The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
TAGKIFRAMYDYMAADADEVSFKDGDAIINVQAIDEGWMYGTVQRTGRTGMLPANYVEAI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 in muscles: solution structure of the SH3 domain from nebulin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
NEBULIN
|
| molecule tags |
Transferase
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| total genus |
5
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2DL5 A; 2KRO A; 1H8K A; 5EC7 A; 4CC3 A; 1ZX6 A; 2XMF A; 2ECZ A; 2F2W A; 3QWY A; 1WXT A; 2M0Y A; 4QT7 A; 3ULR B; 2GNC A; 1T3S A; 2AZV A; 2CT3 A; 2K3B A; 3SHW A; 1U06 A; 3PVL A; 4OMQ A; 3IQL A; 2KNB B; 2DA9 A; 2KYM A; 3M0P A; 1PRL C; 4AFZ C; 2AKL A; 1WFW A; 1X2Q A; 1Z9Q A; 3EGU A; 1K9A A; 2DLP A; 1WXU A; 2C0T A; 4J9D A; 4R0K A; 1I07 A; 2GBQ A; 1VYT A; 3EG2 A; 2L3P A; 4Z8A A; 2OI3 A; 3M0Q A; 2V1R A; 2X3W D; 1SRL A; 1UJY A; 1HD3 A; 2DL8 A; 2EYY A; 2FRY A; 1UG1 A; 2HDA A; 2L0A A; 1XOV A; 2F2X A; 4K11 A; 4HVW A; 1UFF A; 1WYX A; 4DEY A; 1K0X A; 4X1V A; 2HCK A; 1KJW A; 2CH4 A; 1ABQ A; 3CQT A; 3I9Q A; 2RQV A; 1BK2 A; 1X43 A; 1IO6 A; 1BU1 A; 2DRK A; 2MIO A; 1ARK A; 5GJV B; 4CC4 B; 1M3C A; 2KGT A; 1ZSG A; 2D8J A; 1OPK A; 1X69 A; 1YCS B; 3VS4 A; 4F17 A; 2FPE A; 2DF6 A; 5ECA A; 2J06 A; 2A08 A; 2EYX A; 1AWO A; 5FWC A; 2FRW A; 1T0H A; 3GBQ A; 3UA7 A; 2RQW A; 2KE9 A; 1WA7 A; 5FW9 A; 1ABO A; 2CT4 A; 2NUZ A; 1GCP A; 4J9C A; 2O88 A; 2O2O A; 5GJW B; 1GL5 A; 1VYU A; 3VS3 A; 1QLY A; 1AWJ A; 2EW3 A; 3UA6 A; 1UJ0 A; 2KT8 A; 2V1Q A; 1YWO A; 2K6D A; 1AWX A; 2CH4 W; 3VS2 A; 2DYB A; 2QDL A; 5IHN A; 1JU5 C; 1M3A A; 2LQN A; 2ENM A; 2YSQ A; 3QWX X; 2EBP A; 4AG2 C; 4J9B A; 1T0J A; 3U23 A; 3UAT A; 2O31 A; 2A36 A; 1W70 A; 4JJC A; 1CKB A; 1JO8 A; 2CDT A; 3H0I A; 2GTJ A; 2L3S A; 3RBB B; 2E5K A; 1KIK A; 1JXO