1BB5A

Human lysozyme mutant a96l complexed with chitotriose
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACLKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 130
sequence length 130
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-04-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1bb5A00
1BB6A 1QDTA 2YDGA 1IC7Y 1FN5A 1P2CC 4H91A 4ETEA 1EQ5A 2LZTA 1FKVA 4N8ZA 4LFXA 4NWEA 3P4ZA 2EQLA 1GE0A 3ZVQA 1UICA 2IFFY 5J7CA 1C08C 4B49A 5C6JA 5FEKA 1DI4A 1BB4A 1N4FA 4WM1A 3B6LA 3RW8A 1I1ZA 2ZWBA 3BKVA 1OQMA 1UCOA 2DQDY 2RSCA 4DDBA 1AT5A 4DD7A 5IDDA 1NKHA 2NWDX 1BWIA 5LVIA 2F2NA 1KXXA 1LMTA 2HECA 5I54A 4M4OA 2C8PA 1LZ8A 2A7DA 1CKHA 1CJ8A 1IWUA 4ET8A 1YL1X 1WTMA 2EKSC 3A90A 1LHMA 1HERA 3WW6A 1D6PA 4RLNA 1LSFA 1HFZA 4DD2A 5KKJA 1B7SA 2LHMA 5KKIA 1GFUA 1DZBX 3CT1A 2D6BA 1IOCA 1VATA 1DKJA 1T6VL 1UIAA 4I0CA 3EO5A 1IP4A 2BQOA 5KXLA 4H90A 1KXWA 1OUJA 4HTQA 1C10A 1LMQA 1TEWA 3A6CY 1NMMA 4NGOA 4ML7A 1GAZA 2DQHY 4J1BA 5KXZA 1GB3A 3TMWA 4DWXA 5AMYA 4H9AA 1GE2A 1LZYA 4XADA 1GB2A 5LAFA 4WOAA 2WARA 4LT2A 1REXA 1HFYA 4GCBA 1HEMA 1OP9B 3EMSA 5D5CA 7LYZA 5LYTA 1GWDA 1PZYA 4ANRA 4GLVA 1AM7A 4BS7A 3VWOA 1JKCA 1LZBA 4GCEA 4WL7A 1BQLY 4BAPA 4N9RA 3LHMA 4ZIXA 1B7OA 4U3XB 1KIQC 1OUGA 3TXIA 1C45A 1YANA 2BLXA 2D91A 4D9ZA 4NGJA 3CSRA 1GDXA 4LT0A 1LJ4A 2MEIA 4KXIA 2YBLA 1ALCA 1UIBA 3HFMY 1XEIA 3LYZA 1HEWA 5LA8A 2F4AA 4NSIA 3WXUA 1IR9A 4UWNA 1IO5A 1BB3A 1LJHA 4XN6A 1HEQA 3A67Y 1OUFA 1JJ0A 1YL0X 2G4NA 1LJJA 1UIEA 4YOPA 1GFTA 6LYTA 3M3UA 5K7OA 1QSWA 1GBYA 135LA 1IP3A 2BQJA 3A94A 1OUBA 2LZ2A 1C43A 1YAMA 1SLYA 1A2YC 3B0KA 5F16A 5DL9A 2YBHA 1LZAA 2BQKA 3WVXA 1QSAA 1HMKA 5FELA 1UC0A 2VB1A 1VAUA 2C8OA 133LA 5HMVA 3A6BY 3CT0A 5HMJA 3CSZA 4HP0A 1QUSA 1UIDA 5I53A 4WL6A 1IY4A 3AZ7A 4OWAA 1LHLA 4NHTA 3N9CA 5JENB 1DQJC 3W6BA 3B0IA 1LHJA 2BQMA 1WTNA 5T3FA 3W6EA 132LA 3HBHA 4G4HA 4IATA 1REMA 2DKVA 4BADA 3TXDA 4J0LA 1GF7A 1HELA 1LSMA 2Z18A 1LPIA 3P64A 4LT3A 5LA5A 2G4QA 4Z46A 1CKDA 3ZEKA 3HBDA 1IC5Y 1C7PA 2YBMA 3TXKA 3A3QA 3CQLA 4NSJA 2BQLA 1GE3A 5LINA 4GN4A 1NF5A 3SP3A 