1BNWA

Carbonic anhydrase ii inhibitor
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
Knots found
sequence length
256
structure length
256
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE
publication title Structural analysis of inhibitor binding to human carbonic anhydrase II.
pubmed rcsb
total genus 73
structure length 256
sequence length 256
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1998-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1bnwA00
4E3HA 1RZDA 3P5AA 5AMDA 4ITOA 4XIXA 1CAKA 4ZWIA 3EFIA 1MUAA 3DD8A 3DVDA 4FL7A 4KNIA 1I9MA 3IAIA 4MLTA 1ZE8A 4PYXA 3F7BA 3S74B 4RN4A 3N2PA 2CA2A 3KOKA 1Z93A 2NN7A 4Z1EA 5E2NA 1CIMA 3V2JA 1FQLA 2ZNCA 3M40A 4K13A 1AZMA 1DCAA 3KOIA 3V3GB 4Q7SA 2POWA 4ETQC 4E3GA 3F4XA 3RYXB 4CACA 3NI5A 1G1DA 3OKVA 3W6HA 4QJMA 3RYJB 2NNVA 4QJWA 9CA2A 5EKMA 4G7AA 4CNXA 5J8ZA 4KUYA 1CVAA 1RAYA 1XEVA 5EIJA 4RFDA 3VBDA 4Z0QA 1HVAA 5EZTX 2FNMA 3BL1A 1BN4A 1FR4A 5DSQA 1CA2A 4ZAOA 4FVOA 4JSWA 3LXEA 3DV7A 3M14A 2QP6A 4YXIA 3SBHA 6CA2A 3FFPX 4BF6A 3M1WA 5CACA 2OSMA 1UGAA 2X7SA 3N4BA 3T85A 1ZFQA 3RYYA 3M1KA 5E2SA 5DOGA 5FDCA 4ZX1A 1AM6A 3RYZA 2NN1A 3D92A 1V9EA 1FQMA 5EH8A 2Q38A 4QTLA 3M04A 1HEBA 1CAOA 1I91A 1IF6A 3L14A 3U3AX 1H9QA 1I9QA 4XIWA 5FLTA 1YDBA 1HEAA 1HECA 4Q7WA 4M2RA 1BNMA 1H9NA 5FNIA 5G03A 5AMGA 4YXOA 5EHVA 2FW4A 1CNIA 1J9WA 5DSRA 4QSJA 5JQTA 1G53A 4HEZA 1I8ZA 5DSMA 3V3FA 3JXFA 3N0NA 1TE3X 1YO2A 3KKXA 4WL4A 5SZ6A 5SZ3A 4Q7PA 3W6IA 2NXRA 3M1JA 3T5ZA 4COQA 2FOUA 3SAXA 3S72B 7CA2A 1ZFKA 5EH7A 3EFTA 3MNKA 1ZSCA 5JEPB 5CLUA 5JEGB 1UGDA 5FL4A 3R17B 3BETA 1CANA 1LUGA 1DMXA 3T83A 3F7UA 1G52A 3MHLA 3M5SA 3V5GA 4JSSA 5FL5A 3ZNCA 4M2UA 4Q8YA 4XZ5A 1RZBA 3P3JA 3FE4A 5EOIA 3U47A 2CBAA 4KUVA 3HKUA 3K34A 2HL4A 4Q8ZA 4YGJA 4E5QA 1TEQX 4XE1A 4QIZA 1KOPA 3KNEA 2HFWA 1BCDA 3T84A 4Q6EA 3P44A 5FLPA 1ZH9A 2EU3A 4QJOA 3M67A 3TVOX 4PZHA 1CCTA 3HKNA 4BCWA 3IBUA 3DCSA 2EU2A 3M1QA 1UGFA 3MNJA 4TWLA 1CNXA 4IWZA 5E28A 5FNGA 1OKNA 5JG3B 1HCBA 1CAHA 3M2NA 3TVNX 4WUQA 1LG6A 1ZGEA 4ILXA 4QJPA 1DCBA 2NXTA 3RYVB 4RUXA 3GZ0A 3T82A 4YGLA 3DCCA 1G48A 2NNOA 3S77B 1OKMA 