1BHZA

Low temperature middle resolution structure of hen egg white lysozyme from masc data
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Multiwavelength anomalous solvent contrast (MASC): derivation of envelope structure-factor amplitudes and comparison with model values.
pubmed doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1bhzA00
4EMNA 5D5FA 3M3UA 3IJVA 2YVBA 1LHMA 5E4PA 1LSYA 5B1GA 5II3A 2DBTA 1GB7A 1SQ2L 4HPIA 1RCMA 1GDWA 1VEDA 1UIGA 4YM8A 3IJUA 2Z37A 4WLTA 1DPWA 4WLXA 1XGTC 3A92A 1LHIA 1NBZC 1T6VL 2FBBA 3QNGA 3A6BY 3W6FA 4NHSA 2HEAA 1O23A 2DKVA 3MGWA 4M6DA 2YBIA 2BQOA 4GLVA 3F6ZA 4N0JA 1IR9A 1LSZA 4DT3A 2BQNA 4OWCA 2MEHA 1B7LA 3CB7A 5DN4A 5IHGA 1I1ZA 3QE8A 5KJ9A 1LSGA 1GFUA 1IY3A 1XGRC 5A3ZA 4H8ZA 4ZFPA 1TBYA 4C3WA 1EQ5A 3LYOA 4KXIA 4QEQA 5KXTA 1DKKA 3LN2A 1IR8A 4NGVA 5LYZA 1LZNA 3B0IA 5B59A 1B0DA 4NG8A 1AZFA 4GCFA 1HELA 1FLQA 4H90A 5L9JA 4MSTA 1LZDA 1LJKA 1KXWA 1IX0A 1B7RA 3TMVA 3TXHA 1GFRA 4LZTA 4WLYA 2HEDA 1GF8A 4NFVA 1IWXA 1LYZA 1B5UA 1XGQC 1LHHA 1NWGA 4MCKA 2CWIA 1B5XA 4NSJA 4WO6A 3WULA 5F81A 5D5CA 1IWTA 1GE4A 4WMGA 4ETAA 1GBZA 4LT1A 4DD3A 1D9UA 2GV0A 4OOOA 4G4CA 1VFBC 1DI3A 1VDTA 4Z98A 2YBMA 4NHQA 1C08C 3D9AC 4R0FA 5APCA 1GPQC 5I4YA 3ATNA 3RZ4A 1LZTA 4YENA 3TXEA 5F14A 1LSNA 2B5ZA 4WM1A 4H93A 5FELA 1GD6A 5KXOA 4DWXA 1YAQA 1HHLA 4J0LA 4TSBA 1TEWA 1CKCA 1HFZA 4XJHA 3VWOA 1N4FA 1OUFA 4HTKA 5HMVA 1BHZA 1LZ6A 1RFPA 1F10A 1JIYA 1NDGC 4H9BA 4RDSA 5IELA 4TUNA 2BQFA 1WVUA 2DQEY 1AT5A 1UUZC 1REYA 2DQJY 2MECA 3SP3A 5LVGA 4BADA 1LOZA 3WMKA 4HJVA 1YQVY 1GE3A 1GBWA 2MEDA 1QQYA 1LMQA 1GAZA 1LZSA 2XBRA 4N1CC 4YF2A 1ZVHL 1IP4A 1RI8B 1GF7A 4H9IA 2BLYA 3AW7A 3EBAB 3ATOA 4LT3A 4IASA 1GAYA 2BQKA 2C8OA 1BVXA 1GFVA 1UIFA 3WW5A 1YAMA 3D3DA 4I8SA 4N5RA 1LMNA 3W6CA 8LYZA 5LINA 2Z2FA 1LSDA 1CKDA 1LYOA 2NWDX 1RJCB 1UIHA 4FJRA 2CGIA 4ANRA 4N1EI 4WO9A 4DD2A 1IC5Y 1IWZA 4KT3A 1Z55A 3TMUA 2D4JA 1LZ5A 4H8YA 2DQCY 5HNLA 2ZNWY 4WG7A 135LA 2CDSA 1DXJA 1HEWA 1HFXA 2MEGA 4W94A 1LHKA 5B06A 1CNSA 1YKYX 1HEQA 1BB6A 6LYZA 1GE1A 4OWAA 1D6QA 1GBXA 4LFPA 4D9ZA 