1B6IA

T4 lysozyme mutant with cys 54 replaced by thr, cys 97 replaced by ala, thr 21 replaced by cys and lys 124 replaced by cys (c54t,c97a,t21c,k124c)
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDCEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQCRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Solid-state synthesis and mechanical unfolding of polymers of T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-01-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1b6iA00
1L89A 1L93A 2B6YA 3GUPA 233LA 205LA 1L47A 3DMXA 1L25A 1L86A 4ARMB 3PDSA 4LZMA 1C6IA 1L88A 1WTHA 1SSYA 143LA 229LA 236LA 1QUGA 3C81A 113LA 3CDQA 3F9LA 1G0KA 1LGWA 4DAJA 3C8RA 184LA 1C6HA 3HUQA 1L79A 3NY8A 2ANVA 1CU0A 1L56A 1CV1A 4PK0A 1L21A 1P2LA 3K2RA 4EPFA 1KW5A 255LA 4W58A 1P64A 1LGXA 199LA 177LA 108LA 245LA 3HTDA 3JR6A 234LA 210LA 1C6JA 1G0LA 3HH6A 4LDEA 1L24A 254LA 4ARLA 1L30A 1L03A 1L38A 2RB2X 256LA 3D4SA 1D3FA 258LA 6LZMA 1L70A 1L39A 111LA 3HT9A 118LA 1DYGA 1L91A 1LLHA 1C64A 1G0QA 1QUOA 1QSQA 195LA 1CUPA 1CX6A 257LA 1L41A 1L26A 1DYDA 1P3NA 214LA 1CV6A 3C82A 235LA 3SB7A 1CU5A 173LA 158LA 176LA 155LA 3GUNA 1L68A 231LA 3VW7A 1DYFA 1LYIA 2L78A 3G3VA 1C6NA 241LA 1L58A 3HH5A 221LA 3DNAA 1L37A 1L76A 3CDVA 1P2RA 211LA 1PQMA 115LA 1LYEA 3HDEA 1L45A 1C6BA 1L60A 3SBBC 3L64A 1QT7A 112LA 1CV5A 1L72A 1L01A 1CU2A 5I14A 3NYAA 3G3XA 186LA 1L10A 1T97A 223LA 183LA 123LA 2HULA 122LA 3HWLA 1L52A 130LA 1QT5A 224LA 1LWGA 159LA 216LA 1JTMA 197LA 260LA 4OO9A 1D9WA 2LCBA 2B75A 189LA 110LA 138LA 1LYFA 150LA 4DKLA 2B6WA 2RBOA 1L50A 1G1WA 191LA 3EMLA 2B74A 120LA 1CVKA 1JQUA 3PBLA 1L83A 162LA 1CV0A 7LZMA 174LA 3DN4A 206LA 1L65A 4ARQB 1PQJA 178LA 2LZMA 217LA 4EKQA 1KY0A 4W57A 161LA 164LA 1C6LA 1PQDA 240LA 1CV3A 4DJHA 246LA 1L28A 107LA 1L95A 148LE 1LWKA 1L62A 1QUDA 1C67A 1QTCA 253LA 1P36A 1L84A 1L00A 145LA 2Z6BA 3HUAA 2F47A 2ANXA 1LI3A 2OTYX 3HH4A 1C6DA 1QTBA 2B7XA 1B6IA 5LZMA 1L82A 1OV7A 213LA 2B73A 103LA 1QSBA 4I7NA 129LA 1QT8A 3DN3A 1P56A 127LA 250LA 3C83A 3SN6R 1G0JA 182LA 4ARJA 3V2YA 1L32A 2B6ZA 4EKPA 1L22A 3DN6A 1C6FA 1L35A 2NTGA 144LA 149LA 1LGUA 4AQNA 1DYEA 1L81A 1P6YA 1T6HA 3DKEX 228LA 3HU9A 