1C43A

Mutant human lysozyme with foreign n-terminal residues
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
MVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Effect of foreign N-terminal residues on the conformational stability of human lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (HUMAN LYSOZYME)
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-08-03
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1c43A00
2BQKA 1LSZA 2HEEA 1ALCA 3EBAB 1J1PY 2ZYCA 1QTKA 1JSFA 1GAZA 3F6ZA 1YL0X 4GCFA 4RW2A 4W96A 5E4PA 2BQAA 5C6IA 1GE2A 4LFPA 1B5WA 1LHJA 2HEDA 5F81A 3TXIA 3LYMA 4IASA 1B7PA 2F4AA 1JITA 1D0MA 4GN3A 5KXPA 4DD2A 2I26L 5KXRA 3LYTA 1B7RA 1LZRA 4ET8A 1LSBA 1FBIX 1I20A 3N9CA 1LJNA 1QQYA 1GBXA 1REXA 1C08C 2MEGA 2FBDA 1KIPC 1V7SA 2MEAA 3B6LA 1IVMA 2BQCA 3A6CY 5APEA 4DD0A 1DI5A 1QTEA 5E9RA 3A94A 3D3DA 4II8A 4G4HA 4LYTA 4M4OA 1YL1X 4RDSA 1OUBA 1ZVYB 2DQIY 4XENA 1IC5Y 4FDYA 4NY5A 1LZYA 4NHPA 4NSHA 4WL6A 1SLYA 1WQNA 4PPOA 3RW8A 4XJFA 2YBJA 1VAUA 1LHMA 1YILA 2G4NA 3A6BY 4CFPA 4DDAA 5A3EA 1FLWA 2DQHY 4H9CA 1YKYX 1IOTA 1UBZA 4OWBA 1UICA 4N8ZA 1EQ5A 4M6DA 4Z3MA 4Z46A 1IOQA 3WUNA 1D9UA 1B5VA 4QDNA 3KAMA 4WLTA 4XJIA 4GCEA 4XADA 4BADA 3TXGA 3QY4A 2XJWA 3J4GA 1IWTA 4ETCA 1EL1A 1VFBC 1NDGC 5LA8A 1EQ4A 2BQHA 1GF7A 5IDDA 4RLNA 2D91A 1LYSA 1LZNA 1JISA 1JJ3A 1OQMA 4WM6A 3RNXA 3TXJA 3T36A 4P2EA 4HPEA 4G4BA 4CFOA 4Z41A 1BB4A 5L3HA 4MCKA 193LA 3HBDA 3LYZA 2Z38A 5KXOA 2LYOA 1OUCA 5LINA 1CKCA 1F0WA 1GF5A 4Z98A 3W6FA 1AT5A 1CKGA 2Y8PA 2HECA 4ANRA 4DD3A 1TBYA 1WVUA 4LYCA 1LZSA 3TXBA 153LA 1YAQA 4NIJA 3WH1A 1UIAA 1B2KA 1HSWA 1NMMA 1INUA 1REMA 1TEWA 3AB6A 1B7OA 1GBYA 1DI4A 3WU9A 4E3UA 8LYZA 5I54A 4DDBA 3RU5A 4NG8A 1LYYA 5LYMA 3AJNA 4XJGA 1D0LA 1LPIA 1LZAA 1BWJA 1GDXA 1QSWA 3AGGG 4NSJA 1GFGA 4GCBA 2VB1A 1IWZA 1GF9A 4B4JA 1MLCE 1GE1A 1QUTA 4UWUA 1C46A 5J7CA 1LSGA 3IWRA 4GCCA 4LFXA 5HMVA 2RSCA 1NWGA 5C6JA 1IP5A 1XGQC 3AZ6A 2G4PA 2ZWBA 5KXMA 1LZ9A 3CB7A 1JTOL 5I53A 5D5CA 5AMYA 3CT5A 1I56A 1Z55A 1RE2A 4OWEA 5I4XA 2BQBA 1P2CC 3WPLA 4B49A 1FLQA 4L41A 5B06A 4YEOA 1CKHA 1OUAA 