1C0GA

Crystal structure of 1:1 complex between gelsolin segment 1 and a dictyostelium/tetrahymena chimera actin (mutant 228: q228k/t229a/a230y/e360h)
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
375
structure length
367
Chain Sequence
DGEDVQALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHTGKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYMMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLAYVALDFEAEMKAYASSSALEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESAGIHETTYNSIMKCDVDIRKDLYGNVVLSGGTTMFPGIADRMNKELTALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKHEYDESGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the higher Ca(2+)-activation of the regulated actin-activated myosin ATPase observed with Dictyostelium/Tetrahymena actin chimeras.
pubmed doi rcsb
molecule tags Contractile protein
source organism Homo sapiens
molecule keywords PROTEIN (GELSOLIN SEGMENT 1)
total genus 120
structure length 367
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0gA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1c0gA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1c0gA03
4EAHD 2QWRA 2P9SA 1KAYA 1ATSA 2E20A 1R59O 2CH5A 2EWSA 3CQXA 5EXWA 4HTLA 4BR5A 1GLDG 2QXLA 1T44A 2QWOA 3AY9A 1ZBSA 4BRFA 4K25A 2Q2RA 4MO4A 3EO3A 2BTFA 4FL9A 4LC9B 4BREA 5BN8A 3H1VX 4BROA 5EVZA 3L4IA 4H0TB 4WQ5A 3RSEB 1HKCA 4WQ5C 3C7NB 2QM1A 4B1YB 3HI0A 5AQWA 3VF4A 3AAPA 2QWPA 4Y0WA 5TKYA 4CD1A 2P9KB 4A2AA 4BR7A 4F9OA 4BVOA 1NGGA 3GE1A 3ZX2A 5KPTA 5AQLA 3VEXA 4BR4A 3VEOA 1Q18A 2E2PA 2ITMA 3ZETB 1BDGA 2FLOA 3WQUA 2GWJA 1YUWA 3H6EA 2IVPA 5AQPA 1SAZA 1HLUA 4Z94A 5AFUH 2ZGZA 1IG8A 5EY4A 2Q31A 1GLLO 3DJCA 3ENOA 2D0OA 4BC3A 4PKIA 2GWKA 3CHWA 2P9IA 1JCGA 2FF3B 3TU5A 2W41A 3FLCO 2IVOA 5BR9A 2W40A 2Q36A 2QWQA 4CBXA 4PKHA 3O6WA 2AP1A 5FPMA 4H0PA 2VYPA 4BRCA 1BUPA 3TPQA 3ULEB 2QW9A 3WXJA 1RDWX 2H3GX 2PAVA 4K41A 2P9PB 1QZ6A 2D4WA 4MO5A 5AQMA 1C0FA 2A5XA 2VCPA 2P9SB 1Y64A 2A6AA 3AARA 1XC3A 3QFPA 3O1BA 2FXUA 3WQTA 3O4WA 3JS6A 2P9NA 4FWPA 3EZWA 4EIAA 1DKGD 3QMLA 4CZIA 1MDUB 3VOVA 4ISEA 1NWKA 2IIRA 4FOEA 4NO7A 1Z05A 4BC2A 3D2FA 3A8YA 3B8AX 4MLEA 1MWMA 1XUPO 5AQHA 