1B7LA

Verification of spmp using mutant human lysozymes
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLLKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Experimental verification of the 'stability profile of mutant protein' (SPMP) data using mutant human lysozymes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 53
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1b7lA00
2W1MA 4N9RA 4PJ2C 1LJEA 1UCOA 4MR1A 1DPWA 1FLYA 1BB6A 1O23A 4OWEA 4DYGA 1LAAA 4FJRA 1GB0A 4WLXA 2F4AA 1JJ3A 1CKGA 4WL7A 3TMUA 3G3AB 3QE8A 1WTMA 2EIZC 2LYZA 4GLVA 4O34A 1FLUA 1WQMA 2IHLA 3WL2A 5J7CA 4KPMA 4N5RA 1LHJA 4Z41A 1LOZA 4PPOA 2BAAA 4GN3A 1V7TA 1IOTA 1LMCA 1J1XY 1LZEA 1BB7A 1GXXA 4XJGA 1H6MA 2AUBA 2C8PA 3WPJA 4BS7A 1LSPA 1UC0A 1XEKA 3CT1A 1VATA 1BQLY 1GFKA 1VDQA 1NKHA 2LYMA 1J1PY 2EPEA 3LYTA 4ZEEA 1ZMYL 4LYOA 3WXUA 1EQEA 1HMLA 4ETEA 5D5CA 1LHLA 3J6KA 1IWYA 5KXOA 4DDAA 3J4GA 4IATA 1UIEA 1T3PA 3A95A 4G4CA 4NG1A 1GB8A 4YENA 4H90A 3TMXA 3D3DA 1IC7Y 1NMMA 4KT3A 193LA 1LMTA 3A3RX 4NSHA 1B9OA 2HEBA 4NGKA 4OOOA 4B4EA 4WO9A 3W6DA 5HNLA 1B5WA 4ETDA 4MSTA 4ML7A 4N0JA 4NGWA 1B5XA 1YQVY 2MEBA 5KXWA 5KXPA 1UICA 1WQRA 4DD2A 1LJGA 2VB1A 1HF4A 1NBZC 4GN4A 1EL1A 1JIYA 4HTQA 1FLWA 4N1CC 2Z2FA 5IDDA 5LYZA 3TXIA 4H9CA 3W6BA 5KY1A 5L3IA 1C08C 1QTKA 1B7QA 3N9EA 1YKYX 4KL7A 1YILA 2DQHY 1XFPL 3CSZA 1QSAA 1BB5A 5KXMA 1CKHA 1GF3A 1KXXA 5IHGA 1IR8A 5HQ1A 1HFZA 1GE1A 1HENA 4XJIA 4LYZA 1GDXA 4H9EA 4HPIA 1LHIA 1RE2A 5KKJA 4LGKA 3B72A 3A6BY 1FLQA 5M1YA 1D0KA 1LYSA 5KXXA 2YDGA 3WUAA 5KXZA 5C6LA 3A96A 4WM3A 2BQCA 4NSGA 1VAUA 5HMVA 5KJ9A 2ZNWY 1LJ4A 1F6SA 3TXBA 3WPLA 4XJFA 2HTXA 1LTMA 1RJCB 3W6CA 1BB4A 3E3DA 4ETCA 4B1AA 1BHZA 1AZFA 3GXKA 1JKCA 1IOCA 4N1EI 3IWRA 1BB3A 1XGRC 3TXDA 1CJ7A 3WYHA 1QDTA 5JENB 3AZ6A 2D6BA 1LSFA 4GCBA 4NSJA 5I54A 4NHTA 1JJ1A 2EQLA 4PRUA 2ZQ4A 2YBLA 2YVBA 2BQIA 3WMKA 1V7SA 1HFYA 3A6CY 1AKIA 208LA 1NF5A 1GB9A 1LJJA 1LYOA 1UIHA 3WUMA 5HNCA 2H5ZA 3EXDA 1C7PA 5FSTA 3RU5A 4PHIA 1GPQC 2Z2EA 132LA 1GE4A 4HPEA 2YBHA 2N5ZA 1NDGC 3M3UA 154LA 1B7SA 1LJNA 3AZ5A 4NWHA 1CJ9A 4XJBA 