1BUPA

T13s mutant of bovine 70 kilodalton heat shock protein
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
b'GPAVGIDLGSTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGKTVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINEPTAAAIAYGLDKKVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The hydroxyl of threonine 13 of the bovine 70-kDa heat shock cognate protein is essential for transducing the ATP-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (70 KILODALTON HEAT SHOCK PROTEIN)
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase
total genus 122
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 1998-09-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1bupA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bupA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bupA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1bupA04
3U8XA 4CZHA 1K8KA 3AARA 5F0XA 3SMSA 4DQ8A 4MO5A 4BC2A 5AZJA 4FPAA 4L3QA 5AQFA 4BR4A 3MN5A 4KBOA 3R8EA 4DCHA 4RTFD 4QS7A 2P9KB 2CH5A 1WOQA 4CZMA 2YCHA 2QWMA 5AQOA 1JCFA 3MCPA 4IJAA 4JHDA 3ENOA 5AQTA 5EOYA 1DGKN 2CGJA 4FWKA 3ZETB 1BG3A 1QQNA 1TYQB 5EVZA 1KXPA 3WUHA 3FZLA 4Z94A 5LY3A 2W41A 2ASOA 3VEOA 5AR0A 5AQIA 3QBXA 2H3GX 1HX1A 2V51B 1NGIA 1NGCA 3GDQA 5AQVA 3H45C 4FWRA 3FZFA 4CBWA 1QQOA 3VESA 3MN7A 4BRDA 2V52B 4JD2B 3HTVA 4FWLA 1GLJO 3VEWA 3QDKA 3EKUA 4B1UB 1GLAG 3EZWA 3BP8A 3DXKA 1NGBA 4BR9A 2FSNA 4C23A 4IJNA 2P9PB 3FR0A 3JS6A 4A2BA 4CZFA 3RSEA 4CBUA 1E4FT 1TUYA 1U2VA 5JICA 4B1WB 3VF6A 1T6DA 2I7PA 1GLCG 3KHYA 4BRHA 4CJ7A 3GE1A 3CJAA 4BRPA 1HPMA 2GTDA 2PAVA 4H0OA 5BR9A 3W0LA 4XH5A 5JLHA 1BO5O 4CZLA 2A6AA 4H0XB 1BWFO 1MDUB 1NGHA 4RWTA 3WXLA 1QQMA 2IVPA 1NGFA 3LDNA 1DEJA 4PKIA 4BREA 3LL3A 4CD3A 4BRLA 1MA9B 3A5NC 5EXWA 5AQHA 4WQ4C 3FZMA 5LJWA 3GL1A 1ZBSA 2IVNA 2VCPA 2P9NB 3HBTA 2FLOA 2OANA 2D0OA 3VOVA 4H5WA 3AY9A 4FWSA 3UKUB 2FSKA 3H1QA 5FPDA 