1BWFO

Escherichia coli glycerol kinase mutant with bound atp analog showing substantial domain motion
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
498
structure length
494
Chain Sequence
b'EKKYIVALDQGTTSSRAVVMDHDANIISVSQREFEQIYPKPGWVEHDPMEIWATQSWTLVEVLAKADISSDQIAAIGITNQRETTIVWEKETGKPIYNAIVWQCRRTAEICEHLKRDGLEDYIRSNTGLVIDPYFSGTKVKWILDHVEGSRERARRGELLFGTVDTWLIWKMTQGRVHVTDYTNASRTMLFNIHTLDWDDKMLEVLDIPREMLPEVRRSSEVYGQTNIGTRIPISGIAGDQQAALFGQLCVKEGMAKNTYGTGCFMLMNTGEKAVKSENGLLTTIACGPTGEVNYALEGAVFMAGASIQWLRDEMKLINDAYDSEYFATKVQNTNGVYVVPAFTGLGAPYWDPYARGAIFGLTRGVNANHIIRATLESIAYQTRDVLEAMQADSGIRLHALRVDGGAVANNFLMQFQSDILGTRVERPEVREVTALGAAYLAGLAVGFWQNLDELQEKAVIEREFRPGIETTERNYRYAGWKKAVKRAMAWEEH'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords GLYCEROL KINASE
publication title Crystal structures of Escherichia coli glycerol kinase variant S58-->W in complex with nonhydrolyzable ATP analogues reveal a putative active conformation of the enzyme as a result of domain motion.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags Transferase
total genus 162
structure length 494
sequence length 498
chains with identical sequence Y
ec nomenclature ec 2.7.1.30: Glycerol kinase.
pdb deposition date 1998-09-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
O PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
O PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bwfO02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1bwfO01
4CD1A 3ZETB 5F0XA 3LM9A 1NM1A 3UKUA 4MO4A 3VERA 4C23A 3QDKA 5I9EB 1DKGD 2FF6A 2CGLA 3ZETA 2FSKA 4BR2A 1WUAA 3U9ZA 3SMPA 5LY3A 2YCHA 3FZMA 3VF6A 1YXQA 3VGMA 3FGUA 4XH4A 3HBTA 1QHAA 4H0VB 3ZX2A 1IG8A 2ITMA 2QWMA 3DXMB 4PKGA 4CZMA 4JNEA 1S22A 2DPNA 1NGDA 4IXCA 3U4LA 2ASOA 4B1XB 4BREA 