The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
10
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sequence length |
56
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structure length |
56
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Chain Sequence |
MEAIAKVDFKATADDELSFKRGDILKVLNEESDQNWYKAELNGKDGFIPKNYIEMK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Molecular and cellular analysis of Grb2 SH3 domain mutants: interaction with Sos and dynamin.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
GRB2
|
| source organism |
Homo sapiens
|
| molecule tags |
Complex (adaptor protein/peptide)
|
| total genus |
10
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1997-11-17 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1GCP A; 2YUO A; 2RQR A; 3VRZ A; 2LQN A; 2OJ2 A; 3O5Z A; 1X43 A; 4OMO A; 2K6D A; 1Z9Q A; 1WX6 A; 2FEI A; 4J9B A; 1RI9 A; 2O88 A; 2DL5 A; 4J9D A; 2P4R A; 2V1Q A; 2EVR A; 2ECZ A; 1Y57 A; 2KRM A; 2ROL A; 1M27 C; 1UG1 A; 2KEA A; 1A0N B; 2W0Z A; 1NYG A; 1VA7 A; 2FG0 A; 3EG1 A; 4WCI A; 2CUB A; 3ZL7 C; 2BZY A; 3EGU A; 2A08 A; 3REA B; 1T0H A; 1T0J A; 4RUG A; 1WXB A; 4K11 A; 4RTY A; 2J05 A; 1M3A A; 5HCK A; 4ORZ A; 1NEG A; 2L3S A; 3SEM A; 4J9F A; 2RQV A; 3EG2 A; 2DRM A; 3PE0 A; 4E6R A; 1PHT A; 4J9E A; 2LQW A; 1AVZ C; 4CC4 B; 1M3B A; 1QKX A; 1YCS B; 2EGC A; 2JT4 A; 2KRS A; 4Z88 A; 5I11 A; 2AK5 A; 2F2W A; 1I07 A; 1GL5 A; 1KJW A; 1SHG A; 3EHR A; 1JQQ A; 1K0X A; 1JXO A; 1WYX A; 4D8K A; 4OMQ A; 2VVK A; 4RTX A; 4AFS C; 3U23 A; 1WXU A; 1M3C A; 1WLP B; 3QWY A; 2DA9 A; 1SRM A; 2KRN A; 1CKA A; 2KT1 A; 2J6F A; 4RTV A; 1EFN A; 1K4U S; 4F16 A; 1VYV A; 2PTK A; 4Z89 A; 1YN8 A; 1G83 A; 4JZ3 A; 1CKB A; 1TUD A; 1QLY A; 1UHC A; 2I0N A; 2YDL A; 2KYB A; 1V1C A; 3H0I A; 2EBP A; 4F17 A; 2GTJ A; 2K79 A; 3VS5 A; 2HBW A; 2CSQ A; 1SSH A; 2VKN A; 1X2K