1C7PA

Crystal structure of mutant human lysozyme with four extra residues (eaea) at the n-terminal
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
133
structure length
133
Chain Sequence
AEAKVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRYWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYSOZYME
publication title Effect of extra N-terminal residues on the stability and folding of human lysozyme expressed in Pichia pastoris.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 52
structure length 133
sequence length 133
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2000-02-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1c7pA00
207LA 1IWUA 1LHHA 3A3RX 4XJHA 1HNLA 1AZFA 1JKCA 5IELA 2H9KA 2YSSC 4DYGA 5ILCA 4H93A 3HBEX 2D4IA 1LAAA 3CT5A 4B4EA 154LA 4EMNA 1TEWA 4GLVA 4YEMA 2Z12A 1YAMA 1LHIA 2DKVA 2DQDY 1NDMC 5HNCA 2LHMA 1JIYA 1VAUA 2LYMA 2Z2EA 3A94A 4NIJA 4WLTA 5D5CA 5LAFA 3WVYA 5APCA 5KKIA 1YAPA 2HEEA 1JPOA 1LHJA 1LPIA 1QUTA 3TXBA 2XBSA 4QY9A 6LYTA 4ET8A 4G4HA 1LZSA 5L9JA 5DLAA 3WL2A 1GF0A 3D9AC 1UIDA 1SQ2L 2IHLA 4UWUA 5LVHA 4NHQA 4PGJB 1WQOA 1BB3A 1LZTA 4OOTA 3TXEA 4MCKA 2GV0A 3A92A 3E3DA 1GB6A 4WLDA 3ZEKA 1XSFA 1C43A 6LYZA 5B1GA 1LJHA 1IP5A 1GFRA 1KXXA 1GB7A 4NGZA 4NG8A 5KKJA 1WTNA 1D0LA 3P4ZA 1JEFA 1NHEA 1N4FA 1REZA 1BB6A 3A93A 4RW1A 1JTOL 4WM5A 1LYYA 5KXWA 1LOZA 3CSRA 1XGRC 1KIRC 3HBHA 1GD6A 4H9IA 1GFHA 2C8OA 5KXRA 2MEBA 4HV2A 4H9EA 2A7FA 2IFFY 1QTKA 4HTKA 5LYTA 2F4GA 5E4PA 4G4CA 2MECA 4WM1A 4XJDA 1HFZA 2DQAA 4MR1A 4XENA 1HEWA 1I20A 1W08A 5APFA 3WPJA 1GAYA 1LSPA 5F81A 5LAGA 4NG1A 1DI5A 1REXA 3K3TA 1MLCE 4HJYA 4HV1A 2I25L 2YBMA 3MGWA 5LYZA 4NY5A 1FBIX 1QSWA 1UCOA 1RFPA 3WUMA 5KXXA 1GF8A 3OK0A 4H9AA 4RW2A 1LZ1A 2BQNA 5KXOA 5LVJA 3A6BY 4OWAA 4LYZA 3A34A 2CJLA 4YENA 1LMPA 4NWHA 3WH1A 1LSCA 8LYZA 4WL7A 1BWJA 2F30A 1B0DA 1IR8A 1JKAA 2BQCA 4N0JA 4WOAA 1IOQA 5AMYA 5I54A 1HFYA 4I8SA 1B7MA 1XEKA 1REYA 2Z2FA 4YEOA 2FYDA 1F6SA 5HQ1A 1D9UA 4DD3A 1JISA 4A7DA 4H92A 1LJ4A 1G7LC 3B6LA 5B05A 4YM8A 4X3BA 5LXWA 1LMTA 1TAYA 1DXJA 4LT3A 2LYZA 3B0OA 4AXTA 1YIKA 1YL1X 4PHIA 4CFOA 2CDSA 2LYOA 3QE8A 4H90A 2ZIJA 2G4QA 3J6KA 1GFAA 1BQLY 1NQIA 1NBZC 1C7PA 1QSAA 1KXYA 2BPUA 4R0FA 1CJ8A 3WMKA 4H8XA 1QQYA 4HSFA 1IC5Y 