1B0LA

Recombinant human diferric lactoferrin
Total Genus 221
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
221
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
b'GRRRSVQWCTVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of recombinant human lactoferrin expressed in Aspergillus awamori.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LACTOFERRIN)
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal binding protein
total genus 221
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-11-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA03
2DWJA 3LSFB 3U8QA 4OFJA 1MPDA 5CI5A 1B0LA 3C33A 2X26A 2VP1A 3G3HA 2QMXA 4R6KA 4YZZA 3MVXA 4DDDA 1SYIA 2Y7RA 1GV8A 2AL5A 4DE8A 3HHGA 3UK4A 1US4A 1P1OA 2UYEA 1Z7NE 3P7IA 5FTIA 4JDFA 4ZZAA 2Z8EA 2E1SA 3HN0A 2QMWA 4MFIA 1PB8A 1ZJLA 1JW4A 1S9TA 3PUYE 1H3DA 1FCKA 3EQ1A 4RPNA 4R9GA 3E3KA 2XXYA 3LC8A 4M4GA 1VE4A 3O97A 3TYHA 3K6UA 3JZJA 3CI8A 3K02A 4DIGA 4OTEA 3UA8A 3VLUA 1R6ZA 5HM4B 4QSDA 4X1DA 3G3GA 3MPKA 1UTHB 4E0WA 1JVXA 4EXKA 1OVBA 2XXIA 1MXVA 3K00A 4F3PA 2V3TA 3GLBA 4LA9A 3CSGA 1Y1ZA 3MBPA 3KSJA 2XXPA 1QKBA 2RKMA 4MLQA 4DZ1A 3IOTA 1DTZA 2G29A 1Y1MA 3Q29A 4R9FA 5K2YA 1N7WA 3N94A 1FQAA 3A3UA 1TFAA 3TAJA 4XKQA 1PDAA 2Z8DA 3K0VA 5FTHA 1I6BA 4L17A 2DE3A 1Q1KA 3FZVA 1A40A 3K1MA 4EF2A 2O84X 1B3FA 3MQ9A 1PEBA 2Y7KA 2BJJX 1ZKBA 4HCWA 2M8CA 3CSBA 2HXWA 4R74A 5JTYB 1IQ7A 3E4RA 2HZLA 3DLNA 3UN6A 2R71A 3FV1A 4JSDA 1NL5A 4H67A 4JWXA 3T22A 2GHAA 3JYRA 5I57A 1IXGA 4KQPA 1FQEA 3KEIA 4ZE8A 3UORA 4IO4A 1POTA 3R6UA 4KYSA 3U93A 2DVZA 3B6WA 2H9BA 1OLCA 3VVDA 4ZEDA 3PGFA 5HBCA 2RF1A 1D9VA 2H98A 2DWHA 4PP0A 3OO7A 3PPNA 4EDPA 1PB9A 5DYHA 4Q0CA 3IB0A 4U21A 4WEDA 4LZ7A 3R7XA 3EN3A 2XXUA 5DVIA 2XXVA 5I56A 4GRKA 