1BQ7A

Dsba mutant p151a, role of the cis-proline in the active site of dsba
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
186
structure length
186
Chain Sequence
QYEDGKQYTTLEKPVAGAPQVLEFFSFFCPHCYQFEEVLHISDNVKKKLPEGVKMTKYHVNFMGGDLGKDLTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEGVQKTQTIRSASDIRDVFINAGIKGEEYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADVQLRGVAAMFVNGKYQLNPQGMDTSNMDVFVQQYADTVKYLSE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords PROTEIN (DISULFIDE OXIDOREDUCTASE)
publication title On the role of the cis-proline residue in the active site of DsbA.
pubmed rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Oxidoreductase
total genus 57
structure length 186
sequence length 186
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-08-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1bq7A00
2GSTA 4E8EA 4GSSA 4EDZA 1BQ7A 1EWXA 3H93A 3IE3A 4E8HA 3QD9A 3I6AA 2IMIA 4J2FA 5CYYA 4GRFA 2HI7A 2ON7A 2PU9C 2XPDA 2V1MA 1F9MA 1ZOFA 3VK9A 3LWAA 1PQNA 4MDCA 3NIVA 1HD2A 2CVKA 2DMLA 4D73B 3C1RA 2O7KA 2RUFA 3D4MA 3GSTA 4ACSA 3TKPA 1U3IA 2AB6A 5DDLA 3TRQA 3RHBA 4TR4A 2VM1A 4ZL7A 2A4VA 1IYIA 2O89A 4MJBA 2GZYA 4F9ZA 5HR0A 1WOUA 1U6TA 1VF4A 1V58A 1VF1A 2H0HA 5H5QA 4PQIA 3IAM2 1M9BA 1XWBA 3ZLPA 3QAGA 1O81A 4ECBA 2GSQA 4MCUA 3HYPA 1ABAA 1Y25A 4EO3A 1ZCPA 3F3RA 2JZTA 3ZRDA 4F03A 1TXXA 1F3AA 2J9HA 1TU7A 1GSFA 4QQ7A 5CREA 1WE0A 1M9AA 4XRAA 2VCTA 2V6KA 2HNLA 3RPNA 2G0FA 1FW1A 4TKYA 3P90A 1H75A 2AV4A 3DKSA 2B5XA 5A5KA 3D21A 1PMTA 5EPFA 3H4KA 2C1YA 4O7HA 1K0CA 1MD3A 4MABA 4O92A 1PRXA 5C00A 2LNSA 2R37A 3DGQA 4QL7A 1TRWA 3VLNA 2X64A 3FRCA 1Z7RA 1X5DA 2YWOA 3IA1A 4WXTA 4TVEA 2YJ7A 1GL8A 4HQZA 4N0ZA 3IRAA 4NAXA 