1ATNA

Atomic structure of the actin:dnase i complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN
publication title Atomic structure of the actin:DNase I complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Endodeoxyribonuclease
total genus 107
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-03-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1atnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1atnA04
4BC4A 4B1VA 3J8AA 5JLHA 2A42A 4CZJA 1XC3A 3FZMA 3VEXA 1NM1A 4LC9B 5AQWA 2A41A 4BC3A 1NGBA 4YDUC 5BPLA 2J4RA 3HI0A 3MN9A 2QWRA 1BG3A 1TUUA 3AAQA 4JD2B 2HMPA 2Q31A 4K43A 4JHDB 5F0XA 1LOTB 3CJ1A 3VETA 5ELZA 4XH4A 2W41A 1T44A 4MO4A 3VEYA 4JAXA 4WQ5C 2YHWA 4QS8A 2CH6A 1BDGA 3UKRA 1HX1A 3ZX3A 3O1BA 4FWNA 1V4SA 2D4WA 3HSCA 3VF6A 1KAZA 3I8BA 3DXKA 4CZFA 4ISFA 2FSNA 3H3OB 3GE1A 4BRAA 4XH5A 4KBOA 5AQQA 4H5RA 3DAWA 4H5VA 5AZJB 4J8FA 1T6DA 3D7EO 4AM6A 1MDUB 2ZF5O 2GEMA 1G99A 4JD2A 4FOEA 1P8ZA 1NLVA 2P9IA 4JN4A 4B1XB 3R9PA 4CD3A 2PBDA 5EXWA 2YI1A 1BA1A 3FZHA 5E26A 3EN9A 5BN9A 1GLJO 3ENHA 3U8XA 3ZETB 3U4LA 4CJ7A 2P9NA 2QWOA 5F1XA 5BPNA 2ASMA 3TU5A 2V7YA 3F9MA 5E84A 5AQZA 3EL2A 2AP1A 3ULEA 2W40A 3LDLA 2UYTA 2QW9A 4L3QA 5AQGA 3S41A 5AQXA 3WUHA 3EO3A 3U9ZA 5AQYA 3VGKA 5BRHA 2E88A 3JS6A 3GOIA 3A5LC 2Q36A 4QS7A 4H5WA 2E1YA 2A3ZA 1OKJA 3CIPA 3SLCA 3VPZA 1ZBSA 4BRFA 4BRLA 3A5MC 4EHUA 2YHXA 3HM8A 4CZGA 3LM9A 4FWSA 3WXJA 5B8HA 5BN8A 1J6ZA 5AQKA 4CD1A 3GG4A 1U6ZA 1EQYA 3FE1A 4BC5A 2GTDA 3IUCA 4K42A 4WQ4A 5AQLA 1MA9B 2H3GX 1ATNA 5AQTA 4XEIA 4PKHA 3UKUA 4BR0A 3LM2A 4BR7A 4H5NA 4IZ9A 1HKBA 2BUPA 4GNIA 3MN5A 1HKCA 1NMDA 2Q0UA 3MDQA 3VEOA 2Q0RA 1NGIA 1V4TA 4FWLA 2A6AA 3WT0A 3A8YA 3KZBA 3UKRB 5JICA 4M7XA 4MLEA 2YCHA 3CHWA 5AQVA 1NGFA 4BRPA 4B1YB 1T6CA 5F2RA 1LCUA 4BR4A 1X9JA 3WXIA 1MWMA 5LJVA 5LJWA 1YAGA 2F9TA 1GLDG 