; 1AVZ C; 1TG0 A; 1JU5 C; 1HD3 A; 2EQI A; 1ZBJ A; 2L0A A; 2OAW A; 2O88 A; 4GLM A; 2D1X A; 2KEA A; 2YUN A; 1T0H A; 4X1V A; 3UA6 A; 2W10 A; 2LJ3 A; 1X27 A; 2PNI A; 4JJD A; 2KXC A; 1E7O A; 2ED1 A; 3GBQ A; 2EYX A; 1Z9Z A; 1K9A A; 2A36 A; 4EIK A; 2H8H A; 1FYN A; 2ROT A; 1PRL C; 2FPE A; 3EG0 A; 1ABO A; 2KRM A; 1FMK A; 1CKB A; 2HCK A; 4QT7 A; 2CH4 W; 2GTJ A; 2EGE A; 1K0X A; 2EVR A; 2CUB A; 1TUC A; 2GNC A; 2ESW A; 1NYF A; 3UAT A; 1UFF A; 1RLP C; 2W0Z A; 2P4R A; 4F17 A; 2K7A A; 2D8H A; 1GBR A; 2RQV A; 2OJ2 A; 2K9G A; 2JW4 A; 1SPK A; 3PVQ A; 4F16 A; 2I0N A; 4Z89 A; 3CQT A; 1YP5 A; 2DJQ A; 3M0S A; 2RF0 A; 2LNH B; 3EG1 A; 1X2Q A; 5FWB A; 2AZS A; 2JS0 A; 1NG2 A; 2HBW A; 2ED0 A; 1RI9 A; 2O9S A; 1ZX6 A; 3IQL A; 2JM9 A; 2KYM A; 3RBB B; 2O2O A; 2HEQ A; 2NWM A; 2K3B A; 1WA7 A; 2RMO A; 2M0Y A; 4WCI A; 2RQW A; 2ABL A; 2JMA A; 2RN8 A; 2G6F X; 2K2M A; 2EPD A; 3VS6 A; 1SSH A; 1XOV A; 1S1N A; 2C0T A; 3I5R A; 2AK5 A; 1YN8 A; 3I5S A; 2O31 A; 2OI3 A; 4LN2 A; 2J06 A; 2DVJ A; 1GFD A; 1OOT A; 2EYW A; 1M3A A; 2CSI A; 2CDT A; 1ZSG A; 2J6F A; 2KRN A; 2GGR A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3RDV A; 4C0D B; 2CP0 A; 3BW1 A; 3SHW A; 4N0A A; 1WLP B; 3JB9 G; 1K73 U; 5GAM f; 3HKS A; 3LGL A; 2YUQ A; 1X2K A; 4F14 A; 3EG2 A; 3CME Q; 3EG9 A; 3KFV A; 5GAN 8; 1NPR A; 1M1K U; 4C0D C; 1SRM A; 4MZM A; 2V8K A; 3DLM A; 3UWN A; 1V1C A; 2KBT A; 3VUB A; 4ELY C; 1TS9 A; 2L3Q A; 5GAN d; 1GFC A; 3I35 A; 3MET A; 1YIT Q; 4J7F A; 5HK0 A; 3V8K A; 4KH1 B; 1QMC A; 1KQS S; 2AIR B; 3OA6 A; 1YJW Q; 5CKH A; 5LJ5 j; 2BZY A; 2RH2 A; 4FM4 B; 3S3O A; 3CXC S; 2EJ9 A; 1PD1 A; 4JRI A; 4D8D A; 2EBP A; 4KRT A; 4KUL A; 2PU9 B; 2HBP A; 2ENM A; 2VGN A; 1KC8 U; 2K5L A; 1NJI C; 1B07 A; 2X4W A; 3GLX A; 5GMK j; 1K9M C; 2VC8 A; 3P8H A; 4LUD A; 1RAE B; 1Q81 R; 3SD4 A; 3I55 T; 1KJW A; 3THK A; 3TSW A; 2QTV A; 1AD5 A; 2DL4 A; 3QZ5 B; 2FPF A; 1PHT A; 2C0I A; 3VRZ A; 5J39 A; 4A4H A; 2A37 A; 3CEY A; 2YXY A; 1ZA1 B; 3FC3 A; 3CC7 T; 4WF2 A; 3QYH B; 1R77 A; 4C8Q B; 2WSC E; 1I81 A; 2J05 A; 2EYQ A; 4AG2 C; 4C5I A; 3LGF A; 4M78 F; 2QQB A; 1PSE A; 2O4X A; 2JMC A; 4X9C A; 2AZV A; 2CP6 A; 5C0M A; 4IUP A; 4EMK A; 5KYY A; 4FT4 A; 1MNE A; 3H9N A; 4R0K A; 3NPF A; 3OB9 A; 3QJY A; 4KBM B; 2K5I A; 5GAN 2; 3CCQ Q; 1QCO A; 1IGQ A; 4M78 A; 4JRQ A; 1W70 A; 2VXE A; 3GPL A; 