1ANFA

Maltodextrin binding protein with bound maltose
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
370
structure length
370
Chain Sequence
KIEEGKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTRITK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Extensive features of tight oligosaccharide binding revealed in high-resolution structures of the maltodextrin transport/chemosensory receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Periplasmic binding protein
molecule keywords MALTODEXTRIN-BINDING PROTEIN
total genus 121
structure length 370
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 1997-06-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1anfA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1anfA01
3PUXE 4YKKA 2DE3A 1BKAA 3H4ZA 4ZE8A 3QIMA 4HCWA 1Z7NE 1H43A 1MXXA 1B3LA 1N3XA 4GWOA 3KG2A 4KCDA 4KR5A 1IEJA 3IR1A 4LZ7A 4BDQA 1MG1A 1YCJA 4IO7A 3FV2A 1Q1KA 4OVJA 5H8FB 1PC3A 3RPWA 1B7UA 3FV1A 2Q88A 3O6HA 5ICQA 3S9LC 3H7MA 3W9WA 4HW8A 3FJMA 2ZNUA 1ANFA 3Q29A 3IO4A 2R9JA 2F78A 2O84X 2RC9A 2ZNSA 4QSDA 1B58A 3O9PA 3VE1B 4DDDA 4DCYA 2Q9TA 2D3IA 2F6PA 2V93A 1NH7A 2Y7IA 2H9BA 2ZYKA 3OOAA 4N13A 4G68C 3TKDA 4Q0CA 4QSEA 1DSNA 4OTEA 4Z0IA 4H8IA 3IORA 2P0SA 2PVUA 4XXUA 1XOCA 3WAEA 4RA1A 5H8FA 4DIGA 2OJTA 2RC7A 1B1XA 3QXMA 4LZ5A 4OZ9A 2I49A 3O97A 1FQAA 1MY1A 3R6UA 3W15C 3CI8A 1FTOA 3Q28A 5I56B 4RNSA 4OHNA 2ZMBA 3BKIB 1B46A 4MLVA 5CMBA 2F8DA 1MXVA 1AMFA 2G29A 2DE4A 2PX1A 2XX8A 2DP8A 1MXWA 3B6WA 3EHTA 5TU0A 2D21A 2I0CA 3T93B 4LONB 1XVYA 2GH9A 1J1NA 1I6AA 1LGBC 2I58A 2DWJA 2O1MA 2V3TA 3CFZA 4ZEFA 1WODA 4BDRA 3TZAA 1FQEA 2AYSA 3DELB 4LATA 1S50A 1SVXB 4FE8A 1BP5A 3N5LA 4G68A 1MY4A 4ZECA 4R72A 3R7XA 4IY6A 3P7IA 3SEVA 4FAJA 3CR9A 5ITOA 1A99A 3SDFA 4F2QA 5DT6A 1SBPA 3CFXA 4DXUA 1MY0A 4WXJA 4ZEKA 4HS7A 1EZ9A 1LFHA 3PMVA 2H99A 1B52A 3IAZA 5CBRA 1M5DA 2DWIA 3HSTA 1GR2A 3FXRA 1OQGA 4NF8A 1AH5A 4F1VA 5H8HA 5AA2A 3LSFB 3L6GA 4LUBA 2QSXA 4H67A 4I62A 3I5OA 2I0BA 2I3VA 2OWTA 5FHOA 