The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
5
|
sequence length |
60
|
structure length |
60
|
Chain Sequence |
TAGKIFRAMYDYMAADADEVSFKDGDAIINVQAIDEGWMYGTVQRTGRTGMLPANYVEAI
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
SH3 in muscles: solution structure of the SH3 domain from nebulin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
NEBULIN
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Transferase
|
| total genus |
5
|
| structure length |
60
|
| sequence length |
60
|
| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-08-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF14604 | SH3_9 | Variant SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3KFV A; 2RQV A; 2B86 A; 2A28 A; 4OMQ A; 2X3W D; 1T0H A; 2YDL A; 4JZ3 A; 4K11 A; 2NWM A; 1E6H A; 2K79 A; 2RQR A; 2V1R A; 1RUW A; 1K9A A; 1WLP B; 3JV3 A; 5IH2 A; 2JMC A; 1AVZ C; 2K9G A; 3ZL7 C; 2C0O A; 3I9Q A; 2MCN A; 2JM9 A; 1TUD A; 2YUQ A; 2DL8 A; 3PVQ A; 1G2B A; 4J9F A; 1GFC A; 1NYF A; 1NG2 A; 1E7O A; 4LE9 A; 1GCP A; 1VA7 A; 1GRI A; 1UJY A; 4JJC A; 2KT1 A; 3I5S A; 2YUP A; 2OJ2 A; 3EGU A; 3VS3 A; 2KYM A; 4RTY A; 3C0C A; 3RNJ A; 2D8H A; 2FO0 A; 2CUB A; 2BTT A; 4LUE A; 2DIL A; 1PWT A; 2GTJ A; 1KJW A; 2DL5 A; 3REB B; 1XOV A; 4F14 A; 5I22 A; 2OAW A; 1X43 A; 2YT6 A; 3VRY A; 3H0H A; 1GL5 A; 4CC2 A; 2RQW A; 2GGR A; 2CT3 A; 2FPE A; 4ZNX A; 2CDT A; 3QWX X; 1WDX A; 3VS6 A; 1MV3 A; 5L23 A; 2ESW A; 1WXB A; 2VWF A; 1U5S A; 2CSI A; 1SSH A; 4RTZ A; 1KSW A; 1AEY A; 2DRK A; 1PRM C; 2DL3 A; 1AOJ A; 4AFU C; 2GBQ A; 1NM7 A; 1K76 A; 2AZS A; 4AG2 C; 1H92 A; 1NEG A; 4RTX A; 3M0P A; 4M4Z A; 1JXO A; 1X69 A; 3TSZ A; 4QT7 A; 1OV3 A; 3UA6 A; 1HSQ A; 2LZ6 B; 3CQT A; 3EG1 A; 2HCK A; 2J06 A; 2FPD A; 1LCK A; 3UAT A; 1WIE A; 2D0N A; 3IQL A; 1ZBJ A; 1CKA A; 4J9B A; 2KRN A; 4A63 B; 4OMM A; 1EFN A; 1JO8 A; 