1B9OA

Human alpha-lactalbumin, low temperature form
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
123
structure length
123
Chain Sequence
KQFTKCELSQLLKDIDGYGGIALPELICTMFHTSGYDTQAIVENDESTEYGLFQISNKLWCKSSQVPQSRNICDISCDKFLDDDITDDIMCAKKILDIKGIDYWLAHKALCTEKLEQWLCEKL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Calcium-binding protein
molecule keywords PROTEIN (ALPHA-LACTALBUMIN)
publication title Crystallographic evaluation of internal motion of human alpha-lactalbumin refined by full-matrix least-squares method.
pubmed doi rcsb
total genus 41
structure length 123
sequence length 123
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-02-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1b9oA00
2G4PA 4KPMA 4TSBA 1WQQA 4DD1A 1C08C 1HF4A 2BQOA 3WU9A 5LYMA 5E4PA 1LZGA 1GB5A 1LOZA 2HTXA 4XENA 1GE2A 3W6CA 4HPIA 4Z46A 1GAYA 1JKAA 4G4BA 1EQ4A 1IP1A 1OUCA 1XEKA 5L3HA 2MEGA 4H8YA 3AZ4A 4LZTA 5KKJA 1HMKA 1LZ9A 1LHJA 3E3DA 2MEIA 5HQ1A 4I0CA 2DQCY 2EQLA 2YVBA 5LA8A 1LCNA 2F4GA 3A8ZA 4DC4A 3WH1A 1V7TA 4FDYA 1DPWA 1GFGA 4NG1A 4HV2A 1IR8A 4LT3A 1A2YC 1IWYA 1QDTA 2ZQ4A 4NFVA 2LYMA 4OOTA 3ZVQA 1YROA 3A34A 3CSRA 4BAFA 4XJFA 5M1YA 2AUBA 4DD0A 1NKHA 4NHSA 1DKJA 3ATNA 4DD3A 4OOOA 1VDTA 1GB2A 4XADA 3WYHA 1BWJA 1GBSA 1GFAA 1LHKA 5E9RA 4B4IA 5KXWA 4OWHA 4TWSA 1VDPA 5D5CA 2IFFY 3IWRA 3F6ZA 1UBZA 2NWDX 1GFVA 4NIJA 2HUBA 3WL2A 4LGKA 1GXV2 1YAPA 1G7LC 4H9EA 207LA 1C10A 9LYZA 5JENB 4OWCA 2LHMA 4PPOA 1AT6A 4PHIA 2IHLA 2D4IA 1W08A 1LZAA 1IC5Y 1LKRA 5LVKA 1REMA 2BQGA 1YAOA 2W1YA 5LAFA 3K3TA 1DXJA 1GBXA 4WG1A 4NGKA 1V7SA 4EMNA 1ZVYB 1LZ8A 1I56A 1NBYC 1LZYA 2HECA 2Z12A 1IO5A 1GE4A 4DDBA 3B0OA 4J0LA 5B06A 4H9HA 1LJ4A 3W3EA 1QTKA 4RDSA 2X0AA 2LYZA 5LYTA 1WQNA 1XSFA 1B7LA 2YBIA 4GCFA 1GD6A 1B7MA 1LSMA 1GF9A 2EPEA 1XGTC 1GDXA 1GEZA 1GF4A 4NGYA 2HEFA 1VDSA 2ZQ3A 1QQYA 1IWVA 1HNLA 1HMLA 4NWHA 3RNXA 1HERA 1W6ZA 1TEWA 1B7PA 2H5ZA 4IJ4A 4C3WA 1YIKA 2BQKA 1LYOA 1IP6A 4G49A 4R0FA 7LYZA 1HHLA 1OUAA 5ILFA 3TMXA 2MEHA 1EQ5A 3A67Y 4KT3A 4AGAA 4NGVA 4NEBA 1IP4A 1BQLY 1UCOA 2XBSA 2CDSA 4HV1A 3AZ6A 5HLLA 2DQAA 5IHGA 2Q0MX 4MSTA 1LSCA 3TXKA 4H92A 4TX7A 