2XXTA 1VFDA 2QL3A 2F7CA 1USYH 4LVQA 4R72A 2ZYOA 2ZNSA 1MXXA 1M5EA 2P0SA 4OETA 2RCAA 2R9JA 3PU5A 4Q5TA 1JQFA 1BKAA 1II5A 1BTJA 1H76A 4FEDA 3FVKA 5I57B 1MQIA 1FTMA 3TUSA 3CR9A 4XKRA 5K2XA 2Q9TA 3FXQA 2F78A 2X7QA 4YAHX 5J1DA 5TPAA 2ESNA 2O69A 4LUBA 5I2KA 1R9LA 2VD2A 3M3LA 5CBRA 4EUOA 4F31B 1JETA 3HSTA 3K6WA 3VXCA 3LSWA 1Z7ME 4LP2B 3HHFA 2AYSA 4WKMA 4GLIA 4R6HA 1ELJA 2DE4A 4YKIA 5H8SA 3KOTA 1SI0A 4KCDA 2XHDA 4X48A 4I8CA 3ODBA 1A8FA 1B1HA 3EPEA 2QSXA 3G7WA 3T9VA 3MWBA 2OK2A 2RCBA 4NF6A 5I56B 1BLFA 2P2AA 2NOOA 4O3AA 4F29A 5AA1A 5IKBA 4R2FA 3O2AA 2H5YA 4XTCQ 3S4UA 1AL3A 4ZS9A 1UIUA 1A54A 2I0CA 3KJ7A 2I48A 5HPQA 3PPPA 3MVWA 2B65A 3QAXA 2O7UA 4PFUA 1AOVA 2ZNUA 1Y9UA 4R2BA 1MRPA 3RTWB 1N76A 3MP6A 3SKPA 5TU0A 4G4PA 4N07A 3KBRA 5I2KB 5B70A 1WDNA 4OFLA 1S7YA 4OEUA 4DLDA 2QS1A 1ZTYA 4ELOA 4FIMA 2ZMBA 2UYFA 1YAEA 2Y84A 1XS5A 1AH5A 3H6WA 3TEPA 3SDFA 3QUFA 4GXAA 4EQ9A 4TLMB 4C0RA 4OXVA 1D4NA 3QSLA 3IR1A 5FHNA 4NF6B 1GGGA 3IJOB 4GXSB 3RUMA 2NUVA 1ZBMA 4GIZA 5TP9A 3CG1A 3VLVA 3OO8A 4DCYA 5ITOA 3VE1B 2V84A 4OQOA 4OEVA 3SETA 4AB5A 3MP1A 2VGQA 1QVSA 4OZ9A 3KOSA 3FXRA 1JEUA 2ZYKA 4G8MA 1N0TA 2LAOA 4KI0E 1FTOA 1EZPA 1GR2A 2ZYNA 3K1PA 3VFJA 4XKPA 1LLSA 3MW0A 2GRVA 2ZYMA 2XXWA 2Q88A 3H06B 3DP4A 4YKKA 1LAGE 1URGA 4AB6A 5AE4A 2XD3A 3V5AA 3H4ZA 5I58A 4RA1A 3ILTB 1LAFE 3IORA 1MQGA 1B7HA 3VV5A 2O68A 4EF1A 3RLFE 5CM6A 1MQJA 1N7XA 1MXYA 4G8HA 2DXYA 2ANJA 3FVGA 5H8QA 4YKJA 1MPCA 4R75A 3T66A 1ANFA 4KFQA 2VOZA 1EZOA 3K01A 1SVXB 4LQ2A 4HTGA 3B6TA 1PB7A 3T9XB 3MZBA 2FNCA 1WODA 1LFIA 3RPWA 3N26A 4F1YA 1UTHA 1B05A 2GHBA 1D3KA 3TZAA 3TFLA 4GL8A 4QSCA 3IO6A 1US5A 3FUZA 2QPQA 1URSA 2XD2A 3W9VA 2V25A 3D4CA 2F34A 2OBGA 4DXUA 5I58B 4I62A 3A09A 1I69A 1LGBC 4HW8A 2YPNA 2F7BA 3ZKKA 4RY1A 1A99A 