1BICA

Crystallographic analysis of thr-200-> his human carbonic anhydrase ii and its complex with the substrate, hco3-
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTHPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Crystallographic analysis of Thr-200-->His human carbonic anhydrase II and its complex with the substrate, HCO3-.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bicA00
4KUVA 5BRUA 4ZWYA 3QYKA 1YDBA 5HPJA 1DMYA 1CA3A 1I90A 4JS6A 4CNRA 1AZMA 2HFWA 5EZTX 3MWOA 1CVFA 1RJ5A 5SZ4A 3R17B 5SZ2A 3T5UA 4ITPA 3S97A 4MDMA 4QJ0A 5SZ7A 2NXTA 4CA2A 5FNGA 5EH5A 3M14A 1ZFQA 1ZNCA 3W6IA 4Z0QA 1BN1A 3D8WA 4DZ7A 3N3JA 8CA2A 1CCTA 5G01A 4CNXA 3S76A 1G48A 1TE3X 2ZNCA 5EKMA 1KWQA 4Q99A 1CCUA 4C3TA 3KIGA 1V9EA 4QK3A 4Z1NA 4LU3A 2CBAA 12CAA 2QOAA 9CA2A 4ZWZA 4Q83A 1HEBA 1JV0A 1ZGEA 4QY3A 2WEJA 5E2MA 4YGLA 3MHLA 1FQRA 4WUQA 2IT4A 3C7PA 5AMDA 1FSQA 1RZDA 1XEVA 3JXGA 1RZBA 4Y0JA 1KEQA 4KV0A 1CVDA 1YO0A 3BL1A 2NNVA 5FLSA 2NWZA 4LP6A 1YO1A 4L5UA 4ZWIA 3DVDA 3BL0A 4Q0LA 2HKKA 3MNIA 4K0ZA 5FLRA 5SZ3A 3RYYA 4E5QA 3FW3A 3N0NA 2NNSA 5JESB 3N2PA 4E3GA 4YGFA 1I8ZA 2X7SA 3T83A 1G0EA 3S71B 3W6HA 4QIYA 4HEZA 5FDIA 3RG3A 3DD0A 3F7UA 1G53A 5G0CA 4L5WA 5JEPB 3V3JA 2FOVA 2VVAX 5J8ZA 3MHIA 5DVXA 4WR7A 1AVNA 2HOCA 1J9WA 4QJMA 5FLTA 1TG9A 4YGNA 7CA2A 4N16A 5SZ1A 1CA2A 3M04A 1FQMA 5EIJA 5L6KA 1THKA 2CBCA 5JEHB 1CVBA 5EHVA 2CABA 4XE1A 3DA2A 1UGBA 3MDZA 5JEGB 3MHCA 1H9QA 3OILA 1ZH9A 4R5BA 1I9PA 1HUGA 3RZ8A 5SZ6A 3DD8A 4KP8A 3VBDA 1UGCA 4M2UA 3OYSA 4Q07A 2FW4A 5E5RA 1BNTA 3IGPA 1HVAA 1ZFKA 4JSWA 1CVCA 4QSJA 3DBUA 1TTMA 3JXHC 1CNWA 4HT2A 4HU1A 4KNNA 2FOSA 4RUZA 1G3ZA 1Z9YA 5BYIA 1RAZA 1JD0A 5G03A 3MHOA 1BCDA 1DCAA 4Q81A 4KNMA 1LG5A 2WD3A 2NMXA 4QIZA 5DSNA 4JSAA 3RZ5A 4CACA 5DRSA 4K0TA 4Q78A 4FPTA 2EU2A 5SZ5A 2NWPA 4BF6A 2F14A 3K34A 1RZAA 4COQA 3M2ZA 4YVYA 4QK2A 2GD8A 2NNOA 1MOOA 3HLJA 3HFPA 3S9TA 1CNYA 1XEGA 1Y7WA 2AX2A 4Q90A 3F7BA 3TMJA 5EH8A 1BNVA 5E2NA 1YO2A 1UGFA 2CA2A 4ZAOA 1I9NA 3F8EA 1CVAA 2FOUA 1IF5A 4K0SA 4ITOA 3IAIA 4KAPA 4N0XB 3PYKA 4G0CA 5L3OA 3P5AA 2POUA 5AMGA 3NJ9A 2WD2A 3P5LA 1UGGA 4KNIA 4KNJA 1FR7A 1ZSCA 3M1JA 1G46A 1BNQA 4RIVA 4WW6A 3EFTA 1CZMA 3S74B 5CJFA 1CILA 3CZVA 1BV3A 3MNKA 4Q7VA 4FL7A 4YYTA 2QO8A 3N4BA 2NWYA 4RUYA 3M2NA 4PYYA 3M98A 5FL6A 4MLTA 3RGEA 3MNAA 3KNEA 2FMGA 1DMXA 1ZSBA 