4C8Q C; 1YBY A; 2DIQ A; 3EG3 A; 1G3S A; 1WPY A; 2DER A; 3FJ5 A; 3MEA A; 5DY9 A; 1VQ7 Q; 2QTX A; 2RQR A; 3L2R A; 2DE0 X; 1BI3 A; 3KXT A; 2K6D A; 2D0Q B; 3URG A; 3M53 A; 4M7A D; 2PUO B; 2JM8 A; 2CZ1 B; 2JZ2 A; 4J9E A; 1H3Z A; 4CC3 A; 2JNG A; 4DQ2 A; 1VQM T; 3U23 A; 4IUQ A; 4B9W A; 2QQ9 A; 1SRL A; 2V26 A; 1ZUU A; 3NMZ C; 2BTT A; 2DL8 A; 3OYF A; 1RI0 A; 3I56 Q; 1AOJ A; 5GAN 3; 3CC2 Q; 3GOX A; 2MK5 A; 1WQ7 A; 4HCZ A; 2MYS A; 3EFR A; 2J7I A; 1YNZ A; 4DEX A; 1VQ8 T; 2DRM A; 2DYB A; 4MDW A; 3EFO B; 1RAI B; 4M75 E; 4HCK A; 2FVU A; 4J7I A; 2KT1 A; 3M59 A; 3HPW A; 2DEQ A; 1ZSZ B; 1OPL A; 1TUG B; 2YT6 A; 2DKG A; 1VYV A; 2RPN A; 3LYI A; 4XU1 A; 2DD4 A; 3QBY A; 3G4S A; 5CIU A; 3G71 T; 1BBZ A; 1TSF A; 4J9I A; 4ZN1 A; 3CCR A; 2VB6 A; 1YJN Q; 2F2W A; 4DBF A; 1SEM A; 1X43 A; 3M0U A; 5GAO l; 3JRZ A; 2DD5 A; 1VQ5 A; 3OSS C; 4FW2 A; 3M5A A; 1ZSZ C; 4PNO A; 2QEX T; 4QQG A; 4FYX B; 2M51 A; 1Q86 R; 2CRE A; 5GAN 7; 4HT9 A; 2DBM A; 1OEB A; 2ZPI B; 4DBQ A; 2F69 A; 3I55 Q; 2I2L A; 1VQP A; 3VS0 A; 2VYT A; 4J9C A; 3CCM T; 4M77 B; 2RJE A; 6AT1 B; 4UC4 A; 4XQ3 A; 2F1L A; 2E41 A; 3CC7 Q; 3JAM E; 1VQL T; 2CZ7 B; 2K57 A; 2EAY A; 1UHF A; 2R5A A; 3JCM V; 1VYU A; 1RAA B; 2RJF A; 3MHX A; 1HYO A; 1N27 A; 1LOJ A; 4M77 C; 1IRE B; 4IIO A; 5LJ5 d; 4II1 A; 2DTH A; 3BE3 A; 1D0Y A; 3LX7 A; 3NTK A; 2K79 A; 1KQS P; 1UJ0 A; 2DPP B; 2DXB A; 3G7Z A; 3I9Q A; 1GBQ A; 4C92 F; 3QKJ A; 4RKU E; 3EHR A; 1T0J A; 3HTR A; 3CXC P; 2KQW A; 2XKO C; 1YI2 A; 3SWN B; 1WDX A; 4C5H A; 5IAY A; 3ZFJ A; 2YSQ A; 3OW2 S; 4HVW A; 2YUP A; 3CPW S; 4HVV A; 1VQM Q; 4C92 A; 2DF6 A; 2ZCF B; 1OI1 A; 4AFU C; 3JCM J; 4ELZ C; 1MUZ A; 3CCJ A; 3V8L A; 5FRN A; 3CCE A; 3JCM b; 1GL5 A; 2LCL A; 1TG0 A; 3SWN C; 2L0A A; 2BE9 B; 2OAW A; 2E64 A; 3A8M B; 4DOV A; 2KEA A; 2YUN A; 2OTL A; 1T0H A; 1O75 A; 1X27 A; 3CCU T; 4M7D G; 5C6S A; 1VQ8 Q; 2E4H A; 1E7O A; 1K8A U; 3GBQ A; 3L42 A; 4AT1 B; 4LD9 K; 4Y28 E; 2ZZD A; 4EIK A; 4A4E A; 1HK9 A; 1PRL C; 3QO3 A; 2XD0 A; 2YWW A; 4XU0 A; 3G71 Q; 2VXF A; 5CVI A; 1TUC A; 1KQ1 A; 2D9T A; 2GNC A; 1KD1 R; 1BI2 A; 4M75 G; 3EH2 A; 2BKD N; 3JB9 I; 1YJ9 Q; 1XQH A; 2QAS A; 2RQV A; 4LDV A; 4NS5 A; 5CCA A; 5GAM g; 1U1T A; 5KYX B; 3QHS A; 2QEX Q; 3MPU B; 3JB9 D; 2I0N A; 3CQT A; 1YP5 A; 4LDW A; 2M0O A; 2AZS A; 1VIF A; 2JS0 A; 2NUP A; 4HCC A; 2ED0 A; 1M5Q 1; 