1B0LA

Recombinant human diferric lactoferrin
Total Genus 221
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
221
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCTVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of recombinant human lactoferrin expressed in Aspergillus awamori.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Metal binding protein
molecule keywords PROTEIN (LACTOFERRIN)
total genus 221
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-11-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1b0lA03
3VLUA 4XKNA 2HAUA 1SW4A 2XXXA 3TYHA 4F3SA 2ZNTA 3Q28A 4JWXA 1JEUA 1M5CA 5TP9B 3RUMA 1B5IA 1XT8A 2DVCA 3E4RA 1P1QA 4LATA 3LSLA 3TELA 2QRYA 3P7IA 4IY6A 5CRYA 4HW8A 5I2NB 2ONKE 3GZGA 2DE3A 1SW2A 3IJXB 2THIA 2P2AA 3VVDA 3OO7A 3SEUA 5KCJB 4G68B 1H45A 4X1BA 3TUSA 4OXVA 1FW0A 5JTYA 1HSLA 1NNKA 2VGQA 3IO6A 1QUJA 4ZEBA 1MS7A 4AB6A 3UN6A 1ZU0A 4LQ5A 3BFTA 1SBPA 1LGBC 1B3HA 4HTGA 1UTBB 2QS3A 3H7MA 3MAMA 3MZ1A 2OZZA 3N26A 3PMVA 4F22A 4IGTA 1B3LA 1NH8A 2OCUA 4PETA 4BDNA 1T0KA 3TCGA 5A5XB 2F7CA 2D5WA 2NXOA 2OJTA 3K4UA 2UVHA 2XXPA 3RLFE 3OEKA 4R74A 3T96B 2UYEA 3RN8A 4P0IA 2Z8FA 1EZPA 2DVZA 1URSA 3UP9A 5JTYB 3H03A 3V8XB 2O68A 3MVXA 4QRZA 4X1DA 4F18A 1B9JA 1LBCA 3R26A 3TPAA 3K1NA 3LUYA 4F1YA 3B6TA 4ZE8A 3U8QA 4OZ9A 3K1MA 3EPEA 4KCCA 1B4ZA 3CR9A 3FZVA 3HHGA 1JVXA 2HZKA 2O7IA 5H8HB 5A5XA 4F31B 5I2NA 4JDFA 3Q27A 3AXFA 3SEXA 3VLWA 4ZEDA 2B3BA 2ESNA 3M3FA 3LBSA 4N07A 3TTNA 3KG2A 5I59B 5CMCA 2F6GA 3E9XA 3PMWA 3I3VA 1DSNA 2WKYA 2AL5A 5DYHA 1KWHA 5AA4B 1I6QA 3Q25A 1POTA 1ZIUA 2DS9A 4G8HA 1O7TA 2Q2CA 1N3XA 4MBPA 3K2DA 1A55A 1JQFA 1M5BA 3RGYA 4ZEFA 4ELQA 4UACA 2GHBA 2PX1A 3PUXE 5CBRA 4EQ7A 5CBSA 4ZEKA 2V3UA 1LAFE 4IO5A 1TXFA 1MRPA 3QUJA 2DE2A 1QKBA 3PU5A 4U4SA 1Y3PA 5DVIA 4XXUA 4BDOA 1TWYA 1LAGE 3OXNA 4FE8A 3TCHA 1VFEA 2DSFA 3CRBA 3EHTA 1GR2A 4JWOA 1H44A 3C34A 1A54A 3K1PA 2XXUA 4R75A 3TCFA 4F19A 1PB9A 4DXUA 1NNFA 2ZYMA 4KPTA 4KQPA 2E0SA 