2PBWA 4R73A 2VHAA 3K01A 4LQ2A 4ZEIA 4GVOA 4GOTA 3FXUA 4RK9A 5H8QA 2QL3A 3I6VA 5AE4A 3C35A 5AA1A 2O69A 2G93A 3VVDA 4EDPA 1US5A 3MJNA 4DLDA 2XX9A 4FJPA 1CE2A 5KDTB 4PP0A 1FCKA 1JETA 3HHFA 5EHSA 1SYIA 4DZ1A 2H98A 2O51A 3F11A 1Y3PA 2ESNA 3TTMA 2B3FA 4EF2A 1N84A 4U1ZA 4GL0A 4MLQA 3K6VA 4PFWA 4RJZA 5JK4A 3S9MC 1WVJA 4O3AA 1NNKA 2R6GE 1NFTA 1N04A 1FTMA 1URGA 3IOUA 4TLLB 1A8FA 4FEDA 3H6UA 3RN8A 4YMAA 1O64A 3W9VA 5L9SA 1Y4CA 3VXBA 5H8NA 4C1TA 3GXAA 2X7QA 1MPDA 5I84A 5CMKA 1P1OA 2O7IA 1L5TA 3TEPA 2Y7PA 1PBPA 1PB9A 3S2VA 4YZZA 4EF1A 3EF7A 4ZS9A 3S9NC 2ZXTA 3BFTA 4UACA 4RXLA 3TYHA 1H76A 3UIFA 3C34A 2Y7WA 4NF6B 3RY3A 1N7XA 5ICTA 3ECRA 4I9DA 4H65A 2KLFA 1TXFA 1ZKBA 5DEXA 1YPNA 4PE5B 3TTRA 4U2RA 1JNFA 1QUJA 2DVZA 3HN0A 4QRZA 5L9OA 3JYRA 4ZZAA 1LB8A 1NNFA 4JBZA 3TCFA 4N07A 2Q8JA 3OO6A 4G8MA 4R74A 5TPAA 3U94A 1MQGA 1MQDA 5ITPA 1P1UA 5ELVA 1MQHA 4WEPA 3KSXA 5IAIA 3TQLA 2QS4A 5DVFA 4NF4B 2A5TB 4L17A 4E0XA 1POTA 3ZS6A 4Q30B 1MY3A 2F7BA 4R6HA 3LC8A 1QKAA 4N6PA 3GZGA 1R9LA 1QKBA 2CMOA 2RKMA 4Q5TA 2HAVA 5H8HB 3U92A 5J1DA 3RGYA 1N76A 3KBRA 4F3PA 3H3GA 3MP8A 5DVJA 2X26A 1Q35A 1RYXA 3ODBA 3FXQA 2O6AA 3FVKA 2ONSA 2IA4A 1P99A 4OWDA 1NNPA 1FQFA 3OO9A 3C9HA 4R75A 3U8QA 2GHAA 1B7HA 2DQVA 1QJMA 2REJA 2FA7A 1DTGA 4XKPA 2V3UA 4WEDA 5A5XA 3H03A 1S9TA 1GGGA 1XC1A 1EU8A 1I6BA 1M5EA 3H6WA 3S4UA 4NE4A 4F18A 1EZPA 2F5XA 1LLSA 4O3CA 3MC2A 4XIGQ 3UGWA 3IOTA 1LCFA 3TTNA 3EHSA 3RQTA 1LAXA 1R6ZA 2P1SA 1SI1A 1B7ZA 2UXAA 1LCTA 2E0SA 2XXVA 2ZYMA 3AXFA 2AL5A 2UYFA 1JW1A 1B3EA 4KYSA 4R6YA 5EYFA 1SW1A 2HFBA 1OLAA 4NF5A 4PFYA 1SD3A 2REGA 1LAFE 3PMWA 4IO6A 1PBQA 4IO2A 4ESXA 3O29A 1LFIA 3A09A 1B5IA 3VLUA 3VXCA 4P0GA 2W7YA 5CRYA 3RLFE 3L6HA 1KWHA 1PDAA 1SQYA 2XXTA 2B3BA 4YU0A 3DP8A 3FVOA 1MPBA 4MFIA 3RT8A 4FEBA 4LA9A 4NF4A 5JEIA 3K1PA 1B5JA 2Q2CA 5I2KB 4PETA 4AB5A 4G2ZA 4M4GA 3KN7A 3TCHA 3IB0A 3H06B 3LSLA 1M5BA 1QULA 3C33A 1IZ1A 3LSXA 3TAJA 1PEBA 3V5AA 1IIWA 1US4A 4GLIA 1JQFA 3TTKA 2HEUA 3ZKLA 3CG1A 2F34A 2VGQA 2XX7A 2OBGA 1UIUA 3PPRA 4R2FA 