1ANFA

Maltodextrin binding protein with bound maltose
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
b'KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
molecule tags Periplasmic binding protein
source organism Escherichia coli
publication title Extensive features of tight oligosaccharide binding revealed in high-resolution structures of the maltodextrin transport/chemosensory receptor.
pubmed doi rcsb
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1anfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1anfA01
3BFTA 4OYVA 1QUIA 4XKRA 1DTGA 1LAGE 2QSXA 3FIRA 5BWJA 5I56A 4MLQA 4NE4A 1BP5A 2GRVA 3DP4A 4IO2A 1MY4A 4GFRA 2ONRA 3HHFA 3HSTA 1A99A 2F6PA 3PMXA 4RJZA 4ESXA 1B32A 4UA8A 2O51A 1IITA 2AIXA 3K4UA 3ZKKA 3IOVA 1VR5A 4X48A 3DP6A 4DXCA 3UK4A 3KFMA 1OVTA 4I62A 1BIYA 2Y7RA 2FNCA 3I3VA 1LLSA 1MPCA 4I8CA 3U93A 3EQ1A 2V3QA 3OEKA 5AA1A 3UORA 2E1SA 3LSFB 4NF8B 3TEPA 4ZE8A 3IORA 3FASA 2QS4A 3MC2A 2F34A 3MBPA 3O29A 3PUVE 4KYDA 2PYYA 5TPAA 4LATA 1D9YA 4OVJA 4WEDA 5IKBA 1IXCA 2I48A 1S9TA 3KG2A 3O6HA 1VSOA 3DP8A 2XXTA 3SERA 1FQBA 1SW5A 4RA1A 3RTFB 1SQYA 2RF1A 3FD3A 1GGGA 2ZMBA 1MY1A 1N3WA 1XOCA 2O69A 4TQUQ 2Y7PA 5AA4B 1B3FA 1A54A 1N76A 2D21A 5DVJA 1ZJLA 3M8UA 3QAXA 4G2ZA 5FTIA 3RPWA 3W9VA 3KN8A 4XTCQ 2XXYA 4OENA 4BDLA 1BKAA 1I6QA 3CIJA 5A5XA 1DPPA 2X26A 4P0GA 2DP8A 1PEBA 2UYEA 3G3FA 1I6BA 3SEUA 4OZ9A 3G3IA 1B3GA 4RYAA 4R73A 3GZGA 5L8DA 3T93B 1B1XA 4QRZA 3VLWA 3K02A 3M3LA 4BDRA 4THIA 3IK6B 1DSNA 1FW0A 5CM6A 2DQVA 2Q9TA 1OQHA 4NF5B 5L9MA 2NWJA 1TWYA 3MPLA 1QUKA 4G68A 4BDOA 4KR5A 4R6HA 1ZTYA 4HS7A 3W15C 4PFUA 3ZKLA 1M5DA 3FVKA 3HN0A 3RLFE 2XXWA 4DZ1A 1TT1A 4LQ5A 3KEIA 3O6GA 4BDMA 2QRYA 2OBGA 2V84A 2XX9A 2ZNUA 2B3FA 3CG3A 3K1MA 4QSDA 3V5AA 2DE4A 3PU5A 2I0CA 4R2BA 4UACA 3S4UA 2H99A 4NMYA 3A3CA 2DXRA 1WODA 3IJOB 3PD8A 4GD5A 4OFJA 4OEVA 1ELJA 3G3JA 3G7WA 3Q27A 3OENA 2THIA 4JBZA 3V89B 4GWOA 1MDQA 2O1MA 2DE2A 5H8HB 1IQ7A 3CFZA 2DWIA 3O6IA 2DE3A 