1BQ7A

Dsba mutant p151a, role of the cis-proline in the active site of dsba
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
QYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVAAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title On the role of the cis-proline residue in the active site of DsbA.
pubmed rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
molecule keywords PROTEIN (DISULFIDE OXIDOREDUCTASE)
total genus 57
structure length 186
sequence length 186
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1bq7A00
4ZB9A 2FWEA 3VWVA 1E6BA 1S3AA 1QUWA 3M3MA 3RHCA 4ILFA 4XS4A 2IMKA 5G1KA 5D93A 3UL3A 4EXJA 3RBTA 4K6XA 4DSQA 1GWCA 1THXA 5ECKB 2C8UA 3UEMA 2E2GA 1AQXA 4AGSA 1NSWA 2VUPA 1S3DA 3TJJA 1TI1A 1ZYEA 4F03A 2H6XA 3GSSA 2PGTA 3F4SA 2DMLA 4YQUA 3LXTA 3ZL5A 2VD1A 4I2TA 5DCHA 4HQZA 1JLVA 3FRCA 2PVQA 4KNDA 5AIXA 5DQSA 5KN0A 1VRSD 3DYRA 5D73A 3DXBA 1UN2A 2DBCA 4F2IA 2N5BA 5DVBA 4XTSA 2PUKC 5GZZB 1WRYA 3VWUA 4FO5A 4MLYA 5B8BA 2LS5A 4HUAA 3HVVA 2YP6A 2YN1A 3ED3A 1XWBA 1XWKA 4PNGA 1TK8B 5KN2A 5J9BA 2C0GA 2L6DA 4MZBA 4MPGA 1O8WA 3LQ7A 3AY8A 4TRXA 2R5GA 5FWGA 2GQLA 2JZSA 4PQIA 2V1MA 3DWVA 3FZ4A 2OADA 2IJYA 4ACSA 2LRTA 2VM2A 2X8GA 2GDRA 4IP6A 1TOFA 1FW1A 5HFIA 4HI7A 3UBLA 1UC7A 2FD3A 1VGLA 3EWLA 4TXOA 3RHBA 4MMMA 3VFIA 2H1AA 1EGRA 3ZFBA 2R37A 2WS2A 2H76A 4POKA 3IC4A 10GSA 4F9ZA 3GUSA 4WXTA 2MYGA 1HD2A 1JZOA 3IRAA 1U3AA 1K0CA 1GLQA 4ZBAA 2YCDA 2FUG2 3Q6OA 1A0FA 4HZ4A 3FEUA 3LSZA 4I6XA 2H73A 1JZRA 2O87A 3ZREA 2WB9A 3MDKA 2H6ZA 3ZTLA 4JZQA 3TCOA 4J2FA 3PH9A 2HRFA 1YJ6A 1CQGA 2AV4A 3ME7A 5ABRA 1NW2A 1BX9A 2I1UA 2RUFA 2VCTA 1DE1A 4LMVA 4YAVA 1PX6A 4CHSA 1PD21 5JWRB 3LGCA 3BD2A 4ZBDA 4HU7A 1GSDA 2VOCA 2CQ9A 2E2MA 1A2JA 1FO5A 1T3BA 1G6YA 2P31A 3I9V2 3K8NA 3GKXA 1WIKA 2DJ1A 2YWIA 5CREA 2H30A 2HE3A 4POBA 3L0HA 5CP1A 1X5DA 5C00A 2XBQA 5HR3A 3GMFA 2H72A 1OC9B 4HS1A 1W89A 2E0QA 2FA8A 2ON5A 2XHFA 4EO3A 4ISDA 2L57A 4LL4B 4LL1B 1GTAA 3L78A 4IVFA 3VLNA 3LJRA 4XS4B 1O7UA 2MZCA 5D96A 2MMAA 