3CVGA 2PBWA 2I49A 2I4BA 4GXAA 3MBPA 5AA4A 3IOUA 3DLNA 2O84X 3U1OA 3DP8A 4YMAA 3MVYA 1H43A 2ZXTA 4NEDA 3FGSA 1Z7NE 3IK6B 4WEDA 4KYSA 1B40A 4NMYA 3DM0A 3U94A 4R2BA 3EHSA 2RKMA 5L9SA 5AA2B 2Q88A 3ZKLA 1POY1 1B3EA 2Y7RA 3N5LA 2V93A 1RKMA 1WDNA 2O6AA 2REGA 2ALUA 3OSQA 4O3BA 3S9NC 3OSRA 1IQ7A 4ZEIA 3TTMA 4GD5A 3RPWA 1Y1ZA 3KEIA 2Y7PA 1R9LA 2H25A 4IO3A 5ITPA 1PBPA 1XVXA 4IO7A 3W9VA 1USYH 2A5SA 3K6XA 3MW0A 4PP0A 2HFBA 3FASA 3G3IA 4MLVA 3U92A 1UTBA 5I57A 4QHQA 4OERA 3CIJA 5LOMA 2Y84A 5FTHA 4MLQA 1XHYA 1MY3A 3K6WA 3UA8A 3T66A 2Y7IA 2Z8EA 1LLSA 4GXSB 3R7XA 3RT6B 1IITA 1IZ1A 1USYE 1FQAA 2UVIA 1B7ZA 3IJOB 3GLBA 4H1XA 2CZLA 2PT1A 3ZS6A 4H0WA 4PFWA 3GXAA 2YLNA 3TTRA 3PUZE 3CFLA 3HPIA 3WAEA 4F2OA 2ABHA 3CI8A 4GL0A 5EYFA 2F6PA 3CG1A 3ECRA 3HV1A 4G8NA 4THIA 2M8CA 2D3IA 3VLVA 5ICQA 1IEJA 2Y7KA 4HS7A 4U1ZA 2H9BA 3D4GA 2F35A 2RCAA 1TFDA 3O29A 3E3KA 1TT1A 2RF1A 1MH4A 2F5XA 1L5TA 3PPOA 3H6WA 5H8HA 4NE4A 5HM4B 2DXRA 4EF1A 3K00A 1HSJA 4DZ1A 5CMKA 2E1SA 2X7QA 3OOAA 3LSFB 5CI5A 1OQGA 1B3FA 3TDJA 2H4IA 3RNNA 2RINA 4R2FA 1EZOA 1LFGA 3T93B 5I56A 2XXHA 2I4CA 5FHMA 3UIFA 1LAXA 1MQHA 3PPQA 3OO6A 4TOZA 4F3PA 5KDTA 1FQDA 4F1VA 3K01A 3K6UA 3FJMA 4KFQA 1LBBA 4ELPA 4ESWA 1R6ZA 2X26A 4QSCA 4QFPA 2Q2AA 2HXWA 1B5HA 1NNPA 3S2VA 3FXQA 3TFLA 1Y1MA 4H6DA 2V3QA 1FCKA 2V25A 4OEVA 3U72A 4DXBA 4YB6A 3LSXA 4FECA 1F9BA 5FHOA 5CC2A 4RA1A 1VFDA 4H65A 1QUIA 5K2YA 1QULA 2IEEA 2F78A 1LCTA 5I2KB 5H8FA 1OVBA 5DVFA 1B05A 1B7UA 1N0TA 1MXUA 3BKIB 1BIYA 5AA2A 1MG1A 2F34A 1NKXA 1ZKBA 3N6UA 1URGA 2O69A 5IAIA 1GGGA 5I2KA 3T9HB 4NF4B 3TEPA 5DTBA 2QSXA 2VHAA 2DOJA 5EHMA 2UXAA 3PV0E 1SW5A 3CFXA 1JVYA 2OLBA 3K6VA 4R6HA 2OWSA 1QUKA 2VD2A 2I3WA 1MQDA 3FATA 3O9PA 1FTJA 4I62A 4WEPA 1PEBA 2I6EA 4Q30B 2I0CA 3C32A 4DLDA 4JWYA 1ZTYA 2O1MA 1IXHA 2O7UA 2XD2A 4YB7A 4Z0IA 5KCJA 4Q5TA 3SEYA 5H8QB 1PB8A 1MY1A 3QK6A 4F39A 4Z7EA 5FHNA 3T9UA 3A3CA 1WODA 4G8MA 4NF6B 3V89B 3BFUA 3HN0A 4GF8A 4LQ2A 4YB5A 2ZNUA 4RY1A 3KZGA 1ZMGA 1MPCA 