3TMUA 1WQPA 1BB5A 4LYTA 4RW1A 1V7TA 3RT5X 1LCNA 2MEAA 4II8A 3W3EA 5B05A 1HC0A 1RI8B 1F6RA 2I25L 2ZYCA 4UWUA 5DM9A 1IC4Y 1TDYA 4H9EA 3A93A 5LYMA 4NG8A 4O34A 1BVXA 1CKFA 2EIZC 2ZNXY 4N0JA 5KXRA 4DDCA 2Z37A 1GF4A 1QTEA 2FBDA 4CFPA 1G7JC 3B72A 3WYHA 4YEMA 1GBOA 1DXJA 1JTTL 4N1EI 1LSDA 2CDSA 2HEAA 3IJUA 4C5FA 4HTNA 3QE8A 1G7IC 3J6KA 4NHQA 1LAAA 3WPLA 4KL7A 1YQVY 1UACY 4WLTA 5LVJA 1LSYA 3QY4A 1IOTA 3T36A 5LAGA 193LA 2D4IA 2AUBA 3QNGA 3LZ2A 1LZEA 4BAFA 1F10A 2A7FA 4M6DA 4NGZA 1GB9A 5ILCA 1NDGC 4I8SA 4MCKA 4N5RA 3WVYA 1GF8A 5KXYA 2DQJY 1B9OA 5II3A 5LXWA 4TWSA 1J1PY 153LA 1AZFA 4KPMA 1VEDA 1H6MA 1YROA 1BVKC 3AGHA 3WULA 1GF9A 1QIOA 194LA 1GE4A 1LZRA 2ZIJA 1OUAA 1UIHA 4H9HA 4HV2A 5LYZA 5KXOA 4NGWA 4MSTA 5B06A 1UUZC 1GFGA 4WLDA 1JTPL 1WVUA 4CGEA 4XJHA 1QQYA 4HPIA 3J4GA 1IWZA 4DD1A 4H9FA 4HSFA 4H94A 2MEGA 1LJEA 4AXTA 4WM6A 1LSPA 3AW7A 4XJDA 3WW5A 1LZDA 1XGQC 4NSGA 1VDPA 1GXV2 2DQCY 1B5YA 1VFBC 1LYOA 1NQIA 1GB5A 1IOSA 1JUGA 2BQIA 2W1LA 3LYOA 5A3EA 4DD9A 1YAPA 1LOZA 1LMOA 3TMXA 5KXSA 2I26L 5KXWA 1LJNA 3F6ZA 2B5ZA 1GB7A 4TUNA 3ZVQB 4H9CA 4WG7A 4ETAA 2DQEY 3RU5A 8LYZA 1GFEA 4HJVA 4OOTA 4WM3A 4XJIA 5KXMA 1CJ9A 1D0KA 1WQQA 1IY3A 2HTXA 3AZ6A 4HV1A 1FLQA 1GD6A 1QDRA 1GF3A 1B7LA 2BQNA 4KT3A 4DT3A 3WL2A 1RCMA 2X0AA 3A92A 5HNCA 1NDMC 5HNLA 1B5VA 1WQMA 2Z12A 4WM4A 1JKDA 5E4PA 4DD3A 4LYBA 5I4WA 1NBZC 5L3HA 4AGAA 4IJ4A 4G4CA 1RJCB 4IASA 4LZTA 1D0MA 5HLLA 2W1YA 3AGGG 1LSBA 4LT1A 1LSNA 4NHSA 1GEVA 1BB7A 1LZCA 4ETBA 2DQFC 207LA 4H92A 3WXTA 4Z3MA 4B1AA 2Z2EA 2ZYPA 4WM5A 3TXBA 4H9IA 5C6LA 1W6ZA 1YKXX 2PC2A 3EBAB 1F0WA 1IR7A 1GBSA 4CJ2A 3W6AA 1GF6A 2MEHA 1IP6A 3E3DA 1GHLA 1VDSA 2ZQ4A 1LSZA 1TAYA 1GF5A 4RDSA 5D5FA 2F4GA 4LYCA 4A7DA 4B4JA 5KXNA 2LYOA 1A4VA 3WPKA 2BLYA 5L3IA 4HPEA 1YIKA 5KY1A 5APCA 1XSFA 5FSTA 1IR8A 1JKBA 1HENA 2I6ZA 1J1XY 1OUEA 2D4KA 1JIYA 3AB6A 4X3BA 5I4YA 4QGZA 4XJBA 1KIPC 1JPOA 4LYOA 3MGWA 4WO6A 3ATOA 1GPQC 1B7RA 3LZTA 4G49A 4NHIA 1LHIA 4E3UA 5LVHA 1IOQA 2CWIA 3W6DA 4QY9A 1I20A 1WQRA 1HNLA 3G3BB 1IP5A 4LYZA 1BGIA 1KIRC 3WU8A 1PS5A 1XGUC 4YEOA 5ILFA 