1BWIA

The 1.8 a structure of microbatch oil drop grown tetragonal hen egg white lysozyme
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Bound-solvent structures for microgravity-, ground control-, gel- and microbatch-grown hen egg-white lysozyme crystals at 1.8 A resolution.
pubmed doi rcsb
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1998-09-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1bwiA00
1LSZA 4AXTA 4NGLA 2BPUA 3WPKA 3TXGA 4H93A 1JWRA 5LAGA 2Z38A 5KXOA 1HFXA 2ZIKA 4UWUA 4IJ4A 2HTXA 1LZGA 4WM5A 1XEKA 1JJ0A 2BLYA 4PRUA 2MEEA 1IEEA 1GBWA 5ILFA 5I54A 207LA 2A7DA 2Q0MX 208LA 1OUJA 4GCFA 1BB5A 4P2EA 2ZIJA 3GXRA 3ULRA 2XJWA 2ZWBA 1GE0A 5LYTA 1KXYA 5KXRA 1V7TA 1GFHA 1RCMA 133LA 1GF6A 1YAOA 3AZ7A 5LA8A 2LZ2A 1DPWA 1GBZA 4J0LA 1CKDA 1LSEA 2BQJA 3EXDA 1F6SA 5LVKA 3A94A 1AKIA 5LVIA 1NDGC 1XGQC 1LCNA 4Z46A 1YIKA 6LYZA 1D9UA 2HU3A 3CSQA 1WQMA 4MCKA 5DN4A 4A7DA 4Z3MA 1BB4A 3HBEX 3WW6A 1QIOA 4GN3A 2DQEY 4I0CA 1LMPA 1BHZA 1LSMA 4HPIA 4I8SA 1LJFA 5DL9A 4B4JA 2BQKA 2BQHA 3LZTA 4XYYA 4H9HA 5IHGA 5F16A 5LVHA 1BQLY 4W96A 1OP9B 1HENA 1J1PY 1BWJA 5KY1A 1XFPL 4ETDA 3A93A 4GCEA 5APDA 1FDLY 1EQ4A 5KKJA 4CGEA 1H87A 2D4IA 3P68A 4GCBA 4DC4A 4LT2A 1YILA 1REYA 1O23A 1LZ1A 1LZDA 1YL0X 1JKDA 4N0JA 5KXYA 5B06A 2ZYCA 1YQVY 2MEGA 2EIZC 1B7LA 4MSTA 4OWBA 4WM1A 2IFFY 4PPOA 1CJ7A 3QE8A 3EMSA 1UC0A 1B5VA 4H9FA 1LJJA 1YKZX 5II3A 2DQJY 2DQHY 3G3AB 4LGKA 2B5ZA 3KAMA 193LA 4PRQA 1DQJC 1KXXA 4WM3A 2MEAA 3J4GA 2Y8PA 5F14A 4Z98A 5KXPA 1IWYA 3TMVA 5C6LA 4YOPA 3FE0A 3AZ5A 5HMVA 1KIQC 5HNLA 1IOCA 1KIRC 4NHPA 3TMWA 4H92A 1QSAA 1GWDA 1UIAA 1V7SA 1UIEA 4XJBA 1UIDA 4IASA 1EQEA 4PHIA 1IP4A 4NGWA 5LXWA 1LZTA 2BQFA 4OWHA 5KXNA 4NHSA 4DDAA 2BAAA 2CDSA 2DQCY 5L9JA 1GB8A 3HFMY 3LHMA 4GCCA 5LINA 1LZRA 1N4FA 1NDMC 4H90A 1GD6A 4DD9A 3CSRA 2PC2A 1LHIA 4DT3A 1IWUA 3A3QA 4YF2A 1B5UA 4CHXA 1LHLA 2I25L 1CJ6A 3N9EA 3ZVQB 4Z41A 5LYMA 5F9XA 1JHLA 1HEMA 1GAYA 4NEBA 5HLLA 4MR1A 3B0OA 1F6RA 2C8PA 2LZTA 1T6VL 3P65A 4PGJB 4TUNA 1IVMA 1NWGA 2YBHA 1FBIX 3D9AC 4G9SA 1LSNA 7LYZA 1DKJA 2ZQ4A 1JSFA 4HPEA 1LJEA 