4F2OA 4YKKA 2XXXA 1NNPA 4HCYA 1B0HA 3S2VA 1Y1MA 1P1OA 3SEVA 4JWYA 3VLVA 4OEUA 3TKDA 5H8NA 3SEWA 1H43A 2DVCA 3PUWE 3TELA 4LVQA 4TLMB 1XVXA 3EHSA 5JTYA 3IB0A 4F2QA 3TPAA 3O66A 2IEEA 3TFLA 3MP1A 3O28A 3ODBA 3RUMA 3S9EA 1MS7A 3B7DA 1RYOA 3ECRA 4JWXA 3IB1A 1H45A 4GLIA 1LAFE 1MDP1 3MQ9A 5EHMA 4E0WA 1NNTA 2F8DA 3TCFA 3THIA 1TFAA 2V3UA 2DWAA 2XXHA 4U2RA 1LBCA 1SI0A 1N0TA 4IY6A 4FJPA 4KI0E 4ZEBA 3RQTA 4YU0A 4EUOA 5H8NB 1ZBMA 3FUZA 3KZGA 3PPOA 1LCFA 3OEMA 3P7IA 3PMVA 3TQWA 3FJGA 1JEVA 2M8CA 2QS2A 1CE2A 3H06B 4NF8A 4RY1A 3HO7A 2HXWA 1MH3A 2LAOA 4Q0CA 3TYHA 1FTLA 2ZNSA 3CVGA 1IXGA 1R9LA 5I57A 4DLDA 3E13X 2DWJA 4EDPA 3LBSA 3TCHA 3TZAA 4IGTA 1QUJA 3GBAA 1Y20A 4IO3A 5FTHA 5K2XA 1JVYA 3OSRA 5I56B 5I58A 4R72A 5AA2A 2B3BA 5KCJA 2V3TA 4QFLA 3PPQA 3BKIB 3IB2A 5I2KB 3TCGA 2XXQA 1JQFA 1SW2A 1Y1ZA 5AE4A 5B7DA 4DXBA 4U1OA 2RC7A 4ISUA 3B6TA 3PUZE 2RC9A 3C36A 1SDXA 2HAVA 1B9JA 2BJJX 5KZTA 4P11A 1XT8A 2ESNA 1MG1A 1B5IA 4F19A 3C9HA 3GLBA 3MUQA 3VDFA 4FE8A 2GH9A 3IAZA 1B3HA 1LB9A 5I2KA 3E3KA 3IR1A 1A40A 1B52A 1LCTA 3ILUB 4O3CA 4PE5B 2HEUA 2OWTA 3BFUA 4AB6A 1EZPA 3MZ1A 1QULA 3QUFA 2HQ0A 5TP9A 2H25A 2H98A 4GXAA 4ZECA 3KOSA 3KJ7A 3HPIA 3RN8A 5IAIA 2A5TA 2DVZA 1LAXA 4XKNA 2CMOA 2A5SA 1MQIA 1MRPA 1SYIA 3GBBA 2V25A 2HCAA 4MF3A 4Q30B 4QHQA 1JW1A 2ZXTA 5I58B 3T9UA 1FTOA 3TDJA 2D5WA 3OD7A 1FQEA 1NNKA 1MPDA 4N6PA 3PV0E 2O84X 3FGSA 4WEPA 2G29A 3PPRA 4WXJA 2Q8JA 4PFTA 2Y7KA 4R2FA 4NWDA 3Q29A 4GIZA 5FHMA 4HW8A 5DYHA 4G8MA 3OO8A 2HFBA 4RK9A 1XC1A 5DTBA 2I6EA 4I9DA 3W9WA 3MPKA 2RCAA 3UGWA 3Q26A 3QSLA 4MH5A 1MXUA 2QPQA 3H3GA 1MY0A 4LONB 3JV9A 4QFOA 2PX1A 4DDDA 1PB9A 1WDNA 1A8FA 4Z7EA 1IUDA 3OMBA 1P1UA 3K6WA 5ITPA 4EXKA 1UQWA 4JDFA 3S9NC 4G68B 3T66A 2ZYNA 1NMUA 1UTHB 2P1SA 2REGA 3T9XB 1A7LA 3LSXA 1ZMGA 4GVOA 4R6KA 3T96B 3OO7A 2V93A 3EHTA 2F36A 2XHDA 3PUXE 4JSDA 5CRYA 5ITOA 1B46A 2Q2CA 4X1BA 1P99A 4ZEKA 3H7MA 1URGA 5L9SA 2F6GA 1XHYA 1MXXA 2Y7WA 1N7XA 5F1QA 1AIVA 4PP0A 1Y4TA 1IXIA 1LFHA 1NKXA 