1GBWA 4HJYA 3TXEA 3BKHA 1GFHA 2HU1A 1JJ3A 1IWXA 2H5ZA 4NIJA 4WLYA 4ETDA 4LYMA 3CB7A 3GXKA 2HEFA 5DN5A 2H9JA 1IWVA 1REYA 1LHHA 4TSCA 4NY5A 1ZVYB 3TXJA 208LA 4L41A 4NHPA 3W6FA 4H9BA 3G3AB 3AYQA 4H8ZA 4XJGA 3P65A 1GAYA 1HMLA 1E8LA 3T6UA 4ZFPA 1DKKA 3LYTA 3P66A 3TXGA 1I56A 2MEDA 4OWEA 4WO9A 3AGIA 5F9XA 3N9AA 4GN5C 1LSGA 4YM8A 4J7VA 1IVMA 2YSSC 2DQAA 1OUCA 1FLUA 1LYYA 1GB6A 3HBEX 3FI7A 4N1CC 1RE2A 1KXYA 1O23A 2HEDA 2Z38A 1WQNA 3ATNA 3EXDA 4NGIA 2Z2FA 4R0FA 3K3TA 2LYZA 4GCDA 1B5WA 4NG1A 3RNXA 1UBZA 1YILA 2H9KA 5I5QA 9LYZA 4NEBA 3D9AC 3N9EA 1XGPC 4C3WA 1LJFA 4ETCA 1LZTA 4G4BA 1HFXA 1LJKA 3A91A 4CFOA 5L9JA 3WUAA 1H87A 1W08A 4RW2A 1ZVHL 4OOOA 1UA6Y 4NSHA 4LGKA 4TSBA 1IX0A 154LA 4WG1A 1LZ9A 1FDLY 5E9RA 4G9SA 1FBIX 4XENA 1FLWA 1MLCE 3M18B 1MELL 1IP1A 2EPEA 3IJVA 1INUA 3LN2A 1IWWA 3WUMA 1VDTA 1CNSA 1J1OY 1BWJA 2YBIA 5B59A 1B5UA 1B7PA 1LJ3A 1QTKA 1BWHA 2XTHA 3ULRA 1Z55A 1D0LA 1GDWA 1NBYC 3GXRA 1CJ6A 2Z19A 1GFRA 2BQBA 2Z39A 1G7LC 1C46A 1IORA 1LZGA 5DN4A 4WMGA 1TBYA 1NWGA 1UIFA 2MEFA 1JJ1A 2N5ZA 1GBZA 1GBXA 2HU3A 2DQGY 1IIZA 5KXXA 5B07A 3A96A 2BQAA 2FBBA 2ZNWY 1EQEA 1JWRA 1LMNA 3AW6A 3B0OA 1GB8A 5B1FA 4Z98A 4EMNA 5F9UA 1B7QA 1B5XA 1DI3A 1XEKA 2F30A 4PPOA 2LYMA 4HTKA 4B4IA 3WH1A 4FDYA 4NGLA 4H1PA 4XYYA 134LA 1OUDA 2BQEA 4GLAA 1WQOA 5M1YA 3RZ4A 4GN3A 4ZEEA 1AT6A 1LTMA 1YKZX 4MR1A 4H8XA 1XGTC 1SQ2L 2HEBA 2W1XA 5APDA 5IHGA 4PRQA 5KXTA 1DPWA 1LYSA 1QUTA 2BAAA 1LKSA 1LYZA 4WM2A 1YKYX 4XJFA 2YBJA 2BQCA 4QDNA 4R6CA 1IEEA 3P68A 3KAMA 5FCPA 2D4JA 2FYDA 1B0DA 4RLMA 2XBSA 1NHEA 1XFPL 1G7HC 5F81A 1LJIA 1LJGA 5C6IA 1GFAA 4TX7A 1YAOA 1JEFA 4OW1A 5KJ9A 2BQDA 1IWYA 2ZILA 5EBHA 1GEZA 5LVGA 5FDJA 2CJLA 5LVKA 1IWTA 1HEPA 1LZ5A 3OK0A 1FLYA 4GCCA 4P2EA 1HHLA 1LZ6A 1EL1A 2HUBA 5APEA 3CSQA 3IWRA 2YVBA 4NGVA 2BQGA 1LMCA 1IP7A 4B0DA 5KXKA 2W1MA 1LSAA 3D3DA 4H93A 1AKIA 3TXFA 1OUIA 2XBRA 1BHZA 2DBTA 3WMKA 1HEOA 4QEQA 4YENA 2CGIA 5LIOA 1FKQA 3W6CA 2Y8PA 1GF0A 1D6QA 1F6SA 1WVVA 1OUHA 3TMVA 3OJPA 1XGRC 4UWVA 4DD0A 1DI5A 1ZV5L 4CHXA 1HSXA 3WUNA 5DLAA 3A8ZA 4WLXA 2MEEA 1VDQA 3WPJA 