The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
118
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sequence length |
283
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structure length |
283
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Chain Sequence |
MLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYRGVLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
PROTEIN (DEOXYHEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN))
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| publication title |
Genetically crosslinked hemoglobin: a structural study.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
118
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| structure length |
283
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| sequence length |
283
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins | ||
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2MB5 A; 1URV A; 3TM9 A; 2MYD A; 3PT8 B; 2HBF B; 3M3B A; 1HCO B; 3WR1 A; 1YMB A; 1Y4G B; 1HBA B; 3MVC A; 3S1I A; 3R5I A; 2XKI A; 3O89 A; 1Y7C B; 3OZU A; 3LB1 A; 1RPS A; 3ORD A; 2D2M C; 3ZJP A; 2MGK A; 3GQG B; 3GLN A; 3UHN A; 3RGK A; 1O1J A; 1JL7 A; 1HGB A; 1HGA B; 1SPE A; 3UBV A; 1OUU A; 5HBI A; 1DUK A; 2LHB A; 1BIN A; 1RTX A; 1A9W A; 1MBO A; 2W72 B; 1AJ9 B; 5JDO F; 1F63 A; 1LFT B; 1Y4V B; 2MHB B; 2OIF A; 2WTH A; 1FHJ B; 1X3K A; 1V4X B; 4B3W A; 1CIK A; 5KKK A; 4OF9 A; 1CPW A; 3EOK B; 4KJT A; 2VEE A; 1HDA B; 4O4T A; 1HBH A; 2V1J A; 3HEN A; 1GDL A; 3GK9 A; 1XZ4 B; 3MKB A; 3GDJ B; 2HZ2 A; 3W4U A; 3R0G A; 1BZ1 B; 1BIJ B; 3OZW A; 3WCP A; 4DC8 A; 1UIW B; 2W6Y A; 2HCO A; 1GCV B; 1A0Z B; 5ILP A; 2Z6N B; 2GRH A; 3OJ1 A; 2FRF A; 3G4W A; 1YVQ B; 1JW8 A; 2ZSO A; 1DO1 A; 2B7H B; 2AV0 A; 3OO4 B; 5E6E A; 1BZ0 A; 1HJT A; 1G08 A; 2IG3 A; 1MLJ A; 1G09 A; 1Y4P B; 1Y7G A; 1Y22 B; 3A5A A; 1SDL B; 1YH9 A; 3FH9 A; 1C40 B; 1YGF A; 1GBU B; 2SPM A; 1URY A; 5ILM A; 1Y4Q B; 1L2K A; 2D2M A; 4F6J A; 3RJ6 A; 106M A; 2CMM A; 1O1M B; 3WCT B; 4TYX A; 1BAB B; 1QSI B; 3BJ1 A; 5EYJ A; 3WFX A; 1QI8 A; 1V75 A; 1O1N B; 3NMM B; 3O7N A; 1GDI A; 3IC2 B; 110M A; 2DHB A; 5JGG B; 1XCH A; 4H2L A; 4NI1 B; 2QSP A; 1CQ2 A; 2HBS B; 3ZJL A; 1JF3 A; 1LFL A; 1VHB A; 7HBI A; 1MLS A; 2HHD B; 1NEJ A; 3WHM B; 2DN1 A; 3VRE A; 2Z6T A; 1YHR B; 4ODC A; 5KER