1GHLA 5F14A 1IOQA 1GE3A 2YBLA 2Z19A 5KXTA 1LZDA 3WXUA 3TXIA 3B6LA 4OWEA 5B07A 4LYZA 1UUZC 1LJFA 1JISA 1RE2A 4X3BA 5KXOA 1NHEA 2HU1A 2DKVA 5I4XA 3A94A 1LMCA 2BPUA 1JITA 3AGGG 3CT1A 1JKDA 194LA 1XEIA 1OUEA 133LA 1GBWA 1ZV5L 3EMSA 3ZEKA 5I4YA 4H8XA 4UWNA 3CB7A 4N0JA 3N9AA 4NGIA 1LHMA 5F9UA 1J1PY 4WM2A 5A3ZA 1JJ3A 3P66A 4WM5A 1GB3A 1T3PA 5DLAA 1LYSA 1UIGA 208LA 4UWVA 5FCPA 3LZTA 5I4WA 4M6DA 4NHTA 1CJ8A 4ML7A 1CJ6A 5KKIA 1BB3A 3QE8A 5APCA 4WLTA 1GXXA 4H93A 4YEMA 3TXBA 4ZFPA 4NHIA 1CJ7A 1GFKA 3ATOA 4NGJA 1C43A 4NSHA 5C6IA 2VB1A 1IR7A 3HBHA 2DQGY 4I8SA 1HELA 4W96A 2H9JA 5D5FA 3A3QA 5HMJA 4B49A 1NDMC 4C5FA 3A93A 3MGWA 1LZSA 1SLYA 3D3DA 5B59A 1QDRA 2Z2FA 4XJHA 1HSXA 2D6BA 4HSFA 1IP2A 5KXKA 3A6BY 4QDNA 1BHZA 4LYOA 1J1XY 4PGJB 4NSGA 2GV0A 4H91A 1H87A 4YENA 5HNCA 3WUNA 1EL1A 1FKVA 1WQRA 1NF5A 3EBAB 4NY5A 2CJLA 2EIZC 4BS7A 4IASA 1AT5A 3WULA 4DYGA 5B05A 4B4JA 3W6AA 5DM9A 4YF2A 1LSBA 4D9ZA 3A95A 4N1EI 1LJNA 1JSEA 1UACY 2XTHA 4CFPA 1RJCB 2D4JA 4LYBA 1GB7A 2DBTA 2DQFC 2LYOA 5APEA 2C8OA 1UIEA 1JKBA 1XGPC 5DN5A 1GE1A 1TBYA 1DZBX 1JPOA 1KIRC 1QUSA 3AZ7A 1WTNA 3FI7A 5KXZA 1GE0A 2Z38A 1LJ3A 2G4NA 4TUNA 3WW6A 5LVJA 1IWWA 5FEKA 4BADA 5A3EA 1D0LA 5T3FA 2ZIKA 1F10A 2FBDA 5I5QA 1B2KA 1AM7A 1BGIA 3LYOA 4H9BA 3FE0A 3W6BA 1YANA 1VFBC 4N1CC 3HFMY 4DD2A 1GB9A 5DL9A 1LJKA 1B5XA 1LZEA 2A7FA 2F30A 3CT5A 1IORA 1UC0A 1TDYA 4H9CA 1D6PA 4LYCA 4R6CA 4WL7A 3WPLA 1LZNA 3A96A 1CJ9A 4HTKA 4PJ2C 2BQEA 4CFOA 1LSPA 1LZTA 1Z55A 2W1MA 4WO6A 4YM8A 1FN5A 4NHPA 3WXTA 1IEEA 2DQHY 1CKHA 2FYCA 2BQHA 4AXTA 4FJRA 4QEQA 4WOAA 4GCDA 4XJBA 2BQFA 5K7OA 1LMPA 2BLXA 1GF8A 1O23A 2ZNXY 3A92A 3G3BB 3EO5A 1GF0A 1JJ1A 2ZWBA 4U3XB 2BQJA 1LJJA 1P2CC 1F6RA 1GFEA 1I20A 4NG8A 5L3IA 1FLUA 3RZ4A 1LSZA 3B72A 1QUTA 3HBEX 4MR1A 1LMTA 2YSSC 4H90A 1OUIA 5IDDA 3ULRA 1HEWA 1IWUA 4EOFA 1LSDA 1LZ1A 1FDLY 4ETEA 1LJEA 1D6QA 1GF7A 5AMYA 2DQJY 2Y8PA 3W6DA 4ETBA 2Z39A 1OUFA 5ILCA 4WLYA 1AKIA 2CGIA 3LN2A 3TXEA 2A7DA 1IOTA 1B7QA 8LYZA 2Z18A 1BB7A 1GBYA 1HEQA 1UIAA 5LYZA 1REYA 3B0IA 2MEAA 1HEMA 3IJUA 4GN3A 1WVUA 1QSWA 4YOPA 3OK0A 1B5UA 3WPKA 4ETAA 3CSZA 1NBZC 5C6LA 5I54A 4LYTA 1IP7A 1GB8A 1IOCA 1WQMA 