4OFOA 3K6XA 2GFEA 2O1MA 4ELQA 1ZMGA 2HAVA 1QUKA 2DWIA 1H43A 1USYE 3ZS6A 3GXAA 5BWJA 3BFUA 5H8QB 2X7PA 5DVFA 3PMWA 3H6VA 4LZ8A 1OIBA 3IAZA 3MVZA 4ZDMA 4BDOA 1FTKA 4THIA 4MF3A 4H8IA 4DXCA 3V8XB 3KSXA 5H8FB 1LB9A 5JTYA 3JV9A 3QUJA 2HAUA 3CFXA 2NXOA 4H5FA 4YU0A 4Q8RA 2ONKE 3A3CA 2VHAA 1OLAA 3AXFA 1JW5A 2XX8A 4N13A 3OO9A 4NE4A 1PBPA 4GL0A 2I3WA 4N6PA 2I4CA 2D3IA 3MZ1A 3UGWA 3HO7A 2ONSA 3IX1A 3FD3A 3SEUA 4ZE9A 3U72A 4OMBA 5I59A 2UVIA 1Y3PA 1M5CA 1B5JA 2F6PA 3E9XA 4KHZE 4OHNA 5H8NB 4P0GA 1LSTA 4JB7A 4UACA 1NH8A 2OCUA 3H7MA 2DWAA 2H4IA 3MJNA 4PE5B 2UVGA 1N3WA 2PT1A 2A5TA 1D9YA 4QFLA 3TODA 3IK6B 3SEWA 3IO4A 2HFBA 2V93A 3FGSA 4F3SA 2REJA 3LUYA 2YLNA 3L6HA 1NKXA 3SEVA 3PMXA 2NWJA 1FW0A 3O6GA 3GZGA 4ECFA 4H65A 3FJ7A 4Z7EA 5I59B 4RK2A 4F3BA 1B40A 3CFZA 4ELRA 2B3BA 1PC3A 2XXQA 1P1WA 1MY2A 3ECRA 1R1NA 4C1TA 1MS7A 2NVUB 2OWTA 2F6GA 1JNFA 3C9HA 1IXCA 4NEDA 3O29A 5JK4A 4BDRA 3BBRA 3VVFA 2A5TB 4O3BA 3OD7A 3K1NA 4P0IA 1LFHA 3LR1A 4U1OA 4ZEIA 3UP9A 1UIVA 3HCQA 1JEVA 3IOWA 2DQVA 2QS4A 3FASA 2D5WA 5DTBA 4Q30B 1GTKA 1DOTA 3IB2A 3GBAA 4H1XA 3G3IA 3MP8A 4X1BA 5ICTA 4PQJA 4EXLA 1N3XA 3RN8A 4PFWA 4ESXA 3TTNA 1FQFA 4QFPA 4I9DA 3R26A 2DXRA 4IGTA 1FQDA 1BP5A 4F39A 4BDLA 4LQ5A 4LATA 3PV0E 1FQBA 5F7VA 4ESWA 1XT8A 2WKYA 3VXBA 3S9NC 1YTVA 4GFRA 1XOCA 3O66A 4X9TA 4TQUQ 3Q25A 3KZGA 4FORA 3TQWA 2I3VA 1B52A 1MY4A 1UTBB 2O1LA 1B5HA 4G8NA 1IXIA 4QFKA 4OESA 1Q35A 3CFLA 3M8UA 5I2NA 2ALUA 2O51A 2O6AA 3E13X 3I6VA 3S9EA 4JBZA 1Y4TA 1RKMA 3Q28A 3S9MC 3L6GA 3K6VA 3IL1B 2Q2AA 3ZKLA 3I3VA 2XXXA 4U4SA 4FE8A 5CMBA 2DE2A 3T9UA 1YCJA 2IEEA 2RC7A 4EQ7A 4OERA 1NNFA 4RNSA 4QF9A 1LBBA 1N04A 1LFGA 1NMUA 2W7YA 1VSOA 2ONRA 2UVHA 1OQHA 1WVJA 4F2QA 4IO3A 4U2RA 3USDA 2RC8A 3TMGA 2I6EA 1SBPA 5L9OA 3QYTA 3RGYA 