A; 2GBQ A; 1ZSG A; 2GNC A; 2BZ8 A; 1AOJ A; 1AD5 A; 4FSS A; 1U5S A; 2D1X A; 1ZBJ A; 2RPN A; 2A28 A; 2RQT A; 4QT7 A; 1J3T A; 1UGV A; 1ZLM A; 1NLP C; 2DNU A; 1AWO A; 1QKW A; 1JXM A; 2AKL A; 2DL3 A; 4HVV A; 2KXD A; 3KFV A; 4A63 B; 1SPK A; 2C0T A; 3PVQ A; 2RMO A; 2X3W D; 2KNB B; 2L3P A; 2EYX A; 2DBK A; 1YP5 A; 2G6F X; 1VYU A; 1H8K A; 4GBQ A; 3VS3 A; 3VS6 A; 1UHF A; 2EKH A; 4J9C A; 4X1V A; 1OPK A; 2ED1 A; 5IXB A; 2QDL A; 2O31 A; 1QWE A; 2RNA A; 3TVT A; 2RQW A; 3M0S A; 1HJD A; 4RTU A; 2F2V A; 1JO8 A; 2FPD A; 2M51 A; 3R6N A; 4D8D A; 1N5Z A; 2O2O A; 3M0R A; 1BB9 A; 4GLM A; 2ED0 A; 3EHQ A; 4AFZ C; 1W1F A; 2FRW A; 1OEB A; 1UUE A; 2H8H A; 4IIM A; 1GFD A; 2LX7 A; 3H41 A; 2EPD A; 2DVJ A; 1AZE A; 1FMK A; 3VS0 A; 2LMJ A; 1E6H A; 2JM9 A; 2LNH B; 1MV0 B; 2DM1 A; 2K7A A; 1H92 A; 2FPE A; 1B07 A; 1KFZ A; 2YUN A; 2DL4 A; 4HVW A; 2EW3 A; 1RLP C; 1U3O A; 3VS7 A; 2OAW A; 2SRC A; 3PVL A; 2ENM A; 4RTZ A; 1VYT A; 1B3Q A; 4RTW A; 2L0A A; 1GBQ A; 1U06 A; 2PZ1 A; 4CC3 A; 3REB B; 1AWW A; 4DEX A; 2B86 A; 4LN2 A; 2DYB A; 4IIO A; 2LJ3 A; 1ZUY A; 2GTO A; 1X6B A; 2DL7 A; 3NGP A; 4HCK A; 1M8M A; 2FPF A; 1PKT A; 4OMN A; 2A37 A; 1ABQ A; 1TUC A; 2KXC A; 1BK2 A; 2LP5 A; 2XMF A; 1X27 A; 2L2P A; 2KBT A; 1NEB A; 2DBM A; 1RLQ C; 2DJQ A; 2CSI A; 2DE0 X; 4J9G A; 4R0K A; 1E7O A; 1GRI A; 2OI3 A; 3M0P A; 5ECA A; 2HSP A; 1AEY A; 4JJC A; 1WA7 A; 2AKK A; 2CH4 W; 2KT8 A; 1PWT A; 2O9S A; 2KGT A; 2LZ6 B; 3C0C A; 1UJY A; 1UDL A; 4LNP A; 2FRY A; 2EYZ A; 1JEG A; 1UE9 A; 5EC7 A; 1G2B A; 2KRO A; 3A98 A; 4AFU C; 1K76 A; 1WDX A; 2JS2 A; 4Y92 A; 4Z8A A; 2O9V A; 2JMA A; 1XOV A; 4HXJ A; 5IHK A; 4OML A; 2JW4 A; 2HEQ A; 2NWM A; 5GJW B; 1IO6 A; 3VS4 A; 2MCN A; 2EQI A; 1ZUU A; 2RF0 A; 4AG2 C; 2DRK A; 2DIL A; 2IIM A; 1I1J A; 3GBQ A; 1FYN A; 1GCQ C; 2DMO A; 1M30 A; 4F14 A; 2HDA A; 2CRE A; 1AZG B; 5IXF A; 1T3S A; 2DLP A; 2V1R A; 2E5K