1BHZA

Low temperature middle resolution structure of hen egg white lysozyme from masc data
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Multiwavelength anomalous solvent contrast (MASC): derivation of envelope structure-factor amplitudes and comparison with model values.
pubmed doi rcsb
total genus 47
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1bhzA00
4TSCA 4ANRA 4H8ZA 1SLYA 1GBXA 2HU3A 3A96A 4D9ZA 3LYZA 4FJRA 5L9JA 3TMUA 1RJCB 1JISA 2I26L 1LPIA 1LZYA 1EQ4A 1LJFA 1GE2A 1WVUA 1LJHA 1DKKA 4YOPA 1LYOA 2BQFA 3AGHA 4YF2A 4NWEA 1GWDA 2YVBA 1B7LA 4MSTA 3B72A 4E3UA 1PZYA 1HMKA 1GFEA 2X0AA 1D9UA 1FLUA 1LKRA 1H87A 1IC4Y 1QDTA 1WQOA 2YDGA 3CT1A 4H9HA 4TSBA 1G7IC 2DQIY 1XGUC 1KXXA 4CFOA 1GBSA 2I6ZA 5B06A 5D5CA 5KXNA 5B1GA 3RNXA 3FI7A 4WL7A 3ZVQA 1JEFA 3CSRA 1GFJA 1HENA 4KPMA 3ZEKA 3TMVA 1MLCE 3CT0A 2YBIA 1WTMA 1V7TA 2HEBA 1UIBA 4WO6A 1CNSA 1YL0X 1DPXA 1IC5Y 5ILCA 1BQLY 2HEFA 5KXZA 2F4AA 1IP3A 2B5ZA 5II3A 3OJPA 4UWVA 4B4IA 5KXSA 4L41A 1LZ4A 5LAGA 135LA 1BGIA 3A6CY 2VB1A 1IWZA 1UACY 3A93A 4GN4A 1YAOA 1LJ4A 3ULRA 5LVGA 3RZ4A 1GBWA 1HF4A 1QQYA 1UICA 2ZNWY 5I53A 3WPKA 5J7CA 1VEDA 5L3IA 4XJFA 4WG1A 4QGZA 3WUAA 1VATA 1WQNA 4GCDA 2MEBA 1LMAA 2W1YA 3W6AA 1I1ZA 4LYZA 2YBHA 4WM4A 3AZ7A 1HEWA 1TDYA 208LA 2FBDA 2ZIKA 1LZCA 4HJZA 4N1CC 4NG1A 4OWAA 4PJ2C 4DC4A 2HECA 1KXWA 3P68A 5F9XA 4MR1A 1GBYA 2D4IA 2C8OA 3E3DA 1B5VA 1YKYX 1SQ2L 1IR9A 2YBNA 4XJDA 4B4JA 1RCMA 1B7PA 1I20A 1VDSA 3IJUA 5I4WA 4J7VA 1XEJA 1OUBA 5KXYA 4ETBA 2D6BA 5APDA 1GE1A 3CQLA 1DQJC 5DM9A 1C46A 1IP1A 1WQMA 4ZIXA 1IOSA 4WMGA 4B49A 4DD2A 1LSBA 1AZFA 1D0LA 4LT3A 1LSGA 4PRQA 3TXJA 3OK0A 3HBDA 5KXWA 1GE4A 1VDTA 3QE8A 1CKGA 4NHIA 1TCYA 4WG7A 5C6IA 2MEEA 3TMXA 4Z41A 4GLVA 2BQBA 4LGKA 5F81A 4HTNA 5APCA 5KXOA 4NGOA 1LMNA 4YEOA 1T3PA 1BB5A 1C43A 1CKCA 1B7SA 1JIYA 1LYYA 3AZ6A 3GXKA 3LYTA 4G4HA 4LT2A 1NKHA 1GB6A 4NGKA 4I0CA 1LHIA 5KXRA 4DD7A 1G7HC 1GF7A 2ZWBA 2DQJY 1NWGA 2H9KA 4IASA 5B07A 5LYZA 4KL7A 193LA 1AT5A 2HUBA 1IP4A 3TXEA 1XGPC 2FBBA 2MEGA 4WLTA 3W6DA 1B5YA 1GBZA 1DKJA 4NHSA 3T36A 4EMNA 3N9CA 