1UCOA 2DQAA 1RJCB 1GPQC 1NF5A 3HBHA 1IIZA 1C10A 1GB2A 4WMGA 1LZAA 4H9BA 3A6BY 3W6FA 1TAYA 1W08A 3A92A 1GHLA 1UUZC 1I1ZA 1UACY 5I4YA 2BQDA 4KT3A 1IP2A 5KXWA 2HEAA 4NGIA 4TWSA 4XJFA 1GFAA 1CKFA 4H9AA 2LYMA 4BADA 5L3HA 3QNGA 1YANA 1LSGA 4LFXA 1LTMA 1KXWA 3TXIA 4HTQA 1IOSA 3WU8A 5APCA 1XGUC 1UIFA 3GXKA 4HJYA 4O34A 1IR9A 1EQ5A 2G4QA 2XTHA 3FI7A 1UBZA 5HMJA 1LZ5A 1GF8A 3A6CY 4GLVA 5KXKA 1CJ9A 1IC4Y 1LSBA 1HMKA 2HEBA 1IWVA 1C46A 3B0KA 3WU7A 1WTMA 1XGPC 1REXA 1VEDA 4ML7A 8LYZA 5FCPA 2HEDA 132LA 1HNLA 5HQ1A 3A90A 2XBSA 1GFEA 1DI3A 4NGJA 1QDTA 2YDGA 1B0DA 4UWVA 4ANRA 4J7VA 4M4OA 1LSFA 194LA 1B7OA 1C7PA 1UIHA 1VFBC 2BQMA 1JISA 3CQLA 4N8ZA 4RLMA 1GDWA 4ZFPA 1LAAA 4NG8A 1WQQA 1DZBX 4GLAA 3AZ4A 4LYOA 4N1CC 2FBBA 4TSBA 5FDJA 4ETEA 1GEZA 1SQ2L 4HSFA 3TMUA 3WH1A 4WO6A 4ETCA 4N5RA 2W1XA 2X0AA 3N9CA 1LHJA 4EMNA 5A3ZA 4W94A 1RI8B 4NG1A 1GB3A 3LN2A 4WM4A 1GB5A 1UICA 1WQNA 4YEMA 2ZILA 1OUAA 1J1OY 1LMTA 1ZVYB 2FYDA 3AGGG 4XENA 3WUMA 4YM8A 3WPJA 3A67Y 4HJVA 4GN5C 4XJGA 4XJIA 1GB0A 4H9IA 1F10A 2HEFA 4XJDA 5JENB 1QTEA 1JIYA 1LZ4A 1DKKA 1H6MA 2W1YA 1A4VA 1RFPA 5EBHA 1DI5A 135LA 4OOTA 1IX0A 1CKCA 1F0WA 3B72A 4DYGA 4HTKA 5LA5A 1B9OA 4NHIA 1D6QA 4LYMA 1AT5A 1HERA 1HSWA 4NGYA 1G7MC 2YVBA 1YKXX 3AJNA 1B7SA 4NHTA 1YKYX 5LYZA 4NSGA 1IR8A 4B4EA 1C08C 1QUTA 2Z12A 2YBMA 1LJHA 3ZEKA 1HFZA 1GBYA 4D9ZA 2CWIA 1JJ3A 4DDCA 4OWAA 2BLXA 1LHHA 1LZ6A 3WMKA 1LYZA 4NY5A 4QEQA 4H91A 1NKHA 2ZYPA 4NGKA 2BQCA 4ET9A 3AW6A 4B0DA 1JSEA 6LYTA 1D0MA 2FBDA 1B2KA 4RLNA 2MEDA 1OUGA 1G7JC 1OUIA 2I26L 1GE2A 1WTNA 3CSZA 2RSCA 4H94A 4NSIA 1GFJA 1VDSA 2IHLA 1C45A 3P66A 5APFA 2YBNA 4OW1A 1OUHA 5KXXA 3RW8A 2A7FA 1LJ3A 1D0KA 3RZ4A 5KXSA 1BGIA 4FJRA 2DQIY 4ETAA 4LT3A 1GFTA 5FHWA 1JKAA 1ZMYL 1JEFA 2BQNA 4NGVA 4QDNA 1UA6Y 1HEQA 1WQOA 1AT6A 1FLUA 1LKRA 1WQRA 4HJZA 2LHMA 3WUAA 1T3PA 1JKBA 3W6EA 1WQPA 3AGHA 4TSCA 4BAFA 4H8ZA 5LAFA 4TTDA 1LOZA 1OUEA 4BS7A 1JUGA 5AMYA 4NGZA 5LVJA 2HEEA 4ET8A 5A3EA 3BKVA 4N1EI 1LYOA 1WVUA 4KXIA 1HELA 3WXUA 3OK0A 4NWEA 4C5FA 4LYZA 1GE1A 1IY3A 5C6IA 5B1FA 1LZCA 1VATA 1A2YC 2CJLA 2H5ZA 1FKQA 2BQEA 