1BBSA

X-ray analyses of peptide inhibitor complexes define the structural basis of specificity for human and mouse renins
Total Genus 79
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
79
sequence length
335
structure length
331
Chain Sequence
TTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRDSELGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Aspartic proteinase
molecule keywords RENIN
publication title X-ray analyses of peptide-inhibitor complexes define the structural basis of specificity for human and mouse renins.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 79
structure length 331
sequence length 335
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 1992-05-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1bbsA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1bbsA01
3NWXA 3SA7A 2BPYA 5P4SA 3EC0A 5E5KA 5TOLA 5EZZA 1RL8A 3INFA 4Y3NA 5AH7A 5P4GA 3OXVA 7UPJA 4OD9A 1UH7A 1HVSA 2QU3A 5P7IA 1LYBB 4NPTA 4COEA 3L5CA 3LIVA 3UQPA 3OU3A 3IGBA 4BEKA 5P4OA 3PCZA 2J9JA 1TCWA 3RSXA 2AVVA 4GJ6A 3ZPSA 2VKMA 1HOSA 1TCXA 4YD6A 4MC6A 1W5YA 1BIMA 2CEMA 3T7XA 3JVWA 5P1WA 4EJDA 2ER7E 3R4BA 1ZPAA 3BUHA 5P1ZA 5OYZA 1Z1HA 5P6LA 1EPQE 3OXWA 4I8WA 4QGIA 1DPJA 5P10A 3OHHA 3HAUA 5DQ5A 2F3FA 1B11A 3KFRA 2QI4A 1C70A 1WKRA 4A6CA 3KFNA 5P12A 5P0PA 4CPQA 1YX9A 1FQ5A 4AMTA 1TQFA 4PPHA 5P11A 5P7SA 4DQCA 1FLHA 5P4WA 2OHMA 5P5UA 2APRA 5OZPA 4U7QA 5P5AA 5P5TA 2Q3KA 3K4VA 2AZ9A 2Q15A 1T7IA 5P7FA 4YCTA 3T11A 4Y4EA 5P5MA 5P70A 3MSLA 5IVSA 1A8GA 1NPAA 5I70A 4Y48A 3IA9A 5AHCA 4OBZB 3R0WA 5P5NA 4FM6A 3O9IA 1ZJ7A 3FNTA 1MRXA 5P2VA 1AIDA 3PMUA 1OEXA 1FFFC 4PHVA 1AVFA 1GVXA 5OZ4A 1HVKA 1SGZA 3ER5E 5JFPA 2QMPA 5P3SA 1E81E 3QVIA 5CONA 4B78A 1BWBA 2WF0A 2ZGAA 3CKPA 3QIHA 1APVE 2VS2A 5P82A 3H0BA 2G1OA 5P4LA 3UFNA 1SDTA 3WB5A 1SH9A 1XE5A 2VNMA 1APWE 5P86A 3HLOA 2JJIA 4ER2E 3PSYA 2FXEA 4OC6B 3OXXA 5P31A 2I4DA 4WTUA 5P8DA 5OZ3A 4K4PA 3S85A 2IDWA 5P7JA 3OHFA 5P1EA 3EKWA 4AA9A 1SP5A 2HB3A 4RYCA 3BHEA 1XN3A 2QD6A 1VIJA 4Z22A 4EWOA 3WZ8A 5P4XA 2Q11A 5P52A 4Y4DA 1EC0A 2P8HA 3Q70A 3PI0A 