1ATNA

Atomic structure of the actin:dnase i complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
b'DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic structure of the actin:DNase I complex.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN
molecule tags Endodeoxyribonuclease
total genus 107
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-03-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1atnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1atnA04
3HBTA 3HTVA 5AFUH 3FFKB 4BC2A 1E4FT 1GLJO 3EN9A 4H0VB 2PBDA 4IJNA 1RFQA 2A3ZA 1WUAA 2ZGZA 1T6CA 1ATNA 4BVPA 4BR9A 4XH4A 1ZBSA 2YHWA 5JICA 4HTLA 4WQ4A 3BP8A 1NGIA 3ZX2A 3DJCA 3C7NB 3A5MC 3AY9A 1TUYA 2P9PB 4FWPA 3FGUA 3U9ZA 4CD1A 3TU5A 3LDPA 1NGCA 4H0TB 4JN4A 5E84A 5BPNA 1HKCA 3JS6A 4CD3A 3CJAA 1Q18A 1V4TA 3CI5A 3CJ9A 3VF4A 4YDUA 4K42A 2FSNA 3MN5A 3VENA 4CZIA 1G99A 4JHDB 2P9LA 5BRDA 1QHAA 4FWMA 3LM9A 4BR4A 1T6DA 4BQZA 3J8AA 5AQFA 1RGIA 4JHDA 3VF6A 3HM8A 2YHYA 2NZTA 4H0YB 2FXUA 1ZXOA 3B8AX 5AQYA 3ZETA 4RWTA 3ULEA 5AZIA 4A2BA 3MN9A 3U9DA 3VEWA 4O5FA 3L6QA 2AA4A 2Q31A 3GG4A 3WXKA 3CJBA 4CZEA 4CZFA 5EOYA 4EHTA 4BG9A 5ADXH 2IVOA 3H1VX 3H3OB 2ITMA 3IMXA 4I6MB 1MA9B 3G25A 2D0OA 2HOEA 3UKUB 3UKRA 3IDHA 3EO3A 2CGLA 3UB5A 4JNEA 3BF3A 4H5RA 1U2VB 4BR7A 1JCEA 1ATSA 2FLOA 4BQLA 4WYBA 1Y64A 3F9MA 5AQOA 1ZC6A 4CJ7A 1U2VA 1HLUA 1SAZA 5FPNA 3D7EO 3FE1A 1X3MA 4B1YB 3QB0A 2F9WA 4BR2A 1HPMA 5AZJB 2E2PA 1Z05A 1HUXA 2F9TA 5JMVA 3CQYA 3GE1A 3H46O 2P9SB 4FWQA 1R59O 4FOEA 1BDGA 1JCFA 2ASOA 3L4IA 4CZMA 1OKJA 4H03B 5AQMA 3MN6A 1JCGA 2A41A 3EKSA 1X9JA 3VETA 5BRFA 3ATUA 4JAXA 4Z94A 3ENHA 4PKHA 1GLAG 1NGDA 3WXJA 3LL3A 4H5TA 2E20A 3VEZA 2D1KA 5EY4A 2IVPA 2QWOA 3KZBA 5FPEA 2CGJA 4A2AA 2W40A 1NBWA 3CJCA 2P9KB 3VERA 2OANA 4M63C 4DQ8A 2BUPA 1XQSC 1ESVA 1NM1A 3LM2A 3R8EA 2P9KA 4H5VA 4M7YA 2CH6A 4EFHA 3WT0A 1DEJA 1QZ5A 3QBWA 3D2EA 3UE5A 1NGHA 4CZJA 4WQ5A 4A62A 4B1WB 2YCHA 1HKBA 4BRMA 3VESA 4JD2B 2UYTA 1DKGD 1LOTB 3MDQA 4GY2B 1MDUB 3O4WA 4BR5A 3DAWA 1GLCG 2VCPA 