3B0OA 1B5ZA 2DQFC 3LYZA 4QGZA 3WUAA 4FDYA 3P68A 5LVKA 1JTPL 1GE0A 2HEFA 4LYZA 1ZV5L 4Z46A 4XYYA 4CJ2A 1F6RA 4WL7A 3A94A 2DQHY 1J1OY 1LJ4A 3EXDA 1WQPA 1GEZA 1LJGA 2BQDA 2AUBA 2ZILA 2H9JA 1GFHA 5LVHA 5M1YA 1YIKA 5ILCA 5L3HA 5ILFA 5APFA 5FSTA 1HF4A 1WQQA 3P66A 4WM5A 1GFAA 1LZYA 4H92A 1REMA 3A90A 4DDAA 1EQ4A 1NF5A 4WL6A 4Z41A 1IWUA 3A3RX 1CJ6A 2LYOA 3TXKA 1IY4A 1LMAA 2BQJA 3J4GA 3TMXA 1D6PA 1IP5A 2BQAA 1G7MC 4AXTA 2YBLA 1JKBA 1LMPA 2MEAA 1G7JC 3P4ZA 3ULRA 2ZQ3A 1PS5A 2W1XA 4DC4A 5KXRA 1T3PA 3WVXA 3B0KA 4NEBA 5I4XA 1LTMA 2DQGY 3WVYA 2BQMA 1HEMA 132LA 1B7OA 1QSAA 4NHIA 1GEVA 1LZBA 1QTEA 4PJ2C 1LJ3A 3A8ZA 3OJPA 1HEPA 3AZ5A 1HENA 1UACY 1B7NA 3LZ2A 1LZEA 4H9CA 5DLAA 3T36A 2F2NA 3ZVQA 3RU5A 1YL0X 1KIQC 1IIZA 1IP2A 4OWHA 5B1FA 3OK0A 4GLAA 2ZIKA 1V7TA 3WPLA 3CT5A 1AKIA 4DD7A 1OUGA 2N5ZA 1OP9B 5KXPA 1BB5A 1LMCA 5LAGA 4ET9A 2H5ZA 4XENA 4WM2A 1I20A 2Y8PA 5FEKA 1JITA 4NSGA 4LYMA 1GB2A 5AMYA 4LFXA 4Z3MA 4BS7A 1H87A 4H1PA 1UBZA 2HTXA 4ETCA 1BVKC 1IP1A 1INUA 2I26L 3A91A 1UIEA 2YBNA 4NIJA 4PGJB 1FDLY 3T6UA 1GHLA 3HBDA 4GN5C 4OOTA 3WYHA 4N9RA 2DQDY 4NGYA 5DN5A 4UWUA 4XADA 1IWVA 4GCDA 4ETDA 3GXKA 1F0WA 5KXXA 1HEOA 1GB3A 1PZYA 1QTKA 2Z12A 3IWRA 1LSEA 1XGUC 4DD0A 5I4WA 1ZMYL 4NGJA 4W96A 2D4KA 4L41A 3AW6A 4A7DA 1CJ9A 2WARA 4CHXA 4HTNA 133LA 1JPOA 3CSQA 1JISA 4HV2A 4B4IA 3B72A 1GBSA 1C45A 1OUBA 4B49A 154LA 1LSFA 4HTQA 1LJIA 3AJNA 4BAPA 1IO5A 4HPEA 3CSRA 4J1AA 4YEOA 4NSHA 1LHLA 4X3BA 3AB6A 3WXTA 1IP7A 1IORA 1LZ9A 3TXBA 2W1LA 2DQAA 1P2CC 3P65A 5LVIA 2YBHA 5E9RA 4KPMA 3LYMA 1QDRA 1IEEA 2F4AA 1NBYC 3TMWA 2XBSA 1GF5A 1NMMA 1XGPC 3AZ7A 3G3AB 4PHIA 4G9SA 2ZIJA 3HBHA 4XJGA 2X0AA 4LYCA 5F9XA 3WPJA 3TXJA 1GB5A 1GB6A 2YSSC 2ZWBA 4B4JA 5LYTA 3CT1A 4NSIA 4H9AA 5HNCA 5KKJA 1CKFA 1EL1A 1F6SA 1ALCA 1B7QA 1DKJA 2Q0MX 3TXFA 1J1XY 3AYQA 4NWHA 1V7SA 5KXMA 4WM3A 3W6EA 1CKGA 3AGIA 1EQEA 1JJ0A 1GF9A 1LZAA 4XN6A 1OUEA 1LPIA 1JTOL 3HBEX 5KXYA 5KXKA 1AT6A 1DI4A 1LSBA 4NGWA 2Z38A 4H9FA 4LGKA 2HEBA 1LJFA 2DQIY 3A93A 1GWDA 3WU8A 2MEBA 1IOTA 4B0DA 4C5FA 2I6ZA 4ZEEA 5HQ1A 1UA6Y 1VDPA 2EPEA 1HSWA 3W6BA 