1ATNA

Atomic structure of the actin:dnase i complex
Total Genus 107
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
107
sequence length
372
structure length
371
Chain Sequence
DEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Atomic structure of the actin:DNase I complex.
pubmed doi rcsb
molecule tags Endodeoxyribonuclease
molecule keywords ACTIN
total genus 107
structure length 371
sequence length 372
ec nomenclature
pdb deposition date 1991-03-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1atnA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1atnA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1atnA04
3FGUA 1NGJA 4A2AA 1GLLO 5AQIA 4DCHA 4FL9A 4CZIA 1KAYA 2QXLA 1KXPA 3LDPA 4FWPA 3QFUA 3UB5A 1YUWA 4BREA 2FSNA 4EIAA 4IXCA 1BDGA 4XEIA 2E2QA 3R8EA 1TUUA 3U4LA 1S22A 3O08A 3WUHA 4CZMA 3KVGA 1BG3A 2ASOA 2J4RA 3H1QA 4BQLA 4FWLA 3MDQA 3RSEB 4CBXA 3VENA 3W0LA 1TYQB 3QFPA 4H5RA 3RSEA 1HKBA 4CZKA 3VF6A 4B1XB 1U2VA 2HMPA 3QB0A 1GLDG 4M7YA 2A40A 3MN9A 2P9NB 2YHYA 4CZLA 2ZWHA 4CI6A 2Q2RA 5AZJB 4MLEA 2P9NA 3H3OB 4H03B 1IG8A 4RWTA 5E84A 2FLOA 3F9MA 3D2FB 4HTLA 3HBTA 2ASMA 4AM7A 3D2FA 3QDKA 4RTFD 2QWQA 3VF2A 3IDHA 1R59O 3AY9A 2QWLA 3TU5A 3QBWA 4BC5A 1V4SA 3M3ZA 2HOEA 3ID8A 1H1VA 2Q1NA 1HLUA 3DAWA 2IVPA 4BRKA 4BRPA 3QMLA 2Q0RA 3U8XA 3TPQA 2CGKA 3U9ZA 3A0IX 2AP1A 4CZJA 1ZBSA 5AQZA 4JN4A 3VEYA 3B8AX 2A5XA 2E20A 1NM1A 3HSCA 1NGEA 4ISEA 2E2OA 3U9DA 1RFQA 5AQLA 1NMDA 3EKUA 4JNEA 1MWMA 4DHYA 2CH6A 2W41A 4BRFA 4E1JA 4EHUA 1HPMA 2Q0UA 4CZEA 3FE1A 1T6DA 4BRIA 3CJCA 3CJAA 3O6WA 1WOQA 2E2NA 2GTDA 4FO0A 5F2RA 3EO3A 4Z94A 1U6ZA 3I33A 4BRLA 3VESA 5JMVA 2E1ZA 3HM8A 1OKJA 5BN8A 3CI5A 3LDQA 4I6MB 4IO8A 1NGAA 3O1WA 4K41A 2PAVA 2QWPA 2CGLA 3CERA 3VGMA 3G25A 2W40A 3L0QA 3VEWA 4I6MA 4B1UB 4ISFA 1P8ZA 2ZF5O 4H0XB 2VWBA 1ATRA 1XUPO 5KQ8A 2HF4A 5FPDA 2GWKA 3GE1A 4CJ7A 3HTVA 1HKCA 3FLCO 2V51B 1QQMA 3CQYA 2A41A 1XQSC 3BF3A 2Q36A 3ENOA 3FR0A 4BRAA 1MWKA 4B1VA 2WUSA 3BEXA 4H5WA 2QWNA 1QQNA 4H5NA 1QQOA 5FPEA 2GUPA 4WQ4C 2YHXA 4C23A 4MLHA 5KPZA 4BR0A 