1HD3 A; 1ZUU A; 2F2X A; 2NUZ A; 1AWX A; 3M0R A; 1VYT A; 1I0C A; 1AD5 A; 2DMO A; 1A0N B; 2FPF A; 2JMA A; 3I35 A; 2KYB A; 2PZ1 A; 4IIO A; 2O2O A; 1YWP A; 1K0X A; 2RQU A; 3SEM A; 2DM1 A; 3VRZ A; 2LMJ A; 3M0T A; 1U3O A; 1QKW A; 2HEQ A; 5FWC A; 1Y57 A; 2HSP A; 3TVT A; 2EYX A; 3O5Z A; 2KBT A; 1K0S A; 2FEI A; 2DRM A; 4JJD A; 1JU5 C; 1GFD A; 3H0I A; 1I1J A; 1TUC A; 3A98 A; 1UDL A; 1T3L A; 1NYG A; 1SEM A; 1SRL A; 4J9C A; 1BU1 A; 2RPN A; 1KFZ A; 2K6D A; 2FG0 A; 2A36 A; 2MOX A; 1BBZ A; 2DX1 A; 3M0Q A; 2V1Q A; 2DJQ A; 1YP5 A; 4J9I A; 2G6F X; 1BB9 A; 1AWJ A; 3ULR B; 3RBB B; 2EBP A; 4ORZ A; 3FJ5 A; 2CRE A; 2SRC A; 3NMZ C; 2RQT A; 2ED1 A; 2CUD A; 1VYU A; 2J7I A; 2LQW A; 2XMF A; 1NEB A; 4RTV A; 4FSS A; 1WXT A; 1OEB A; 2DF6 A; 1X6G A; 4Z8A A; 3H41 A; 1UE9 A; 1M30 A; 1H3H A; 4HXJ A; 1PKS A; 3NGP A; 2D1X A; 2AK5 A; 1K1Z A; 4OMN A; 2KT8 A; 4LN2 A; 4CC4 B; 1WA7 A; 2SEM A; 5IXB A; 2DYB A; 2DL7 A; 2JM8 A; 1W1F A; 1QWE A; 1U06 A; 2KE9 A; 2X3X D; 1OOT A; 4HCK A; 2ENM A; 2EVR A; 3EHQ A; 2JS0 A; 1UHF A; 3NHN A; 2LX7 A; 1TG0 A; 2EGC A; 1G83 A; 2EW3 A; 1T3S A; 1X27 A; 4DEY A; 5HCK A; 4GBQ A; 4R0K A; 2O88 A; 2AKL A; 4E6R A; 1SPK A; 2ECZ A; 2EQI A; 2IIM A; 2ROL A; 5IHK A; 2EYY A; 1S1N A; 2JT4 A; 1YN8 A; 1ZX6 A; 1PHT A; 3TSW A; 4Z89 A; 3VS4 A; 4HVV A; 2DBM A; 2GQI A; 1RI9 A; 4OMP A; 2CSQ A; 1ARK A; 2J6F A; 5IHI A; 2YUN A; 4D8D A; 3LH5 A; 2I0N A; 2DVJ A; 4Y92 A; 3SHW A; 2YUO A; 2AZV A; 1FYN A; 1UFF A; 1ZUY A; 3H0F A; 1WXU A; 1UUE A; 2JS2 A; 2KXC A; 1PRL C; 4D8K A; 1FMK A; 2E5K A; 2M0Y A; 1MUZ A; 1QCF A; 3VS1 A; 2K7A A; 1OPK A; 2KNB B; 1WYX A; 1W6X A; 2PTK A; 1JXM A; 1W70 A; 1Z9Z A; 3R6N A; 2KRM A; 2JW4 A; 1V1C A; 1HJD A; 1IO6 A; 4OMO A; 2L3Q A; 4CC3 A; 1GCQ A; 3EHR A; 4JZ4 A; 2DBK A; 1JEG A; 1SRM A; 3PVL A; 1Z9Q A; 2J6O A; 2A37 A; 2F2W A; 2L0A A; 1UJ0 A; 1PNJ A; 2ED0 A; 2EYW A; 1QLY