4EDYA 4WBJA 1BQ7A 3RDWA 1Z3EA 2PPTA 3IK7A 3EINA 3N5OA 1A8YA 4G19A 3J7Yk 3HJPA 1G6WA 3GH9A 4NMUA 1RW1A 3ERFA 1WP0A 1WE0A 2A4VA 3R2QA 4GSNA 3MAKA 3KD0A 2GGTA 1ON4A 1ZGNA 1T4ZA 3IBHA 2DMMA 5DBQA 4WR5A 4ULXA 2ON7A 3LORA 2OE3A 3KP9A 2RUEA 1OAZA 4F0CA 4GXZA 2N5FA 2WGRA 4ZL8A 3TGZA 2NVLA 3GV1A 1XW9A 4O92A 4ZBBA 3IHQA 2B5YA 3GN3A 2VL9A 4TR0A 1SKRB 3KCMA 2YZUA 1KEBA 3HA9A 3TKSE 3FHKA 4DEJA 2X8HA 3ZLPA 4G10A 1XVQA 3TDGA 1XVWA 3UAPA 2Z9SA 3HYPA 2R2JA 4OFTA 4ECJA 1XZOA 4QQ7A 1SK2A 1ZL9A 4RI6A 1N2AA 3BBYA 5HFGA 1BG5A 2OE1A 1NHYA 1ZOFA 4RUVA 2WDUA 1Z9HA 1ZZYA 2C4JA 2ZCTA 3O3TA 4ECCA 4E8EA 2FHEA 2HYXA 4LA1A 4XRAA 4TXOB 4JBBA 5ELGA 1ST9A 6GSUA 1OE7A 5DALA 1FOVA 3GTUA 4PUFC 1PX7A 2GVPA 2YPMA 2OKAA 2AHEA 1H75A 1QK8A 2V6OA 1SJIA 5JCWA 4K0NA 6GSWA 2LTKA 1USBA 4GTUA 4YQVA 4Q5NA 3L4NA 1XW5A 3IR4A 8GSSA 9GSSA 5LCZA 1M2BA 5CYYA 4WEYA 5G1LA 4QL7A 3BCIA 3KEBA 2OACA 2CAIA 4XCSA 1V40A 3DKSA 4MF5A 6GSYA 5GSTA 1F2EA 3KMNA 1AW9A 4NHWA 4LMWA 3GURA 3TKRA 4V2MA 3H1NA 5JWOB 2H70A 5ECRB 2B6MA 6GSVA 4FIWA 4IBPA 4IGJA 1TDIA 5IOWA 3ERGA 1O73A 2CX3A 2O8VB 4BWSA 4TR1A 2P0GA 3VPTA 3F63A 1YF1A 3GL5A 4I2UA 1RK4A 1TW9A 1J08A 2CZ2A 1QQ2A 2C80A 3TB2A 3WD6A 2F8AA 1SL0B 3WGEA 2HZEA 4Q5RA 1MDJA 1OC3A 1X5CA 5A4VA 6GSXA 2LRCA 2ZUPA 1LJRA 1OYJA 2AJQB 4OWYA 4N0VA 3IOSA 1R7HA 2VL2C 3BCKA 3KTLA 2M46A 20GSA 1GL8A 1JZWA 2A2SA 4YAPA 3WT1A 1ZYQB 2YZHA 3FR6A 5KN3A 1B48A 2LNSA 4MZWA 4ZL9A 4XHMA 5F06A 4X0XA 1T00A 3A5WA 4ZB6A 3WYWA 1J9BA 1SYRA 3HVSA 3QOUA 3QFAC 2IMFA 5G30A 1R5PA 4V2NA 3GKMA 5AGYA 1W4VA 3HVXA 3MSZA 3P7XA 2CAQA 5ENUA 1OVNA 2B1LA 3TRQA 1GULA 3J7Yb 4JR4A 2JADA 4AF2A 3N9JA 3ERWA 3TRXA 2VAFA 1SK0A 1MD4A 3CBUA 5IMDA 1GP1A 3W6GA 1XWCA 4IN0A 11GSA 4MH2A 1K0AA 2IWTA 1EP7A 3GL3A 3ZFLA 4JR6A 2OE0A 4LLRA 4BPYA 3HCZA 3ISOA 2B5EA 1GLPA 2AYTA 4KCAA 3ZVJD 4OO5A 1YKAA 2CA8A 2VCXA 1SU9A 1VF4A 4OFNA 5IO2A 1F37A 3M0FA 4I5QA 3L9VA 2HSYA 1LBKA 1X0RA 4MA9A 1AQWA 4YQMA 1A23A 3FR3A 5DDLA 2I9HA 1B4QA 1TRWA 5AN1A 2KLXA 3LYKA 2L5LA 2IMEA 3F6FA 2E7PA 2H74A 4HQSA 3ZMLA 