1BUPA

T13s mutant of bovine 70 kilodalton heat shock protein
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGSTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The hydroxyl of threonine 13 of the bovine 70-kDa heat shock cognate protein is essential for transducing the ATP-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Bos taurus
molecule keywords PROTEIN (70 KILODALTON HEAT SHOCK PROTEIN)
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1bupA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bupA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bupA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1bupA04
3KZBA 2ZGZA 4XH5A 1QQNA 2W40A 1T6DA 1NGCA 1T44A 2GTDA 3FZFA 2P9IB 1U2VB 3TPQA 1H1VA 2P9PA 3AAQA 2V52B 1ESVA 4PKIA 4H0VB 3CJCA 2E8AA 3WEEB 4WQ5A 4WYBA 2GELA 1SZ2A 3F9MA 4B1ZA 3FFKB 4BC5A 3HI0A 3D2EB 3H1VX 4QS9A 4BG9A 3BUZB 2D4WA 3MMVA 3P4IA 2CH5A 3L0QA 4BROA 3W0LA 1K8KB 1JCEA 4CZJA 2A6AA 1NGJA 4H03B 1RDWX 3M3ZA 5BPLA 3MDQA 3WT0A 5B8HA 3RSEB 4MLHA 1HJOA 3ZETA 3ZX3A 3LDLA 3O5BA 5JLFA 1QQMA 1QQOA 2FXUA 4A61A 4MO4A 3MN6A 1DGKN 5ADXA 5BREA 2D0PA 2E2PA 3BF3A 1HLUA 2A5XA 3VGMA 4FPAA 4B9QA 4GY2B 2HOEA 1YXQA 1NWKA 3C7NA 4CZGA 1NGBA 3J8AA 2AP1A 3SMPA 3CQYA 1EQYA 4B1UB 4QS8A 3UB5A 3GDQA 4CI6A 3WXKA 4RWTA 3VEWA 1XC3A 1GLJO 3A5LC 3ULEB 3HZ6A 4FOIA 5BN9A 4BQZA 2BTFA 2GWJA 5AQXA 3L4IA 4MO5A 3LDOA 3CIPA 4BR0A 1BA0A 2CH6A 4CBXA 4JHDA 1HPMA 2UYTA 3JS6A 1RGIA 1HX1A 4M63C 4H0PA 4FSVA 1ATRA 3HTVA 3WXLA 3O6WA 4H0OA 4K43A 1S22A 3C0BA 2QW9A 3GOIA 5AQHA 3VEXA 3ZETB 3CJ9A 3WUHA 1E4GT 5AFUH 5FPNA 4Z94A 3WXJA 3CJBA 4IXCA 4FWNA 5FPMA 2QWOA 2Q2RA 2P9IA 1NBWA 1U2VA 4BGBA 3VEZA 1DKGD 4EFHA 4B1YB 3C7NB 1P8ZA 2YCHA 3BEXA 3WEEA 2ASPA 5ADXH 3ID8A 3EN9A 3O08A 3FLCO 3CQXA 5FPEA 2P9LB 4I6MB 5KQDA 2E20A 5AQRA 3D2EA 1MWKA 4H5TA 2DPNA 4FWRA 4IO8A 3OHRA 2V7YA 