4PQJA 4FJPA 4GVOA 4ECFA 1B32A 2XXWA 4H5FA 3KN7A 3VV5A 4QSEA 3VDFA 2DYXA 5B70A 2DQVA 2D21A 3OD7A 5H8NA 4ELRA 1SI1A 3HHFA 2H5YA 1ATGA 1MXVA 3CSGA 2NWJA 1IXCA 3QYTA 4G77A 1B1XA 3M8UA 3USDA 4C1TA 2DWAA 3PPPA 1EH3A 1N7XA 3QXMA 1O64A 4R72A 4ZE9A 3KSXA 4GQOA 3VXCA 4N13A 3O6HA 3S9MC 3B6WA 1PDAA 4IY5A 2Q8JA 1TFAA 1Y3QA 3IB1A 2R71A 4FATA 1GV8A 4GIZA 4M1VA 3TKDA 1URDA 4H67A 4XTCQ 4OETA 2HCAA 1P1NA 3PUVE 1BLFA 5KZTA 1YTVA 1B0HA 2DXYA 1Y3NA 1MXWA 3L6GA 1MH3A 4P0GA 4O3AA 3I5OA 4AQ4A 3IOTA 2A5TA 3BBRA 4TLLB 4IGRA 4YICA 5ISUA 1B58A 2GFEA 2XX7A 3EF7A 3MUQA 4JSDA 4QFLA 1MY0A 3IOVA 5FTIA 3T9VA 4O3CA 4EXKA 5JEIA 5TPAB 1IIWA 4NF5B 2HAVA 3UGWA 3IAZA 3DP4A 1DMBA 1VSOA 4HCWA 1ZJLA 3B6QA 1AH5A 2PMSA 3EN3A 5I59A 4IB2A 1B3GA 2HZLA 4U21A 2XD3A 2YJPA 1N04A 4M4GA 2LAOA 4ZDMA 1A8FA 1A8EA 3VVFA 4ZECA 3SKPA 4BDRA 3FUZA 3MC2A 2ONSA 4Q0CA 3RTFB 4GFRA 4OENA 5DT6A 1N7WA 3TQLA 4TLMB 2DWJA 3ZSFA 1SQYA 1FQFA 4IO4A 1N3WA 2RC9A 3EHUA 3H06B 3N6TA 2HEUA 2QS4A 3OELA 4LZ8A 4C0RA 2O1LA 4DIGA 4MH5A 2PYYA 1D9YA 2RC7A 4X9TA 4ESXA 2QPQA 2B65A 3THIA 5I84A 4GWOA 4UA8A 3KN8A 4Q8RA 3IB0A 2VD3A 3IOWA 1Y20A 4R6KA 4PFUA 4IO2A 2XXRA 4KI0E 3PD8A 4KHZE 2FNCA 2PT2A 3FXUA 4R9GA 1MM6A 4FIMA 1OVTA 2PVUA 1MXXA 2F7AA 2AIXA 2QS1A 2VP1A 3M3LA 2B3FA 4NF4A 5DEXA 4XIGQ 1B2HA 1MQJA 1MY2A 2F36A 3DP6A 1BKAA 4QFKA 3KBRA 1EU8A 2AL4A 1AMFA 2ZNSA 3H3GA 4NF6A 4R73A 2ONRA 4OVJA 1AIVA 3PUWE 3KOSA 4POXA 1B51A 4EF2A 4FEBA 1LCFA 2NUVA 4BLAA 1B6HA 4YKJA 3TMGA 1YCJA 1MXYA 1M5EA 4OHNA 1N84A 1PB7A 2NOOA 5H8FB 1MPBA 4IO6A 1H76A 1I69A 3K02A 3EQ1A 3H6UA 3G3FA 1LAHE 5L8DA 1MQIA 1YAEA 3C31A 3MP1A 1UTHA 4YKIA 3FVOA 4YZZA 4I9DA 2XX9A 4QSDA 4KR5A 3V5AA 4EXLA 1B52A 2G29A 4YKPA 3TODA 4FAJA 1B1HA 1DPEA 3GBAA 2DWIA 4JBZA 4N6PA 1UTHB 3RTWB 3TZAA 1D9VA 5M2VA 3PD9A 2XXIA 3FVKA 4JB7A 3V83A 1OLAA 2AYSA 2RC8A 4X48A 3KFMA 1ZBMA 5AA1A 3RY3A 1CB6A 1YPNA 5BWJA 3JZJA 4G2ZA 2F8DA 1AOVA 4NWCA 4LZ7A 2GH9A 4E0WA 2UVGA 3KJTA 1UQWA 2P1SA 2XXQA 3SEVA 1OQHA 3QSLA 