1F9MA 3HKRA 5ECHB 3EU3A 2M80A 3GTUB 5J9CA 1O85A 1YY7A 2EIRA 5H5SA 4AJ8A 3O6TA 4K7NA 3FR9A 2D2ZA 5CRHA 4TVEA 4E8HA 3L9UA 5A4UA 3TRPA 2RLIA 1AC1A 1GRXA 2PN8A 3FZ9A 3DRNA 2X8CA 5HFKA 1U88A 3BOAA 4KSOA 1QFNA 2QKEA 3C8EA 1LU4A 1X9SB 1PN9A 4IS0A 1VF2A 3F8UA 3KP8A 1PL2A 2LRNA 2YANA 3SBCA 3C7MA 1RQMA 2IMDA 2HFDA 1K0BA 18GSA 3CSHA 5IMCA 5E4WA 3HJOA 3FYGA 1QXHA 4KA0A 1ML6A 4ZB8A 2C3NA 2YOIA 1SD8A 2LUSA 4WBRD 5LD0A 4D73A 1J0FA 4IQ1A 4F82A 2JSZA 4TR3A 3LEFA 3QAWA 4BL7A 3ZITA 1EV4A 1GNEA 3PGTA 1X9MB 1M99A 4J57E 4TW5A 3FW2A 1XOAA 2H8LA 4K0GA 1AIUA 2F9SA 1IYIA 4N10A 4MJBA 5KN1A 2NTOA 4OMVA 5F0GA 2O85A 2JU5A 1GTIA 2HRNA 5ID2A 1GNWA 3TKSC 3H8QA 2O89A 4L5OA 1T8EB 1F3AA 3G7JA 2IFQA 1ZMAA 1EOGA 5B7CA 1AQVA 3OR5A 1K3OA 3QAVA 4PGTA 2C0FA 4GSTA 1PSQA 3CTGA 4KW6A 3KTBA 2JZRA 4H86A 4POMA 4TOPA 3VI7A 2HXKA 2K9FA 1AXDA 4O32A 1PA3A 2V2GA 1DUGA 1SYXA 4GF0A 2L6CA 3UOMA 2C1YA 4IP1A 5ELAA 1M9AA 5IPHA 2ALBA 2H1BA 3ZYWA 4EE0A 3IAM2 2HNLA 4IJ3A 2VIMA 3IK9A 5A4WA 3EU4A 2TIRA 3KMOA 3VWXA 3DIEA 1SKWB 1MDKA 2DSAA 2AB6A 3WT2A 3PR8A 4KSMA 5ECSA 3O76A 1TK5B 3E3EA 5IMZA 2HI7A 1M2DA 5EL8A 1ERUA 3MWHA 1YZXA 5J3RA 4EDZA 3C73A 3NZNA 2AAWA 2R6KA 3U5RE 1GUHA 1Y6EA 2VM1A 3IV4A 4HU9A 1XFLA 5B8AA 1F6MC 1V58A 2ES7A 2FA4A 2HSHA 2VLTA 3GSTA 4DSRA 4L0WA 1TRVA 2CVBA 3IAS2 4AJ6A 3TKPA 1VF1A 2LJAA 3UMAA 1X5EA 1ZCPA 4GSSA 4BVXA 1TRUA 4MF7A 1YQ1A 3CYNA 4HZ2A 1K0DA 2C0DA 5EPFA 3D21A 4OFMA 1YDKA 3EMPA 5G5EA 1T1VA 3CRTA 3HD5A 1FB0A 5JWQB 4OCEA 1Q98A 3H79A 2IIYA 2QGVA 1HNCA 3G7IA 1OC8A 1EP8A 3UBKA 3D4MA 2F3MA 3VPQA 1T7PB 3HJMA 5ECPB 4D73B 2QSIA 2FNOA 1Z7RA 2L59A 2WULA 4KE3A 3DD3A 4L5LA 1A24A 2N5AA 1JLWA 1TRSA 2P5RA 4POLA 3GX8A 2WCIA 2DJ2A 4K2DA 4MABA 3P8WA 2KP1A 2CVKA 1I5GA 1WJKA 3CTFA 3ZRDA 2PBJA 2VO4A 2DJ3A 1K3LA 1OE8A 3WGXA 5J41A 4BWQA 3QCPA 2PMTA 1R4WA 3GRXA 1XIYA 4TKYA 5HR2A 1DSBA 2V41A 1TTZA 3CMIA 1AAZA 5CNWA 5ID2B 2VCQA 1X9WB 1TI3A 4PUAA 3VI5A 3UARA 3KZQA 5D9WA 3LXZA 1PMTA 1S3CA 1R26A 4NV5A 2IFQB 3F0IA 3H4KA 3EVIA 5J4UA 3KH7A 2YWOA 2PWJA 1I9DA 