1LSDA 1F10A 3P68A 3WU8A 1FBIX 1LHKA 8LYZA 1XGQC 1LKSA 2ZILA 3ATOA 1GXV2 1T6VL 2HEAA 1B0DA 3A34A 2W1YA 2LZ2A 3AGIA 3CB7A 2HECA 5ILFA 3P65A 3LYZA 2HEFA 4LT0A 3OK0A 1VDSA 1BGIA 194LA 1HELA 4NFVA 1GAZA 4LT2A 1REYA 1IP2A 6LYZA 4OWHA 3QY4A 3WU9A 3TXJA 1OUIA 4LFPA 1XSFA 4B4JA 2XTHA 3WUNA 4WOAA 2YBMA 1JISA 2HEEA 4J7VA 1LZCA 1F6RA 1B7PA 3FI7A 4WM4A 1LHHA 5F16A 2BQMA 1OUBA 1JKAA 3D9AC 3AZ7A 2DQAA 4B49A 4ZFPA 5I4WA 4LYMA 1A2YC 1LZYA 4G4BA 2A7FA 1JSEA 1B7NA 4YEOA 5I4XA 2Z38A 2ZYPA 3ZEKA 1BWHA 1WTNA 2MECA 4NIJA 3LZ2A 1B5UA 1LZ5A 3W6AA 1HSXA 134LA 1CJ6A 1VDPA 5B06A 4W94A 4XJDA 1OUCA 1RFPA 4H94A 4A7DA 1DKKA 4WLTA 1CKCA 1KIRC 4RW1A 1LKRA 1FDLY 1LJKA 1NWGA 2F2NA 4IASA 1LZ8A 1IWTA 1PZYA 1UIAA 4OOTA 1ALCA 1GF8A 3RT5X 1LZGA 4WLYA 4HV2A 4NGVA 3EMSA 1VFBC 4I0CA 3A67Y 4J1BA 3WW5A 2LHMA 1DKJA 1UA6Y 3G3BB 1NHEA 1GE0A 1RI8B 1YKXX 4LT3A 1ZVHL 1LSAA 1IO5A 3AGGG 1I1ZA 3TXEA 1IOSA 1HFXA 2MEEA 3IJUA 5FEKA 2YBJA 1SQ2L 1LSCA 1HEWA 3AZ4A 1IP4A 2XBRA 5LIOA 1G7IC 3A90A 4BAFA 1GB2A 5LINA 1B5VA 2W1XA 1HHLA 3A93A 4LT1A 1GAYA 2B5ZA 5APEA 1GF9A 1UBZA 1HEPA 5B1GA 1EQ5A 1YKZX 3BKVA 1C45A 4WLDA 4J1AA 1QQYA 1JEFA 1LZ1A 2BLYA 2G4QA 1CJ8A 1LPIA 3HBDA 4H8YA 3B0OA 2HEDA 3HFMY 5KXTA 1LZ9A 1XEIA 1BVKC 5I4YA 1B5YA 4W96A 1VEDA 4PGJB 1G7MC 3WULA 1XGUC 2ZIJA 3QNGA 1UIBA 1LZSA 4NHSA 1ZVYB 2BQBA 4UWNA 1LMPA 2ZIKA 1LJFA 3TXFA 3P66A 3AW7A 1D0LA 4UWUA 1W6ZA 4NGYA 5LYMA 5LA5A 2DQIY 4HV1A 3CSQA 1IWUA 1IY3A 1YROA 5APCA 1LMAA 1IP5A 1DI4A 5II3A 1GE2A 5KXRA 1GDWA 4XADA 1GBXA 2Q0MX 4WMGA 5APDA 1F0WA 4NEBA 1INUA 1DI5A 1FKQA 1WVVA 1NBYC 4NHIA 1OUGA 3CT5A 1HSWA 4OWCA 1YAPA 4XJHA 4H9IA 4AXTA 2I6ZA 4QY9A 1KXWA 1LMNA 1HERA 2RSCA 2DQJY 1UIDA 1BVXA 1UUZC 3CQLA 3B0KA 4CJ2A 4DD9A 1GB3A 5EBHA 2BQFA 1OUAA 4WO6A 4HSFA 2IFFY 3WVXA 2XBSA 1AT6A 4GLAA 1UACY 1XGPC 1IC4Y 2Z18A 1LZDA 133LA 1REMA 3KAMA 3GXRA 2BQGA 1KIPC 3T36A 1CKFA 4WG7A 5I53A 3MGWA 1JJ0A 1OUEA 1TDYA 1DQJC 3F6ZA 3WU7A 5LYTA 4FDYA 4LZTA 1HC0A 3WH1A 3IJVA 4GCCA 1GB7A 2D4IA 1B7RA 5LAFA 5T3FA 4B0DA 1E8LA 1XGTC 1IP6A 1JSFA 2ZQ3A 4TTDA 1DPXA 2MEDA 4H8ZA 1LZRA 2DQDY 1GF0A 4WG1A 