1IX0A 1GXV2 4XJGA 4M4OA 3BKHA 1BWIA 207LA 1F6SA 2CWIA 3ATOA 1JSEA 1C10A 1TEWA 4LFPA 4NSHA 2D4JA 1DI3A 1IOTA 3AB6A 4CGEA 1B5UA 1OUEA 4H94A 4HPIA 1LZRA 2DQFC 1QTEA 1OUJA 1GFGA 4LYCA 2CGIA 2H5ZA 2YBJA 1IY4A 4QDNA 5APEA 3WU9A 1GFAA 1GFKA 4H9CA 3LZ2A 4X3BA 2BQNA 1UC0A 4WM1A 4LYBA 1LZEA 2C8PA 1RE2A 1W08A 4HTKA 3D3DA 1A4VA 1OUAA 1GB2A 5KXTA 5I54A 1DPWA 4N9RA 1N4FA 4H1PA 1G7JC 1NBZC 2D4KA 1JPOA 1LSEA 2BQEA 1GHLA 2Z18A 3WU8A 1YKXX 4HJYA 1OUCA 4B1AA 2MEDA 3B6LA 2Z38A 1LZ8A 3TXGA 4A7DA 2HEEA 3M18B 3N9EA 5T3FA 3RU5A 5KXXA 1UIAA 3AZ4A 1IP7A 3P4ZA 4H91A 2ZILA 1FBIX 4RLMA 4FDYA 5LA5A 4CHXA 5KY1A 4XN6A 1WTNA 3HBHA 2Z2FA 1PS5A 1LMTA 1YAQA 2LYZA 4OW1A 1GFUA 5B1FA 2BQAA 4Z98A 2XTHA 4PRUA 1HSXA 5FELA 194LA 1LJEA 2LYOA 2Y8PA 3WVYA 3B0KA 1UIDA 1CJ9A 1GFHA 1IR7A 1LHMA 1LHHA 1LYSA 1QIOA 1YL1X 4NIJA 4YM8A 7LYZA 8LYZA 1LZDA 4H90A 1LZGA 1D6PA 1C08C 1OQMA 1NHEA 1TBYA 4HV2A 4NGLA 132LA 2GV0A 5DL9A 1YANA 4NGJA 4J1AA 1XEIA 2IHLA 1CKHA 4NGZA 1UIHA 5A3ZA 1EQEA 3ATNA 3B0IA 4GLAA 1LJIA 1LSAA 4DD3A 5KXLA 4WLYA 4UWNA 3W3EA 1GFRA 1JKBA 4EOFA 1G7LC 1IWUA 5FCPA 3A92A 4GCBA 4G4CA 3M3UA 1D0MA 1FLWA 4WM2A 1FLQA 4NWHA 1G7MC 1WQPA 1IWYA 1LTMA 4W96A 4KT3A 3EXDA 1VFBC 1LSYA 3A3QA 4XJIA 1HEMA 1GF4A 1GXXA 2ZYCA 3WXTA 4ZFPA 1XFPL 5KXMA 4AGAA 5IELA 1F0WA 1KIRC 5ILFA 3WL2A 2WARA 4LT0A 4Z46A 134LA 1JJ1A 4WL6A 4LYOA 5I5QA 4GCCA 1KXYA 1IP2A 1NDGC 1QSAA 1LMPA 2W1LA 1GDXA 2BQJA 4DD1A 5LVJA 1ZMYL 1D6QA 1IR8A 4BAPA 1LHKA 5LXWA 4OWEA 1VDQA 5IHGA 1C7PA 1I56A 2W1MA 3CSZA 1ALCA 4I8SA 3A3RX 2BLYA 3TXHA 4GCFA 5LVKA 1HNLA 4PGJB 2ZNXY 4DD0A 1LJJA 1MELL 1B7MA 1FKVA 2I25L 4HPEA 1LOZA 4J0LA 2EQLA 3J4GA 1JUGA 4RDSA 3EMSA 2BQDA 4KXIA 1OUFA 4LZTA 5F16A 1JITA 2BQMA 3ZVQB 4ETDA 1IOCA 1D0KA 1BWJA 3MGWA 1IWVA 2BQKA 1CJ8A 2BPUA 1F6RA 1EQ5A 4Z3MA 1LZ6A 1GF5A 3WULA 1GAZA 4ML7A 4M6DA 2LHMA 4DDBA 1YILA 1BWHA 4ETEA 4H9BA 3D9AC 1LJNA 1HC0A 1GE3A 3LHMA 2DKVA 1LZBA 4N5RA 2MEAA 2BAAA 2RSCA 4GN3A 1UUZC 4DWXA 3TXIA 2G4PA 4XENA 4BADA 1FDLY 4DDCA 1IY3A 1W6ZA 2YBLA 3F6ZA 3EO5A 1RFPA 3N9AA 1GFTA 4OOOA 1JKCA 3SP3A 1CKFA 4C5FA 2Z12A 5FHWA 