2VB1A 1HEOA 3W6AA 1TDYA 3LYMA 2Z39A 3MGWA 2MEHA 3TXBA 1J1XY 4YEOA 1LZYA 3AGIA 3W6BA 3TXKA 1UIBA 4WL7A 1G7IC 2DQDY 2HECA 3TXFA 3AZ6A 4WOAA 1GFUA 4B49A 1SLYA 4YENA 4B1AA 3TXHA 2MEIA 1JJ1A 3P64A 2NWDX 3CT5A 2BQAA 1LZEA 1ZVHL 4LYTA 5K7OA 4DD3A 3LYTA 1GEVA 4RW2A 3B6LA 134LA 2H9KA 1XEIA 5DM9A 1LPIA 3RU5A 5J7CA 2Z2EA 4R6CA 3B0IA 1GB9A 4NIJA 4G4CA 4RW1A 1LMNA 4WL6A 1GDXA 3G3BB 1MELL 1GXXA 1GF5A 3WU9A 1TCYA 1IWXA 4BAPA 1BWHA 1FN5A 1GB6A 1IP5A 1GF4A 1OQMA 4GN4A 4L41A 1BWIA 1B7NA 1FLQA 1VDPA 1Z55A 1GFVA 5B59A 3CB7A 1ZV5L 1LKSA 4M6DA 4G49A 154LA 2D6BA 2BQBA 5KXTA 4TX7A 2YBIA 5E4PA 5LIOA 4QGZA 4DD2A 1FLYA 4II8A 4NGOA 4WM2A 3RT5X 1FLWA 1LZSA 5B07A 3AYQA 4LT0A 5I53A 1GAZA 1TEWA 4H8XA 5FSTA 1HMLA 4DD7A 5DLAA 2GV0A 1LJGA 1GF3A 5D5CA 4NSJA 1IWZA 3W6DA 2ZQ3A 4R0FA 2HUBA 4FDYA 1BB3A 1IC5Y 1JPOA 1REMA 4LT1A 1LZNA 4AGAA 1D0LA 1JITA 1LJKA 1YROA 1IP3A 3J6KA 3LZ2A 1IWWA 4NSHA 2BQGA 1NBZC 1LYSA 2Z19A 2EPEA 2MECA 1OUFA 2HU1A 2D4KA 2CGIA 1QQYA 1XEJA 4ZIXA 1NBYC 1C43A 1P2CC 1YAMA 1JKCA 5F81A 4DD0A 1GXV2 2MEFA 1XGTC 1IY4A 1TBYA 2MEBA 4KPMA 1AM7A 1CJ8A 1UIGA 4NFVA 1LJNA 3A96A 2W1MA 1LHMA 3T36A 5HNCA 4XN6A 1CKGA 5C6JA 4NWHA 2Z2FA 3HBDA 3OJPA 3WW5A 1JTOL 3D3DA 4WLXA 3VWOA 5I4XA 2C8OA 1LMAA 1LZBA 3QY4A 1RE2A 4H9CA 2DQGY 4WLDA 1HFYA 2D91A 1LJIA 5KXZA 2W1LA 5IDDA 1GBSA 4PJ2C 4N9RA 1E8LA 1LYYA 9LYZA 3BKHA 1ALCA 4J1AA 4H1PA 4OWEA 1BB6A 3E3DA 3WULA 1VAUA 2F30A 5E9RA 1GFRA 1B7PA 1HEPA 3T6UA 1LSCA 2FYCA 2EQLA 3TXEA 1IP1A 1B5WA 2YBLA 3LYZA 5APEA 1B5YA 1IOQA 4OWCA 2AUBA 1CKHA 4WG1A 3CT1A 4IATA 4X3BA 1QUSA 4H8YA 4LYBA 5F9UA 4WLTA 3W3EA 1INUA 1OUDA 5ILCA 2XBRA 2DQFC 1QSWA 4CFOA 4WLYA 2LYOA 1IR7A 2I6ZA 3IJVA 4WO9A 4DD1A 2ZNWY 1DI4A 1OUBA 1I56A 1NMMA 4RDSA 2DBTA 4DDBA 3WYHA 1GE3A 3N9AA 4LYCA 3WUNA 5D5FA 3WVYA 1GFKA 3W6CA 4HV1A 3ZVQA 2BQOA 5LVGA 1LMQA 1G7HC 5KKIA 3WXTA 3AB6A 5IELA 5I5QA 4LFPA 5M1YA 5T3FA 1YAPA 2YSSC 1D6PA 1JTTL 3A34A 1NHEA 4GCDA 1IP7A 3WPLA 1GFGA 1LZ9A 3RNXA 1LHKA 1LJ4A 1LZ8A 1VDTA 1IOTA 4LZTA 4WG7A 5B1GA 4ETBA 1FKVA 3AW7A 1IORA 1DXJA 1LMCA 5KXLA 3M3UA 3EO5A 3ATOA 4C3WA 1B5ZA 3SP3A 5L3IA 