B; 1OUT B; 1Y4F B; 3CIU B; 1IRD A; 1CH1 A; 3TLD A; 5CN8 A; 3AQ8 A; 3PI9 B; 2NSS A; 1J7Y A; 4FWZ A; 1JPB A; 1XZV B; 1NS9 B; 1LJW B; 1M9P A; 3UHV A; 4HBI A; 3U3E A; 1IDR A; 4MQJ B; 2H35 A; 1R1Y A; 3NL7 B; 1YHU D; 1MYH A; 1WMU A; 5AB8 A; 1DXT A; 1SI4 A; 4B4Y A; 1Y5K B; 1DXV B; 5CN5 A; 1S5Y A; 5KDQ B; 3UHY A; 3PT7 A; 1NPF A; 1ABW B; 1X9F B; 5CN6 A; 1YVT A; 4HHB A; 2BLJ M; 1LH5 A; 1V5H A; 2BWH A; 1SHR A; 1J3F A; 1PBX A; 1YHU C; 2O5Q X; 2W6X A; 3DHT A; 3HC9 A; 5F2A A; 3SDH A; 5HAV A; 5C6E B; 1HBR A; 1NZ2 A; 1YHE B; 2RAO B; 1Z8U B; 3S65 B; 3AQ5 A; 2YRS A; 1JF4 A; 4HRR B; 1K0Y B; 2O5S X; 1RVW B; 1XZ5 A; 3G4Y A; 2MYE A; 1CH5 A; 3BJ2 B; 1DWR A; 1FSX B; 1N9H A; 2GL3 A; 3BA2 A; 3UBC A; 3M39 A; 1Y0W B; 1S61 A; 1Y8W A; 4X0L B; 1Y09 B; 1CG8 B; 3RJN B; 2DC3 A; 3BJ3 B; 112M A; 1ITH A; 2QFN A; 1FAW A; 5E83 A; 2ZFB B; 1CH7 A; 1JY7 B; 2LH3 A; 1Y5J B; 2DN3 B; 5SW7 B; 4FWY A; 2FRI X; 2OH8 A; 2WY4 A; 1A01 A; 1LTW A; 1CMY B; 3A0G B; 4NZI A; 2JHO A; 1GDK A; 3ZJM A; 1EBT A; 4YU3 A; 1GZX A; 1DXU B; 1IWH A; 5HLX A; 1A6G A; 3ONZ A; 4TWU A; 3D7O B; 1H1X A; 4O2G A; 4DC7 A; 3UHD A; 1YEQ B; 1T1N A; 5EUI B; 1FDH G; 4FC3 A; 2R80 B; 1QXE B; 1NWN A; 1MOA A; 6HBW B; 5B84 A; 1MOH A; 1I3E A; 1X46 A; 1MLG A; 1XZU A; 1MLF A; 3IXF A; 1B86 B; 1A0U A; 1QXD A; 2ZS1 B; 1C7D B; 2MGJ A; 1RQA B; 1Y2Z A; 4N7O B; 2ZS0 B; 1OFK A; 2LH6 A; 1GLI B; 1XXT B; 1R1X B; 4M4B A; 1DKE B; 1Y46 B; 2WTG A; 2D5X A; 1Y0C A; 3EDA A; 1BBB B; 3MJU B; 1YHU A; 5ILE A; 3E5O A; 1C7B B; 4IT8 A; 2ZSY A; 2MGH A; 1NGK A; 3P5Q A; 5CN9 A; 3ZJN A; 1HBB A; 1HAC B; 1O1I A; 2ZT3 A; 2IN4 A; 1TES A; 2QMB A; 1LFQ A; 3SZK B; 3QJD A; 3K8B B; 3NFE A; 1V4W A; 3PIA B; 1KD2 B; 1NZ4 A; 5HY8 A; 3MN0 A; 2VLX A; 5ILR A; 1MTI A; 3PEL B; 4DWU A; 2VEB A; 3IC0 B; 3BOM B; 4N8T A; 1QPW A; 1JEB B; 3QM8 A; 3A5G A; 1BZR A; 2AUP A; 1Y7Z B; 3AT6 B; 1SDK A; 1NIH B; 1ECN A; 3G4Q A; 2EB8 A; 1MOD A; 1MYJ A; 1C7C A; 1MKO A; 4L7Y A; 3VRG A; 2PEG B; 1MLQ A; 4HRT B; 2O5L X; 4ESA B; 2Z8A A; 2GDM A; 1Y8H B; 5JOM A; 3NG6 B; 1QSH A; 3WCU D; 3EDB A; 1S5X A; 1Y7D B; 1XZ7 A; 2G14 A; 3QQR A; 3ARK A; 1Y4R B; 1O1L B; 1BVC A; 3VRF A; 1H97 A; 4XDI A; 1F65 A; 3CY5 B; 2RI4 B; 4M4A B; 4MAX A; 1FDH A; 5EU2 A; 1S6A A; 2ZFO D; 4WCH D; 3UGY A; 3QMA A; 3WCU C; 2SPL A; 1M6C A; 1MBD A; 3HXN B; 4ROL A; 1MYZ A; 1A3N B; 109M A; 3GYS B; 1CLS A; 