3IMXA 4BR7A 4FWOA 1RDWX 4XH1A 4BGBA 4DCHA 2D1KA 3DXMA 2QWLA 5BRHA 2KHOA 3C7NB 1GLCG 1NGIA 1NGFA 4MLHA 2D4WA 5BPLA 1BA0A 2FSNA 2NZTA 2QWNA 4YDUC 1NGGA 3A5LC 3LDPA 3C7NA 5E26A 3VENA 1X3NA 1TUYA 4FWQA 4FO0A 5BREA 3BEXA 5AQOA 1HLUA 5AQLA 4BR9A 3CJAA 5EOYA 4BR5A 1ATRA 3H46O 1MA9B 3AAQA 2Q97A 3CQXA 1GLLO 2E2OA 2ASMA 4JHDB 3VESA 4FPAA 4H0TB 2FXUA 2QXLA 4K41A 2YHWA 3LDOA 1HKGA 3QB0A 4B1WB 1QQNA 5AQZA 4JHDA 4H0OA 4WQ4C 1JCGA 1NMDA 3WXLA 3GDQA 4BQZA 2YJFA 4CJ7A 3CJ9A 4EIAA 5KPRA 4CI6A 1BU6O 2UYTA 4EAHD 3QFUA 3QBXA 5AQYA 5BN9A 4M63C 4BRLA 2D0PA 4O8KA 4RWTA 1T44A 4EHTA 2V51B 4K25A 5LJWA 3ULEB 2P9SB 1GLEG 1YVNA 4A62A 3CIPA 3WQTA 3A0IX 2A3ZA 5AQJA 2FSJA 2P9SA 4BC4A 1ATNA 4BRFA 2P9LB 1SQKA 1Y64A 3AAPA 5KPTA 2HMPA 2GTDA 3ZEUB 3EO3A 4FOIA 3SMSA 5EX5A 5JLFA 1NGHA 4L3QA 1JCEA 2P9LA 1QQOA 2A5XA 3VEOA 1BOTO 1H1VA 4F9OA 5AZIB 1ZC6A 3EN9A 3ZEUA 1J6ZA 5BRDA 3CERA 5AQTA 3WUHA 5FPNA 2YI1A 2ZGZA 2A42A 3UE5A 4O5FA 5AZIA 3MN6A 3SJHA 3VEVA 3KVGA 1GLAG 1U6ZA 2ASPA 4EFHA 3DAWA 3LL3A 3KZBA 2CH6A 2IIRA 5KQDA 3BP8A 3CI5A 5E84A 2CH5A 1NGEA 3O6WA 3MDQA 3W0LA 4IZ9A 1GLDG 4H0PA 4QS9A 3WT0A 4BRDA 1C0FA 3MCPA 1P8ZA 3U9DA 2I7PA 5AQPA 4BRKA 1HJOA 3BF3A 3ZX3A 1WOQA 3D2FB 3MN7A 2QW9A 1DEJA 2V7YA 3BUZB 1TYQB 3CJ7A 4BR0A 1KAYA 3ENOA 1NGCA 3D2FA 3L4IA 3UB5A 3VEZA 4BRPA 2E1YA 4FOEA 1JCFA 1SZ2A 2A40A 2BTFA 2VCPA 1TUUA 3ID8A 4FWMA 3QBWA 2E2PA 1R59O 3FZHA 5AQGA 5F1XA 5AQHA 2EWSA 5BR9A 1NGBA 5TKYA 5BPNA 1HX1A 3FZFA 1LOTB 4GNIA 4E1JA 4H5RA 1X9JA 3B8AX 4PL7A 4CZKA 1BO5O 4BG8A 3D2EB 3H3OB 2CGKA 3VEYA 3LDNA 5ELZA 5AQIA 1NLVA 4CBUA 5JICA 1XUPO 1Q18A 1QZ6A 5CE3A 3M1FA 3D2EA 5KPZA 4NB4A 1ZXOA 3I33A 2I7NA 1ESVA 2VWBA 5ADXH 3U8XA 4BROA 5AQKA 3R9PA 4NO7A 3FE1A 3RSEB 2QWRA 2WUSA 4QS8A 1EQYA 2A6AA 3IUCA 3EKSA 5AFUH 4CZIA 4ISFA 2VYPA 4BC5A 4BQLA 1BG3A 3H1VX 1IJJA 2IVOA 3A5NC 