1ATNA

Atomic structure of the actin:dnase i complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN
publication title Atomic structure of the actin:DNase I complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Endodeoxyribonuclease
total genus 107
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-03-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1atnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1atnA04
4K41A 3CQYA 3LL3A 2ZF5O 1DEJA 1KAXA 1X9JA 3BF1A 1WOQA 4LC9B 1XUPO 4QS7A 3VGLA 4PKIA 3GDQA 4XH1A 2V52B 1IJJA 4B1XB 4BGAA 3SK3A 2Q31A 4CD3A 1QQMA 4K25A 1BA0A 2YHWA 3QB0A 2DPNA 4MO4A 4FWPA 1MWKA 4L3QA 3HZ6A 4FWLA 3SMSA 4BR5A 3EKSA 4H0PA 1NGJA 3I8BA 2A40A 4IWVA 1H1VA 4B1VA 4BQZA 2P9UA 1TUUA 3O1BA 2F9WA 2I7NA 3U9DA 2I7PA 3ZEUB 4H0TB 3VENA 4RTFD 4BC5A 2Q97A 3CHWA 5AQQA 3GOIA 3QICA 1NM1A 1KAZA 5JLFA 3BP8A 4PKHA 3VF4A 1GLFO 3DXMA 1MA9B 2D0OA 1Z6RA 1V4SA 3DXMB 4BRKA 4AM7A 3CETA 3ZX2A 3WQUA 2HF4A 4M7XA 1U2VA 4BREA 4FOEA 4PL8A 3RSEB 3ZETA 4B1WB 3EO3A 3QBXA 2Q1NA 3O8MA 1RFQA 4BR7A 2QW9A 4BRDA 2EWSA 1BU6O 1HKBA 5FPNA 1BUPA 4FWRA 1T6DA 1QHAA 2E2OA 4Z94A 1K8KB 2A3ZA 2A6AA 4BRQA 1KXPA 3WEEB 3VEXA 2V7YA 4CZGA 4IJAA 3CJ7A 3H3OB 1HKGA 3JXUA 5BN9A 2P9SB 2V7ZA 1S22A 3DXKA 3CQXA 5AQGA 5AFUH 3WXKA 1NGIA 3MK6A 5AFUA 3DJCA 2FF6A 5BRFA 4H5RA 4NB4A 4CBXA 5AQLA 3O08A 3LDOA 3CIPA 2QWRA 3G25A 2UYTA 3LM9A 2IVOA 4JD2A 4CI6A 4FWQA 2E2PA 4B1YB 5JLHA 2YJFA 2P9IB 3H1VX 3ULEA 4MLHA 3ULEB 1BWFO 3MDQA 2A41A 5AZJB 4BQLA 3H45C 4BRFA 4DCHA 1CZAN 5AQZA 3HTVA 3BUZB 1JCEA 3BF3A 5BR9A 4B1UB 4CZFA 2VYPA 1ZXOA 4I6MB 3M3ZA 4DB3A 5AQHA 3HBTA 4BRCA 5EXWA 4MLEA 5AQVA 3VF6A 3UKUB 2HMPA 4YDUA 5AQOA 1ZC6A 3P4IA 1YUWA 2WUSA 4H5NA 3HI0A 5AZIB 3L4IA 4WQ4A 1NGHA 3EL2A 5F0XA 3ZX0A 4YDUC 2YJEA 2E20A 1GLAG 2CGLA 3TPQA 4WQ4C 2P9NA 4H5VA 1HUXA 4BRMA 3AAQA 4QS9A 1TYQB 1GLJO 1IG8A 1GLDG 2NRHA 4NO7A 4E1JA 1OKJA 3IFRA 5KQDA 3U9ZA 5FPEA 4QS8A 1HLUA 2KHOA 2P9LB 4IJNA 3EN9A 4ISEA 5AQJA 1MDUB 5AQYA 3R8EA 5EX5A 4ISGA 4EHTA 5LJVA 