3KOSA 2XXPA 3FJGA 2I4CA 1B4HA 4ELPA 2H5YA 3IO6A 3FVNA 3DP4A 5H8SA 3T9VA 3DLNA 3FJ7A 4C0RA 4ZEDA 3M3KA 3JZJA 4F39A 5A5XB 4BDOA 2F97A 3FGSA 3G3KA 5JTYB 3UK4A 1A54A 4F2OA 3GBAA 3OSRA 3N6UA 2ABHA 4JXIA 5IKBA 5KCJB 3G3IA 3I3VA 4IB2A 4ZZEA 2XD2A 4YKJA 1B9JA 1B4ZA 1VE4A 3C36A 3DP6A 3G3HA 2THIA 4G68B 3T22A 1URSA 5AA4B 1ZLQA 1S7YA 1ZIUA 1A55A 4OENA 2QMWA 1BIYA 3ILTB 4F29A 2XXXA 3MP1A 1QVSA 3CSBA 2AL4A 1H3DA 1UTHA 2FNCA 2PT1A 2UYEA 3G3FA 4KD5A 2XD3A 1TFAA 1SW5A 4R9FA 4FATA 5I58B 4ELQA 3D4GA 1LFGA 3O28A 3OEMA 1MPCA 4ONYA 2UVJA 3Q27A 1B40A 3KN3A 4RY1A 4GXSB 4XKNA 4Z7EA 1A40A 1VR5A 2I6EA 1F9BA 1JVXA 2V3QA 3QUJA 2YPNA 2FYIA 4GRKA 5KCJA 4R2BA 1UTBB 3PUVE 4DCXA 4OEVA 2ALUA 4R6KA 3IL1B 4GIZA 2DXYA 5B7DA 1B0LA 2Y84A 3U1OA 1MH4A 4YICA 1Y1MA 3KZGA 3SKPA 5F1QA 3T9UA 1NKXA 2ZYOA 2B65A 3KJTA 3VDFA 5HBCA 1B0HA 2DOJA 2XXWA 1B3GA 2M8CA 3PUYE 3EN3A 1FTJA 3MPLA 4OESA 1Y3QA 4XKRA 4OFLA 4GF8A 4OQOA 4YB5A 4ESWA 3LSWA 3TUSA 1I69A 4OMBA 1ZMGA 4ISUA 1D9VA 1GVCA 4YKIA 1YAEA 2GRVA 3VFJA 1B05A 3G3JA 1ATGA 2D5WA 2HZKA 2PMSA 2R71A 1JEVA 3MPKA 4JSDA 2DWHA 3N6TA 5FHMA 4Q8RA 4H1XA 4LZ8A 2UVGA 2YLNA 3TODA 1Y9UA 3TPAA 4EXLA 3K02A 5H8NB 1FTLA 4PQJA 1BTJA 5FTIA 1NL5A 3PGFA 1FQDA 2NWJA 3N26A 5I57A 2F7AA 3OEKA 4RYAA 2NOOA 1B3FA 4YAHX 1LBBA 2OLBA 1D9YA 3IB1A 1NNTA 3PPPA 2HQ0A 4H8JA 4FECA 4JWOA 4QFLA 2OZZA 2H4IA 1MXYA 4EQ7A 4H5FA 1A7LA 3D4CA 1ZU0A 3T96B 3U72A 2HZLA 2O7UA 5AA2D 5DEXB 2DXRA 3K6UA 2XXQA 2Z23A 2QS1A 4X1DA 3MVYA 5AA3A 2GHBA 4U21A 1FQCA 5ISUA 4TOZA 3LUYA 4JWYA 4U1OA 5CM6A 4KHZE 2ZYNA 1JEUA 1XT8A 3USDA 5HM4B 1LB9A 1ZBMA 3FASA 4KPTA 1POY1 3WAFA 4C1UA 3B6TA 3ZKKA 3OO7A 1SDXA 4F19A 3PD8A 2X7PA 1BLFA 1MQJA 1A8EA 2HXWA 5LOMA 4DXBA 3A3UA 4THIA 1FQBA 3O6IA 1UTBA 4RPOA 3MQ9A 2NUVA 4OERA 3O6GA 3MBPA 5K2YA 1D4NA 3MWBA 4GD5A 3TTLA 3FATA 4X9TA 1GV8A 2CZLA 2XXYA 3KFMA 2Z8DA 3V89B 3VVFA 2F36A 3V8XB 5I2NA 2DVCA 2OWSA 2Z8EA 1OVBA 1QUIA 1TFDA 3IOWA 3K6WA 3MUQA 3QYTA 4P0IA 2IEEA 3CSGA 1Y1ZA 3MZ1A 4H5GA 4KI0E 1VSOA 1MXUA 3PUWE 3O66A 3ILUB 