4H92A 5I5QA 5LVGA 3G3BB 3WUMA 4OWHA 2LHMA 3OJPA 4WLDA 1YQVY 1TCYA 1CJ9A 207LA 4C5FA 4NGLA 1G7IC 2EPEA 3ATOA 2HUBA 4DC4A 1B7SA 5FSTA 1GPQC 4ETDA 5ILCA 2BQMA 3N9AA 1REYA 1DKJA 2HU3A 3LHMA 4AXTA 4ZEEA 5HNCA 2EQLA 1GB8A 4PHIA 4YF2A 2ZNWY 1HEMA 4GLAA 3WYHA 4R0FA 2ZQ4A 4H9EA 1CJ8A 1EQEA 1IWVA 3A96A 1IOCA 4RW1A 1HC0A 1OUHA 1BHZA 1XGTC 1F10A 1LSCA 2DQGY 1OUIA 2IFFY 3D9AC 1GE3A 4EMNA 1AM7A 2EIZC 2H5ZA 3J6KA 3N9EA 4J7VA 4HSFA 3AZ4A 2XTHA 5LAFA 1LMCA 1GFEA 1HERA 4TWSA 4UWNA 3CQLA 4NHTA 5F9XA 4ETBA 1AZFA 1JEFA 3AZ7A 4C3WA 4HJZA 4U3XB 5FELA 5KXTA 1LJ4A 2Z37A 5DN5A 3EO5A 3GXRA 3MGWA 5KXYA 2D4IA 4YEMA 5LVHA 4N1EI 4G4CA 4W94A 2YVBA 1JPOA 5KXZA 2DQDY 1FKVA 3AGHA 4GLVA 5DLAA 1LSFA 1GE4A 5KJ9A 2MECA 3ZVQA 4HJVA 3WUAA 5KY1A 4FJRA 4J1AA 3LZ2A 2F4GA 4X3BA 2CJLA 2DQFC 3WULA 1FDLY 1NDMC 4QGZA 2A7FA 3W6CA 2BQDA 1UUZC 1KIQC 4HV1A 1H6MA 1JSEA 1UCOA 1UIHA 1QIOA 2LZ2A 2LYMA 4WLXA 1RI8B 3FI7A 1UC0A 1XEJA 4OOOA 4WOAA 3TXFA 1RFPA 3HBEX 5HNLA 2ZNXY 4H9HA 4HPIA 4NG1A 3W6EA 3WXTA 4DYGA 5F14A 3TMWA 2H9KA 4WL7A 1H87A 1HMKA 1HSXA 4TUNA 4LT2A 5IELA 4HTNA 1LKRA 3AW7A 4LT0A 4B4EA 4MR1A 5L9JA 3RZ4A 3W6BA 4XJDA 2MEHA 1JJ0A 1T3PA 1LZTA 4PGJB 4DD7A 4LYMA 5C6LA 5LAGA 1LMOA 3A34A 3A3RX 5FHWA 2ZIJA 1DZBX 2ZILA 1C7PA 1VEDA 5D5FA 1NBYC 2BQLA 1HEPA 1LMAA 1GXV2 1LJIA 2HEAA 3M18B 3P68A 2C8OA 4N9RA 2EKSC 1LJ3A 4BAPA 4DWXA 3T6UA 1GWDA 3CSRA 1IO5A 2DQJY 4WM1A 3W6AA 3WMKA 5HQ1A 1LZBA 1LCNA 2DKVA 2YBLA 1GF4A 5M1YA 1HHLA 1IP6A 2MEDA 4TTDA 3ATNA 1B7QA 1CJ7A 1IP2A 1GB2A 4WLYA 1OP9B 1VDSA 1UIEA 1LAAA 2YBMA 1B7LA 1YANA 4H8XA 133LA 1GFUA 3LZTA 1JTTL 3A90A 3WU8A 4DDCA 4R6CA 1QUSA 2DQEY 1ZVHL 2Q0MX 4NSGA 1GEZA 5B07A 1QDRA 1GFAA 4HP0A 1J1OY 3P4ZA 1GFHA 1YAOA 3WW6A 1XGRC 3SP3A 4CGEA 1IR7A 154LA 208LA 1B7MA 1VATA 4B4IA 5ILFA 1F6SA 1OUGA 1GFVA 4LGKA 2CWIA 2D4JA 4H9IA 3WW5A 1RCMA 1LSPA 4EOFA 3W6DA 1KXWA 3E3DA 4NGZA 1GBWA 1IP7A 1REZA 4H94A 1HMLA 1JUGA 3EMSA 2I25L 2HEBA 1GB3A 1IR9A 3ZEKA 3K3TA 5HLLA 1LZDA 3IJUA 5LYTA 4UWVA 3WL2A 1LZ6A 4YOPA 5APFA 3TMUA 1UIBA 2FYDA 1WVVA 1FN5A 1V7TA 1DPWA 4NGKA 1GB5A 1NF5A 4I0CA 1SQ2L 4NWHA 3CSQA 