The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
13
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sequence length |
58
|
structure length |
58
|
Chain Sequence |
GKELVLALYDYQEKSPREVTMKKGDILTLLNSTNKDWWKVEVNDRQGFVPAAYVKKLD
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
1H and 15N NMR assignment and solution structure of the SH3 domain of spectrin: comparison of unrefined and refined structure sets with the crystal structure.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
ALPHA-SPECTRIN
|
| molecule tags |
Cytoskeleton
|
| source organism |
Gallus gallus
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| total genus |
13
|
| structure length |
58
|
| sequence length |
58
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-03-02 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1SSH A; 3M0R A; 4RTV A; 2DYB A; 2L2P A; 2HBW A; 2D1X A; 3H0F A; 2BZY A; 2RPN A; 1M8M A; 1UE9 A; 4CC3 A; 2K9G A; 1OPK A; 1UJ0 A; 1V1C A; 2ED0 A; 2DMO A; 4CC2 A; 1WYX A; 3UAT A; 4D8K A; 1GRI A; 1GBQ A; 1SRM A; 4HXJ A; 1H92 A; 1SHF A; 2GGR A; 2DRM A; 4D8D A; 4RUG A; 3FJ5 A; 2FPE A; 2KYM A; 3IQL A; 1T3S A; 2RNA A; 1H8K A; 1BK2 A; 2RQV A; 1QKX A; 2FEI A; 2ROT A; 2HCK A; 4RTY A; 1PRL C; 2LX7 A; 3TSW A; 4RTX A; 1K4U S; 1ZLM A; 4JJC A; 2AZV A; 5FW9 A; 4ESR A; 1I1J A; 2K3B A; 4J9C A; 3CQT A; 4IIM A; 1BB9 A; 2KGT A; 1NYF A; 2ENM A; 5ECA A; 4A63 B; 2DL3 A; 1ABO A; 2KEA A; 3PE0 A; 5IHI A; 1AVZ C; 2J7I A; 1NLP C; 4ZNX A; 3A98 A; 2RMO A; 3M0U A; 3VRZ A; 4Z88 A; 2CSQ A; 1T3L A; 2X3X D; 1JU5 C; 2KT1 A; 1GCP A; 3JV3 A; 2JTE A; 2D8J A; 2RQU A; 1E6H A; 2AKK A; 2DA9 A; 2CH4 W; 3VS1 A; 4FSS A; 2L0A A; 2G6F X; 1WLP B; 1NEG A; 2CDT A; 2KE9 A; 2EYY A; 2YUP A; 1NLO C; 2EYZ A; 2YUN A; 3SHW A; 1VA7 A; 1ZX6 A; 2EYX A; 5EC7 A; 1UDL A; 1TG0 A; 1WXU A; 2GBQ A; 3EHQ A; 2CH4 A; 2LZ6 B; 5IXB A; 1AZE