3SERA 3CIJA 4ND9A 3ONMA 3BFUA 3OXNA 4U4XA 1SW2A 3PPOA 1EZOA 1P1QA 5I59A 3FZVA 4I8CA 4NF8B 3K2DA 4ZDMA 1IXIA 5CBSA 3ZSFA 4RPNA 1MDP1 4H6DA 3SESA 4EUOA 4IO4A 4OETA 3V83A 3MVZA 5DYHA 1DPEA 4HCYA 1HSLA 4IO3A 3TMGA 1GTKA 1MRPA 2DYXA 4FIMA 3MAMA 1ZTYA 5CC2A 1XHYA 4GFRA 2UVHA 3HO7A 4ELRA 1B6HA 1Y4TA 1IITA 2UVIA 3B7DA 3M3LA 1SW4A 2F7CA 2I3WA 3M3FA 3M8UA 3MZ9A 4NEDA 2HAUA 2V84A 4OXVA 2VOZA 3SEXA 3TDJA 3CVGA 1IXHA 1H44A 2XXHA 2Y7RA 1FTKA 3RUMA 1NH8A 1EH3A 1FW0A 2ONRA 2DE2A 2LAOA 5B70A 3K6XA 3MP6A 5I59B 1TT1A 4ZEBA 3KGCA 5I2KA 5KZTA 1URDA 3UP9A 2WKYA 1LSTA 4I1DA 2ZNTA 3EPEA 2F35A 1MS7A 3HPIA 3K1NA 2NXOA 5F7VA 4H0WA 4ECFA 4UA8A 4PFUA 1DMBA 1QW0A 1B5HA 1USYE 4AQ4A 2I48A 2QS2A 1SI0A 3K1MA 4U23A 5TPAB 4BDMA 2E1SA 4YB7A 1P1WA 1MM7A 1RKMA 4OEUA 1IXCA 5K2XA 2BJJX 3C4MA 3KOTA 4GXAA 5L8DA 3TCGA 3SEUA 1IQ7A 3OD7A 5I56A 1O63A 1OVTA 4DE8A 4F3GA 3MVWA 1IXGA 3RT6B 1O7TA 5JTYA 1H45A 3U93A 1AOVA 5BWJA 4JDFA 4YB6A 4GQOA 1B2HA 1II5A 1P1NA 2XXUA 4LQ5A 4R9GA 3BBRA 3FD3A 4XKQA 3SEWA 1LAHE 4AB6A 5AA4A 3K0VA 4F3SA 1UTHB 3KSJA 4KYDA 3E3KA 4KCCA 1N3WA 2RC8A 3OELA 4MBPA 4OFOA 3PUZE 4DXCA 1AIVA 2AIXA 4OYVA 4EQ9A 3K00A 4NTLA 3DM0A 3OMBA 4NWDA 3RTFB 3SEYA 3KJ7A 4PFTA 1B51A 1M5CA 4F31B 3VLVA 4HTGA 2XHDA 3IJXB 3G7WA 3R26A 3FUZA 4JSOA 5TP9B 4F3BA 4IY5A 2XXIA 5M2VA 4TQUQ 3UA8A 4GL8A 3PMXA 4TLMB 3Q26A 5TP9A 3E9XA 3CRBA 4X1BA 4YMBA 2V25A 3HCQA 1VFDA 2YJPA 4X48A 2H25A 3C32A 3MW0A 1ZJLA 3FVGA 4QFKA 1OQHA 3PPQA 4POWA 3IJOB 1ELJA 3QAXA 4K3FA 3OO8A 5HPQA 3QK6A 1AL3A 4MH5A 1XS5A 1XVXA 2Q89A 3OENA 3QUFA 1MDQA 4KFQA 3T66A 1IUDA 1NMUA 4NF5B 5CI5A 2QRYA 3GLBA 2Z8FA 3SETA 2ONKE 4U22A 4M1VA 4NMYA 4G77A 1MXZA 4O3BA 5H8QB 3UN6A 4F1UA 5EHMA 1R1NA 1MH3A 2Q2AA 3HV1A 3G3GA 3JV9A 3LBSA 3O2AA 2VP1A 3PD9A 3PV0E 3RTWB 5BUUA 4ELOA 3EHUA 4NWCA 3TQWA 1N7WA 2Z22A 3HHGA 1RYOA 1JW5A 1USYH 2QJEA 1Z7ME 3KN8A 1DTZA 3H6TA 1YTVA 1OIBA 4P11A 5DVIA 3T9XB 1QUKA 4IGTA 5L9MA 3CFLA 3TELA 2O1LA 3C31A 4ZE9A 1T0KA 4OFJA 4POXA 3PU5A 1MY2A 1B1HA 4IO5A 2ANJA 5I57B 5FHNA 4QFNA 