4WQ5A 3A8YA 1Q18A 3L6QA 1J6ZA 1ZC6A 3DXMB 3CHWA 2P9SB 4YDUC 1BO5O 4BRQA 4AM6A 4PL7A 4A61A 3DXMA 3S41A 3WXLA 3ULEB 1E4GT 4BG8A 1E4FT 3H6EA 4ISGA 1LCUA 4H5TA 3ULEA 4Y0WA 5I9EB 1X3MA 4HWIA 1JCFA 5AZIB 1GLEG 4L3QA 2EWSA 1TYQA 1NGFA 3GDQA 2CGJA 4FPAA 3C0BA 2D4WA 3AARA 2P9UB 3LDLA 4H0PA 5AQKA 3DXKB 1NGHA 3AAPA 4PKGA 2E1YA 3JXUA 5AZJA 4YDUA 4FPBA 3CJBA 3OHRA 3FZLA 4O8KA 1HKGA 2BTFA 3VERA 4BR9A 2VCPA 4GNIA 5EXWA 5AQWA 4FWNA 2IVOA 2Q31A 4FWMA 4CZGA 2HF3A 2KHOA 1KAXA 3ZX2A 3ZX0A 1HX1A 3ZEUB 4K43A 3EN9A 2YI1A 4B9QA 3LM9A 3MN6A 2Q97A 1SQKA 5BRDA 3WXKA 3ZEUA 5BRFA 1D4XA 3JS6A 1T44A 2A42A 4GY2B 2F9TA 4BRDA 4B1ZA 2E88A 3GL1A 2QM1A 5AQOA 1QHAA 5ELZA 5JLFA 1NGIA 1QZ6A 2P9KB 2GWJA 4RCHA 3W3DA 1SZ2A 2OANA 1CZAN 2P9KA 4CBWA 1NLVA 4BRCA 3H45C 4PKHA 3ATVA 3WQTA 5JLHA 2QWMA 3LM2A 3D2EB 3EL2A 5AQPA 5EVZA 3H3NO 3A5NC 5EX5A 1DKGD 5BN9A 2GELA 3R9PA 1GLFO 4BG9A 3SLCA 1K8KB 3ZETB 2D0PA 3EKSA 4MO4A 3SK3A 1NWKA 4IWVA 4QS9A 1K8KA 2ASPA 2QWOA 3GBTA 3ZETA 3CQXA 5KPTA 4LC9B 4H0VB 4BROA 3WXJA 4H5VA 3SMPA 5F1XA 4F9OA 2D1KA 2A6AA 3UKUB 5BPNA 5FPNA 3O80A 1WUAA 4JD2B 1NGDA 2D0OA 5AQNA 3UKUA 1DGKN 3VEXA 3O8MA 3HI0A 1HUXA 3A5OC 2P9LB 4FSVA 1KAZA 5AQQA 5E26A 5AR0A 1BA0A 2P9LA 4EAHD 1C0FA 2FF6A 1ESVA 4KBOA 3IMXA 5AQYA 4XH5A 4QS8A 5AQSA 4IJAA 3DJCA 4FWOA 2UYTA 1YXQA 1ATSA 4CZFA 1JCGA 1ATNA 3WEEB 4BGBA 3LL3A 2V52B 5F0XA 5AQFA 2BUPA 2FSJA 2YJFA 3P4IA 2QWRA 3SMSA 3MMVA 3VEOA 3WEEA 3ATUA 2H3GX 4BVPA 1HJOA 3AAQA 3FZKA 3EZWA 4FWKA 2YCHA 4JAXA 3IFRA 3BUZB 3BP8A 3WXIA 2AA4A 1GLBG 1LOTB 1RGIA 4EHTA 4BR2A 1GLCG 2NRHA 2VYPA 2E2PA 2CH5A 2P9PB 2P9SA 4FWRA 1X9JA 5B8HA 2P9PA 3VF4A 1IJJA 4A2BA 1C0GA 3SJHA 1YAGA 4PKIA 4FOIA 5AQTA 5AQGA 3WQUA 2FSKA 3VOVA 2I7PA 3A5LC 5AZIA 4WQ4A 1ZXOA 2FF3B 3UE5A 5FPMA 2FXUA 2ZGZA 4CBUA 5EOYA 1BU6O 5BR9A 1EQYA 2P9UA 4BRNA 4BC3A 1NGBA 3DXKA 1TUYA 1GLJO 1U2VB 5TKYA 1X3NA 1XC3A 3LDNA 3QICA 3CJ7A 2YJEA 4BGAA 5BPLA 3FFKB 4NO7A 4FOEA 3KHYA 1Z05A 2F9WA 4EFHA 4FWSA 1BA1A 1Y64A 2DPNA 2V7YA 3VEVA 2A3ZA 4K25A 4IJNA 4IZ9A 5AQHA 3MK6A 3O4WA 3H46O 4MO5A 5AQUA 3C7NB 3FZMA 1BOTO 