3W6AA 1B5VA 2IFFY 3GXRA 1D0LA 1HMLA 9LYZA 1C10A 3RT5X 4HP0A 2HEEA 1LMTA 4GCCA 3WUMA 2BQHA 1LKRA 1WQRA 3A96A 3AGHA 1GXXA 4B4EA 2G4PA 4P2EA 4CFPA 1GB0A 1H6MA 1OUIA 2MEEA 4B1AA 2D6BA 2FYDA 1CJ8A 1HC0A 1BB7A 1C46A 1LZ8A 1WTNA 1IOCA 3HFMY 5LXWA 2W1MA 2G4NA 1G7HC 3AZ4A 3WXUA 134LA 4H9EA 2EKSC 1B2KA 5A3EA 1KIRC 4M4OA 4HSFA 5FDJA 4ET8A 1KXYA 1G7IC 1IC7Y 1GB8A 1RE2A 4ETBA 1IWYA 1WVVA 2LZTA 3TXDA 1B7PA 2MEFA 2LHMA 5B05A 1GE2A 1GFEA 1VAUA 5KY1A 3G3BB 2Z18A 3QY4A 4WOAA 1DZBX 4AGAA 1TAYA 1VDSA 3LYTA 3WPKA 5JENB 5KKIA 1LMOA 2I25L 1FN5A 1FLYA 2PC2A 3CT0A 1LCNA 2F30A 3WU7A 3A95A 1JJ3A 1A2YC 2F4GA 1CKHA 4GN3A 4NGIA 1D0KA 5C6LA 1C43A 1REXA 1LZ1A 4CGEA 1OUJA 1LAAA 5APEA 3ZEKA 1JEFA 2BQCA 1FKVA 1TDYA 1UC0A 4IJ4A 1NQIA 4HV1A 1LZRA 7LYZA 1GF6A 3CSZA 1LJHA 1QSWA 4PRQA 3LZTA 1B7MA 1HFYA 5K7OA 1LSAA 1JUGA 2MEIA 1JWRA 4GN4A 4DDCA 1LJJA 2XTHA 153LA 3CQLA 3N9CA 2A7FA 2D91A 4NGZA 4NGLA 1MELL 2FBDA 5LAFA 5C6IA 1GF0A 1VATA 2BQGA 5I53A 4XJIA 1IOSA 2YBJA 5EBHA 1BQLY 1OUHA 4KL7A 1JTTL 4YEMA 5J7CA 1LSCA 3J6KA 4XJFA 1BWHA 1UIAA 1BWIA 2RSCA 1YKZX 1TCYA 4J1BA 1YL1X 3M18B 1ZVYB 1WQMA 2ZQ4A 1KIPC 3WW6A 194LA 1LYYA 5APDA 4II8A 4LT2A 4RW1A 5KXWA 1E8LA 4LT0A 3K3TA 3N9EA 5B07A 1BGIA 1QUTA 4RLMA 3A67Y 5FHWA 2VB1A 4LYBA 1QUSA 2C8PA 4WG1A 4EOFA 5DM9A 1KXXA 1HSXA 1CJ7A 4OWEA 2G4QA 4XJBA 2ZYCA 1DPXA 1XEKA 2Z39A 4GCBA 4NHPA 4NGOA 4NY5A 1JHLA 4G4BA 5L3IA 1LZ4A 3EO5A 5F16A 2BAAA 1HNLA 2EIZC 3TXGA 4HJYA 5DL9A 3FI7A 4MR1A 1FLWA 5HLLA 4O34A 2A7DA 3BKHA 1DI5A 1NHEA 4N8ZA 1HMKA 1IC4Y 4TX7A 1GBYA 4PPOA 2LZ2A 4J7VA 5KXZA 1OUAA 1LZGA 1W08A 3BKVA 1FKQA 3A6CY 1LKSA 4DDBA 1XSFA 4H91A 4DD1A 2LYMA 2CJLA 4BAFA 1UIBA 5LIOA 4RW2A 4R6CA 1LSMA 2HU1A 5HMJA 1YROA 4CFOA 1QIOA 1B9OA 2HECA 1JKDA 4U3XB 2EQLA 3RW8A 1LYSA 3WUNA 1OQMA 1NKHA 4TWSA 3AZ6A 3RNXA 1XEJA 3LHMA 3WH1A 1DQJC 1A4VA 4G49A 4UWVA 4WLDA 4XJDA 4YOPA 5T3FA 1GFKA 5KXLA 5I54A 1GFJA 5LVJA 1WTMA 1J1PY 4LYOA 2Z19A 4WM4A 4RLNA 1GFTA 3WL2A 2BPUA 4H9HA 5FCPA 1JSEA 3P64A 2H9KA 1YANA 3W3EA 2ZNXY 1IR7A 3KAMA 4I0CA 1GBOA 1YAPA 5F9UA 4E3UA 5C6JA 1REZA 3ZVQB 1LJNA 