4LC9B 2YI1A 1YUWA 2P9LA 4K42A 4FWMA 3W3DA 3HM8A 4I6MA 1T44A 2ZWHA 2E88A 2YJEA 5BRFA 3VGLA 2I7NA 1NGGA 1NMDA 4H0YB 3CHWA 3MDQA 3FFKB 2CGKA 4YDUC 2D4WA 3L6QA 4CZGA 2F9WA 3MN9A 3CIPA 4H03B 3UKRA 4BRCA 2YHWA 5AQQA 2KHOA 3MN6A 4PKHA 5AQXA 3WEEB 4E1JA 3O1BA 5AQUA 2Q2RA 4GY2B 2GUPA 1NWKA 2E1YA 3LDLA 4BRNA 3ZEUA 4M63C 3IMXA 4XH4A 5I9EB 4BGAA 4K41A 1QZ6A 4QS8A 4FL9A 3P4IA 2P9UB 3EN9A 4FOIA 2ZGYA 3ZX2A 3ATVA 4FPBA 1HUXA 2NZTA 4MO4A 1YVNA 3ULEA 4H5VA 1X9JA 1ATRA 3GG4A 2BUPA 1P8ZA 2P9UA 1LOTB 3D2FA 3L4IA 4H5TA 2E2NA 3CETA 3VF2A 5KPTA 1KAXA 3FZKA 3VEYA 1HKGA 5BREA 1RDWX 4BRIA 5ELZA 2P9KA 3ID8A 1JCGA 1MWKA 3EL2A 4J8FA 5ADXH 3O80A 2YHXA 3CJ9A 3ZETA 5AQLA 4BRQA 2BTFA 3AAPA 4M7XA 1TYQA 3U9ZA 2QWOA 1DKGD 5AZIB 5TKYA 2P9SB 3O5BA 4CZIA 3DJCA 3HSCA 3H1VX 3CERA 4PL8A 3TPQA 4O8KA 4O5FA 3S41A 2CGLA 1BU6O 1NLVA 3C7NB 3VEZA 4BG8A 2ITMA 3DWLA 5BPMA 3LDPA 1WUAA 4H0TB 2VWBA 3VEXA 1RFQA 2HOEA 1IJJA 5FPMA 2ZF5O 4BVOA 4JD2A 3VETA 5BRDA 4WQ5C 2QWNA 1T6CA 3A8YA 4PL7A 3IFRA 1BDGA 2Q31A 3FGUA 2QWLA 1H1VA 5AQKA 1YAGA 4H5RA 2P9PA 2EWSA 4FOEA 2D0PA 4BC3A 1S22A 4Y0WA 3O4WA 3L0QA 3IDHA 1SAZA 3O08A 5EX5A 1Y64A 5AQNA 1ESVA 3SK3A 4BVPA 2Q0UA 2UYTA 4BQZA 3F9MA 3DXMB 3R6MA 4RCHA 5EY4A 3SMPA 1SQKA 1V4TA 1NGJA 3M3ZA 1MWMA 5AQRA 5BPLA 2GWJA 2GWKA 5AQGA 3A5MC 3H46O 4BC5A 3WXIA 3QB0A 3VGKA 3O8MA 4AM6A 4A2AA 1E4GT 4DB3A 3FE1A 1Z05A 2YHYA 3OHRA 3A0IX 4H0VB 2P9NA 3CJBA 1XC3A 1ATSA 4EFHA 4FO0A 2E20A 3I33A 3KZBA 1QHAA 4BRKA 5AQSA 4H0PA 5E84A 1Z6RA 3VEVA 1J6ZA 4K25A 1KAYA 3EO3A 4IWVA 3U9DA 3UKUA 1CZAN 1NGAA 4ISEA 3A5OC 4BRGA 4H5NA 2GEMA 2P9IB 3KVGA 3VGMA 3WQTA 5KQ8A 4HWIA 3DAWA 3WQUA 1HKBA 1V4SA 4EHUA 2ASPA 2VYPA 1GLEG 4IXCA 3D7EO 5ADXA 3U4LA 5BN8A 4B1VA 3A5LC 3D2EB 3G25A 1NGDA 2ASMA 1XUPO 2V7YA 3QMLA 5JLFA 2J4RA 2FXUA 3WEEA 3R9PA 5F2RA 1YXQA 2Q1NA 4WQ5A 4FSVA 3BEXA 4MLHA 5AFUH 2YJFA 1BUPA 1K8KB 4XH1A 3ZX3A 4B1XB 3TU5A 2QWRA 1XQSC 2E2OA 3CQYA 5AZJB 4BRAA 