4ZPUA 2OTZX 180LA 1L87A 219LA 3SB9A 1LYJA 2HUMA 4YXCA 1LPYA 1L05A 3CDTA 239LA 4PJZA 1G1VA 3C7ZA 1L02A 1JTNA 220LA 237LA 2A4TA 262LA 1DYCA 1QT3A 2OEAX 4W54A 4EKRA 1EPYA 1DYAA 126LA 242LA 1OV5A 4W51A 1C6GA 1C68A 1OWYA 2RH1A 3FADA 1L49A 4I7SA 1L19A 215LA 3ODUA 1G07A 1L29A 3SB5A 1QTDA 201LA 249LA 2RBSA 1LYDA 3SB8A 1D3MA 1L51A 261LA 147LA 1L11A 4W53A 3C7WA 4ARMA 1L27A 1L99A 1P7SA 3G3WA 1KW7A 2RBRA 4I7PA 1L43A 168LA 4LDOA 192LA 4EPIA 1C66A 1L13A 1L73A 2IGCA 1L04A 1D3NA 1T8AA 1KS3A 152LA 1T8GA 1DYBA 3C7YA 139LA 1XJTA 1L34A 146LA 4I7RA 141LA 218LA 226LA 1L71A 3QAKA 1D2YA 1L57A 244LA 4S0WA 1D2WA 1CU3A 3C8QA 175LA 163LA 1L98A 142LA 1L0JA 1PQOA 1L12A 2OU9A 1L90A 3RZEA 1L63A 222LA 1L74A 1L15A 114LA 187LA 172LA 2RB0X 230LA 1OWZA 171LA 3OE8A 196LA 1L66A 3HTBA 1G0PA 1L59A 3HTGA 1D3JA 3SBAA 2Q9DA 1PQKA 1L33A 137LA 181LA 1L80A 4E97A 3OE6A 3OE9A 1L67A 3HU8A 3GUKA 2B6TA 3HT6A 4YXAC 3DN1A 3DN0A 131LA 1C6KA 198LA 1I6SA 3SB6A 1L77A 167LA 2RB1X 2OE7X 2QB0B 2O4WA 1C60A 4IAPA 1XJUA 4W59A 1L0KA 1L46A 109LA 252LA 2OE9X 3UONA 4ARPA 4EXMA 1QT4A 1C6AA 102LA 1G0GA 1L75A 1L07A 1LYHA 1L61A 4GRVA 3OE0A 1L96A 1C69A 1ZYTA 3HT8A 2F32A 2QARC 227LA 4GBRB 185LA 3DN8A 1L48A 4YX7C 1L08A 1TLAA 3CDRA 3DN2A 1C61A 251LA 1C6TA 3HUKA 4I7TA 1CU6A 4W56A 1L20A 3F8VA 104LA 1C62A 1L97A 1C63A 3FI5A 1L14A 1L54A 190LA 170LA 1L36A 1P5CA 3V2WA 1L18A 157LA 1G0MA 1P37A 1SWZA 2Q9EA 1L44A 1K28A 2B70A 2RBQA 1L92A 212LA 1L69A 4ARQA 3HDFA 3GULA 3C8SA 1ZWNA 3C80A 156LA 1CX7A 3GUOA 4I7QA 2F2QA 119LA 1C6CA 151LA 4W55A 1CTWA 1CUQA 1ZURA 1P46A 3DMVA 4I7KA 209LA 248LA 1L64A 1L85A 1L42A 1QTVA 1SX2A 169LA 3GUIA 2RBNA 166LA 1OVKA 1SX7A 2O79A 4I7OA 1LI2A 140LA 1KY1A 232LA 200LA 1L06A 1PQIA 259LA 3LZMA 4K5YA 2B6XA 4I7JA 1LI6A 1XEPA 1T8FA 4LDLA 247LA 3GUJA 1L31A 1LW9A 3GUMA 1OVJA 3HH3A 1L16A 3HT7A 160LA 1L55A 3L2XA 1C6MA 2O7AA 1QTZA 3NY9A 1L09A 1L40A 1OVHA 1LYGA 1NHBA 1QUHA 1L94A 238LA 1SWYA 1C6PA 1G06A 2RAYX 188LA 243LA 2LC9A 2OU0X 2OU8A 3DMZA 2B72A 3RUNA 1C65A 1OYUA 1C6QA 165LA 2OE4X 3HTFA 1C6EA 2HUKA 3CDOA 1L23A 2CUUA 128LA 1QS9A 1KNIA 1SSWA 4I7LA 225LA 1L17A 125LA 1QT6A 2RBPA 1L53A 4EKSA 1QTHA 3FA0A 1QS5A 2RAZX 1CV4A 4EJ4A 4I7MA 2NTHA 