3O80A 2ASMA 1V4SA 1BO5O 4H0TB 1K8KA 1KXPA 1KAXA 3HBTA 1YUWA 4JHDB 4A62A 4BQLA 4FWOA 3VF2A 1JCFA 1E4FT 3QDKA 3RSEA 4FWKA 3ATUA 1J6ZA 4B1XB 5BN8A 3I8BA 1V4TA 4DHYA 4BRFA 4WQ4C 1YVNA 3DWLA 4IWVA 1IJJA 4K25A 1TYQB 2FF6A 1RFQA 4FOEA 1CZAN 4O5FA 3H46O 3DXKB 3L6QA 1ATNA 3H45C 4H0YB 4JN4A 5AQYA 4BREA 3LDPA 3U8XA 1X9JA 1GLAG 2P9SB 3U9DA 5KQ8A 4CZFA 3FE1A 4H5VA 4ISFA 4ISEA 2QWLA 1WOQA 2QXLA 3QICA 4WQ4A 5TKYA 3FR0A 3CJ1A 2A3ZA 3ULEA 5EOYA 4GNIA 4CD3A 3O4WA 2D0OA 3VEOA 1Z05A 2VYPA 4CZHA 5BRHA 3WXIA 3O1BA 2FF3B 3UE5A 1BU6O 3SLCA 4NO7A 4EHTA 1NM1A 3D7EO 4FWSA 5BPMA 3MN5A 5AQQA 1MA9B 4H5NA 5F1XA 3CI5A 4EIAA 1ZBSA 2P9KB 4PKHA 3LDQA 5LJVA 5JMVA 2Q0UA 2WUSA 3TU5A 1NGDA 1U6ZA 2BUPA 5EXWA 4M7YA 2QWMA 1GLBG 2A40A 3KHYA 4FPBA 4PL8A 4BGAA 4XEIA 5EY4A 4B1WB 3QBWA 3LL3A 1NMDA 4M7XA 3QFPA 4FWPA 3EO3A 4I6MA 2P9LA 4IJAA 2Q0RA 2IIRA 3HSCA 2H3GX 2GWKA 2P9NB 4BRLA 3H3NO 2IVNA 3R8EA 5AQIA 1D4XA 2NRHA 3SJHA 5AQUA 2I7PA 3MN9A 5E84A 3H3OB 4K41A 2OANA 1JCGA 1NGHA 3LDNA 2ZWHA 3EL2A 1QZ5A 4BRQA 3IDHA 3A5OC 3AAPA 2YJEA 2YHWA 2W41A 1S3XA 4H0XB 4ISGA 4H5RA 4BRAA 2PBDA 3VEYA 1BG3A 5AQWA 4FWQA 3CETA 4QS7A 1NLVA 1YAGA 4BRGA 4AM6A 1TYQA 4BC2A 1ATSA 3DXKA 5KPRA 4E1JA 3A5MC 1LCUA 3FZMA 5AQFA 1T6CA 5AQTA 2CGJA 2P9SA 2E2OA 2E2QA 3VERA 1Q18A 3ZX0A 4BRDA 2CGKA 1C0FA 1R59O 3BP8A 3M6GA 4K42A 4RCHA 2ASOA 1G99A 3H1QA 3GBTA 1ZXOA 1BOTO 4CZIA 2VWBA 4IJNA 4BVPA 4FL9A 5AQKA 2V7ZA 1XUPO 3MCPA 3D2FB 2GUPA 5AQOA 5BR9A 1HUXA 1X3NA 2E1ZA 1GLCG 2HF4A 5BPNA 2ZGYA 3A0IX 3DJCA 5AQSA 2P9KA 2FSKA 2NLXA 4BRCA 3QFUA 3CJ7A 5E26A 3UKUB 4BRKA 2E1YA 1NGGA 1TUUA 4XH1A 3ENOA 1QZ6A 4HWIA 5AZJB 2Q97A 2KHOA 3CJAA 3IUCA 1MDUB 4BRPA 5F2RA 2IVPA 5BRFA 4EHUA 5JICA 5AQLA 5BRDA 5AZIB 1BA1A 4A2BA 4WQ5C 4CZLA 3VOVA 5I9EB 4FO0A 1X3MA 4PKGA 1HKBA 1SQKA 2P9NA 5ELZA 4CBUA 1NGFA 4JAXA 5F0XA 1QHAA 1LOTB 3WQTA 5KPZA 3FZKA 5EX5A 2QWPA 2YHYA 