1CKDA 1QDRA 3IJVA 1B2KA 1XGTC 4WM5A 3HFMY 6LYZA 4QY9A 2XBSA 1REMA 3G3AB 1C45A 3AZ5A 4RLNA 4NFVA 4HP0A 2IFFY 4TTDA 3WUNA 5C6LA 5DN5A 1LSDA 5I4YA 4R0FA 1REYA 2Z37A 4CFPA 4N0JA 4NSGA 3AGGG 3P66A 1LJKA 3WYHA 1LJ3A 2LZTA 1JSFA 1CJ6A 2EIZC 4NGWA 4XJBA 1XSFA 2Z39A 3TXFA 3WMKA 4BS7A 5FEKA 3CSQA 2G4NA 1NBYC 1GF9A 1LMOA 5HMVA 1GF6A 3GXRA 1JKDA 3LN2A 1HSWA 1XGRC 5K7OA 3TXKA 1GB8A 1BVXA 1IWXA 1GEZA 4RW2A 2PC2A 3WXUA 2Z2EA 1IC7Y 4MCKA 1HFZA 1B7QA 1GAYA 4N1EI 1B5ZA 1H6MA 1YAMA 1HEPA 2D91A 2EKSC 4II8A 1ZV5L 1GFVA 4PHIA 3TXDA 1HFYA 4H92A 1BB6A 3A8ZA 1VDPA 5AMYA 5L3HA 1IP6A 4NEBA 3A91A 1GE0A 1LSPA 1RI8B 4ET9A 4WM3A 1CJ7A 5LYMA 4DT3A 1F10A 5LVIA 1YKZX 5KXPA 5LIOA 1DXJA 1OUDA 3LYMA 1B7NA 2DBTA 4GCEA 4W94A 4AXTA 2BQIA 1WQRA 4DYGA 5LINA 1DI5A 1INUA 3WPJA 4QEQA 3K3TA 1BHZA 3J6KA 1B7RA 4H9AA 2BQGA 1GB9A 1V7SA 4NSIA 5HNCA 5KKIA 1FN5A 1LKSA 5B59A 1IVMA 5LA8A 2NWDX 3VWOA 3AJNA 4OOTA 3QNGA 1UBZA 3TXBA 2F30A 5LVHA 5I4XA 4TWSA 1FLYA 2DQEY 1GB7A 1O23A 1J1OY 1REZA 1LHJA 1JJ3A 1UIFA 3FE0A 4NY5A 1DI4A 3AGIA 4G9SA 4BAFA 1YROA 1E8LA 2N5ZA 1HFXA 1LZSA 1XEKA 1UA6Y 4N8ZA 5M1YA 1GB5A 1YIKA 4LYTA 1IOQA 1VAUA 1IEEA 5E9RA 4H8XA 4UWUA 1IORA 1IWTA 5A3EA 1LZ9A 1HHLA 4B0DA 1B7OA 1KIQC 4H9EA 1EL1A 2DQGY 3AYQA 2XBRA 1IIZA 4ZEEA 1JJ0A 3LYOA 4H9FA 3A6BY 3HBEX 4YEMA 154LA 1IP5A 4XYYA 4C3WA 2DQDY 1XGQC 1A2YC 4TUNA 1B5WA 4WLDA 5IDDA 1UIGA 4ETAA 4OWCA 1AM7A 4WO9A 2MECA 3CT5A 1JKAA 4NHTA 5F9UA 5LYTA 4GN5C 4NGVA 3W6CA 2MEFA 1JHLA 3G3BB 2Q0MX 1QSWA 2G4QA 3WPLA 3P64A 3AW7A 2MEIA 4O34A 3A34A 3A95A 3B0OA 1JWRA 1LZAA 3IWRA 2AUBA 1LZNA 4H9IA 1HEOA 1B5XA 1GF3A 1TAYA 3A90A 4J1BA 1J1XY 3RW8A 2BQOA 4NHQA 5EBHA 3AW6A 1LSFA 1Z55A 1LYZA 4G49A 4HTQA 1IWWA 2HU1A 4G4BA 2HTXA 4LT1A 4DD9A 1LZ1A 4IATA 1REXA 1LJGA 3WVXA 5HLLA 4OWBA 3W6FA 1LSNA 1HERA 1GF8A 1LMQA 1LZ5A 2LYMA 1OUGA 1LCNA 1GEVA 1BVKC 2EPEA 4H8YA 4LFXA 4WLXA 3WW5A 1GB0A 2DQHY 3BKVA 2HEAA 1DZBX 4XADA 1QUSA 1UCOA 1WQQA 1HELA 1OP9B 5FSTA 2Z19A 5D5FA 5LAFA 4WOAA 1ZVHL 3W6BA 3WH1A 4ET8A 4CJ2A 1LHLA 2LZ2A 133LA 1AKIA 2BQLA 1JTTL 4R6CA 3T6UA 3A67Y 4DDAA 1LZTA 4WM6A 4TX7A 