4MCUA 2H0IA 2IN3A 5F05A 5IMFA 3F3RA 3LWAA 2B1KA 2ZNMA 1YEPA 4K9ZA 14GSA 1SK1A 2R4VA 2RM6A 5DAKA 2CT6A 1K0OA 3QPMA 2VD0A 3Q18A 2P5QA 1M0UA 2LNTA 2FLSA 3Q74A 2MBTA 5ECIB 2H71A 3HHVA 5GSSA 3UVTA 3KXOA 1FVKA 5IIZA 2LQOA 3M1GA 3A2VA 3MNGA 2XPEA 5EVOA 1TP9A 3I6AA 4ZIJA 4NHZA 1BEDA 1G7OA 2H0HA 2RM5A 2MMOA 1A2MA 1ERTA 3D6IA 2TRXA 12GSA 2OA7A 1THOA 3KM6A 4FYUA 22GSA 2LSTA 3C1SA 3EMXA 3GKNA 2JZTA 1V2AA 4HOJA 5HR0A 2DJJA 4KDUA 3HY2A 5G2ZA 3LYPA 2L4CA 3CSJA 2X99A 3KGKA 3U6VA 1SJ6A 2H0GA 2C3QA 2GSSA 1EEMA 4RQRA 1TU7A 4TXVA 4ZILA 2O7KA 2H75A 2YV7A 2IL3A 3GFKA 4EL1A 4FYBA 2I81A 4V1Ap 3PINA 1NHOA 1HNBA 3P90A 17GSA 4HDEA 3ME8A 4X43A 2PVOC 2WFCA 4PNFA 1EOHA 2EIOA 5IOXA 4NXIA 1V57A 3ZVJA 4IQAA 1GSQA 2YJHA 3GIXA 1A0RP 2YWMA 4IELA 5CO3A 1G7EA 1KTEA 2JACA 1GUKA 4JU5A 4NV2A 3A2XA 2JL4A 5C04A 2OBKA 2NDOA 3IPZA 5AISA 1OKDA 3H93A 5GAND 1TKDB 2M72A 2H6YA 2XPDA 5H5RA 2J9HA 5DALB 3QR6A 4XIHA 2I3YA 2LJRA 4MDCA 4RI7A 2WRTA 1ACVA 5IPGA 5CRWA 1OKTA 4N11A 3DVWA 1VF3A 2GZYA 4KX4A 2XC2A 1R5AA 5B6MA 2HZFA 2H1GA 4EKZA 2GS3A 3FK8A 3W8JA 1EWXA 3QDNA 3UJ1A 4FH8A 1WWJA 1BAYA 5IQYA 2REMA 2DIZA 4ECIA 5F07A 3US3A 2GZZA 2BTOT 3G7YA 1FB6A 4DSSA 1DBYA 3LG6A 4GQCA 2K8SA 3TOTA 1Y25A 2KHPA 4TR1B 2IPAA 4X1UA 3F6DA 2CZ3A 3HDCA 2FWHA 3QFBC 3WGDA 4BA7A 3DMLA 4F0BA 1YEXA 1HYUA 4N0ZA 1WMJA 2HZEB 5DAKB 3RPNA 4OO4A 5IO0A 3FKFA 3IE3A 2K18A 2B3SA 2NPBA 5ECLB 4O7HA 1BYEA 1MDIA 3BJ5A 16GSA 1E2YA 1NM3A 2DJ0A 4MK3A 3UVHA 3RAZA 4K7OA 2H66A 2EIQA 1GSUA 4EVMA 3QMXA 2GSTA 4TR4A 3NIVA 3TJGA 3E0UA 2F8FA 2FWFA 1XWAA 3EE2A 1WOUA 3TJKA 1MTCA 4MF6A 1KNGA 13GSA 4GQFA 1EGOA 2HLSA 3APQA 2GT5A 2PERA 1TXXA 2C0EA 3HXSA 5LNKe 4MJEA 3HZ4A 5CRDA 1K0NA 5G5FA 5ECMB 3P2AA 4MH3A 1M2AA 1Z7PA 4RQXA 5D9XA 2KOKA 3I69A 5G31A 2FCHA 1UVZA 4KAEA 5EY6A 1FVJA 2B5XA 4JEDA 5HR1A 2GQKA 4NAXA 5KEJA 1QMVA 4YH2A 1Z6NA 4CDOA 4HJMA 1TJDA 1A8LA 5AIVA 3GH6A 3ZIJA 4Z7XA 4ML6A 2BJXA 3EYTA 4PQ1A 4MJAA 1HQOA 3NOFA 5D9TA 2FY6A 3FZ5A 4KDXA 2FWGA 2BMXA 2VL2A 1F3BA 4ZL7A 2B7JA 2L4QA 4KB3A 1EEJA 4KCEA 5GAPD 