1C63A

T4 lysozyme mutant c54t/c97a/l121a in the presence of 8 atm argon
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMAQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Size versus polarizability in protein-ligand interactions: binding of noble gases within engineered cavities in phage T4 lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 58
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-12-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1c63A00
1D3MA 172LA 1L10A 4DJHA 1D2YA 1D3NA 1L26A 2NTGA 3HU9A 2B6ZA 4GBRB 1G06A 1PQIA 2F2QA 3OE0A 1L82A 4ARJA 103LA 1G0PA 4ARLA 1L11A 2RB0X 110LA 2OU8A 3D4SA 1P64A 1CV6A 2OE4X 1SX7A 183LA 1T8GA 1EPYA 144LA 3UONA 1L51A 1P5CA 4ARQA 1L57A 3DN2A 1QUOA 2LZMA 1QSBA 3L2XA 3HT9A 1L70A 4OO9A 1LW9A 191LA 1L35A 1SWZA 257LA 1L41A 3DN8A 182LA 120LA 1C68A 4YXAC 1C69A 1C6KA 1L05A 232LA 4PK0A 2B6TA 3DN6A 1G1WA 3GUMA 4ARQB 170LA 1LYDA 2B72A 1C6AA 4IAPA 1LI3A 4W51A 1K28A 2B6WA 1KS3A 1P7SA 1CX6A 3FI5A 1L13A 1G0QA 4W56A 1QT3A 212LA 236LA 3HH6A 4ZPUA 231LA 4S0WA 181LA 3HT6A 1DYEA 248LA 2O79A 1L06A 2B74A 1L17A 1L93A 241LA 1G0MA 114LA 210LA 1C62A 1QSQA 1L15A 255LA 1QTDA 2QARC 1L74A 3GUPA 1C6NA 1ZWNA 1QT5A 1L84A 1SSYA 4I7KA 218LA 5LZMA 148LE 3C80A 150LA 1L67A 3C82A 3EMLA 192LA 3HDEA 2HUKA 186LA 1L64A 1JQUA 1L39A 219LA 2B6YA 2F47A 165LA 1L66A 4K5YA 4EJ4A 1ZYTA 4I7PA 1T8AA 1CX7A 3DN3A 1T8FA 2OU9A 1L62A 3C7WA 4ARMA 1L36A 156LA 3NYAA 2RBNA 1NHBA 138LA 234LA 242LA 140LA 1C6CA 4I7SA 3SBBC 1QT4A 239LA 1L31A 1DYFA 1C6MA 1L34A 163LA 5I14A 4I7OA 3G3VA 2L78A 4EKQA 2CUUA 3SB7A 4EXMA 1P2RA 2OE9X 1CU6A 1L87A 1L69A 3CDQA 1L85A 167LA 1L80A 1P46A 2LCBA 4W53A 1CU2A 3CDRA 2HULA 1C6DA 2B73A 3QAKA 3C7ZA 3FA0A 1L00A 130LA 1CV5A 1G0GA 1L32A 1T97A 1LYJA 1L07A 7LZMA 118LA 161LA 1C64A 1L77A 3HDFA 1G0JA 4W58A 115LA 1LI6A 184LA 1L98A 1LGWA 2OTZX 1L94A 223LA 1L0JA 2Q9DA 185LA 1L42A 1PQDA 4I7TA 190LA 1L21A 1QUDA 3OE9A 2A4TA 159LA 173LA 3DKEX 1C6EA 1C6TA 1L04A 1KY0A 1PQMA 1L16A 151LA 3OE8A 1XJTA 2RBOA 1JTNA 4EKPA 4EKSA 1L14A 1P56A 205LA 3GUNA 4YXCA 1L71A 112LA 189LA 3DN1A 3GUIA 1L56A 1D3FA 1QTBA 1SX2A 4LDEA 2B6XA 1B6IA 3PDSA 251LA 225LA 1QTHA 1L53A 4I7LA 