A; 5L23 A; 3THK A; 5FW9 A; 2EGA A; 2KYM A; 1PRM C; 1NG2 A; 2YSQ A; 1UEC A; 1W70 A; 1ZX6 A; 2ABL A; 3EG0 A; 1ZUK A; 4JJB A; 2BTT A; 3JV3 A; 1UJ0 A; 2AZS A; 2FO0 A; 2HCK A; 1ARK A; 2RQU A; 2J6O A; 1WFW A; 5I22 A; 3TSZ A; 3H0H A; 3NHN A; 4EIK A; 5GJV B; 5IHI A; 1OV3 A; 3VS1 A; 2KR3 A; 3RNJ A; 4CC7 A; 1OOT A; 1QWF A; 4AFQ C; 4RTT A; 3H0F A; 2D0N A; 2PNI A; 2BZX A; 1BBZ A; 2CH4 A; 1UTI A; 2EYY A; 1YNZ A; 2YT6 A; 2EYW A; 4HVU A; 4AG1 C; 2LCS A; 3LH5 A; 1I0C A; 1E6G A; 1OPL A; 2M0Y A; 3FJ5 A; 2CDT A; 2GGR A; 1Z9Z A; 2DX1 A; 1PKS A; 3UAT A; 1X6G A; 4JPB W; 1NM7 A; 1PRL C; 2NUZ A; 2A36 A; 2MIO A; 3NPF A; 2J7I A; 2YUQ A; 2VWF A; 2K2M A; 2DL8 A; 1RUW A; 1X2Q A; 1TG0 A; 1YWP A; 2C0I A; 2X3X D; 4OMM A; 4DEY A; 1GBR A; 3I5R A; 1KSW A; 2JTE A; 1KIK A; 3ULR B; 1NLO C; 2D8H A; 3IQL A; 2JXB A; 1BU1 A; 1SRL A; 2JS0 A; 3I35 A; 2RN8 A; 1MV3 A; 1LCK A; 1SHF A; 1CSK A; 3UA7 A; 1JU5 C; 3M0U A; 1NYF A; 1GCQ A; 2GQI A; 2DF6 A; 1HSQ A; 2AZV A; 5FWB A; 3M0T A; 5IH2 A; 1QCF A; 1K1Z A; 1UFF A; 1WXT A; 4LE9 A; 2C0O A; 2KE9 A; 3NMZ C; 2CUD A; 4ZNX A; 3TSW A; 1K0S A; 2K3B A; 5IHN A; 2YUP A; 1GFC A; 1YWO A; 2SEM A; 3VRY A; 4CC2 A; 2L3Q A; 2ROT A; 2LJ1 A; 1X69 A; 2LJ0 A; 2CT4 A; 2K9G A; 1HD3 A; 1MUZ A; 1K9A A; 1PNJ A; 1ABO A; 2JM8 A; 2F2X A; 1WIE A; 3UF4 A; 4M4Z A; 4JJD A; 2CT3 A; 2MOX A; 3RBB B; 1S1N A; 4OMP A; 1AWX A; 2EGE A; 1Y0M A; 2W10 A; 1AWJ A; 4JZ4 A; 3I9Q A; 3UA6 A; 2JMC A; 2D8J A; 3QWX X; 4J9I A; 4LUD A; 3VS2 A; 3CQT A; 3EG3 A; 4LUE A; 2ESW A; 3I5S A; 1WI7 A; 3M0Q A; 2J06 A; 1W6X A; 5FWC A; 1SEM A; 4ESR A; 1T3L A; 2J6K A; 3SHW A; 4J9H A; 1H3H A; 4KRT A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2DD5 A; 3MEW A; 1G5V A; 5J3B A; 2M02 A; 2E3I A; 3CCV Q; 2RQR A; 2KK4 A; 3CCL A; 1D09 B; 2K6D A; 3CC2 T; 2LCC A; 1U1T A; 4PNO A; 1VQ7 Q; 2KAF A; 4C8Q D; 5FU7 B; 4J9D A; 2DTH A; 4DBF A; 1Y57 