1NGCA 4PL8A 5LJWA 1NGHA 3CQYA 3R6MA 2FSNA 2CH6A 4YDUA 3VETA 1LOTB 3VESA 4EHUA 1G99A 4WYBA 1U2VA 1E4FT 2P9UA 3I33A 4FWSA 2WUSA 4FWMA 3ZX0A 1OKJA 4DHYA 2VWBA 3VEZA 5EOYA 4BGAA 3FZHA 3EKUA 3IFRA 4FPBA 3U9ZA 4QS8A 3H3OB 1X9JA 4JD2A 3EKSA 3QBWA 4BRPA 3JXUA 1EQYA 2P9IB 2KHOA 3M6GA 4FOIA 4BR2A 3HM8A 2GUPA 4DB3A 1NGFA 5AQIA 3FFKB 3VERA 3ZX3A 1E4GT 1GLAG 3ATUA 3VF6A 4IWVA 4C23A 5AQQA 3FR0A 3GBTA 3QFUA 1YAGA 2AA4A 3FZKA 4BRHA 4CZGA 4A61A 3A5MC 4BRNA 4H03B 1BA0A 2V7ZA 4RCHA 3WXLA 3WT0A 4BR9A 4H5RA 2E2OA 4J8FA 2BUPA 4GY2B 4M63C 3S41A 3FZMA 4CI6A 2P9NB 1P8ZA 2A3ZA 3FGUA 3MMVA 3O5BA 5AQZA 5E84A 1ZC6A 1KAXA 3CI5A 3IMXA 3J8AA 3D2EA 1KXPA 3CJ7A 3H1QA 1HJOA 3CJ9A 4QS7A 3AAQA 4BRGA 2E1YA 1T6DA 3D2FB 4FWQA 4HWIA 4JHDB 4CZEA 4CBUA 2P9LA 2Q1NA 5AZIA 4AM6A 4CZFA 4H0XB 4CJ7A 3IUCA 1NLVA 1ATNA 3DXMB 2ASOA 4L3QA 5KQ8A 5FPNA 4H5NA 1U2VB 4EFHA 2P9UB 1J6ZA 5AQVA 1TUUA 5B8HA 3QB0A 5BREA 3ENHA 3A5LC 3KHYA 5KPZA 1MWKA 4FWKA 1JCEA 5AQRA 4QS9A 1QQMA 2E1ZA 1BOTO 3VEVA 2F9WA 3W0LA 4K43A 3MN5A 4JD2B 1HKGA 2ZWHA 2YJFA 5I9EB 4JAXA 5AQXA 3CIPA 3P4IA 5JLFA 2UYTA 1BO5O 5AQOA 4BG9A 1NGDA 3DXKA 1U6ZA 3U4LA 3QDKA 1HKBA 3ID8A 3LDQA 1GLJO 4H0VB 4BRMA 2CGLA 3LDNA 4BVPA 3G25A 2D0PA 1IJJA 4JNEA 4RTFD 4K42A 3SK3A 2YCHA 3VPZA 2ZGYA 5BPLA 5AQJA 1C0GA 3GOIA 1D4XA 2I7PA 3IDHA 4JHDA 2F9TA 5E26A 1BG3A 3LDOA 4XEIA 1YXQA 3D2EB 1ZXOA 3FZFA 5BRDA 5JMVA 4CBWA 2IVNA 3DXMA 4H5VA 2Q0RA 1GLEG 2HF4A 3A5NC 4B1ZA 5AZJA 2P9LB 5AZIB 1TYQA 2NZTA 3UKUA 1JCFA 3R8EA 5BRFA 1NGJA 1XQSC 5EX5A 3O80A 2E2QA 2GELA 2YHXA 3QBXA 4GNIA 5AQFA 4CZLA 4IXCA 3ZEUA 2ZF5O 5BPMA 4FPAA 3CJ1A 1K8KA 3L0QA 4O5FA 4BC4A 2E88A 3HTVA 4FWLA 1GLBG 3WUHA 5BPNA 3O8MA 3WXIA 2HMPA 4IZ9A 4XH5A 3VEWA 3LDPA 5F1XA 4BRDA 2V7YA 1X3NA 3W3DA 3SLCA 4H5WA 1YVNA 3O08A 4FO0A 3MCPA 5F2RA 4B1VA 1DGKN 5CE3A 3H3NO 2D1KA 3DXKB 4DCHA 3ATVA 1DEJA 3VGLA 4FWNA 1RFQA 4CZMA 3F9MA 3VGMA 1GLCG 4BRIA 5JLHA 3SJHA 5LY3A 3A0IX 5LJVA 4BRLA 1T6CA 4FWRA 1WUAA 1NGAA 4WQ4A 4BRKA 4E1JA 1V4TA 4WQ4C 3BF3A 5ADXA 3O1WA 1CZAN 2GEMA 3WXKA 4B9QA 3H46O 3BUZB 3UKRB 3U8XA 4IJAA 3WEEA 1HX1A 3VEYA 5BRHA 4RWTA 4BRAA 4XH1A 4FSVA 2CGJA 1KAZA 5ADXH 2J4RA 3SMPA 5AQSA 1NMDA 2V51B 1NGIA 3BP8A 1H1VA 3VF2A 5AZJB 