A; 1RI9 A; 2ROT A; 2LNH B; 1X2K A; 1PKT A; 5HCK A; 1YN8 A; 2J7I A; 2C0O A; 2C0I A; 2KEA A; 2YUO A; 3I5R A; 2VWF A; 1WI7 A; 2LP5 A; 1U3O A; 2O9S A; 2KR3 A; 1FMK A; 4RTT A; 1UHC A; 1OOT A; 2BZY A; 2VVK A; 3SEM A; 5IHI A; 1GBQ A; 1A0N B; 2JTE A; 3NMZ C; 4RTV A; 2CUD A; 3EHR A; 1I1J A; 3VS0 A; 2RQT A; 2D8H A; 4ESR A; 3PE0 A; 3NHN A; 2HSP A; 2KYB A; 1TUC A; 1TG0 A; 2DNU A; 2DJQ A; 2EYZ A; 2KXC A; 4AFS C; 1OPL A; 1WIE A; 2KRN A; 1UE9 A; 2AZS A; 4FSS A; 2IIM A; 2SEM A; 1J3T A; 3TVT A; 4WCI A; 1PKS A; 1MUZ A; 4LE9 A; 1H92 A; 2MCN A; 2OAW A; 4J9H A; 4HCK A; 2PTK A; 2LZ6 B; 1HSQ A; 3UF4 A; 2FG0 A; 2HBW A; 2JM9 A; 3VS1 A; 4Y92 A; 1AZE A; 2JM8 A; 5IHK A; 1JQQ A; 2EVR A; 1JEG A; 2RQU A; 2X3X D; 1ZUY A; 3EHQ A; 3A98 A; 2EKH A; 2LJ1 A; 4D8D A; 1RLQ C; 1NLO C; 3REA B; 2J05 A; 1NYG A; 1N5Z A; 3NPF A; 4OML A; 2DRM A; 2KBT A; 1W6X A; 1M8M A; 3JV3 A; 2RN8 A; 3M0U A; 2AK5 A; 1EFN A; 2KT1 A; 2JMC A; 4JPB W; 4AFU C; 5I11 A; 1GCQ A; 2EGA A; 1H3H A; 4Z88 A; 1B07 A; 1WLP B; 2RMO A; 2KRM A; 2HEQ A; 2DL7 A; 4RTY A; 1OEB A; 2LQW A; 2M51 A; 1GBR A; 4IIM A; 1GFC A; 3H0F A; 1PNJ A; 2K2M A; 4JZ4 A; 4JJD A; 2P4R A; 3NGP A; 1AZG B; 4E6R A; 1I0C A; 3VS6 A; 4OMN A; 1LCK A; 1UHF A; 1YP5 A; 1ZLM A; 4J9F A; 4IIO A; 2LCS A; 4LUD A; 3C0C A; 3VRY A; 1NEG A; 1UTI A; 4OMM A; 4OMP A; 4LNP A; 1ZUU A; 1FYN A; 3M0S A; 2OJ2 A; 1AWW A; 1ZBJ A; 3LH5 A; 4J9G A; 4AG1 C; 1UUE A; 3H0H A; 2DBK A; 1QWE A; 2EQI A; 1E6G A; 2ROL A; 1CKA A; 4AFQ C; 3H41 A; 2YUQ A; 2LJ0 A; 2SRC A; 3EG3 A; 2RQR A; 2BZ8 A; 1SEM A; 3I35 A; 4CC7 A; 3KFV A; 2EPD A; 2EGC A; 4RTX A; 2ED0 A; 1WDX A; 2G6F X; 2K9G A; 2MOX A; 2GTO A; 4KRT A; 1KFZ A; 1TUD A; 2FPF A; 2RPN A; 2I0N A; 1SHF A; 3R6N A; 4LUE A; 5L23 A; 2RNA A; 1K0S A; 4CC2 A; 1K4U S; 1BBZ A; 1WX6 A; 2A37 A; 2DVJ A; 4EIK A; 1W1F A; 1Y0M A; 