4PL7A 3DXKB 5FPEA 1ATSA 1GLEG 4B1WB 3HBTA 4CI6A 4JNEA 5AFUH 2ZGYA 2GELA 5EVZA 2YHYA 5AQPA 3QMLA 3IMXA 4FWKA 4BGBA 3QDKA 2P9IB 5AQOA 5BRDA 1U2VA 3GL1A 3L6QA 5AQMA 3B8AX 4FWMA 1S22A 3FR0A 3QB0A 3FLCO 4AM7A 1NBWA 3ATUA 2P9NB 2WUSA 3O4WA 4BRGA 4CZKA 5AZIA 3M3ZA 4CZLA 3EKSA 2ITMA 4A2BA 4BQZA 1Z6RA 3EKUA 5FPNA 3ULEB 3L0QA 5LY3A 2P9SA 4BRQA 2QM1A 3W0LA 3H6EA 5EOYA 1SZ2A 5KQ8A 4BRDA 3GDQA 4H0VB 3C0BA 1BU6O 3FZKA 2E2PA 3H45C 2P9KA 1Q18A 4IJNA 5AQHA 3OHRA 5FPDA 4FOIA 2P9PA 3JXUA 4CZHA 3MK6A 2FXUA 1RDWX 5CE3A 1BUPA 1ATRA 4XH1A 2DPNA 4FPAA 2CGKA 3KHYA 1QQNA 5BRFA 3LDQA 1XQSC 1YUWA 4H0YB 1XUPO 3HTVA 1NGDA 4BREA 5TKYA 3CQYA 2KHOA 3VEZA 2E8AA 2V7ZA 3AARA 4H03B 3CJ9A 1X3MA 4BVPA 2NRHA 3WEEA 1KAYA 3UKUB 3O1WA 4E1JA 2VCPA 3ENOA 3L4IA 2QWQA 3BF1A 3CJCA 1MWKA 3O08A 3FGUA 5ADXH 3D2EA 4NB4A 4YDUA 2ZGZA 3VOVA 3CETA 1NGEA 5JMVA 3O6WA 3H46O 4HTLA 5EY4A 4BRCA 2GUPA 3FZLA 1S3XA 3MMVA 4IO8A 1TUYA 2Q2RA 1H1VA 4K25A 1DKGD 3QBXA 4M7YA 3C7NA 3ID8A 3AAPA 4FO0A 4BR2A 3WXKA 4BRMA 4WQ5A 3DXMA 5JLFA 1ZC6A 3D2FA 5AQIA 4EHTA 1QHAA 3A0IX 3DJCA 2E2QA 4IWVA 3IDHA 4O8KA 4Y0WA 4DHYA 3BF3A 3BP8A 3CJ7A 1WOQA 3MCPA 1TYQA 5KPZA 1YVNA 4NO7A 1U2VB 2IVOA 1HLUA 4CBXA 4I6MA 2V52B 2I7PA 3LL3A 5FPMA 5AZIB 2D0OA 2E1ZA 1IG8A 4IJAA 1HJOA 1GLAG 3VEVA 5KPRA 1IJJA 3QICA 5AQFA 1HKGA 3SMPA 4MLHA 5AFUA 3M1FA 2P9SB 2A40A 3AY9A 4F9OA 4H5TA 2P9LA 3VENA 4ISEA 4O5FA 5BPMA 2P9KB 4WYBA 3WQTA 3WQUA 1SQKA 2FF3B 2V51B 4M63C 2GWJA 3DWLA 2P9PB 1NGCA 2IVNA 4FWPA 3TPQA 2VYPA 3LDNA 3SK3A 3G25A 1QZ5A 1NGGA 2CGJA 1ESVA 3QBWA 4GY2B 4EIAA 3ZEUA 5KQDA 5AQNA 3VF4A 4HWIA 2D0PA 3UB5A 5I9EB 2FLOA 3ZX2A 3HZ6A 3M6GA 2QWLA 3VF2A 1NGJA 1GLLO 2IIRA 5AQSA 2I7NA 2OANA 4DB3A 1HPMA 2ASPA 2HF3A 2NLXA 3WEEB 4EFHA 3CJBA 4BG9A 1DGKN 3RSEA 4B1UB 4BC2A 4BR5A 3VGMA 2P9UB 3I33A 3LDPA 1NGHA 2D1KA 1K8KA 2QWNA 2Q1NA 3BUZB 