3IB2A 3OSQA 4JB7A 4BLAA 1N0TA 3VVEA 2VD3A 4QF9A 2I4BA 1MM6A 2QS3A 1MQIA 3IOVA 3B6QA 3K4UA 1UQWA 4BDLA 2F6GA 4XTCQ 4U4SA 1B3HA 1UIVA 1VFEA 1HSEA 1Y3NA 3E4RA 4YKPA 5CMMA 4E0WA 2Y7KA 2XXRA 4NF6A 1I6QA 3S9EA 1LBCA 3RNNA 1WDNA 3PPNA 3VV5A 4BDNA 3KEIA 4MF3A 4QFOA 1OMPA 2DWAA 5AA2B 5CMCA 1DPPA 2RCBA 4KQPA 5I2NB 3GBBA 1Y20A 2PT2A 3MVXA 4QHQA 1HSJA 2P2AA 4F1YA 4F22A 1LAGE 2PYYA 1JVYA 4LVQA 1JW4A 1R9QA 1SYHA 2VD2A 3A3CA 3FIRA 4G8NA 3THIA 3IK6B 4G4PA 2RF1A 1DOTA 4G8HA 4LP2B 3UORA 5I58A 2RCAA 1CB6A 3MZBA 4QFPA 3VLWA 2GFEA 3CG3A 3N94A 4WKMA 2OK2A 1B32A 1OLCA 1D3KA 4FORA 3H6VA 4KYEA 1PB7A 2DSFA 2O68A 4QSCA 2A5SA 1PB8A 3LR1A 3Q25A 2RINA 4IGRA 5FTHA 4EXKA 1TWYA 3EQ1A 2QMXA 2QPQA 1M5FA 3QSLA 3T9HB 4EQBA 2NVUB 2A5TA 3E13X 3IX1A 5KDTA 3TFLA 4RK2A 2DS9A 5DTBA 2HCAA 2OCUA 4JWXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BKAA 2XWVA 4HCWA 4KCDA 4BDQA 3RPWA 3FV1A 4X04A 2ZNUA 3Q29A 2F78A 3VE1B 2Q9TA 4PE3A 2H9BA 1YYZA 4OTEA 1XOCA 4RA1A 3O97A 1FQAA 1MY1A 1FTOA 2WBBA 3Q28A 1B46A 4ZDMA 2PX1A 2DE4A 2XX8A 4PGPA 3MYUA 3T93B 2GH9A 1FPIA 4FAJA 2V3TA 3CFZA 4GWUA 3CHGA 3TZAA 1FQEA 4LATA 1MY4A 4R72A 2PFZA 4HE2A 3R7XA 2ZZWA 1SBPA 4DXUA 1MY0A 4ZEKA 1FBPA 5CBRA 1FSAA 4F1VA 3D1RA 2QSXA 2I0BA 5FHOA 4ZEIA 4GVOA 5H8QA 3I6VA 4I3YA 3C35A 5AA1A 2O69A 2G93A 2WEFA 1CE2A 4PP0A 5EHSA 3TTMA 4PFWA 3K6VA 4O3AA 1NNKA 2R6GE 3IOUA 1A8FA 1O64A 1NV7A 3FBPA 4OVRA 1MPDA 5CMKA 2O7IA 3TEPA 2Y7PA 1PBPA 4EF1A 3BFTA 4JVIA 1G0HA 3UIFA 2Y7WA 1KA1A 4H65A 1TXFA 5DEXA 3RPLB 1QUJA 2DVZA 4QRZA 5L9OA 4JBZA 4N07A 1IMCA 4R74A 3U94A 1MQGA 2A5TB 4F39A 4Q5TA 1R9LA 2RKMA 2ONSA 2IA4A 4PCDA 2GHAA 1B7HA 1QJMA 4XKPA 5A5XA 2F5XA 3UGWA 1LAXA 2P1SA 1SI1A 1B7ZA 3AXFA 1LCTA 1SD3A 2REGA 3PMWA 1PBQA 4ESXA 3VXCA 2HPGA 3DP8A 1FPJA 2F3BA 1B5JA 4AB5A 3IB0A 3TAJA 1US4A 2HEUA 4P47A 1UIUA 3KOSA 1B4HA 5H8SA 3T9VA 3DLNA 5A5XB 4BDOA 2F97A 3FGSA 4F2OA 5KCJB 3OSRA 3N6UA 4JXIA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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