4A61A 4BRAA 3FZLA 3A0IX 5AQTA 5I9EB 3FZFA 5E26A 2E2QA 2GELA 3MN5A 2Q36A 3VEOA 3J8AA 4B1ZA 3ZEUA 4RWTA 5AQRA 3DAWA 3UKRB 3FZHA 3VEVA 4FPAA 3L0QA 2YI1A 5KPZA 4H0XB 1NGEA 2P9PB 3ATVA 3EZWA 3H3NO 4MO5A 5AQXA 3AY9A 2H3GX 4CZEA 5KPTA 4H5TA 1GLLO 1QZ6A 5AQKA 2OANA 2YHXA 3SJHA 3W3DA 1X3NA 5F2RA 2D0PA 3CJ1A 4Y0WA 4CZMA 2GWJA 1TUYA 5ELZA 5BRHA 5F1XA 3RSEA 4BR0A 2Q2RA 3QMLA 4EIAA 5LJWA 3JS6A 3WQTA 4A2AA 5FPMA 4BRPA 1Y64A 3O1WA 3LDLA 3B8AX 3VETA 2CGKA 1K8KA 3ATUA 1SZ2A 3GG4A 3A5LC 3WEEA 3VGKA 2D1KA 4FO0A 2CH6A 2HF3A 3O4WA 3FE1A 2P9SA 2V51B 4C23A 1RDWX 2E2NA 3LDQA 3QFPA 4JN4A 1V4TA 3CERA 3EKUA 4BC3A 1SQKA 4BR4A 5KQ8A 1SAZA 1XC3A 4BROA 2QWQA 3FGUA 5ADXH 4PL7A 5ADXA 4RCHA 3FFKB 1MWMA 4B9QA 1NGBA 3MN9A 3CJBA 3L6QA 4XH5A 4BC2A 3KZBA 1JCGA 3AAPA 3D2EB 3HSCA 5EOYA 4IO8A 1NLVA 3R6MA 4EAHD 2P9IA 2Q0RA 4DHYA 5AQFA 2QWOA 2AP1A 1BDGA 5BPLA 3SLCA 2E1ZA 2FLOA 4BGBA 1J6ZA 4CZHA 5AZJA 3U8XA 5CE3A 4FWSA 4GNIA 4CBWA 3WXJA 1LOTB 3VPZA 3A5OC 4BC4A 3GE1A 5AQPA 3MN7A 2IVPA 4CZLA 2QWMA 4J8FA 4BR2A 5JMVA 4BRHA 1HJOA 3AARA 1XQSC 4I6MA 3WT0A 1BO5O 3FLCO 4H5WA 4BRNA 2FXUA 2A5XA 2CH5A 3FR0A 3UKUA 3A5MC 5AQIA 2VWBA 3LDPA 5AZIA 1EQYA 2ASOA 3KVGA 3D2FB 1R59O 4FL9A 3A5NC 4BRLA 3OHRA 3O6WA 3QBWA 1C0FA 4CZIA 1NGAA 1ZBSA 1DGKN 4CZKA 4JAXA 1TYQA 4M7YA 3VEZA 4WQ5A 5JICA 1LCUA 5FPDA 3W0LA 4A2BA 2FSKA 3IDHA 4ISFA 4WQ5C 5E84A 2P9LA 2BUPA 4XH4A 1NMDA 4FOIA 1C0GA 1YAGA 3LM2A 2HOEA 4BVOA 3VEYA 5B8HA 2ASPA 4F9OA 1BA1A 4XEIA 2ASMA 4KBOA 1WUAA 3M1FA 2NZTA 2NLXA 5AQNA 4FPBA 3UKRA 4FWKA 3R9PA 2FSJA 4O5FA 1ATNA 3H46O 4HTLA 2AA4A 2E8AA 1NGDA 2P9PA 1BG3A 3U4LA 3VERA 3WXIA 5EY4A 3UB5A 1Q18A 2IVNA 2PBDA 2ZGYA 2ZGZA 4M63C 3HM8A 1P8ZA 2A42A 3A8YA 1QQOA 1RGIA 2GEMA 2J4RA 3S41A 5BN8A 4H03B 1E4FT 2BTFA 2YHYA 3IUCA 2P9KA 1HX1A 2P9KB 1GLEG 4IZ9A 3VOVA 2QXLA 2PAVA 3ID8A 4IXCA 2P9UB 1GLCG 4O8KA 2VCPA 2D4WA 1X3MA 4BR9A 3CI5A 3ZX3A 2W40A 2E1YA 3WXLA 4CJ7A 4BRIA 4BG9A 4GY2B 4FWMA 1ATRA 1NBWA 3VESA 2FF3B 1D4XA 5AR0A 1T44A 4HWIA 3SMPA 3VF2A 4PKGA 4K42A 1U2VB 