3WVXA 1EL1A 1IO5A 3A8ZA 1BVXA 1QDRA 4E3UA 4EOFA 1WVVA 1B7RA 1B7MA 1KIPC 3WL2A 1GF0A 1GBOA 2DKVA 3P4ZA 5DN5A 1B7QA 1PS5A 1HSXA 5FELA 1VDQA 1NQIA 2F4GA 2G4NA 3TXDA 2H9JA 1LSDA 3EBAB 5KXMA 4XJHA 1CNSA 1G7LC 1QTKA 1AZFA 1DPXA 1REZA 4U3XB 1OUCA 4HTNA 3F6ZA 2BQIA 2Z37A 1XSFA 4KL7A 1HC0A 4XADA 2G4PA 1GB7A 4WM6A 4QY9A 3M18B 2Z18A 4NHQA 4HP0A 1IWTA 1LSPA 5KJ9A 1YL1X 3IJUA 1I20A 2BQLA 1B5XA 1XGRC 1JTPL 1W6ZA 4G4HA 1IC7Y 1GE4A 2EKSC 2F2NA 3A91A 3TXJA 1HEWA 1HF4A 4OOOA 3ATNA 2WARA 1IP6A 5I4WA 1LSAA 1BB7A 3LYOA 4HV2A 3TMXA 1YAQA 3IWRA 153LA 4G4BA 1BVKC 4DWXA 1GBXA 1GF7A 4H9EA 4UWNA 4J1BA 5B05A 5FEKA 3K3TA 2F4AA 1MLCE 1GF9A 2N5ZA 3A95A 1HHLA 4B4IA 4ZEEA 1LMOA 4CJ2A 2YBJA 4CFPA 3CT0A 2ZNXY 3A3RX 1PZYA 2LYZA 1LSYA 2D4JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LSZA 3G3VA 4NGLA 2BPUA 3WPKA 3TXGA 1HFXA 4IJ4A 2HTXA 1JJ0A 2BLYA 1LGUA 1GBWA 1LI3A 4I7SA 5KXRA 161LA 133LA 227LA 3C7ZA 4I7MA 1GBZA 1PQDA 1C6JA 103LA 3HU9A 1NDGC 1LCNA 1YIKA 2OTYX 4MCKA 104LA 1BB4A 3WW6A 1QIOA 4GN3A 2DQEY 4I0CA 4HPIA 2BQKA 2BQHA 253LA 4W96A 141LA 1J1PY 5KY1A 4ETDA 1L86A 5APDA 1H87A 2D4IA 4LT2A 158LA 1O23A 1LZDA 4LDEA 2OU8A 3SBAA 3HTGA 2EIZC 4WM1A 4OWBA 3EMSA 1L01A 1KNIA 1B5VA 2B6YA 1YKZX 5II3A 2DQJY 4PJZA 1LYEA 1C6IA 2B75A 1L80A 1QTBA 2MEAA 5KXPA 1IWYA 3FE0A 122LA 1IOCA 2Z6BA 3TMWA 238LA 1L12A 4H92A 1QSAA 1UIAA 1G07A 1UIEA 4IASA 1L59A 1KW7A 213LA 1L33A 1GB8A 3LHMA 1LZRA 4EKSA 4H90A 4DD9A 1CV5A 3A3QA 157LA 4CHXA 4Z41A 1JHLA 4W53A 4MR1A 1F6RA 2YBHA 1LSNA 1UCOA 257LA 3HBHA 1LZAA 164LA 4H9BA 1L73A 1L92A 1TAYA 2L78A 201LA 4ARMB 1I1ZA 2BQDA 1IP2A 212LA 5KXWA 2HEAA 4NGIA 4TWSA 4H9AA 3HH5A 1CU6A 1KXWA 3WU8A 5APCA 1UIFA 4HJYA 142LA 1IR9A 1D2WA 2G4QA 4ARJA 1UBZA 3A6CY 1C6CA 2HEBA 1XGPC 8LYZA 2HEDA 147LA 1GFEA 4ANRA 1QDTA 1LSFA 194LA 1B7OA 4N8ZA 1JISA 4NG8A 4LYOA 3JR6A 1GEZA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1LSZ A;  4AXT A;  4NGL A;  2BPU A;  3WPK A;  3TXG A;  4H93 A;  1JWR A;  5LAG A;  2Z38 A;  5KXO A;  1HFX A;  2ZIK A;  4UWU A;  4IJ4 A;  2HTX A;  1LZG A;  4WM5 A;  1XEK A;  1JJ0 A;  