1WQOA 1HEWA 2F30A 1JKAA 5EBHA 2BLYA 2CGIA 5A3ZA 5T3FA 1GB7A 1XGPC 1XEKA 5FEKA 1LHLA 5IHGA 2Z18A 5KXWA 4MSTA 1BVXA 2BQJA 1YKXX 2DBTA 1GFTA 5DL9A 2BAAA 3BKHA 5KXKA 1D6QA 4OWCA 1LSMA 4NWEA 4QEQA 1BB5A 5L3IA 4KL7A 4HTQA 1LZ4A 4H8ZA 2H9JA 1MELL 1UACY 4IATA 2BQIA 1YAPA 4GN5C 1BB6A 1UA6Y 3WPKA 1LSYA 3WU7A 3B72A 1GB0A 1VDTA 4B0DA 4N1CC 5B1GA 1BGIA 1LZCA 4QY9A 1LJEA 1J1XY 1LZ8A 1DI3A 5KKJA 1ZMYL 1QSAA 5LIOA 1HFYA 3HBHA 4DT3A 1N4FA 5LVJA 1TDYA 2Z19A 3A91A 2XBSA 1CJ6A 4H9AA 1LMTA 1GF0A 5F9UA 1LJKA 1IR8A 4GCDA 1LJFA 4LYZA 1IP1A 2YBIA 4G9SA 2DQCY 1GBSA 4KXIA 4TSBA 2W1MA 4WG7A 4D9ZA 5LVKA 5B1FA 1WQRA 3A3QA 3AGIA 1DQJC 1JJ1A 1HFZA 3A67Y 1XEIA 1IWWA 1NHEA 4B1AA 1NQIA 4XJBA 132LA 1LHHA 1GBZA 3QNGA 1LYZA 3TXHA 3CSZA 3AZ5A 3GXKA 3EXDA 4NGYA 5FDJA 1WQMA 5I4YA 9LYZA 2NWDX 4YENA 2GV0A 1YIKA 3QE8A 2ZQ3A 4WM2A 5KXSA 4NHQA 2HTXA 1LJGA 4ETEA 1PZYA 1GFRA 2BQOA 2G4QA 3LN2A 2YBNA 2BQEA 1BWIA 1IOSA 4HV2A 1LZ5A 2BPUA 2YSSC 1GDWA 1FLYA 1JKCA 2PC2A 1IP3A 1G7MC 1JKDA 1LOZA 2FBBA 3TXKA 4NFVA 1HELA 2Z39A 1F6RA 3A92A 3WXUA 1YKZX 1C43A 6LYTA 2C8PA 4ETAA 1LSNA 1OUFA 4YM8A 3RT5X 4NGWA 3WPJA 1LKSA 1OUJA 4HJYA 4WMGA 1IWYA 2I6ZA 3IJVA 1IY4A 4TSCA 1FLUA 2BLXA 4LT1A 2XBRA 5LYZA 1GE0A 1B5UA 1IWXA 7LYZA 2HU1A 4WO9A 194LA 4PJ2C 1BVKC 1JKBA 4J1BA 5APDA 2W1YA 3TMXA 1D6PA 1KIRC 1JWRA 2W1LA 1LSDA 1CKFA 1HNLA 3AW6A 1LZ1A 1D0KA 3B0OA 2HEFA 5B05A 5KKIA 4GN4A 1W08A 1LHIA 5KXNA 5KXXA 1LZEA 3P66A 4DD9A 1LJHA 1IC7Y 4N5RA 1GHLA 2Z2EA 4ZFPA 4AGAA 4XYYA 4H8YA 1C10A 1DKKA 1BWHA 1JIYA 5LA5A 1HENA 4ZIXA 3VWOA 1LZGA 4NHIA 3G3AB 4DD1A 2MEIA 1B9OA 1LMNA 2LZTA 3BKVA 2ZYPA 3M3UA 1GEVA 2CDSA 2MEBA 1GB6A 4N0JA 4ET9A 1AKIA 1BQLY 2Z12A 4PRUA 2D6BA 1IC4Y 1LYOA 4H90A 4H93A 5I4WA 3WVYA 3LYOA 1G7LC 1YAMA 1KXYA 1GFJA 6LYZA 1HFXA 1B5YA 4OWAA 4H9FA 134LA 1O23A 1HF4A 1RJCB 2F2NA 4CJ2A 4NGVA 1JHLA 4OW1A 1QDTA 2BQFA 4KT3A 4TX7A 3A93A 4XJHA 5DM9A 2YBHA 3CT1A 1DPXA 1GAYA 4NGIA 2ZIKA 3WVXA 1NKHA 4XN6A 1BB7A 2LYZA 2D4KA 2X0AA 1LMPA 1UIDA 1GD6A 4I8SA 1KXXA 1C45A 1IORA 1B5XA 4J0LA 4NGJA 2MEFA 5DN4A 3TXDA 2YDGA 1GF3A 1DXJA 1G7JC 1XFPL 4NGOA 5LVIA 4LYOA 