1B7NA

Verification of spmp using mutant human lysozymes
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWLSGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Experimental verification of the 'stability profile of mutant protein' (SPMP) data using mutant human lysozymes.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1b7nA00
5LVHA 1FKQA 1UACY 3WVXA 2Z37A 2ZQ4A 1IOQA 207LA 4C3WA 5HNCA 4RW1A 2EPEA 1OUAA 1YQVY 4QGZA 1G7HC 1VDQA 3HBDA 5APCA 1LKRA 1QUSA 1IOTA 1GFGA 4WLYA 1LYZA 1WQNA 4DD9A 3M3UA 1GXXA 1UICA 2EKSC 4E3UA 5L3HA 3WU8A 133LA 3A6CY 3LZTA 4O34A 2H5ZA 1F10A 2DQIY 3ATOA 1HEOA 2F4GA 4G49A 2Z2EA 5KXLA 1REXA 3WUMA 3LYMA 4ZFPA 134LA 1HSXA 1OUCA 5LVIA 5KJ9A 1T3PA 3D9AC 1FBIX 2XBSA 2BQHA 1B7LA 4PHIA 1DKKA 1NBYC 1LHLA 1ALCA 3KAMA 4N9RA 1LZGA 1PZYA 2DQAA 4FDYA 4XJGA 3WUAA 2W1XA 1GEZA 1OUGA 5LVKA 3RW8A 132LA 1GB8A 1GEVA 1HMLA 1KXWA 1YKXX 2PC2A 4TTDA 5LYMA 4CFPA 1CKDA 1V7TA 4ETDA 1BB6A 1NWGA 4LT2A 1C46A 1W08A 1LSFA 5FEKA 3M18B 1DI4A 2ZIJA 1BWJA 1HFYA 3CSZA 4DD0A 4TUNA 1J1XY 3N9EA 2IFFY 4J7VA 4DDCA 2F4AA 2C8PA 1LSYA 3WPJA 1JUGA 4PGJB 1O23A 1GE3A 2HTXA 3ZVQA 1T6VL 1XGQC 2NWDX 2YBNA 1HC0A 208LA 2BQIA 1GB6A 3W6DA 1JITA 3CSRA 4WG1A 2MEAA 4LYOA 2XJWA 1NHEA 4DYGA 1QDTA 2YBLA 6LYZA 2G4QA 3FI7A 3AGGG 1IC4Y 1OUHA 1DPXA 4GLVA 1VATA 1LCNA 2X0AA 3AW6A 2LYOA 2ZQ3A 4M6DA 4PPOA 1BVXA 1GF7A 1XGRC 1UIGA 4HV1A 4ETEA 3WPLA 1LYOA 1ZMYL 4NSIA 2BQEA 1YROA 1LJJA 3J4GA 1REZA 2H9JA 1JWRA 3HFMY 4GCCA 1LYSA 2RSCA 4QY9A 5LAFA 4N0JA 4B0DA 2YSSC 4NY5A 1JTOL 1IWXA 4DT3A 1LZ6A 3OK0A 4NGWA 4H93A 1CKGA 3TXFA 3WW6A 5E9RA 3LYOA 5KXMA 1LHMA 1IY4A 2BQLA 193LA 1WTMA 5HLLA 1VEDA 4LYBA 1GB2A 3P66A 1UCOA 3B0OA 1IP5A 1HEPA 1LMNA 1HHLA 1JISA 2Z19A 3IWRA 2ZNXY 5KKJA 4HV2A 1H87A 1IWTA 4LYMA 4N1CC 5KXYA 4OWEA 1D0LA 1REYA 5KXTA 1JSFA 1OUDA 1XEJA 2ZNWY 1SLYA 3AGIA 2MEIA 4H8ZA 5F9XA 1GF0A 4LFPA 3TXGA 3A95A 3QE8A 3TMXA 4XYYA 1J1PY 1IX0A 4NGLA 4N8ZA 1W6ZA 1IO5A 4QEQA 1IVMA 5LYZA 1A2YC 3LYTA 5KXOA 4OOOA 1UIEA 5APFA 1QTKA 3WUNA 1QTEA 4X3BA 1IWUA 1LJKA 4LT0A 1G7JC 4BADA 3K3TA 1FLWA 1DI5A 