1GRI A; 1YWP A; 2BTT A; 2W10 A; 4F16 A; 1AD5 A; 2D0N A; 4HVU A; 2ED1 A; 2YUP A; 1K76 A; 1UDL A; 2BZX A; 4M4Z A; 1B3Q A; 2JS2 A; 1G83 A; 2YT6 A; 2FO0 A; 1M27 C; 1U5S A; 2ESW A; 1NM7 A; 4ORZ A; 1QKX A; 1SRM A; 2CSQ A; 5FWB A; 3M0T A; 2O9V A; 4RTU A; 1VYV A; 1RLP C; 2GQI A; 3VRZ A; 4Z89 A; 2DMO A; 1X27 A; 1SHG A; 1GCQ C; 2W0Z A; 2VKN A; 1Z9Z A; 2RF0 A; 4JJB A; 1JXM A; 1KSW A; 1OV3 A; 2KRS A; 3O5Z A; 1S1N A; 3PVQ A; 3REB B; 1VA7 A; 2DL4 A; 3TSW A; 1NLP C; 1QCF A; 1CSK A; 2JS0 A; 2LX7 A; 2JW4 A; 2YDL A; 3M0R A; 2YUN A; 4LN2 A; 1E6H A; 2EGE A; 2FPD A; 2L3Q A; 3I5S A; 2JMA A; 1RUW A; 4D8K A; 4F14 A; 2ABL A; 1YNZ A; 4ZNX A; 2K7A A; 1QKW A; 2PZ1 A; 2JXB A; 1MV3 A; 1X6B A; 1UGV A; 3THK A; 2KXD A; 2CRE A; 4J9I A; 1MV0 B; 1X6G A; 2J6F A; 3FJ5 A; 1AOJ A; 2H8H A; 2PNI A; 3EG0 A; 2LMJ A; 2FEI A; 1HJD A; 5I22 A; 1T3L A; 1G2B A; 4J9E A; 2D1X A; 4GBQ A; 1M30 A; 5IXF A; 2DBM A; 3TSZ A; 2LJ3 A; 2J6O A; 2DIL A; 2K79 A; 2DM1 A; 3VS5 A; 4GLM A; 1QWF A; 1V1C A; 4JZ3 A; 1ZUK A; 3VS7 A; 2DE0 X; 2AKK A; 2NWM A; 2CUB A; 1BB9 A; 1PRM C; 1NG2 A; 4OMO A; 2DL3 A; 1NEB A; 4HXJ A; 2CSI A; 2JT4 A; 1M3B A; 1AVZ C; 2J6K A; 4RTZ A; 1NYF A; 3EG1 A; 1Y57 A; 3RNJ A; 1K1Z A; 1WXB A; 4DEX A; 2GGR A; 4HVV A; 5IH2 A; 4RUG A; 3ZL7 C; 4RTW A; 1E7O A; 2DX1 A; 5IXB A; 1UEC A; 1GFD A; 1SPK A; 1AEY A; 2B86 A; 2L2P A; 4A63 B; 1SSH A; 2EYW A; 2A28 A; 2F2V A; 1PWT A; 1PHT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 3QZ5 B; 4M77 D; 2DL5 A; 2O4X A; 2Z0W A; 4M7A D; 3MHX A; 5EC7 A; 2EWN A; 1ZX6 A; 1VIE A; 4M75 G; 2ECZ A; 3QWY A; 4XU1 A; 1M90 U; 3ULR B; 1LJO A; 2AZV A; 3CC2 A; 4WTO B; 1NBE B; 5LJ5 d; 3IQL A; 4NS5 A; 3CC4 T; 4DBQ A; 3M0P A; 1PRL C; 4AFZ C; 3J7A F; 1I4K 1; 1D0X A; 3RKX A; 4XU2 A; 3L42 A; 4MDX A; 4E7H A; 3QJ6 A; 1TS9 A; 5GAN 5; 3CD6 Q; 2RJD A; 3CC4 