A; 1M27 C; 1UG1 A; 2KEA A; 2CUB A; 3CCQ Q; 4OB2 B; 1IXD A; 3EGU A; 3M56 A; 2A08 A; 1Q86 R; 2M16 A; 3CMA T; 3HSB A; 4RG8 A; 2PQW A; 1QVG P; 4K11 A; 2E1H A; 3JCM c; 2J05 A; 3L2Z A; 1M3A A; 5CIU A; 3VKI A; 2P0P A; 2BKD N; 5KYY B; 2XKO C; 4M7D F; 3R6O A; 2L3S A; 1O9S A; 4E7Z A; 4J9F A; 2Z0W A; 4HKE A; 1YBY A; 5IAY A; 1KQS P; 4J9E A; 1AVZ C; 2XK0 A; 1M3B A; 4PFZ A; 2EGC A; 2VXE A; 1OU9 A; 4NL2 A; 3LGL A; 4Z88 A; 2F2W A; 1I07 A; 5KYY A; 1GL5 A; 5GAO r; 1KJW A; 1M90 U; 3EHR A; 4ZGD B; 3V8L A; 5A0L A; 1JXO A; 1WYX A; 3OYJ A; 4OMQ A; 5D7U A; 1BI0 A; 2DYI A; 4AFS C; 3U23 A; 1VQN T; 2CKK A; 1DJ7 B; 4ELZ C; 1MMN A; 1IB8 A; 2J6F A; 2KMT A; 4JJN K; 5GAM e; 2YRD A; 1CKB A; 3QJ6 A; 1X75 C; 4KGX B; 1W2B P; 1YJW T; 1SKU B; 1PD0 A; 4FIB A; 4IUU A; 2GTJ A; 4LDX A; 3OMG A; 2NLU A; 3FRN A; 2LT1 A; 1ZSG A; 1FX7 A; 5GMK i; 1LJO A; 3OYA A; 2EYQ A; 3CCR T; 1NLP C; 1G3S A; 2DNU A; 1QKW A; 2V8J A; 5AT1 B; 1JXM A; 2X9H A; 2KXD A; 1VOM A; 1TXQ A; 2XID A; 5FRN A; 4HCB A; 1WQ7 A; 4E7I A; 4F04 B; 2L3P A; 2DBK A; 1RAC B; 1YP5 A; 1N6A A; 2ATC B; 4F7U F; 2EQM A; 2ZPH B; 5A0G A; 5LJ5 j; 3OYM A; 1Q82 R; 3OQ5 A; 2RNA A; 3TVT A; 2DER A; 4FW2 A; 5M9O A; 2Y4Y A; 2PVO B; 3M0S A; 4OB3 B; 3ER0 A; 3TEE A; 2F2V A; 1JO8 A; 2M51 A; 4M78 C; 2I2L A; 2JZ2 A; 2F1L A; 4M7A F; 1M4Z A; 4B9X A; 2ED0 A; 1Q86 U; 1M8V A; 1VQM A; 4AFZ C; 2WSF E; 1OEB A; 1WPY A; 4XK8 E; 3G4S A; 2EIF A; 2HSE B; 1FMK A; 2LMJ A; 3L2W A; 3JCM g; 2NYS A; 2JM9 A; 3QHS A; 4XTU A; 2P0K A; 1Y71 A; 2EW3 A; 2OAW A; 4PJO E; 1YHQ A; 1M2V B; 3OYB A; 3CCU A; 2DAQ A; 1I4K 1; 3L2V A; 1C6V X; 2L0A A; 1U06 A; 4X9D A; 3ASK A; 5LJ3 e; 2H3E B; 2EQU A; 3UPU A; 4LN2 A; 1FMV A; 1ZUY A; 4BDY A; 1M2V A; 3G7Z A; 3QII A; 3OBY A; 3X26 B; 2X4Y A; 4HCK A; 3J81 E; 1VQP T; 3VYG A; 2A37 A; 2CZ7 B; 2QXF A; 2DK3 A; 4WTO B; 1RLQ C; 2CSI A; 1Q86 C; 4M78 B; 3KBG A; 4R0K A; 2DJZ A; 