5HQ1A 3A3RX 1JTOL 5F14A 1UIGA 4PHIA 1DPXA 1HSWA 1T3PA 2DQIY 1LSEA 4PJ2C 2GV0A 4DYGA 5B1GA 1LSCA 1LHKA 3AJNA 1LZ4A 4DDAA 2BQHA 2MECA 1LZSA 4LFPA 4HJZA 4DC4A 5IELA 4YF2A 1GFJA 4GCFA 2YBNA 1LZNA 1B7NA 3TXHA 1LZ1A 1G7MC 1REZA 3LYMA 1GXXA 2MEBA 1JISA 4OWBA 1JKAA 1D9UA 1JSFA 1ZMYL 5I4XA 4W94A 2FYCA 1HF4A 4J1AA 5FHWA 3A34A 6LYZA 3A95A 3FE0A 2BPUA 1LKRA 2ZIKA 1V7SA 2ZQ3A 4FJRA 2G4PA 4NWHA 4TTDA 3WU7A 1JHLA 2HEEA 1GB0A 2IHLA 1JSEA 5KXPA 4ET9A 1GFKA 1CJ7A 3AZ5A 1CKCA 5A3ZA 1YAQA 1RFPA 2BQFA 2XJWA 4OWCA 4PGJB 1JITA 4PRUA 4NGYA 1CKGA 1B5ZA 4W96A 1LMPA 4H8YA 4Z41A 4EOFA 1XEJA 1B2KA 1EQ4A 1GE1A 5APFA 1TCYA 2Q0MX 3CT5A 4NFVA 4NGKA 1B7MA 1LMAA 3WU9A 1IP2A 3AZ4A 1GFVA 4B4EA 4OWHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1BB6A 1QDTA 4DJHA 1IC7Y 1EQ5A 2LZTA 1L75A 4NWEA 2IFFY 1N4FA 3B6LA 2ZWBA 1SSWA 4DD7A 235LA 5LVIA 1KXXA 2A7DA 1G1WA 1L12A 3C82A 3C81A 1VATA 1DKJA 5LZMA 3HTFA 214LA 1LMQA 3A6CY 1C6BA 1GAZA 1L37A 2RB0X 1LZYA 1L93A 2Z6BA 4GCBA 4ANRA 4GLVA 1L61A 1SX2A 1BQLY 4BAPA 1C45A 1CVKA 1GDXA 1OV5A 4LT0A 1LJ4A 2MEIA 1HEWA 1IR9A 4UWNA 4XN6A 3DN4A 1OUFA 1YL0X 4YOPA 1QSWA 135LA 1LPYA 1OUBA 2LZ2A 4LDLA 1D2YA 1A2YC 5F16A 1C6HA 4W51A 1LLHA 1UC0A 1LWKA 1L92A 1VAUA 2C8OA 133LA 5HMVA 3A6BY 1L69A 174LA 4OWAA 3AZ7A 3K2RA 1WTNA 3W6EA 1REMA 4BADA 3TXDA 222LA 137LA 1P3NA 2YBMA 1C7PA 3TXKA 262LA 1L68A 3C80A 1L52A 3SP3A 1WQPA 4LYTA 4RW1A 2ZYCA 1L57A 1IC4Y 3FI5A 1GF4A 2FBDA 4YEMA 3WYHA 1QTCA 4C5FA 1P2LA 4EKQA 4KL7A 4PK0A 5LVJA 3T36A 1KS3A 178LA 4BAFA 2A7FA 5ILCA 1GB9A 4ARMA 1NDGC 4MCKA 2DQJY 5LXWA 182LA 1VEDA 1QIOA 1GE4A 1LZRA 1OUAA 1UIHA 4H9HA 4HV2A 5KXOA 4NGWA 1UUZC 1JTPL 3J4GA 1C6DA 4H9FA 2MEGA 1C69A 1LSPA 3AW7A 3WW5A 261LA 1XGQC 4NSGA 1GXV2 1IOSA 2W1LA 1C6EA 1LMOA 5KXWA 4W56A 1GB7A 112LA 1L73A 4WM3A 1CJ9A 1D0KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1BB6 A;  1QDT A;  2YDG A;  1IC7 Y;  1FN5 A;  1P2C C;  4H91 A;  4ETE A;  1EQ5 A;  2LZT A;  1FKV A;  4N8Z A;  4LFX A;  4NWE A;  3P4Z A;  2EQL A;  1GE0 A;  3ZVQ A;  1UIC A;  2IFF Y;  5J7C A;  1C08 C;  4B49 