3FJ7A 1B3EA 2AYSA 4P0IA 4LUBA 3FXUA 2I0BA 4KYSA 5B70A 1UTHA 3TODA 2I3VA 1Z7NE 3RT8A 1PB7A 1Y3PA 3QYTA 1RKMA 5CMCA 4I1DA 4KHZE 1US4A 4POXA 2P2AA 5CC2A 5I59A 1B58A 1MH4A 3S9LC 2VOZA 2QJEA 2YJPA 1ATGA 5EHSA 3U8QA 1S7YA 1LFGA 1ZLQA 1PDAA 2PMSA 3O97A 3SEYA 1USYH 1ZIUA 2F97A 3ILTB 4H8IA 1N3XA 4BLAA 3SESA 4R9GA 4ZS9A 2UVIA 3PPNA 4EQ7A 3KN7A 1Y4CA 1LAHE 1JNFA 1OMPA 4F1VA 1FQDA 5JTYB 4OHNA 5DEXA 3KOTA 2QMWA 1ZKBA 3O2AA 4OQOA 4TOZA 3TTLA 3CI8A 1TXFA 2Y7IA 3VFJA 1D3KA 1MQHA 2F5XA 4LZ8A 3VVFA 1OVBA 1HSJA 1SYHA 2VP1A 3TTKA 1BTJA 2NXOA 2I49A 3G3KA 4ZZEA 3FXQA 3H6WA 1VFDA 3KBRA 3MZBA 3Q25A 5ICTA 3MW0A 2XXIA 4FEDA 1UIVA 4MBPA 3L6GA 4IO7A 1IIWA 5K2YA 4F3GA 4YMAA 1POTA 5J1DA 3E9XA 3IOUA 4M4GA 4G4PA 3A3UA 3H6VA 3KJTA 2XXVA 3G3GA 4EXLA 4OWDA 3QK6A 3O9PA 4IGRA 4NWCA 2HZLA 2FA7A 3TMGA 4DXUA 1QJMA 1MQDA 2PT1A 2O6AA 4R75A 2Z8EA 1BLFA 1H44A 3ONMA 4JWOA 1D4NA 1Y3NA 4HTGA 1R9QA 1R6ZA 4OESA 2I58A 4N13A 3M3KA 1M5BA 1URSA 2PVUA 4H65A 1DTZA 2UYFA 2XXPA 3H03A 3QXMA 5FHOA 3USDA 4ECFA 2VHAA 1LB8A 2H4IA 4BDQA 1QKAA 2F35A 3A09A 5TPAB 3KSJA 1LBBA 1QW0A 2YLNA 2XXRA 3MP8A 4C1TA 1QVSA 4H8JA 2ONKE 4GF8A 3LSLA 1MM6A 1S50A 1XVYA 1YAEA 2NUVA 1UTBB 3C34A 3KN3A 4MFIA 4YKJA 4EF2A 5H8FA 2VGQA 1B7UA 1LFIA 3CRBA 4X1DA 4ZDMA 3HCQA 4YB5A 4F18A 1MY2A 2GHBA 1FTMA 3N26A 4PQJA 4F3BA 5ELVA 5HPQA 4U4SA 2QS1A 4ZEFA 4G77A 2E0SA 1IEJA 2W7YA 3R7XA 2H5YA 2I4CA 3IX1A 3T9VA 4AB5A 4ESWA 3I6VA 1OLAA 1B4ZA 1MPBA 3IOTA 1SVXB 3K6VA 5F7VA 1ANFA 1POY1 1TFDA 4OFLA 4LA9A 3K6UA 4O3BA 3CG1A 4IO4A 1B3LA 1FTJA 3IO4A 3SEXA 3LSWA 3I5OA 3TTNA 1N7WA 1Z7ME 1FTKA 3UN6A 4F31B 3H4ZA 5I84A 1I6AA 3U94A 3FXRA 2Y84A 3UIFA 5CMKA 5DVIA 3IL1B 5CMMA 3OXNA 4Q5TA 4R6YA 2X7PA 3VXCA 1PB8A 4ONYA 4XKPA 3LR1A 4HCWA 3OO9A 3PGFA 4ND9A 2Z8FA 5M2VA 4RXLA 5I2NA 1EH3A 3FVNA 1NH7A 2OWSA 4OXVA 3HV1A 4OTEA 3CSBA 3M3FA 1AL3A 1LGBC 1M5FA 3MJNA 4EF1A 2ZNTA 4LQ2A 4F3PA 3K1NA 2D3IA 4LZ7A 1PBPA 1JW5A 1H76A 2ABHA 4GQOA 3MVZA 4H1XA 1SD3A 4U22A 4X9TA 2DOJA 