1ATNA

Atomic structure of the actin:dnase i complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Atomic structure of the actin:DNase I complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Endodeoxyribonuclease
molecule keywords ACTIN
total genus 107
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-03-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1atnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1atnA04
2W40A 4MO4A 4PKHA 4WQ5A 1JCEA 1OKJA 3H3OB 1HPMA 1MWMA 1BWFO 2KHOA 1GLDG 2A6AA 2Q2RA 2YJFA 4BC5A 2AA4A 3A5NC 2CH5A 5AZIA 5E26A 2ZGZA 3VGLA 3LDOA 1GLBG 4CZHA 3LM9A 1SZ2A 2P9KB 4RWTA 1WOQA 4H0TB 3CIPA 3CETA 2E88A 4IXCA 5ELZA 2YHYA 2GTDA 5AQSA 5AQQA 5F1XA 2BTFA 3GE1A 3ID8A 3JS6A 4IO8A 1HUXA 3HM8A 4BRGA 1JCFA 4WQ5C 5JMVA 4CD1A 3VESA 3GBTA 5AQMA 2ZF5O 1K8KB 1HX1A 4BRNA 4JD2B 5AQZA 1KXPA 4EIAA 5ADXH 3LDLA 1MWKA 4MLHA 4BRPA 2V7ZA 2QM1A 3HI0A 3VEOA 4H5RA 2HMPA 1NWKA 5KPRA 4BVPA 1U6ZA 1HKGA 4HTLA 3WEEB 4BRKA 2Q97A 2CGLA 3KVGA 2W41A 4BGBA 3DAWA 3D7EO 1BDGA 4XH1A 4JNEA 5AQJA 1S3XA 1NGFA 5AQVA 4EFHA 3H46O 4FWSA 4BG9A 1ESVA 2FSNA 1QQOA 4B1VA 2GWJA 4BR9A 3P4IA 3WQUA 4BR5A 3EL2A 2ASOA 2ASMA 3WEEA 4CZGA 1SAZA 4BVOA 4I6MB 5AQOA 1G99A 1NGDA 1ZXOA 4IZ9A 3B8AX 2H3GX 2P9LB 4F9OA 2J4RA 2D0PA 1ZBSA 1RFQA 2YCHA 4AM6A 2P9NA 5BPNA 3FZKA 1RGIA 4AM7A 3UE5A 2IVNA 3TPQA 1DEJA 3WT0A 5FPMA 1NM1A 1YXQA 3CERA 3LM2A 3UKRB 3FZLA 2UYTA 1TUUA 3DWLA 4B1XB 2FF6A 1CZAN 3VOVA 1YVNA 2QWOA 2P9KA 4K41A 3EO3A 3AARA 2YHWA 4JN4A 3L6QA 3D2FA 3EKUA 3O8MA 3QMLA 5F2RA 4I6MA 3CJBA 3MMVA 2E8AA 3BP8A 3O80A 3O1WA 1H1VA 4B1WB 3FE1A 1QZ6A 1NBWA 5AQNA 4BC3A 2PBDA 3O6WA 4B1YB 2VWBA 2FXUA 5LJWA 3HZ6A 2YHXA 4H5VA 3S41A 3VEXA 3QBXA 4BR2A 2GWKA 1NGAA 3ATUA 2P9IB 1KAYA 4J8FA 3LDPA 2P9PB 4FWKA 3GL1A 3I33A 4H5TA 4BG8A 4GY2B 5KPTA 3OHRA 4O5FA 1EQYA 4DCHA 1GLFO 3I8BA 3VGMA 4H03B 2QWLA 1HKBA 4FPAA 3AAPA 4Z94A 2ITMA 1MDUB 3HTVA 4PKGA 2F9WA 4CI6A 1SQKA 3BUZB 1XQSC 4H0OA 1D4XA 5FPNA 3WXLA 2YI1A 3HSCA 5BREA 5AZJA 5BN8A 3BF3A 1C0FA 