4W52A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2BQDA 1L89A 4GN3A 3ZVQB 2Z39A 2XJWA 2Q0MX 1J1XY 1C6IA 1D0MA 1REYA 1JTPL 4LGKA 4H8ZA 1INUA 3C81A 1TEWA 113LA 1G0KA 2MECA 3NY8A 1CU0A 4NSJA 4PK0A 1L21A 1OUGA 1LPIA 1KW5A 255LA 4W58A 1LGXA 108LA 245LA 3JR6A 1LYOA 4NGYA 4PPOA 4NEBA 1LSMA 1IORA 4Z46A 1VDTA 4DC4A 1L30A 1L38A 1JKCA 258LA 3WPJA 6LZMA 1L39A 1LJKA 1GB8A 1G0QA 1IWWA 5LVKA 1F0WA 3M18B 1LCNA 1L41A 1L26A 257LA 4WM1A 1P3NA 1KXWA 214LA 235LA 1HSWA 1GE4A 4H8YA 1IOQA 231LA 2DKVA 4H94A 1DYFA 5HNCA 5L9JA 2BLXA 3G3VA 1C6NA 2BQKA 1UIGA 4RDSA 3HH5A 221LA 1L37A 1WQMA 1CKHA 115LA 3HDEA 4WL7A 1C6BA 2Z18A 1LZTA 3L64A 5ILFA 1QT7A 4LFPA 3QE8A 2YSSC 1VDQA 1L10A 4CHXA 4W96A 3AZ7A 4XENA 122LA 1YKZX 2ZQ3A 1QT5A 4RW2A 224LA 1LWGA 159LA 2FYCA 2I26L 4OO9A 5A3EA 189LA 1TCYA 1CJ8A 1WQRA 150LA 2B6WA 2RBOA 3CT1A 1NDMC 3PBLA 3CT0A 1QUTA 4NGJA 3W6EA 206LA 1EQ4A 4RLNA 1LMTA 1C6LA 3AGGG 1DXJA 5LYZA 107LA 3FI7A 1Z55A 3RNXA 1LTMA 1L62A 4D9ZA 1L84A 1LSZA 1XGUC 4NG1A 5LVHA 2Z6BA 3HUAA 3WH1A 2F47A 1LI3A 1FLQA 3G3BB 3LYMA 3BKHA 1L82A 1FKVA 4XJDA 4QGZA 103LA 4B1AA 4R6CA 5L3HA 3SN6R 1GXV2 5KXYA 4ARJA 3DN6A 1UIAA 1JSFA 149LA 1LGUA 1NDGC 4CGEA 4XJIA 1LSBA 4XN6A 1A2YC 180LA 2BLYA 2EKSC 3AB6A 2BQFA 4PJZA 1L02A 220LA 4N0JA 2OEAX 4H9EA 4W54A 1EPYA 1DYAA 1LJEA 4NGKA 3B72A 3FADA 4OWEA 4DQJA 4I7SA 1UICA 4HV2A 215LA 2ZQ4A 2ZYCA 1NF5A 1IWXA 249LA 4ETDA 3SB8A 1D3MA 5F81A 4LT2A 5C6IA 1D0KA 4W53A 1J1PY 1IP7A 1L99A 1P7SA 1KW7A 168LA 5IELA 3AW7A 1JJ1A 1L04A 1D3NA 3RZ4A 5FDJA 2H5ZA 5M1YA 4Z98A 1JTOL 1EQEA 4ZFPA 193LA 141LA 1L71A 5KXKA 1GE0A 1MELL 1GFUA 5I4XA 4S0WA 1B7MA 4WM5A 1D2WA 2CDSA 3A90A 1HMLA 1L0JA 1QUSA 1PQOA 3W3EA 2OU9A 4L41A 1L15A 1HMKA 172LA 230LA 5JENB 1OWZA 2DQEY 3EXDA 3OE8A 1IP3A 1IC7Y 1V7SA 2G4PA 1L59A 1D3JA 3A96A 4E97A 1MLCE 1B7LA 2MEFA 2BQGA 4WLDA 4BS7A 1IVMA 167LA 1UIEA 2OE7X 5APEA 1JITA 4LT3A 2G4QA 1TAYA 1LJNA 4DYGA 4IAPA 4WL6A 4UWUA 1DPXA 2LHMA 1GBYA 3N9EA 1QT4A 102LA 5APCA 1L61A 3LN2A 1LHJA 3OE0A 1L96A 1D9UA 2B5ZA 2ZILA 2QARC 3DN8A 2MEBA 1LZSA 4WO6A 4LT1A 4H92A 4GLAA 1L08A 1TLAA 3DN2A 3HUKA 1WQOA 3CB7A 4BAPA 3OK0A 4ETEA 6LYTA 1IOTA 1IP2A 1GWDA 190LA 1GPQC 1L36A 2MEEA 1G0MA 1L44A 4NHTA 212LA 