4IJ4A 2FYDA 153LA 2HEDA 5DN4A 2CJLA 1YQVY 1LSZA 3P65A 3A94A 5E4PA 1P2CC 3TMWA 3WW6A 1GPQC 1WVVA 1OUIA 4PPOA 4YENA 4HV1A 5APFA 4NG8A 2DQCY 1B9OA 1B0DA 2ZQ4A 5FDJA 5KJ9A 3KAMA 5B05A 2ZIJA 3QY4A 1QUTA 2F2NA 1ZVYB 2W1XA 3EBAB 1AT6A 4NGIA 2DQAA 2MEHA 2YSSC 1YAPA 4LYMA 2BQCA 4NSJA 1JTOL 2A7FA 1LAAA 1OUHA 2H9JA 5DLAA 1T6VL 2CDSA 1LSMA 2ZYPA 4OWHA 1KIPC 1FKQA 1GD6A 1HEQA 1QTKA 2F4GA 4P2EA 3LZTA 2ZQ3A 3CB7A 3WUMA 1BB3A 1BB4A 2BQHA 4XJHA 1IO5A 1NF5A 2BLXA 3RT5X 9LYZA 5HMJA 1JTPL 5C6JA 1GDWA 4NHPA 1HMLA 6LYTA 2YBMA 1GBOA 5HNLA 5F14A 4ETCA 5JENB 2XJWA 1BB7A 3WU7A 1LSCA 1NQIA 4HJVA 4NGYA 5HQ1A 2A7DA 4RW1A 1LMCA 4HSFA 3W6EA 5KKJA 1UIEA 2FYCA 1NMMA 5KXKA 4U3XB 4B4EA 1GF0A 1J1PY 1GB3A 4H93A 1NDMC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H8ZA 3A96A 3PBLA 1G06A 1JTMA 238LA 245LA 1ZWNA 3V2WA 1WVUA 138LA 177LA 4DJHA 2BQFA 4MSTA 3ODUA 1GFEA 2X0AA 2YDGA 1H87A 1WQOA 3CT1A 1G7IC 1XGUC 1PQIA 5KXNA 1JEFA 1HENA 161LA 1LYFA 3ZEKA 1MLCE 4WO6A 2HEBA 1YL0X 1DPXA 168LA 1IP3A 1OWZA 3OJPA 4L41A 135LA 4I7SA 1TLAA 1YAOA 1GBWA 1UICA 1L47A 3WPKA 196LA 5L3IA 4K5YA 1WQNA 242LA 3PDSA 102LA 4WM4A 208LA 4DC4A 1C65A 1SQ2L 1SSYA 1L02A 2Z6BA 3IJUA 2B6WA 257LA 1LYHA 5APDA 1L51A 4ZIXA 244LA 1D0LA 2OE4X 3HBDA 5KXWA 1QUDA 228LA 4LGKA 200LA 4HTNA 1L41A 5APCA 3LYTA 3GXKA 4G4HA 1NKHA 1L79A 4W56A 4DD7A 1G7HC 4IASA 5LYZA 1NWGA 3L64A 2HUBA 1IP4A 1L91A 1D3MA 1GBZA 3N9CA 1GXV2 4ARPA 3ATOA 2F47A 1C10A 1C6CA 262LA 4LFPA 4CGEA 1OUJA 1GFGA 4LYCA 1CX7A 2CGIA 1D3JA 3CDTA 3DN4A 247LA 4H9CA 4WM1A 1W08A 3SB8A 4HTKA 1A4VA 1L03A 235LA 2OU8A 1G7JC 1L43A 1LSEA 2BQEA 2Z18A 1YKXX 4B1AA 4A7DA 3TXGA 2Z38A 1LZ8A 3N9EA 5T3FA 5KXXA 1L72A 1IP7A 2RB0X 3P4ZA 3OE9A 118LA 4EJ4A 1WTNA 2OE9X 2LYZA 3VW7A 4OW1A 2BQAA 1HSXA 5FELA 231LA 3WVYA 1L96A 1L28A 1LHHA 1LYSA 1YL1X 5I14A 1D6PA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4TSC A;  4ANR A;  4H8Z A;  1SLY A;  1GBX A;  2HU3 A;  3A96 A;  4D9Z A;  3LYZ A;  4FJR A;  5L9J A;  3TMU A;  1RJC B;  1JIS A;  2I26 L;  1LPI A;  1LZY A;  1EQ4 A;  1LJF A;  1GE2 A;  1WVU A;  