3TMWA 5L9JA 1FKVA 1LZ6A 2ZNXY 4R0FA 5DL9A 3W6EA 1GF7A 1YAOA 5LVJA 4G4HA 1IR7A 4BADA 1WVUA 2D4JA 4HJYA 4ET9A 2I25L 1I20A 5DN4A 1FN5A 207LA 1LZ4A 5E4PA 1GHLA 1IEEA 5LVIA 1YANA 1QIOA 3B6LA 1IWZA 1TCYA 4H92A 2Y8PA 4H8XA 1B7LA 5B1FA 1LZBA 1OQMA 4GN5C 4QGZA 1QUTA 1YIKA 4L41A 1LSMA 3N9AA 1GF6A 4OWAA 2XJWA 2F30A 4HJZA 2FBBA 3P64A 4WM6A 1GBWA 4H9AA 2FBDA 3W6FA 5KXYA 2PC2A 4DD0A 1IC5Y 1GFEA 5F14A 1KIQC 1AT5A 3LYMA 4GCFA 3VWOA 3TXKA 4DDCA 4DDBA 1IR9A 3CSRA 3K3TA 4WM1A 5E9RA 1P2CC 4HP0A 3WXTA 4YM8A 1LYZA 2CJLA 6LYTA 4OW1A 1JTTL 2ZWBA 1YL1X 2LZTA 3WVYA 1GEZA 3TXHA 1GF5A 5KXSA 1WQPA 1REZA 3T6UA 4M6DA 2GV0A 4WM2A 5KXNA 1YL0X 1GWDA 5B05A 1IWWA 1IWXA 1LHMA 4H9FA 4NSIA 1XEJA 4RLMA 4X3BA 1AM7A 2DQFC 2CWIA 1IP1A 3RNXA 1LZNA 3W3EA 5FHWA 1IIZA 1TAYA 2D91A 4YOPA 4DD3A 2DQCY 3LZTA 5C6IA 2Z19A 2D4KA 5KXLA 4YF2A 4TWSA 1LSNA 3HBHA 4N8ZA 1D0MA 1MLCE 3RZ4A 1OUDA 2Z39A 1JWRA 4RDSA 1GFTA 1LSZA 4CFOA 4ET8A 3WW6A 1BWIA 5D5FA 3A8ZA 1ZV5L 4NY5A 4LFXA 1D6QA 4AGAA 4ZIXA 1HEQA 4H91A 4NHQA 1QSWA 3AB6A 4OWBA 1GBYA 1GBZA 1LJ3A 1C46A 2H9KA 2LYOA 2ZYCA 3M18B 3ZVQB 1LSGA 1JITA 1PS5A 1IORA 4GCEA 1YAMA 1OUFA 2BQEA 1UIFA 3A91A 4TX7A 3TXGA 4C5FA 4E3UA 1TBYA 3AW6A 2DBTA 5F9UA 1GFAA 1GFHA 1HNLA 1WQNA 1JHLA 1D6PA 1LSEA 2YSSC 3CT0A 2DQEY 2I26L 3OJPA 5F81A 4DD7A 2MEFA 3HBEX 1G7JC 1QUSA 1OUHA 4CHXA 2EKSC 4NWEA 4H9HA 4B4IA 2MEAA 1B7OA 4WL6A 4BAPA 2HUBA 1HEOA 4M4OA 1GD6A 4IJ4A 1TEWA 1NDMC 2YBNA 4NGJA 1REXA 4UWVA 1B5ZA 4Z3MA 4NGIA 1GB6A 5LVKA 4J0LA 1JKDA 3A3QA 4EOFA 2BQDA 2C8OA 4H9BA 5KXKA 4G9SA 1CNSA 2FYDA 1B2KA 4DWXA 1CKDA 1VDTA 4I8SA 4MCKA 5LA8A 4QEQA 5HLLA 5F9XA 1KXYA 5ILCA 1B7MA 1LJHA 4HTNA 1QDRA 2BQOA 3AJNA 4U3XB 3ULRA 3FE0A 3P4ZA 2G4NA 2BQJA 1LSBA 5FDJA 2CDSA 3ZVQA 1BWJA 5KKIA 2MEHA 1JTOL 5FCPA 3B0IA 4LYCA 4II8A 1C10A 2MEIA 4P2EA 153LA 1GB5A 4QDNA 5LAGA 1GE3A 3WPKA 135LA 1G7HC 2F4GA 2BLXA 1GFRA 5A3ZA 1LYYA 3LHMA 5LXWA 1LZAA 4C3WA 5C6JA 2BQNA 2DQGY 1J1OY 3LN2A 5AMYA 1GBOA 5FELA 1LSYA 2BQAA 4TUNA 1D9UA 1Z55A 3EBAB 2BQLA 4GCDA 3SP3A 5LVGA 5DLAA 1DXJA 1NQIA 1SLYA 2HU3A 4DT3A 1JUGA 1IX0A 2CGIA 3AYQA 4H93A 