4K7IA 1MEKA 5DJLA 2DJKA 2X64A 4I8BA 3TJFA 3KIJA 2PU9C 2CVDA 5DJMA 1B4PA 2XBIA 3S9FA 1XOBA 1MD3A 4MZCA 3D4TA 2K6VA 3ZMKA 4AJ7A 5IMAA 1K0MA 2GT6A 1GTUA 3JCML 1B9YC 3FY7A 4EUYA 1PL1A 1JHBA 4XS1A 1JFUA 2AUVA 4NPBA 4I97A 1SD9A 1A2LA 4K1FA 4KUNA 3ZZXA 3CXGA 3TKQA 5D9VA 2WJUA 4WF5A 3VK9A 2GSRA 4PQHA 1V98A 1SENA 5E59A 2F51A 4J56E 4O5RA 6GSSA 2B7KA 3Q19A 3D22A 3F4TA 2H19A 3GKKA 4EF0A 1EV9A 2DLXA 1TU8A 2V6KA 5COHA 4IKHA 5B6NA 2MBSA 1JZDA 4KGIA 1FHEA 1XBSA 3D5JA 1XXUA 1AUCA 2VL3A 1KBNA 2FGXA 2CV4A 5L71A 4XS6A 1TK0B 1ERWA 4NWYA 3F4RA 3ZIVA 3QAGA 4G2EA 1U6TA 1SL2B 4GRFA 3APSA 4DSSB 1XCCA 4GWRA 4DVCA 1FAAA 2IMIA 4ML1A 1EZKA 4PX1A 1HNAA 4WKWA 3TUEA 4IJIA 4MJCA 2VCVA 3TOUA 3FZAA 1SJZA 2OBIA 2HT9A 3G9BA 2DC5A 2L5OA 3DGQA 4N30A 1GSFA 4MP4A 2VCWA 3IDVA 2A2RA 4WF4A 5JCUA 1B8XA 3M9KA 1IYHA 5CRGA 2TRCP 4ID0A 1Q4JA 1T4YA 2LQQA 4CW9A 4TN8A 3DVXA 1GSSA 3VWWA 1PQNA 4HJ2A 4HEA2 2R3XA 5ECNB 4L8EA 3APOA 2GQMA 2YNXA 4OCFA 2MMNA 4WR4A 2OJLA 4Q5FA 2LV3A 2LKUA 3GHAA 4IW9A 2KUCA 5H5QA 1URMA 4WETA 4P3YB 5IM9A 2H1DA 2RIIA 19GSA 2VCZA 3GYKA 1ILOA 1B9XC 1C72A 1FG4A 1O6JA 5HQPA 3M8NA 1SKSB 4GLTA 5CAXA 5IMVA 2LJKA 1WPIA 2GLRA 2GSQA 1K3YA 1O8XA 3CRUA 4KDYA 1ABAA 2WZ9A 4JRRA 1PGTA 2K8VA 4V1Ag 4IHUA 1GH2A 2J23A 1M7TA 3F3QA 2VLVA 1YF0A 3M9JA 1GUMA 4EC0A 3CSIA 5F8BA 5D8IA 4BVYA 1XW6A 3C71A 3LFLA 7GSSA 1YKCA 1GTBA 1V9WA 4ZXGA 5DQYA 3GA4A 1UA5A 4OD7A 2YWNA 3E9JB 2LEGA 4L0UA 2DIYA 2I4AA 5J5NA 5A5KA 2QC7A 3KJYA 3TKSA 2YJ7A 3RPPA 1XPVA 4XRDA 2G0FA 1BJXA 3F9UA 1U87A 4GCIA 3TJBA 1QGVA 2H01A 3GNJA 3GX0A 3EC3A 3IXRA 1ERVA 2G2QA 5FT3A 3SWLA 3A3TA 2EC4A 2MMZA 4QL9A 5FHIA 2C3TA 5ECQB 4PURA 1H4OA 2YV9A 1G0TA 5JCGA 1CQHA 1GSEA 4G9HA 1Z6MA 3D0ZA 3QD9A 4MPFA 1SL1B 3C1RA 3V1WA 2NBSA 3EURA 1XWGA 2KP2A 3DEXA 2GZPA 6GSTA 4K8MA 1O81A 4V2LA 4FYCA 1Z5YE 3A2WA 1N8JA 2JSYA 4Q5QA 4PXOA 1PKZA 2V32A 3KH9A 1M9BA 5INYA 1PRXA 2GTUA 3IA1A 5DCGA 3I43A 3L9SA 4KH7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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