The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGKVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
PROTEIN (DEOXYHEMOGLOBIN (ALPHA CHAIN))
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| publication title |
Genetically crosslinked hemoglobin: a structural study.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
56
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2000-02-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1Y01 B; 1LFZ A; 1CQ2 A; 3EOK A; 1MLG A; 3CY5 B; 1R1Y A; 2XKI A; 2G12 A; 1O1J A; 4FWY A; 3D4X A; 3QZX A; 1Y0A A; 1HBH A; 4F6G A; 2ZS1 B; 3NMM A; 1A9W E; 5CN4 A; 1RQA B; 3S65 A; 1MOH A; 2EVK A; 3K3U A; 1CP0 A; 1IT2 A; 3ZJN A; 1O1M B; 1J7Y B; 1HBI A; 2D2N A; 3QJD A; 3ZJI A; 5KDQ A; 3ASE A; 1GLI A; 2BKM A; 2MGJ A; 2LH1 A; 4MQC B; 2HHD A; 3UHZ A; 2V1F A; 5CNF A; 2ZLU B; 3S66 A; 1LFY A; 3W4U A; 5KER B; 3UI0 A; 2GRZ A; 2O5B X; 2GL3 A; 3GK9 A; 3O7N A; 2FRK X; 1JP6 A; 3V2V A; 1VXH A; 1Y4P A; 3WTG B; 5CHQ A; 2SPM A; 1LH2 A; 1HV4 B; 2RAO A; 2EKT A; 1QXD B; 1T1N A; 1YEN A; 1C7C B; 1MLK A; 1G09 B; 3WCU B; 3UHH A; 1Y35 B; 3EU1 B; 1HGB A; 1J40 B; 3IXF A; 1LTW A; 5HLQ A; 4U8U B; 4NZI A; 3NFE B; 5JOM A; 3QM5 A; 1YOG A; 4YU3 A; 4F4O A; 3AQ7 A; 1HGC A; 1C7B B; 3WCW B; 1Y4G A; 1Y2Z A; 2HZ1 A; 4H07 A; 5E83 A; 2NSS A; 3QM6 A; 3UGY A; 3PT8 B; 3ODQ B; 1MYF A; 1JL6 A; 3SDN A; 1CIO A; 2D2M B; 2MGE A; 3S1J A; 4NXC A; 4HRT B; 4B3W A; 3UHD A; 2O5S X; 3R5I B; 2VLX A; 1CO8 A; 4ZVA A; 1MTI A; 2ZLX B; 1HDB B; 1JY7 B; 1S5Y B; 1Y83 B; 2MHB B; 5AB8 A; 3VRF B; 4L7Y B; 2LHB A; 1LA6 A; 1BZP A; 1Y5K A; 3ARJ A; 5JDO F; 1MYH A; 112M A; 1YZI A; 1YG5 A; 3WCT D; 3UHU A; 1Y0T A; 1Y7C A; 1Y5J A; 1Y5F A; 1NGK A; 1Y8I A; 1HDA A; 1M6M A; 5EUI A; 1YGD B; 2ZS0 B; 2ZWJ A; 1RVW A; 1O1L A; 2H35 B; 1F5O A; 1ABY B; 1WLA A; 1Y0W A; 1YGF A; 2OH9 A; 1RQ3 B; 2D60 B; 3AQ9 A; 1RPS B; 1YMC A; 4MQH A; 3S48 C; 1YEQ B; 2VYZ A; 3AQ6 A; 4F68 A; 2HBS A; 1OBM A; 5C6E B; 4O4Z A; 1LFT B; 4F6F A; 2W6X A; 1MLF A; 2IG3 A; 5CMV A; 3ZOM A; 4KN3 A; 3FS4 B; 1A4F A; 1N9X A; 1R1X B; 1ECN A; 1BUW B; 5F0B A; 3ARL A; 4M4A A; 1DXV B; 1EBC A; 1J3Z A; 4MBA A; 4OF9 A; 4ROM B; 6HBW B; 1XZ5 B; 1WVP A; 4HSW A; 1U7R A; 3MKB B; 1LFL A; 