A; 2L3P A; 2RF0 A; 3EG2 A; 4HVU A; 2FRY A; 4ESR A; 2K3B A; 1ABO A; 1T0J A; 5GJV B; 1NLO C; 1WI7 A; 2KRO A; 5IXF A; 4J9G A; 2LNH B; 3VS7 A; 1M3B A; 4RTW A; 1X6B A; 1H8K A; 1QKX A; 1GCQ C; 1M27 C; 2W0Z A; 4AFZ C; 1BK2 A; 3M0S A; 2LQN A; 2GNC A; 3VS0 A; 1K4U S; 1M3A A; 4AFQ C; 1YWO A; 2DNU A; 2VVK A; 1YNZ A; 2RMO A; 2CT4 A; 2LJ1 A; 2P4R A; 2JXB A; 1GBQ A; 1WFW A; 1UHC A; 2BZ8 A; 4JPB W; 1RLQ C; 2J6K A; 1M8M A; 3NPF A; 5GJW B; 1AWO A; 4J9H A; 2EGE A; 1SHG A; 1UGV A; 4Z88 A; 2LCS A; 4RUG A; 1RLP C; 4KRT A; 1MV0 B; 2MIO A; 3VS2 A; 2BZY A; 2ROT A; 2K2M A; 1WX6 A; 3UF4 A; 3QWY A; 4RTU A; 3U23 A; 2KXD A; 2M51 A; 2O31 A; 2EYZ A; 1B07 A; 2EKH A; 4GLM A; 4EIK A; 5FWB A; 1ABQ A; 2L2P A; 1I07 A; 3UA7 A; 2CH4 A; 5IHN A; 1ZLM A; 1J3T A; 1VYV A; 1ZUK A; 2JTE A; 2C0I A; 2O9S A; 2GTO A; 2DLP A; 3GBQ A; 3M0U A; 3I5R A; 3EG0 A; 4LNP A; 1Y0M A; 1ZSG A; 1UTI A; 2KRS A; 2A08 A; 1OPL A; 1M3C A; 2H8H A; 2FRW A; 2DA9 A; 2LP5 A; 2LJ3 A; 4AFS C; 4J9E A; 5EC7 A; 2C0T A; 2HBW A; 1CSK A; 4LUD A; 2D8J A; 2HDA A; 2KEA A; 2L3S A; 4F16 A; 1JQQ A; 4OML A; 1E6G A; 5I11 A; 1GBR A; 4J9D A; 3REA B; 2PNI A; 1KIK A; 1SHF A; 3VS5 A; 4F17 A; 2DL4 A; 2QDL A; 4CC7 A; 2RNA A; 2VKN A; 4HVW A; 2W10 A; 1NLP C; 5ECA A; 1AWW A; 2AKK A; 2BZX A; 4RTT A; 2YSQ A; 1PKT A; 2ABL A; 2EGA A; 2DE0 X; 1X2Q A; 2CH4 W; 2RN8 A; 1QWF A; 2EPD A; 1UG1 A; 1B3Q A; 1UEC A; 1YCS B; 4JJB A; 1N5Z A; 2LJ0 A; 4AG1 C; 4DEX A; 1AZE A; 2KGT A; 1X2K A; 3PE0 A; 1AZG B; 4IIM A; 3EG3 A; 2J05 A; 5FW9 A; 4X1V A; 2OI3 A; 4WCI A; 2F2V A; 3THK A; 1CKB A; 2O9V A; 2KR3 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2QQR A; 1M2V A; 1RL2 A; 3FRN A; 1Q81 C; 2B86 A; 2A28 A; 2MMP A; 2P84 A; 2R58 A; 4C0Z A; 1E6H A; 2VXF A; 2V1R A; 2RK2 A; 1RUW A; 2M1H A; 1K9A A; 5FU7 B; 5KE3 A; 3CC4 T; 2XD0 A; 1Q86 C; 3ZL7 C; 1RAG B; 3I9Q A; 3MPU B; 2MCN A; 