1CBM A; 1HV4 A; 5CN7 A; 3LB4 A; 3GQP A; 2ZLU A; 2G10 A; 3UHQ A; 3A59 B; 3WTG B; 3KMF C; 1DUO A; 1YIH A; 3D4X B; 1NAZ A; 1GCW B; 4O4Z A; 2AUR A; 2ZFO C; 4O35 A; 1J7W B; 1HHO B; 3LR9 A; 3ZJR A; 3PI8 B; 1VXE A; 2QSS A; 1DXD A; 3D1K A; 3G53 A; 1EMY A; 1YEN B; 1LA6 B; 2QLS B; 2ZSR A; 2ZLT B; 1XYE B; 5EE4 D; 1Y0A B; 3QZX A; 104M A; 1Y8K B; 1YEO A; 3S66 A; 1HBG A; 2DXM A; 3HF4 A; 1GBV A; 1MLN A; 2BLI A; 3WCT D; 3EU1 A; 2QRW A; 1HCO A; 2ZSQ A; 1Y4G A; 3M3A A; 1HBA A; 2AV3 A; 2W6W A; 1F5P A; 3HHB B; 1YG5 A; 5EE4 C; 1UFP A; 2MGF A; 2D60 A; 4G51 A; 2V1E A; 2QU0 A; 3UHU A; 4F4O B; 1JZM A; 3UH3 A; 3GQG A; 1LFY B; 1CH3 A; 1VXG A; 5EV5 A; 1Y0D A; 1RPS B; 3OVU C; 2GNW A; 3WCT C; 2M6Z B; 5CMV A; 3LHB A; 1G0A B; 1HGA A; 1EWA A; 1A6K A; 1MYG A; 4JYQ A; 1FCS A; 1YGD A; 2O58 X; 3HEP A; 1HGB B; 5MBA A; 3MJP B; 5CHR A; 3S1J A; 2Z6S A; 1VXA A; 1BZZ B; 3WCU A; 3KUN A; 1OUU B; 2NRM A; 1Y4V A; 1LFT A; 2G0X A; 4XS0 A; 2G0Z A; 1J40 A; 1NWI A; 1O1O A; 4AVD A; 1FHJ A; 2LH7 A; 1MLM A; 1CIO A; 2G3H A; 1DWS A; 3KMF A; 4H07 A; 1A6M A; 5HU6 A; 3EOK A; 2AUO A; 1HDA A; 3ARL A; 1BJE A; 2ZFO A; 1SPG B; 1Y4B B; 2V1G A; 3GDJ A; 5D5R A; 1A00 A; 1BZ1 A; 102M A; 3H58 A; 1UIW A; 1X9F D; 5JDO E; 4N7N B; 1DO3 A; 1GCV A; 1J3Z A; 3W4U B; 2Z6N A; 3WCP B; 1A6N A; 1XZ2 B; 2GRZ A; 4TWV A; 1MLU A; 1YVQ A; 1O1P A; 1KFR A; 1GDJ A; 1N9F A; 1X9F C; 1Y4P A; 1Y22 A; 2HHB B; 1SDL A; 1S0H A; 1YFF B; 1BZ0 B; 1AZI A; 1I3D A; 2R4Y A; 1HBS B; 1Y4Q A; 2BNL A; 1JWN A; 3ZOL A; 2AA1 B; 1Y31 A; 1YGF B; 2EF2 A; 1J7S A; 2D5Z A; 5EOH A; 2GKM A; 3TM3 A; 1O1M A; 3LB3 A; 3WCT A; 1QSI A; 1CH2 A; 3UHH A; 1O1N A; 2EVP A; 1XY0 B; 3WCW D; 2FAM A; 3BJ1 B; 1J41 B; 2ZSP A; 1LFV A; 2W6V B; 5JGG A; 1V75 B; 1MBN A; 4NI1 A; 3G4R A; 2HBS A; 5CNC A; 2HBD A; 4WJG A; 2HHD A; 1ABY A; 3WHM A; 2FAL A; 4UUR A; 1YDZ B; 1YIE A; 1MTK A; 5KER A; 1OUT A; 1PMB A; 2HBC B; 5AZR A; 2DN1 B; 2DN2 B; 3WCW C; 4MQG A; 3VRE B; 2ZWJ A; 4ODC B; 3K3U A; 1UT0 A; 1IRD B; 5AZQ A; 1HAB B; 1MWD A; 1BUW A; 1XZV A; 1J3Y B; 3E55 A; 1NS9 A; 1O1K B; 1LJW A; 3WFT A; 5HLQ A; 4F68 A; 2O5B X; 3D1A B; 5F0B A; 4PQB A; 1NQP A; 2D2N D; 4MQJ A; 5JDO D; 3ECL A; 1MLK A; 2XKG A; 1IT3 A; 1RTE A; 3UHG A; 3ZJI A; 1G0B A; 1DXV A; 2H35 B; 1R1Y B; 1LFZ B; 3WFU A; 1ABS A; 1DXT B; 1MDN A; 1SI4 B; 3ZJJ A; 2GTL B; 4N7P A; 1ABW A; 1X9F A; 4F6F A; 2D2N