1E4FT 3LDLA 4H03B 5AQFA 3VF4A 1NBWA 3RSEA 4B1VA 5JLHA 3KHYA 2Q0UA 5AQVA 4WQ5C 4H5WA 4Y0WA 1D4XA 3GG4A 5AR0A 4DB3A 3FR0A 2P9KB 2QM1A 3EKUA 2HF4A 3JS6A 1HUXA 3MN5A 2E2NA 4CBWA 4LC9B 4K42A 2F9TA 1G99A 3H1QA 4FWLA 4H5TA 4PL8A 1HKCA 3O1BA 1NGJA 3M6GA 5AQSA 4EHUA 3IFRA 4JAXA 3SK3A 4QS7A 2P9KA 4BRMA 2HOEA 2IVPA 4K43A 2D0OA 2ZGYA 3F9MA 5B8HA 3ULEA 3LDQA 4CD3A 3J8AA 4RTFD 3HI0A 3FZLA 4IWVA 4YDUA 4CZLA 4A2BA 4A2AA 5KQ8A 3HTVA 4ISGA 4FWPA 4H5NA 2PBDA 3AARA 3L6QA 1V4TA 4AM7A 1QQMA 5FPMA 1GLBG 5BRFA 1T6DA 4BRQA 1BDGA 5AQRA 3O80A 3VEWA 3O4WA 4FWKA 1K8KB 1HPMA 5AQXA 2P9IB 4CZFA 4PKIA 3A5OC 3VF2A 4WYBA 3QFPA 4FWSA 4FWRA 1S3XA 1GLFO 3TU5A 2Q31A 4H0YB 1K8KA 2AP1A 3CETA 2GWKA 2H3GX 2P9IA 3L0QA 4WQ4A 2QWQA 3FZKA 3UKRB 3FLCO 5FPDA 3MN9A 2E1ZA 1KAXA 3FFKB 3GBTA 4BRAA 1XC3A 1QZ5A 3OHRA 3GOIA 4WQ5A 1C0GA 3WQUA 3CJ1A 3JXUA 4IJAA 2CGJA 1GLJO 4FPBA 4BRGA 3VETA 2Q1NA 3HZ6A 4MLEA 5AQNA 5AQWA 3I8BA 4H5VA 1U2VB 2E8AA 2GELA 4FL9A 2ZF5O 4J8FA 1E4GT 2QWOA 1TYQA 1ATSA 4IJNA 5F2RA 2PAVA 2E88A 1U2VA 4BRNA 2QWPA 5BN8A 3TPQA 4BG9A 3MMVA 3R8EA 4BRIA 1Z05A 2OANA 4BRCA 4DQ8A 3DXKB 4IO8A 3A5MC 1RGIA 3WXIA 3DWLA 4BC2A 3A8YA 3VPZA 3ENHA 3HSCA 2FLOA 1KXPA 1BWFO 3CJCA 3QMLA 3M3ZA 3P4IA 3O8MA 4PKHA 3DXKA 5ADXA 3DJCA 4CZJA 1SAZA 4GY2B 3ATUA 3S41A 4FSVA 5AQQA 3O1WA 4B9QA 5AFUA 1NWKA 4M7YA 1HKBA 3BF1A 3H3NO 3MK6A 2E2QA 3D7EO 2E20A 4B1ZA 2GEMA 2NLXA 1V4SA 4JN4A 3VGLA 2Q0RA 1RFQA 3R6MA 4CBXA 3GE1A 4KBOA 1CZAN 4DHYA 2W41A 4HWIA 3VGKA 3H45C 4BVOA 1X3MA 2AA4A 2Q2RA 3WEEB 2YHYA 1BA1A 1BUPA 2BUPA 3EL2A 2V52B 4BVPA 2A41A 5EVZA 4BC3A 3WEEA 4CZEA 1KAZA 2V7ZA 2IVNA 4ISEA 5EY4A 2J4RA 2P9UB 3GL1A 4B1YB 3W3DA 1Z6RA 3VOVA 5LJVA 2P9PB 3G25A 4RCHA 1MWMA 1MWKA 4XEIA 3CHWA 2GUPA 2FF3B 1LCUA 1XQSC 1YAGA 2P9UA 2P9PA 4FWNA 2HF3A 4CZGA 3AY9A 3O08A 4JD2B 4A61A 2YJEA 1MDUB 5AZJB 