3CERA 3D2EB 3SJHA 4EAHD 3VERA 3IFRA 5BREA 3MN6A 2PAVA 4CBWA 1BOTO 4BROA 1RFQA 4WQ4C 1RGIA 1BO5O 2CH5A 4CZIA 3WXLA 1GLBG 5AQUA 3FFKB 3C7NB 4A2AA 1JCGA 3FZFA 4PKIA 3GBTA 1X3NA 2NZTA 4A61A 3DXMB 1E4FT 3R6MA 1D4XA 3D2FB 5ADXA 2ASOA 3CJAA 4K41A 4DCHA 1HUXA 2GWKA 3H1VX 4RCHA 2F9WA 4MO5A 4B9QA 1TYQB 4CBUA 2P9UA 4JHDA 3U9DA 3LDOA 3R8EA 3QFUA 4I6MB 1C0FA 2QWMA 4DQ8A 4BRNA 1NWKA 5BR9A 1SAZA 4RWTA 4FWQA 4BVOA 2YJEA 2ZWHA 4BRHA 4FL9A 4FWRA 2HOEA 3A5OC 3SMSA 1JCFA 4FPBA 2FSKA 1GLCG 3BEXA 1YXQA 3W3DA 4BQLA 2P9LB 3CQXA 2CGLA 2QWPA 4BG8A 4CZEA 4BGAA 4FWOA 5AZJA 3H3NO 2HF4A 1KAXA 3H1QA 4BR9A 1CZAN 5EX5A 2QXLA 3ZEUB 3QFPA 1QZ6A 3ZETA 1C0GA 2IVPA 5AQJA 3KVGA 1NGAA 4ISGA 3O5BA 4FSVA 2EWSA 4QS9A 4RTFD 3VEWA 5AQRA 5KPTA 1E4GT 3P4IA 1BA0A 1DEJA 2BTFA 3A5NC 3ATVA 4C23A 1QQMA 3O80A 1JCEA 1GLFO 4B1ZA 2E2NA 4H0TB 3UE5A 3VESA 2Q97A 1BWFO 2A5XA 5AR0A 4BRIA 3RSEB 3CI5A 3VGLA 4CZMA 3O8MA 3MN7A 1K8KB 1R59O 3EZWA 4BRKA 3ZX0A 1Y64A 2AA4A 4IXCA 2FSJA 1KXPA 4H0OA 2E20A 1WUAA 4Z94A 4H0PA 2YJFA 4A62A 1Z05A 4PL8A 1QQOA 1ZXOA 4H0XB 4PKGA 2VWBA 2FF6A 2E2OA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1S1XA 5JLHA 1KTQA 4LC9B 5AQWA 4CJ3A 1SV5A 4BC3A 4E7HA 1C0TA 1LWFA 2NNWA 3K2PA 3F5TA 4Q5VA 1BG3A 2C1GA 1TUUA 1RT5A 2HMPA 1JL1A 1RDDA 1WN7A 1B9FA 5F0XA 3VQQA 4XH4A 4CW7B 3OYMA 4IFEA 2CH6A 3HK2A 2WOMA 1WSJA 3BDPA 4BDYA 3NVMA 1JLFA 3HSCA 1OH8A 2O8DA 1KAZA 3HM9A 1U45A 3DXKA 1RNHA 4W5NA 4FJXA 4FJLA 4H5RA 4PQUA 5CR4A 3AVHA 3DRRA 4NYNA 5JS2A 4AM6A 1MDUB 1G99A 4FOEA 1NLVA 3ZT1A 1S1VA 4CD3A 1B92A 5EXWA 2YI1A 3EN9A 4CGFA 1NJZA 1JLBA 3U8XA 3ZSRA 1KCFA 2QWOA 5BPNA 5I42A 4X62K 4NLBA 1W97L 2AP1A 4NCBA 1RDBA 1I3AA 3EO3A 3U9ZA 4K8ZA 1RT3A 4LSNA 3VGKA 4OLBA 5BRHA 4JKBA 3JS6A 3GOIA 5SZTA 1DLOA 4CEBA 3D0PA 3DYAA 3O9RA 3NE6A 2Z1HA 2A3ZA 4LH4A 1Q9XA 3OYBA 4BRFA 4CEZA 3G71N 