2NLXA 2EWSA 3W3DA 3RSEB 4EHUA 3ZX0A 3CIPA 4BRLA 1GLDG 2A40A 2GWJA 1C0GA 2E1ZA 2VYPA 1J6ZA 3DWLA 3C7NA 2QWMA 4BC3A 2P9PA 3FZFA 1NGJA 3MCPA 5BR9A 4BR0A 3BF1A 4PKGA 2ZGYA 2E8AA 2FSJA 3CQXA 2IIRA 2QWNA 1QQOA 1NGFA 4EIAA 1YVNA 4A61A 5AR0A 3WQUA 2DPNA 4IWVA 4BROA 4BRNA 2V7YA 4H5NA 4BRCA 2E2OA 2P9UB 3VEXA 3WUHA 3H6EA 3VEVA 3MN7A 2E88A 3ZEUB 2FF3B 3FLCO 5KPZA 4BGBA 2P9UA 4M7XA 3SMSA 3R9PA 3AAQA 2YI1A 3LDQA 3SK3A 3ZEUA 1H1VA 3FZHA 5AQUA 1V4SA 3A8YA 4B1XB 2GWKA 2HMPA 5F2RA 1XUPO 1BA1A 3L0QA 5EX5A 3EZWA 2H3GX 4H0OA 1GLBG 5JLHA 1P8ZA 5KPTA 2FSKA 4WQ4C 4XH1A 4BRPA 3D2FB 4EAHD 4I6MA 3O80A 2Q0RA 4PL8A 3EKUA 3P4IA 3LDNA 3UKUA 4K43A 2V51B 4E1JA 5ELZA 2HF4A 3A5LC 4Y0WA 1YAGA 5BN8A 3CETA 2QM1A 4HWIA 2P9IB 2E1YA 3GDQA 3LDOA 3C0BA 3TPQA 3MMVA 5FPDA 3VGMA 4YDUC 5AQRA 3CERA 4BRHA 2P9IA 4ISEA 4BC5A 5AZJA 5AQLA 4BRIA 1TUUA 3QMLA 1HKGA 1U6ZA 4B1VA 3ATVA 3QDKA 2P9SA 3GBTA 3R6MA 4BC4A 2AP1A 5KQDA 5AQPA 2FF6A 4C23A 3H45C 3WEEB 1QZ6A 3H3NO 5ADXA 2NRHA 1BUPA 5E26A 5LY3A 4H5WA 3A5OC 3FR0A 4FWSA 3WEEA 1ATRA 4F9OA 2A6AA 3QBXA 4RCHA 3HSCA 3I8BA 3CHWA 2D4WA 2QWLA 4CZGA 4KBOA 4L3QA 5KPRA 3MK6A 1S3XA 5BPLA 4BRQA 1RDWX 2V7ZA 5B8HA 1KXPA 2GEMA 4NO7A 2P9NB 3I33A 4FPAA 5AQKA 5FPMA 4CBWA 5I9EB 2Q1NA 5AQXA 4QS9A 3FZMA 2A5XA 4MLEA 4ISFA 4FPBA 1XC3A 2P9NA 1NGAA 3O1BA 4XH5A 4LC9B 2YJEA 3WXIA 2CH5A 2KHOA 3H1QA 1NWKA 4IJAA 4IZ9A 3VF2A 5BN9A 3VGKA 3WXLA 2E2QA 4JD2A 3M6GA 1X3NA 3CJ1A 4O8KA 3VOVA 1YXQA 1NMDA 1IJJA 3OHRA 2QWRA 3RSEA 4XEIA 1QQNA 4BRFA 4J8FA 5EXWA 3ENOA 3HI0A 3BEXA 3DXKB 1NLVA 3VPZA 1BOTO 3FZKA 4QS7A 2ASPA 4BRGA 1GLFO 2ZF5O 2GELA 3IFRA 3DXKA 4FL9A 2J4RA 2QWQA 2WUSA 5AQJA 3ID8A 1NGGA 3A0IX 3VGLA 5AFUA 5AQQA 3O5BA 2BTFA 3CJ7A 4BRKA 1TYQB 1D4XA 1BWFO 3KVGA 2V52B 4FOIA 3SLCA 3SMPA 5CE3A 1BO5O 1NGEA 2Q2RA 2GUPA 4H0XB 4BRAA 1Z6RA 2QXLA 5AQWA 1TYQA 4K41A 1WOQA 1BA0A 3M1FA 3VEYA 2P9LB 4WQ5C 5BRHA 3A5NC 3VEOA 3QICA 2I7PA 3LDLA 4GNIA 2VWBA 1IG8A 3IUCA 4FWOA 1DGKN 4H0PA 4PL7A 4IXCA 4CBXA 4BGAA 3O6WA 3ZETB 2Q0UA 3ULEB 5AZIB 1GLEG 2GTDA 1SZ2A 