2H25A 1B5IA 2KLFA 5EYFA 4FJPA 4RYAA 4ND9A 3C4MA 1MY0A 3D4GA 1J1NA 3TTRA 5DEXA 1EH3A 3S2VA 4F19A 1OMPA 1SDXA 1MH3A 5I2NB 1M5BA 3PUVE 5KCJA 3FXUA 3DP6A 2Z8FA 1T0KA 4JWOA 2QS2A 2DYXA 3PPRA 1MY3A 3H3GA 1Y3NA 3OO6A 4GVOA 5EHSA 3SEYA 3RY3A 1SQYA 4KD5A 1P1UA 3LSLA 3C35A 3OEMA 3TKDA 5B7DA 1HSJA 3WAEA 3PPOA 1P1NA 1BIYA 4DXBA 1LAXA 1QW0A 3PD9A 5AA3A 4NTLA 3ONMA 3O9PA 3RT8A 4NF5A 3VDFA 3OMBA 3H6UA 1EZ9A 1SW2A 1P99A 1LBCA 2Z22A 3HPIA 1MXWA 2Y7WA 4OVJA 4F1UA 5JEIA 5ISUA 5DEXB 4F22A 1FQCA 3U92A 1RYOA 3K4UA 5CMKA 4H0WA 5KCJB 1M5DA 4G77A 3FIRA 2A5SA 3C36A 4YKPA 3CVGA 4YMAA 1OVTA 1CB6A 2VD3A 5H8FA 3BKIB 4DCXA 4RK9A 1M5FA 3U1OA 1AIVA 4LZ5A 2E0SA 4OENA 1OQGA 1YPNA 3KFMA 2REGA 1DTGA 1B7UA 3H03A 3EHUA 4GWOA 4YB7A 1B1XA 3TDJA 1B58A 3KGCA 2OZZA 4NF5B 5BUUA 2IA4A 2F5XA 3KN8A 1XC1A 4O3CA 4U4XA 1L5TA 4TLLB 1MPBA 1VR5A 3PUXE 4BDQA 3DP8A 4F2OA 1VFEA 3LSXA 2HZKA 4ZEFA 4MBPA 3C32A 2UVJA 4ISUA 3CG3A 4IO7A 3N5LA 2PMSA 5H8NA 4WXJA 1IIWA 1POY1 3BFTA 2F7AA 4JXIA 2OWSA 3PPQA 3PD8A 4K3FA 2I4BA 4MLVA 4IB2A 1NNTA 3IJXB 4GOTA 3OELA 1IEJA 4H6DA 3V89B 2DS9A 4H8JA 1MY1A 3DM0A 3OSRA 3FJMA 1HSEA 4XXUA 1A8EA 2F8DA 3O28A 1CE2A 4POWA 3G3KA 4YB5A 1KWHA 3TTMA 3F11A 3PUWE 4U1ZA 1XVYA 3ZSFA 1LCTA 5A5XA 1DPEA 3MAMA 2V3UA 1B51A 4KPTA 5KDTA 1B3EA 3Q26A 1XHYA 1LCFA 1PBQA 1Y4CA 1NFTA 5CRYA 1B7ZA 4XKNA 3SEXA 5H8HA 4YMBA 4IGRA 1EU8A 1QULA 1MQDA 2V3QA 4FEBA 3TTLA 2QRYA 3C31A 2PYYA 4QRZA 1IITA 4PETA 5DT6A 2OLBA 3H6TA 4H5GA 2Q89A 1B46A 2GH9A 2B3FA 1AMFA 1B3HA 2DP8A 3T93B 5LOMA 3KN7A 1NNKA 2PVUA 2Y7IA 3M3KA 3OXNA 1DSNA 2QS3A 2DSFA 1IZ1A 5AA2A 2XXHA 4KR5A 4PFYA 5ELVA 4BDMA 3KN3A 5AA2D 2HQ0A 5A5XB 3GBBA 1JW1A 5L9SA 3O6HA 1Y20A 5KDTB 1IUDA 1XVXA 1B32A 2OJTA 5AA4A 5H8HB 4ZEBA 1FTLA 2XXRA 3MZ9A 4WEPA 3V83A 4JWYA 