2HEAA 1EQEA 4H9FA 3TXGA 1QSAA 1FLWA 3LYMA 5LINA 3IJVA 1JJ0A 4NHQA 1IY4A 1F0WA 4Z98A 1YL0X 3W6FA 3WUAA 3N9CA 3P64A 4WM4A 5KXLA 4HJYA 2BQCA 2I6ZA 1RCMA 4A7DA 4GN5C 1LSAA 1LZCA 1GF5A 3D9AC 3TXHA 4ETDA 1LSGA 1JKCA 2FYDA 1GFTA 5KXSA 1LSEA 1T6VL 3T36A 1IC7Y 3WMKA 3RW8A 5C6JA 153LA 4RW2A 4KXIA 1DKKA 4WM1A 1LJGA 5DN4A 5KXXA 3P68A 1B5YA 1LTMA 5L9JA 2ZYCA 1IR9A 1DI3A 1G7HC 193LA 2HEDA 5KXMA 4WL6A 3LHMA 4IATA 4KL7A 4G4CA 1QIOA 2YBJA 5KXRA 4WLDA 1BB5A 1JTTL 3AJNA 1LMQA 4MCKA 1BWHA 3AW7A 1OUJA 4L41A 3VWOA 4H8ZA 4HP0A 5KJ9A 1YAQA 2LZTA 1INUA 3CT0A 1XGRC 2DQIY 2W1XA 2ZYPA 3GXRA 4GLVA 3J4GA 4N9RA 5HNLA 4QGZA 5KXPA 3WPJA 3J6KA 3GXKA 1C7PA 1YKXX 1CKDA 2MEEA 4HPEA 1KXYA 4B4EA 1IC4Y 3QNGA 1I1ZA 1HEOA 1NDGC 1BB4A 1G7JC 4G4HA 4H94A 5LAGA 1IWXA 2ZIJA 1MELL 3AYQA 4HJVA 4HTQA 1GFJA 4N5RA 1LSFA 4NSIA 4WG7A 3T6UA 2BQDA 1B7OA 4XJIA 4DD9A 1CKGA 4DDAA 1GF3A 1DQJC 5I53A 2D4KA 1YAMA 1G7MC 1LMOA 4RLMA 1RI8B 1GDWA 4NGOA 4J7VA 1HSWA 2EKSC 5J7CA 4ANRA 2DQDY 1IY3A 2C8PA 2W1LA 1LSNA 4XYYA 2YBNA 2ZNWY 1IWTA 1E8LA 1GB0A 3AW6A 3A6CY 4CGEA 4RW1A 1VAUA 3EXDA 1KIQC 1UIHA 4NWEA 1LMAA 1B7RA 1G7IC 1GB6A 1WQPA 3BKVA 5II3A 5LVGA 1D0KA 1LHHA 3ZVQB 1LYYA 2RSCA 4LT0A 1HFZA 3LZ2A 1DI5A 4B1AA 2I26L 4LT1A 1OQMA 2MEBA 4DD7A 4LFXA 1LZ4A 4E3UA 1B9OA 1UICA 1YILA 1LJIA 3RT5X 1GFRA 5IELA 1JSFA 2B5ZA 4WLXA 1FLYA 1XGUC 1MLCE 1GFHA 4B0DA 4CHXA 3HBDA 4H9IA 2PC2A 1LAAA 5B1GA 1HC0A 4Z3MA 4TSCA 5APFA 1XEJA 4GCCA 1PS5A 5LVIA 2BQLA 4NGLA 1IVMA 3WU7A 4WO9A 2WARA 3TXJA 3AB6A 1N4FA 5APDA 3WU8A 4LT2A 1ZVHL 3LYZA 1C46A 4PRQA 3SP3A 1HENA 1ALCA 4O34A 4WMGA 4M4OA 1NWGA 1BVXA 3CQLA 4ET9A 3OJPA 1LKSA 1B5VA 2G4QA 4Z41A 4HTNA 1BWIA 3AZ5A 1OUHA 1B7SA 1C45A 1DI4A 2YDGA 5LA5A 3P65A 1LPIA 1LSYA 1PZYA 2BQMA 134LA 1B7NA 132LA 1LYZA 3A90A 1CNSA 1SQ2L 4WM6A 1B5ZA 4UWUA 1IWZA 1IX0A 1FKQA 1GBZA 2ZILA 4DT3A 1REXA 1IP3A 2MECA 1D9UA 3AGIA 4J1BA 3TMUA 5F16A 3TMVA 1JWRA 3WW5A 3KAMA 1WTMA 4DDCA 154LA 2MEDA 1F6SA 4TTDA 1GFUA 2HEBA 2XBRA 3TMWA 2MEFA 3BKHA 4DWXA 2BQBA 3LYTA 4ETCA 1FBIX 4XJDA 5KXNA 1KIPC 1TAYA 1YL1X 1B5WA 1OUDA 5FHWA 4ET8A 1HFXA 1CKFA 3WUMA 4GCBA 1RFPA 2F2NA 1GPQC 1IOSA 3M18B 4J1AA 4PRUA 1H6MA 4H9AA 