3TAEA 3THWA 3EY1A 1KLNA 4AHRA 3ZSVA 1VRUA 1UA1A 4CD1A 2NRWA 1KVAA 3LP1A 3GG4A 1U6ZA 3FE1A 4ZTFA 1T05A 2UXDK 1XNQK 3JAMO 4M3XA 2GTDA 3IUCA 4K42A 4CHPA 1MA9B 3N4PA 1NOZA 3NHGA 4E7LA 1BI4B 4BR7A 4H5NA 3EYZA 3I8DA 4GNIA 4YFUA 1NMDA 1WSGA 4YOXA 1V4TA 2A6AA 3WT0A 1Q81O 4CHYA 2Q3SA 2YCHA 2YX6A 1BGXT 4DTUA 1ASWA 1YTAA 2OPRA 3K5LA 5FPEA 1ZBHA 3HBTA 1T3VA 4Z4IA 4F8RA 1SL2A 5AFUH 2GELA 5EVZA 3SV3A 2HHQA 5AQPA 4BACA 4DTPA 3M8RA 4FWKA 5KRTA 4DLEA 5AQOA 4KO0A 5BRDA 3GL1A 1IV0A 1RDUA 4B8AB 1TAUA 1HR0K 2WUSA 4OGEA 4CIEA 4BWMA 4FJKA 3EKSA 4IBNA 1IBLK 4A2BA 1Z6RA 1RT4A 4FJNA 3ULEB 5LY3A 2R7YA 4OPKA 5EOYA 3AVCA 3C0BA 1BU6O 1CZBA 3LANA 2E2PA 3H45C 2P9KA 1Q18A 4IJNA 5AQHA 4OPAA 1N33K 2JWLA 4YOWA 2DPNA 4J2EA 4WF9L 1X9SA 1U47A 4M41A 3Q7BA 1M90O 1XQSC 4RW7A 4AHUA 1C1AA 4K0KK 2ZJPL 4C8LA 5HL7L 1VAZA 4DTSA 4FM1A 1UAXA 1FKOA 2DFFA 3CFOA 4M3WA 3NAEA 2E8AA 2V7ZA 4H03B 2JGUA 4YOYA 3CJ9A 4DFPA 4CHZA 3O1WA 4GV9A 2D0BA 5HP1A 4FJMA 4IFYA 2IC3A 3BF1A 1MWKA 3D2EA 3VQCA 3CM6A 5HRRA 2O8CB 2ZGZA 1IH7A 2AJQA 5J2QA 4CJWA 3E1YA 5JENA 1NGEA 4ELVA 3R3LA 2Y1IA 1I39A 3FZLA 3C95A 5FLXO 4CFDA 4N76A 3ID6A 3THXA 3ID8A 2W42A 3DXMA 5JLFA 4O5BA 4O44A 3D2FA 4GKKK 1QHAA 2HHVA 1IKYA 5GIOA 2KKZA 4O8KA 4E7KA 3DRPA 2VG6A 4DHYA 2GV9A 3MCPA 3CC4N 1LW2A 3SUNA 4AHTA 1YVNA 4CEEA 1U2VB 2IVOA 4JI1K 1K73O 3K0SA 2VGNA 4O8UA 3ZSYA 2I7PA 5C42A 3LL3A 3V1OA 2RE2A 3V9ZA 3HPOA 3LP2A 3VEVA 5AQFA 3SMPA 3CG7A 4ELUA 3L8BA 2QI2A 4JK7A 1IKWA 4DR2K 5JS1A 4LH5A 2HVIA 1L3VA 4O5FA 3V9SA 4WYBA 3WQTA 1SQKA 2FF3B 2V51B 4N41A 2GWJA 2P9PB 5FRNA 4QCLA 3SK3A 3O3FA 3ZSZA 3TTCA 3OJUA 3K57A 3SJJA 4EIAA 3THYB 4CEQA 3F9KA 4MQ3A 3UB5A 3HZ6A 4IG3A 2QWLA 1U04A 4YOTA 1QHTA 4JKGB 1SL0A 2I7NA 3OYNA 2QK9A 1C0MA 2ASPA 1NNEA 3OA9A 4CVNE 4DS4A 4LFBK 4BC2A 4HUGA 4BR5A 4LF7K 2P9UB 4AH9A 3D45A 4H8KA 4W5TA 4ELTA 2UUAK 