4J1EA 2ZJKA 4DQEA 3EL9A 3UQWA 3UFLA 2V12C 4I11A 5P7NA 5P6TA 4NJSA 1ZPKA 1FGCC 3I8WA 4TVGA 1QDMA 1F7AA 1VIKA 3VV8A 5OYRA 4J17A 4Y5LA 3FIVA 5P1AA 5HE4A 4EJLA 2G1NA 4J0VA 4OBFA 5P38A 5OYXA 2O40A 4R8YA 3FSMA 5P2UA 2ASIA 4Q1XA 3VV6A 4OBGA 4FCOA 1OD1A 5P8TA 2FLEA 3TKWA 3EKPA 2F80A 3OAGA 3SA4A 4Y3QA 5DQCA 3UTLA 1ZP8A 5ER2E 4H1EA 1KJGA 2HM1A 5COKA 7HVPA 3L3AA 1EC2A 2HPFA 1QS8A 3OGPA 1BBSA 2QNNA 2FNSA 2HC0A 5KR0A 3O9LA 3WSJA 4ZIPA 4U8WA 5P2YA 4FSEA 1LYWB 1GVVA 3DV1A 5AH8A 3O9GA 2QMGA 4NPUA 4KE0A 2QNPA 5P1YA 1HIVA 3WZ6A 2A1EA 5P6NA 4AA8A 2Q55A 5P4ZA 3FNSA 4I0HA 3S53A 5OZXA 5P7DA 1DAZC 1HVIA 2QHZA 4Y3YA 5DQ1A 2HS1A 3UDQA 1HEGE 5P35A 3OTYA 4DH6A 3ZKGA 5P2SA 5SXNA 1OHRA 3D1XA 4OD9B 3GGXA 1C6YA 5P1MA 4EQ0A 4Y3LA 2Z4OA 3L58A 1FQ8A 5OZ1A 3ZKSA 4I1CA 3NU9A 5HD0A 3I7EA 2BPVA 4JECA 2BBBA 4FE6A 5P08A 4A6BA 5JG1A 1ME6A 3BUGA 3RTHA 5P3MA 3LHGA 4MC1A 1MEUA 5P6CA 2G24A 1KJHA 2PK6A 2ER9E 5P1PA 3QRSA 1YTJA 2JYSA 5P6UA 2OHPA 5P7TA 1LF3A 4Y4GA 5P0HA 2QHYA 5JODA 3ZKQA 5P71A 2RKGA 2G1SA 4Y37A 1HVCA 3OOTA 1W5VA 4BFDA 4RCDA 2ZJIA 5HU0A 1EBWA 2RENA 5OZBA 5P7HA 5P0NA 1PSAA 3R0YA 4Y4AA 5P66A 1OEWA 4UPJA 1MRWA 5DGUA 5P2IA 2WF3A 2Q5KA 4DJVA 4XKXA 1G2KA 2XFIA 4Y4ZA 3PBZA 3KT2A 4NJVA 3S43A 4HVPA 2OHTA 5P2CA 2ZHTA 2VNNA 3OY4A 5AGZA 4APEA 5DR1A 3SA9A 4ZE6A 1NPWA 5P6DA 4TVHA 3INHA 1MTRA 5P2XA 1EPPE 1DP5A 3OUDA 5OZGA 4DJYA 5C9DA 2VJ7A 5P57A 1EPLE 1HPXA 5P2JA 1G0VA 3GGAA 2VJ9A 5P27A 3OU1A 2AODA 5P1VA 5P0UA 2VIJA 3GGUA 3QN8A 3ZKIA 5P72A 4Y5MA 2IQGA 4QJ8A 3K5GA 4AZYA 4R95A 2NXLA 2ANLA 2FDDA 3SM2A 5P48A 3D91A 1RPIA 5P7RA 3OQDA 3VUCA 4YCKA 5P7PA 1HSHA 2ER0E 1G35A 2B60A 3BXSA 4I0JA 2G1YA 3BGBA 4RVJA 5P40A 3EM6A 1B6KA 4ZLSA 2R3TA 3DUYA 4XX3A 3G72A 5P1BA 5P6MA 5OZYA 4L6BA 4FL8A 3NU6A 5AHAA 3EM4A 4EJKA 4FM7A 2ZJHA 4CMSA 5P2RA 1HPVA 2CENA 5P01A 4H3GA 3SA6A 2OHRA 3KYRA 1EAGA 5IE1A 1HVHA 3S7LA 1FQ7A 5HDZA 3SA3A 2QZXA 4OBJA 5KAOA 1MSNA 4Y35A 1MIQA 2QI1A 4Y4XA 5HCOA 1FMXA 2R5PA 4Y4BA 5P1GA 5P8CA 5COOA 3U7SA 3OAGB 1TW7A 2BQVA 2ZHSA 4EPJA 2RKFA 2WEBA 2FGVA 2IGYA 5P0JA 1E5OE 4CPSA 1YT9A 5P46A 5P0KA 3S54A 1UPJA 2AVMA 5P0LA 