4HTKA 1I56A 1YAQA 1IP7A 2Z12A 1H87A 4NG8A 1JPOA 2BQHA 2X0AA 3LYOA 2BPUA 3EO5A 4XN6A 1G7LC 4TSBA 2A7DA 4Z98A 4XYYA 5K7OA 4G49A 2G4PA 4WM5A 4DD1A 4H1PA 5LVHA 1OP9B 4KXIA 1JKBA 1GFGA 4LYTA 5HMJA 1IP3A 1DZBX 4NGLA 2BQKA 4ETAA 4Z46A 1W08A 2H9JA 1LCNA 4D9ZA 4NGZA 5DN5A 1IOQA 1HEMA 1JTPL 2Z37A 1UIGA 1GEVA 1LMOA 4XENA 2MEGA 4CFPA 4DC4A 3A92A 2FYCA 1MELL 4ANRA 4NGOA 4TSCA 3ATNA 1DI3A 2DKVA 3RW8A 4PRQA 3AGHA 2YBIA 4NHPA 1A4VA 1GFJA 1IWVA 4R6CA 5DM9A 4ETBA 5IELA 1HMKA 4EMNA 1RCMA 1N4FA 1IY4A 2NWDX 1LZTA 1GBSA 1WQQA 3BKHA 1OUJA 5B07A 1IVMA 4LYBA 1LJIA 1QTEA 5L3HA 2WARA 5I5QA 5APFA 9LYZA 1EQ4A 5B59A 7LYZA 4CGEA 3N9CA 4RW2A 2HU1A 4HJVA 4RLNA 3A94A 1GF4A 3TMVA 1GFVA 1LMQA 4YEMA 1GFUA 1C43A 1WQOA 5A3EA 2W1LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PJ2C 1LJEA 1O23A 1DYDA 1LAAA 2F4AA 1L29A 1JJ3A 1CKGA 3G3AB 1WTMA 5J7CA 4I7JA 3SB9A 4Z41A 1C6KA 4PPOA 2BAAA 1J1XY 2AUBA 1LSPA 1VATA 1GFKA 1VDQA 1NKHA 2EPEA 4ETEA 1EQEA 1LHLA 3J6KA 5KXOA 178LA 3A95A 3GUIA 1DYEA 4H90A 3TMXA 1L51A 1IC7Y 1NMMA 4S0WA 193LA 1QS5A 1B9OA 2HEBA 1B5WA 4ETDA 1NHBA 1L62A 4N0JA 2MEBA 3HUKA 1QTBA 2VB1A 4GN4A 3ODUA 1JIYA 2Z2FA 3W6BA 5KY1A 1G0MA 1C08C 1CV6A 3CDQA 1L92A 1YILA 2DQHY 1D3NA 176LA 2HUKA 1XJTA 1GF3A 3NY9A 7LZMA 111LA 1IR8A 3G3VA 1HENA 1DYCA 1LHIA 244LA 3A6BY 228LA 1QTCA 1PQOA 2YDGA 5C6LA 4I7PA 5KXZA 2B6WA 1VAUA 5HMVA 3TXBA 104LA 113LA 1LTMA 1RJCB 3W6CA 1BB4A 3E3DA 1LGUA 3GXKA 1CJ7A 4YXAC 1CUQA 2D6BA 1L82A 173LA 4NHTA 1JJ1A 1L44A 2YBLA 3WMKA 1L33A 5FSTA 3DN4A 3RUNA 2RBPA 154LA 1LSDA 1TLAA 3ATOA 1T6VL 2HEAA 2W1YA 1VDSA 1HELA 1PQMA 3LZMA 3QY4A 3WU9A 4LFPA 4B4JA 4WOAA 2YBMA 1JISA 1B7PA 2BQMA 3AZ7A 4PJZA 1L04A 3SN6R 119LA 1JSEA 1B7NA 5I4XA 4ARMA 1L89A 1JTNA 3OE0A 211LA 2HUMA 1C60A 219LA 4A7DA 1OVKA 1LKRA 1FDLY 1LGWA 1LJKA 1NWGA 1LZ8A 1ALCA 3RT5X 1LZGA 128LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2W1M A;  4N9R A;  4PJ2 C;  1LJE A;  1UCO A;  4MR1 A;  1DPW A;  1FLY A;  1BB6 A;  1O23 A;  4OWE A;  4DYG A;  1LAA A;  4FJR A;  1GB0 A;  4WLX A;  2F4A A;  1JJ3 A;  1CKG A;  4WL7 A;  3TMU