1O1I A; 1Q1F A; 1MLL A; 1Y0C A; 3HYU B; 1CH7 A; 3TM3 A; 5KKK A; 3UHN A; 3GKT A; 1YEV A; 4DC7 A; 4UZV A; 1CH9 A; 3ZJQ A; 3G4V A; 3QJC B; 1BZ0 A; 1BIN A; 2MGK A; 1A01 A; 3GOU B; 1FN3 A; 3HC9 A; 3GQG B; 1V4U A; 2QMB A; 2SPL A; 2GTL D; 4ROL A; 1MOC A; 2V1G A; 5SW7 B; 5AZQ A; 3LQD B; 1NQP A; 5CNG A; 2QLS B; 1F65 A; 1X9F D; 1Y7D A; 3ZJS A; 3KMF A; 2VEB A; 4WJG 1; 1O1O A; 1GJN A; 3A5B A; 5E29 A; 2FRF A; 1K1K B; 1G0A A; 1O1N A; 1YVQ B; 4KJT A; 1JDO A; 1K0Y B; 3QJE A; 4BJA A; 3CIU B; 111M A; 2ZFO D; 1UT0 A; 1RTX A; 1KD2 B; 1YHU D; 1UFJ A; 3G53 A; 1BZZ B; 1QI8 B; 3M3A A; 2M6Z B; 1YFF B; 1VXC A; 2BK9 A; 1LJW B; 2ZT3 A; 4N7N A; 1MBI A; 3G4R A; 1OR6 A; 4O1T A; 2W72 B; 1GVH A; 1X46 A; 1CMY B; 5CN9 A; 1OUT B; 2MGD A; 2DN2 B; 2W6Y A; 3WCV A; 3HEP A; 1VWT B; 1RSE A; 3GDJ A; 3GQP A; 5CNB A; 1BIJ B; 2VRY A; 4F6J A; 4F6D A; 5HU6 A; 1Y31 B; 3G4U A; 1DTI A; 3BCQ A; 4MQI A; 4WCH D; 1GDI A; 3AT5 A; 2CMM A; 3IA3 B; 3BA2 A; 1HAB A; 3PIA A; 1YEU A; 3G4Y A; 1WMU B; 1HBR A; 4O35 A; 3AT6 B; 2GTL A; 3SDH A; 1MYG A; 3D7O A; 1CBM A; 3UHI A; 4PNJ A; 5EOH A; 1J41 A; 1NEJ B; 1NAZ A; 3B75 B; 4L2M A; 3ECX A; 3PEL A; 3MJU B; 1ECO A; 1A6K A; 1Y4F B; 1HDS A; 2BWH A; 1PBX A; 3UHS A; 1RQ4 B; 1Y4R A; 3WFW A; 4N7P A; 3P5Q A; 5ILP A; 1BAB A; 1BJE A; 3DHR A; 2ZFO A; 1IRC A; 1A0U A; 2Z6N A; 2HBD B; 4N8T A; 1DXD A; 1LFZ B; 1YHU A; 3EOK B; 1R1Y B; 1OJ6 A; 1O1J B; 3D4X B; 1TES A; 1DM1 A; 1MKO A; 1NS6 A; 2VYY A; 1S5X A; 1VXB A; 3WCT C; 1UX8 A; 3M38 A; 2G0V A; 1Y0A B; 1HBH B; 4ZVB A; 2EVP A; 3NMM B; 3TLD A; 3S65 B; 1Y4V A; 2G3H A; 1BZ1 A; 1IOP A; 4NI1 A; 3GKV A; 2D2N B; 3QJD B; 5KDQ B; 1URY A; 3UBV A; 1GLI B; 2O5T X; 2ZST A; 2HHD B; 2MYA A; 3KMF C; 5CN7 A; 2HZ2 A; 3S66 B; 2HZ3 A; 1FHJ A; 1LFY B; 3W4U B; 2ZT2 A; 1BZZ A; 2AA1 A; 1NPG A; 1V4X A; 4GZG A; 4DC8 A; 1Y4P B; 2D6C A; 2QU0 A; 2VLZ A; 3UHE A; 2RAO B; 1T1N B; 1YEN B; 4AVD A; 1IRD A; 1AJH A; 4MQG A; 3HRW A; 4PQ6 A; 2GRF A; 3KUN A; 2HHE A; 1HGB B; 2QFN A; 2R80 A; 4IT8 A; 3RJ6 A; 3GQR A; 4G1B A; 3LB4 A; 5B85 A; 4YU3 B; 3GYS A; 4F4O B; 1HGC B; 2AUR A; 1Y4G B; 2HBC A; 1Y09 A; 1Y2Z B; 1GCV A; 3FH9 A; 2MGL A; 1MNH A; 5E83 B; 3E5O A; 1COH A; 3RJN B; 2R1H A; 1YMA A; 2RI4 A; 1BVC A; 2R50 A; 1UMO