3HKTA 3JXGA 4LP6A 4PXXA 4DZ9A 2QO8A 5SZ7A 4QIYA 1Z97A 1LGDA 4Z1JA 4R5AA 5G0BA 2NMXA 5L3OA 4Q83A 4FIKA 4MDGA 3OY0A 1BN1A 1ZGFA 3RZ8A 1IF7A 1I9OA 5JGTB 1I9NA 3DD0A 1KEQA 1THKA 2FMGA 4ZWYA 1TEUX 5FLSA 2H15A 1YO0A 2FNNA 3S9TA 3M2YA 4QK1A 4RH2A 4XFWA 4YVYA 1CVEA 3S75B 3D9ZA 5DVXA 3KWAA 2FOYA 2HD6A 1CINA 4KAPA 3ML5A 1A42A 2Q1BA 1CVCA 2FOVA 4FRCA 4Q81A 3DBUA 1G4JA 1T9NA 3MNHA 4QEFA 4MTYA 1ZNCA 3B1BA 3MHCA 5FL6A 3SBIA 5BRWA 5DSIA 4Q08A 2NNGA 5DSLA 5L6KA 1G3ZA 1F2WA 4YYTA 5BNLA 1G45A 4QSBA 4HEYA 3MWOA 2ABEA 4ZX0A 3OKUA 1TG9A 4GL1X 3ZP9A 3RJ7A 2X7UA 1CCUA 1TBTX 4FU5A 4YHAA 3CZVA 4IDRX 2CBBA 2NWZA 4K0ZA 4PYYA 4YWPA 4K0SA 3RZ5A 3M98A 4E49A 2HOCA 5JDVB 3DAZA 2X7TA 1CVDA 4MDMA 3Q31A 4HU1A 3D93A 4YX4A 3KIGA 1CZMA 4WUPA 3V3JA 2Q1QA 2NWPA 3S73B 3S78B 3B4FA 2GD8A 5G0CA 4ITPA 5SZ1A 5DSNA 1UGBA 5FLQA 3IBLA 3DC9A 4YGKA 1CNBA 4K1QA 3M5EA 4BF1A 3RZ0B 4N16A 4CQ0A 2WEGA 3DVCA 4ZWZA 1V9IC 1CRMA 3P58A 4Q78A 1BNWA 4JS6A 3MYQA 4KV0A 3MZCA 3QYKA 4Q0LA 4Q87A 3S8XA 3MDZA 1CVHA 3R16A 4Q6DA 1CCSA 1YO1A 4HT0A 5FDIA 3RG4A 2W2JA 2CBEA 4LU3A 3KLDB 3N3JA 5EHEA 4E9OX 1FR7A 3RGEA 1KWRA 3C7PA 2FNKA 4Z1KA 1FQNA 4MLXA 1KOQA 2HNCA 1URTA 5DRSA 4WR7A 1FQRA 5DSOA 4FPTA 4Q07A 4QJ0A 4MO8A 2POVA 4Q9YA 3TMJA 1Z9YA 1FSQA 2FOSA 4QK3A 3FW3A 1I9PA 3P5LA 3HKQA 5FNKA 8CA2A 3KONA 5E2MA 3S97A 3RZ7A 3V7XA 1I9LA 4QY3A 3S71B 4UOVA 2AW1A 5JQ0A 4YXUA 3MHIA 3NB5A 3RG3A 1FSNA 3U7CA 3UYNA 1CNWA 1BNQA 2CABA 1CNYA 5FNMA 3SAPA 1IF9A 3HS4A 4HBAA 3MMFA 4M2VA 1UGEA 3CYUA 1CVBA 1BNVA 5SZ2A 5CA2A 1CNKA 1LZVA 2GEHA 3JXHC 2CBDA 4M2WA 2WD3A 1XQ0A 1G4OA 3M5TA 3MNIA 5A25A 1UGGA 1BNUA 2FMZA 3M2ZA 4CNWA 1RJ6A 4Q09A 3M3XA 3BL0A 1FLJA 4QK2A 5AMLA 1LG5A 4Y0JA 2CBCA 2WEOA 3NJ9A 3M96A 5A6HA 4E4AA 5JEHB 1CNJA 3HFPA 1I90A 3OIMA 4JSAA 4YGNA 5JESB 5SZ4A 4KNMA 1CAJA 1ZSBA 1CNHA 3DC3A 4E3DA 5LMDA 1DMYA 5BRUA 1UGCA 3OYSA 4RUZA 1CAYA 1BV3A 1RZEA 2H4NA 5FLRA 4R5BA 4Q7VA 3HLJA 1XPZA 1CAIA 2WEHA 1CAZA 2POUA 4QSAA 5SZ5A 4HT2A 1JCZA 1RAZA 3PO6A 3S76A 1TB0X 4FVNA 2ILIA 1CVFA 3PYKA 4YGFA 5G01A 3F8EA 4HEWA 1HUHA 1G0EA 1H4NA 2OSFA 4L5WA 5DSJA 2NNSA 4MDLA 4ZWXA 3IGPA 3IEOA 1OKLA 1CALA 