A; 5FRM A; 2JTF A; 1SRL A; 4ZN1 A; 2KSS A; 5GAM f; 2FRY A; 2HDA A; 1YJ9 T; 2HKQ B; 5D6X A; 4K11 A; 1YJN Q; 5GAN d; 1YIJ T; 3CQT A; 4ANJ A; 2EQJ A; 4JS5 A; 1BK2 A; 1IO6 A; 2MK5 A; 2OTJ Q; 2X9H A; 4O5V A; 1YJ9 A; 4JLI A; 4M7D F; 3A8G B; 2VAS A; 4F7U E; 1YIJ A; 5GAN g; 3QBY A; 1VQ7 Q; 1YCS B; 2DF6 A; 4FCY A; 3ZFJ A; 2A08 A; 4Z02 A; 2E4H A; 4LDW A; 1PSF A; 3GBQ A; 2K5F A; 1K8A C; 4QVZ A; 2CT4 A; 2DZC A; 2JZ2 A; 2NUZ A; 2RJF A; 3EFR A; 2X51 A; 1VQ4 A; 3QDF A; 2ZPI B; 1VQ9 T; 2O2O A; 1LVK A; 1G3S A; 3MEA A; 3VS3 A; 5LJ3 h; 1QLY A; 2DXC A; 4FU6 A; 3CCR Q; 2LCL A; 2EQK A; 3MP8 A; 4GLK A; 2V1Q A; 2QDL A; 3CCV T; 5IHN A; 1JU5 C; 4C92 A; 1VQ9 A; 1MNE A; 2EBP A; 3EG9 B; 3OYD A; 3VV0 A; 3V8J A; 3QXE B; 1JO8 A; 3OYG A; 1VQP A; 3CBM A; 2GTJ A; 1RAA B; 3LGL A; 3FB9 A; 2E5K A; 1C1A A; 1JXO A; 1RI9 A; 2VV5 A; 2LT4 A; 4EMG A; 3JB9 J; 2GQV A; 1OZ2 A; 1WZO A; 4II1 A; 2E6N A; 2KEA A; 2YUO A; 1YHQ T; 3I5R A; 1UEB A; 5FRO A; 1WI7 A; 2LP5 A; 2KR3 A; 3QDR B; 4RTT A; 3OYB A; 1OOT A; 2CKK A; 2CUD A; 3EHR A; 2EFI A; 2DTI A; 3VS0 A; 4JS4 A; 1YHQ A; 2D8H A; 3OYJ A; 2FZK B; 2NUP B; 3NTH A; 2KYB A; 1TUC A; 1N27 A; 3OMC A; 1TG0 A; 3G4S Q; 4KGX B; 1OPL A; 2AIR B; 1VQM Q; 1WIE A; 3CD6 A; 2KRN A; 4C5G A; 1UE9 A; 2AZS A; 4FSS A; 3EGD A; 4JLG A; 3TVT A; 1MUZ A; 3RKY A; 2RA2 A; 4M77 C; 2LZ6 B; 4Y92 A; 3RKW A; 2WSF E; 1BKB A; 1AZE A; 1V29 B; 2JM8 A; 3QUI A; 4PFO A; 5IHK A; 1JEG A; 1D0Y A; 1WHJ A; 2VB6 A; 2VYT A; 4M78 D; 3A98 A; 2K5I A; 1N9S A; 4D8D A; 2YRD A; 2QQ9 A; 2DER A; 1KHI A; 1NYG A; 1VQ7 A; 1N5Z A; 3QYG B; 2KBT A; 1D1C A; 4J7F A; 2ZPH B; 3ME9 A; 2RN8 A; 1KC8 R; 1Y71 A; 1OI1 A; 1W4S A; 4Z88 A; 1VQ5 T; 4PJO A; 4KT0 E; 2VXF A; 1WLP B; 2KRM A; 4C8Q D; 2DL7 A; 1LNX A; 1PNJ A; 2XID A; 4JJD A; 3LWI A; 1ZA1 B; 5LJ3 j; 2RB6 A; 3CCR A; 3HL8 A; 1I0C A; 