A; 5L23 A; 1GFD A; 1Z9Z A; 3M0S A; 2ECZ A; 4JZ4 A; 2HEQ A; 2DIL A; 2F2V A; 2DL8 A; 1YNZ A; 4IIO A; 2FRY A; 1Y57 A; 1U06 A; 2AKL A; 2A28 A; 2OAW A; 2DBM A; 2CT4 A; 2E5K A; 2JW4 A; 4JPB W; 1ZUU A; 1WX6 A; 2RF0 A; 4AFZ C; 2O88 A; 4GLM A; 4RTZ A; 4HVU A; 2CT3 A; 3VRY A; 2BZ8 A; 5GJW B; 3SEM A; 2LQN A; 4DEY A; 1I07 A; 2L3S A; 4OMN A; 4JZ3 A; 1UGV A; 1UG1 A; 1RLP C; 1WXB A; 2X3W D; 2A08 A; 4RTT A; 2KRO A; 2DL7 A; 1W70 A; 4JJB A; 2KRM A; 1JO8 A; 4LUD A; 1X2K A; 2BZX A; 2DF6 A; 2K2M A; 1KIK A; 1IO6 A; 2ED1 A; 1HSQ A; 1RUW A; 1QWE A; 2C0I A; 3VS4 A; 2L3P A; 4OMQ A; 2RQT A; 4Z8A A; 1PKS A; 1OPL A; 4E6R A; 2YSQ A; 2VKN A; 1JXM A; 1LCK A; 1J3T A; 1I0C A; 1HD3 A; 2EYW A; 2YT6 A; 1ZBJ A; 2J6K A; 2FPD A; 5I22 A; 1AWJ A; 2VWF A; 3EGU A; 2DL4 A; 1GL5 A; 2YDL A; 1JXO A; 2DL5 A; 2DVJ A; 1FMK A; 1B3Q A; 2GTJ A; 3EHR A; 4EIK A; 2O2O A; 1ZUY A; 4OMO A; 1G2B A; 2J05 A; 2D0N A; 1QCF A; 4RTU A; 5IXF A; 1VYV A; 4OML A; 3EG0 A; 1UHF A; 2V1Q A; 1WFW A; 1JQQ A; 1QLY A; 1Y0M A; 2VVK A; 2M0Y A; 4LN2 A; 4OMM A; 4Y92 A; 2J06 A; 1AWW A; 4K11 A; 2L3Q A; 2J6F A; 2PNI A; 2C0T A; 2JXB A; 1K9A A; 1T0J A; 4RTW A; 4QT7 A; 2LJ1 A; 3QWY A; 2DX1 A; 2MIO A; 1KSW A; 4ORZ A; 3UF4 A; 1K1Z A; 5GJV B; 2MCN A; 1K76 A; 2DRK A; 4DEX A; 2KRN A; 4AFQ C; 1WA7 A; 4M4Z A; 2F2W A; 2ABL A; 1M30 A; 4J9B A; 4AG1 C; 3I35 A; 1HJD A; 3VS6 A; 2H8H A; 2SEM A; 2BTT A; 3VS7 A; 2LCS A; 1QWF A; 2JM9 A; 1MUZ A; 3VS3 A; 5IH2 A; 3NHN A; 1SEM A; 1Z9Q A; 2NWM A; 1A0N B; 3PVL A; 4J9D A; 4J9H A; 1G83 A; 2LNH B; 2OI3 A; 1BU1 A; 2K7A A; 1CKB A; 1QKW A; 1PWT A; 1SPK A; 2A36 A; 3NPF A; 2KRS A; 3PVQ A; 3QWX X; 4LUE A; 1X6G A; 4J9E A; 2AZS A; 1PHT A; 1E7O A; 2F2X A; 1KFZ A; 1X69 A; 2YUQ A; 3TSZ A; 1AWO A; 1AEY A; 1FYN A; 1U3O A; 3VS0 A; 2RQR A; 2W10 A; 2DE0 X; 4Z89 A; 4AG2 C; 1M27 C; 1PKT A; 1NYG A; 1WXT A; 1YP5 A; 3NMZ C; 2CRE A; 2YUO A; 3M0P A; 2JT4 A; 