3LM2A 5LJVA 1ZC6A 3B8AX 1HKCA 2DPNA 2AA4A 2QM1A 1KAZA 1ZXOA 2A42A 3QFPA 3LDQA 4JHDB 3VERA 2FSJA 4WQ4A 1X3NA 2QW9A 4BGBA 2E8AA 1LCUA 3H6EA 1D4XA 3WT0A 2E2PA 2NLXA 3VENA 1GLBG 4FWOA 2Q36A 3O6WA 4PKGA 4ISGA 2E1ZA 3JXUA 4CBXA 2ZGZA 4IZ9A 3IUCA 1SZ2A 1Q18A 1NGEA 4WYBA 1EQYA 3I8BA 1GLLO 4FWQA 1ATNA 1BA0A 1NM1A 4NO7A 5BPNA 4YDUA 3ZX0A 4K43A 3FLCO 5FPEA 4A61A 4JNEA 2QWQA 5FPNA 4HTLA 1GLDG 3UE5A 3MK6A 5E26A 3DXKB 5CE3A 3FZHA 1BOTO 5AZIA 2W40A 2A5XA 2P9SA 2IVOA 3RSEB 2V7ZA 1U2VB 3C7NA 2PBDA 2Q97A 3M6GA 2HMPA 1IG8A 3CJ7A 4FWPA 1OKJA 4BG9A 3LDOA 4CD1A 3CJ1A 1TUUA 5AQZA 4AM7A 4CZJA 4EIAA 2CH6A 4M7YA 4BRMA 3J8AA 4A62A 3BUZB 1U6ZA 2FF6A 5F1XA 3GBTA 1RGIA 4BROA 5KPRA 2D1KA 3AAQA 1C0FA 4BR0A 2A41A 4XEIA 1X3MA 3SJHA 2NRHA 2AP1A 1C0GA 3QFUA 2FF3B 2HF3A 4ISFA 3GOIA 5AFUA 4NB4A 4FWNA 3QICA 3BF1A 3DXMA 4BR5A 2P9LB 4F9OA 3BF3A 4I6MB 4B9QA 4BR2A 3HI0A 2QXLA 4BC4A 4CZEA 3LM9A 3O1WA 4EHTA 3ATUA 3H3NO 2A3ZA 4JAXA 4BR7A 4B1ZA 4CI6A 4BRFA 5AQMA 3UKRB 5KPZA 3HZ6A 5BN9A 4GNIA 3ENHA 1G99A 1GLFO 3SLCA 4QS9A 2Q0RA 5JMVA 3VF4A 3H3OB 3WXKA 3CJCA 3C0BA 2E2QA 1HLUA 5AQJA 3ZEUB 4EAHD 2P9IA 1S3XA 5AQWA 3VPZA 1HJOA 4MLEA 5BRHA 1QZ5A 2A40A 4JN4A 2IIRA 4B1YB 2QWPA 3M1FA 4CZKA 1R59O 4IO8A 1NBWA 1BA1A 4DHYA 2GELA 3D2EA 3MMVA 4BQLA 5KQDA 3EKSA 3CQXA 3CI5A 3ULEB 1JCEA 2F9TA 3QBWA 3WXJA 5AQPA 5B8HA 3UB5A 2HF4A 2WUSA 3D2FB 5AQYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4IFYA 4B3OA 4F3OA 1SL1A 4FJMA 5KI6A 5C25A 2OZMA 4CIGA 4DFMA 3OYBA 1ZU3A 4KBOA 1SL2A 3R8EA 2G8UA 4A59A 4CF2A 2P9KB 3NMUA 4IJAA 3O9RA 3DYAA 1SUQA 5EOYA 1DGKN 2CGJA 1BG3A 1JXCA 1VK0A 5EVZA 1VSEA 3DLKA 1RTDA 1BQNA 1RBVA 1LAVA 4NCAA 3OYDA 2ASOA 3VEOA 1QSYA 3V1OA 1NGIA 1JL1A 2DTUA 2G8IA 2O4GA 4BRDA 3TTFA 4FWLA 5D3GA 3EKUA 3LPTA 1XMOK 1LWEA 4HUGA 1JZAA 3SBGA 1HNWK 3JS6A 4BEBA 3OW2M 3THYB 1CN2A 3MXIA 3L2UA 4OPAA 1TUYA 4DTRA 5FLXO 3VF6A 1GLCG 4B9UA 4FZXC 4E0DA 2OPSA 1BO5O 5LMUK 4H0XB 