4IJ4A 1WQPA 1OUEA 2FYCA 1IP4A 1WQQA 1IIZA 1B5ZA 2DQAA 1UIGA 4WM3A 1GF8A 2WARA 1YROA 3ULRA 5K7OA 1HEQA 2MEEA 3AYQA 1IWUA 1LJJA 135LA 1G7HC 1GBOA 1GB9A 1CKDA 1NBZC 1T6VL 4H1PA 4WG1A 1TAYA 5HMJA 1UIFA 3A8ZA 5JENB 3TXEA 3W3EA 3P65A 4NEBA 4NSIA 4O34A 4BAFA 5LXWA 3B0IA 4CHXA 2W1XA 1IEEA 4LZTA 4WM4A 4A7DA 1GFKA 1FKQA 2B5ZA 3A95A 4NHSA 4G49A 1HEOA 1A4VA 3B0KA 2BQGA 1WTNA 2IHLA 4WO6A 5F16A 4WM5A 1A2YC 1LMQA 4KPMA 3TMVA 1WTMA 1ZV5L 1IY3A 3FE0A 5B59A 5KXLA 1W6ZA 3P64A 4OOTA 4PRQA 2N5ZA 1VDPA 4RLMA 3ZVQB 5APCA 4BS7A 1JTPL 2A7DA 4H9BA 1PS5A 4ML7A 1B7NA 4LYBA 1B0DA 1AT6A 1IX0A 1I1ZA 3OK0A 1OUDA 1GF6A 1XSFA 5FCPA 3HFMY 4HTKA 1E8LA 1GXXA 1VDQA 1BB3A 1LSEA 4H91A 2Z2FA 1LSAA 5II3A 1XGUC 3CT0A 1LHKA 4LT3A 2AUBA 1CNSA 1LTMA 2BQNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KY0A 1LSZA 4ARMB 1QTDA 4RW2A 5C6IA 2B72A 1LHJA 139LA 1TLAA 1JTMA 1JITA 1D0MA 2I26L 1LZRA 1I20A 3N9CA 1QQYA 1L38A 1C08C 3FI5A 1V7SA 3B6LA 1L86A 1YL1X 1IC5Y 2RBOA 4NY5A 1WQNA 3RZEA 2OEAX 1LHMA 5A3EA 1QT8A 3HTDA 1L65A 4Z3MA 3L64A 4Z46A 3PDSA 4WLTA 2XJWA 140LA 1EL1A 4ETCA 1NDGC 1EQ4A 2BQHA 5IDDA 1JJ3A 3C7ZA 4HPEA 226LA 1QS9A 4CFOA 5L3HA 193LA 3HBDA 3LYZA 2Z38A 5KXOA 1OUCA 1CKGA 171LA 2HECA 1WVUA 103LA 153LA 3WH1A 1HSWA 1DI4A 5I54A 258LA 5LYMA 4NSJA 1GF9A 3C8QA 1QUTA 1L15A 5HMVA 4DQ7A 1IP5A 1L47A 3AZ6A 1CX6A 4EKSA 5KXMA 1T6HA 1Z55A 1L18A 150LA 1FLQA 1LGWA 4YEOA 1OUAA 4H92A 3WUMA 187LA 1TCYA 1CJ9A 151LA 1G7IC 2EPEA 2HUBA 5ILCA 1DKJA 2ZNWY 3WYHA 1DYEA 1EQEA 1IOCA 2RB1X 1BHZA 1LSCA 3SB6A 1G0JA 4J7VA 3N9EA 1C69A 5LAFA 2XTHA 1LMCA 3CQLA 4W54A 4DKLA 1L28A 1JEFA 245LA 5DN5A 3EO5A 2YVBA 4LDEA 3NY8A 3AGHA 1LSFA 1P37A 4FJRA 3C80A 3LZ2A 1PQIA 1NDMC 4QGZA 1L19A 1L09A 163LA 1L48A 253LA 2LYMA 2LZ2A 1UC0A 1RFPA 4DYGA 1HMKA 1HSXA 4TUNA 4MR1A 1JJ0A 1L01A 1L13A 1QUGA 1P56A 183LA 2ZIJA 2ZILA 5D5FA 3HT8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2BQK A;  1LSZ A;  2HEE A;  1ALC A;  3EBA B;  1J1P Y;  2ZYC A;  1QTK A;  1JSF A;  1GAZ A;  3F6Z A;  1YL0 X;  4GCF A;  4RW2 A;  4W96 A;  5E4P A;  2BQA A;  5C6I A;  1GE2 A;  4LFP