2YUQ A; 2DET A; 2DL8 A; 1M1G A; 2QQ9 A; 1GFC A; 2XID A; 4PJN A; 3QYH B; 4M7D G; 2QAS A; 1NG2 A; 4JJN K; 1E7O A; 4LE9 A; 2FZG B; 5KCH A; 1UJY A; 4JJC A; 2XKO C; 4QVD A; 3CCL A; 1W2B S; 5D6X A; 3VU3 C; 4M7D C; 5GAN 4; 4DBF A; 3I55 Q; 4XTV A; 4N4I A; 2GFA A; 5KH6 A; 2RD1 A; 2DXB A; 2ZPF B; 5LJ3 d; 4IUU A; 2QG9 B; 2P4T A; 2CUB A; 2KAF A; 1PWT A; 1KJW A; 3H9N A; 1WHJ A; 2DL5 A; 3FDR A; 1WNL A; 1XQH A; 3REB B; 1XOV A; 2K3X A; 4FCY A; 2V8J A; 3TEE A; 5GMK j; 2H3E B; 1X43 A; 1Q82 C; 2LQ8 A; 2RQW A; 3QJY A; 3QWX X; 4AMC A; 3CCM Q; 1TH7 A; 3VS6 A; 3JB9 F; 4DBR A; 1MV3 A; 2ESW A; 4ZGD B; 1MMA A; 1YIT Q; 1SKU B; 2RH2 A; 4E7Z A; 2CSI A; 5CKD A; 3OA6 A; 1SSH A; 4C0D C; 4BI8 B; 2V8K A; 1PRM C; 5J3B A; 4AFU C; 4M78 E; 2DD4 A; 2AZS A; 4AG2 C; 1H92 A; 4RTX A; 2EFI A; 4ZN1 A; 2FHD A; 2P0K A; 4HCC A; 4VUB A; 1PM3 A; 3CCS Q; 1OV3 A; 3S3O A; 1HSQ A; 3JB9 D; 4XQ3 A; 5KYU A; 2CZ1 B; 4PNO A; 1HXD A; 1VQL Q; 1WPY A; 2E6N A; 2PU9 B; 3UAT A; 1AHJ B; 1CKA A; 2A0F B; 1VQN Q; 2AIR B; 3Q1J A; 3CC4 A; 4OMM A; 1EFN A; 4DOV A; 4A4G A; 1ZUU A; 4M75 B; 5LJ3 f; 1VQ9 T; 1Q7Y U; 5IN1 A; 2AHJ B; 2EJ9 A; 5GAN d; 1VYT A; 1RAC B; 3CCJ A; 8ATC B; 3OSS C; 3ZBD A; 2FPF A; 1AT1 B; 2QAZ A; 4M75 F; 2KYB A; 2PZ1 A; 3ER0 A; 4C92 E; 1YWP A; 4C5G A; 3I56 Q; 1S72 T; 3VRZ A; 1U3O A; 2O4X B; 4WF2 A; 1N8R R; 3PFS A; 5FWC A; 1Y96 A; 2NYS A; 4RCC A; 1RAI B; 2HSP A; 2VUB A; 3TVT A; 4LD6 A; 1QP3 A; 3O5Z A; 4FT4 A; 2JUF A; 1TUC A; 1UDL A; 1T3L A; 1SEM A; 1BU1 A; 2RPN A; 4OVA A; 3WVE B; 1QW1 A; 3D7S B; 4M75 D; 1DJ7 B; 4BDZ A; 3P8D A; 4C8Q A; 1BBZ A; 4PL6 A; 4F7U B; 4MDW A; 3G71 Q; 2G6F X; 4MZM A; 3ULR B; 2M0O A; 3RBB B; 2EBP A; 3OW2 P; 5GAM j; 5CKE A; 4F7U F; 2ED1 A; 1D1C A; 1VYU A; 2J7I A; 1RAH B; 2IG0 A; 4M78 C; 3EH2 A; 3CC2 A; 3PGG A; 4RTV A; 4FIB A; 3CCU T; 2PUO B; 1QQJ A; 4GY5 A; 2IPO B; 3OYI A; 3L2U A; 1UE9 A; 