1BWHA

The 1.8 a structure of ground control grown tetragonal hen egg white lysozyme
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Bound-solvent structures for microgravity-, ground control-, gel- and microbatch-grown hen egg-white lysozyme crystals at 1.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1bwhA00
1IIZA 1KIQC 3FE0A 1LZBA 4LFPA 1C46A 1RJCB 1IWXA 5FCPA 3T6UA 2DQDY 1UA6Y 1B7NA 1LMQA 4Z98A 1OUAA 4H9BA 1FBIX 2HEAA 1B7PA 2LYMA 4DD2A 1V7SA 2EQLA 2HUBA 1F6SA 5DLAA 5F9XA 4Z46A 2YSSC 3TXIA 1GB0A 2XTHA 1DQJC 3A34A 3HBDA 5KXXA 1VDPA 3QE8A 4RDSA 5EBHA 4CGEA 1BB3A 1TBYA 2ZIJA 2H9KA 4H93A 1YAPA 3AGIA 4GN3A 1HMKA 4UWNA 2D91A 2BLXA 2HEBA 5E4PA 1AZFA 1LYOA 5F9UA 134LA 2Y8PA 4B1AA 1J1PY 5ILFA 1LZEA 1GBYA 4ZIXA 2Z39A 1LZDA 1LJIA 4IASA 4PPOA 3E3DA 4WG7A 1LSDA 3A6CY 3A3QA 4GN4A 1GB3A 1QQYA 3G3AB 1GFEA 4NG1A 3D9AC 4XYYA 2W1YA 2MEHA 4WM3A 2LYZA 4H8XA 5HNLA 3P68A 5LVKA 4CHXA 1FDLY 4TX7A 3W6BA 1JIYA 4GLVA 1LSFA 1IC7Y 1YKZX 5FHWA 5LA8A 1LZ6A 1IP1A 3WXUA 4NEBA 4WM2A 1CJ8A 2YDGA 2Z18A 1LAAA 2HTXA 4NWHA 1GPQC 3WL2A 1OUIA 2YBHA 4MR1A 2BQMA 5LIOA 1G7MC 1ZVHL 3AGGG 4NGJA 2DQCY 2BAAA 3B0KA 1CKCA 5I4XA 1VATA 5KXMA 2YBMA 1KIPC 2FYCA 5DM9A 4B0DA 4GLAA 1DPXA 3AW7A 1JISA 1IP7A 3HBHA 153LA 2I26L 5FSTA 5I54A 1GF8A 3ZVQA 2CJLA 4ET8A 1LJJA 4HPEA 4HSFA 2DKVA 1IP5A 1DKJA 1QDTA 1IY3A 5F14A 1XEKA 1F0WA 3WPKA 3WW5A 5FDJA 1LSAA 1DZBX 4TSCA 1UC0A 3A8ZA 4ZFPA 3CT5A 2BQNA 1UIEA 1C08C 2GV0A 4R0FA 4WM4A 5LYZA 1IY4A 4OWAA 4WM5A 1NWGA 5KXNA 1B7QA 1F10A 4DD9A 5A3EA 1BVXA 4J1AA 1HFZA 2G4PA 1IWUA 4C3WA 4Z41A 1JKDA 1RI8B 1WQQA 4WL6A 2ZYCA 1GF6A 1LZGA 1TCYA 1GD6A 2YVBA 3ULRA 4ANRA 3WPJA 3WUAA 1IOSA 4H9IA 1A2YC 4AGAA 1LZ4A 1QTKA 7LYZA 1HC0A 4M6DA 3N9AA 1HFYA 1C45A 4N0JA 1IX0A 4DD7A 1B7MA 2EPEA 3W6AA 3TXFA 4Z3MA 1TAYA 1D6QA 1NQIA 3WU7A 1D9UA 1XEIA 3LYZA 4GN5C 4YENA 1BWIA 5D5CA 4DWXA 4UWVA 3F6ZA 4IJ4A 3GXKA 2Z2EA 3ATNA 1LMNA 5AMYA 5KKJA 1NHEA 1LSNA 1VDTA 1D0MA 1FLQA 1LSZA 3AGHA 1RFPA 2A7FA 3B0OA 1GE2A 1JKBA 2MECA 3CB7A 4WLDA 4NGZA 1B5YA 2A7DA 3P66A 2LZ2A 2VB1A 3WUNA 1XFPL 1B0DA 