1BB5A

Human lysozyme mutant a96l complexed with chitotriose
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACLKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords LYSOZYME
total genus 50
structure length 130
sequence length 130
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1bb5A00
1GFHA 3A6BY 2C8PA 1IR9A 4NFVA 2BQFA 4DWXA 2Z2FA 1LJNA 4LYBA 1LHKA 1YROA 1BWHA 2BAAA 4NGLA 5KXKA 1LSZA 2ZNXY 1C45A 1XGTC 4NHPA 2HEBA 3P68A 4N1EI 5LXWA 1HNLA 3WUAA 4PRUA 1LJ4A 3CSZA 1NWGA 4H8XA 1UACY 2XJWA 4PGJB 1RJCB 3CQLA 3AGIA 4NGZA 4DD2A 1LZCA 1GF9A 5B1GA 1HELA 1YAMA 1KIRC 4ET8A 4OOTA 1I1ZA 1LMNA 5LA8A 1W08A 3A8ZA 3WH1A 5T3FA 2N5ZA 4KT3A 4WMGA 1GDXA 4B4EA 1GFEA 2BQLA 4KL7A 1ALCA 1GE1A 4GN4A 5KXXA 1LPIA 1YKXX 2DQDY 1GF7A 1GF8A 3AW6A 1LHMA 2NWDX 4J1AA 4LFXA 4DC4A 4DDAA 4ETCA 2IHLA 4RLMA 4ZEEA 3AZ5A 1IP4A 1D6PA 2MEDA 4XJHA 1LHHA 4YF2A 4H90A 4CJ2A 4ETDA 3CSRA 4DDBA 1CKHA 1ZV5L 1B0DA 1HFZA 3GXRA 3TXIA 3OK0A 1BHZA 2BQKA 3ZVQA 2H5ZA 1IP5A 1QQYA 2ZYCA 1HC0A 1FN5A 1VAUA 1DKKA 4NSHA 2ZYPA 1LYZA 1LYSA 4TTDA 4XADA 1IWVA 1GB8A 1TCYA 1B2KA 1OUHA 1RI8B 1GB5A 1LMCA 1GFGA 1YANA 2BQGA 2GV0A 3RNXA 3CT0A 3W6AA 3AYQA 4H9BA 4L41A 2DQCY 8LYZA 4WM1A 2X0AA 1LZTA 1LAAA 5KKJA 1LZGA 1QTEA 2CDSA 2Z2EA 2RSCA 1LZBA 4WLTA 1GEZA 1WQRA 1LSGA 3W3EA 1IR8A 1A2YC 1DZBX 4RDSA 3P64A 1NHEA 5KXWA 1C08C 208LA 2MEAA 4TWSA 2DKVA 1IR7A 154LA 4NGVA 1EQ5A 1GD6A 1LSAA 1UIEA 4GCBA 1QIOA 1WQQA 1GAYA 5KXYA 1IP1A 134LA 1NDMC 2D91A 2HU1A 4BS7A 5LA5A 1B7PA 1C46A 1WQPA 3J4GA 3TMXA 1GF0A 1IY4A 3A90A 3A34A 4NGOA 1JISA 1GFUA 4WL7A 3LYTA 2W1MA 3OJPA 2D4IA 1KXXA 1B7OA 1UIDA 3M18B 1XGUC 1WQOA 5I4XA 5IELA 1LSFA 3A94A 2MEEA 1JJ0A 1JKDA 4H93A 4DD0A 3EO5A 2YVBA 1LHJA 1B7MA 193LA 1H87A 4ETEA 1C10A 2CJLA 133LA 1QUSA 3AB6A 3KAMA 4H9HA 4LZTA 2HECA 1FLWA 4DD7A 1LZ9A 2DQEY 3TXBA 1CJ6A 1XEIA 4TUNA 4Z3MA 2BQIA 4M6DA 5L9JA 2Z19A 1IC4Y 2D6BA 1IIZA 4WM6A 1LMAA 3AGGG 1GFKA 4XJBA 4H9FA 2MEIA 3WVYA 5LVHA 1LSMA 2EKSC 5L3IA 1LHLA 1WVVA 2W1YA 5HNCA 1DQJC 1LMTA 3ATOA 2D4KA 5APEA 1CJ7A 1GBZA 1TAYA 1B7NA 1HERA 4B0DA 5LINA 