2AW1A 4Z1EA 3MNJA 1KOPA 4Q08A 4YWPA 1CRMA 5FLQA 3UYQA 2W2JA 2X7TA 3HKNA 4Q6EA 5DSIA 3MYQA 2Q1QA 4RFCA 5CLUA 5A6HA 4E3HA 3V2MA 3T84A 1V9IC 3KONA 3V3IB 4PYXA 5EH7A 1I9OA 3HKTA 3B4FA 4YGJA 4QJOA 1HUHA 1KOQA 2NN1A 3M67A 4FVNA 3TVNX 1FQNA 5DSPA 3HKQA 3DVBA 3K7KA 4WL4A 4PQ7A 1FR4A 1FQLA 4QK1A 3D92A 1UGDA 4IWZA 5FLOA 1CAZA 1CNBA 2QP6A 3M3XA 1LGDA 3NI5A 5DSKA 3S72B 4Z1KA 2H4NA 3TVOX 3OIKA 4Q09A 1AM6A 4FU5A 4LHIA 2Q1BA 1CALA 4YXUA 3KS3A 3U7CA 2FOYA 2ILIA 4FVOA 4JSZA 1JCZA 1G54A 3JXFA 3D0NA 3M1WA 3T85A 3ML5A 3MZCA 1RZEA 5DSRA 4E49A 1CAIA 1FSNA 1IF9A 2CBBA 4YHAA 4R5AA 1OKNA 4YX4A 2WEGA 3T82A 5FLPA 3U47A 3S75B 1YDDA 1F2WA 3BETA 5FNJA 5IPZA 3CA2A 1UGEA 3S78B 1A42A 3IEOA 5G0BA 5E28A 5FNLA 5FL5A 4Q7SA 3ZNCA 3DC9A 4XIXA 2HL4A 1CNCA 4YXOA 1CIMA 1G1DA 1I9MA 3P3HA 4Q49A 4MO8A 4Q06A 1IF8A 1CINA 1ZE8A 1CNKA 1MUAA 4UOVA 3S77B 1ZGFA 5SZ0A 5EHWA 5EHEA 3HS4A 4Q7WA 3V5GA 5C8IA 4L5VA 1TBTX 4KUWA 3M5TA 5BRVA 4CQ0A 3M1KA 3PO6A 1EOUA 4QJPA 4DZ9A 5EKHA 1IF6A 3GZ0A 2CBDA 2CBEA 3DCWA 4QTLA 2HNCA 5JGTB 4HT0A 1HEAA 1G45A 5FNMA 1OQ5A 4E4AA 1DCBA 1IF7A 1FSRA 1YDAA 3V7XA 2POWA 5FNHA 4E9OX 3LXEA 4QJXA 3P3JA 4WW8A 4PXXA 1CAJA 4RUXA 1BN4A 3OKUA 5E5UA 4ZX0A 3D93A 3MNHA 4Z1JA 3FE4A 2EU3A 2OSMA 4Q7PA 4K1QA 5JQ0A 3DC3A 2FNMA 3OKVA 3B1BA 1BNUA 2O4ZA 3M96A 1G52A 3OIMA 4PZHA 3K2FA 3CYUA 1G4OA 3DV7A 4RIUA 3MNUA 3IBLA 4Q8ZA 3IBIA 4MTYA 4M2WA 5E2RA 3RYVB 3RZ1B 3UYNA 3SAXA 3SBHA 4E3DA 5JG3B 4HF3A 2HD6A 3D9ZA 3L14A 3M2XA 3M2YA 1CCSA 1OKLA 3IBUA 3M5EA 2POVA 5DSOA 5CACA 4GL1X 4X5SA 3KLDB 1TEUX 2FNNA 3CAJA 4G7AA 5JQTA 1CANA 4HEYA 4M2RA 3DVCA 1HECA 5FNKA 3S73B 2NXSA 4HEWA 4CNVA 2ABEA 4QEFA 3MHMA 3T5ZA 5A25A 2NNGA 3M5SA 1OKMA 4WUPA 5E2KA 3SBIA 3RZ7A 1G4JA 4TWMA 3RYZA 4E3FA 4ZWXA 3U3AX 1TEQX 4KUYA 4TWLA 3V3FA 1LUGA 4ZX1A 3V3HB 4R59A 1BICA 3OYQA 1I9LA 2FMZA 5EKJA 1I91A 4FRCA 3PJJA 1Z93A 5AMLA 5DSJA 4BF1A 3P4VA 5BRWA 2FOQA 1XQ0A 1CVHA 5LMDA 3RYXB 1BNNA 1RZCA 1G0FA 1URTA 6CA2A 2H15A 2WEOA 3R16A 4MLXA 2VVBX 3RYJB 3V2JA 4YGKA 3KOIA 1LG6A 4XZ5A 3RG4A 1CAHA 1BNMA 4BCWA 1CVEA 1ZSAA 3ZP9A 1XPZA 3Q31A 3DCSA 3HKUA 1BZMA 5FL4A 1KWRA 1TB0X 5EOIA 4FIKA 2GEHA 2EZ7A 5JG5B 1CAMA 1H9NA 5E2SA 3EFIA 5CA2A 4ETQC 4IDRX 3OY0A 4QSIA 5FNIA 4XIWA 3P55A 1CAOA 4RFDA 1HCAA 2NXRA 5DSQA 2X7UA 1CNGA 2NN7A 4HBAA 2WEHA 3MMFA 4QSAA 4XFWA 1H4NA 1RAYA 5DOHA 5JDVB 1CNHA 1CNJA 