5KXYA 1D6PA 1LSEA 4MSTA 4NSGA 4OOOA 1LJFA 5HNCA 1GE3A 1JEFA 2G4NA 2W1LA 3A93A 1C7PA 4HJVA 4NHTA 1IOTA 4XJIA 1TDYA 1VDSA 2F4AA 2DQHY 3CT1A 3W6FA 1IWTA 3WYHA 2Q0MX 2C8OA 4RLMA 4WLXA 1YIKA 2D4IA 3AZ6A 3CQLA 2MEEA 2Z38A 4BAFA 1T3PA 4I0CA 4OOTA 1FLYA 1GBXA 1OUBA 2PC2A 1IOCA 1QUTA 1LPIA 1LZCA 1LHKA 1HFXA 1WQRA 2Z37A 5APEA 4YOPA 1NMMA 5LYTA 4BS7A 2ZNXY 4B49A 1XGTC 4HTQA 1FLUA 3ATOA 4YEMA 3A3RX 2YBIA 1VEDA 1AT5A 1FKVA 1LSMA 5KXOA 5HQ1A 4PHIA 1CJ7A 4XJFA 3A90A 1GFKA 1LSYA 3TMUA 2BQJA 1LOZA 3WVYA 1C10A 1B9OA 132LA 1DXJA 1JITA 1WQMA 4LT0A 4TUNA 6LYTA 3LHMA 3WW6A 2ZQ4A 1TEWA 3GXRA 4H90A 1IEEA 2ZWBA 2F2NA 1MELL 1GB8A 1LJGA 1PZYA 5KXRA 4GCCA 4WOAA 1JTPL 1GF7A 3LZTA 3ZEKA 1LJNA 1XSFA 5LVHA 1LSCA 2BQCA 3HBEX 4NGYA 5KXLA 1I56A 4LYZA 3W6DA 1ALCA 1AM7A 1GFRA 1XGUC 2BQFA 4G4BA 3A95A 1GB6A 4GCEA 3OK0A 4HJZA 4X3BA 1E8LA 3AYQA 4NHQA 3AZ4A 3G3BB 1UIGA 4B4JA 4J7VA 3TXBA 2DQGY 2YBJA 4FDYA 4N9RA 1YROA 2MEAA 1IVMA 5JENB 2H9JA 4G4HA 1JUGA 1GHLA 4TWSA 4J0LA 1JHLA 3TMWA 1JJ3A 5ILCA 4ETEA 1IC4Y 4NSJA 4ETCA 1SQ2L 5B59A 3LN2A 3LYMA 4NGKA 5J7CA 4NIJA 3RU5A 1T6VL 1HSWA 4OWBA 1NKHA 5D5FA 1EL1A 2HU3A 4DT3A 5KJ9A 1LZ1A 4KPMA 4BADA 1B7SA 1DPWA 4YM8A 1LMOA 1UCOA 4WL7A 5B06A 1JPOA 1HEQA 2BPUA 2C8PA 2MEBA 4XJBA 5FELA 2ZNWY 1UIFA 1GDWA 4IATA 4LT3A 2AUBA 2G4QA 2EIZC 3IJUA 4QEQA 5LXWA 1HEOA 1LZTA 1GF5A 3LZ2A 4QDNA 1DI4A 1HEPA 1KXXA 2DQAA 4NGWA 5KXPA 4BAPA 3B0IA 1JJ1A 1LJ3A 4PRUA 1IWWA 1UIAA 1BWJA 5B1FA 5F81A 1UICA 4YEOA 1G7HC 1OQMA 1DI5A 4AXTA 5DN5A 2X0AA 1BGIA 1BB4A 4NHPA 1WVUA 4DD1A 3WU9A 5I53A 4N1EI 1UIBA 2HECA 4I8SA 1IR9A 5HLLA 2EKSC 4LGKA 1QDRA 4WO9A 3VWOA 1GFVA 4QGZA 1YL0X 5HMJA 4PRQA 1HMLA 5IELA 1B5VA 1LZRA 2CWIA 3WMKA 4ETBA 1MLCE 1J1OY 2DQJY 3CSQA 4H92A 4H8ZA 1IC5Y 4H1PA 1YAOA 1JTTL 1J1XY 3B6LA 4WM6A 4LT2A 2I25L 1LMPA 1ZMYL 3SP3A 1JSEA 1CJ9A 5E9RA 2ZIKA 1IWYA 5KXZA 1GF4A 1IORA 1WQNA 1I20A 3B72A 1AKIA 2DQFC 1GFAA 5DL9A 4NWEA 1KXWA 1LZ9A 4RW2A 1INUA 1UACY 5KXKA 3CSZA 4OWEA 3RW8A 4YF2A 8LYZA 3TXJA 4XADA 5L3IA 5C6LA 4RLNA 5LAGA 4H9CA 1IOQA 1B5WA 1JKCA 1HEWA 2D6BA 3MGWA 4LYTA 