1UIGA 3W6CA 3WU8A 3WW6A 3WUNA 2LZ2A 4HPEA 5L3HA 4HJZA 5KXZA 1D6QA 4D9ZA 1BB7A 1NF5A 1KIPC 1JUGA 4B4JA 4ML7A 3N9CA 153LA 2XBSA 5KY1A 3EMSA 1B5XA 3WU7A 4MCKA 1LJHA 4EMNA 4LYZA 2ZNWY 2BQBA 1V7TA 5IDDA 4GN5C 4AXTA 3P66A 2I26L 3A67Y 4FDYA 4OWBA 4WM5A 1HMKA 5KXTA 1LMPA 1XGRC 3ULRA 4H9EA 1LSEA 4H9IA 4OW1A 3A3RX 4NEBA 3WPJA 1JTTL 1LSDA 1JHLA 2LYOA 1UA6Y 2MEFA 3EBAB 3TXEA 1YAPA 4NHIA 1LZ1A 3WU9A 132LA 1GE2A 1P2CC 1REZA 1IOSA 1GBXA 1LZRA 3LZ2A 2HEEA 1KXWA 3HBHA 4B1AA 4C3WA 1LKSA 2BPUA 1GFRA 1BVXA 3D9AC 5LVGA 1LZSA 1J1XY 2D4JA 3GXKA 4WLDA 1LHIA 2IFFY 3RW8A 1B9OA 2G4PA 3D3DA 5F9XA 5B59A 1AKIA 5B05A 4ANRA 4ETBA 3TXHA 1EQEA 4YENA 3QY4A 1FLUA 4ET9A 2HUBA 5M1YA 1IWWA 3BKVA 4E3UA 1CKGA 4QGZA 1IWYA 5AMYA 1LTMA 2DQHY 4HV2A 1LSBA 5B07A 2F2NA 4MR1A 4H91A 3WYHA 4UWUA 4OOOA 1T6VL 2YBHA 5KXOA 1GXXA 135LA 2MEHA 2MECA 4H94A 2EPEA 1F10A 1LMOA 4LFPA 4WL6A 4WM2A 1BWJA 1BQLY 4OWEA 4J1BA 4DD1A 2F4GA 1GF3A 1GPQC 1QSWA 1WVUA 4NGYA 1YL0X 1CKFA 1LSNA 4WO9A 1YAQA 2W1LA 3MGWA 4I8SA 1IWZA 1G7HC 1VDPA 1DKJA 1PZYA 2BQCA 1CJ8A 4WOAA 3TXGA 4CFPA 2DQFC 2BQOA 3K3TA 4FJRA 4LYTA 5ILCA 1GFJA 4QDNA 4RLNA 1XGPC 1GF5A 1GE0A 3AJNA 2ZQ4A 3B0KA 1IC5Y 1MLCE 3WULA 1VATA 1GWDA 4HP0A 2BQNA 1B7QA 1GXV2 4QEQA 5D5FA 1NBYC 3FE0A 3LYOA 1B5UA 1SLYA 4RW1A 1FLQA 1GB2A 4UWNA 5FHWA 1UIAA 2C8OA 5I4YA 4LT2A 1LZ5A 1BWIA 5KXMA 5C6IA 2FYDA 2Z39A 2YSSC 1JITA 3A95A 3TXFA 3WPKA 2HTXA 4BADA 9LYZA 5LVIA 2Z38A 4HV1A 5FCPA 3F6ZA 1N4FA 1XEKA 4NIJA 3A92A 2FYCA 1LCNA 1HSXA 5E4PA 1LJEA 1T3PA 1UIBA 1XEJA 1IORA 3QNGA 5LYTA 4B49A 3LN2A 4HSFA 3CSQA 1FDLY 4XJIA 1Z55A 4HJYA 7LYZA 3WMKA 5F14A 3M3UA 2BQDA 4LYOA 1RCMA 5APCA 1GAZA 4P2EA 5FDJA 4NHSA 5LYMA 3P65A 4G4HA 2LZTA 4PRQA 2I25L 3N9AA 4LT1A 1VDSA 4TSCA 4NY5A 4XENA 1C43A 4ZFPA 1BVKC 3WVXA 1LKRA 1REMA 4Z41A 1RFPA 1NDGC 1RE2A 1LJGA 1REYA 1IOTA 1GF4A 1JWRA 4OWHA 1LZ4A 2F4AA 1J1PY 5D5CA 1UICA 2Z37A 3A93A 3WL2A 1E8LA 2YBNA 1B7RA 4PPOA 1B7LA 1HEQA 1IEEA 1QTKA 3HBEX 1QDTA 2ZIKA 5HMVA 3RZ4A 1JKBA 3LYZA 4ETAA 1GFTA 3A96A 1B5YA 2BQEA 1HMLA 5J7CA 1JKCA 4XN6A 1LZEA 2DQJY 4R0FA 