4BRNA 2Q36A 1NGEA 3LM9A 2NZTA 2J4RA 5JLHA 4BG8A 3EZWA 3VGLA 3ZX2A 2P9UB 4JD2B 4O8KA 4LC9B 1BWFO 5AQGA 2I7NA 4DB3A 4B1VA 3GG4A 2EWSA 3VGKA 5AFUA 3ZEUB 1IG8A 4DCHA 5FPDA 4CZKA 3B8AX 3GL1A 3S41A 3VPZA 1BDGA 3O8MA 4BR2A 1SAZA 3R9PA 3A5NC 4NB4A 1MWMA 2ITMA 1XQSC 3U4LA 1GLDG 2CGLA 3CERA 3DXMB 4BC3A 3QBXA 4XH4A 3VF4A 1WUAA 2PAVA 2FLOA 2GEMA 2E88A 3WQUA 4HTLA 5LY3A 1KAYA 2AA4A 4KBOA 4L3QA 5EVZA 2QWQA 3UKRA 2P9PB 3GE1A 1KAZA 2YI1A 2A42A 5CE3A 3D2FA 3AARA 4IZ9A 4BRMA 4PL7A 3R6MA 4BR5A 4F9OA 2VCPA 1Z6RA 3EKUA 1GLFO 3UKUA 5AQJA 4BR7A 2ZF5O 3I33A 1GLLO 3AY9A 3VF6A 4AM7A 5AQZA 5AZJA 2F9TA 4J8FA 3ENHA 4CBWA 2Q31A 4DQ8A 3EKSA 5LJWA 2D1KA 5AZIA 4CJ7A 3KVGA 4H5WA 3HM8A 4CZMA 2QWNA 3IMXA 3O1WA 3U9ZA 4CZEA 3SMSA 1C0GA 4BVOA 3JXUA 4MLEA 3FZLA 1TUYA 3QB0A 5AQPA 1NGAA 2YHXA 4YDUC 3LM2A 3BF1A 2A41A 1BUPA 1NGIA 3UKRB 4A2AA 3VETA 4BR9A 5AQMA 2FSNA 3QMLA 5AQNA 1GLEG 5KPTA 4BR4A 3DAWA 4RTFD 4BC4A 1HKGA 4BRHA 2HF3A 2P9UA 4JD2A 3IFRA 1OKJA 3H6EA 4YDUA 3CHWA 3VESA 4FWLA 2F9WA 2V51B 3ZEUA 3M1FA 3MK6A 2YJFA 3W3DA 5AQVA 1DEJA 1ZC6A 2QWRA 3FZHA 2E2NA 4FWMA 2Q1NA 2FSJA 3G25A 4CD1A 3SK3A 3ATVA 5AR0A 3MN7A 2IVOA 1HKCA 3A8YA 2HMPA 2QM1A 3FGUA 4C23A 4EAHD 1Y64A 3DXMA 4JNEA 4Y0WA 3VEVA 3VENA 4BRIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3MCAB 2OPRA 1T6DA 1CXQA 1SV5A 2BH1A 3TPQA 4TSXA 2YIPA 1NKBA 4DV1K 4DR3K 3V1QA 4DR4K 5GAEP 4CK2A 3OYNA 3L3UA 4CEZA 5BR8K 3TAFA 4FM0A 4O0JA 3OYDA 1B92A 1SKSA 5CZ2A 3H1VX 2O4IA 3TTCA 4JKGB 1WSHA 5C2FA 4BROA 3AVKA 2VQEK 2O8BA 2A6AA 1S6PA 4LD0A 3WT0A 2OTJN 4PWDA 3D45A 3ZETA 3VQQA 3NDKA 4NCAA 1RT1A 1ZYWA 2KJAA 3O5BA 5JLFA 2KTQA 3QI7A 3MN6A 4LH5A 1DGKN 2RHKA 2WBNA 2E2PA 3BGRA 1EX4A 1YVUA 2HNDA 4FPAA 1J54A 1VQPN 1YXQA 2GX9A 3AVCA 2E2FA 3J8AA 4DU3A 2HSTA 3SMPA 3CQYA 3J80O 4QS8A 3BK3C 3CG7A 1GLJO 4F3OA 4GV9A 3PO4A 3SYZA 3V9WA 1E3MA 1TGOA 4H4MA 2GWJA 