4KRT A; 2JMA A; 3U23 A; 3VS5 A; 2DNU A; 3I5S A; 1K0X A; 5IHK A; 1M3B A; 2LJ3 A; 1WI7 A; 1K0S A; 1M3C A; 4HCK A; 2DLP A; 2P4R A; 1PRM C; 2KYB A; 2ROL A; 1AZG B; 2LMJ A; 1VYT A; 1GCQ A; 3ZL7 C; 1JEG A; 1X43 A; 1BBZ A; 1ZSG A; 1YCS B; 1SHG A; 2MOX A; 2CUB A; 2GTO A; 1WDX A; 2O9V A; 3REA B; 1X6B A; 2JMC A; 3EG1 A; 3GBQ A; 3R6N A; 2FG0 A; 2K6D A; 2JS2 A; 2EBP A; 1RI9 A; 2DBK A; 1AD5 A; 1U5S A; 1CKA A; 3VS2 A; 1YN8 A; 2KNB B; 4F14 A; 1YWO A; 1OOT A; 1ABQ A; 4HVW A; 2EGC A; 3M0T A; 5FWB A; 2DM1 A; 2JS0 A; 1SRL A; 3KFV A; 2LQW A; 3C0C A; 3O5Z A; 2A37 A; 1E6G A; 1W6X A; 1OEB A; 4J9I A; 1MV0 B; 1UEC A; 4AFS C; 2KT8 A; 3M0Q A; 1UFF A; 2V1R A; 2HDA A; 1VYU A; 2CUD A; 1XOV A; 2EGA A; 3UA7 A; 4LNP A; 3H0H A; 2XMF A; 5HCK A; 2I0N A; 2SRC A; 4F17 A; 1EFN A; 1M3A A; 2LP5 A; 1ZUK A; 4AFU C; 2W0Z A; 1X2Q A; 1OV3 A; 1GFC A; 1TUD A; 2FRW A; 3EG2 A; 4CC4 B; 2AK5 A; 4R0K A; 3RNJ A; 2KXC A; 2IIM A; 2J6O A; 2KBT A; 1S1N A; 4J9G A; 3I5R A; 2FO0 A; 1X27 A; 2EPD A; 2DJQ A; 2NUZ A; 2D8H A; 4J9F A; 1NM7 A; 1KJW A; 1NEB A; 2LJ0 A; 1WIE A; 3H41 A; 5FWC A; 3EG3 A; 2O31 A; 4LE9 A; 2O9S A; 2JM8 A; 1NG2 A; 2GQI A; 2EGE A; 2QDL A; 1CSK A; 2EVR A; 3I9Q A; 2B86 A; 2M51 A; 1GCQ C; 2C0O A; 1ARK A; 3NGP A; 2HSP A; 1RLQ C; 3REB B; 1PNJ A; 5IHN A; 2CSI A; 2GNC A; 2ESW A; 2K79 A; 1W1F A; 5I11 A; 1UUE A; 1UHC A; 1N5Z A; 1TUC A; 1UTI A; 1YWP A; 2PZ1 A; 4JJD A; 2EKH A; 2RN8 A; 1AOJ A; 3H0I A; 4WCI A; 1GBR A; 3LH5 A; 2EW3 A; 2KXD A; 4CC7 A; 3THK A; 1B07 A; 1AWX A; 4HVV A; 2RQW A; 4X1V A; 3UA6 A; 1UJY A; 4OMP A; 1H3H A; 3RBB B; 4GBQ A; 2PTK A; 2FPF A; 1T0H A; 2EQI A; 2OJ2 A; 3TVT A; 3ULR B; 4F16 A; 2KR3 A; 1MV3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3FC3 A; 2HQX A; 4X9C A; 1O75 A; 5LJ5 e; 1D3B A; 1UE9 A; 2K9G A; 2ED0 A; 1TXQ A; 1VQ6 Q; 1SHF A; 3CCL T; 2GGR A; 5GMK i; 1KC8 R; 2FPE A; 1DJ7 B; 3CCJ T; 3OY9 A; 1VQ5 