1BWFO 1MDUB 2IVPA 3NCIA 1CXUA 1RT2A 3SYZA 3I8DA 1DEJA 2LY6A 2UUBK 3MX2A 2F4VK 1MA9B 1QSSA 2OTLN 4WQ4C 2A7TA 3I0SA 4FLUA 4DU1A 1ZVGA 2OPQA 1ZBSA 3QEWA 2IVNA 3OYFA 2VQEK 2P9NB 5I42A 1NK0A 4M3XA 4JI7K 2KZZA 4NYFA 2FLOA 3LAMA 5FDLA 3QNNA 1NJZA 4IDHA 2YV0X 4CGDA 3AY9A 1UAXA 4CEBA 5FPDA 2YI1A 4CECA 1QQCA 1RDCA 2ITGA 2P9LA 4FWMA 4H8KA 4AAZA 3HM8A 4I6MA 1T44A 2ZWHA 5HRRA 3OJUA 2E88A 2YJEA 2QA4N 4DV0K 3EYZA 4R5PA 1NGGA 2I61A 3MDQA 2CGKA 4JI5K 4YDUC 4DV7K 3C6AA 1W0HA 1N8RO 5J1EA 4OGCA 1KTQA 2KHOA 4CEAA 3QIOA 4GKJK 2LJMA 1SV5A 4UQGA 1Q81O 4E89A 3HOTA 1NWKA 2NRZA 1IG9A 4JKCA 3T1HK 1BI4A 3IMXA 1UA0A 4W5NA 3CFPA 3PO5A 3P4IA 4CVNE 3SPYA 3CQ8A 4ZTJA 3CC7N 2YIOA 3ZX2A 1TKTA 4HVJA 1HUXA 2NNWA 2PY5A 4DV5K 3V81A 4H5VA 3JYTA 4KHSA 4GW6A 2NRRA 3R2VA 2RF2A 2X6NA 3KD1E 4F8RA 5HBMA 3D2FA 4H5TA 1L5UA 3OYGA 1RDWX 3OBYA 4W5RA 4DR5K 1NRAA 3NVKA 1MWKA 1EETA 2RPIA 3EL2A 3ZETA 5AQLA 3EE9A 2Z1GA 4DR6K 1TYQA 2QWOA 1HMVA 4FJNA 3MECA 5AZIB 2NY8X 5TKYA 3O5BA 1CZBA 4A5AA 1X1PA 3HSCA 1JLQA 3AO2A 4YNQA 3S5TA 2ITMA 3DWLA 5BPMA 1WUAA 2NRTA 3OY9A 4LSLA 3VQDA 4CK3A 2ZF5O 5C10A 2HW3A 4BVOA 1L3SA 1TAUA 2Y1IA 3L2RA 4JKDA 3A8YA 1U4BA 2G8KA 1YJNN 3P5JA 2Q31A 5AQKA 1YAGA 4H5RA 4E1MA 3PLAA 4YHHK 2P9PA 2HHQA 1Y97A 4FOEA 2N2RA 1TKXA 1N6QA 4CEDA 4Y0WA 5FROA 2F96A 2WBNA 4FLXA 1ZBIA 1Y64A 1ESVA 4BVPA 3IG1A 1Q8IA 2Q0UA 2UYTA 3LP3A 4JI4K 5HRPA 4DF8A 1JJ2M 1IBMK 3VTIA 3R6MA 4MQ3A 3ASMA 4WFBL 4FLZA 2GWJA 4YFUA 1K73O 3WXIA 3QB0A 1WBDA 2O8DA 3U3GA 1XMQK 1HJRA 1N34K 4DB3A 4UY8O 3FE1A 2YHYA 3KK7A 2C1IA 3NF8A 2B5JA 4FO0A 3I33A 4BRKA 5E84A 3RMDA 2G8VA 1NU0A 1HNZK 1BRZA 4FW1A 3CM5A 2NRXA 5DM6L 4U67L 4YY3K 4AHRA 1WAFA 2KLAA 4BRGA 1VNBA 3PSMA 3KVGA 4KH4A 1FKOA 1XNQK 4HWIA 3WQUA 4B08A 4X62K 3OYAA 3DI6A 4EHUA 4CESA 3MXJA 1P90A 3MCAB 3AV9A 4MDBA 2A1RA 5BN8A 3L56A 3ENBA 1ZYVA 3E9PA 4R79A 2ZJRL 3BZCA 2W6LA 3AVCA 4CCHA 4LF4K 5F2RA 4WQ5A 4UJ0A 1W97L 1NH5A 4FSVA 4OX9K 4KKOA 4HUFA 