2A41A 4KBOA 3M3ZA 1TYQB 3UKUB 4IO8A 4BQZA 1S22A 2YJEA 4B1WB 4BRQA 2FSKA 3VGKA 1HPMA 3OHRA 2DPNA 2PBDA 5KPRA 2YHYA 5FPDA 1Z6RA 3BEXA 5AFUA 4H5TA 4FWOA 3ZEUB 2E8AA 4M7XA 1K8KB 3CETA 3HBTA 4EHTA 5AQYA 2QWLA 3MN9A 4BR0A 1ATRA 3KZBA 3M1FA 3H45C 3SMSA 5KQDA 1BU6O 2GTDA 3DAWA 1V4SA 4NB4A 4I6MB 3R9PA 3FE1A 3LM2A 5AQNA 1SQKA 4PKGA 2HOEA 2HF3A 3LL3A 3HSCA 1QHAA 3HZ6A 3KVGA 4A62A 4ISGA 1BWFO 1ESVA 2FF6A 4JN4A 2A42A 3CJAA 4B1UB 5FPEA 2YI1A 3GG4A 4A2BA 3UKRA 5JICA 3GDQA 1X3MA 2OANA 3CJCA 3LDLA 5BN9A 2CGKA 4IJNA 4BGBA 4PL7A 1HUXA 4BQLA 3RSEA 4AM7A 2YHWA 3EN9A 3CJBA 1LCUA 1BA1A 3C7NA 1QQOA 3DWLA 2I7NA 3FZLA 3L6QA 4CZKA 3MN6A 3A5OC 5AR0A 1SZ2A 3WEEB 2P9KA 1QZ5A 5AQUA 2QWMA 3I8BA 3MN7A 4CZHA 5AQGA 2ASPA 1NM1A 3C0BA 4ISFA 2E2NA 5ELZA 3ZETA 3LM9A 4MLHA 4H0YB 2NLXA 5AQTA 5AQKA 4YDUC 3MDQA 3BF1A 4H0OA 2Q0UA 4B1XB 3U9DA 1NBWA 1TUYA 4BC5A 4M7YA 4I6MA 4CZJA 1MA9B 5F0XA 4BG8A 2A40A 1QQNA 3GL1A 2ASMA 3QICA 3D7EO 4CD3A 2FSJA 1WOQA 2QWNA 3UE5A 3CERA 1NGBA 1S3XA 3ULEA 1GLFO 1RGIA 3UB5A 3EL2A 4O8KA 1NGEA 3VENA 4XH4A 4DQ8A 3MK6A 2Q97A 2P9PA 2V52B 2NRHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4K8XA 1N6QA 2QTDA 3LANA 2CH5A 4YNQA 1Q81O 4BR5A 3VQAA 2RF2A 3CC2N 3IAYA 1DTQA 3EO3A 2KLAA 5J2PA 1C1CA 4LC9B 3H1VX 2QI2A 1SKWA 4WQ5A 3RSEB 3J7AP 1RDBA 4DLGA 2QM1A 3CCSN 2QWPA 4CD1A 4F9OA 3MECA 1QSLA 1NGGA 1RCHA 4AHVA 3DLLL 3LDSA 4FJ7A 3ZETB 4KHQA 4BECA 3WQUA 3EE9A 1CZ9A 3TAGA 3H6EA 4DSIA 2DFFA 5AQPA 1SAZA 1QE1A 3DJCA 1XNQK 2E4LA 3OJUA 3TU5A 2W41A 4DV2K 5J2QA 4YOVA 5BR9A 2OZMA 2W00A 2Q36A 4C8OA 4KB0A 2QWQA 3OYLA 4DU3A 4LSNA 2DFHA 3DLEA 1BUPA 3HP6A 4DTMA 3TPQA 3AVKA 3ULEB 1RDWX 2IDOA 2WTUA 4K41A 2P9PB 1TKZA 2YX6A 5SWMA 1SL2A 1C0FA 2AJQA 2VGMA 3IKMA 3DRPA 1Y64A 3OYBA 2A6AA 4B3RK 1XC3A 3VQ7A 4EZ9A 3R3LA 3TABA 4M3WA 3QFPA 2PYJA 2NNWA 3O1BA 4DR5K 3WQTA 3O4WA 1J5OA 4DSEA 3AVJA 1RDUA 3CPWM 2WOMA 1CLQA 1MDUB 3VQEA 4NCGA 3O3GA 5A2QO 3B8AX 4MLEA 1XUPO 4PL8A 3R6MA 4YDUA 5HRPA 3RMBA 3PV8A 1VSKA 3VETA 3NCIA 2HHXA 3RMAA 1E4FT 2ATQA 2P9UA 3I33A 4BACA 5EU7A 3LAMA 1Q86O 4ELTA 4G1QA 1OKJA 3E9LA 5FRNA 4KHUA 4CIEA 3L2QA 3FZHA 4FPBA 2UU9K 1X9JA 4DTUA 3QBWA 3SQ4A 4E7IA 4MDBA 3JXUA 4ID1A 4BR2A 3HM8A 1VQMN 1NK6A 