3C0BA 3LDNA 5EX5A 4PL7A 5LY3A 4IJNA 4PKIA 3FZHA 1TYQA 3BEXA 2P9PA 3R9PA 2VCPA 1DGKN 3ZETB 2D4WA 2P9LA 3C7NA 1HLUA 4XH4A 4BR4A 1V4TA 3WUHA 4FL9A 3L0QA 1U2VB 3KZBA 2ZGYA 4O8KA 4DQ8A 5AQGA 4PL8A 1E4FT 4QS7A 5AQHA 2VYPA 3A5LC 1BU6O 4BRLA 2D0OA 5CE3A 4LC9B 5AZIB 3A8YA 3U8XA 1BA1A 3O5BA 2E2NA 3IMXA 2E2QA 4H0YB 3VGKA 1TUYA 2E2PA 1ATRA 3EZWA 3W3DA 3H45C 5FPDA 1TYQB 5EXWA 2Q1NA 3DXKB 5AQFA 3BF1A 3MN9A 4H0PA 1NGGA 4K43A 1BA0A 3H6EA 3CJ9A 5FPEA 1RDWX 3L4IA 2DPNA 1T44A 1NGIA 3VEYA 3M6GA 4B1ZA 1ATNA 1IJJA 1QQMA 3VF6A 5AQKA 1KAZA 1R59O 4ISEA 2BUPA 1X3NA 3U4LA 3WQTA 3GDQA 4JAXA 4RTFD 3FZFA 4XEIA 3FGUA 4CZFA 4DHYA 4YDUA 1GLAG 5BN9A 3W0LA 4A61A 1LOTB 3H1VX 4BGAA 3UB5A 2NZTA 4BRHA 3ZX3A 3CQXA 2V52B 2CH6A 4H5WA 3D2EB 4MO5A 3QB0A 3MN7A 4CBUA 5ADXA 4KBOA 1U2VA 2IVPA 3CHWA 4DB3A 3O4WA 3QDKA 3QFPA 5AQWA 2FLOA 3SJHA 2Q36A 4NO7A 4B1UB 4CJ7A 1Q18A 3MK6A 2QWRA 3CJAA 4FWNA 4C23A 1NGEA 3RSEB 2HF3A 3CJ1A 4BRQA 3G25A 3VERA 4BRMA 3DXMB 2F9TA 4IWVA 3ZETA 1XC3A 2NRHA 5AQTA 4YDUC 2NLXA 2I7NA 1V4SA 5KQDA 3CJCA 2I7PA 3FR0A 3VF4A 2AP1A 2GELA 1J6ZA 1GLJO 3R8EA 4M63C 4EHUA 3RSEA 3VENA 5JLHA 4WQ4A 3D2FB 3WXIA 4FPBA 1HJOA 3DJCA 3U9ZA 3ZX0A 4A2BA 4H0VB 5EY4A 3SK3A 3ENOA 1X9JA 4FWPA 3VPZA 1NGHA 5B8HA 3H1QA 1XUPO 2IVOA 1S22A 4E1JA 1DKGD 3HBTA 4CZLA 5TKYA 4BRIA 4BRCA 5BRDA 3SMPA 4WYBA 1ATSA 3IFRA 4BC2A 3H3NO 5JLFA 4EHTA 3DXMA 4K42A 2P9UA 1WUAA 5F0XA 2HF4A 4CZIA 3QICA 4FO0A 4M7YA 1GLLO 3ULEB 3D2EA 5KPZA 3VEZA 2A3ZA 1BOTO 1ZC6A 3A5OC 3VEVA 1YAGA 1P8ZA 5BRFA 1T6DA 1Z6RA 2ASPA 4BRDA 4H0XB 3M3ZA 4CZKA 2E1ZA 3FZMA 3WXKA 2ZWHA 1BG3A 1K8KA 5AZJB 2A42A 5E84A 2FF3B 5I9EB 2FSJA 2Q0RA 3VF2A 1NMDA 2GEMA 2D1KA 4RCHA 2WUSA 1T6CA 4XH5A 3U9DA 3ZX2A 4ISFA 4JHDA 3J8AA 1NLVA 3ULEA 3ENHA 4CZEA 3C7NB 2A41A 1QHAA 1IG8A 4GNIA 4BQLA 3GOIA 3LL3A 5AQLA 2A5XA 5AR0A 4BROA 1Y64A 4FSVA 3VETA 2YJEA 1YUWA 4BR7A 3EN9A 5BPLA 3QFUA 3ZEUA 2PAVA 4QS9A 5BRHA 3O08A 4MLEA 3DXKA 3MCPA 4BR0A 1QZ5A 4CZMA 2E20A 4Y0WA 1GLCG 3EKSA 3F9MA 3A5MC 3GG4A 1HKCA 3MN6A 5AQPA 5KQ8A 