4DWIA 3CERA 2O8BB 4GVMA 5CYMA 3IFRA 1KC8O 1VQ5N 1G15A 4BROA 4CF1A 1TKXA 4WQ4C 4DFKA 4OGCA 3HT3A 2BGGA 1BO5O 2CH5A 4U7BA 2IS3A 5DM6L 3CPWM 2VWJA 2I5JA 1W0HA 4A2AA 3FZFA 3I0RA 3GBTA 4IFVA 1NK4A 4A61A 1E4FT 4LF8K 1LW0A 2B5JA 1Q9YA 4OVLA 4IOXA 2Z1GA 2ZD1A 3L2QA 3DRSA 3RR8A 4C1NI 4ILJA 1VQ9N 3F2KA 4U67L 3HOSA 4DQRA 4MFBA 5IT9O 2FBVA 3VQDA 4I6MB 4DQ8A 5SWMA 1O1WA 4DG1A 1VSFA 1GOCA 4B9MA 3AO1A 1HYVA 4M3TA 4A5AA 4BRHA 1IKXA 3VQEA 3A5OC 1ZBLA 3E66A 4CJQA 3E01A 3SBTA 1BL3A 4GKJK 1YXQA 4KH5A 3W3DA 4CHNA 2P9LB 3CQXA 2CGLA 3J80O 3P1GA 3CCRN 2QWPA 4BDZA 1VSJA 1GOAA 1W9HA 3P31A 4F2SA 3HOTA 2EX3A 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3L2VA 4LY7A 1SS6A 3VPZA 1ZBSA 4RW6A 3ZLJA 3S9HA 2YHXA 4KI4A 1FW6A 1TVRA 4JI4K 4Z4GA 3B6PA 5B8HA 5BN8A 1ITGA 1J6ZA 4LF6K 3IG1A 4BC5A 1KLMA 4JI0K 3KIOA 2H3GX 4Z4FA 5AQTA 4XEIA 4BR0A 3AO5A 2O4GA 4JKEA 3CCVN 1VSMA 5H1SQ 2BUPA 4C8NA 1NU0A 1HKCA 2Q0UA 4FLWA 2HBJA 1J54A 4QAGA 2O8CA 2Q0RA 1NGIA 4Z4CA 3KZBA 3UKRB 1S9EA 1KVBA 4MLEA 5AQVA 4OKJA 2HBMA 1X9JA 3T1YK 5LJVA 5LJWA 4LF9K 1QS4A 1GLDG 3LALA 3PIPL 4DU4A 4CI6A 1NK9A 5LL6Z 4A57A 3MAQA 2YHYA 3QMLA 4JKHA 3KKRA 4BGBA 1U4BA 2P9IB 1RCHA 1U2VA 3L6QA 4NCGA 2FC0A 5AQMA 3B8AX 4DF4A 4PY5A 4FW1A 1RBTA 2KW4A 4AHVA 4AM7A 1RT2A 2P5GA 2VG7A 3HO1A 3QIPA 4KTZA 3ATUA 2P9NB 3O4WA 4B3OA 3HJFA 4FCYA 2OZSA 2VQEK 2PFUA 3EKUA 5FPNA 4DU1A 3L0QA 1YT3A 4BRDA 4H0VB 3A2FA 3PV8A 1R0AA 2D5RA 2P9PA 5HOOA 3MK6A 2FXUA 3VQPA 4J2BA 1RDWX 1S5JA 1ATRA 2HSTA 4XH1A 3P5JA 3HP6A 3NCIA 4F2RA 2CGKA 2FBTA 3VQ9A 4B9NA 3SAGA 3THYA 5BRFA 3AVLA 4AHSA 3LPTA 4CECA 4H0YB 3AVBA 1XUPO 2PY5A 1Q8IA 4CE9A 3G6EN 1A5WA 1BIUA 4R79A 4JKGA 3CQYA 4LD0A 2KHOA 2KQ2A 3VEZA 5HRSA 1NKCA 2OZMA 4FJ5A 3AARA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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