5AQGA 3DXMB 4FWRA 4CZHA 3FZLA 1YUWA 2Q36A 3D2FA 3DXMA 5AQNA 1T44A 3M3ZA 1HX1A 5AQTA 1KAXA 2PAVA 4B9QA 3S41A 4B1ZA 3ZX3A 4FWKA 3UKRB 1MWKA 2YHXA 4FO0A 2QWPA 4IO8A 4ISGA 3QFUA 2E2NA 3WQTA 2I7NA 4MO5A 1KAZA 1K8KB 1MWMA 2ZWHA 3GOIA 4AM6A 1EQYA 5JLFA 5KQ8A 5TKYA 4FWLA 1KAYA 5BREA 1LCUA 1HJOA 1K8KA 3BUZB 4DB3A 3W0LA 3U8XA 4NB4A 4RTFD 2HF3A 5AQZA 4K25A 2Q97A 3O08A 4CBUA 1QQMA 3AARA 5AQSA 2CGKA 1CZAN 1GLLO 4MO4A 4QS8A 4BREA 1S22A 3JXUA 4MLHA 3SJHA 3O8MA 2YJFA 2QW9A 4DCHA 4BG8A 4B1UB 4PKIA 3EL2A 2W41A 1E4GT 5BPMA 4FWNA 5AQHA 3KHYA 3QFPA 4CZLA 4DHYA 4CZKA 5F0XA 2A42A 3HZ6A 5LJVA 5LJWA 2ASMA 1BU6O 1BG3A 1C0FA 3O1WA 3U4LA 5AQIA 4AM7A 2IVNA 5F1XA 5EVZA 4CI6A 1SQKA 5AQVA 3AAPA 4BRDA 2D0PA 4BVOA 1NGBA 4FSVA 3GL1A 3D2EB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3HT3A 5AFUH 2Z1JA 1E4FT 1GLJO 3V1RA 4JI6K 1RBTA 1TKDA 4IJNA 4E89A 3BY5A 4FJIA 1DTTA 1EX4A 1VSMA 4BR9A 1ZBSA 2E6LA 3MEGA 5GINA 3B6OA 1GOAA 5JICA 2VWJA 1A5VA 4HTLA 3ZX2A 1JLCA 4FW1A 3C7NB 1ZYQA 3A5MC 3AY9A 3E9PA 1VSJA 1NK0A 3FGUA 3AVLA 2GUIA 1N33K 4ILJA 1WAFA 4CD1A 1NK9A 2KZMA 1KVCA 3LDPA 3PUFA 1NGCA 1HKCA 1Q18A 3QIOA 3L2RA 4CK2A 1NU0A 3M8QA 2IOCA 2RKIA 4JKFA 3MN5A 1YHQN 2HHSA 1XNQK 4DSIA 5BRDA 5D3GA 3LM9A 1T6DA 1RTJA 1NK4A 2YX6A 3TSQA 4H0YB 3QNNA 3B8AX 3OYNA 1BIUA 4CEBA 3ZETA 4RWTA 4DG1A 4KTQA 5AZIA 3E9OA 3RMBA 3GG4A 2Q31A 4DTJA 3MECA 4CZEA 3A2FA 1RBSA 1X9MA 1QSLA 4FK2A 3H1VX 2ITMA 1KCFA 2HHVA 1RT6A 4JLHA 4JI5K 2HOEA 4OKJA 1Q7YO 3UKRA 2CGLA 3OYFA 5M1KA 3BF3A 4H5RA 4B3MK 1GOBA 4DR2K 1BQMA 3VQ4A 4BQLA 4WYBA 3MX5A 3RVCA 5IT9O 3NF9A 2VGMA 1FJGK 2YKMA 1SL0A 4KAZA 1HPMA 1Z05A 2JWKA 4KH5A 2OPRA 1T7PA 3K57A 1N32K 3GE1A 4M3RA 3H46O 1R59O 4JS4A 1BDGA 1S1WA 2AJQA 2ASOA 3Q7BA 4N56A 2NRXA 4H03B 3TAMA 3TANA 3MN6A 2NRZA 1OH6A 4CEOA 3AGKA 3SNNA 2ZE2A 3CCQN 3ZSQA 3WXJA 1YTAA 3ZT1A 2D1KA 2IVPA 2W6LA 2QWOA 3KZBA 4DQPA 4A2AA 2HHIA 3ZSOA 3VERA 2OANA 4M63C 4HUEA 4HCBA 4IOAL 4WFBL 4M42A 1S5JA 1TK0A 1Y97A 5T7BA 3D2EA 3UE5A 1UOCA 4O5BA 1EETA 1S6PA 4B1WB 3AGRA 1HKBA 1VQ9N 