3WXJA 4FOIA 4BRFA 5JICA 2E1YA 2FSKA 2P9NB 4FWLA 2CGJA 2P9SB 3JXUA 2GUPA 4FWOA 5AFUA 3ATVA 3CI5A 4BC4A 3UKRA 3M1FA 4FOEA 1C0GA 1E4GT 3ZEUB 4A62A 4M7XA 2OANA 5LJVA 2P9UB 4HWIA 4B9QA 3FFKB 5AQYA 2QXLA 3IUCA 3TU5A 3UKUA 2CGKA 5EOYA 4FWMA 1BUPA 4FWQA 4QS8A 2HOEA 5BR9A 3MN5A 4K25A 3FLCO 4BQZA 4FWRA 5BPMA 1NGBA 5AFUH 4BRAA 4CBWA 4BREA 3MDQA 2P9IA 5EVZA 4CD3A 2V7YA 4CBXA 4WQ4C 3IDHA 5AQRA 1NGJA 4JHDB 3UKUB 1KAXA 3O1BA 2A40A 4ISGA 1GLEG 3R6MA 4NB4A 3QBWA 1NGCA 2QWNA 2QW9A 2QWMA 3LDQA 2P9SA 3CQYA 4EAHD 2IIRA 4A2AA 5AQXA 4JD2A 4CZJA 5AQUA 3A0IX 3VEWA 2QWQA 1JCGA 1LCUA 1QQNA 3SLCA 2Q0UA 3CJ7A 4H5NA 2QWPA 2V51B 1X3MA 2EWSA 2E2OA 1Z05A 3SMSA 1BO5O 2Q31A 4L3QA 4IJAA 1MA9B 5AQIA 3AAQA 3KHYA 3AY9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3THXA 2W40A 4PKHA 4WQ5A 1WAFA 1MWMA 1I39A 3TSUA 3P38A 3N4QA 1VQPN 1WB9A 1GOCA 5C2DA 4DLGA 4AHVA 1D5AA 3J81O 4O44A 1SZ2A 1VSHA 4CJPA 4LF6K 3E1YA 3CETA 1RDBA 2E88A 3JSMA 4JRQA 3IG1A 2BDPA 1CXUA 5F1XA 4HUGA 1TL1A 4IO8A 5C2FA 1HUXA 3V9XA 2VG5A 3SUQA 4CF1A 1VK0A 2WTUA 4FJ5A 3SAFA 5A2QO 4CE9A 1WBDA 2ZF5O 4BRNA 2D0CA 4FW1A 5AQZA 4EIAA 5ADXH 5FRMA 2ZJPL 1BGXT 4H5RA 1OVQA 4E89A 4HTLA 3E66A 3OBWA 1W97L 2W41A 3KVGA 4BGBA 3QNNA 4TSXA 3IRXA 3CXCM 4CEQA 4BE7B 5TKWA 4OLAA 4CEEA 3LAMA 3NF8A 5AQVA 4FWSA 3J7YP 3KLEA 3OBYA 4CJEA 4BR9A 4JRPA 3WQUA 1FKPA 3EL2A 1SAZA 2FBXA 5AQOA 1NGDA 5DMRA 4B9NA 1NOZA 1I3AA 4BECA 3BY5A 4DV3K 1A5WA 2C1IA 4DTMA 1RFQA 3ZT0A 4BY9C 4DUZK 3DLHA 3VQ4A 5LL6Z 3L2QA 5FPMA 1YXQA 1IKWA 2UU9K 3QIOA 3K5LA 3U3GA 4B1XB 1L5UA 1VQ5N 1YVNA 2QWOA 2P9KA 1ZBUA 1YJWN 1WLJA 1JLAA 3L6QA 2G8HA 2O4IA 4CIGA 3OS0A 4N5SA 3O80A 1U4BA 1FW6A 3O1WA 1H1VA 1HJRA 2PBDA 3C94A 4I9LA 1TK8A 1VQ9N 1XI1A 3TAPA 1BCMA 1UAXA 3HO1A 5C0YA 4N47A 2P1JA 2FBYA 3PX6A 1EP4A 3KTQA 1RBUA 3THWA 2P51A 1EQYA 4O5FA 1GLFO 4NCGA 4H03B 4JEPA 1HKBA 4FPAA 4ILHA 3P83D 1HRHA 1MDUB 3HTVA 4KAZA 4XJXA 3BUZB 4H0OA 3WXLA 3NH2A 3RTVA 4JI0K 5C42A 3L2VA 4IJNA 4PKIA 4JI4K 4CK3A 3FZHA 1TYQA 1J5OA 4C8LA 2X6SA 3AA5X 2P9LA 