4NGWA 3RU5A 1AZFA 2Z37A 5FDJA 1UA6Y 2BQIA 4P2EA 4XJGA 6LYZA 3B0KA 1WQOA 4GN4A 4XN6A 5KY1A 4ZIXA 6LYTA 1GWDA 2BQNA 2N5ZA 1KXXA 1LZ6A 1LHLA 1VEDA 1NQIA 5HMVA 3G3AB 5F9XA 1NMMA 1LZBA 1VDQA 1BB6A 1HFYA 4YEOA 4BAPA 4OWBA 4II8A 4RLNA 2FBBA 5LXWA 1A4VA 2BLYA 5B1FA 3TXDA 2CWIA 3WVYA 2DQEY 3A3RX 5FELA 2XJWA 5LVHA 5LIOA 3TXFA 4HJZA 1HEPA 2YBMA 1YQVY 2D91A 3P4ZA 4W94A 1YKYX 1OUGA 1LZ5A 1UIDA 1B0DA 1JTPL 2Z2EA 1GF6A 1YKZX 4H1PA 4OW1A 1ZMYL 2LZ2A 1WVVA 1GBOA 1IP5A 1VATA 4NGZA 3M3UA 1JHLA 4LFPA 135LA 1JIYA 1OUBA 1KXWA 1UIFA 4N8ZA 5F81A 1OP9B 2YBHA 1IIZA 3N9EA 3AGHA 1LZRA 3W6EA 1JTOL 1XGQC 1UIBA 3CSQA 2BQAA 4LYMA 4NSJA 4QY9A 3QY4A 1CKCA 2HEEA 1GEVA 1REZA 1TCYA 1D0MA 2H9KA 2F4AA 4CJ2A 1JUGA 1JEFA 4ZEEA 1BVKC 4WM3A 5FSTA 4G9SA 1FLQA 2HU3A 1GAZA 1J1OY 1QTEA 2I25L 4GCEA 5KXYA 3A91A 3WVXA 4GLAA 1DPXA 1LJHA 2BAAA 5EBHA 1LMNA 4OWAA 1XFPL 1LHIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4I7NA 4TSBA 1C08C 1L06A 2BQOA 2O4WA 2HTXA 4ARQA 1L79A 1IP1A 1CV5A 188LA 2NTGA 1LHJA 5HQ1A 2EQLA 4DC4A 3A8ZA 1TLAA 4FDYA 1DPWA 4OOTA 2ZQ4A 4NFVA 3A34A 4BAFA 195LA 4XJFA 5M1YA 220LA 3G3WA 1DKJA 4XADA 1GFAA 1GBSA 3QAKA 1LHKA 5E9RA 4B4IA 1G0GA 2NWDX 1GFVA 1G1VA 4H9EA 3C8QA 4W56A 2LHMA 2IHLA 1QT6A 5LAFA 4NGKA 1L43A 4I7SA 1I56A 1DYAA 1L94A 4DDBA 3B0OA 3DNAA 3SB9A 1C60A 2X0AA 2LYZA 1GF9A 1GF4A 1GEZA 4OO9A 3RNXA 2H5ZA 143LA 137LA 1LYOA 3OE0A 3SBAA 1HHLA 1OUAA 2MEHA 1L17A 2XBSA 2CDSA 4HV1A 3AZ6A 1L28A 3TXKA 4H92A 1GE3A 5KXTA 3WXUA 1C6BA 221LA 5B07A 224LA 4X3BA 2HU1A 2BPUA 3AGGG 1JKDA 1ZV5L 1GBWA 260LA 3CDTA 3CB7A 4N0JA 5F9UA 4LDEA 4WM5A 1L63A 5DLAA 5I4WA 4NHTA 3HWLA 1BB3A 262LA 1GXXA 1L04A 159LA 1L38A 1CJ7A 1C43A 2VB1A 4W96A 4I8SA 1HELA 5D5FA 2H9JA 5HMJA 4B49A 168LA 1P36A 3D3DA 4I7LA 1D2WA 1IP2A 3A6BY 4W57A 1OV5A 4PGJB 1NHBA 4YENA 1WQRA 147LA 150LA 3EBAB 4DQ5A 4IASA 3WULA 3C7ZA 4N1EI 1JSEA 3SN6R 2D4JA 1C65A 175LA 1GB7A 2DBTA 5DN5A 3AZ7A 1WTNA 5KXZA 1KY1A 1LJ3A 1L07A 1L13A 4BADA 1L92A 164LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2G4P A;  4KPM A;  4TSB A;  1WQQ A;  4DD1 A;  1C08 C;  1HF4 A;  2BQO A;  3WU9 A;  5LYM A;  5E4P A;  1LZG A;  1GB5 A;  1LOZ A;  2HTX A;  4XEN A;  1GE2 A;  3W6C A;  4HPI A;  4Z46 A;  1GAY A;  1JKA A;  4G4B A;  1EQ4 A;  1IP1 A;  1OUC A;  1XEK A;  5L3H A;  2MEG A;  4H8Y A;  3AZ4 A;  4LZT A;  5KKJ A;  1HMK A;  1LZ9 A;  1LHJ A;  3E3D A;  2MEI A;  5HQ1 A;  4I0C A;  2DQC Y;  2EQL A;  2YVB A;  5LA8 A;  1LCN A;  2F4G A;  3A8Z A;  4DC4 A;  3WH1 A;  1V7T A;  4FDY A;  1DPW A;  1GFG A;  4NG1 A;  4HV2 A;  1IR8 A;  4LT3 A;  1A2Y C;  1IWY A;  1QDT A;  2ZQ4 A;  4NFV A;  2LYM A;  4OOT A;  3ZVQ A;  1YRO A;  3A34 A;  3CSR A;  4BAF A;  4XJF A;  5M1Y A;  2AUB A;  4DD0 A;  1NKH A;  4NHS A;  1DKJ A;  3ATN A;  4DD3 A;  4OOO A;  1VDT A;  1GB2 A;  4XAD A;  3WYH A;  1BWJ A;  1GBS A;  1GFA A;  1LHK A;  5E9R A;  4B4I A;  5KXW A;  4OWH A;  4TWS A;  1VDP A;  5D5C A;  2IFF Y;  3IWR A;  3F6Z A;  1UBZ A;  2NWD X;  1GFV A;  4NIJ A;  2HUB A;  3WL2 A;  4LGK A;  1GXV 2;  1YAP A;  1G7L C;  4H9E A;  207L A;  1C10 A;  9LYZ A;  5JEN B; 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 1RFP A;  2F2N A;  1GPQ C;  1IOS A;  3M18 B;  4J1A A;  4PRU A;  1H6M A;  4H9A A;  4NGW A;  3RU5 A;  1AZF A;  2Z37 A;  5FDJ A;  1UA6 Y;  2BQI A;  4P2E A;  4XJG A;  6LYZ A;  3B0K A;  1WQO A;  4GN4 A;  4XN6 A;  5KY1 A;  4ZIX A;  6LYT A;  1GWD A;  2BQN A;  2N5Z A;  1KXX A;  1LZ6 A;  1LHL A;  1VED A;  1NQI A;  5HMV A;  3G3A B;  5F9X A;  1NMM A;  1LZB A;  1VDQ A;  1BB6 A;  1HFY A;  4YEO A;  4BAP A;  4OWB A;  4II8 A;  4RLN A;  2FBB A;  5LXW A;  1A4V A;  2BLY A;  5B1F A;  3TXD A;  2CWI A;  3WVY A;  2DQE Y;  3A3R X;  5FEL A;  2XJW A;  5LVH A;  5LIO A;  3TXF A;  4HJZ A;  1HEP A;  2YBM A;  1YQV Y;  2D91 A;  3P4Z A;  4W94 A;  1YKY X;  1OUG A;  1LZ5 A;  1UID A;  1B0D A;  1JTP L;  2Z2E A;  1GF6 A;  1YKZ X;  4H1P A;  4OW1 A;  1ZMY L;  2LZ2 A;  1WVV A;  1GBO A;  1IP5 A;  1VAT A;  4NGZ A;  3M3U A;  1JHL A;  4LFP A;  135L A;  1JIY A;  1OUB A;  1KXW A;  1UIF A;  4N8Z A;  5F81 A;  1OP9 B;  2YBH A;  1IIZ A;  3N9E A;  3AGH A;  1LZR A;  3W6E A;  1JTO L;  1XGQ C;  1UIB A;  3CSQ A;  2BQA A;  4LYM A;  4NSJ A;  4QY9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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