4JNEA 4H0OA 4CZJA 3ZETB 2QWPA 4WYBA 3MN6A 1HPMA 3C7NA 5BPMA 3C7NB 2IIRA 2W41A 2ZWHA 3CJAA 1YVNA 3DWLA 3GBTA 1HKCA 4H0VB 5AQMA 1NWKA 5KPRA 4FWOA 3D7EO 2ITMA 1S3XA 3D2EA 3VGMA 3H6EA 3O80A 3DXKB 2CGJA 3C0BA 1E4GT 5LY3A 4JHDA 4JHDB 3ENOA 4K43A 3I33A 1NGCA 2YCHA 4BRGA 5BPNA 3BEXA 3ENHA 4EFHA 2QM1A 1GLBG 1QQNA 2F9TA 3FZKA 1DKGD 4JD2B 2E88A 1BOTO 3CJCA 1G99A 3MCPA 4AM6A 4BG8A 3D2FA 3F9MA 1QZ5A 4FSVA 2GWKA 3LDNA 1T6CA 1U6ZA 3WUHA 5EVZA 4EHUA 3FZMA 3IMXA 1YXQA 1Z05A 1JCFA 5BRDA 5AQSA 2QWLA 2GUPA 1ESVA 5BREA 4A62A 3QFUA 3GL1A 1NGGA 2GTDA 4FWNA 4DQ8A 2Q0UA 3KHYA 3O5BA 1ATSA 2QWNA 3UE5A 5AQWA 1NGFA 4H0YB 4BVPA 4CBUA 5TKYA 3VEWA 2P9NB 3CJ9A 5AQUA 3TU5A 2FSNA 3QDKA 3M6GA 3MMVA 4CD1A 3H1QA 1KAYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1SL0A 4IOAL 1B92A 3BF1A 1WOQA 4A5BA 3WNFA 4PKIA 3SYZA 4XH1A 1FKPA 2V52B 4RW6A 3CC4N 4FXDA 2YV0X 3DLHA 4CESA 3OA9A 1QQMA 1WLJA 3AVLA 3DI6A 1BQMA 4FWPA 1NK9A 1TK8A 4FWLA 3KD1E 4BR5A 4DSKA 3EKSA 4H0PA 1B9FA 4IWVA 2A40A 1H1VA 1VQON 4BQZA 1TUUA 3DLLL 1FW6A 4B8AB 4W5RA 1ASVA 1RTHA 1NM1A 4IFYA 4JV5K 2HMIA 5JLFA 2IDOA 4KTZA 4I7FA 1J5OA 1ZBUA 1OH5A 5HOOA 1GLFO 4XIUA 1VRTA 3DXMB 5CYMA 4M7XA 4FZZA 1A5XA 5CZ2A 4FOEA 3CFRA 1JLAA 2VG5A 4AHVA 4B1WB 4A5AA 3D0PA 3VA0A 1S9EA 3MXJA 1BUPA 3G0ZA 4FWRA 1Q8IA 1T6DA 1QHAA 3SV4A 3THYA 4Z94A 4I9LA 3J7ZO 1N33K 2UU9K 1KXPA 1X9MA 1ZBFA 4CZGA 4IJAA 2Z1GA 3H3OB 1HKGA 2V7ZA 4WCEL 1WNSA 3VQ6A 3O9SA 4ZTJA 4KRFA 3MK6A 4H5RA 5J2MA 1IKXA 4W5QA 1M90O 1MU2A 3LDOA 4YY3K 3CYGA 2O8CB 4MDBA 4N41A 4IOCL 1SUQA 4KFBA 5LMUK 3O9UA 1N6QA 2RE2A 1DLOA 2QKKA 2YJFA 5LMNK 5HRPA 4CHOA 3KLGA 3ULEB 1F21A 4CIEA 4O8UA 3KD5E 4DR2K 3T69A 4GVEA 1JKHA 5AQZA 1RBRA 4JI0K 3Q7BA 3V9UA 4DB3A 4BE2A 4BRCA 4CK2A 1NOYA 2HBMA 3VF6A 2DTUA 4YDUA 1VRUA 3P4IA 4DR4K 3CCQN 5H1SQ 1NGHA 3O4NA 3ZX0A 1D9FA 1HNVA 4YDUC 2QA4N 4R5PA 3TPQA 4BRMA 2E6MA 2QK9A 1WSEA 1KFDA 5KQDA 4FM0A 3NE6A 1UAXA 4PQUA 5KI6A 1U45A 3EN9A 3EEQA 4ISEA 5AQJA 5T7BA 3R8EA 4ISGA 5LJVA 3ZLJA 1NJIO 4B3SK 5AQTA 5I9EB 4AHRA 