A; 4M75 E; 1QKX A; 1Y7X A; 3QSU A; 2FEI A; 1YIT Q; 2HCK A; 4RTY A; 4ZTJ A; 3HTR A; 1PRL C; 3TSW A; 1ZLM A; 4EMK B; 4ESR A; 2R58 A; 4PLL A; 4C0D C; 4JRQ A; 1I1J A; 5FU7 B; 4J9C A; 3CXC S; 1VQO Q; 1NYF A; 1VQ9 Q; 4C92 F; 1Q86 R; 2DD5 A; 3X24 B; 3PE0 A; 5IHI A; 3CME T; 1AVZ C; 4M7A G; 5CKB A; 1Q82 R; 4XTU A; 1TWB A; 2RHY A; 2IPO B; 3E9G A; 4TVR A; 9ATC B; 1G3Y A; 2KT1 A; 1PCX A; 2JTE A; 3CCQ T; 2AKK A; 1ZSZ C; 2CH4 W; 3VS1 A; 4C0D B; 1R77 A; 2G6F X; 1WLP B; 1NEG A; 3FDR A; 3SHW A; 1VA7 A; 3S3N A; 3OW2 P; 2E65 A; 5GAM d; 1QQJ A; 3JCM f; 1TG0 A; 2YHT A; 3QYH B; 3CCU Q; 1YJ9 A; 2LCC A; 3MP8 A; 3EHQ A; 1KC8 C; 4CRI A; 2LCL A; 2LZ6 B; 4FM4 B; 1VUB A; 1D0X A; 1OU9 A; 2QTX A; 4C8Q A; 3MPU B; 5IXB A; 1Z9Z A; 3TU4 K; 1AZE A; 4JZ4 A; 5CK9 A; 2K5L A; 2CZ6 B; 4A54 A; 2DIL A; 4M78 F; 4NOY A; 1WPY A; 1JB0 E; 4LDY A; 3V7R A; 3CD6 T; 2V8I A; 1Y57 A; 4VUB A; 3EGX A; 1ZSZ B; 1EIF A; 2AKL A; 4MML A; 2A28 A; 3OB9 A; 1K9M U; 4AFZ C; 3HKS A; 2DIG A; 2O88 A; 4J7F A; 2MAM A; 4HVU A; 1Q82 C; 2CT3 A; 2DTO A; 5GJW B; 5DY9 A; 2QA4 A; 1MND A; 2L3S A; 2ZGW A; 5LJ5 f; 1WXB A; 2A08 A; 2QTV A; 3X26 B; 4E7H A; 4PJO G; 3G4S T; 4JUV A; 2NUT A; 4PJO E; 1QP2 A; 3G71 Q; 2K2M A; 2AIR B; 4KUI A; 3VU3 C; 5J39 A; 1HSQ A; 2H3E B; 3LWI A; 3CC4 Q; 1KHC A; 3VS4 A; 5DLQ E; 1UGQ B; 1UEB A; 4OMQ A; 2RQT A; 1PKS A; 1JXM A; 2D6F A; 1M2V B; 2HMA A; 4IKF A; 1IB8 A; 1I0C A; 1Q95 G; 2MPX C; 1QCO A; 2FPD A; 3OS1 A; 5HY6 A; 3EGU A; 3RKX A; 2DL4 A; 3S3O A; 1LJO A; 1GL5 A; 1VQ8 Q; 1JXO A; 2DL5 A; 1MMA A; 2VGN A; 2NUP B; 3EH1 A; 4EIK A; 3I56 A; 3EHR A; 2O2O A; 2DXC A; 3CCM T; 4F7U A; 3CBM A; 1QW1 A; 1WFW A; 1MMD A; 1QLY A; 1IGQ A; 1WQW A; 5GAN h; 3OYI A; 3I55 T; 4K11 A; 3JAM E; 2L3Q A; 3CCR Q; 2J6F A; 1PSE A; 2PNI A; 3HPW A; 2WSC E; 2C0T A; 2JUF A; 1QVF S; 4ANJ A; 4A4F A; 1TTH B; 1K9A A; 3QKJ A; 8ATC B; 1FMV A; 3OYE A; 3CC7 A; 4XTV