5F9UA 4WLXA 5II3A 1LSYA 1B5VA 1DPXA 1HSWA 2W1XA 3HFMY 1INUA 4GN3A 1JIYA 4LT3A 4W94A 4GLAA 1ZVYB 4KXIA 1XFPL 1VDQA 5APFA 1IP7A 1LMQA 3AW7A 4DT3A 5A3ZA 1TBYA 2PC2A 4XJFA 4WG1A 1IOQA 1CJ9A 1YL1X 5I53A 2YBMA 1GFVA 1REXA 3TMUA 4HTQA 1IWTA 5KXNA 1IOCA 1IO5A 1YKZX 3AZ4A 4W96A 5LVKA 1QUTA 1J1OY 3AZ6A 1HEWA 1WTMA 4BAFA 4NWEA 5FEKA 1BGIA 3ZVQB 2BLYA 5LYZA 5I5QA 1C7PA 3T6UA 3ZEKA 3G3BB 5A3EA 5HLLA 1WQMA 1LSCA 1WQNA 1LZ6A 1WTNA 1GE3A 4WM4A 1I56A 3N9EA 1OUCA 1F0WA 1HF4A 2LYMA 3A6CY 4XYYA 3LHMA 1JKAA 4DD3A 5KXRA 5LAGA 1YILA 4YEMA 5I4WA 2MEBA 4NSGA 4TSBA 1GBWA 3TXJA 5F16A 4H1PA 4LYCA 5EBHA 2BLXA 5APDA 1IVMA 1QSAA 1LJIA 4BAPA 1TEWA 1AM7A 1UUZC 4IATA 4OWCA 4ZIXA 2HEFA 4N8ZA 1OUGA 1I20A 2YDGA 4HTKA 1CKCA 1FKVA 3P4ZA 5HQ1A 1NKHA 3B72A 4CGEA 5FELA 5KXPA 1JPOA 1OUJA 5DL9A 1YAOA 5I54A 5FSTA 1TDYA 2I6ZA 4M4OA 2LHMA 2DQIY 1MELL 4EOFA 4NHQA 4UWVA 1OUDA 4NGIA 5B06A 1IC7Y 1GEVA 1OQMA 1JTPL 1FBIX 2ZWBA 1HFXA 3EXDA 3IJVA 5DM9A 3W6DA 2Z18A 4NHTA 3SP3A 4N5RA 1GB3A 2CGIA 1VFBC 3FI7A 1DI5A 2Y8PA 3LZTA 4TX7A 4WO6A 2MEGA 1JJ3A 1D0MA 1LYOA 2BQHA 1W6ZA 5C6LA 1HHLA 2ZIJA 2YBJA 1JTOL 2F30A 4YOPA 4H9CA 4XJGA 2EQLA 5HNLA 3TMWA 1GBOA 4X3BA 4Z46A 1QDRA 4CFOA 1LZAA 4N1CC 3W6EA 2BQJA 1OP9B 2HEDA 1BB5A 2HEAA 4DDCA 1GBYA 3T36A 1DPWA 1IP6A 1UBZA 1LJFA 4H9AA 5LIOA 2G4QA 4LT0A 1XGQC 3WXTA 4B4IA 1OUFA 3IJUA 4WLYA 4NGWA 4HPIA 1LZ8A 5B1FA 194LA 1IWUA 1HEMA 2CWIA 4N0JA 3W6BA 1BB4A 1LOZA 2FBDA 1B5WA 1G7IC 1G7MC 1GE4A 3BKHA 4I0CA 1SQ2L 4NGJA 4WM3A 5LVJA 207LA 2BQAA 2H9JA 1G7LC 1OUIA 1KIQC 4WG7A 1IY3A 5E9RA 5LAFA 1AT5A 2XTHA 1LJKA 5KJ9A 3CT1A 1CNSA 1NMMA 4U3XB 1JSFA 3TMVA 3A3QA 1JEFA 4N9RA 1OUBA 1LSPA 4OWAA 4R6CA 4HTNA 1AZFA 1B5ZA 1GB6A 2BQMA 2HU3A 1OUEA 1EL1A 1EQ4A 5DLAA 6LYTA 2WARA 3E3DA 2XBRA 4IASA 4NG1A 1BB6A 5KXSA 1LZDA 1KXYA 1VEDA 1D0LA 3WXUA 1HFYA 3RT5X 4A7DA 5KKIA 5KXLA 2DQAA 1GFAA 2G4NA 4XJDA 2A7FA 1DXJA 4G9SA 1ZMYL 4GCCA 4Z98A 3IWRA 3AGHA 4NSIA 1DI3A 1O23A 1GHLA 1IWXA 2DBTA 4H92A 4G4BA 3WPLA 1LZYA 4GLVA 3G3AB 1FKQA 4GCDA 4RW2A 1YIKA 4G49A 3B6LA 1JJ1A 3CT5A 4PHIA 3AZ7A 1IX0A 2Q0MX 