1FKQA 4H9AA 1BQLY 2LYOA 5LAFA 2RSCA 4QY9A 5LYMA 2NWDX 2D4JA 1GFTA 1GE0A 3A6BY 2BQHA 4OW1A 3T36A 2BQEA 3EXDA 1KIRC 4G9SA 5I5QA 2HEFA 3BKVA 3P4ZA 3TXGA 1P2CC 4UWUA 4PGJB 5L3HA 1EQEA 4HPIA 1B2KA 4NHSA 1YILA 1QUSA 4II8A 4B4IA 4EOFA 1JWRA 4NGIA 5II3A 194LA 2BQLA 1IP6A 1GB7A 4ML7A 5I4WA 2B5ZA 4FJRA 4WLTA 3TMVA 4HP0A 4DD0A 1LSGA 2BQAA 1GAYA 3AB6A 1GXXA 5L9JA 1B5ZA 1CNSA 1IO5A 1NF5A 1WQPA 1NDGC 2DQIY 1B5UA 4LYBA 1ZVYB 2HU1A 1DKKA 3A92A 1OUFA 1UIDA 2CDSA 1LJ4A 2BQDA 1GXV2 1LMTA 1BWHA 3M18B 3IWRA 1LYSA 1GFUA 4GCBA 3W6CA 4NHIA 1GFJA 4H94A 5DN4A 3J6KA 5HMVA 1ZV5L 2ZYPA 1OUJA 1GF0A 1IP3A 4H8YA 4MCKA 4WM1A 1GF3A 2W1XA 4GCFA 1BB6A 1HHLA 4D9ZA 1GAZA 1GF9A 4G49A 3A94A 154LA 4J1BA 4R6CA 1W08A 1CKHA 1LJHA 1YQVY 3WPLA 2DQEY 1GFHA 5KXSA 1CKGA 2F4GA 3OJPA 2BQKA 1WVVA 2YBNA 1OUDA 4XENA 3ZVQB 4C5FA 2N5ZA 1JKAA 2DBTA 5IHGA 1WQOA 1LZAA 3AZ5A 4DDCA 3KAMA 1LZ5A 1OUHA 1LZSA 4HTKA 1EQ5A 1HNLA 5B05A 1REZA 1JJ0A 3FI7A 4XJDA 1VFBC 1OUCA 1B5XA 2BQIA 5K7OA 4TSBA 1GB2A 2XJWA 2ZQ3A 3TXEA 4XN6A 1LYYA 4WMGA 1QSWA 4XJGA 1GE1A 2Z2FA 1GB5A 2MEFA 4N8ZA 5APCA 3WUMA 5T3FA 3P64A 1F6RA 1RCMA 2LHMA 135LA 1GWDA 3IJVA 3M3UA 4WG1A 1YKXX 3RNXA 4H9EA 4CJ2A 1REMA 1XGRC 4L41A 1G7LC 1KXYA 1D0KA 1GDXA 1LSPA 2F30A 1OP9B 1HSXA 4G4CA 3D3DA 4GCDA 4B4EA 4M4OA 1EQ4A 2BQOA 1G7JC 5FEKA 1LHLA 3TXHA 3W3EA 1SLYA 2YBLA 1UIHA 4LYOA 1DI3A 1AT6A 1PS5A 2Z12A 4HV2A 6LYZA 2D4KA 1XGPC 1UBZA 1JTOL 4A7DA 4ET9A 5B07A 1LZYA 2H5ZA 5F16A 1B7RA 4HJYA 4NSIA 5I4YA 4CFOA 4O34A 1LYZA 3HFMY 1YANA 1HELA 1GEZA 2WARA 1IR7A 1XGQC 2Z19A 3EBAB 5APDA 5IDDA 1LZNA 4RW1A 1NDMC 4H91A 4P2EA 1CKDA 4KT3A 5LVGA 1LHJA 3AJNA 1WTNA 4NY5A 3J4GA 1BB5A 1LKSA 1XEJA 1LCNA 1IP4A 3CT0A 1LHIA 4LYCA 2XBRA 193LA 1N4FA 1YAMA 1NBYC 207LA 4WO6A 4ETDA 1CJ6A 3WULA 2XBSA 2ZILA 1H87A 1CKFA 1NBZC 4WLYA 5M1YA 4PJ2C 1GBWA 4N1CC 1LHMA 1REYA 1UUZC 5KKIA 5KY1A 1REXA 3WU8A 1HF4A 1OUEA 1W6ZA 2BQBA 2IHLA 5LA5A 2LZTA 3LYTA 9LYZA 1HERA 1V7TA 2MEGA 3N9EA 4HTNA 4W96A 3A91A 3TXKA 5KXWA 2CGIA 1BHZA 1BVKC 1GE4A 4OWHA 3N9CA 2HEDA 5C6IA 4DDAA 2HEEA 1B7OA 1LTMA 3WVXA 1HENA 1LKRA 