4L41A 1B7QA 1GB7A 1GFJA 5L3IA 4WOAA 1GBZA 4NSHA 4XN6A 4GN3A 4LT1A 2DKVA 2HEAA 2ZILA 2LHMA 2LZ2A 1E8LA 1IP7A 4KT3A 4RDSA 2MEBA 2W1LA 4H1PA 4H9IA 4NHQA 4DD2A 2IHLA 3A94A 1HMKA 4NHTA 4LYZA 4YEMA 4BS7A 1GFUA 2HU3A 3B0IA 3ZVQB 4C5FA 4Z3MA 1LMQA 1LSDA 1LSEA 4WM4A 5A3ZA 2MEHA 3LZ2A 3BKHA 4H8YA 1H6MA 1OUEA 4ZEEA 1JTPL 5DM9A 1LJIA 1GBXA 1UA6Y 4WLDA 5B05A 1AT6A 2ZWBA 5ILFA 1HERA 4J0LA 1LPIA 4MCKA 4NHPA 1GF9A 4U3XB 1IORA 3B0KA 5F16A 5LIOA 1J1OY 1UIHA 1IOCA 4G4HA 4H91A 4HSFA 2N5ZA 4YF2A 1LSZA 2GV0A 4HTQA 1IOSA 1IP4A 1LJNA 2MEEA 1BQLY 1B9OA 4YEOA 3RNXA 4WL7A 4XJFA 5I4WA 5F14A 5I4YA 2A7FA 2XBRA 4NGOA 1ZV5L 4D9ZA 1G7IC 153LA 1FLQA 1GF3A 3WH1A 1NQIA 3AZ6A 5HQ1A 4A7DA 1LJFA 1D0MA 4HTNA 5APDA 3WXUA 1ZVYB 5D5CA 1JEFA 1GBWA 5HNLA 5LYTA 1KXXA 2BQDA 5F81A 1KIPC 1BVKC 1OUJA 1QIOA 1REMA 1OQMA 1DZBX 3A8ZA 1B5VA 2D91A 3WW5A 1B7OA 4CJ2A 2YVBA 1JJ1A 1GWDA 1GPQC 1LMOA 4UWUA 1INUA 3HBHA 3W6EA 1UIFA 3TXKA 9LYZA 1LHIA 1EL1A 2Z38A 4GCDA 2Z39A 4B4IA 1KIQC 1IR7A 4HPIA 5HMVA 1B2KA 4WM6A 1FDLY 3MGWA 1I1ZA 3EMSA 1IR8A 4BAFA 4WL6A 2LZTA 3P65A 1B7RA 4MSTA 4TX7A 1YANA 1GBYA 4IJ4A 4H9EA 1LAAA 1LZBA 4NG1A 1AKIA 4B4EA 1UIAA 5LXWA 3WVYA 5C6LA 3A34A 1LZ1A 4N5RA 5KXKA 2DQFC 3A3QA 2BQOA 1TDYA 4ETAA 4GCEA 2D4KA 5E4PA 2HECA 4GN4A 5DL9A 1LZTA 1CJ7A 4IATA 4N1EI 4DC4A 1JKBA 1HEMA 3TXDA 3ZEKA 1CJ9A 4H9CA 4NWHA 5L9JA 4H90A 1GBOA 1LZAA 4NSJA 1JSEA 1LZDA 5I53A 4B4JA 4ANRA 5LAGA 4DD7A 1GFKA 1YL1X 4KXIA 4WM3A 3TXIA 4BAPA 1B7MA 1GD6A 1CKHA 1JIYA 4P2EA 154LA 4ETCA 1D6PA 4HTKA 4B1AA 1BB7A 4R0FA 1LYYA 4NGYA 1IWYA 4XJDA 1JHLA 1OUBA 1HFZA 5HMJA 4CHXA 3AB6A 3A92A 1UBZA 3CT5A 5B1FA 3A67Y 1XGPC 5DN4A 3ULRA 1TAYA 1OP9B 4HJVA 3WXTA 1BGIA 1GDXA 1VFBC 1G7MC 4LT3A 1Z55A 3B6LA 5C6IA 2VB1A 3TXEA 3TXJA 4WG7A 4UWVA 1GFVA 5FSTA 1YKYX 4GN5C 1NKHA 5B07A 1WQOA 5I5QA 1HENA 1QSWA 1CJ8A 1I56A 4G9SA 1IWWA 4TSBA 1I20A 1C45A 1LSAA 1RJCB 3EBAB 1N4FA 4PRQA 1HEWA 3FE0A 4OWAA 5B59A 4WM2A 3CSQA 3RZ4A 1NDMC 1GE4A 3LN2A 5LVJA 2CGIA 3A93A 4NG8A 4ML7A 1MLCE 1NF5A 4IASA 3W6FA 5KXPA 4AXTA 2HEDA 1C43A 1LSGA 2DQJY 1YAMA 2WARA 3N9AA 1GB9A 1LSBA 