1IF8A 1CA3A 1TG3A 2WD2A 5EH5A 2NXSA 2FOQA 5E5UA 3OIKA 4Q99A 4QSIA 3V3HB 1CRAA 5E2KA 3IBNA 3CAJA 1IF5A 2WEJA 2AX2A 5HPJA 3D0NA 1BNTA 1RZCA 4HF3A 4QJXA 1FSRA 1YDCA 3DA2A 2IT4A 5EKHA 4TWMA 4WW8A 1IF4A 4L5VA 3T5UA 4Q8XA 3IBIA 3DCWA 3DVBA 1KWQA 3CA2A 3M2XA 3PJJA 1G46A 3MNAA 1RJ5A 2NWYA 4KP8A 5DSKA 5IPZA 4Q49A 3P55A 4G0CA 1G54A 3D8WA 4PQ7A 4N0XB 5E2RA 5EKJA 5FNHA 1G0FA 1CNGA 3MNUA 3OYQA 1CILA 4R59A 3K7KA 1CNCA 4K0TA 4X5SA 5BRVA 1JD0A 2NWOA 1G6VA 1Y7WA 1ZSAA 4Q06A 5JGSB 2EZ7A 3OILA 4RUYA 3RLDA 1RZAA 5FNJA 1EOUA 1TTMA 3V3IB 5C8IA 1HEDA 5E5RA 4JSZA 1AVNA 5BYIA 5SZ0A 4Q90A 4CNRA 4KNJA 2VVAX 3UYQA 1HUGA 12CAA 2HKKA 2F14A 4C3TA 4Z1NA 4RFCA 1YDDA 4CA2A 4KNNA 3ML2A 5FNLA 1BNNA 1MOOA 1XEGA 3MHOA 4RIVA 5DSPA 4DZ7A 4L5UA 3V2MA 4LHIA 1OQ5A 3KS3A 3MHMA 3P3HA 1TH9A 4RIUA 1BICA 3P4VA 1BZMA 5EHWA 1HCAA 3RZ1B 4CNVA 2VVBX 4WW6A 2QOAA 2O4ZA 5DOHA 4KP5A 4KUWA 1YDAA 5JG5B 1BN3A 5CJFA 5FLOA 1JV0A 4E3FA 3U45X 3K2FA 1CAMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4E3H A;  1RZD A;  3P5A A;  5AMD A;  4ITO A;  4XIX A;  1CAK A;  4ZWI A;  3EFI A;  1MUA A;  3DD8 A;  3DVD A;  4FL7 A;  4KNI A;  1I9M A;  3IAI A;  4MLT A;  1ZE8 A;  4PYX A;  3F7B A;  3S74 B;  4RN4 A;  3N2P A;  2CA2 A;  3KOK A;  1Z93 A;  2NN7 A;  4Z1E A;  5E2N A;  1CIM A;  3V2J A;  1FQL A;  2ZNC A;  3M40 A;  4K13 A;  1AZM A;  1DCA A;  3KOI A;  3V3G B;  4Q7S A;  2POW A;  4ETQ C;  4E3G A;  3F4X A;  3RYX B;  4CAC A;  3NI5 A;  1G1D A;  3OKV A;  3W6H A;  4QJM A;  3RYJ B;  2NNV A;  4QJW A;  9CA2 A;  5EKM A;  4G7A A;  4CNX A;  5J8Z A;  4KUY A;  1CVA A;  1RAY A;  1XEV A;  5EIJ A;  4RFD A;  3VBD A;  4Z0Q A;  1HVA A;  5EZT X;  2FNM A;  3BL1 A;  1BN4 A;  1FR4 A;  5DSQ A;  1CA2 A;  4ZAO A;  4FVO A;  4JSW A;  3LXE A;  3DV7 A;  3M14 A;  2QP6 A;  4YXI A;  3SBH A;  6CA2 A;  3FFP X;  4BF6 A;  3M1W A;  5CAC A;  2OSM A;  1UGA A;  2X7S A;  3N4B A;  3T85 A;  1ZFQ A;  3RYY A;  3M1K A;  5E2S A;  5DOG A;  5FDC A;  4ZX1 A;  1AM6 A;  3RYZ A;  2NN1 A;  3D92 A;  1V9E A;  1FQM A;  5EH8 A;  2Q38 A;  4QTL A;  3M04 A;  1HEB A; 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