3C7NA 3VN5A 4BR4A 1S72N 2KLAA 3SPZA 1XMQK 3L0QA 1U2VB 4OO1J 1KQSM 4KTQA 2D0OA 1FJGK 4FZZA 5AZIB 4JK7A 3O5BA 2E2NA 4ID1A 3VGKA 1TUYA 5DM7L 4KI4A 3W3DA 1TYQB 5EXWA 2Q1NA 3RVCA 1A5XA 3M8RA 2NNWA 2UUBK 4H0PA 1NGGA 1BIZA 5HRSA 1IH7A 4CHOA 3TANA 2OYQA 3VEYA 4LF8K 3J7ZO 4B1ZA 1IJJA 2Y1IA 5AQKA 1DLOA 3SPYA 3U4LA 1RDAA 3GDQA 2PYJA 5H1SQ 3W0LA 3H1VX 3TSQA 3CQXA 2V52B 1LW0A 2CH6A 4H5WA 4K8XA 3RRGA 4FJNA 4I2QA 4O0IA 1NJZA 4G9ZA 4KHYA 4CJ7A 1X9WA 2Z1HA 4JI1K 2QWRA 4B3TK 1XHXA 4ICLA 1VSDA 3EY1A 4C23A 1NGEA 4ZTJA 4OX9K 4BRQA 1T05A 3G25A 3VERA 4BRMA 4FLYA 3DXMB 4DTSA 3OJSA 2F9TA 3NGYA 1XWLA 1HR0K 1Q9YA 2NRHA 3SBGA 5JVGL 3M8PA 5LMUK 5HRRA 1V4SA 2IGIA 3OYBA 2I7PA 2O8FB 3VQEA 1HPZA 1J6ZA 1OH6A 1GLJO 1N32K 3LPTA 4DTJA 3RSEA 2VG6A 4CHPA 5FDLA 4DF4A 1SS6A 4GW6A 3LZJA 3WXIA 4DFMA 1Q9XA 3U9ZA 3ZX0A 5SZTA 3CYGA 1QHTA 4H0VB 4NCAA 3RWUA 1K6YA 3M8QA 3SK3A 3PX4A 1EWRA 3ZSXA 4AHCA 4ELVA 2XY5A 1RDDA 5CZ2A 4RW7A 3TWHA 3IAYA 1XUPO 1S22A 3AV9A 1XMOK 5J2MA 4E1JA 4EZ9A 5IT9O 4CZLA 4C1NI 4BRIA 5M1OA 2JWLA 1RCHA 4BE1A 1BI4A 1VQ7N 4FJXA 3WXMB 1JL1A 1VQ8N 3O9RA 1WUAA 1WBBA 5F0XA 3QICA 1NKBA 1BOTO 1YAGA 1P8ZA 4L8RB 4WFAL 1IBLK 1N33K 4QOZB 3HOSA 2QA4N 3V1QA 3A2FA 3FZMA 3L3VA 1K73O 3AVGA 4Z4CA 4LF7K 3QERA 4FJGA 1C1CA 3N4PA 4YY3K 3CYMA 2WUSA 4MQ3A 2ZJQL 1ZBHA 4XH5A 1E3MA 4E1MA 1KTQA 1WSJA 1NLVA 3ULEA 4CJ5A 3MXIA 4CZEA 2A41A 4GNIA 1VQNN 5AQLA 4O5BA 4KKOA 3F9KA 3V81A 4IFYA 4N56A 4AILC 5BPLA 3QFUA 3K5NA 2JLEA 4FLTA 4CZMA 4Y0WA 2NUBA 1GLCG 2XRIA 4IOAL 3A5MC 3MN6A 4LFBK 3AVAA 4FJ9A 2GBZA 1LW2A 4BRFA 5JICA 2E1YA 3R1XA 1J9AA 4FLZA 3JXUA 2GUPA 5HROA 1U04A 4F8RA 3P5JA 5GAHP 4GVMA 3OW2M 3SI6A 1VQ6N 3ZSQA 3PY8A 4DUYK 3OS1A 3DRRA 4M7XA 2OANA 1VRTA 3UKUA 2CGKA 3SAGA 4FWMA 4CK2A 4AHTA 2XHBA 3K59A 1SKWA 1ZBIA 5IWAK 5C12A 2VQFK 4FYDA 2HOEA 5BR9A 2P5OA 1IV0A 1KSPA 2KFZA 1IBMK 1VHXA 3HPGA 3ZT2A 1CZBA 1NGBA 4AF1A 4Z4EA 5AFUH 4CBWA 2RPIA 2HHUA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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