1Q95 G; 4V2S A; 1UHF A; 2QQS A; 3QZ9 B; 3RMQ A; 4M77 G; 5LJ5 h; 4LUD A; 4M7A G; 3C0C A; 3VRY A; 1UTI A; 4OMM A; 3V8L A; 1OZ3 A; 3M0S A; 5CCA A; 1P92 A; 2P0P A; 3LH5 A; 2YRV A; 4AG1 C; 1UUE A; 1IZ6 A; 1QWE A; 2PVG B; 2COY A; 4PL6 A; 1ZSZ C; 4IUP A; 3OYK A; 2XHC A; 5D6Y A; 2LX9 A; 3EG3 A; 2QQR A; 2RQR A; 2BZ8 A; 3I35 A; 3CCQ T; 4M75 A; 5D6W A; 1IB8 A; 3L2W A; 4J8O A; 3A8H B; 5GAN h; 2ZPF B; 4N4H A; 2MOX A; 2G3R A; 4B9X A; 4F04 B; 2EIF A; 3R6N A; 5KYY B; 1WHH A; 2FZC B; 5FU7 C; 2DET A; 3O8V A; 1M90 R; 2BTT A; 2W10 A; 4M77 B; 4F16 A; 1AD5 A; 1GXI E; 3HTR A; 1V76 A; 2BKD N; 1M90 C; 4M4Z A; 2JS2 A; 1G83 A; 3G4S A; 2FO0 A; 2YLC A; 4ORZ A; 3CBO A; 5FWB A; 4RMO A; 4RCB A; 1YI2 Q; 1D3B B; 1RLP C; 4BY6 B; 1X27 A; 3OBY A; 1SHG A; 1H3Z A; 3PVQ A; 4X9D A; 4OB3 B; 4XU3 A; 4C0D B; 5KH6 A; 2K2V A; 2JW4 A; 1IRX A; 1RAG B; 2QQB A; 3SD4 A; 1NJI U; 2EGE A; 5AYF A; 1UGQ B; 1K8A U; 3I5S A; 1G5V A; 3CCJ Q; 1M9S A; 1N9R A; 2K7A A; 2QQA A; 3T9N A; 3FLG A; 3EGX B; 1MV3 A; 1X6B A; 2CRE A; 4ZTF A; 6AT1 B; 4LDY A; 2HKN A; 2F1L A; 2EQM A; 3OB9 A; 2PVO B; 2K3X A; 2HQH A; 4Y91 A; 2CP7 A; 2BE7 D; 2DD4 A; 2DVE A; 4DOV A; 1T3L A; 4VUB A; 4PLI A; 2D1X A; 2RM4 A; 4PFP A; 3C95 A; 3QKJ A; 1M30 A; 5CKB A; 3PMT A; 5KE3 A; 4J6W A; 3ZEH A; 4KGV B; 2DIL A; 4GLM A; 1IRE B; 3CXC A; 1AT1 B; 5CKH A; 5CR2 A; 4DBR A; 4M78 C; 1G8X A; 5LJ5 j; 1NG2 A; 1TOV A; 3CCU Q; 3GPL A; 3S3M A; 2DXT A; 2DL3 A; 3CXC P; 4DQ2 A; 4HXJ A; 3MEV A; 2EJF A; 2GFA A; 2PU9 B; 4JRP A; 1MND A; 4RTZ A; 1NYF A; 1NPP A; 1QVF S; 1Y57 A; 3M57 A; 2CZ7 B; 4PFZ A; 2CZ1 B; 5FU7 B; 2WAC A; 2QK0 A; 4HVV A; 4RUG A; 1KK7 A; 4C8Q C; 5GMK l; 3OYL A; 1RAB B; 1VQL T; 4C92 F; 5IXB A; 4HCC A; 1XJW B; 1GFD A; 1AEY A; 2B86 A; 5GAN j; 2KAF A; 2L2P A; 2EYW A; 5LJ3 e; 1PHT A; 2DJZ A; 3OMG A; 3EH1 A; 1VQL A; 5A0L A; 