1CV1A 3GUOA 125LA 3F8VA 1L12A 3CDVA 1L44A 2RB1X 1C63A 162LA 1CTWA 2QB0B 4I7RA 1QT8A 1G1VA 1L65A 1L81A 1L0KA 4EPFA 1LWGA 1PQJA 1DYAA 3C83A 2OEAX 2Q9EA 4I7NA 1LLHA 1I6SA 2ANVA 2O4WA 1PQKA 3C8QA 1L89A 3HTFA 4LDLA 3G3WA 1L55A 1C6JA 228LA 1C65A 1C6GA 3C8SA 254LA 1JTMA 1QTZA 3SN6R 1L47A 3JR6A 1L38A 169LA 249LA 1L33A 1CVKA 217LA 102LA 3DN4A 178LA 1P3NA 3HH5A 176LA 158LA 1CU3A 1LPYA 2RAYX 109LA 1ZURA 3PBLA 1L02A 237LA 4GRVA 221LA 1C6LA 1G0LA 1C6QA 1KW7A 122LA 1OV7A 3HT7A 195LA 1L48A 1L30A 1CUPA 1D2WA 168LA 260LA 1L68A 143LA 1C6BA 259LA 253LA 155LA 4PJZA 166LA 188LA 3OE6A 1C66A 1QTVA 197LA 214LA 3L64A 198LA 3CDOA 2B7XA 2F32A 3SB9A 1L52A 3C8RA 1WTHA 3ODUA 1L27A 1L63A 1L25A 3DMVA 258LA 1QS9A 256LA 1L45A 201LA 3GUKA 2NTHA 1DYGA 1L75A 1SSWA 4LDOA 209LA 152LA 4W55A 6LZMA 126LA 1G0KA 1TLAA 128LA 1KW5A 1L19A 1L40A 3C7YA 139LA 3CDTA 1DYCA 1DYBA 245LA 1DYDA 3SB5A 119LA 2OU0X 129LA 2RBQA 4ARPA 224LA 187LA 4I7JA 3C81A 3NY8A 4AQNA 1C60A 1KNIA 220LA 1LYGA 3DMXA 1LYIA 2RB2X 1P6YA 1L59A 1L01A 4W59A 2HUMA 111LA 1QUHA 180LA 1L72A 1L37A 211LA 213LA 1C6IA 3VW7A 1LYFA 3HUAA 222LA 3HWLA 1QT7A 164LA 244LA 123LA 1PQOA 238LA 243LA 1LYEA 3RUNA 2RH1A 1L95A 1CU5A 1OV5A 247LA 3HTGA 4I7QA 2RBPA 1L54A 3HH3A 262LA 1OWZA 1L09A 107LA 1L23A 4DAJA 1L79A 1C6HA 3HH4A 127LA 1OVKA 1L73A 1P2LA 1D9WA 1LYHA 1P37A 108LA 2O7AA 3HTBA 175LA 2RBRA 3HTDA 1L24A 1LGUA 147LA 1L92A 160LA 1OVHA 1XEPA 2Z6BA 1L83A 1C61A 3GULA 1LWKA 229LA 1OWYA 1OVJA 3SBAA 1CU0A 1KY1A 1D3JA 1L91A 145LA 1L43A 3NY9A 3DN0A 1C6PA 1QUGA 1L28A 1P36A 174LA 1L49A 1CV3A 1L50A 1L60A 1QT6A 1G07A 1L29A 1L22A 142LA 4W52A 1L20A 3K2RA 3DMZA 2LC9A 1L58A 3GUJA 3HT8A 1L18A 2B75A 4I7MA 240LA 4E97A 250LA 2OTYX 1L03A 1L86A 261LA 1L99A 146LA 3SB8A 177LA 113LA 2OE7X 4EPIA 3HUQA 1CV4A 4YX7C 4W57A 196LA 1L08A 199LA 3RZEA 1L96A 216LA 1L61A 3LZMA 252LA 3HU8A 226LA 1C6FA 1L46A 3SB6A 1OYUA 3V2WA 104LA 230LA 246LA 4W54A 1C67A 2B70A 3DNAA 3G3XA 1SWYA 131LA 3FADA 1L90A 4DKLA 141LA 3HUKA 1XJUA 4LZMA 3V2YA 2RAZX 2IGCA 1L88A 1T6HA 1LGXA 233LA 4ARMB 171LA 149LA 1L97A 1QS5A 2ANXA 215LA 1QTCA 227LA 200LA 235LA 157LA 1LI2A 1CV0A 1L76A 2RBSA 4EKRA 137LA 3F9LA 206LA 1CUQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LZ2A 3W6DA 1T3PA 3HU9A 2B6ZA 4GBRB 2YBNA 5B59A 5APEA 2OU8A 3CSQA 2GV0A 1HEOA 2OE4X 1EL1A 1T8GA 2H5ZA 4LYMA 4ARQA 1QUOA 3LHMA 4OO9A 1L35A 120LA 4YXAC 1C6KA 232LA 2B6TA 3HBDA 3WH1A 4HPIA 170LA 1UIHA 4IAPA 1LI3A 2DQHY 4W51A 1WQPA 1KS3A 1GFKA 1DZBX 1QT3A 212LA 231LA 1YKYX 181LA 1IWVA 1HMKA 2O79A 2B74A 1YKZX 1GF3A 1LZTA 4WM6A 4WM1A 210LA 2WARA 1TAYA 1JITA 1GDWA 3J4GA 5LINA 1LZ1A 1DKKA 1GWDA 4NGOA 1LCNA 1LZ4A 5LZMA 153LA 1LJIA 1L67A 1YAQA 192LA 3W6FA 3HDEA 2HUKA 1L64A 219LA 3TMVA 4Z46A 1HEMA 4H94A 1G7HC 4H1PA 1B7RA 2I6ZA 1AM7A 5IELA 4ARMA 4YOPA 2A7DA 1GF9A 3A96A 4DWXA 1C10A 1GF4A 1TDYA 2BQAA 4NHSA 1DI3A 2MEIA 1GE4A 1QT4A 1F6SA 1KXYA 239LA 1L31A 5KXZA 1IOQA 1WQRA 1DQJC 163LA 4DDAA 1LSCA 1JJ3A 4QEQA 3CT0A 3WPLA 4EKQA 1ZMYL 4EXMA 4B4EA 2A7FA 1HF4A 1WTMA 1LMNA 1GXXA 2YSSC 1XGPC 2C8OA 1L85A 1IWTA 4RDSA 2ZILA 5LYMA 1CU2A 1CKGA 2HTXA 1I56A 1LZ6A 4TTDA 3FA0A 1L00A 4XJFA 1CV5A 1L32A 1QUTA 3P4ZA 1L07A 118LA 161LA 4H9CA 5I54A 4W58A 3AZ6A 223LA 4Z98A 4I7TA 3DKEX 5B05A 1D6PA 3QNGA 1VDQA 3IWRA 1UIFA 4B1AA 1GDXA 1XJTA 1JTNA 1YAMA 1L14A 4YXCA 1L71A 4WL6A 4NHPA 3DN1A 1IC5Y 4RW1A 1SX2A 4H93A 5KKJA 3HFMY 1ZVYB 4CGEA 1IR8A 1CTWA 1XGQC 1L65A 5KXOA 1IP2A 1L0KA 3M3UA 1J1PY 4EPFA 2OEAX 2Q9EA 1BHZA 1XGRC 3C8QA 1L89A 3G3WA 1L55A 1FBIX 3HBHA 254LA 1GB2A 5DN5A 1ZVHL 1LZCA 1QTZA 2G4NA 4NGIA 3AJNA 1XSFA 1JIYA 3JR6A 1IC4Y 5LA5A 1DXJA 1L33A 5I53A 1P3NA 176LA 1GB9A 1CU3A 1YANA 1L02A 1LYYA 4H90A 1JJ1A 1G0LA 5LA8A 1KW7A 4OW1A 3HT7A 4ETAA 1BB3A 1OUEA 3EXDA 1F10A 4DQ7A 188LA 5FHWA 6LYZA 4WM4A 1VATA 4NGJA 1L52A 3C8RA 5DM9A 1L63A 3TXKA 3DMVA 5C6JA 1GB5A 1QS9A 1WQNA 5FELA 1L45A 1GB8A 1DYGA 1KXWA 1GEVA 1L75A 1SSWA 4J1AA 5B06A 134LA 4OOOA 4G49A 3TMWA 245LA 119LA 4ARPA 2RBQA 1IR7A 4I7JA 3RNXA 1LYGA 1XEKA 1B7PA 1LYIA 3W6CA 1UUZC 2W1LA 4W59A 1B2KA 4C3WA 4NGWA 5I5QA 180LA 211LA 3ZVQA 3HUAA 4CHXA 238LA 8LYZA 4E3UA 1QIOA 1LYEA 2DQDY 3G3AB 1CU5A 1JUGA 4GLAA 247LA 3CQLA 2RBPA 1QQYA 3LYOA 3HH3A 262LA 4DAJA 1L09A 1L23A 4G9SA 1QTKA 4TSCA 5K7OA 1JKCA 133LA 4HTKA 2RSCA 1L92A 1WQMA 3GULA 1LWKA 229LA 5M1YA 4WLTA 1OWYA 1CU0A 1KY1A 1TCYA 4ZIXA 145LA 1XEJA 3DN0A 1N4FA 4J7VA 3B6LA 