3SERA 3I5OA 4GD5A 1HSLA 1NNPA 1O7TA 3RQTA 3VLWA 3TTKA 4R6YA 3RTFB 4HS7A 4RPOA 1LB8A 2O7IA 1S50A 1B3GA 1MQHA 4E0XA 2DVCA 4G68C 3ILUB 3IB1A 1MDQA 3EHTA 5DVJA 4POXA 1IXHA 1MM7A 2FYIA 3EHSA 1B2HA 3CRBA 1I6QA 1ATGA 4ZEKA 5IAIA 1QUIA 3CIJA 1UTBA 2Y7PA 5AA2B 4G2ZA 3T96B 2RINA 2RC9A 3FVNA 4NF8A 2UXAA 1ZLQA 4GF8A 3TCFA 2F35A 3THIA 5AA4B 4YICA 2P1SA 3VVEA 2I58A 1F9BA 4R73A 3G3JA 1ZIUA 1O64A 3OENA 2Q8JA 3RT6B 2AL4A 1URDA 4LONB 4NWDA 4G68A 1SW4A 4U22A 1P1QA 3FV2A 2PT2A 1TWYA 1B3LA 1NH7A 4OWDA 3TCHA 4ZZEA 4C1UA 2ABHA 4IY6A 3WAFA 4NF4A 3MUQA 3W15C 5FHMA 3DELB 3TPAA 2Q2CA 3C34A 1MG1A 1TT1A 1R9QA 2F97A 2THIA 4YB6A 1B4ZA 3PUZE 4P11A 2YJPA 1SYHA 4ELPA 3QXMA 2I49A 4TOZA 3MPLA 5ICQA 5L9MA 1H45A 4NF8B 2F36A 3LBSA 4FATA 1GVCA 4NMYA 1MXUA 5CMMA 5KZTA 4PFTA 1SD3A 4AQ4A 2R6GE 3FATA 2FA7A 3M3FA 4RJZA 1Y3QA 3T9HB 1SW5A 5TPAB 4OYVA 1DPPA 4G68B 2ZNTA 3PMVA 4BDNA 3N6UA 3KG2A 4KCCA 1UQWA 4FAJA 4RXLA 4IO5A 1B9JA 4NF4B 1MH4A 3O6IA 2HEUA 1FTJA 3QK6A 1MDP1 5M2VA 3IOUA 1N84A 1QJMA 3TQLA 1ZU0A 4MH5A 3FJGA 1QUJA 1B0HA 3S9LC 2ZXTA 4KYEA 2I0BA 3OOAA 2XX9A 3Q27A 5F1QA 2HCAA 3RNNA 2PBWA 2PX1A 4NWCA 2G93A 2QJEA 5CBSA 4ZECA 3EF7A 4F1VA 2H99A 2CMOA 1SW1A 4I1DA 3B6QA 2AIXA 1MM6A 4M1VA 5L8DA 1QKAA 3MC2A 5CC2A 4QHQA 4FECA 1A55A 1A7LA 3W9WA 4QSEA 1TFDA 1H44A 3OEKA 4ONYA 4IY5A 3FVOA 1MXZA 1JVYA 4BLAA 1B6HA 1B4HA 3G3FA 3IOVA 4IO2A 1RYXA 4F3GA 5EHMA 4EQBA 2XX7A 3OSQA 4QFOA 3UIFA 3TCGA 3KJTA 4KYDA 4IO6A 5I84A 1O63A 5TP9B 1I6AA 2Z23A 3U94A 4XIGQ 5CMCA 3HV1A 1SI1A 3TELA 3N6TA 3QIMA 4UA8A 2CZLA 3SESA 2DOJA 4HCYA 4QFNA 4U23A 4Z0IA 3MVYA 1DMBA 1TXFA 4GQOA 3B7DA 1LAHE 4JSOA 5FHOA 5ITPA 2D21A 3K2DA 4F18A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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