A;  3G3A B;  3QE8 A;  1WTM A;  2EIZ C;  2LYZ A;  4GLV A;  4O34 A;  1FLU A;  1WQM A;  2IHL A;  3WL2 A;  5J7C A;  4KPM A;  4N5R A;  1LHJ A;  4Z41 A;  1LOZ A;  4PPO A;  2BAA A;  4GN3 A;  1V7T A;  1IOT A;  1LMC A;  1J1X Y;  1LZE A;  1BB7 A;  1GXX A;  4XJG A;  1H6M A;  2AUB A;  2C8P A;  3WPJ A;  4BS7 A;  1LSP A;  1UC0 A;  1XEK A;  3CT1 A;  1VAT A;  1BQL Y;  1GFK A;  1VDQ A;  1NKH A;  2LYM A;  1J1P Y;  2EPE A;  3LYT A;  4ZEE A;  1ZMY L;  4LYO A;  3WXU A;  1EQE A;  1HML A;  4ETE A;  5D5C A;  1LHL A;  3J6K A;  1IWY A;  5KXO A;  4DDA A;  3J4G A;  4IAT A;  1UIE A;  1T3P A;  3A95 A;  4G4C A;  4NG1 A;  1GB8 A;  4YEN A;  4H90 A;  3TMX A;  3D3D A;  1IC7 Y;  1NMM A;  4KT3 A;  193L A;  1LMT A;  3A3R X;  4NSH A;  1B9O A;  2HEB A;  4NGK A;  4OOO A;  4B4E A;  4WO9 A;  3W6D A;  5HNL A;  1B5W A;  4ETD A;  4MST A;  4ML7 A;  4N0J A; 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 1LZA A;  4C3W A;  5C6J A;  2BQN A;  2DQG Y;  1J1O Y;  3LN2 A;  5AMY A;  1GBO A;  5FEL A;  1LSY A;  2BQA A;  4TUN A;  1D9U A;  1Z55 A;  3EBA B;  2BQL A;  4GCD A;  3SP3 A;  5LVG A;  5DLA A;  1DXJ A;  1NQI A;  1SLY A;  2HU3 A;  4DT3 A;  1JUG A;  1IX0 A;  2CGI A;  3AYQ A;  4H93 A;  4HTK A;  1I56 A;  1YAQ A;  1IP7 A;  2Z12 A;  1H87 A;  4NG8 A;  1JPO A;  2BQH A;  2X0A A;  3LYO A;  2BPU A;  3EO5 A;  4XN6 A;  1G7L C;  4TSB A;  2A7D A;  4Z98 A;  4XYY A;  5K7O A;  4G49 A;  2G4P A;  4WM5 A;  4DD1 A;  4H1P A;  5LVH A;  1OP9 B;  4KXI A;  1JKB A;  1GFG A;  4LYT A;  5HMJ A;  1IP3 A;  1DZB X;  4NGL A;  2BQK A;  4ETA A;  4Z46 A;  1W08 A;  2H9J A;  1LCN A;  4D9Z A;  4NGZ A;  5DN5 A;  1IOQ A;  1HEM A;  1JTP L;  2Z37 A;  1UIG A;  1GEV A;  1LMO A;  4XEN A;  2MEG A;  4CFP A;  4DC4 A;  3A92 A;  2FYC A;  1MEL L;  4ANR A;  4NGO A;  4TSC A;  3ATN A;  1DI3 A;  2DKV A;  3RW8 A;  4PRQ A;  3AGH A;  2YBI A;  4NHP A;  1A4V A;  1GFJ A;  1IWV A;  4R6C A;  5DM9 A;  4ETB A;  5IEL A;  1HMK A;  4EMN A;  1RCM A;  1N4F A;  1IY4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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