A;  5C6J A;  5FEK A;  1DI4 A;  1BB4 A;  1N4F A;  4WM1 A;  3B6L A;  3RW8 A;  1I1Z A;  2ZWB A;  3BKV A;  1OQM A;  1UCO A;  2DQD Y;  2RSC A;  4DDB A;  1AT5 A;  4DD7 A;  5IDD A;  1NKH A;  2NWD X;  1BWI A;  5LVI A;  2F2N A;  1KXX A;  1LMT A;  2HEC A;  5I54 A;  4M4O A;  2C8P A;  1LZ8 A;  2A7D A;  1CKH A;  1CJ8 A;  1IWU A;  4ET8 A;  1YL1 X;  1WTM A;  2EKS C;  3A90 A;  1LHM A;  1HER A;  3WW6 A;  1D6P A;  4RLN A;  1LSF A;  1HFZ A;  4DD2 A;  5KKJ A;  1B7S A;  2LHM A;  5KKI A;  1GFU A;  1DZB X;  3CT1 A;  2D6B A;  1IOC A;  1VAT A;  1DKJ A;  1T6V L;  1UIA A;  4I0C A;  3EO5 A;  1IP4 A;  2BQO A;  5KXL A;  4H90 A;  1KXW A;  1OUJ A;  4HTQ A;  1C10 A;  1LMQ A;  1TEW A;  3A6C Y;  1NMM A;  4NGO A;  4ML7 A;  1GAZ A;  2DQH Y;  4J1B A;  5KXZ A;  1GB3 A;  3TMW A;  4DWX A;  5AMY A;  4H9A A;  1GE2 A;  1LZY A;  4XAD A; 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 1AKI A;  3TXF A;  1OUI A;  2XBR A;  1BHZ A;  2DBT A;  3WMK A;  1HEO A;  4QEQ A;  4YEN A;  2CGI A;  5LIO A;  1FKQ A;  3W6C A;  2Y8P A;  1GF0 A;  1D6Q A;  1F6S A;  1WVV A;  1OUH A;  3TMV A;  3OJP A;  1XGR C;  4UWV A;  4DD0 A;  1DI5 A;  1ZV5 L;  4CHX A;  1HSX A;  3WUN A;  5DLA A;  3A8Z A;  4WLX A;  2MEE A;  1VDQ A;  3WPJ A;  5HQ1 A;  3A3R X;  1JTO L;  5F14 A;  1UIG A;  4PHI A;  1DPX A;  1HSW A;  1T3P A;  2DQI Y;  1LSE A;  4PJ2 C;  2GV0 A;  4DYG A;  5B1G A;  1LSC A;  1LHK A;  3AJN A;  1LZ4 A;  4DDA A;  2BQH A;  2MEC A;  1LZS A;  4LFP A;  4HJZ A;  4DC4 A;  5IEL A;  4YF2 A;  1GFJ A;  4GCF A;  2YBN A;  1LZN A;  1B7N A;  3TXH A;  1LZ1 A;  1G7M C;  1REZ A;  3LYM A;  1GXX A;  2MEB A;  1JIS A;  4OWB A;  1JKA A;  1D9U A;  1JSF A;  1ZMY L;  5I4X A;  4W94 A;  2FYC A;  1HF4 A;  4J1A A;  5FHW A;  3A34 A;  6LYZ A;  3A95 A;  3FE0 A;  2BPU A;  1LKR A;  2ZIK A;  1V7S A;  2ZQ3 A;  4FJR A;  2G4P A;  4NWH A;  4TTD A;  3WU7 A;  1JHL A;  2HEE A;  1GB0 A;  2IHL A;  1JSE A;  5KXP A;  4ET9 A;  1GFK A;  1CJ7 A;  3AZ5 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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