4BR5A 3GOIA 4M7XA 4DB3A 4K42A 5CE3A 2PBDA 3C7NA 3VPZA 5AQJA 2IVNA 1NBWA 3O1BA 5BRHA 3FZHA 3IUCA 3QBXA 5AQRA 3HZ6A 3L4IA 3A5MC 3KZBA 3M6GA 5KPRA 3D2EA 3D7EO 3CJ1A 3R6MA 4BVOA 3H1VX 4BR7A 1MDUB 5AQMA 3BF1A 3WT0A 3LDOA 1G99A 1JCEA 2YHWA 4CD1A 5KQDA 4BRHA 5BREA 1Z6RA 2I7NA 1YVNA 4CZHA 4J8FA 4QS7A 4XH4A 2QW9A 5LJWA 2ZGYA 4JHDB 4BR4A 4CD3A 4BRMA 1MA9B 3VETA 2GEMA 4O5FA 3O5BA 4JHDA 2E8AA 4JD2A 1NGCA 3ZX3A 3VGKA 3DWLA 3VGLA 4DQ8A 5LJVA 1BUPA 3FZFA 4PL8A 4BQZA 1DEJA 4BC2A 5AQVA 4XH1A 3UKRB 4H0YB 4A62A 2IIRA 5AQXA 4H0OA 5BPMA 2ITMA 3CETA 3UKRA 1RDWX 3ENHA 3MN7A 1S3XA 1V4TA 3MCPA 2NLXA 4BRGA 1QZ5A 3I8BA 2V7ZA 3GG4A 5ADXH 4WQ5C 5AFUH 3CJ9A 4NB4A 4BC4A 2P9IB 5JICA 1T6CA 2P9IA 1BWFO 1NGGA 4B1YB 4FWQA 3J8AA 1SAZA 4WYBA 3VEZA 4B1WB 3CIPA 5EY4A 3MN5A 2NZTA 4M63C 5ADXA 5AFUA 5LY3A 3M1FA 4H0TB 1GLAG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IKXA 1WSHA 3FGUA 1KLMA 1P90A 4YHHK 4KI4A 3BGRA 4CZIA 4DQIA 3TTFA 3NE6A 2FSNA 1D9DA 3AGKA 1BDGA 1K6YA 3SUQA 4BWJA 3R8EA 1IBMK 3U4LA 4CJWA 1O1WA 3O08A 1EWRA 3B6PA 2ASOA 1NOZA 3MDQA 2HNDA 4EP4A 3VENA 3W0LA 2RF2A 2QI2A 3P5JA 3QFPA 3SCXA 1WB9A 4FCYA 1HKBA 4B1XB 4CJEA 3OYMA 4JI3K 4FLTA 1IH7A 3KLGA 1Q82O 4HUEA 5AZJB 5KGWA 5HRPA 4CJLA 1DTQA 5E84A 5A2QO 1BQNA 2B4JA 3HBTA 4M45A 3V9SA 3D2FA 4CE9A 3QDKA 4RTFD 3QEIA 1R59O 3KLHA 2O4GA 3QBWA 4BC5A 3K59A 2XY8A 1T3VA 3M3ZA 2HOEA 2Z1GA 4CFAA 3K58A 4OKJA 1L5UA 2IVPA 3DAWA 3AO5A 5M1KA 5KGXA 3M8PA 3LWMA 4HCCA 2Q0RA 3U8XA 4YORA 3QESA 2CGKA 2YKMA 2AP1A 5C12A 3VQ8A 4YOWA 4KH4A 3VEYA 2A5XA 1NM1A 2E2OA 3HT3A 1NMDA 3CXCM 2W41A 4BY9C 3DLEA 3LPUA 1KVBA 3G0ZA 1KLNA 5J2QA 3SYZA 4HTUA 1ZBLA 4MDAA 3R1XA 1L3SA 4PA1A 1WSFA 3DOKA 4BDPA 3QEVA 2YNGA 3AVJA 3VESA 4X64K 3ZT2A 3CI5A 3KK7A 3O1WA 3V1OA 2W40A 4CIGA 3OYCA 1SL0A 1XMOK 3NCIA 1RDAA 4JI6K 3MX2A 1HPZA 2HF4A 5FPDA 2G8FA 4CIFA 1BISA 1HKCA 3FLCO 3CQYA 4M3UA 2Q36A 1VHXA 3ENOA 1OVQA 4BRAA 4CJUA 3ZT0A 1J5OA 2WUSA 5SWMA 3I0RA 5FPEA 2XO7A 3OW2M 4WQ5A 3L6QA 4FLXA 3ENBA 3CHWA 4DTMA 2P9SB 3AVIA 3O3FA 1BO5O 4WCEL 1M90O 3DXMA 4G1QA 3WXLA 3ULEB 1E4GT 