4CZHA 5FPEA 3WXKA 5AQUA 5BPMA 4JD2A 4M7XA 3QICA 3LM2A 2P9NB 3CJBA 1YUWA 4BR4A 2ZWHA 4H0XB 1OKJA 2YHXA 5AZJA 4I6MB 3CQYA 5AQMA 2Q36A 3HM8A 3ZX0A 3VEXA 3IDHA 3H6EA 4BRHA 4B1UB 3ATVA 2P9NA 1DGKN 5EXWA 4MO5A 4HTLA 1T6CA 4I6MA 1NGAA 2NRHA 4BGAA 3EZWA 2GWJA 3SLCA 3UKRA 4Z94A 3O5BA 5JMVA 3UKUB 2W40A 1ZBSA 3WXJA 4XH5A 3C0BA 2F9WA 4AM6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4M3RA 3ITHA 3ZETB 2VQEK 1NM1A 4JI4K 3UKUA 2OTJN 4JKBA 2VWKA 1KVCA 3P1GA 3QDKA 3AV9A 1YI2N 4BR2A 2A1SA 4DR1K 1FXXA 3TAFA 3VQ5A 3WNGA 1NG9A 2D5RA 4DSLA 2GX9A 5LMNK 3VGMA 3SYZA 4XH4A 3HBTA 4HHTA 1EETA 4H0VB 3CPEA 4C8MA 2NRVA 2WC9A 1JLBA 4X65K 3ZSVA 1KLMA 2HHSA 2VQFK 4OKKA 4NXMK 4CHNA 4DG1A 4B9LA 3DRRA 4E7IA 1K8AO 3U3YA 4BREA 1KFDA 4BR7A 1KCFA 4FWOA 2KZMA 4BGBA 2D1KA 3DXMA 3P39A 4FLVA 1BIUA 1GLCG 2D4WA 1BA0A 1I39A 2F4VK 3CCSN 2QWNA 4C8OA 3CCVN 1RDUA 1QVFM 3KK3A 3CCQN 2B6AA 3VENA 4ID1A 4MDBA 3CF5L 3CCRN 1WLJA 4DR6K 3AA3A 4B3SK 4OO1J 4BR5A 4CEAA 3OYNA 4YOUA 1WAFA 3AAQA 2WONA 4EP5A 3DLEA 2E2OA 2ASMA 3OJUA 3QIOA 4CHOA 3SAHA 3SQ2A 1X9WA 2FXUA 3I8DA 4B1WB 3PX0A 4JHDA 3OS0A 1NMDA 4FZYA 2LSNA 3GDQA 4BQZA 4CJ7A 4EIAA 4DV1K 2GV9A 4M63C 1C1CA 2D0PA 4CECA 4RWTA 4YORA 4FJ5A 4K25A 4LFCK 4QOZB 3ULEB 1TKDA 4PQUA 3QNOA 3OYMA 1L3UA 1ASVA 3CIPA 1C6VA 1KTQA 5AQJA 4NCAA 1RTDA 2P9SA 3DLHA 1Y64A 3AAPA 2HMPA 3NVMA 3RRHA 3CCMN 4JI3K 4JS5A 1JLQA 3D45A 3IS9A 3SMSA 4I9LA 2WFBA 4YOVA 2A5XA 1TKTA 1QE1A 1BOTO 3OYEA 1L3SA 4B8CA 3CMEN 3MEGA 2GUIA 4LY7A 5AQTA 3WUHA 2KKZA 4E3SA 4DF8A 5JS2A 3AVFA 3MN6A 3SJHA 3VEVA 4C8KA 1SUQA 4O0IA 3DAWA 2IIRA 3BP8A 4N47A 4DFKA 4Z4IA 1J54A 2XHBA 2PFUA 3WT0A 4QS9A 2YHBA 4B3OA 1RILA 4OPJA 3MCPA 1P8ZA 4CJEA 3VQQA 4JK8A 2F96A 4DTUA 2O8DB 1DEJA 3ZCMA 2XY5A 1J53A 4N56A 1YITN 4LF8K 5M1NA 1BISA 2ZD1A 3K9JA 5HOOA 3THYB 3UB5A 3VEZA 1SZ2A 4F2RA 2BTFA 