3OYBA 4IDHA 2HVIA 4MO5A 4CBXA 2YILA 3NHGA 1HPMA 3JS6A 3VTHA 3LAKA 4DLGA 5HRPA 3TSQA 1HX1A 4H0PA 3DLBA 1ATRA 3HTVA 3O6WA 4H0OA 2BDPA 2G8HA 3L4QA 1LV5A 2VG7A 4CJKA 4CGFA 3TR8A 3OYJA 4FJ5A 4AEIA 4RW7A 2NNWA 3SAGA 4FWNA 4Z4HA 3KOWA 3PSMA 1XHXA 3VEZA 1DKGD 1T3VA 3KOXA 1ZYQA 3ID8A 3EN9A 4LFAK 3FLCO 4N41A 5FPEA 2P9LB 2KFZA 1RBUA 2DPNA 2K35A 3THWB 4A59A 4OKKA 1PE4A 2ASMA 4CGDA 4FJMA 1XNQK 1OH8A 4GMJB 3IKMA 1K8KA 4OVLA 3U6FA 4JHDB 4BQLA 4FWOA 3VF2A 1XWLA 1JCFA 4YOUA 4W5TA 1W7AA 2KKZA 3NFAA 3RSEA 1NK7A 2DFFA 4NXNK 3ATUA 2B4JA 4B1XB 5FDLA 2ASCA 1TKXA 4E0DA 4M3RA 3RWUA 3M5RA 1NJYA 1W2BM 3CC2N 1IJJA 1NK8A 4V1DC 2QTDA 1RFQA 4PY5A 3H46O 1T8EA 4BREA 3QEWA 3K5NA 2E6MA 1KSPA 3FE1A 1CZBA 4ISEA 4C8NA 2QXLA 4WQ4A 5FLXO 3CJ1A 2JWLA 4IOCL 5EOYA 3D0PA 4CD3A 3L56A 4EP4A 4IG0A 1Z05A 1PTXA 2B68A 4CFDA 3I0SA 2KLAA 5DMRA 3M8QA 4CJSA 3O3FA 3IRXA 2DFEA 4O44A 1NG9A 1RDCA 4AHSA 4ZTJA 4EHTA 2W00A 3MN5A 5AQQA 5F1XA 1HNZK 4KTQA 3VTIA 4PKHA 4KHPK 3QINA 5JMVA 2Q0UA 5CZ1A 4EP5A 2PYLA 4Z4IA 3VQCA 1XI1A 3OYIA 1IG9A 3U3YA 3PLAA 4M7YA 3DLHA 1GLBG 5GIPA 1BL3A 3NF7A 4C8KA 4FPBA 3NGZA 4FLUA 4UY8O 1L3SA 4C8OA 1IH7A 3LL3A 1NMDA 4FWPA 3V1RA 4I6MA 4M45A 4Z4EA 1BQMA 4K8ZA 3HSCA 4KHSA 2IVNA 3R8EA 2NRHA 2KSKA 3MN9A 5E84A 5LMUK 4IKFA 3RVCA 4JI3K 2HB5A 2UU9K 3E9LA 1QZ5A 5TKWA 4DR5K 2PBDA 4FWQA 3CETA 1NLVA 3KK2A 5J2PA 3MWPA 4BC2A 3G10A 1ILYA 1P90A 4A57A 1KLNA 3IAYA 4KV8A 3TAPA 1LCUA 2LJ7A 5AQTA 2CGJA 3I55N 1POIA 1Q18A 3RMBA 2CGKA 4FLYA 4KHQA 3M6GA 3BP8A 2XY5A 3SUPA 3TAGA 2UUAK 2LI7A 3H1QA 2WOMA 2LR3A 2VWBA 1NOYA 4F4KA 2VG5A 5HRSA 4DR7K 3D2FB 1KVBA 5AQOA 4NLBA 1HUXA 1VSHA 1IV0A 4C8MA 5GINA 2P9KA 4OKJA 2E3FA 4DF4A 4CGJA 3UKUB 4BE7B 1TUUA 3NCIA 4XH1A 4IO9L 1CHZA 3CFPA 4PHTX 3V1OA 4AH9A 5IT9O 2Q97A 1TK5A 5KGXA 3O9SA 2HHXA 1ASVA 1UWBA 4GV6A 2A7TA 3SNNA 5AZIB 4LF7K 2ZE2A 4IG3A 4BE2A 3K58A 4JEPA 1WSIA 2G8IA 