A; 2E6Z A; 2DZ9 A; 3OMC A; 2YLB A; 5FLX E; 5I21 A; 4JLI A; 3MEV A; 4BY6 C; 5GJV B; 1K76 A; 2C06 A; 2M0O A; 4AFQ C; 1ZHI A; 4M4Z A; 1RAC B; 2ABL A; 3LGF A; 1U1T A; 1Q7Y R; 1M30 A; 4J9B A; 4OMF B; 1K73 R; 2RI5 A; 3JCM g; 2H8H A; 2HD0 A; 2BTT A; 2CP7 A; 4M77 F; 2JM9 A; 1MUZ A; 3VS3 A; 3N5B B; 1Z9Q A; 4JDS A; 1A0N B; 2K2V A; 4J9D A; 4J9H A; 3OYD A; 3JCM d; 2CP2 A; 3OW2 A; 1G83 A; 5GMK l; 2KK4 A; 4BY6 B; 1BU1 A; 2K7A A; 3LGL A; 1VQ7 Q; 1C1A A; 1CKB A; 1QKW A; 2A36 A; 4ZGD B; 3PVQ A; 4LUE A; 1KQS S; 2COW A; 1BCM A; 1X6G A; 1YJW T; 4J6X A; 2F2X A; 5D6Y A; 3EFS A; 3VS0 A; 2WAC A; 1PC0 A; 4N0A A; 5KYW A; 1WNL A; 3QPH A; 4QVC A; 1M27 C; 1VQ6 A; 3BY7 A; 4LXC A; 2HKN A; 4ELZ C; 1VQL Q; 3DB3 A; 2YUO A; 5KYY B; 5DLO A; 3JCM W; 2DVE A; 2JT4 A; 5LJ5 g; 4FYW B; 3A5Z B; 5GAN j; 1OYX A; 2JZ2 A; 4QVD A; 2ROL A; 1NPP A; 1AZG B; 1Y96 A; 4DBR A; 4QKU A; 3ZL7 C; 5LJ5 d; 1K73 C; 1JEG A; 1X43 A; 1BBZ A; 3OYB A; 4XTX A; 2RK1 A; 2GTO A; 1VQK A; 3EG1 A; 2MWP A; 4XTY A; 2K6D A; 2DBK A; 1VQ5 Q; 1AD5 A; 2G3R A; 3BFM A; 3GNG A; 1YN8 A; 3L2W A; 5GAN 2; 1TS9 A; 1OOT A; 1YWO A; 3F70 A; 4HVW A; 2EGC A; 4BD3 A; 3HFO A; 4KGV B; 2VV5 A; 1YI2 T; 2MF2 A; 3KFV A; 4C0Z A; 3TQ7 P; 1E6G A; 2HNI A; 4J9I A; 1UFF A; 3MEA A; 3CPF A; 1EFN A; 4BAC A; 1ZUK A; 3QII A; 1WJQ A; 3BW1 A; 1X2Q A; 3ASK A; 4R0K A; 4PLI A; 4MZM A; 2HBP A; 3QHS A; 2MWO A; 4GLK A; 1S1N A; 4RG2 A; 3L42 A; 3I5R A; 2DZC A; 4XTW A; 3E19 A; 2EPD A; 2DD4 A; 1M90 U; 1EX4 A; 3CPW A; 1D0Y A; 2E6N A; 2EQM A; 4JRK A; 2JVV A; 2V8J A; 2OTL T; 4LD9 K; 1HXD A; 1WIE A; 3PMI A; 1YJ9 Q; 4LDU A; 4LE9 A; 2JM8 A; 1NG2 A; 2GQI A; 1HYO A; 2PVD B; 3L2U A; 2COY A; 5GAN 5; 1CSK A; 2VXE A; 5GAO l; 5GAN 4; 3JCM c; 4PFZ A; 3CCL A; 1GCQ C; 2C0O A; 2EQJ A; 2DTH A; 2DEQ A; 3CMA T; 5IN1 A; 1BKB A; 4FCY A; 1PNJ A; 5HK0 A; 5IHN A; 3PIO A; 2CSI A; 3CCJ A; 1W1F A; 2EKH A; 2RN8 A; 5I2M A; 