2BLY A;  4PRU A;  2MEE A;  1IEE A;  1GBW A;  5ILF A;  5I54 A;  207L A;  2A7D A;  2Q0M X;  208L A;  1OUJ A;  4GCF A;  1BB5 A;  4P2E A;  2ZIJ A;  3GXR A;  3ULR A;  2XJW A;  2ZWB A;  1GE0 A;  5LYT A;  1KXY A;  5KXR A;  1V7T A;  1GFH A;  1RCM A;  133L A;  1GF6 A;  1YAO A;  3AZ7 A;  5LA8 A;  2LZ2 A;  1DPW A;  1GBZ A;  4J0L A;  1CKD A;  1LSE A;  2BQJ A;  3EXD A;  1F6S A;  5LVK A;  3A94 A;  1AKI A;  5LVI A;  1NDG C;  1XGQ C;  1LCN A;  4Z46 A;  1YIK A;  6LYZ A;  1D9U A;  2HU3 A;  3CSQ A;  1WQM A;  4MCK A;  5DN4 A;  4A7D A;  4Z3M A;  1BB4 A;  3HBE X;  3WW6 A;  1QIO A;  4GN3 A;  2DQE Y;  4I0C A;  1LMP A;  1BHZ A;  1LSM A;  4HPI A;  4I8S A;  1LJF A;  5DL9 A;  4B4J A;  2BQK A;  2BQH A;  3LZT A;  4XYY A;  4H9H A;  5IHG A;  5F16 A;  5LVH A;  1BQL Y;  4W96 A;  1OP9 B;  1HEN A;  1J1P Y;  1BWJ A;  5KY1 A;  1XFP L;  4ETD A;  3A93 A; 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 1NHE A;  4GCD A;  1IP7 A;  3WPL A;  1GFG A;  1LZ9 A;  3RNX A;  1LHK A;  1LJ4 A;  1LZ8 A;  1VDT A;  1IOT A;  4LZT A;  4WG7 A;  5B1G A;  4ETB A;  1FKV A;  3AW7 A;  1IOR A;  1DXJ A;  1LMC A;  5KXL A;  3M3U A;  3EO5 A;  3ATO A;  4C3W A;  1B5Z A;  3SP3 A;  5L3I A;  3WVX A;  1EL1 A;  1IO5 A;  3A8Z A;  1BVX A;  1QDR A;  4E3U A;  4EOF A;  1WVV A;  1B7R A;  1B7M A;  1KIP C;  3WL2 A;  1GF0 A;  1GBO A;  2DKV A;  3P4Z A;  5DN5 A;  1B7Q A;  1PS5 A;  1HSX A;  5FEL A;  1VDQ A;  1NQI A;  2F4G A;  2G4N A;  3TXD A;  2H9J A;  1LSD A;  3EBA B;  5KXM A;  4XJH A;  1CNS A;  1G7L C;  1QTK A;  1AZF A;  1DPX A;  1REZ A;  4U3X B;  1OUC A;  4HTN A;  3F6Z A;  2BQI A;  2Z37 A;  1XSF A;  4KL7 A;  1HC0 A;  4XAD A;  2G4P A;  1GB7 A;  4WM6 A;  4QY9 A;  3M18 B;  2Z18 A;  4NHQ A;  4HP0 A;  1IWT A;  1LSP A;  5KJ9 A;  1YL1 X;  3IJU A;  1I20 A;  2BQL A;  1B5X A;  1XGR C;  1JTP L;  1W6Z A;  4G4H A;  1IC7 Y;  1GE4 A;  2EKS C;  2F2N A;  3A91 A;  3TXJ A;  1HEW A;  1HF4 A;  4OOO A;  3ATN A;  2WAR A;  1IP6 A;  5I4W A;  1LSA A;  1BB7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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