3LJRA 3KGKA 5KN0A 4IBPA 3IDVA 2OE3A 2C3NA 5EL8A 4GWRA 2H71A 1XWGA 3VURA 5GSSA 3M3MA 3GKXA 2V32A 1AIUA 3GKNA 5ECIB 4KX4A 5IOXA 12GSA 2LNTA 1GSDA 3BBYA 4NV5A 1AXDA 3TB2A 2PGTA 2YP6A 3U6VA 4PUFC 4YQVA 3LXTA 4BVXA 1SD8A 3GIXA 2L5LA 4JU5A 2F3MA 3KH9A 1X5EA 4CW9A 5G30A 4ML6A 5A4UA 5AN1A 3RPPA 1XW9A 3GKKA 4YAVA 4EF0A 1ERUA 2VL9A 1M2BA 19GSA 1C72A 1YF0A 5FWGA 3DVXA 3W8JA 5ECSA 4L0UA 2YWIA 5GZZB 1WWJA 1JZDA 2KLXA 3KH7A 1XXUA 2FWGA 2IMKA 4XS6A 1DUGA 1J0FA 1N2AA 4KA0A 2B7KA 4YQMA 3HCZA 3UJ1A 1FOVA 1LU4A 2C0GA 1SU9A 4TR3A 3C73A 3EINA 2OADA 5G31A 5INYA 2FD3A 4OCEA 2LJAA 5J41A 3ZMLA 3H8QA 5B6NA 3GUSA 4RI7A 3LORA 1AQXA 1SK1A 3J7Yb 3CSJA 3FY7A 2AHEA 2K8VA 1AQWA 4IJ3A 6GSUA 4KGIA 5IO2A 5G1LA 3GX0A 1A2JA 3CYNA 2GZZA 1G6WA 5DCHA 2EC4A 6GSTA 5B7CA 2OE1A 1WIKA 3PH9A 2OJLA 3UAPA 4ZBAA 4X1UA 1TK8B 2DJ1A 2FA4A 1THXA 4Z7XA 1XVQA 3Q19A 4LA1A 5KN2A 1QGVA 4Q5FA 3PINA 4HZ2A 2KP1A 1HNBA 1N8JA 5IMFA 3N5OA 2EIOA 2C8UA 4XS4B 3QR6A 4PX1A 2VO4A 3ZVJA 1ZL9A 1AQVA 2H1GA 2PWJA 2WFCA 3FR9A 1JFUA 2LKUA 1QFNA 1XW5A 4BVYA 5D9WA 13GSA 4BWSA 3F9UA 3LGCA 3KXOA 4LL4B 1CQGA 3D22A 3NOFA 2GQLA 1EP8A 2DIZA 3TJBA 4ZILA 1SKWB 2OA7A 1ILOA 2PVQA 5ECRB 4P3YB 2YJHA 3BJ5A 1TW9A 3EU3A 2CVBA 1GUKA 4JBBA 4AJ8A 3KJYA 2OBIA 5A4WA 3ZL5A 2VUPA 5IPHA 3S9FA 1K0NA 4MMMA 5IMVA 2L6DA 4K7OA 1OC3A 1KEBA 2G2QA 4DSSB 3Q18A 4OWYA 1GRXA 3GNJA 4TXOA 3ZIVA 2VOCA 3IHQA 5E59A 1GLPA 2H0IA 1Z9HA 1WJKA 2VL2A 2H6YA 1WRYA 5LCZA 3HJPA 3JCML 1V57A 3MDKA 2F8AA 4EDYA 5D9TA 2B7JA 3KD0A 2N5FA 4HOJA 4DSRA 1GSUA 2B5YA 1UN2A 2HZEB 2JSYA 2F51A 1K0OA 3L9VA 2KUCA 4ZL8A 2VM2A 1MTCA 1UVZA 5C04A 1O73A 2XBQA 1PL2A 5DALB 2YCDA 3IPZA 4IW9A 3EMPA 2AYTA 5DCGA 5ABRA 3QMXA 4I6XA 2LSTA 3TCOA 1F3BA 2HXKA 2FA8A 1TI1A 3EU4A 3TKQA 3APOA 2REMA 4FYBA 4F0CA 1RK4A 5CRDA 1URMA 14GSA 1ZGNA 1FVJA 1V40A 2I9HA 4NPBA 1BG5A 1FVKA 4TN8A 3TOTA 3W6GA 4JR6A 1HQOA 2HLSA 4IQAA 1JZRA 2ALBA 1TI3A 4Q5NA 2JACA 2GGTA 2DIYA 1B9YC 5L71A 1NHYA 1SJ6A 4Q5RA 1TU8A 1RQMA 3C8EA 1VF3A 6GSVA 2WDUA 1GSYA 2HT9A 3L9SA 5B6MA 1XBSA 4K1FA 5ELGA 2H75A 3ME7A 2B6MA 3IC4A 3GFKA 1DBYA 2JSZA 4MJAA 2CAIA 4J57E 4NXIA 3O3TA 3IV4A 3FZ4A 3CRUA 2TRXA 5ECPB 1THOA 4I2TA 2CV4A 2MMOA 5JCGA 1ON4A 2K18A 3Q6OA 6GSYA 2CZ2A 3HY2A 2DC5A 3WT2A 3QCPA 3CMIA 3F6FA 4WKWA 4IN0A 2ZUPA 4HI7A 1GTAA 1A8YA 2H74A 3FZAA 3IBHA 2PN8A 1FAAA 2WGRA 5JWRB 3AY8A 1SJZA 2IN3A 4N11A 4V2MA 4J56E 3P2AA 2HRFA 3LQ7A 4GXZA 3ED3A 2J23A 3L4NA 2V41A 1Z7PA 2MBTA 5D93A 5CO3A 3EYTA 2FWEA 4GQCA 5JCUA 5G1KA 4ZXGA 2E2GA 3VFIA 2P5QA 2JADA 2TIRA 4IP1A 4ECIA 2P0GA 4JZQA 4RQRA 1YKCA 1HNCA 1S3DA 1TP9A 1Z6MA 2DJ0A 3CTFA 3DRNA 4ZL9A 3G9BA 3KTBA 1G7OA 1YKAA 2H73A 4LL1B 4HU9A 4WBJA 4K9ZA 2C0DA 1H4OA 3QFBC 4I5QA 1EGOA 4KUNA 1SK2A 5IQYA 3C1SA 1F2EA 5A4VA 1PX6A 4FYUA 1EZKA 2KP2A 5IIZA 1ML6A 3F3QA 3APSA 1M0UA 3HZ8A 4CDOA 5HQPA 4MZCA 2Z9SA 2GDRA 1BJXA 1K0MA 3RBTA 2NDOA 3VWWA 7GSSA 3IOSA 5G5EA 1X9SB 1J08A 5ID2B 5J5NA 1SYRA 3A2XA 3LG6A 5DQSA 4EUYA 2GQKA 1I5GA 1ERWA 1B4QA 4LLRA 3FZ9A 3VPTA 2LJRA 1GTIA 3E3EA 10GSA 4KDXA 1XWKA 1B4PA 8GSSA 4WF5A 3RAZA 4KCEA 1ERTA 3GYKA 2BJXA 3ZITA 2RIIA 1LJRA 3G7IA 2LV3A 2V2GA 2X8CA 5DJLA 4TXVA 4IVFA 2F8FA 1IYHA 3HVSA 2AUVA 3N9JA 4HUAA 2GVPA 2M46A 5F07A 3OR5A 1A2MA 3ZIJA 1U3AA 2IJYA 4D73A 1XW6A 1TK0B 3DYRA 4AF2A 3G7JA 1QK8A 2PVOC 4N0VA 1XPVA 2CQ9A 4OO5A 5DAKB 4ECJA 2YNXA 1Q4JA 4G9HA 3GHAA 4GSNA 4MZBA 5J3RA 5DQYA 5HR2A 4F2IA 1I9DA 4OFTA 3F4SA 3CRTA 1G7EA 4AGSA 2NTOA 3NZNA 1B9XC 4BA7A 3WT1A 3D0ZA 2K6VA 1K3OA 1KNGA 3QAWA 1SYXA 2WB9A 1X9MB 