194LA 1OUIA 1TEWA 4LGKA 1GXV2 4WM1A 1VDTA 3AYQA 4CFOA 1ZVHL 4HJZA 4NGVA 1RI8B 5B06A 3WYHA 4ETBA 1LOZA 3P68A 4LZTA 5B1GA 3T36A 4Z41A 1WQQA 1UUZC 3F6ZA 1LJEA 2ZYCA 1KIRC 3TXHA 4WM5A 1LZ8A 1YL0X 1GFAA 2DQHY 3TMUA 2Z2FA 2MECA 3TXBA 1HEQA 1CNSA 2FYDA 1LZEA 3P64A 3WMKA 1LMTA 1B5XA 3W6AA 3BKVA 4H8XA 2MEGA 5KXSA 3CT0A 1BWHA 1XFPL 3HBEX 2DQEY 3A6BY 3A90A 1B7NA 2YDGA 4OWBA 1FKVA 1C08C 1WVVA 2W1YA 1F6RA 1XSFA 4GLAA 3LYZA 4QDNA 2F30A 4TWSA 1LZCA 5KY1A 5LINA 3AZ4A 4H9FA 1IC7Y 4DD3A 4CGEA 5JENB 1RE2A 1WVUA 1NMMA 1BB4A 1XGTC 1GB0A 3J6KA 1QUTA 1VAUA 3B72A 1D9UA 1XGUC 3W3EA 1UIBA 4W96A 3TMWA 1HELA 5KXXA 1GHLA 1UC0A 1AT5A 1LHKA 2DQGY 4NIJA 1IP2A 4WO9A 4W94A 4WLTA 2EQLA 5A3EA 2HEEA 1GF6A 1QSAA 1LZ4A 1VDSA 2ZIKA 4NEBA 1GFHA 4PJ2C 4UWNA 4XENA 3ATNA 6LYTA 3SP3A 8LYZA 5FCPA 1LMAA 1LSCA 2CDSA 2DQDY 1VDPA 1GBSA 1UIDA 1GB5A 4KPMA 4FJRA 1IWZA 5AMYA 5IDDA 2G4NA 1IWVA 2BQCA 1A4VA 1LSNA 2G4PA 5F9UA 1LSPA 2B5ZA 1EQ4A 2BQFA 5KXRA 3AW7A 2YBIA 3CT1A 2BQJA 2BQAA 1NBZC 1DI3A 4GCBA 5KKIA 5M1YA 1G7LC 2DBTA 1TBYA 3CQLA 4LYTA 5EBHA 135LA 4H9HA 3GXRA 2D4IA 5KXZA 1D0KA 1NDGC 5IHGA 1GF8A 2ZYPA 1JPOA 3E3DA 1BB5A 4XJIA 1WQMA 1IEEA 3A91A 1B7PA 1CJ6A 1DXJA 2BLXA 3VWOA 4NGZA 3AZ7A 2BQKA 3AGHA 4RLNA 5J7CA 4WMGA 4J1AA 1DQJC 2Z12A 1TCYA 1LHJA 2YBHA 3N9CA 4OW1A 1LMCA 1LHHA 4NGIA 1IC5Y 1CKFA 5LA5A 1B7SA 2HEBA 5LVGA 1GFRA 3IJUA 2CWIA 1WQPA 1FLUA 1YAQA 4I0CA 3LHMA 4HPEA 2AUBA 5KXNA 5FHWA 1B5YA 3W6CA 1LTMA 1JKCA 1LZ5A 4J1BA 2HUBA 1QQYA 3RU5A 1B5WA 1QDRA 1GAZA 3D3DA 1YAOA 3EXDA 3IJVA 4ET8A 3WU9A 1GE0A 5KXWA 2F2NA 1GF5A 2H9KA 4NSGA 3OJPA 4M4OA 1CKCA 2BPUA 4G4CA 2C8OA 1RFPA 1YILA 5I54A 4G4BA 1B5ZA 1IY3A 1BWIA 2HEFA 3AZ5A 4NGKA 1IIZA 4OOTA 1LZ9A 2Z18A 4YM8A 2BQMA 2MEDA 4GCFA 2EIZC 1JTTL 2I6ZA 2BQGA 4DDBA 4RW2A 4XJHA 5DLAA 5I4XA 3G3AB 2D4JA 1IP1A 4PRUA 1AM7A 5DN5A 4YOPA 1JKDA 1XEKA 4MR1A 1GE2A 4Z46A 1F6SA 3EO5A 1C7PA 1B0DA 1F0WA 1GDWA 1GB3A 1JJ0A 3W6BA 2LYZA 1DPWA 3WL2A 7LYZA 5C6JA 3GXKA 3T6UA 4ZIXA 2Q0MX 5IELA 2DQCY 1GFEA 3A3RX 4H94A 1LJHA 4EOFA 1SQ2L 1GE1A 1EQ5A 1OUFA 1GFTA 1HF4A 1JKAA 2MEFA 4OWHA 