2ZYCA 1IY3A 3AZ4A 4W52A 4IATA 5KXRA 3GUJA 4XYYA 1L18A 2B75A 4H9EA 240LA 4E97A 4ZFPA 2OTYX 1L03A 1LJJA 2W1XA 5F16A 4PRQA 5LAGA 3WULA 113LA 1IP1A 1CV4A 196LA 1L08A 1ALCA 2MEDA 216LA 1L61A 5ILFA 252LA 5LVGA 4XJDA 3SB6A 104LA 3WUAA 4X3BA 4H9AA 230LA 246LA 4W54A 1C7PA 1IOTA 1GBSA 1C67A 2B70A 4TX7A 4NSHA 3AGHA 3A34A 1FLWA 141LA 1GB3A 1GF7A 5LVHA 4HTNA 1B5ZA 1LGXA 233LA 1LKSA 3TXFA 4NSJA 2Z39A 1QS5A 2ANXA 1OUBA 227LA 4DD3A 2Z2FA 1CKDA 3N9EA 137LA 4W96A 1CUQA 4BS7A 1C45A 4B49A 1F0WA 1D2YA 1D3NA 1L26A 1HEWA 4GN5C 1LSPA 1LYOA 2C8PA 1PQIA 3OE0A 1G0PA 4WM3A 4ARLA 2RB0X 1YIKA 1CV6A 4MSTA 1SX7A 1RJCB 1BGIA 1L57A 1FN5A 1LZ8A 3HT9A 3EBAB 5HMVA 1BQLY 1FLUA 1GFHA 1WQQA 1C68A 1C69A 1L05A 3T6UA 1G1WA 3GUMA 1OUHA 1IO5A 4ARQB 4HV1A 1G7JC 2MEFA 1NF5A 1GE1A 1JTOL 4XJBA 4R6CA 4RLMA 236LA 4ZPUA 4S0WA 248LA 4QY9A 1BWIA 3P66A 1B5UA 241LA 1B5VA 1C62A 1UIAA 1L15A 1OUJA 1NBYC 2QARC 3KAMA 2FBBA 3GUPA 1ZWNA 1QT5A 1L84A 4FDYA 1BB5A 4ETDA 148LE 4IJ4A 2BQFA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3LZ2 A;  3W6D A;  1T3P A;  3HU9 A;  2B6Z A;  4GBR B;  2YBN A;  5B59 A;  5APE A;  2OU8 A;  3CSQ A;  2GV0 A;  1HEO A;  2OE4 X;  1EL1 A;  1T8G A;  2H5Z A;  4LYM A;  4ARQ A;  1QUO A;  3LHM A;  4OO9 A;  1L35 A;  120L A;  4YXA C;  1C6K A;  232L A;  2B6T A;  3HBD A;  3WH1 A;  4HPI A;  170L A;  1UIH A;  4IAP A;  1LI3 A;  2DQH Y;  4W51 A;  1WQP A;  1KS3 A;  1GFK A;  1DZB X;  1QT3 A;  212L A;  231L A;  1YKY X;  181L A;  1IWV A;  1HMK A;  2O79 A;  2B74 A;  1YKZ X;  1GF3 A;  1LZT A;  4WM6 A;  4WM1 A;  210L A;  2WAR A;  1TAY A;  1JIT A;  1GDW A;  3J4G A;  5LIN A;  1LZ1 A;  1DKK A;  1GWD A;  4NGO A;  1LCN A;  1LZ4 A;  5LZM A;  153L A;  1LJI A;  1L67 A;  1YAQ A;  192L A;  3W6F A;  3HDE A;  2HUK A;  1L64 A;  219L A;  3TMV A;  4Z46 A;  1HEM A;  4H94 A;  1G7H C;  4H1P A;  1B7R A;  2I6Z A;  1AM7 A;  5IEL A;  4ARM A;  4YOP A;  2A7D A;  1GF9 A;  3A96 A;  4DWX A;  1C10 A;  1GF4 A;  1TDY A;  2BQA A;  4NHS A;  1DI3 A;  2MEI A;  1GE4 A;  1QT4 A;  1F6S A;  1KXY A;  239L A;  1L31 A;  5KXZ A;  1IOQ A;  1WQR A;  1DQJ C; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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