1TUUA 1WBDA 2E6MA 5C24A 2E2PA 1U47A 1TAUA 1R59O 3RMDA 4DTRA 4FJ9A 2EWSA 2O8EB 1IG9A 2OTLN 1NGBA 5BPNA 1HX1A 3EZ5A 3HT3A 4I7FA 3WNFA 3O9SA 3B8AX 4N76A 3B6PA 3H3OB 4JI0K 4DS5A 2PZSA 3VEYA 4WF9L 3PIPL 4RW4A 3NGIA 2QKKA 2BGGA 3AO4A 1B9FA 3M1FA 3D2EA 4DWIA 2W6KA 3I33A 2I7NA 2VWBA 1HR0K 3P5JA 3VQ9A 3HM9A 4CJSA 3MXJA 3R3LA 1EQYA 5AFUH 4M3WA 4ISFA 3MX2A 1BG3A 2G8IA 3A5NC 4Y1CA 3RSEA 5JLHA 3KD5E 2Q0UA 4CF8A 4AH9A 4H5WA 4O55A 2KQ2A 1VSDA 4Y0WA 4JI6K 4HCCA 3FR0A 2YHAA 1DTQA 1JXBA 4FK4A 1JLAA 1A5WA 2O8FB 4ZTJA 1KQSM 1TGOA 5J2NA 3O4NA 3WNHA 2P5OA 5B8HA 3TWHA 1NK7A 3LDQA 5CYMA 1N5YA 4CD3A 2FBTA 4HUFA 5M1QA 4CW7B 1WSIA 4J2BA 4YDUA 3MCAB 1U45A 4KI6A 4ILJA 1CZ9A 4I2QA 3D0PA 1HNXK 4B9UA 3AARA 3L6QA 1V4TA 4BWJA 3OYHA 1YJ9N 4BRQA 4U67L 4GV9A 1TAQA 4FJ7A 1UA0A 1SKRA 4MFBA 2P9IB 2HHVA 4JLHA 1DT9A 3M8PA 1RDBA 4FW2A 4E7LA 4FWRA 1S3XA 3K2PA 2JWLA 1XNQK 2Q31A 1JLGA 1K8KA 2AP1A 1Z25A 1L5UA 2NRZA 4DTPA 3HL8A 1JKHA 1IBKK 1KAXA 5FROA 2G8VA 4BRAA 1C0GA 4FLZA 1NU0A 3JXUA 4CIEA 3QEXA 5AQNA 3V4IA 2YNFA 2E8AA 2GELA 4JKGB 1UA1A 2QWOA 4LSNA 3C95A 3F2KA 4CHZA 2OPPA 4BRNA 3QNNA 1U49A 3TPQA 3ULDA 1W2BM 3MMVA 3R8EA 4JYAK 1Z05A 2OANA 5KGWA 4BRCA 5C10A 3DWLA 1HQUA 4CJRA 3A8YA 4KHPK 1RT5A 4DMNA 4IDKA 1KXPA 3O8MA 2A1RA 3DXKA 3A2FA 3K9KA 4GY2B 2P1JA 3P83D 5AQQA 2R7YA 3V9XA 4N5SA 4PA1A 2B4JA 1NWKA 4CEOA 1HRHA 4M7YA 1FW6A 3BF1A 3SZ2A 4KRFA 3MWTA 5FRNA 3L3VA 2Q0RA 3PX6A 1RFQA 4DSJA 1OVQA 2JGUA 3AGKA 2HBLA 3GE1A 4WFNL 1E3MA 3TANA 4DHYA 5LL6Z 3HO1A 2KTQA 2G8KA 1CXQA 3C6AA 1NMNA 1RBUA 2Q2RA 5MLCQ 3M8QA 2YHYA 3KWIA 1BA1A 1BUPA 2BUPA 5HP1A 3ASMA 2O8CA 4JK7A 2V52B 3SUNA 4DTOA 3LZJA 4FM0A 1JLCA 4JKAA 5EVZA 4BC3A 1NKBA 1RT6A 3O9RA 1KAZA 2V7ZA 2IVNA 3OYDA 3GL1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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