4J54A 3ZMGA 5P0SA 3OU4A 5P0IA 1IIQA 3BUFA 3PWMA 2AIDA 3O9LB 5P2TA 5P04A 2VA6A 2P3CA 3NDWA 5AH6A 5OZDA 5P8NA 5C9FA 1XE6A 1ENTE 1EBKC 3OQAA 2QI3A 3NR6A 3PJ6A 5P7ZA 4H3JA 1G6LA 4J1IA 4RLDA 4FS4A 5P8EA 2QD8A 3HDKA 1CPIA 4H3IA 2HAHA 1AM5A 1DW6C 5F01A 3ZL7A 2QZLA 3A2OA 3UCBA 1YTGA 5P0QA 3EL4A 1D4LA 2JE4A 4YOAA 4HZTA 5OYVA 3UDHA 2HIZA 5P53A 3INEA 1XL5A 5P3AA 3QPJA 4Y5BA 1MT7A 3LIZA 4PZXA 4YDFA 4Q1NA 5P63A 3QI1A 5P3WA 5ENKA 1Z1RA 5P88A 5T4SA 5P8PA 2NNPA 3NXNA 3TKGA 2NR6A 2BPWA 3PEPA 4DI2A 4DQGA 5P83A 5P4IA 4DJQA 5P37A 4CPXA 3HVGA 3Q6YA 4HA5A 4N00A 1EC1A 2FS4A 5P2AA 5P5WA 4H3FA 5P6YA 3VEUA 3PCWA 2RMPA 4QJ6A 4B70A 3LIXA 2AOGA 4J0TA 4ZSPA 1AZ5A 5P00A 5P06A 4HDPA 1HBVA 2G21A 5OZTA 2G94A 5P18A 5SY2A 1GKTA 1LF2A 1IZEA 3QRVA 5P07A 5P67A 2B7FA 3S43B 4Y4WA 5P4VA 5P2NA 4DFGA 4DUSA 1MERA 5P20A 4JOOA 3FV3A 5P7CA 4PZWA 2QMDA 1QBSA 5P3EA 2ER6E 5IVRA 5P29A 5P50A 3KF0A 4GZFA 2FMBA 5P3VA 4D85A 4GJ9A 3IN4A 3KMXA 2ZE1A 4X7IA 4LXKA 3DOXA 3GI6A 4Y3EA 1K2CA 3SO9A 5P59A 3URIA 3FNUA 2XFKA 3S56A 3VF7A 3EKXA 3KDBA 5P55A 3ZKMA 4BFBA 1AAQA 1ZTZA 5P45A 5DQ2A 3NDXA 1ODYA 1GVTA 4Y3RA 5P2KA 5P3HA 5P22A 4S1GA 2QP8A 5P8VA 2VA5A 4YHQA 4BELA 3CYWA 5OZ5A 1E80E 3LZUA 4Y41A 5OYSA 4AUCA 4Q1YA 4GJAA 2ZYEA 3CIDA 5P1CA 3D3TA 1NSOA 5OZAA 2Q54A 1K2BA 4ACUA 4DJOA 5P0AA 4ZSQA 1SBGA 2F8GA 4ZEAA 5P5GA 5DR4A 5P0FA 5P8QA 2WF4A 1NH0A 3MXEA 4J0YA 4EHCA 1M4HA 5SZ9A 3UDMA 8HVPA 3HAWA 5P3CA 5OZ9A 3VV7A 2QI6A 3LZVA 5P16A 5P79A 3KA2A 5P8GA 1K1UA 4L1AA 1IBQA 5P3GA 5P3TA 1RV7A 2VIZA 4R91A 1PSNA 5HDVA 5P7XA 3AUPA 5P3QA 3UDRA 5OZJA 4B77A 2QCIA 5P1IA 2QHCA 3KN0A 4DQBA 3LZSA 4YE3A 1BILA 2QK5A 5P7BA 1EC3A 3OQKA 3DCRA 5P73A 2QU2A 3TOFA 5P03A 1IZIA 4FM8A 1TZSA 2R38A 2IEOA 5OZIA 3G6ZA 3OU4B 3NU5A 5KR8A 3EBZA 2G1RA 3VCMA 2ZHUA 2V13A 3U6AA 1SMEA 4Y3TA 4OBDA 3GGVA 1MPPA 3SPKA 1J71A 1FMBA 1DMPA 5CLMA 2XYFA 2P3DA 5OZVA 4GJ8A 6APRE 3EKVA 1HWRA 2PK5A 1MT8A 1U8GA 3VG1A 2R3WA 1PROA 5KR2A 4GB2A 5P76A 1FEJC 3TLHA 3D1YA 4YDGA 1B6MA 4ZPEA 4PEPA 4I0IA 3MWSA 5P68A 3HD8A 1HXBA 3NLSA 3R2FA 4TRWA 4Y3MA 3RTNA 5P4DA 3DM6A 1FMUA 5P49A 1MESA 3KFPA 3K1WA 4Y5AA 1LV1A 