3RRGA 5E26A 2ETJA 3I56N 3QETA 2UUAK 3VQEA 3QINA 3DAWA 3UKRB 5HRNA 4N56A 1XI1A 3FZHA 3VQBA 1GOAA 1LW0A 3L0QA 3ZSVA 4H0XB 3OYNA 1NMNA 3AY9A 4CEAA 3DLBA 1GLLO 1QZ6A 3RMBA 4DR1K 2O8EB 1R0AA 2YHXA 1JLQA 3SJHA 4JS5A 4DF4A 5F2RA 4Y0WA 4CZMA 5ELZA 2GBZA 3G71N 4LF5K 2FBVA 2Q2RA 4EIAA 5LJWA 3JS6A 4DKWA 1EWRA 4UQGA 4MQ3A 3ZT3A 4DQQA 4JKEA 2CGKA 4ZHRA 2EHGA 4KREA 3DLEA 4KH6A 2X6NA 4Z4IA 2RPIA 2G8IA 3KKRA 1O1WA 3LDQA 3QFPA 1XMOK 4JN4A 3EKUA 3PSIA 2IAJA 3KLHA 4FLYA 3P83D 3RMDA 3VQ8A 4GVMA 4X66K 3V81A 4ELTA 2QI2A 5ADXA 3FFKB 4B9QA 5IWAK 4DQSA 3L6QA 3WXMB 1FXXA 4B9UA 2P5OA 3VQCA 3RR7A 4JYAK 3AAPA 1LAVA 1NLVA 1JLGA 2Q0RA 3ALYA 3IKMA 3LANA 3ZT1A 4JK9A 3ZT2A 4DHYA 4DV3K 3THWA 1RDCA 4FJ8A 3V9XA 2E1ZA 2FLOA 1J6ZA 5AZJA 5CE3A 4HCCA 4CBWA 5SZTA 1LOTB 4E89A 5M1PA 1VK0A 2B5JA 4CFDA 1W7AA 4B3OA 4Z4GA 4NCGA 2HHUA 3U3YA 4J2BA 4FK0A 3ZSRA 4FLTA 3KVGA 4M3YA 3D2FB 1R59O 3I55N 3A5NC 4GMJB 1NK6A 4YOUA 1C0FA 4AHCA 2HW3A 1JLEA 1DGKN 4M7YA 5HROA 4WQ5A 1JL2A 3CPWM 1SKSA 1LCUA 4CJKA 4BECA 2FSKA 1S1VA 2F96A 4WQ5C 4DSFA 2P9LA 3PO4A 3M5RA 1DTTA 3AVCA 1TL1A 3LM2A 1NJYA 2HOEA 2VQFK 2HBLA 1RT7A 3ISNC 3AO3A 4KHPK 4XEIA 4KBOA 5C12A 2NZTA 2NLXA 3NF6A 4DV6K 4OPJA 4J2DA 3AVNA 4HTLA 3CCVN 2F8SA 1N32K 2AA4A 3VTIA 2WONA 1BG3A 1C0UA 3MX2A 1NK7A 2IVNA 3QEWA 4JKAA 4K8ZA 1RCHA 5BN8A 2Z1JA 3HK2A 1L3VA 5DK5A 4FJMA 2IGIA 2P9KA 3NVMA 3CCLN 4E0DA 2E5LK 3VOVA 1S72N 3V9ZA 1TKDA 3V1QA 4CEOA 3QIOA 1GLCG 3NHGA 1D8YA 3LZJA 3CI5A 4DG1A 2W40A 4HHTA 3L2WA 4I2QA 2HHXA 4GY2B 1ZYQA 4FWMA 4JI3K 3TAMA 1HPZA 3QLHA 4HWIA 3SMPA 3OYHA 4LF9K 5J2PA 3KTQA 4K42A 4OPKA 4WYBA 1KSPA 1OH6A 4J2AA 4B9VA 2YKMA 1HPMA 2JLEA 3TTDA 3QEXA 2IS3A 4FLVA 4OX9K 1BCMA 4N5SA 4X65K 3CFPA 2FBYA 3CJAA 3THYB 2F8TA 3TTFA 3D2EA 1WN7A 4LFAK 2NRTA 3AVGA 3O80A 4CJSA 4JKGA 1E4GT 2FC0A 4JHDA 3ENOA 5BPNA 3HL8A 3ENHA 4OGEA 3QEVA 4B9TA 2QM1A 4DU1A 3M8PA 3FZKA 1DKGD 1JXEA 4YNQA 4I9QA 4FLWA 2E88A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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