4WCI A; 3CCV T; 2FZC B; 4ZN3 A; 3LH5 A; 3CXC P; 3THK A; 2R5M A; 2QA4 Q; 4KGX B; 2DET A; 4X1V A; 2ZZD A; 1SKU B; 1S72 T; 3CME A; 3RBB B; 4GBQ A; 4L6V 5; 4M7D A; 1N8R R; 2OJ2 A; 3UDC A; 2QQS A; 3MET A; 3M0R A; 1JBM A; 2L2P A; 2D1X A; 4HCZ A; 3H0F A; 3L1A A; 2BZY A; 1M8M A; 1OPK A; 4O5V A; 1V1C A; 4II1 A; 2DMO A; 1QVG S; 4CC2 A; 4D8K A; 1KG1 A; 3CCQ A; 1SRM A; 5J3B A; 2DKG A; 4E7K A; 3OQ5 A; 2FL7 A; 4C5E A; 3EFO B; 2B8A A; 4HKE A; 1H8K A; 2RQV A; 4C8Q F; 1NJI R; 5KH6 A; 4Y91 A; 2LX7 A; 4RTX A; 1K4U S; 4JJC A; 2QAS A; 2AZV A; 1RAI B; 5FW9 A; 3VUZ A; 2K3B A; 5CO7 A; 5GAM f; 2E64 A; 2KGT A; 4BUG A; 2DL3 A; 1ABO A; 4BDY A; 3M59 A; 3CD6 A; 3SFM A; 3C12 A; 5A0G A; 5A2Q E; 5GAN 8; 3A98 A; 3I56 Q; 2RMO A; 3VRZ A; 4Z88 A; 2CSQ A; 2F5K A; 4M75 A; 1T3L A; 1G3T A; 1N8R C; 1GCP A; 3JV3 A; 2RQU A; 1E6H A; 2DA9 A; 3SWN A; 3JCM X; 2BE9 B; 2CDT A; 3HRU A; 2EYZ A; 2YUN A; 1OUL A; 4QVZ A; 1JJ2 A; 2MMP A; 2HAX A; 1BI0 A; 3OYY A; 5EC7 A; 3UPU A; 3CC7 Q; 3Q1J A; 3TEE A; 3G4S A; 3CCS T; 8AT1 B; 1JJ2 S; 4V2S A; 4M7A A; 4B6M A; 2O4X B; 2GBQ A; 2CH4 A; 3M4Y A; 3SD4 A; 5L23 A; 1YHQ T; 1NJI C; 2ZCF B; 2XIC A; 1ACM B; 2QYZ A; 3HP9 A; 4M7D E; 2KDS A; 4FW1 A; 2DBM A; 2CT4 A; 1TU0 B; 1WX6 A; 1WHL A; 4HT8 A; 3OMG A; 4RTZ A; 5KYU B; 4AT1 B; 3VRY A; 2BZ8 A; 3CBP A; 3PGG A; 3QXE B; 5M9O A; 3QBY A; 4FW2 A; 1P92 A; 5CVI A; 2K5I A; 5CKD A; 4JZ3 A; 4XU0 A; 4F7U F; 4RTT A; 3VUB A; 3JCM h; 4OGE A; 2DL7 A; 3P8D A; 1W70 A; 4JJB A; 3VKI A; 1JO8 A; 5CIU A; 5GAO p; 4LUD A; 1X2K A; 2DF6 A; 4PL6 A; 2K3X A; 3LH0 A; 2K5F A; 2BKD N; 3RES A; 3I55 A; 2F5T X; 4Z8A A; 1QVF P; 2YSQ A; 2K3Y A; 4LDW A; 3RMS A; 3CC2 T; 3NTH A; 1PM3 A; 2IVW A; 1LCK A; 3CXC A; 4Q5W A; 2EWN A; 3M5A A; 4JJN K; 4PJO A; 1HD3 A; 2F69 A; 3QO3 A; 3AT1 B; 1V29 B; 3JCM J; 2J6K A; 2VWF A; 1LNX A; 4RG8 A; 1WHG A; 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