A; 2G0R A; 3PI9 A; 4PQB A; 2Z85 A; 2GTL C; 2O5M X; 1X9F C; 1S61 A; 2G0Z A; 3M39 A; 4PQC A; 3PT7 A; 1LA6 B; 1Y5K B; 3SZK A; 1EMY A; 1Y45 A; 3V2Z A; 2ZSY A; 1DKE A; 1YZI B; 2OLP A; 1CPW A; 4JYQ A; 1YG5 B; 1AJ9 A; 5CN6 A; 5HY8 A; 1Y0T B; 1Y7C B; 5HLU A; 2ZFO C; 1HSY A; 2KSC A; 2DXM A; 1Y5J B; 1Y5F B; 1JWN A; 1Y8I B; 1HDA B; 1YOH A; 1YHU C; 5EUI B; 1XZ7 A; 1BBB A; 3QM9 A; 3WFT A; 3PI4 A; 3HF4 A; 1Y8W A; 1MLU A; 1RVW B; 5EE4 D; 2SPO A; 1VRE A; 1F63 A; 1O1L B; 1V75 A; 1Y0W B; 1YGF B; 2ZLW A; 1GDK A; 1HRM A; 1NZ5 A; 3EDB A; 4MQH B; 1FAW A; 3E5I A; 4MAX A; 2ZFB A; 3E55 A; 2HBS B; 2W6V A; 1LFV A; 1IWH A; 1A3N A; 1Y85 A; 1Y8K A; 1JW8 A; 3VHB A; 1LH3 A; 2H8D A; 1H97 A; 3BJ3 A; 4DWT A; 1HHO A; 1I3D A; 1LFQ B; 3MBA A; 3UHT A; 1MLJ A; 1A4F B; 1LUE A; 5JDO D; 1N9F A; 1JP8 A; 4NI0 A; 4M4A B; 2GKN A; 3UHY A; 1J3Z B; 1MNJ A; 1VXA A; 2QSS A; 1J3Y A; 3A5G A; 2ZS1 D; 1LFL B; 1O1I B; 1UC3 A; 1Y22 A; 4OOD A; 2XKG A; 5JGG A; 1Y0C B; 1UIW A; 1CH5 A; 1HCO A; 1MLH A; 4MQK A; 2MBW A; 1OFJ A; 1YEV B; 3VRG A; 1JZM A; 4HBI A; 4TYX A; 2LH2 A; 1BZ0 B; 3KUO A; 1A01 B; 2QSP A; 1FN3 B; 101M A; 2Z6T A; 1V4U B; 5CHR A; 2QMB B; 1XXT A; 3WFU A; 1ASH A; 4ROL B; 4F69 A; 1G0B A; 3R0G A; 1NQP B; 3U3E A; 3UHQ A; 4KMW A; 4NXA A; 4O2G A; 1YE2 A; 1Y7D B; 1C7D A; 3UHW A; 3NL7 A; 5CN8 A; 5D1V A; 1NXF A; 3ONZ A; 1O1O B; 5E29 B; 1G0A B; 1H1X A; 3UHK A; 1O1N B; 3WR1 A; 2DN1 A; 3WCU D; 3QJE B; 1UX9 A; 1MYZ A; 1GCW A; 1SI4 A; 1MBN A; 1FDH G; 4QAU A; 1MLQ A; 2MGM A; 1KR7 A; 4FH6 A; 108M A; 2ZT1 A; 1M6C A; 1HBB A; 3MJP A; 3IC0 A; 3UHC A; 4G51 A; 1W92 A; 3ZJR A; 2QFK A; 1DO1 A; 4N7N B; 3VRE A; 3WCW D; 4MQJ A; 1JF3 A; 2ZSX A; 3WCV B; 2HBE A; 3D1A A; 2AV3 A; 3GDJ B; 3GQP B; 3BJ1 A; 1VXG A; 1MBA A; 2D2M D; 1JL7 A; 5HU6 B; 1Z8U B; 2VYW A; 3LHB A; 3BOM A; 1U7S A; 3PI2 A; 3TM9 A; 3BCQ B; 4MQI B; 1IBE A; 3AT5 B; 2D5X A; 1LFQ A; 1CO9 A; 1HAB B; 2MYE A; 3PIA B; 2DC3 A; 1YEU B; 2V1H A; 1HBR B; 1GDJ A; 1MWC A; 1J52 A; 1MZ0 A; 2GTL B; 1MNK A; 1X3K A; 3HHB A; 3D7O B; 4KMV A; 1Y8H A; 3GLN A; 1UVX A; 1FSL A; 4B4Y A; 1DO4 A; 1J41 B; 1GBU A; 2FRJ X; 3PEL B; 3DHT A; 1J7S A; 1QXE A; 3MVC A; 1XCH A; 1HDS B; 1PBX B; 1L2K A; 1DO3 A; 1CBL A; 2R4Z A; 1Y4R B; 104M A; 4N7P