3CPW P; 1WA7 A; 3UT1 A; 4XQ3 A; 1M1F A; 2DXT A; 2O01 E; 1UJY A; 1UDL A; 4M78 A; 1Q95 G; 2DXB A; 1JEG A; 2VXF A; 3A98 A; 4AFU C; 4C92 B; 1K76 A; 4EMH A; 4FM4 B; 2X4X A; 2PUO B; 3X25 B; 3OW2 S; 4HXJ A; 3CMA A; 4OML A; 2JW4 A; 1QW1 A; 1IO6 A; 2QTX A; 5CR2 A; 3MCA B; 3RKW A; 1ZUU A; 2RF0 A; 1F1B B; 2DKG A; 2E5Q A; 4C92 A; 1FYN A; 2YRC A; 4XU3 A; 4FT4 A; 1GCQ C; 2OTL T; 1AZG B; 4B9W A; 4BE0 A; 1T3S A; 2DLP A; 1UGR B; 3G6E T; 3OYE A; 2BE7 D; 3LLR A; 5FW9 A; 2EGA A; 2KYM A; 2ABL A; 3EG0 A; 4JJB A; 2BTT A; 1VQN A; 2AZS A; 2FO0 A; 3DLM A; 2RH2 A; 2JNG A; 3JB9 G; 5I22 A; 3H0H A; 3NHN A; 3OYK A; 5GAN g; 5IHI A; 4C92 D; 3I55 T; 3GP8 A; 4FCY A; 3JCM J; 3WVD B; 1QWF A; 3GNF B; 2E65 A; 1RAB B; 4KBM B; 4RTT A; 5DY9 A; 1YJW A; 2D0N A; 2WSE E; 3M58 A; 2YT6 A; 3BY7 A; 4M77 A; 5AYF A; 4Y91 A; 3KXT A; 5CCA A; 1I0C A; 2RHY A; 1E6G A; 3FJ5 A; 3HP9 A; 2CDT A; 2CP5 A; 2GGR A; 2BE9 B; 3UAT A; 2EQJ A; 5KE2 A; 1PRL C; 3CCR A; 2A36 A; 1Q82 C; 3M4G A; 1FXX A; 2K2M A; 4E7L A; 1ACM B; 5GAN d; 1TG0 A; 2QI2 A; 1YWP A; 2QDY B; 4OMM A; 4A4G A; 5GAO q; 1GBR A; 1PC0 A; 4LDU A; 1KSW A; 1KIK A; 1NLO C; 3IQL A; 2R5A A; 2RN8 A; 2RJF A; 4M77 D; 5CO7 A; 1SHF A; 3CCS Q; 5CKB A; 5KYW B; 1NZ9 A; 1GCQ A; 1D1C A; 4XU0 A; 5FWB A; 1XNI A; 1ZA1 B; 3J80 E; 4E7S A; 3CC4 T; 1VQK Q; 5GMK e; 1WXT A; 1OX9 A; 4JRK A; 1K0S A; 5IHN A; 1YIJ Q; 1LOJ A; 4BI8 B; 5KYW A; 1B34 B; 1IGU A; 4XTX A; 4PJO G; 4QQG A; 4LXC A; 4A53 A; 1WHM A; 1VQ9 Q; 1X69 A; 2CT4 A; 1KQ2 A; 4M75 F; 5FU6 C; 1WIE A; 1B34 A; 3H6Z A; 1VQK T; 5C0M A; 4PJL A; 3FEO A; 4PLL A; 2A3L A; 4LD6 A; 1TUG B; 4N4H A; 2HBP A; 1YIJ T; 2QEX T; 3RBB B; 4OMP A; 3RER A; 4QQ6 A; 1AWJ A; 2MYS A; 4LUD A; 3SDZ A; 3VV0 A; 2DFU A; 2ESW A; 1YJ9 T; 2RHU A; 3JSC A; 1M5Q 1; 3A8M B; 3V7S A; 1VQP A; 2JTM A; 4HCC A; 3JCM b; 3BFM A; 1SEM A; 3RDV A; 1R8O B; 2ZGW A; 2M9U A; 1GCP A; 2K57 A; 