4GMJB 3VESA 3V81A 2C1IA 3NGYA 4J2BA 4O8UA 1DKGD 1LOTB 3MDQA 3SAHA 4IOCL 1MDUB 3DAWA 2JGUA 2VG6A 3VA3A 1YJNN 3QINA 1XHZA 4Q0BA 2Y1JA 1GLDG 4K8XA 3IRXA 1LWEA 4CJPA 2VYPA 4A57A 1LV5A 3C7NA 4CJ5A 4UY8O 2QWMA 4BC3A 4OLAA 2OA8A 3FZFA 3SV4A 1NGJA 3MCPA 1N5YA 3BF1A 4KI4A 3J7ZO 1O1WA 2A1SA 3CQXA 1NGFA 1QS4A 2EHGA 3WQUA 1HNZK 1OVYA 2XRIA 4H5NA 4HUFA 4BRCA 3C94A 3V9XA 3MCAB 3VEXA 4DMNA 3H6EA 3KIOA 3VEVA 4JS5A 3OW2M 4DQIA 5LL6Z 2HVIA 5DM6L 2QXFA 4BGBA 3S3MA 2KQ2A 3AVIA 3NGIA 3CFRA 1K9MO 1RT1A 4GVEA 3O3HA 4C8LA 1RT7A 2W6KA 4N76A 4B1XB 2GWKA 3P38A 5F2RA 1VQ4N 1BA1A 1KLMA 3DMJA 5GAEP 2YNHA 3L0QA 3BZCA 3PIOL 1N34K 4CEAA 4FYDA 4CK1A 1Q81O 1VQMN 4EP5A 2Q0RA 4PL8A 3NH0A 3PLAA 3P4IA 3M8RA 2Q3SA 3C6HA 4DTXA 4E1JA 5C42A 4IKFA 1FW6A 5BN8A 1UA0A 1C1CA 1RDBA 1ASWA 3GDQA 1VSFA 5FPDA 4JRQA 4I2QA 2HBKA 3CERA 3O9TA 2G8HA 2VWKA 4JI7K 4BC5A 3AVJA 5AJ3K 1T05A 5AQLA 3O9QA 1HKGA 4FLWA 1KC8O 1KQSM 1WBBA 3VQQA 4DV7K 1W2BM 4DTMA 1TV6A 5AQPA 3OYCA 4LF6K 5IWAK 4LF9K 2X78A 4KO0A 3WEEB 1QZ6A 3NBPA 5K14A 3WNFA 5E26A 4H5WA 3HOTA 3A5OC 3NCIA 2QKBA 3PY8A 4F9OA 3CHWA 4JI3K 2QWLA 3L2WA 5FLXO 4CF0A 2ITGA 1RDWX 2V7ZA 5B8HA 1YF5L 2P9NB 4B9UA 5FPMA 5I9EB 2Q1NA 3O1BA 4YNQA 4FK0A 1NMNA 2YJEA 3K9KA 3LALA 1VSIA 4XJXA 1JXBA 5LMUK 4B9SA 3DM2A 2E2QA 1RILA 4I2PA 4FM1A 3ZLJA 3KK2A 3CJ1A 4M45A 3THYB 3N4QA 3O9RA 5JS2A 5C15A 4QAGA 1G15A 3AVCA 3MXMA 4BRFA 4JRPA 3HI0A 1YIJN 3ZSRA 3DXKB 3VPZA 3OYDA 4BE2A 4JKCA 2IS3A 1BOTO 3FZKA 5CR4A 2WONA 5SZTA 2OCEA 4JKBA 2WUSA 2A1RA 5AQJA 1OH8A 3ID8A 3OYHA 3LP1A 3CJ7A 4E1NA 1D4XA 1L3UA 1BWFO 4DSLA 2V52B 2KFNA 5CE3A 2Q2RA 2F4VK 4BRAA 1WLJA 4FJGA 3PIPL 4IFVA 1RNHA 1XWLA 3M1FA 4M41A 2ZJPL 1ZBFA 3L2QA 4K0KK 4ELTA 3VEOA 3QICA 3CCRN 3C6UA 4GNIA 2DFEA 4C8OA 4RW7A 1YTUA 4B9LA 4CBXA 4BGAA 3O6WA 3NMUA 3WNGA 3ULEB 4CCHA 1SZ2A 2NRVA 1MU2A 4NCGA 3FZLA 4CZHA 2Q36A 2W00A 1C0UA 3V9WA 3DXMA 4DSFA 1T44A 3M3ZA 2F8SA 1HX1A 3VQPA 3CD6N 1RBUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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