3O28A 1LSTA 1I6AA 4H8JA 4OQOA 4R9FA 1M5DA 1QVSA 5HBCA 4JSOA 3I6VA 1O63A 3U93A 4LONB 3W9WA 1QKAA 1ANFA 3F11A 4U2RA 1FQCA 1DOTA 3GBBA 3IORA 3K0VA 1UIUA 2XX8A 3MPLA 3QAXA 4RK2A 4U4XA 5IKBA 2Z23A 3TQWA 2G93A 4PFTA 4QF9A 3OMBA 2R9JA 2V84A 1US5A 4GOTA 1I6BA 3O6IA 4ISUA 4NF8B 4EDPA 5I56B 2F97A 2R6GE 3IR1A 5KDTB 1US4A 4YMBA 3HCQA 2I48A 3C36A 4GLIA 4NF8A 2DP8A 2QMXA 2QS2A 1D3KA 1P1WA 3FVGA 3ILTB 1XVYA 4U22A 3RQTA 5ICTA 4ZS9A 3OEMA 4QFOA 4TQUQ 2HQ0A 1FTMA 4LA9A 3FV1A 3KGCA 4EQBA 2NVUB 2OWTA 4KYDA 1CE2A 3ODBA 4YU0A 3UORA 2I58A 5B7DA 3KJ7A 4ND9A 3SDFA 4KD5A 4XKQA 1JETA 1R1NA 3IX1A 1EZ9A 3PPRA 1JEVA 1SW1A 4GL8A 2H98A 1MPDA 3LC8A 1A40A 4F1UA 5AA3A 5CMMA 1FTOA 4RPOA 1RYXA 2O51A 1Q35A 1NL5A 2UVJA 2Q9TA 2X7PA 2ZYOA 1DPPA 1FQBA 3ILUB 3G3JA 3E13X 1MXZA 2OK2A 3MJNA 3MP8A 3R6UA 1B5JA 1B0LA 2Q89A 2ZMBA 4ZZAA 3FV2A 3CSBA 1R9QA 4DXCA 1MDP1 2H99A 2RCBA 3MP6A 5F1QA 1RYOA 1Y9UA 2KLFA 1ZLQA 3M3KA 1LFHA 2Z8DA 2ZYKA 3D4CA 1MY4A 3FIRA 4OFLA 3S9LC 2ANJA 1FTKA 2REJA 2I3VA 1OMPA 1A7LA 3H4ZA 3OO9A 3G3GA 4G68A 4YAHX 3W15C 3KOTA 3C33A 3PPNA 3JV9A 1JW4A 1OLCA 1OIBA 2VOZA 1HSEA 1LB9A 2ZYNA 3MVZA 2F7BA 5F7VA 4LVQA 5H8SA 3VXBA 3TAJA 4H8IA 4DE8A 3B7DA 3MZ9A 1NNTA 3PGFA 4RK9A 1FQEA 1XS5A 4EUOA 4RJZA 5CM6A 2QMWA 5DEXB 3OO8A 4FEDA 4BDMA 2XXVA 3KSJA 1FTLA 4F3GA 1JW1A 5HPQA 5TP9A 4KYEA 1NFTA 4OFJA 5K2XA 1VR5A 3IL1B 3OENA 4F29A 1VE4A 4KCDA 4WXJA 2GHAA 4RYAA 1LFIA 3O66A 4PE5B 1AL3A 2QL3A 1P1UA 2IA4A 3G7WA 3PMXA 4POWA 3C9HA 3UK4A 4QFNA 4NTLA 3MQ9A 3CG3A 5I58B 5EHSA 3G3KA 5BUUA 4U23A 4WKMA 3H6VA 1Z7ME 3A09A 3SERA 3MWBA 3MPKA 1SI0A 5AA2D 1IXGA 1MDQA 1DTGA 5I58A 1JNFA 2FYIA 5DVJA 1JW5A 2P0SA 3IB2A 1Q1KA 3A3UA 5ELVA 5ITOA 3SESA 4G68C 4BDLA 3MZBA 1II5A 5L9OA 5AE4A 1ELJA 1QW0A 4F2QA 2DWHA 4R6YA 3DELB 4NF5A 3Q26A 1NH7A 2YPNA 4L17A 4MF3A 3G3HA 3FVNA 5TPAA 4DCXA 1LB8A 4E0XA 4ELOA 4LP2B 1QJMA 2Y7WA 1XC1A 2CMOA 1SYHA 3HO7A 3VE1B 4FORA 1NMUA 1XOCA 4K3FA 4JXIA 2DE4A 3VFJA 5TU0A 1GTKA 4DCYA 4F3BA 1P1OA 2GRVA 