2CZ6 B; 4QT7 A; 2YWW A; 1D1A A; 1T3S A; 1R0B G; 3SHW A; 3PVL A; 3OW2 A; 4N0A C; 4C0F A; 4IKF A; 2KNB B; 1EZZ B; 4M78 G; 4MZP A; 2AKL A; 4FW2 A; 1Z9Q A; 1K9A A; 2DLP A; 2KK4 A; 3CME Q; 3M4Y A; 2HMA A; 3OW2 P; 3RER A; 2C0T A; 3CPF A; 1YBY A; 1I07 A; 4J9D A; 2GBQ A; 1M2O A; 4ZN3 A; 3QO3 A; 4Z8A A; 1BI0 A; 3PIP A; 2RHZ A; 1B34 A; 2RK1 A; 4XTU A; 1YI2 A; 2FB7 A; 2X3W D; 1UJY A; 3DKM A; 5I2S A; 3BW1 A; 5KYX B; 4HT8 A; 4L59 A; 4ZGJ B; 1R77 A; 4C8Q G; 4N4G A; 1KD1 U; 2VC8 A; 4HVW A; 3JCM J; 1UFF A; 1VOM A; 1K0X A; 1KJW A; 3VJP A; 1PM3 A; 3LH0 A; 1YIT T; 1H64 1; 1X43 A; 4C92 E; 3MEU A; 2DRK A; 2MIO A; 4EMK A; 2OX7 A; 5GJV B; 2CP0 A; 2EQU A; 1S72 T; 3C94 A; 2DEQ A; 3VS4 A; 1C0M A; 4FW1 A; 3CC7 T; 1SG5 A; 2EYX A; 1M8V A; 2EAY A; 2LT1 A; 3UA7 A; 2RQW A; 2QTX A; 4NL2 A; 5FW9 A; 1S72 A; 2E64 A; 1M5Q 1; 4J9C A; 4M7A A; 3CC7 A; 1GL5 A; 1AWJ A; 2NUT A; 3I56 Q; 1FMV A; 2EW3 A; 2KT8 A; 1LPL A; 1VIF A; 3OW2 S; 4PJM A; 2QI2 A; 4PLL A; 2DYB A; 4C8Q B; 1VQ6 T; 3CCU A; 2LVM A; 3L2Z A; 2YSQ A; 1Q86 U; 4AG2 C; 3TU4 K; 3CEY A; 1T0J A; 4PJO F; 3S3O A; 3U23 A; 1MHN A; 3CBP A; 2O31 A; 1W70 A; 3X25 B; 2ZPG B; 4ZGD B; 3RDV A; 2V8K A; 3H0I A; 1VQ6 A; 2EJ9 A; 3RMS A; 2QGF B; 3HPW A; 3JCM g; 1RAI B; 3CC2 T; 1FXX A; 1PKT A; 1X2K A; 4XTX A; 2JNG A; 2J7I A; 2C0O A; 2C0I A; 3JCM f; 4F7U G; 4AMC A; 1U3O A; 2HZY A; 1UHC A; 4LDU A; 5IHI A; 4A54 A; 5GAM d; 3CME T; 4M7D C; 1A0N B; 4LXC A; 5LJ5 e; 2KMT A; 4XTZ A; 2RQT A; 2M1H A; 1ZSZ A; 4M75 F; 1Y7X A; 4C5E A; 2RJE A; 1IHV A; 3CME A; 2MAM A; 3CCL Q; 5GAM g; 2V26 A; 2L8D A; 4AFS C; 3WXM B; 1FWZ A; 3OSV A; 4ME7 A; 5GAO n; 2V8I A; 2IIM A; 2H3E B; 5GAN e; 2JOY A; 1KG1 A; 4WCI A; 4LE9 A; 3E2U A; 1H92 A; 2XIC A; 2QDY B; 4UC4 A; 4RKU E; 4MZM A; 2JM9 A; 4R55 A; 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