3GKMA 2WCIA 4K7NA 3APQA 3WD6A 3HDCA 2D2ZA 1GH2A 1S3CA 2P5RA 1X9WB 2PMTA 1XOBA 1K0BA 5H5RA 2CA8A 2VCQA 3CBUA 3WGDA 4IHUA 3KP8A 3BD2A 3QAVA 2EIRA 5J9BA 1T1VA 1GSQA 4OCFA 2VD0A 1YQ1A 4PXOA 2FUG2 2RM5A 3GX8A 3ERWA 4GSTA 2JZRA 1K0AA 4WBRD 1GUHA 4MH3A 1FHEA 3KP9A 1EEJA 1GUMA 3QFAC 1O8XA 2IPAA 3EURA 3F0IA 3IAS2 1XFLA 22GSA 3VWXA 11GSA 4V2NA 4HZ4A 3VI7A 3GTUA 4TRXA 1EEMA 6GSSA 2WJUA 2X8HA 2FLSA 3G7YA 1TTZA 4EVMA 1GLQA 2GLRA 3HKRA 3A2WA 4PNFA 2I4AA 5F06A 2RM6A 2OBKA 4H86A 1V98A 5G5FA 2H70A 3V1WA 1ERVA 1PGTA 2N5BA 2R3XA 5JCWA 1OC8A 1QQ2A 2H0GA 3HVVA 1G0TA 3RHCA 2IIYA 4MF7A 3A5WA 3L78A 4G10A 5G2ZA 4ILFA 3EC3A 1AW9A 2DJJA 3M0FA 1TRSA 1T8EB 4RUVA 3IXRA 3F6DA 2YV9A 3P7XA 1W4VA 1T00A 3GH6A 5CP1A 1XWAA 4ZBBA 4GTUA 3W8SA 3CXGA 3UEMA 2HE3A 1GWCA 3GURA 3LXZA 4L5OA 1EV4A 4IKHA 2MMNA 1WP0A 17GSA 2WRTA 2H30A 1OAZA 3E9JB 2O85A 4KNDA 3A2VA 2VIMA 3ZFBA 2HYXA 1EGRA 1K3LA 6GSXA 3HJOA 3ISOA 3KIJA 1A24A 1KBNA 3US3A 1F37A 1NW2A 2LEGA 1O6JA 1ST9A 2IFQB 1MD4A 3TGZA 3UVTA 4IJIA 2DSAA 1QUWA 4POLA 4MF6A 1R26A 4OO4A 5KN3A 1R7HA 5E4WA 5CNWA 3DWVA 4OD7A 1EOGA 1RW1A 2FNOA 5B8AA 1V9WA 2H6XA 3VWVA 4HJ2A 4MJCA 4NMUA 1UC7A 3F63A 3R2QA 3FYGA 4K7IA 2DJ2A 3FR6A 1UA5A 4KSOA 2CVDA 4MH2A 4MP4A 3A3TA 4L8EA 1R5PA 5LD0A 4IS0A 3KTLA 4POBA 1MDJA 5AISA 3PGTA 1MDIA 5DBQA 2WS2A 4G2EA 2L6CA 2H1BA 3L0HA 1EP7A 3UL3A 4Q5QA 3FZ5A 2HSYA 5CRWA 3DXBA 3FR3A 2M80A 1AUCA 1K3YA 5IMZA 3FW2A 2B1KA 4HU7A 1JLWA 2BTOT 3ERGA 4ML1A 2VCXA 2RLIA 2B1LA 3ZTLA 2PERA 1X5CA 1MDKA 5IOWA 1YJ6A 5EY6A 3K8NA 5ECLB 1YY7A 4EE0A 1T7PB 1PX7A 3TJFA 3IR4A 3HJMA 5DJMA 2L5OA 9GSSA 5D73A 3VI5A 3VPQA 3UARA 3LEFA 2QSIA 5J4UA 4V2LA 4V1Ap 4JR4A 4XS1A 2VD1A 4ID0A 5AIXA 5ECHB 3J7Yk 2HRNA 3P8WA 4TR1A 3SBCA 3U5RE 3SWLA 1BYEA 