4DS5A 4ISGA 4H5TA 2X78A 4OVLA 3TAPA 3L2QA 3NHGA 1JCFA 3HRGA 4KB0A 3GDQA 2G8WA 4FPAA 4EZ9A 3ULDA 4IG0A 4JKGB 2D4WA 4OLAA 3HOTA 3NF8A 1W97L 1C0UA 1WAJA 4GVEA 4MQ3A 4PKGA 2B6AA 5AZJA 4DG1A 1LW0A 5I42A 1IKVA 4FPBA 1R0AA 3OHRA 3FZLA 3LAKA 1HKGA 4BR9A 4O0JA 4GNIA 5EXWA 3T7ZA 3OYKA 3OYBA 1QHTA 4C8MA 2FBYA 4FJ8A 3EN9A 1ZBHA 1SQKA 4JI4K 2VWJA 3PIPL 3VTIA 1VQ4N 4GY2B 1RT7A 1U48A 3U6FA 3L3UA 2E88A 3GL1A 4UQGA 3V1QA 3DLBA 2KTQA 2OPPA 4WFNL 4PUOA 4DU1A 4DFPA 2GWJA 4RCHA 5M1FA 4J2AA 4BRCA 2UU9K 4PKHA 3WQTA 4O44A 2QWMA 1IV0A 3EL2A 1KCFA 5EVZA 2HBMA 4NXNK 1VQ8N 4JLHA 2G8UA 1VQMN 3MEDA 3SLCA 3DLRA 4BG9A 3IAYA 3HO1A 5MLCQ 2F7TA 4TSXA 3MCAB 4DR3K 1SUQA 4IWVA 3THWA 2KLAA 1K8KA 1VQ6N 1SL2A 3WXJA 3K5MA 2A6AA 1RT1A 3CMEN 4GVMA 5BPNA 1VSMA 1HJRA 3QO9A 1CXUA 1WUAA 4X65K 4M3RA 1DGKN 3OVNA 3O8MA 4QAGA 1XNQK 1HUXA 2NRXA 3H08A 2QKBA 4BDYA 2P5OA 3C95A 3G71N 1EKEA 4EAHD 1XMQK 4WFBL 3IMXA 4IBNA 4J2EA 3EE8A 4JI8K 3DOLA 1S9EA 3DJCA 2UYTA 4KKOA 3MAQA 1JLBA 4BGBA 5D3GA 3NF9A 3P4IA 2QWRA 3WEEA 4GW6A 4KV8A 4DQPA 1NJIO 3BUZB 2AA4A 4CGGA 3D6RA 1LOTB 4W5QA 2VQEK 2D5RA 4NCAA 3VA0A 5GADP 1ASWA 2VYPA 3DRRA 5E41A 2CH5A 3PX4A 2W00A 5GAEP 3DM2A 2P9SA 1ZBIA 5GAHP 3TANA 5B8HA 2P9PA 3VQ9A 1IO2A 1K9MO 3VF4A 4A2BA 3SJHA 3K2PA 2FSKA 2E6LA 2O8BA 4O55A 1ZXOA 3UE5A 3OJUA 2HBKA 4DSEA 2FXUA 1RTDA 5BR9A 1Q81O 4K0KK 3TTDA 2OTJN 1K8AO 1JLCA 4ZHRA 1XC3A 3LDNA 1HNIA 1HMVA 3WNGA 3P39A 3OYDA 2F9WA 4V19S 2B5JA 4CEDA 4DV6K 1ZBUA 2DPNA 3VEVA 4FK0A 4QOZB 3VQ6A 4Q5VA 3MK6A 4I2PA 4JI1K 4MO5A 4LF4K 2YNHA 4BR5A 3NVKA 3AO2A 4CJKA 5JVHL 4DB3A 4K42A 2PBDA 5AQJA 2IVNA 4DLGA 4NYFA 4FJJA 1QSSA 3VMFB 2JLEA 3MEGA 3TSPA 5AQRA 3K5LA 3L8BA 5GINA 3K5NA 3IRXA 3H1VX 4CJ5A 1ASVA 4CF9A 3QIOA 3KK1A 4DSLA 4JI5K 3WT0A 1ZYQA 4DR6K 4W5NA 4CD1A 5KQDA 3I56N 4HUGA 2HMIA 2GUIA 1WSJA 5BREA 1Z6RA 4JYAK 1KVCA 2Q3SA 4J8FA 4QS7A 4KH5A 2ZGYA 2RE2A 4CK1A 4CD3A 4PHTX 3TTCA 4KB1A 3QERA 2E8AA 1NOYA 2OYQA 3VQ5A 1BL3A 5EU7A 4CGJA 4DR2K 3FZFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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