1IVPA 5P3OA 2IL2A 5P1FA 3VFAA 4Y50A 1W5WA 3LITA 1HEFE 2HPEA 5P3UA 5P7EA 5P33A 2QNQA 3DV5A 4Z50A 2AVSA 1GVWA 2HS2A 3CICA 1HPSA 2PC0A 3OADA 2BB9A 5P62A 4L7GA 4Q5MA 1IZHA 5P4AA 5P8IA 2O4NA 3PLDA 3T7PA 3L59A 3NU4A 5P2QA 5DQ4A 4M8YA 5DR7A 1FQ4A 5OYWA 2ZDZA 5P3JA 3QVCA 1PSOE 4MC9A 1AJXA 1EBYA 2IENA 2V10C 5P77A 2ZJNA 1YTHA 1M43A 3FKTA 4GJ5A 5HE5A 3TOHA 5P4RA 3PVKA 3SABA 3ZLQA 2J9JB 4JPCA 1CMSA 3CIBA 1GNNA 3DJKA 5P1DA 1HSIA 4TRYA 2HB2A 4QLHA 5PEPA 4WY6A 3OWNA 4RGHA 3CYXA 1LF4A 2QZWA 5P65A 4YD5A 3MSKA 4I0EA 2I1AA 1HTEA 3HZCA 2CEJA 3ECGA 5HDXA 2F81A 3ZKXA 5OZRA 3QBFA 5OYQA 1BXQA 4Y39A 3KFSA 1ZAPA 5P3YA 5P02A 5P8MA 1QBUA 5UPJA 4QJAA 3LIQA 5P4KA 1E82E 3AIDA 1D4SA 3TPRA 2WL0A 2V0ZC 1FG6C 4Y54A 4E43A 4M8XA 1AXAA 1D4IA 3NXEA 5HVPA 5OZFA 1KJFA 1SMRA 4D89A 5P26A 3B80A 5OZMA 3LINA 4WY1A 3VF3A 3URLA 3O9FA 4MC2A 2PWCA 1LS5A 1LYAA 3RSVA 1GNOA 4Y4JA 5P6KA 3IXOA 2QI5A 4YA8A 2PSUA 5P5BA 5OZHA 5DPZA 3MXDA 2A4FA 2I4UA 3GI5A 2H6TA 5P0BA 3SM1A 4EQJA 5P2GA 3N3IA 5P3DA 4Y3PA 4Y3JA 5P8KA 3TPLA 3EL5A 2V00A 4Y56A 4CPWA 5P1NA 2J9KA 2F3EA 3KMYA 2BKTA 4I0GA 2AOEA 3L38A 5P5SA 4HDBA 5P0ZA 1C6XA 1ZLFA 1A9MA 2P83A 4L7HA 4FLGA 2AOJA 5P2WA 4CPUA 1MSMA 5OZ6A 2QI0A 1ODWA 1ZBGA 2IGXA 5I3WA 3PM4A 4OBZA 2B8LA 1MTBA 2OAHA 3U71A 1D4HA 2BKSA 3NDTA 2H6SA 4Z2ZA 5P30A 4Y5CA 4RRNA 1K6CA 3EKQA 5BS4A 5P5XA 3LIYA 3NU3A 3HVPA 4YD3A 5KQZA 3EL1A 2NMZA 4JP9A 1Z8CA 5COPA 4NJUA 5P8RA 5P4BA 1HVLA 1W5XA 3S2OA 1SIPA 3L5FA 1YG9A 4APRE 4ZSRA 3OUAA 1K6TA 3PMYA 4Y3WA 5P7UA 3QBHA 3SLZA 3R1GB 4EP2A 5P4FA 2QI7A 5P0MA 3UPJA 1HTRB 5AH9A 5P4QA 1EPME 5E5JA 2OF0A 9HVPA 5P60A 2G69A 1ZSFA 5OZZA 1K6PA 3NUJA 3H5BA 1B5FA 4GIDA 1AJVA 3OXCA 2B8VA 4Z4XA 3WB4A 2AZCA 3BGCA 3RVIA 3VYEA 4J55A 4ZSMA 2G20A 4CPTA 3K5CA 3OADB 4DQFA 2NPHA 3UDKA 5P6FA 4RYGA 3JVYA 5I3VA 4Q1WA 3SAAA 5P5DA 5P7KA 3S45A 3PLLA 3GI0A 3PI5A 5ER1E 4FRKA 5OZUA 2MIPA 1XN2A 4CKUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3NWX A;  3SA7 A;  2BPY A;  5P4S A;  3EC0 A;  5E5K A;  5TOL A;  5EZZ A;  1RL8 A;  3INF A;  4Y3N A;  5AH7 A;  5P4G A;  3OXV A;  7UPJ A;  4OD9 A;  1UH7 A;  1HVS A;  