1L69A 3HDFA 1GAYA 3C8SA 2XQOA 156LA 4W55A 1CTWA 1IC4Y 2DQAA 1GF9A 1L64A 2VB1A 4WM4A 2LZTA 1QQYA 169LA 5FCPA 4WM3A 2RBNA 1IOCA 2O79A 3TXFA 4YF2A 2BPUA 232LA 1IIZA 1ZV5L 200LA 1YQVY 2Z37A 4K5YA 1XEPA 4LDLA 4RLMA 1LW9A 2FYDA 3HH3A 3HT7A 1C10A 1L55A 5ILCA 3L2XA 1C6MA 1NHBA 4ET8A 1LJ3A 134LA 1G06A 188LA 3W6AA 243LA 1HF4A 2LC9A 4DDCA 2X0AA 1YROA 3TMVA 1SQ2L 3RUNA 1GB7A 1C65A 1LZNA 5KXMA 4CFOA 2EIZC 2YBJA 1L23A 3LYOA 3GXKA 4B4IA 5C6LA 1KNIA 1SSWA 3W6DA 1LZAA 1UC0A 4HP0A 1IR8A 1LZ9A 1L53A 5J7CA 1IO5A 5KXWA 2W1LA 4I7MA 4M4OA 4G4HA 2NTHA 4H9HA 1ZVHL 1HEWA 1L93A 2B6YA 4HJZA 3GUPA 233LA 1IWZA 1L25A 1L86A 132LA 3A34A 3LYTA 4OOOA 1DZBX 1WTHA 1SSYA 143LA 1B5UA 1QUGA 1JUGA 3C8RA 2ANVA 135LA 4ETCA 2HECA 3K2RA 4EPFA 3WUNA 2W1YA 4NGLA 3HTDA 177LA 4HJVA 2CGIA 1C6JA 3K3TA 5FHWA 2RSCA 1L24A 254LA 2RB2X 1AT5A 3D4SA 1D3FA 1JWRA 111LA 1EL1A 3HT9A 1BB4A 1DYGA 1LZ5A 4NG8A 4C5FA 1OUBA 1GHLA 1QUOA 1QSQA 1T3PA 1CUPA 1DYDA 3IJVA 3SB7A 4EOFA 4X3BA 1CU5A 158LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2BQD A;  1L89 A;  4GN3 A;  3ZVQ B;  2Z39 A;  2XJW A;  2Q0M X;  1J1X Y;  1C6I A;  1D0M A;  1REY A;  1JTP L;  4LGK A;  4H8Z A;  1INU A;  3C81 A;  1TEW A;  113L A;  1G0K A;  2MEC A;  3NY8 A;  1CU0 A;  4NSJ A;  4PK0 A;  1L21 A;  1OUG A;  1LPI A;  1KW5 A;  255L A;  4W58 A;  1LGX A;  108L A;  245L A;  3JR6 A;  1LYO A;  4NGY A;  4PPO A;  4NEB A;  1LSM A;  1IOR A;  4Z46 A;  1VDT A;  4DC4 A;  1L30 A;  1L38 A;  1JKC A;  258L A;  3WPJ A;  6LZM A;  1L39 A;  1LJK A;  1GB8 A;  1G0Q A;  1IWW A;  5LVK A;  1F0W A;  3M18 B;  1LCN A;  1L41 A;  1L26 A;  257L A;  4WM1 A;  1P3N A;  1KXW A;  214L A;  235L A;  1HSW A;  1GE4 A;  4H8Y A;  1IOQ A;  231L A;  2DKV A;  4H94 A;  1DYF A;  5HNC A;  5L9J A;  2BLX A;  3G3V A;  1C6N A;  2BQK A;  1UIG A;  4RDS A;  3HH5 A;  221L A;  1L37 A;  1WQM A;  1CKH A;  115L A;  3HDE A;  4WL7 A;  1C6B A;  2Z18 A;  1LZT A;  3L64 A;  5ILF A;  1QT7 A;  4LFP A;  3QE8 A;  2YSS C;  1VDQ A;  1L10 A;  4CHX A;  4W96 A;  3AZ7 A;  4XEN A;  122L A;  1YKZ X;  2ZQ3 A;  1QT5 A;  4RW2 A;  224L A;  1LWG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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