1ZX6 A; 4F7U F; 5I2S A; 3OYG A; 3A5Z B; 2JM9 A; 4NL3 A; 2FHD A; 1D3B B; 3CCM Q; 1Q86 C; 2K3B A; 2RQW A; 2BE7 D; 3CD6 A; 4F7U A; 1VQL Q; 1Q7Y C; 1SSH A; 2NUT B; 1S72 T; 2AK5 A; 2HL3 A; 2M16 A; 3HSB A; 3L2Q A; 4XU3 A; 4ZN3 A; 4J83 A; 2J06 A; 1JJ2 S; 3CCV A; 2DVJ A; 3P8D A; 2M9U A; 3MJX A; 1OOT A; 1VQ9 Q; 3OYB A; 5LJ3 f; 2CDT A; 2R58 A; 1Q82 R; 2KRN A; 4RCB A; 4PJO F; 1X6G A; 4PKC C; 3LLR A; 1VYT A; 3G6E T; 5GAM h; 1BYM A; 4OMO A; 4MZP A; 2M02 A; 2DA9 A; 2MWO A; 4Z8A A; 2XDD A; 3OYH A; 1WXU A; 4PJO A; 4M7A B; 1T3S A; 2FL7 A; 2JUF A; 5CK9 A; 1N9S A; 1UTI A; 2RJD A; 2D8J A; 2XI9 A; 4OP0 A; 4PK4 A; 2QQS A; 3DLL A; 1B34 A; 4DOW A; 1Y96 A; 3CC4 T; 3QYG B; 2JVV A; 3OMG A; 4M75 B; 1KFZ A; 1M8V A; 2J6K A; 3OYD A; 1N8R R; 4M7A C; 1JQQ A; 3EGD A; 5IHI A; 1H92 A; 1MV3 A; 1V29 B; 3GF5 A; 5GJW B; 3RUX A; 3H0F A; 4R55 A; 4ZGD B; 4RTZ A; 2QA4 T; 1QVP A; 1F1B B; 2P0P A; 2ROL A; 3A1P A; 2LQW A; 3CCU Q; 2DL5 A; 5GMK m; 1I5O B; 4M75 C; 2IVW A; 2AT1 B; 3LH0 A; 1TH7 A; 5I21 A; 3CCL Q; 4FSS A; 1UJY A; 1W4S A; 1I0C A; 4RTV A; 1PC0 A; 2LX7 A; 1AWX A; 2XK0 A; 1IXD A; 3QG1 A; 4P5N A; 5GAO p; 5KCH A; 1KQS A; 1EX4 A; 4Y92 A; 4AG1 C; 3GIB A; 1NJI U; 2XDP A; 2KGT A; 1GRI A; 1K9M U; 3CXC A; 3FDR A; 1SHF A; 3PIP A; 1J3T A; 4QVD A; 3RES A; 1PKS A; 1RLQ C; 4L59 A; 5D7U A; 1ZUY A; 1NM7 A; 1OU9 A; 2NUZ A; 3PVL A; 1KD1 C; 2DX1 A; 1YHQ T; 4KT0 E; 3TSZ A; 2XHC A; 1K1Z A; 1UB4 A; 1WIE A; 4E6R A; 3OW2 P; 1FMV A; 3CPW P; 1UE9 A; 2CYZ B; 3O5Z A; 1MMA A; 1VQK A; 3HP9 A; 2YRD A; 1HXD A; 4D6W A; 2OAU A; 1OU8 A; 3L2Z A; 2DXT A; 1PD0 A; 2LX9 A; 1YIT A; 2BZX A; 2XMF A; 4A4G A; 3BDU A; 1K4U S; 4BI3 A; 1QWE A; 1X69 A; 1M90 U; 1WFW A; 1PSF A; 5IXF A; 4FYV B; 2YUO A; 4OB0 B; 3KUF A; 1WNL A; 2RK1 A; 5DLO A; 2P84 A; 2K2V A; 1I1J A; 1QP2 A; 2VV5 A; 3JCM X; 1OX8 A; 1VQ4 Q; 1CSK A; 3G6E Q; 3VKI A; 3ULR B; 4JJC A; 2O9V A; 1NEB A; 3M0T A; 1Q82 C; 1WHH A; 2HNI A; 2MI6 A; 3OYC A; 1KIK A; 3CBP A; 1VQ6 Q; 3OYI A; 4AFZ C; 4MDX A; 1M9S A; 3BDL A; 1PWT A; 1JEG A; 2RK2 A; 2R57 A; 4OMP A; 4C8Q F; 4BAC A; 1BU1 A; 3CC4 Q; 2FO0 A; 4OVA A; 1WXT A; 1JXM A; 3PMI A; 2COZ A; 5KYN A; 5J3B A; 2X51 A; 2X3X D; 2LQN A; 1M8M A; 1U06 A; 2DBK A; 4C8Q A; 3V8J A; 1AWW A; 3E19 A; 2K3Y A; 3A8G B; 5A0D A; 2KDS A; 3CCQ A; 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