2QU3 A;  5P7I A;  1LYB B;  4NPT A;  4COE A;  3L5C A;  3LIV A;  3UQP A;  3OU3 A;  3IGB A;  4BEK A;  5P4O A;  3PCZ A;  2J9J A;  1TCW A;  3RSX A;  2AVV A;  4GJ6 A;  3ZPS A;  2VKM A;  1HOS A;  1TCX A;  4YD6 A;  4MC6 A;  1W5Y A;  1BIM A;  2CEM A;  3T7X A;  3JVW A;  5P1W A;  4EJD A;  2ER7 E;  3R4B A;  1ZPA A;  3BUH A;  5P1Z A;  5OYZ A;  1Z1H A;  5P6L A;  1EPQ E;  3OXW A;  4I8W A;  4QGI A;  1DPJ A;  5P10 A;  3OHH A;  3HAU A;  5DQ5 A;  2F3F A;  1B11 A;  3KFR A;  2QI4 A;  1C70 A;  1WKR A;  4A6C A;  3KFN A;  5P12 A;  5P0P A;  4CPQ A;  1YX9 A;  1FQ5 A;  4AMT A;  1TQF A;  4PPH A;  5P11 A;  5P7S A;  4DQC A;  1FLH A;  5P4W A;  2OHM A;  5P5U A;  2APR A;  5OZP A;  4U7Q A;  5P5A A;  5P5T A;  2Q3K A;  3K4V A;  2AZ9 A;  2Q15 A;  1T7I A;  5P7F A;  4YCT A;  3T11 A;  4Y4E A;  5P5M A;  5P70 A;  3MSL A;  5IVS A;  1A8G A;  1NPA A;  5I70 A;  4Y48 A;  3IA9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3FX5 A;  5P8J A;  2V11 C;  4Y3D A;  3EKT A;  3EXO A;  5P0C A;  4F74 A;  4A4Q A;  1W6H A;  3SKF A;  3CKT A;  2BPZ A;  5P5Y A;  4YBF A;  1SGU A;  5P7O A;  2PSV A;  4NJT A;  2PYM A;  3OUB A;  1FF0 C;  3F9Q A;  1CZI E;  5SY3 A;  5P0Y A;  5P2Z A;  4Y3A A;  4OC6 A;  2WJO A;  2FDP A;  5P14 A;  1TSU A;  4GJC A;  3UHL A;  5BWY A;  2O4P A;  5P2M A;  1UH8 A;  2O4S A;  5P2L A;  5P1O A;  5OZC A;  3TH9 A;  3GW5 A;  3S7M A;  5P1X A;  3UQR A;  3NDU A;  1APT E;  2FGU A;  3K5D A;  2P3B B;  5P1Q A;  5DGW A;  5P0R A;  4EP3 A;  5P0W A;  4IVS A;  1BDQ A;  2Q64 A;  4DJP A;  5P36 A;  3O9H A;  5P8O A;  4EYR A;  3OK9 A;  5DR3 A;  5P3F A;  1GNM A;  3IXK A;  1BVG A;  1T6E X;  1QBR A;  5P39 A;  2FIV A;  5P23 A;  3EMY A;  5P3P A;  3UDN A;  1MVP A;  5P1T A;  2I4Q A;  2Z54 A;  1XL2 A;  2AQU A;  5I3X A;  5P5V A;  3OQ7 A;  5OZO A;  5P24 A;  1RQ9 A;  5P56 A;  3VSW A;  4YBI A;  5P7M A;  4GJB A;  4R5N A;  1PPM E;  3LPJ A;  4DJW A;  4Y58 A;  5P7Y A;  2B7Z A;  1B6P A;  4GYE A;  4XXS A;  5P5Z A;  4FIV A;  4FRJ A;  1HTF A;  1KJ7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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