1P1WA 3IJXB 2NOOA 3B6WA 2F7AA 1II5A 1WVJA 2GHAA 1IXHA 5H8QB 4ELPA 1YTVA 2GFEA 5AA3A 3L6HA 1YCJA 1DOTA 3OELA 3MVXA 3PD9A 5I2NB 2ONSA 2UVGA 3VLUA 5JEIA 2Z22A 4PFYA 5CI5A 4POWA 4F1YA 1YPNA 4GRKA 1NL5A 4IB2A 4ZEDA 1JW4A 3C35A 3RY3A 3ZS6A 3MZ9A 2AL4A 2UVJA 3MAMA 1SW1A 2OCUA 2PT2A 3UA8A 5HM4B 3D4CA 4JXIA 5CMBA 4RNSA 3TAJA 1USYE 4QF9A 1GV8A 1IZ1A 2AL5A 1HSLA 5KDTA 4U4XA 3TUSA 1B7ZA 1LSTA 4NF4B 4QFPA 1OQGA 1MY3A 4XXUA 4DCXA 2CZLA 3CFXA 3K0VA 1Q35A 3K1PA 4JSOA 4NF6A 4U23A 2UVHA 3TTRA 4PETA 2RINA 4LZ5A 2OZZA 4RK2A 4RPNA 1GTKA 4ELQA 5I59B 1CB6A 3V83A 1MM7A 4O3AA 2Z23A 1M5CA 2Q88A 2REJA 4OFOA 4XIGQ 1FQCA 4Z0IA 1B0LA 4EQ9A 5A5XB 4U21A 2RC8A 4JB7A 4QSEA 5ICQA 3R26A 2F7BA 3DM0A 2DWHA 3TTMA 4F39A 2DSFA 3BBRA 2O68A 5JK4A 1NFTA 2VD3A 4FORA 2UXAA 2FYIA 2WKYA 3C32A 4H6DA 3SDFA 1AOVA 4OERA 3RT6B 4XKQA 3OSQA 4YKPA 4TLLB 2I4BA 1B4HA 1VFEA 3FJMA 1FQFA 3N5LA 2RKMA 4G68C 4MLVA 4FAJA 3MVWA 3IOWA 3MVYA 2YPNA 1I69A 2OLBA 2ANJA 1URDA 2XD3A 3OOAA 4WKMA 3D4GA 4H67A 3EHUA 1SBPA 3GXAA 4QSCA 1N84A 2DXYA 1AMFA 2B65A 2QS3A 3V8XB 4YMBA 3EN3A 3QUJA 4FECA 2R9JA 2XX8A 4FIMA 2OK2A 4R9FA 4GL8A 4OMBA 5H8SA 1EU8A 2ALUA 3VXBA 4FATA 2IA4A 4F3SA 3LC8A 4G8HA 4YB6A 3N6TA 3N94A 3K00A 4RPOA 3JZJA 2O1LA 4OETA 2Q2AA 1QKBA 1MXVA 5FHNA 3VVEA 1R1NA 3CFLA 5AA2D 4M1VA 4KCDA 4YZZA 3C4MA 1B51A 4KPTA 3OO6A 4Q8RA 1MXZA 2XX7A 2HZKA 1A8EA 1O64A 2DYXA 2ZYOA 3DELB 3G3HA 3KSXA 4H5FA 4NTLA 2ZYKA 1B40A 4YB7A 1UTBA 5H8FB 1JETA 3LUYA 4KYEA 1B5HA 1ZU0A 4F1UA 2RCBA 5I57B 1O63A 1Q1KA 5KCJB 3UP9A 3DLNA 3K6XA 4YICA 5AA2B 2I3WA 1HSEA 3FVOA 4YAHX 3C33A 1J1NA 3SETA 1Y9UA 5LOMA 3WAFA 3MWBA 4G8NA 4NEDA 2VD2A 3F11A 3PMWA 3RTWB 3FV1A 3WAEA 5H8QA 1P1NA 1SW4A 3B6QA 5DT6A 3RGYA 3E4RA 3ZSFA 1B2HA 3Q28A 3RNNA 4ELRA 3FATA 2Q89A 4ZEIA 4BDNA 1B5JA 3H6TA 5CBSA 3CR9A 3T22A 4IO6A 3U92A 3QIMA 4DIGA 2F78A 5AA4A 3U72A 4GXSB 1B05A 3T9HB 4ELOA 1Y3QA 5CBRA 1SI1A 3R6UA 1B1HA 4F29A 1OLCA 1N04A 4KFQA 1GR2A 4LP2B 1MQGA 2Z8DA 3SKPA 2OJTA 4NF4A 4PFWA 