1LJGA 4Z98A 1BB3A 2CJLA 4DDAA 4II8A 1YIKA 4ET9A 1AZFA 4H9AA 1DKJA 4I8SA 2BAAA 2BQBA 4DWXA 2BLYA 1PS5A 1LMPA 2A7DA 1EQEA 3WPKA 3TMVA 4B49A 2W1MA 1LZRA 1V7SA 1FN5A 2XTHA 1WTNA 1D6QA 1HSWA 5LA8A 4HJYA 4NWEA 4YENA 1B5UA 2Y8PA 3P4ZA 4XADA 3WULA 2FBBA 1YAPA 2HU1A 3A96A 1YKZX 2I25L 2LYMA 4NHIA 3RT5X 1LSMA 1P2CC 1JJ3A 4XJBA 2YBJA 4WO6A 5FELA 1KXYA 4NFVA 1LJ3A 1IR9A 2BQNA 4RLMA 1LKSA 3G3BB 4R6CA 4H9BA 1IP6A 1LZYA 1HNLA 1WQRA 4TSCA 3QNGA 1GF4A 4NGJA 5ILCA 1C10A 3AJNA 5D5FA 1RCMA 4DD1A 1GAYA 1LZNA 4AGAA 3CB7A 1LZSA 2FBDA 1HFXA 1LJ4A 5FDJA 5T3FA 3WU7A 1FLYA 1XEIA 4H92A 4LFXA 1IP3A 3QY4A 5II3A 2FYCA 4HP0A 4WLXA 1BHZA 4NHSA 2D6BA 2I26L 5APEA 5K7OA 1MELL 4EMNA 4KL7A 2YBMA 4OWCA 4LYCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L34A 5HNCA 4C3WA 1VDQA 1QUSA 1IOTA 1GFGA 1WQNA 228LA 4EXMA 4E3UA 5L3HA 3RZEA 2F4GA 1XEPA 2Z2EA 3LYMA 1L49A 4W55A 4I7KA 3D9AC 1FBIX 2XBSA 1DKKA 3KAMA 4EJ4A 1LYJA 3RW8A 5LYMA 2B74A 125LA 4CFPA 1V7TA 196LA 1BB6A 1C46A 205LA 1LSFA 5FEKA 4DKLA 1C6BA 1LI6A 2ZIJA 252LA 4DJHA 250LA 4DD0A 2IFFY 4DDCA 2F4AA 1B6IA 2HTXA 257LA 1L93A 2YBNA 2NWDX 1K28A 1CV0A 3W6DA 144LA 2MEAA 2XJWA 1NHEA 2B72A 1T97A 221LA 2G4QA 1DPXA 1VATA 1LCNA 3DN3A 1GF7A 4ETEA 1UIGA 169LA 1L71A 4NSIA 2BQEA 1YROA 1LJJA 2H9JA 1JWRA 3HFMY 4NGWA 220LA 5E9RA 5KXMA 1G1VA 1OVHA 1LYGA 1D3MA 1L31A 5HLLA 1VEDA 1L84A 2L78A 3B0OA 1IP5A 1HEPA 1JISA 2ZNXY 4LYMA 4YX7C 1D0LA 1XEJA 1SLYA 4W59A 2NTGA 3TXGA 3A95A 3TMXA 1P36A 1W6ZA 1IVMA 5LYZA 1PQJA 1LJKA 1G7JC 3C82A 1E8LA 2DKVA 2LZ2A 1IP7A 3C7YA 1OWZA 4H1PA 4H9IA 4YEMA 3ZVQB 4C5FA 1L23A 2MEHA 3LZ2A 1L46A 5DM9A 258LA 165LA 5M1YA 5F16A 4U3XB 1L27A 4ZIXA 1J1OY 4YF2A 2N5ZA 1KS3A 2GV0A 177LA 209LA 4YEOA 4XJFA 1G7IC 1GF3A 3CDOA 1NQIA 2B70A 4A7DA 3QAKA 2HUKA 4ARQB 217LA 4UWUA 226LA 3DNAA 1P6YA 3SB7A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5LVH A;  1FKQ A;  1UAC Y;  3WVX A;  2Z37 A;  2ZQ4 A;  1IOQ A;  207L A;  4C3W A;  5HNC A;  4RW1 A;  2EPE A;  1OUA A;  1YQV Y;  4QGZ A;  1G7H C;  1VDQ A;  3HBD A;  5APC A;  1LKR A;  1QUS A;  1IOT A;  