1JLFA 5AQIA 4JKHA 1E4GT 3DOKA 4ZHRA 1FKPA 4KO0A 3FZKA 4IEIA 3N4QA 5CHIA 2KW4A 3KD1E 4F3TA 1VQ6N 4BE1A 4H03B 1BA0A 2V7ZA 4DF4A 4Q5VA 5DMRA 3S3OA 5AJ3K 4BR9A 4H5RA 2XO7A 4CJQA 2BUPA 4CCHA 5KI6A 4C8LA 4JEPA 2HBLA 1S1XA 3FGUA 3O5BA 3PSIA 3O4NA 2Y1JA 3AA3A 3IMXA 3J8AA 4OVLA 1WBBA 3CJ7A 3H1QA 4CFAA 4QS7A 3AAQA 2E1YA 4I2PA 3L4QA 4CZEA 4CIFA 4CJ7A 3LP0A 3HVRA 1NLVA 2Z1IA 2ASOA 5KQ8A 5FPNA 4B3OA 4H5NA 1BQNA 4CHYA 3K59A 2P9UB 1J6ZA 3CYGA 1U04A 1IKXA 2HHQA 3AVMA 4JKCA 3OS2A 4QS9A 1QQMA 4CEEA 4GV3A 3VEVA 3DLRA 4K43A 3HPOA 1TKDA 2VG5A 1YVUA 2ZWHA 3HYFA 4B9TA 5AQXA 3P4IA 5JLFA 3PIOL 1VSFA 3U4LA 3F2KA 2ITGA 4OO1J 4X65K 4KFBA 1VQ9N 2KKZA 3O4QA 4NCAA 4FK0A 4CJEA 4BVPA 3NE6A 1EX4A 4K42A 1IV0A 3VPZA 2IAJA 4CW7B 3GOIA 1TAUA 1ASUA 3S3NA 3M8PA 2KZMA 2BANA 4AILC 4KREA 3CG7A 3NGZA 1CXUA 4JK9A 1ZXOA 4M3ZA 3FZFA 1L3SA 5JMVA 3RRHA 2IVNA 2HVIA 1WSGA 4Y1DA 3THYA 4FLXA 5HP1A 3V9XA 4DTRA 3AV9A 3R8EA 4W5RA 3BDPA 3DMJA 3O80A 4X64K 2E2QA 1C0TA 4GNIA 4CZLA 4CJWA 2ZF5O 4DFMA 1ILYA 1EKEA 2P5OA 1VQKN 2VGNA 4E7KA 5M1OA 1TKTA 5FRMA 4LF7K 3O8MA 2RPIA 3RR8A 1EWQA 1BCOA 3LDPA 5C42A 4BRDA 4I7FA 3KK1A 2YNFA 3SLCA 4Q0BA 4YOYA 4H5WA 4DU4A 4KHWA 1DGKN 3ULDA 5CE3A 2D1KA 3BZKA 3ATVA 3VGLA 1S72N 2JLEA 3K9KA 3NAEA 1RBRA 3NVMA 1VAZA 3F9MA 3K5LA 4BRIA 1BHLA 4KH6A 4BRLA 5DM6L 4MFBA 3K2PA 4W5OA 2B5JA 1NMNA 5ADXA 3O1WA 3K57A 4JRQA 3H46O 3BUZB 2HHUA 3UKRB 4GW6A 3EE8A 3VEYA 2G8WA 1S1WA 3T3FA 1YTUA 4XH1A 3HOSA 3IRXA 4FSVA 1KAZA 1YJWN 4YY3K 3LPTA 3TAMA 2OA8A 3C94A 4X66K 3BP8A 1WSEA 3NMUA 1WSFA 2YJEA 3O9SA 3VGKA 1X1PA 4FXDA 2YHYA 4UY8O 5C10A 4B9NA 3V1QA 4E7HA 3QEWA 4M7XA 4CJ3A 1J53A 5DM7L 2O8DB 4EHTA 1C1AA 4ID5A 3SUNA 3CCMN 1K73O 3M1FA 1Z25A 1BU6O 1V4SA 4NB4A 4IG0A 2OYQA 4E3SA 3R9PA 4Z4EA 3FE1A 3LM2A 1SQKA 4PKGA 3NGIA 2HOEA 1XNRK 1QHAA 4E89A 3MX5A 4BDYA 4JI1K 4A62A 4FJMA 4XIUA 4E7JA 4JN4A 2YI1A 1N33K 4CK3A 4AHSA 2O8BA 1QVFM 3WNFA 3MXJA 3OYAA 3NF9A 4F2SA 4BGBA 3HRGA 4C1NI 1YT3A 4PWDA 1A5XA 4FK4A 2YHWA 1LCUA 1BA1A 3C7NA 1QQOA 2BH1A 4CF8A 1U45A 3C6HA 1IKVA 4DS4A 1VSLA 1A5VA 3PX4A 4FJNA 1QQCA 4JI4K 2VQEK 3I8BA 1U48A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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