3D6IA 3BCIA 1OVNA 2B5EA 4DSSA 4K2DA 1HYUA 4JEDA 4POMA 2C0EA 4ZB9A 4HDEA 4MLYA 2C0FA 1OC9A 5CRHA 2C80A 2CX4A 3FKFA 1SENA 2FGXA 1SL1B 3ZZXA 2A2RA 1FB0A 4EC0A 3HA9A 1PN9A 1R5AA 4ISDA 3TOUA 3F4RA 3TJKA 2BMXA 2O8VB 2MBSA 2IL3A 3GSSA 3M1GA 2OACA 2HZEA 1SL2B 4MPGA 3GV1A 3KMOA 4CHSA 4GCIA 4RQXA 2LTKA 4PQ1A 3D5JA 1Z5YE 2IMFA 3UIWA 5AIVA 4ULXA 5H5SA 4DEJA 1X0RA 4OMVA 4DSQA 2H6ZA 1GP1A 4IELA 4EXJA 3M9JA 3GL3A 1PKWA 5ECQB 3CSHA 1ZMAA 1A2LA 5GSTA 2LJKA 4IGJA 1YDKA 1FO5A 2E2MA 4YH2A 1BAYA 1GNWA 1TDIA 4FIWA 4KB3A 4YAPA 4MK3A 1TK5B 4IP6A 3KM6A 3GN3A 2VLVA 4BL7A 4FO5A 2NBSA 3HVXA 2FY6A 5IMCA 1SKRB 1M2DA 2KHPA 3ME8A 4G19A 2HSHA 4HJMA 1Q98A 1Y6EA 5D9XA 2ZNMA 2R4VA 2H66A 3UBKA 2AAWA 1A0RP 2YPMA 3O76A 1EV9A 2DMMA 3KEBA 3ZREA 1KTEA 4MZWA 2C3QA 2LUSA 1PKZA 1OKDA 5HR1A 1FB6A 3QDNA 3EMXA 3EWLA 2FWFA 4I97A 4XHMA 4LMWA 4KW6A 4NWYA 1A23A 4QL9A 1Z3EA 1V2AA 1HNAA 2VCVA 4PGTA 4KSMA 4ECCA 5EVOA 1GTUA 2H1AA 3IK9A 3D4TA 1DE2A 3UVHA 1NM3A 2FHEA 1TRVA 5HFKA 5IMDA 3QPMA 3GRXA 2QC7A 1DSBA 4XTSA 3MWHA 4ZB6A 1SJIA 4X0XA 5F0GA 4K0NA 2WZ9A 5KEJA 1ZYQB 3TKSA 3FHKA 2YN1A 4HQSA 1JZWA 4PURA 1O8WA 2L4QA 3GTUB 3TKSE 1O7UA 3I9V2 1NSWA 1WPIA 3TKSC 1GULA 3H79A 1PL1A 4IQ1A 2ES7A 1YZXA 3ERFA 1JZOA 1TRUA 1LBKA 1OYJA 3ZFLA 4KDUA 3FK8A 1O85A 4MF5A 3TUEA 4L5LA 3GH9A 2LRTA 3EVIA 5GAND 3TRXA 4DVCA 4HEA2 1QMVA 2VCWA 4O32A 1A0FA 2CX3A 4HS1A 2VLTA 5JWQB 2O87A 4N30A 2C4JA 2I3YA 5ID2A 3HHVA 4JE1A 5LNKe 3LYPA 4FH8A 2YWNA 3GMFA 2GS3A 1TKDB 20GSA 2VLUA 2R2JA 4WEYA 1ZZYA 5FHIA 2GTUA 4OFNA 1AC1A 3H1NA 3WGEA 6GSWA 2L59A 2K8SA 1VGLA 2XPEA 1U87A 1YF1A 5D9VA 3CSIA 2QKEA 4I8BA 1TJDA 1YEPA 1CQHA 4AJ6A 2XC2A 3UOMA 4WETA 1VF2A 2H76A 1SL0B 2FWHA 3HZ4A 2GT5A 2GSSA 4KCAA 1T4YA 2PUKC 4XRDA 2B3SA 1ZYEA 4F0BA 