2ZQ3A 1GDWA 4O34A 1FLYA 2EIZC 3J6KA 3B0OA 4YEOA 4C5FA 1OUAA 4DYGA 1IP3A 4NSJA 1F6RA 1B7SA 5ILFA 3B0IA 3LYMA 1F6SA 2Z12A 1G7JC 1GBSA 4KPMA 3A91A 3RU5A 1UCOA 1ZVHL 5DN5A 3WW5A 4PJ2C 1YKYX 3WUMA 1HEOA 4DD9A 1D9UA 1UIHA 1BB3A 4J7VA 1GB0A 4IJ4A 1GB9A 1VDTA 2H9KA 1UC0A 2DQGY 4LGKA 2ZILA 1JSEA 4NWHA 4NGKA 1CKDA 4CHXA 4GCEA 5IHGA 2VB1A 2AUBA 4LYMA 1GF6A 2YBIA 1LYYA 4NG8A 5F81A 1YQVY 2YBLA 4MSTA 3TXKA 1GB7A 1D0KA 1LJ3A 1A4VA 2A7DA 3HBDA 1PS5A 1NQIA 5JENB 3W6FA 1IP2A 3VWOA 4H8ZA 5DN4A 1HENA 1XSFA 5K7OA 3ATNA 4HJVA 3CB7A 4II8A 4QY9A 1LJJA 4GCFA 1V7SA 1AT6A 1LZNA 4H8YA 1DI4A 3QE8A 4AGAA 1UIFA 2FBBA 1NBZC 4G4CA 6LYZA 1H6MA 3TXDA 1HEPA 4YM8A 5HMJA 2B5ZA 2LYZA 4J0LA 5C6JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2C8PA 1IR9A 1LJNA 4LYBA 2BAAA 1LSZA 3OE9A 1XGTC 4W58A 2HEBA 4N1EI 5LXWA 4DD2A 3AGIA 1L47A 1HELA 1YAMA 1I1ZA 3WH1A 2BQLA 1ALCA 4GN4A 4J1AA 2HUKA 4ETCA 139LA 1L99A 3AZ5A 3FADA 4YF2A 1QTBA 3OE8A 4CJ2A 253LA 3GXRA 1L83A 3HT8A 3ZVQA 1IP5A 1QQYA 1FN5A 1VAUA 4NSHA 2ZYPA 4TTDA 1IWVA 1YANA 1GB5A 4DQ7A 2NTGA 166LA 233LA 2DQCY 1LZTA 3SBBC 108LA 1LZGA 1QTEA 2CDSA 3W3EA 2RH1A 1IR8A 1L07A 208LA 2MEAA 4TWSA 2DKVA 1QT6A 154LA 3HTGA 1WQQA 2D91A 2HU1A 5LA5A 1C6GA 1WQPA 3J4GA 3TMXA 110LA 3OJPA 1B7OA 3L2XA 3M18B 3A94A 1XEPA 1B7MA 4ETEA 141LA 3AB6A 3KAMA 4I7MA 2HECA 1C65A 4DD7A 1LZ9A 2DQEY 3TXBA 1CJ6A 1G0QA 237LA 235LA 4TUNA 5L9JA 4WM6A 1QTDA 231LA 4H9FA 1LSMA 5L3IA 162LA 1LHLA 1P56A 1WVVA 1C62A 1PQIA 1TLAA 1HERA 4B0DA 5LINA 1UIGA 3WU8A 3WW6A 1L25A 1L39A 220LA 1D6QA 4D9ZA 1KIPC 1JUGA 4B4JA 128LA 3EMLA 153LA 3EMSA 107LA 1XJUA 4FDYA 4WM5A 4OWBA 3ULRA 1LSEA 4H9IA 1JTTL 1LSDA 1UA6Y 1CV0A 1YAPA 1L88A 132LA 3LZ2A 2HEEA 4B1AA 3C7WA 1BVXA 1LZSA 2D4JA 1L29A 2G4PA 5F9XA 1CU6A 4ETBA 1EQEA 4YENA 1OVJA 4I7SA 4QGZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1GFH A;  3A6B Y;  2C8P A;  1IR9 A;  4NFV A;  2BQF A;  4DWX A;  2Z2F A;  1LJN A;  4LYB A;  1LHK A;  1YRO A;  1BWH A;  2BAA A;  4NGL A;  5KXK A;  1LSZ A;  2ZNX Y;  1C45 A;  1XGT C;  4NHP A;  2HEB A;  3P68 A;  