1BUPA 1K8KB 3ZX3A 2XO7A 3WNGA 4E7LA 3QO9A 2QWRA 1XQSC 2E2OA 3EE8A 4BRAA 3LM2A 5LJVA 2VWJA 2QM1A 3S9HA 3CPWM 1ZXOA 4CF0A 3QFPA 3G10A 4WQ4A 1ICAA 3ZSYA 3VTHA 3H6EA 4E19A 4CQKA 4X64K 3V6DA 4KB1A 2IOCA 3V4IA 1GLBG 2Q36A 3O6WA 3RVCA 4PKGA 2PYJA 2QKKA 3ZT1A 1WSJA 1N33K 3M8QA 3AVAA 1SZ2A 1K9MO 3EY1A 4FJIA 3VQ8A 1A5WA 4FWQA 4CIEA 3AO5A 1NM1A 4DR7K 4YDUA 3ZX0A 4B8AB 3FFIA 3FLCO 4FK0A 4AF1A 2UUCK 5FPNA 1TL3A 4DV1K 4PY5A 3DRSA 3QIPA 4FCYA 4H4MA 1BOTO 4F2SA 1HNXK 2W40A 2P9SA 3O9TA 4JKGB 1KVBA 1HQUA 4NLCA 3DOKA 3ZLJA 2V7ZA 2O8FB 1U2VB 4GV3A 4KHPK 3NF7A 2YHBA 1IKWA 2ZQBA 4FWPA 4M41A 4UAEF 5AQZA 1Q82O 2CH6A 1WT7A 4BRMA 3QNOA 5F1XA 3OYKA 3PSIA 3ZSRA 2D1KA 1TGOA 2RHKA 3QERA 4DSJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4IFY A;  4B3O A;  4F3O A;  1SL1 A;  4FJM A;  5KI6 A;  5C25 A;  2OZM A;  4CIG A;  4DFM A;  3OYB A;  1ZU3 A;  4KBO A;  1SL2 A;  3R8E A;  2G8U A;  4A59 A;  4CF2 A;  2P9K B;  3NMU A;  4IJA A;  3O9R A;  3DYA A;  1SUQ A;  5EOY A;  1DGK N;  2CGJ A;  1BG3 A;  1JXC A;  1VK0 A;  5EVZ A;  1VSE A;  3DLK A;  1RTD A;  1BQN A;  1RBV A;  1LAV A;  4NCA A;  3OYD A;  2ASO A;  3VEO A;  1QSY A;  3V1O A;  1NGI A;  1JL1 A;  2DTU A;  2G8I A;  2O4G A;  4BRD A;  3TTF A;  4FWL A;  5D3G A;  3EKU A;  3LPT A;  1XMO K;  1LWE A;  4HUG A;  1JZA A;  3SBG A;  1HNW K;  3JS6 A;  4BEB A;  3OW2 M;  3THY B;  1CN2 A;  3MXI A;  3L2U A;  4OPA A;  1TUY A;  4DTR A;  5FLX O;  3VF6 A;  1GLC G;  4B9U A;  4FZX C;  4E0D A;  2OPS A;  1BO5 O;  5LMU K;  4H0X B;  1BWF O;  1MDU B;  2IVP A;  3NCI A;  1CXU A;  1RT2 A;  3SYZ A;  3I8D A;  1DEJ A;  2LY6 A;  2UUB K;  3MX2 A;  2F4V K;  1MA9 B;  1QSS A;  2OTL N;  4WQ4 C;  2A7T A;  3I0S A;  4FLU A;  4DU1 A;  1ZVG A;  2OPQ A;  1ZBS A;  3QEW A;  2IVN A;  3OYF A;  2VQE K;  2P9N B;  5I42 A;  1NK0 A;  4M3X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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