1VQK T; 1ZBX A; 3NGP A; 4JUV A; 3LX7 A; 4HT8 A; 3JB9 H; 1OQK A; 2PUK B; 2DL7 A; 2DYB A; 2JM8 A; 1W1F A; 4J5Y A; 2COY A; 2ENM A; 3S3M A; 3EHQ A; 3NFC A; 4PJO F; 2JS0 A; 3V8K A; 3NHN A; 2LX7 A; 1IXD A; 1T3S A; 4DEY A; 5CKF A; 2HQH A; 2AKL A; 3L2V A; 3GPL A; 2ECZ A; 3MEU A; 5IHK A; 3DLL A; 4EMK A; 3TSW A; 4Z89 A; 4HVV A; 4M7A B; 4C92 C; 3RIR A; 1ARK A; 2J6F A; 3C4S A; 4B9W A; 5IHI A; 4M7A F; 4JRI A; 4OGC A; 5FRN A; 3EGX B; 3GOX A; 4PJM A; 4EMH A; 4V2S A; 3G6E Q; 1K73 U; 4Y92 A; 2YRV A; 3PT9 A; 2YUO A; 4PJO D; 2KI7 A; 1UFF A; 3H0F A; 1WXU A; 3PMI A; 2KSS A; 1QVG P; 4J83 A; 2JS2 A; 3QSU A; 1FX7 A; 1HK9 A; 1PRL C; 1PCX A; 3M59 A; 2M0Y A; 2LRQ A; 1VQO Q; 4QQD A; 1WYX A; 1Z9Z A; 4KGV B; 2JW4 A; 1HJD A; 1YJW Q; 1NJI U; 3M54 A; 2QK0 A; 4M7A D; 2RA2 A; 2F1L A; 1GCQ A; 4JZ4 A; 4F7U G; 2L0A A; 2RF0 A; 4HVU A; 4PK4 A; 4ELZ C; 3GIB A; 3LYI A; 5GJV B; 3I55 T; 4LDX A; 4A54 A; 4HA8 A; 1M3B A; 3OSV A; 4LDW A; 3H6Z A; 5GAO m; 2X4W A; 1KC8 U; 1K4U S; 2LQN A; 2GNC A; 5LJ5 f; 2DD5 A; 1G3Y A; 2RI2 A; 1YWO A; 5KE2 A; 2VVK A; 3HKS A; 2RM4 A; 3CC7 A; 3QHS A; 1VQ6 Q; 5J39 A; 2XU8 A; 2CGH A; 2BZ8 A; 2ZPB B; 1RLQ C; 2J6K A; 3CPW S; 3CCM T; 4JLI A; 4OB0 B; 5HY6 A; 2EGE A; 4Z88 A; 2QTV A; 4RG2 A; 2LCS A; 1YIT T; 5GAN j; 5CAI A; 1G5V A; 4Y91 A; 3QWY A; 4LXC A; 2ZCF B; 2KXD A; 2M51 A; 1B07 A; 3TU4 K; 2XG8 D; 5GAO p; 3CBO A; 1ABQ A; 2K57 A; 4BY6 C; 1I07 A; 1RAF B; 3P8H A; 3JCM c; 1ZLM A; 2ZAE A; 3RER A; 1VYV A; 1ZUK A; 2K5I A; 3CCS T; 3EG0 A; 4M75 A; 1W2B P; 4DBH A; 1YIJ Q; 3M9Q A; 1M1K C; 1VQL T; 2A08 A; 3CCR A; 2MAM A; 4AFS C; 2FRW A; 4J9E A; 1JJ2 S; 1VQN T; 2RI5 A; 3ZEH A; 1RAE B; 2LT4 A; 1CSK A; 1QMC A; 1UGR B; 2KEA A; 2L3S A; 4OML A; 4F16 A; 3CBM A; 1VUB A; 2K5F A; 1F1B B; 2KDS A; 1FMV A; 1NBE B; 2MWP A; 3JCM P; 2DL4 A; 2QEX Q; 4XAX B; 2QDL A; 2VV5 A; 3I56 T; 3EFS A; 3JCM X; 1K8A C; 