B; 3P5Q B; 1BAB B; 3DHR B; 3DUT A; 5JDO E; 2ZFO B; 2GRH A; 1A0U B; 3WCT A; 4FC3 A; 2Z6N B; 2O5Q X; 4N8T B; 2XKH A; 4HRR A; 2FAM A; 1MWD A; 1JEB A; 1YHU B; 3ORD A; 4ODC A; 2ZSQ A; 1MKO B; 1NS6 B; 4UUR A; 1S5X B; 4ESA A; 1OFK A; 1NS9 A; 1YCB A; 1NZ4 A; 1OR4 A; 2O5O X; 3PI8 A; 1YEO A; 4C44 A; 1Y4V B; 1YDZ A; 1BZ1 B; 4NI1 B; 2OHB A; 3GKV B; 1G9V A; 2PEG A; 5EE4 C; 2EB9 A; 1O1P A; 1MYM A; 1XZ4 A; 2EKU A; 1DWS A; 1XZ2 A; 1OUU A; 1FHJ B; 1BVD A; 2BLH A; 5EET A; 3UHV A; 2AA1 B; 1V4X B; 1LH1 A; 1V07 A; 1A3O A; 1Y4B A; 2QU0 B; 3HXN A; 4IRO A; 3A0G A; 4ILZ A; 5HBI A; 1N9I A; 3WI8 A; 3K8B A; 1VXF A; 2MYB A; 1YE0 A; 1IRD B; 5JDO C; 2BNL A; 4MQG B; 1CH2 A; 2AUO A; 3HRW B; 2HHE B; 2R80 B; 4JAC A; 2MGH A; 4WJG A; 1UFP A; 1DLW A; 3GQR B; 1QSI A; 2ZS1 C; 4X0L A; 3S1I A; 3GYS B; 1VHB A; 3NG6 A; 1CG8 A; 2ZLV A; 2HBC B; 1Y09 B; 1GCV B; 3FH9 B; 1HAC A; 1YHE B; 4XDI A; 1CG5 A; 1COH B; 3QM8 A; 1MLR A; 2WY4 A; 2R1H B; 3OJ1 A; 1CQX A; 2RI4 B; 3OO5 A; 1X9F A; 3PI9 B; 2G0X A; 2PGH A; 1HGA A; 2G11 A; 5ILM A; 1O16 A; 5B84 A; 3O89 A; 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1C7D B; 2GLN A; 1EW6 A; 3NL7 B; 1ABS A; 3IC2 A; 1NIH A; 3ONZ B; 5M3S A; 3WR1 B; 4F6B A; 2EB8 A; 2DN1 B; 4H2L A; 3LB3 A; 1GCW B; 1SI4 B; 1YCA A; 4M4B A; 3D17 A; 2R4W A; 1DWT A; 2HCO A; 2XYK A; 5E6E A; 1NPF A; 1HBB B; 2C0K A; 1YIH A; 3MJP B; 1FSX A; 3IC0 B; 4G51 B; 1ABW A; 3DR9 A; 2NX0 A; 3VRE B; 1QPW A; 1Y7Z A; 4MQJ B; 4MBN A; 3HEO A; 5CNC A; 2HBF A; 2GNW A; 3OZW A; 2HBE B; 3D1A B; 3BJ1 B; 4G1V A; 1C40 A; 1NWN A; 1RTE A; 1YH9 A; 3UH6 A; 1LHS A; 1DLY A; 1XZV A; 1AJG A; 3BOM B; 3G46 A; 1IBE B; 2HBG A; 1YIE A; 3A9M A; 2ZSP A; 4O4T A; 2D5X B; 4H0B A; 2ZLT A; 1M9P A; 2D5Z A; 109M A; 1DXU A; 1MLS A; 4NS2 A; 1MOB A; 2W31 A; 2FRI X; 3OO4 A; 3HHB B; 1MYJ A; 3UGZ A; 1Y8H B; 4XS0 A; 1O1K A; 2GDM A; 1GBU B; 1SPE A; 2E2Y A; 1J7W A; 2AV0 A; 6HBI A; 3DHT B; 1J7S B; 1I3E A; 1QXE B; 1ITH A; 3QJB A; 3BJ2 A; 1MLM A; 1VXE A; 3LB1 A; 2W72 C; 102M A; 2HHB A; 1PMB A; 1Y4Q A; 4HSX A; 3DUT B; 3WCT B; 4FC3 B; 2BW9 M; 4HRR B; 2WTH A; 1QSH A; 1CLS A; 1JEB B; 1MTJ A; 1URV A; 1XYE A; 4ODC B; 1HLB A; 4N7O A; 1SDL A; 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