A;  1B5W A;  1LHJ A;  2HED A;  5F81 A;  3TXI A;  3LYM A;  4IAS A;  1B7P A;  2F4A A;  1JIT A;  1D0M A;  4GN3 A;  5KXP A;  4DD2 A;  2I26 L;  5KXR A;  3LYT A;  1B7R A;  1LZR A;  4ET8 A;  1LSB A;  1FBI X;  1I20 A;  3N9C A;  1LJN A;  1QQY A;  1GBX A;  1REX A;  1C08 C;  2MEG A;  2FBD A;  1KIP C;  1V7S A;  2MEA A;  3B6L A;  1IVM A;  2BQC A;  3A6C Y;  5APE A;  4DD0 A;  1DI5 A;  1QTE A;  5E9R A;  3A94 A;  3D3D A;  4II8 A;  4G4H A;  4LYT A;  4M4O A;  1YL1 X;  4RDS A;  1OUB A;  1ZVY B;  2DQI Y;  4XEN A;  1IC5 Y;  4FDY A;  4NY5 A;  1LZY A;  4NHP A;  4NSH A;  4WL6 A;  1SLY A;  1WQN A;  4PPO A;  3RW8 A;  4XJF A;  2YBJ A;  1VAU A;  1LHM A;  1YIL A;  2G4N A;  3A6B Y;  4CFP A;  4DDA A;  5A3E A;  1FLW A;  2DQH Y;  4H9C A;  1YKY X;  1IOT A;  1UBZ A;  4OWB A;  1UIC A;  4N8Z A;  1EQ5 A;  4M6D A;  4Z3M A;  4Z46 A;  1IOQ A;  3WUN A;  1D9U A; 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 3WVX A;  1NKH A;  4XN6 A;  1BB7 A;  2LYZ A;  2D4K A;  2X0A A;  1LMP A;  1UID A;  1GD6 A;  4I8S A;  1KXX A;  1C45 A;  1IOR A;  1B5X A;  4J0L A;  4NGJ A;  2MEF A;  5DN4 A;  3TXD A;  2YDG A;  1GF3 A;  1DXJ A;  1G7J C;  1XFP L;  4NGO A;  5LVI A;  4LYO A;  4IJ4 A;  1WQP A;  1OUE A;  2FYC A;  1IP4 A;  1WQQ A;  1IIZ A;  1B5Z A;  2DQA A;  1UIG A;  4WM3 A;  1GF8 A;  2WAR A;  1YRO A;  3ULR A;  5K7O A;  1HEQ A;  2MEE A;  3AYQ A;  1IWU A;  1LJJ A;  135L A;  1G7H C;  1GBO A;  1GB9 A;  1CKD A;  1NBZ C;  1T6V L;  4H1P A;  4WG1 A;  1TAY A;  5HMJ A;  1UIF A;  3A8Z A;  5JEN B;  3TXE A;  3W3E A;  3P65 A;  4NEB A;  4NSI A;  4O34 A;  4BAF A;  5LXW A;  3B0I A;  4CHX A;  2W1X A;  1IEE A;  4LZT A;  4WM4 A;  4A7D A;  1GFK A;  1FKQ A;  2B5Z A;  3A95 A;  4NHS A;  4G49 A;  1HEO A;  1A4V A;  3B0K A;  2BQG A;  1WTN A;  2IHL A;  4WO6 A;  5F16 A;  4WM5 A;  1A2Y C;  1LMQ A;  4KPM A;  3TMV A;  1WTM A;  1ZV5 L;  1IY3 A;  3FE0 A;  5B59 A;  5KXL A;  1W6Z A;  3P64 A;  4OOT A;  4PRQ A;  2N5Z A;  1VDP A;  4RLM A;  3ZVQ B;  5APC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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