1LSBA 1GEVA 4LT1A 5APFA 3WH1A 2BQGA 1QTEA 1LMCA 4U3XB 1QIOA 3WXTA 4TTDA 1G7IC 5A3ZA 1D0LA 4E3UA 1HEMA 2FBDA 4CFPA 1JSFA 3P65A 1Z55A 4H9HA 1FN5A 4LZTA 1H6MA 3EO5A 5LVIA 4DDBA 4NGOA 2FBBA 3A67Y 1YL1X 4NGVA 3W6EA 3RZ4A 1IWZA 2MEIA 1GBZA 3BKHA 3EMSA 4EMNA 3AZ7A 4ETAA 1LHHA 4ZEEA 5LVJA 133LA 2MEDA 1RE2A 3LYOA 3QY4A 2IFFY 5C6JA 4H9FA 1GB9A 4XJHA 3TXDA 1IR8A 1B7LA 1LMAA 3CSRA 3RT5X 5LINA 1VAUA 2BLYA 4DD3A 4DC4A 1YKYX 3AW6A 4LFXA 4NG8A 4KL7A 4NFVA 4OWCA 1C43A 4DYGA 1LZ8A 208LA 4NGLA 1OUGA 1YAQA 1GBSA 1WTMA 1IP2A 1FLWA 3QNGA 1IWVA 5B1GA 3TMXA 3K3TA 1LJEA 1BB7A 1O23A 1GFGA 2I6ZA 4HV1A 1I1ZA 1QSAA 4LYMA 4KXIA 1A4VA 2W1MA 4NSHA 1VDQA 5KXTA 4N5RA 1GBOA 3A96A 2FYDA 1LJKA 4W94A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L30A 3FE0A 1LZBA 1C46A 1IWXA 1L48A 5FCPA 1UA6Y 1OVJA 1L31A 2LYMA 1V7SA 2HUBA 1F6SA 3HTGA 4Z46A 3TXIA 1DQJC 3HBDA 1CTWA 5EBHA 2ZIJA 2LZMA 3V2YA 1YAPA 1L59A 5E4PA 1L81A 2Y8PA 169LA 4ZIXA 2B73A 4PPOA 1DYAA 3A3QA 3D4SA 1QQYA 1GFEA 3D9AC 234LA 2W1YA 2LYZA 4H8XA 1SWYA 2B6YA 3P68A 1C6BA 1LSFA 1YKZX 5FHWA 5LA8A 1LZ6A 4NEBA 1CJ8A 2Z18A 1OV5A 2HTXA 1GPQC 3WL2A 4MR1A 1KY0A 3AGGG 3B0KA 1VATA 1LYGA 1C68A 1C69A 1KIPC 5DM9A 4B0DA 4GLAA 3AW7A 1IP7A 1JTMA 153LA 1D3FA 3HTBA 1L0JA 4ET8A 167LA 3PDSA 3C83A 1IP5A 5F14A 1D3NA 5FDJA 1LSAA 4TSCA 3A8ZA 4ZFPA 4WM5A 3C8SA 4GBRB 1IWUA 2RBPA 4Z41A 4WL6A 1L97A 1L28A 2NTGA 1TCYA 1LGUA 221LA 4H9IA 1LWGA 1LZ4A 1L16A 1HC0A 4M6DA 3N9AA 1B7MA 171LA 3SB8A 1C6AA 5LZMA 1TAYA 1XEIA 1L24A 1BWIA 2O7AA 218LA 188LA 2Z2EA 3OE0A 1LSNA 3SN6R 1C6NA 1FLQA 1LSZA 1RFPA 3CB7A 1PQDA 4NGZA 3WUNA 1XFPL 1D6PA 4MSTA 1LJFA 1T8GA 3GUNA 1C7PA 5I14A 3CT1A 4WLXA 2D4IA 3AZ6A 3CQLA 4BAFA 1T3PA 3NY9A 4W53A 1IOCA 1OWZA 1D3MA 2NTHA 1L25A 4BS7A 166LA 143LA 2YBIA 2RB0X 1CJ7A 3TMUA 2BQJA 132LA 1KW5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1IIZ A;  1KIQ C;  3FE0 A;  1LZB A;  4LFP A;  1C46 A;  1RJC B;  1IWX A;  5FCP A;  3T6U A;  2DQD Y;  1UA6 Y;  1B7N A;  1LMQ A;  4Z98 A;  1OUA A;  4H9B A;  1FBI X;  2HEA A;  1B7P A;  2LYM A;  4DD2 A;  