2NVUB 1F9BA 3TQLA 4F22A 4H5GA 2DS9A 2A5TB 4AQ4A 3S9MC 5H8HA 2KLFA 1MXYA 3FZVA 1US5A 4GOTA 4ZZAA 5DVFA 2PBWA 5ISUA 1A55A 4DE8A 2QL3A 1FQAA 3PUYE 1B6HA 1JEUA 1O7TA 3C31A 4IO5A 4NF5A 3IO6A 4EQBA 2QMXA 1T0KA 2X7QA 1NH8A 1MXWA 3CSGA 2XXUA 1H3DA 4KCCA 4KQPA 3MP6A 2P0SA 4R74A 3AXFA 1B7HA 1RYXA 3HHGA 5TU0A 5HBCA 2R6GE 1FCKA 4C1UA 4GL0A 4H0WA 3N6UA 1OIBA 1DPEA 1M5EA 2F7CA 3PPPA 4FEBA 1D9VA 4N07A 3FVGA 1DMBA 3U1OA 3VV5A 3H6UA 1KWHA 4YKIA 2XD2A 4IY5A 1MQJA 2HAUA 2H9BA 2G93A 1VE4A 1P1QA 1UIUA 2O7IA 3KGCA 4KD5A 3K2DA 1L5TA 4ZE9A 3EPEA 1PC3A 3JYRA 5KDTB 1XS5A 1PBQA 2ZYMA 3EF7A 3K01A 4L17A 1GVCA 1EZ9A 4QFNA 4E0XA 5TP9B 4U1ZA 1AH5A 5DEXB 4DCYA 4QFKA 5L9OA 2R71A 4K3FA 5EYFA 3FV2A 3VE1B 1JVXA 4C0RA 4NF6B 2O7UA 3VVDA 1EZOA 5BUUA 1NNFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MLQA 4GFRA 3HHFA 2F6PA 3PMXA 3IOVA 1VR5A 4X48A 3DP6A 3UK4A 3KFMA 1LLSA 3U93A 4H45A 2V3QA 5AA1A 2E1SA 3TEPA 4ZE8A 3FASA 3O29A 2PYYA 4LATA 4OVJA 2I48A 3O6HA 1VSOA 3DP8A 3SERA 3RTFB 4RA1A 4JVDA 4LN5A 3FD3A 1GGGA 1MY1A 1N3WA 5AA4B 1G0HA 1A54A 3M8UA 4G2ZA 3KN8A 1NV0A 1I6QA 1DPPA 2DP8A 1PEBA 3SEUA 5L8DA 4QRZA 3K02A 2ZZWA 5CM6A 2DQVA 4KR5A 4HS7A 5IZ1A 3W15C 4PFUA 1FSAA 1TT1A 2OBGA 3K1MA 2DE4A 3S4UA 2DXRA 4OEVA 3G7WA 4JBZA 1IMDA 1IQ7A 1FPJA 4NGUA 2XXXA 3S2VA 1Y1MA 1P1OA 3SEVA 3TKDA 2DVCA 3PUWE 4LVQA 5JTYA 3TFLA 3MP1A 3S9EA 4JSOA 1RYOA 3IB1A 4GLIA 1MDP1 1TFAA 5IGAA 2DWAA 4U2RA 5H8NB 5LTCA 3KZGA 3PPOA 4GWYA 1JEVA 1Q9DA 2ZNSA 3CVGA 3FXBA 3TZAA 5FTHA 3GBAA 4IO3A 5K2XA 1JVYA 2QVUA 2V3TA 4QFLA 5I2KB 3TCGA 2XXQA 1JQFA 3B6TA 2RC9A 3C36A 1B9JA 2ESNA 1MG1A 3C9HA 3GLBA 3IAZA 4GWSA 3E3KA 3ILUB 4PE5B 1BK4A 2HQ0A 3KOSA 3HPIA 5IAIA 2A5TA 1LAXA 3W9VA 4QHQA 1IMBA 1LEVA 3PPRA 3Q29A 4GIZA 3OO8A 4DI4B 1XC1A 2I6EA 4I9DA 3MPKA 2RCAA 3UGWA 3Q26A 3QSLA 1MXUA 4DDDA 3OMBA 3T66A 2ZYNA 3T9XB 2QVVA 2V93A 3EHTA 4X1BA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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