3SWN C; 8AT1 B; 4CI0 C; 4ELY C; 2XDP A; 5KYW B; 1NLP C; 5ECA A; 3BDL A; 3I55 A; 1PKT A; 4PKC C; 3URG A; 2EGA A; 4XU1 A; 2MF2 A; 2CH4 W; 2LT1 A; 1Q7Y R; 1QWF A; 2YRC A; 4RCB A; 2GFU A; 4JRK A; 1UG1 A; 1B3Q A; 1N5Z A; 4DEX A; 5LJ3 g; 2L3R A; 2KGT A; 2JTF A; 4PFZ A; 6AT1 B; 4A53 A; 1X2K A; 3CEY A; 1ZSZ C; 2XDB A; 3KBG A; 3EG3 A; 2KMT A; 2J05 A; 3G71 T; 3EGD A; 1Q81 U; 2E3H A; 2F2V A; 1CKB A; 4F17 A; 3CCM A; 3JCM f; 3J7A F; 2F5K A; 4OMQ A; 1RAD B; 1YIT A; 1T0H A; 2RO0 A; 2YDL A; 4JZ3 A; 2NWM A; 2K79 A; 3PIP A; 1Q86 U; 3MP6 A; 1QVP A; 4M77 B; 1WLP B; 4MML A; 3JV3 A; 1BKB A; 4J7I A; 2JMC A; 1N9S A; 1AVZ C; 4PJO A; 3ZFJ A; 2C0O A; 2JM9 A; 2B8A A; 1IZ6 A; 4M77 F; 2LCL A; 1N9R A; 3CXC P; 2GQV A; 5CKH A; 2KY9 A; 1VA7 A; 3RMQ A; 3CCS A; 3QII A; 2YUP A; 4B6M A; 4X9D A; 2OJ2 A; 1V29 B; 5A2Q E; 5DM7 R; 2LDM A; 3DB4 A; 2PVD B; 2E64 A; 2PQW A; 4ZTJ A; 4M7A A; 4R55 A; 1UB4 A; 2KYM A; 3VUB A; 3EH1 A; 3KUF A; 1VQN A; 3RNJ A; 1N6A A; 3HRT A; 2D8H A; 2BTT A; 3QKJ A; 5DLO A; 1ZQ1 A; 3OW2 A; 1QVF S; 3EGX A; 2A7Y A; 2GTJ A; 5LJ3 e; 4GLK A; 4M77 D; 3C94 A; 3RKX A; 2QA4 Q; 5I22 A; 2OAW A; 3VRY A; 3H0H A; 4CC2 A; 2GGR A; 2CT3 A; 3DB3 A; 5C0M A; 4N0A C; 1ZHI A; 3G6E T; 1SSF A; 3M53 A; 2VWF A; 4A4F A; 3F70 A; 4RTZ A; 2GCX A; 1KSW A; 1AEY A; 1Y07 A; 2DL3 A; 1AOJ A; 2RHZ A; 2Y90 A; 1VQO T; 4UC4 A; 1NEG A; 1YJW T; 4NL3 A; 1PD0 A; 3G71 A; 1K73 R; 1WJQ A; 5GAN 5; 1VQP A; 3TSZ A; 4QT7 A; 3UA6 A; 1VIE A; 2HCK A; 1WIE A; 2RHI A; 3IQL A; 2MPX C; 4E7S A; 4LDU A; 3L1A A; 4J9B A; 2KRN A; 3CCQ Q; 1WJR A; 2LC4 A; 1QCO A; 1YHQ Q; 2F2X A; 3M0R A; 1K9M U; 4KH0 B; 2DTO A; 1MGQ A; 1NJI R; 1QVG A; 1VQ7 Q; 5LL6 S; 1QP2 A; 1A0N B; 4OMF B; 3UWN A; 3WXM B; 3I35 A; 2DXT A; 1YJ9 T; 1VQ4 Q; 3LGF A; 2RQU A; 2DM1 A; 2LMJ A; 2ZGW A; 1QKW A; 4QQ6 A; 1VQ6 T; 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