4N1E I;  5LXW A;  1HNL A;  3WUA A;  4PRU A;  1LJ4 A;  3CSZ A;  1NWG A;  4H8X A;  1UAC Y;  2XJW A;  4PGJ B;  1RJC B;  3CQL A;  3AGI A;  4NGZ A;  4DD2 A;  1LZC A;  1GF9 A;  5B1G A;  1HEL A;  1YAM A;  1KIR C;  4ET8 A;  4OOT A;  1I1Z A;  1LMN A;  5LA8 A;  1W08 A;  3A8Z A;  3WH1 A;  5T3F A;  2N5Z A;  4KT3 A;  4WMG A;  1GDX A;  4B4E A;  1GFE A;  2BQL A;  4KL7 A;  1ALC A;  1GE1 A;  4GN4 A;  5KXX A;  1LPI A;  1YKX X;  2DQD Y;  1GF7 A;  1GF8 A;  3AW6 A;  1LHM A;  2NWD X;  4J1A A;  4LFX A;  4DC4 A;  4DDA A;  4ETC A;  2IHL A;  4RLM A;  4ZEE A;  3AZ5 A;  1IP4 A;  1D6P A;  2MED A;  4XJH A;  1LHH A;  4YF2 A;  4H90 A;  4CJ2 A;  4ETD A;  3CSR A;  4DDB A;  1CKH A;  1ZV5 L;  1B0D A;  1HFZ A;  3GXR A;  3TXI A;  3OK0 A;  1BHZ A;  2BQK A;  3ZVQ A;  2H5Z A;  1IP5 A;  1QQY A;  2ZYC A;  1HC0 A;  1FN5 A;  1VAU A; 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 5KXL A;  2DQA A;  1GFA A;  2G4N A;  4XJD A;  2A7F A;  1DXJ A;  4G9S A;  1ZMY L;  4GCC A;  4Z98 A;  3IWR A;  3AGH A;  4NSI A;  1DI3 A;  1O23 A;  1GHL A;  1IWX A;  2DBT A;  4H92 A;  4G4B A;  3WPL A;  1LZY A;  4GLV A;  3G3A B;  1FKQ A;  4GCD A;  4RW2 A;  1YIK A;  4G49 A;  3B6L A;  1JJ1 A;  3CT5 A;  4PHI A;  3AZ7 A;  1IX0 A;  2Q0M X;  2ZQ3 A;  1GDW A;  4O34 A;  1FLY A;  2EIZ C;  3J6K A;  3B0O A;  4YEO A;  4C5F A;  1OUA A;  4DYG A;  1IP3 A;  4NSJ A;  1F6R A;  1B7S A;  5ILF A;  3B0I A;  3LYM A;  1F6S A;  2Z12 A;  1G7J C;  1GBS A;  4KPM A;  3A91 A;  3RU5 A;  1UCO A;  1ZVH L;  5DN5 A;  3WW5 A;  4PJ2 C;  1YKY X;  3WUM A;  1HEO A;  4DD9 A;  1D9U A;  1UIH A;  1BB3 A;  4J7V A;  1GB0 A;  4IJ4 A;  1GB9 A;  1VDT A;  2H9K A;  1UC0 A;  2DQG Y;  4LGK A;  2ZIL A;  1JSE A;  4NWH A;  4NGK A;  1CKD A;  4CHX A;  4GCE A;  5IHG A;  2VB1 A;  2AUB A;  4LYM A;  1GF6 A;  2YBI A;  1LYY A;  4NG8 A;  5F81 A;  1YQV Y;  2YBL A;  4MST A;  3TXK A;  1GB7 A;  1D0K A;  1LJ3 A;  1A4V A;  2A7D A;  3HBD A;  1PS5 A;  1NQI A;  5JEN B; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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