4KI4A 3MEDA 2Y1IA 3I0RA 3AO5A 4A2BA 4A5BA 1HNIA 3V4IA 1BK8A 5I9EB 1HQEA 1X3MA 1HKBA 5HOOA 1B9DA 1VQKN 1SQKA 1J53A 3K5LA 4Z4FA 5F0XA 3JSMA 1LOTB 3MAQA 2Z1IA 4YOTA 3WQTA 1JLCA 3HSTB 1W0HA 3ITHA 5D3GA 1GPSA 1RTHA 2RPIA 4H8KA 3RR7A 5LL6Z 3T7ZA 4CJRA 5JLHA 3EZWA 2P9UB 4LC9B 1VSEA 4MFBA 4DB3A 4CJ3A 2OZMA 1BCOA 1CXUA 2NRTA 5HLFA 3K0SA 2WTUA 3PY8A 5FPDA 4KKOA 4CZKA 4ELUA 3B8AX 1U04A 3VPZA 3QNOA 1BDGA 3O8MA 3WNEA 4FM2A 4NYNA 3U4LA 4M3UA 3UIQA 1GLDG 3CERA 3KLIA 4XH4A 3GKUA 4FJ8A 3WQUA 1KAYA 2AA4A 3PSIA 1QS4A 5SWMA 1ITGA 2IS3A 4NLCA 3CCVN 3AARA 1C0MA 1I2UA 1A5VA 4W5NA 3HOSA 1L5UA 3PSFA 3CM6A 4UQGA 1Z6RA 4I2PA 4GKKK 3TARA 2VWKA 4KH4A 4BR7A 3CQ8A 1EWRA 4FK0A 5AQZA 5AZJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3MCA B;  2OPR A;  1T6D A;  1CXQ A;  1SV5 A;  2BH1 A;  3TPQ A;  4TSX A;  2YIP A;  1NKB A;  4DV1 K;  4DR3 K;  3V1Q A;  4DR4 K;  5GAE P;  4CK2 A;  3OYN A;  3L3U A;  4CEZ A;  5BR8 K;  3TAF A;  4FM0 A;  4O0J A;  3OYD A;  1B92 A;  1SKS A;  5CZ2 A;  3H1V X;  2O4I A;  3TTC A;  4JKG B;  1WSH A;  5C2F A;  4BRO A;  3AVK A;  2VQE K;  2O8B A;  2A6A A;  1S6P A;  4LD0 A;  3WT0 A;  2OTJ N;  4PWD A;  3D45 A;  3ZET A;  3VQQ A;  3NDK A;  4NCA A;  1RT1 A;  1ZYW A;  2KJA A;  3O5B A;  5JLF A;  2KTQ A;  3QI7 A;  3MN6 A;  4LH5 A;  1DGK N;  2RHK A;  2WBN A;  2E2P A;  3BGR A;  1EX4 A;  1YVU A;  2HND A;  4FPA A;  1J54 A;  1VQP N;  1YXQ A;  2GX9 A;  3AVC A;  2E2F A;  3J8A A;  4DU3 A;  2HST A;  3SMP A;  3CQY A;  3J80 O;  4QS8 A;  3BK3 C;  3CG7 A;  1GLJ O;  4F3O A;  4GV9 A;  3PO4 A;  3SYZ A;  3V9W A;  1E3M A;  1TGO A;  4H4M A;  2GWJ A;  3OYB A;  4IDH A;  2HVI A;  4MO5 A;  4CBX A;  2YIL A;  3NHG A;  1HPM A;  3JS6 A;  3VTH A;  3LAK A;  4DLG A;  5HRP A;  3TSQ A;  1HX1 A;  4H0P A;  3DLB A;  1ATR A;  3HTV A;  3O6W A;  4H0O A; 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