1JLVA 4X43A 1MEKA 4GLTA 5D96A 4LMVA 5KN1A 2GT6A 5FT3A 4MA9A 1SK0A 4K8MA 1XVWA 3GL5A 2X99A 1GNEA 5DAKA 3EE2A 1PSQA 2E0QA 4KDYA 4RI6A 2MYGA 4V1Ag 1USBA 2DLXA 5ELAA 2MMAA 2K9FA 3UBLA 2IMEA 1WMJA 2FCHA 3TRPA 2MMZA 2OE0A 3FEUA 1E6BA 3C71A 5B8BA 5F05A 3GA4A 2YWMA 2JU5A 1M99A 4MJEA 2LRCA 4TXOB 3VWUA 5DVBA 2H01A 1DE1A 1B8XA 3F8UA 4KH7A 1PD21 5CAXA 1BEDA 4EL1A 1TOFA 2VCZA 3MAKA 3TJJA 2OKAA 4GQFA 1QXHA 3DMLA 1VRSD 1R4WA 2YOIA 1XZOA 1PA3A 4GF0A 2IWTA 1U88A 1B48A 5IMAA 3WGXA 3MSZA 2P31A 5JWOB 1OKTA 5GAPD 2JZSA 4K6XA 3ZYWA 2YV7A 1OE8A 5AGYA 1JHBA 1XCCA 3TKRA 2CZ3A 1G6YA 3I43A 4WF4A 2YZUA 2DBCA 1XIYA 3Q74A 5CRGA 1Z6NA 2XBIA 2N5AA 2H1DA 3ZMKA 2PPTA 2KOKA 4NHWA 1M7TA 3KCMA 4PQHA 2LQQA 4PUAA 3TJGA 5ECMB 3E0UA 1S3AA 2M72A 4WR4A 4TW5A 2V6OA 4TR1B 4OFMA 1SD9A 5ENUA 3IK7A 3KMNA 5IM9A 2LS5A 2VAFA 5D8IA 3BOAA 2LRNA 2VL3A 4I2UA 2GZPA 4F82A 2R5GA 1XWCA 2H19A 2RUEA 1AAZA 3DEXA 3LSZA 1OC9B 2YANA 3O6TA 4TOPA 1OE7A 3M9KA 4FYCA 2PBJA 5ECKB 4ZB8A 3KZQA 5ECOB 2C3TA 2VL2C 3BCKA 4XS4A 3I69A 3L9UA 3ZVJD 2E7PA 3F4TA 3LYKA 1ACVA 2L4CA 2A2SA 2GQMA 3RDWA 3CTGA 2XHFA 1W89A 4KAEA 1T3BA 4ZIJA 2CAQA 2ZCTA 1GTBA 2H8LA 4YQUA 1K0DA 2X8GA 2I1UA 5ECNB 4K0GA 4TR0A 2WULA 5HFGA 4POKA 3DVWA 4MPFA 1FG4A 1E2YA 2H72A 2IFQA 4XIHA 1GSSA 2L57A 2IMDA 5F8BA 2HFDA 5IPGA 4NV2A 3DIEA 4KE3A 1A8LA 2ON5A 1T4ZA 3LFLA 4EKZA 18GSA 4AJ7A 3M8NA 2I81A 3HXSA 4PNGA 2CT6A 5HFIA 2LQOA 1EOHA 4JRRA 2EIQA 3TDGA 2YZHA 5COHA 1F6MC 2AJQB 5HR3A 2NVLA 4XCSA 2QGVA 1GSEA 2HZFA 4NHZA 1YEXA 3HD5A 2DJKA 3UMAA 2F9SA 4BPYA 3DD3A 5IO0A 4O5RA 16GSA 1NHOA 2JL4A 2DJ3A 4ZBDA 3PR8A 5J9CA 1J9BA 3WYWA 2GSRA 5DALA 2R6KA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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