2XHDA 3Q29A 4LZ5A 3TTKA 3QIMA 2XXYA 3S4UA 1N76A 5J1DA 1S50A 2I0BA 5CMBA 3SEWA 4OYVA 1Y4CA 1UIVA 4PFYA 1J1NA 3JYRA 1B7HA 1SD3A 1PBQA 3KN3A 4AB5A 5JK4A 3C35A 3CFZA 3SETA 1DTZA 1B4HA 2XXTA 2OBGA 1H3DA 4OESA 3T9XB 4ONYA 3MVWA 3RT8A 4OFOA 4XKRA 1PC3A 4OMBA 3FJ7A 1SVXB 1BP5A 2W7YA 5H8NB 1D4NA 3IO4A 4OEUA 3LSWA 3PUYE 1IXIA 4HCYA 5L9MA 2FA7A 3T22A 3FJGA 4RNSA 1A99A 2A5TB 2V3TA 3ONMA 4OTEA 1GVCA 1MQGA 1IUDA 4DDDA 4OWDA 3N94A 3O97A 4I8CA 1BTJA 4U1OA 4XKPA 3L6HA 3C4MA 3VVEA 5H8QA 4G4PA 3FD3A 4C1UA 3TTLA 4H5GA 3O2AA 4NWDA 2QJEA 3LR1A 3HSTA 4LUBA 1S9TA 1SDXA 4ZZEA 4EQ9A 1B46A 4RXLA 3S9EA 2UYFA 2Z22A 3O6GA 3H6TA 4I1DA 1SYIA 4P11A 3QUFA 4GRKA 4RPNA 1P99A 1MM7A 4BDQA 4YKKA 1M5FA 3FXRA 1S7YA 4MFIA 5I57B 2BJJX 1Y4TA 3WAFA 1WVJA 3ZKKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OANA 3TYHA 4F3SA 1JEUA 1M5CA 3RUMA 1B5IA 1FBCA 4LATA 5CRYA 4HW8A 5I2NB 4HE1A 1SW2A 2P2AA 5KCJB 1H45A 4X1BA 1HSLA 2VGQA 3IO6A 4F22A 1NV1A 1B3LA 1T0KA 4PETA 2NXOA 2XXPA 2UYEA 1LBYA 2Z8FA 4G61A 2XA5A 3R26A 1NV4A 3LUYA 3U8QA 3CR9A 1JVXA 2HZKA 5H8HB 3SEXA 2ESNA 3LBSA 4N07A 1FPIA 5I59B 2F6GA 3I3VA 1I6QA 4MBPA 3K2DA 4ZEFA 5EYGA 4IO5A 3OXNA 4GWSA 1GR2A 1H44A 1PB9A 4P47A 1DBZA 2I4BA 3IOUA 4YMAA 1H43A 1Z7NE 4KYSA 4NMYA 3U94A 4R2BA 4QXDA 3QMFA 5AA2B 2Y7RA 1RKMA 1WDNA 3OSQA 4GD5A 4PGPA 4IO7A 2HFBA 3FASA 4X8RA 1UTBA 4QHQA 4OERA 3CIJA 2Z8EA 1USYE 1FQAA 2UVIA 3IJOB 5IZ3A 4PFWA 3E78A 3HPIA 3WAEA 3CI8A 2F6PA 3CG1A 4O8MA 3D4GA 2RCAA 1TFDA 3O29A 5LOMA 4EF1A 4GX6A 2E1SA 3FBPA 2H4IA 3RNNA 2RINA 2I4CA 1MQHA 3PPQA 5KDTA 4AS5A 4NF0A 1K9ZA 2Q2AA 3FXQA 3TFLA 1Y1MA 2V3QA 3LSXA 1F9BA 4RA1A 1B05A 1B7UA 1N0TA 1BIYA 3N6UA 2O69A 4N6DA 5DTBA 5EHMA 1SW5A 3O9PA 4I62A 4DLDA 4MHFA 2O7UA 1IXHA 4YB7A 5KCJA 4Q5TA 5H8QB 1FPLA 1MY1A 1WODA 1FJ9A 3BFUA 2ZNUA 4ECFA 4GVOA 2XXWA 3VDFA 3OD7A 2VT5A 3HHFA 1B1XA 3VXCA 2MKZA 1PDAA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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