1HERA 1GDXA 4IATA 1B5WA 1VDQA 4PRUA 4DYGA 3FE0A 1IP3A 1UCOA 4QDNA 3B6LA 4ZIXA 4G4HA 1IWWA 1LJEA 4NGKA 208LA 4OW1A 2Z2EA 4ML7A 2YDGA 1FBIX 2HU3A 1UICA 4NWEA 1I56A 4ETEA 1JSFA 3WU9A 4OWBA 4QY9A 4HJZA 2BLXA 4WM6A 1IP6A 4H8XA 5KXSA 2IHLA 1OUDA 1JKCA 4UWNA 6LYTA 5IDDA 4NHTA 1IVMA 193LA 1BB3A 1D0MA 1NDMC 1GXV2 3N9AA 2ZYPA 4DD9A 1W6ZA 2W1YA 3A34A 1LZCA 5I5QA 1IOQA 4H94A 1GFGA 1YAOA 1BWJA 1QDTA 1AM7A 1LSPA 1BB4A 5LA8A 2HUBA 1B5YA 1B7SA 1MLCE 1YILA 2XJWA 3W6DA 3E3DA 4LYTA 1FLUA 4NG1A 1SLYA 3EMSA 1XFPL 1JJ1A 1GB9A 1OUCA 1G7LC 1GF3A 1GF4A 2D4IA 4TSCA 2BQLA 1LHJA 2LYZA 2BQEA 5KXNA 2BQBA 3AGGG 207LA 1WQOA 5LA5A 1YKXX 1XEIA 4TTDA 1WQNA 2BQIA 2FYCA 3A3QA 3TXIA 5LYMA 4GCEA 1JKAA 1C7PA 1UIDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4GRVA 1C67A 2Z37A 1DPWA 1L67A 4I7QA 4NHSA 1D3MA 4M6DA 1SWYA 2BQOA 1LSZA 4GBRB 2MEHA 1QTZA 1LSGA 259LA 1IY3A 1XGRC 4H8ZA 1TBYA 3LYOA 4QEQA 5LYZA 169LA 1KW7A 5B59A 1B0DA 4GCFA 5L9JA 1LJKA 3DN0A 3TMVA 3TXHA 1OVKA 1NWGA 4NSJA 120LA 4E97A 1L44A 1GE4A 4WMGA 1D9UA 1VDTA 5APCA 1GPQC 1CX6A 1LZTA 4YENA 3TXEA 2B5ZA 240LA 4WM1A 1HHLA 4TSBA 1LZ6A 1F10A 1JIYA 4H9BA 4TUNA 1UUZC 2OTZX 4BADA 4HJVA 1GE3A 1QQYA 1RI8B 2HUKA 2BLYA 3AW7A 4LT3A 3ATOA 3W6DA 1GAYA 2BQKA 1BVXA 1UIFA 144LA 1YAMA 3W6CA 2Z2FA 4FJRA 1JTMA 213LA 188LA 3HT7A 3TMUA 1LZ5A 2DQCY 1HEWA 5B06A 1LHKA 4W53A 1HEQA 4OWAA 1P37A 1OV7A 1B5ZA 1L45A 3GUMA 4XYYA 129LA 1L32A 160LA 1LJ4A 1WQPA 137LA 3FA0A 5M1YA 1YIKA 5L3HA 5ILFA 5FSTA 1WQQA 1REMA 4DDAA 3GUPA 1NF5A 1IWUA 1CJ6A 1D6PA 1IP5A 4S0WA 1PS5A 4DC4A 141LA 1G0QA 5KXRA 125LA 3B0KA 2DQGY 3WVYA 1KY1A 189LA 142LA 1QSAA 4NHIA 2Z6BA 182LA 1L56A 1HENA 1C66A 5DLAA 2F2NA 3RU5A 1YL0X 1KIQC 1IIZA 4OWHA 4GLAA 4DQJA 2N5ZA 1OP9B 1LMCA 2B74A 119LA 4XENA 1D2WA 5FEKA 4LYMA 1GB2A 237LA 1L58A 2HTXA 163LA 2I26L 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4EMN A;  5D5F A;  3M3U A;  3IJV A;  2YVB A;  1LHM A;  5E4P A;  1LSY A;  5B1G A;  5II3 A;  2DBT A;  1GB7 A;  1SQ2 L;  4HPI A;  1RCM A;  1GDW A;  1VED A;  1UIG A;  4YM8 A;  3IJU A;  2Z37 A;  4WLT