C; 5JDO C; 4FH6 A; 3PT7 B; 1YOI A; 4ROM A; 5C6E A; 1OR6 A; 1K1K B; 2RAO A; 1YVT B; 4HHB B; 3HYU A; 1JP6 A; 3DHT B; 1DO4 A; 3D17 B; 4HRR A; 3GKV A; 1VWT A; 1K0Y A; 2BMM A; 1G9V A; 1CP0 A; 1THB B; 2ZSZ A; 1Y85 A; 3ODQ A; 1YE0 A; 4KN3 A; 1KR7 A; 1GVH A; 1CQX A; 1FSX A; 2HHE A; 3AQ7 A; 3QM5 A; 4MQI B; 3UHK A; 1XZ5 B; 3UGZ A; 1MBI A; 2LH2 A; 2G0R A; 4NK1 A; 1WVP A; 4X0L A; 105M A; 3BJ3 A; 1Y8W B; 1Y01 B; 1YEV B; 1A3O A; 1DTI A; 1JY7 A; 1Y5J A; 1CH4 A; 3WCW A; 5SW7 A; 2PGH B; 1MOC A; 1FAW B; 5CNE A; 2R1H B; 1RQ3 B; 3PI1 A; 1UVY A; 4U8U D; 1HBI A; 3ASE A; 2NRL A; 1A01 B; 3DUT A; 1DXU A; 3FS4 B; 1CH9 A; 4YU3 B; 3BCQ B; 1A9W E; 1Y83 B; 1IWH B; 1QXE A; 3G52 A; 4MBA A; 3HRW A; 6HBW A; 3MYN A; 2VYZ A; 2GKN A; 4U8U C; 4SDH A; 1RQA A; 1FN3 B; 5C6Y A; 4N7O A; 2H8D A; 3QJB B; 3OO5 A; 1B0B A; 1R1X A; 1DKE A; 1HRM A; 2D2N A; 1YCA A; 2V1H A; 2NSR A; 1COH B; 2ZLW B; 1JZL A; 1MLL A; 1Y35 B; 3MYM A; 1MGN A; 2SPO A; 2D5X B; 1DWT A; 1Y0C B; 1HAC A; 1YHU B; 4MU5 A; 2BKM A; 5D1V A; 2MGL A; 1UX8 A; 2AUQ A; 1HGC B; 1OFJ A; 1O1I B; 1V4U B; 3H57 A; 1EBC A; 2ZT1 A; 2QMB B; 3PEL A; 1RQ4 A; 1LFQ B; 1TU9 A; 2ZLX B; 3IC0 A; 3NFE B; 1V4W B; 2EB9 A; 2VYW A; 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1GBV B; 1Y7C A; 3HHB A; 1MLO A; 4DWT A; 3WR1 B; 3EU1 B; 1YMC A; 2OHB A; 1HSY A; 2W31 A; 3R5I B; 1V07 A; 5CNF A; 4F4O A; 4PQ6 A; 4F6D A; 1LFY A; 2EKU A; 1YG5 B; 4F6G A; 2MYA A; 3QM9 A; 2D60 B; 4G51 B; 2M6Z A; 2QU0 B; 3QM6 A; 1O1J B; 1VXB A; 4F69 A; 1G0A A; 1Y0D B; 3NML A; 1VXC A; 4C0N A; 1UMO A; 3E5I A; 2VLY A; 1ECA A; 3HEO A; 3MJP A; 1U7S A; 2W72 A; 1AJ9 A; 2MHB A; 1BZZ A; 1YGD B; 3ZJH A; 1UFJ A; 1LHT A; 1V4X A; 1SWM A; 2GLN A; 2XYK A; 3WCU B; 1LH6 A; 1N9X A; 2HZ1 A; 4XS0 B; 1O16 A; 5CN4 A; 1J40 B; 1O1O B; 1XZ4 A; 2LH5 A; 1D8U A; 1SPG A; 5HU6 B; 3LB2 A; 1Y4B A; 1BIJ A; 1HBH B; 3UHW A; 3ZJO A; 3MKB B; 4ZVB A; 107M A; 4LPI A; 1YOG A; 2GTL D; 2ZFO B; 6HBI A; 1A0Z A; 2VLZ A; 4NS2 A; 4UZV A; 4N7N A; 3VHB A; 1A00 B; 2BW9 M; 1UC3 A; 3UH5 A; 4MPM A; 2HCO B; 1XZ2 A; 2B7H A; 2FRK X; 3OO4 A; 1J3Z B; 1MYF A; 3SDN A; 1VRE A; 4WJG 1; 2GTL C; 5E6E B; 1C40 A; 2ZST A; 2HHB A; 3ZJQ A; 1O1P B; 1G08 B; 3A5B A; 1GBU A; 1G09 B; 1YFF A; 3G46 A; 1Y7G B; 4MXK A; 1S56 A; 2MGE A; 1MOB A; 1YH9 B; 3FH9 B; 1HBS A; 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