1GFG A;  4WLY A;  1LYZ A;  1WQN A;  4DD9 A;  3M3U A;  1GXX A;  1UIC A;  2EKS C;  4E3U A;  5L3H A;  3WU8 A;  133L A;  3A6C Y;  3LZT A;  4O34 A;  2H5Z A;  1F10 A;  2DQI Y;  3ATO A;  1HEO A;  2F4G A;  4G49 A;  2Z2E A;  5KXL A;  1REX A;  3WUM A;  3LYM A;  4ZFP A;  134L A;  1HSX A;  1OUC A;  5LVI A;  5KJ9 A;  1T3P A;  3D9A C;  1FBI X;  2XBS A;  2BQH A;  1B7L A;  4PHI A;  1DKK A;  1NBY C;  1LHL A;  1ALC A;  3KAM A;  4N9R A;  1LZG A;  1PZY A;  2DQA A;  4FDY A;  4XJG A;  3WUA A;  2W1X A;  1GEZ A;  1OUG A;  5LVK A;  3RW8 A;  132L A;  1GB8 A;  1GEV A;  1HML A;  1KXW A;  1YKX X;  2PC2 A;  4TTD A;  5LYM A;  4CFP A;  1CKD A;  1V7T A;  4ETD A;  1BB6 A;  1NWG A;  4LT2 A;  1C46 A;  1W08 A;  1LSF A;  5FEK A;  3M18 B;  1DI4 A;  2ZIJ A;  1BWJ A;  1HFY A;  3CSZ A;  4DD0 A;  4TUN A;  1J1X Y;  3N9E A;  2IFF Y;  4J7V A; 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 4Z46 A;  1F6S A;  3EO5 A;  1C7P A;  1B0D A;  1F0W A;  1GDW A;  1GB3 A;  1JJ0 A;  3W6B A;  2LYZ A;  1DPW A;  3WL2 A;  7LYZ A;  5C6J A;  3GXK A;  3T6U A;  4ZIX A;  2Q0M X;  5IEL A;  2DQC Y;  1GFE A;  3A3R X;  4H94 A;  1LJH A;  4EOF A;  1SQ2 L;  1GE1 A;  1EQ5 A;  1OUF A;  1GFT A;  1HF4 A;  1JKA A;  2MEF A;  4OWH A;  1LJG A;  4Z98 A;  1BB3 A;  2CJL A;  4DDA A;  4II8 A;  1YIK A;  4ET9 A;  1AZF A;  4H9A A;  1DKJ A;  4I8S A;  2BAA A;  2BQB A;  4DWX A;  2BLY A;  1PS5 A;  1LMP A;  2A7D A;  1EQE A;  3WPK A;  3TMV A;  4B49 A;  2W1M A;  1LZR A;  1V7S A;  1FN5 A;  2XTH A;  1WTN A;  1D6Q A;  1HSW A;  5LA8 A;  4HJY A;  4NWE A;  4YEN A;  1B5U A;  2Y8P A;  3P4Z A;  4XAD A;  3WUL A;  2FBB A;  1YAP A;  2HU1 A;  3A96 A;  1YKZ X;  2I25 L;  2LYM A;  4NHI A;  3RT5 X;  1LSM A;  1P2C C;  1JJ3 A;  4XJB A;  2YBJ A;  4WO6 A;  5FEL A;  1KXY A;  4NFV A;  1LJ3 A;  1IR9 A;  2BQN A;  4RLM A;  1LKS A;  3G3B B;  4R6C A;  4H9B A;  1IP6 A;  1LZY A;  1HNL A;  1WQR A;  4TSC A;  3QNG A;  1GF4 A;  4NGJ A;  5ILC A;  1C10 A;  3AJN A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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