A;  1DPW A;  4WLX A;  1XGT C;  3A92 A;  1LHI A;  1NBZ C;  1T6V L;  2FBB A;  3QNG A;  3A6B Y;  3W6F A;  4NHS A;  2HEA A;  1O23 A;  2DKV A;  3MGW A;  4M6D A;  2YBI A;  2BQO A;  4GLV A;  3F6Z A;  4N0J A;  1IR9 A;  1LSZ A;  4DT3 A;  2BQN A;  4OWC A;  2MEH A;  1B7L A;  3CB7 A;  5DN4 A;  5IHG A;  1I1Z A;  3QE8 A;  5KJ9 A;  1LSG A;  1GFU A;  1IY3 A;  1XGR C;  5A3Z A;  4H8Z A;  4ZFP A;  1TBY A;  4C3W A;  1EQ5 A;  3LYO A;  4KXI A;  4QEQ A;  5KXT A;  1DKK A;  3LN2 A;  1IR8 A;  4NGV A;  5LYZ A;  1LZN A;  3B0I A;  5B59 A;  1B0D A;  4NG8 A;  1AZF A;  4GCF A;  1HEL A;  1FLQ A;  4H90 A;  5L9J A;  4MST A;  1LZD A;  1LJK A;  1KXW A;  1IX0 A;  1B7R A;  3TMV A;  3TXH A;  1GFR A;  4LZT A;  4WLY A;  2HED A;  1GF8 A;  4NFV A;  1IWX A;  1LYZ A;  1B5U A;  1XGQ C;  1LHH A;  1NWG A;  4MCK A;  2CWI A;  1B5X A;  4NSJ A;  4WO6 A; 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 5T3F A;  1GFK A;  5KXL A;  5I54 A;  1GFJ A;  5LVJ A;  1WTM A;  1J1P Y;  4LYO A;  2Z19 A;  4WM4 A;  4RLN A;  1GFT A;  3WL2 A;  2BPU A;  4H9H A;  5FCP A;  1JSE A;  3P64 A;  2H9K A;  1YAN A;  3W3E A;  2ZNX Y;  1IR7 A;  3KAM A;  4I0C A;  1GBO A;  1YAP A;  5F9U A;  4E3U A;  5C6J A;  1REZ A;  3ZVQ B;  1LJN A;  1HER A;  1GDX A;  4IAT A;  1B5W A;  1VDQ A;  4PRU A;  4DYG A;  3FE0 A;  1IP3 A;  1UCO A;  4QDN A;  3B6L A;  4ZIX A;  4G4H A;  1IWW A;  1LJE A;  4NGK A;  208L A;  4OW1 A;  2Z2E A;  4ML7 A;  2YDG A;  1FBI X;  2HU3 A;  1UIC A;  4NWE A;  1I56 A;  4ETE A;  1JSF A;  3WU9 A;  4OWB A;  4QY9 A;  4HJZ A;  2BLX A;  4WM6 A;  1IP6 A;  4H8X A;  5KXS A;  2IHL A;  1OUD A;  1JKC A;  4UWN A;  6LYT A;  5IDD A;  4NHT A;  1IVM A;  193L A;  1BB3 A;  1D0M A;  1NDM C;  1GXV 2;  3N9A A;  2ZYP A;  4DD9 A;  1W6Z A;  2W1Y A;  3A34 A;  1LZC A;  5I5Q A;  1IOQ A;  4H94 A;  1GFG A;  1YAO A;  1BWJ A;  1QDT A;  1AM7 A;  1LSP A;  1BB4 A;  5LA8 A;  2HUB A;  1B5Y A;  1B7S A;  1MLC E;  1YIL A;  2XJW A;  3W6D A;  3E3D A;  4LYT A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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