5DOGA 1FLJA 1BN3A 4JSSA 1BNWA 4KP5A 1G6VA 3V3GB 1IF4A 3KKXA 5DSLA 1T9NA 3DAZA 1CRAA 4K13A 3S8XA 1Z97A 5FDCA 1YDCA 4QJWA 1CAKA 1CNXA 3KOKA 3M40A 3RJ7A 1HEDA 3P44A 3KWAA 3IBNA 3M1QA 1HCBA 1TG3A 4Q8YA 1CNIA 2Q38A 4RH2A 4RN4A 1TH9A 2NWOA 3RZ0B 3FFPX 4CNWA 4Q6DA 4Q87A 4QSBA 2OSFA 3F4XA 1CAYA 4M2VA 3RLDA 2FNKA 3P58A 4MDGA 5BNLA 3NB5A 4ILXA 1I9QA 4YXIA 4Q8XA 3DCCA 1UGAA 1RJ6A 4MDLA 3ML2A 5DSMA 4Q9YA 1LZVA 3U45X 3SAPA 5JGSB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1CNJ A;  5DOG A;  1FLJ A;  1BN3 A;  4JSS A;  1BNW A;  4KP5 A;  1G6V A;  3V3G B;  1IF4 A;  3KKX A;  5DSL A;  1T9N A;  3DAZ A;  1CRA A;  4K13 A;  3S8X A;  1Z97 A;  5FDC A;  1YDC A;  4QJW A;  1CAK A;  1CNX A;  3KOK A;  3M40 A;  3RJ7 A;  1HED A;  3P44 A;  3KWA A;  3IBN A;  3M1Q A;  1HCB A;  1TG3 A;  4Q8Y A;  1CNI A;  2Q38 A;  4RH2 A;  4RN4 A;  1TH9 A;  2NWO A;  3RZ0 B;  3FFP X;  4CNW A;  4Q6D A;  4Q87 A;  4QSB A;  2OSF A;  3F4X A;  1CAY A;  4M2V A;  3RLD A;  2FNK A;  3P58 A;  4MDG A;  5BNL A;  3NB5 A;  4ILX A;  1I9Q A;  4YXI A;  4Q8X A;  3DCC A;  1UGA A;  1RJ6 A;  4MDL A;  3ML2 A;  5DSM A;  4Q9Y A;  1LZV A;  3U45 X;  3SAP A;  5JGS B; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 4KUV A;  5BRU A;  4ZWY A;  3QYK A;  1YDB A;  5HPJ A;  1DMY A;  1CA3 A;  1I90 A;  4JS6 A;  4CNR A;  1AZM A;  2HFW A;  5EZT X;  3MWO A;  1CVF A;  1RJ5 A;  5SZ4 A;  3R17 B;  5SZ2 A;  3T5U A;  4ITP A;  3S97 A;  4MDM A;  4QJ0 A;  5SZ7 A;  2NXT A;  4CA2 A;  5FNG A;  5EH5 A;  3M14 A;  1ZFQ A;  1ZNC A;  3W6I A;  4Z0Q A;  1BN1 A;  3D8W A;  4DZ7 A;  3N3J A;  8CA2 A;  1CCT A;  5G01 A;  4CNX A;  3S76 A;  1G48 A;  1TE3 X;  2ZNC A;  5EKM A;  1KWQ A;  4Q99 A;  1CCU A;  4C3T A;  3KIG A;  1V9E A;  4QK3 A;  4Z1N A;  4LU3 A;  2CBA A;  12CA A;  2QOA A;  9CA2 A;  4ZWZ A;  4Q83 A;  1HEB A;  1JV0 A;  1ZGE A;  4QY3 A;  2WEJ A;  5E2M A;  4YGL A;  3MHL A;  1FQR A;  4WUQ A;  2IT4 A;  3C7P A;  5AMD A;  1FSQ A;  1RZD A;  1XEV A;  3JXG A;  1RZB A;  4Y0J A;  1KEQ A;  4KV0 A;  1CVD A;  1YO0 A;  3BL1 A;  2NNV A;  5FLS A;  2NWZ A;  4LP6 A;  1YO1 A;  4L5U A;  4ZWI A;  3DVD A;  3BL0 A;  4Q0L A;  2HKK A;  3MNI A;  4K0Z A;  5FLR A;  5SZ3 A;  3RYY A;  4E5Q A;  3FW3 A;  3N0N A;  2NNS A;  5JES B;  3N2P A;  4E3G A;  4YGF A;  1I8Z A; 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