1LJH A;  1DKK A;  4YOP A;  1LYO A;  2BQF A;  3AGH A;  4YF2 A;  4NWE A;  1GWD A;  2YVB A;  1B7L A;  4MST A;  3B72 A;  4E3U A;  1PZY A;  1HMK A;  1GFE A;  2X0A A;  1D9U A;  1FLU A;  1LKR A;  1H87 A;  1IC4 Y;  1QDT A;  1WQO A;  2YDG A;  3CT1 A;  4H9H A;  4TSB A;  1G7I C;  2DQI Y;  1XGU C;  1KXX A;  4CFO A;  1GBS A;  2I6Z A;  5B06 A;  5D5C A;  5KXN A;  5B1G A;  3RNX A;  3FI7 A;  4WL7 A;  3ZVQ A;  1JEF A;  3CSR A;  1GFJ A;  1HEN A;  4KPM A;  3ZEK A;  3TMV A;  1MLC E;  3CT0 A;  2YBI A;  1WTM A;  1V7T A;  2HEB A;  1UIB A;  4WO6 A;  1CNS A;  1YL0 X;  1DPX A;  1IC5 Y;  5ILC A;  1BQL Y;  2HEF A;  5KXZ A;  2F4A A;  1IP3 A;  2B5Z A;  5II3 A;  3OJP A;  4UWV A;  4B4I A;  5KXS A;  4L41 A;  1LZ4 A;  5LAG A;  135L A;  1BGI A;  3A6C Y;  2VB1 A;  1IWZ A;  1UAC Y;  3A93 A;  4GN4 A;  1YAO A;  1LJ4 A;  3ULR A;  5LVG A;  3RZ4 A; 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 2DQH Y;  3BKV A;  2HEA A;  1DZB X;  4XAD A;  1QUS A;  1UCO A;  1WQQ A;  1HEL A;  1OP9 B;  5FST A;  2Z19 A;  5D5F A;  5LAF A;  4WOA A;  1ZVH L;  3W6B A;  3WH1 A;  4ET8 A;  4CJ2 A;  1LHL A;  2LZ2 A;  133L A;  1AKI A;  2BQL A;  1JTT L;  4R6C A;  3T6U A;  3A67 Y;  4DDA A;  1LZT A;  4WM6 A;  4TX7 A;  4IJ4 A;  2FYD A;  153L A;  2HED A;  5DN4 A;  2CJL A;  1YQV Y;  1LSZ A;  3P65 A;  3A94 A;  5E4P A;  1P2C C;  3TMW A;  3WW6 A;  1GPQ C;  1WVV A;  1OUI A;  4PPO A;  4YEN A;  4HV1 A;  5APF A;  4NG8 A;  2DQC Y;  1B9O A;  1B0D A;  2ZQ4 A;  5FDJ A;  5KJ9 A;  3KAM A;  5B05 A;  2ZIJ A;  3QY4 A;  1QUT A;  2F2N A;  1ZVY B;  2W1X A;  3EBA B;  1AT6 A;  4NGI A;  2DQA A;  2MEH A;  2YSS C;  1YAP A;  4LYM A;  2BQC A;  4NSJ A;  1JTO L;  2A7F A;  1LAA A;  1OUH A;  2H9J A;  5DLA A;  1T6V L;  2CDS A;  1LSM A;  2ZYP A;  4OWH A;  1KIP C;  1FKQ A;  1GD6 A;  1HEQ A;  1QTK A;  2F4G A;  4P2E A;  3LZT A;  2ZQ3 A;  3CB7 A;  3WUM A;  1BB3 A;  1BB4 A;  2BQH A;  4XJH A;  1IO5 A;  1NF5 A;  2BLX A;  3RT5 X;  9LYZ A;  5HMJ A;  1JTP L; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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