1V7S A;  2EQL A;  2HUB A;  1F6S A;  5DLA A;  5F9X A;  4Z46 A;  2YSS C;  3TXI A;  1GB0 A;  2XTH A;  1DQJ C;  3A34 A;  3HBD A;  5KXX A;  1VDP A;  3QE8 A;  4RDS A;  5EBH A;  4CGE A;  1BB3 A;  1TBY A;  2ZIJ A;  2H9K A;  4H93 A;  1YAP A;  3AGI A;  4GN3 A;  1HMK A;  4UWN A;  2D91 A;  2BLX A;  2HEB A;  5E4P A;  1AZF A;  1LYO A;  5F9U A;  134L A;  2Y8P A;  4B1A A;  1J1P Y;  5ILF A;  1LZE A;  1GBY A;  4ZIX A;  2Z39 A;  1LZD A;  1LJI A;  4IAS A;  4PPO A;  3E3D A;  4WG7 A;  1LSD A;  3A6C Y;  3A3Q A;  4GN4 A;  1GB3 A;  1QQY A;  3G3A B;  1GFE A;  4NG1 A;  3D9A C;  4XYY A;  2W1Y A;  2MEH A;  4WM3 A;  2LYZ A;  4H8X A;  5HNL A;  3P68 A;  5LVK A;  4CHX A;  1FDL Y;  4TX7 A;  3W6B A;  1JIY A;  4GLV A;  1LSF A;  1IC7 Y;  1YKZ X;  5FHW A;  5LA8 A;  1LZ6 A;  1IP1 A;  3WXU A;  4NEB A;  4WM2 A;  1CJ8 A;  2YDG A;  2Z18 A; 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 5KY1 A;  1REX A;  3WU8 A;  1HF4 A;  1OUE A;  1W6Z A;  2BQB A;  2IHL A;  5LA5 A;  2LZT A;  3LYT A;  9LYZ A;  1HER A;  1V7T A;  2MEG A;  3N9E A;  4HTN A;  4W96 A;  3A91 A;  3TXK A;  5KXW A;  2CGI A;  1BHZ A;  1BVK C;  1GE4 A;  4OWH A;  3N9C A;  2HED A;  5C6I A;  4DDA A;  2HEE A;  1B7O A;  1LTM A;  3WVX A;  1HEN A;  1LKR A;  1LSB A;  1GEV A;  4LT1 A;  5APF A;  3WH1 A;  2BQG A;  1QTE A;  1LMC A;  4U3X B;  1QIO A;  3WXT A;  4TTD A;  1G7I C;  5A3Z A;  1D0L A;  4E3U A;  1HEM A;  2FBD A;  4CFP A;  1JSF A;  3P65 A;  1Z55 A;  4H9H A;  1FN5 A;  4LZT A;  1H6M A;  3EO5 A;  5LVI A;  4DDB A;  4NGO A;  2FBB A;  3A67 Y;  1YL1 X;  4NGV A;  3W6E A;  3RZ4 A;  1IWZ A;  2MEI A;  1GBZ A;  3BKH A;  3EMS A;  4EMN A;  3AZ7 A;  4ETA A;  1LHH A;  4ZEE A;  5LVJ A;  133L A;  2MED A;  1RE2 A;  3LYO A;  3QY4 A;  2IFF Y;  5C6J A;  4H9F A;  1GB9 A;  4XJH A;  3TXD A;  1IR8 A;  1B7L A;  1LMA A;  3CSR A;  3RT5 X;  5LIN A;  1VAU A;  2BLY A;  4DD3 A;  4DC4 A;  1YKY X;  3AW6 A;  4LFX A;  4NG8 A;  4KL7 A;  4NFV A;  4OWC A;  1C43 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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