1VQ4 Q; 3O8V A; 2JUF A; 1QVP A; 1PCX A; 4AT1 B; 3GOX A; 3VRZ A; 2LQN A; 1X43 A; 3QO3 A; 2MAM A; 4MDW A; 4JRQ A; 1YCY A; 1D0Y A; 1UB4 A; 2VYT A; 4J9B A; 4M77 G; 4XAX B; 1MHN A; 4OB1 B; 3RIR A; 1MMA A; 2KRM A; 3VUZ A; 2ROL A; 4D6W A; 4C8Q C; 2W0Z A; 1NYG A; 4BE1 A; 2FG0 A; 2RJC A; 3EG1 A; 3PNW C; 1VQ4 T; 3SWN C; 3ZL7 C; 3FJP A; 5FU6 B; 2BZY A; 4OB0 B; 5DM7 R; 1T0H A; 2MWP A; 1YI2 A; 4RUG A; 4KUL A; 3L2R A; 3JCM Q; 3HFO A; 1Y7X A; 1NEG A; 1OI1 A; 3SEM A; 4HT9 A; 3EG2 A; 4IUP A; 1W4S A; 5LJ3 g; 2YLB A; 2DRM A; 3PE0 A; 2OTL A; 3G1J A; 2RI2 A; 4OP0 A; 3G6E A; 2XDB A; 2DD4 A; 1YCS B; 2KRS A; 2PVG B; 4C5G A; 3I56 A; 2DZC A; 2IPO B; 2ZPF B; 2AK5 A; 4VUB A; 3MKD A; 1H3Z A; 4DBH A; 2MWO A; 1JQQ A; 4D8K A; 1RAF B; 3L2U A; 1VQ5 Q; 4JUV A; 1M3C A; 2NUP B; 3QWY A; 2DA9 A; 4J7I A; 2DIG A; 2E41 A; 4C0Z A; 1M90 R; 3OYY A; 4C8Q F; 3CBO A; 3I55 A; 4JZ3 A; 2K5F A; 2OTJ Q; 2DIQ A; 5J39 A; 4C0D C; 2I0N A; 2NUP A; 2KYB A; 3CD6 Q; 1V1C A; 1IRX A; 1I5L A; 3WVE B; 2K79 A; 2CSQ A; 1YJN Q; 1VQ5 T; 4FT2 A; 1X6O A; 2VKN A; 1X2K A; 4TVR A; 4OGC A; 3SWN B; 4DBQ A; 1AD5 A; 2JN0 A; 2D1X A; 5GMK m; 3CC7 Q; 2RQT A; 4QT7 A; 3QKJ A; 2RHX A; 2OTJ T; 3CBM A; 1RAH B; 1UGV A; 1ZLM A; 3OYH A; 1YIT Q; 2AKL A; 4FYY B; 1WHL A; 4HVV A; 3OB9 A; 3SWN A; 1BIB A; 5HK3 A; 2E10 A; 4UC4 A; 2HD0 A; 4X9C A; 1H8K A; 4GBQ A; 3VS3 A; 2ZCF B; 2DVE A; 3CC7 T; 1OPK A; 2PU9 B; 4E2F B; 2D0Q B; 3CC4 A; 1HJD A; 3H9N A; 3A8O B; 5CQY A; 3JCM V; 2JJ9 A; 3HTR A; 2RK1 A; 3M0R A; 4KGV B; 3JCM f; 4QVD A; 3EHQ A; 4PJN A; 3OYD A; 2FRW A; 4IIM A; 1UUE A; 3C94 A; 1GFD A; 2LX7 A; 3CBP A; 3H41 A; 4C0D B; 1WHG A; 1AZE A; 3F70 A; 1VQO Q; 3D7S B; 2XHC A; 3OSS C; 3CCV T; 3HL8 A; 4C5E A; 1MV0 B; 1OQK A; 1KFZ A; 3LX7 A; 1D0Z A; 1RLP C; 1P92 A; 1BCM A; 3PVL A; 5CKE A; 2QEX A; 1TSF A; 3QUI A; 1VQ7 T; 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