1FLQA 3CB7A 1LJEA 3WYHA 1GB2A 1OUAA 1LSDA 5C6JA 1IR9A 2PC2A 4DDAA 2FYCA 1A4VA 1CKDA 4UWNA 4WO6A 4ZEEA 2BQFA 4NGJA 1GBSA 3F6ZA 1CKFA 2C8PA 1LZCA 7LYZA 1UIEA 2DQJY 4NEBA 1B7QA 4NGIA 1QTEA 2W1LA 3WUNA 4HP0A 1JUGA 5JENB 1ALCA 1UICA 1LYOA 1B5XA 1W6ZA 1IWTA 1VDQA 1VATA 4B4JA 2BLYA 4NGOA 1F6RA 1P2CC 3P68A 3W6BA 2MEDA 1C08C 1IVMA 2HECA 2W1MA 9LYZA 1QDTA 3WVXA 3B0IA 4NHPA 1IP2A 3WU9A 4B0DA 5I4YA 1QDRA 2H5ZA 1KIQC 1RE2A 4GCCA 3P64A 5HMVA 4ETDA 1B7RA 3CT1A 1JJ1A 4H91A 4OWEA 4TTDA 1LZRA 5HLLA 1VDPA 1QIOA 1D6QA 1FLYA 2Y8PA 4NHTA 1EL1A 2EQLA 1OP9B 5L3IA 2D4JA 1UIFA 1XEJA 2RSCA 2I26L 1OUBA 2MEEA 2YVBA 3QY4A 1FDLY 3ATOA 4ET9A 1GEVA 1IC4Y 1GB9A 5FELA 5I53A 4XYYA 1JJ3A 1DPXA 2D91A 5HMJA 1WQRA 4XJGA 1OUDA 3G3AB 1NKHA 1DQJC 1CKHA 2ZYPA 1T6VL 1B5UA 4QGZA 2MEHA 4P2EA 1CJ6A 5LYMA 1LZAA 1JKDA 1XEIA 3AZ6A 2FBDA 4N1EI 5FHWA 1LZ4A 3EMSA 1VDSA 3EO5A 4N1CC 1J1XY 2Z19A 1BB5A 1D0KA 3WULA 4NGYA 2HEFA 193LA 4WM2A 2MEGA 1GF9A 1IWZA 1GB3A 4TSBA 4B49A 3A3QA 3CQLA 4DD0A 1NF5A 4CFPA 1BVXA 1GDXA 2HEDA 4XN6A 1UIAA 1GFGA 1RCMA 1J1OY 1GFTA 4CHXA 3QNGA 2D4KA 4LYBA 4DD7A 1LZEA 5J7CA 4ETEA 1VDTA 2NWDX 2YDGA 1LZ6A 4N9RA 5E9RA 1REMA 3EBAB 4J1AA 4DD1A 1D0MA 1VEDA 1E8LA 4WM3A 4HPEA 5KXMA 2ZWBA 3VWOA 3ULRA 5APDA 1IP7A 1F0WA 1IO5A 1LSYA 132LA 5LVKA 1WQMA 3RT5X 4E3UA 3TXKA 1LMCA 2DQFC 1GFVA 2FBBA 4KL7A 4U3XB 1LJKA 5K7OA 1LZDA 1IOSA 2AUBA 2DQHY 1G7JC 1ZMYL 3OJPA 5DN4A 3WW6A 4G4BA 2MEIA 1HELA 3N9EA 1UBZA 4ML7A 4PRQA 1KXWA 2YBNA 1V7SA 4HJZA 1CJ7A 3RW8A 1FKVA 1HEQA 3TXIA 1WTMA 2BQEA 2XBRA 4KPMA 1HHLA 5KXKA 2WARA 1GBXA 1LYZA 4TSCA 1DPWA 4R6CA 1GWDA 1IY3A 3B72A 4M6DA 1YANA 1WQNA 1B5ZA 5KXPA 3WW5A 1B7OA 1I56A 1PS5A 1XGQC 5B59A 1HMKA 4HJVA 1XGPC 2BAAA 2Z18A 4PPOA 5LINA 1BHZA 3J4GA 133LA 1DKKA 1UIBA 2DQCY 3KAMA 1IC7Y 4YF2A 1LMNA 4NSJA 1MELL 1LJGA 4DD9A 1GE3A 4HTNA 2EIZC 1B5YA 3SP3A 3WXUA 2HU3A 1HEPA 1BGIA 5LIOA 1G7MC 4ETCA 4H9BA 1G7IC 4OWCA 1GE1A 4PRUA 4XJIA 4LFPA 5LVIA 4GCDA 3N9CA 4NWEA 5FCPA 3ZVQB 4XADA 4WL6A 3WU8A 4GCFA 1JTPL 1NBYC 1FLWA 3RU5A 1SLYA 1YKZX 4FDYA 4D9ZA 1LJFA 4KXIA 1AT6A 1HFXA 5FEKA 1LJNA 4G49A 3W6DA 2ZYCA 4TX7A 1DZBX 5B07A 1B2KA 3HFMY 1IY4A 3AGHA 5FSTA 1OUHA 1CJ9A 4QEQA 4M4OA 4NGKA 1GBYA 1LSFA 4KT3A 1IP1A 4IASA 3M3UA 3P66A 5KXSA 3WXTA 5IHGA 1ZVHL 3WUAA 2ZNWY 208LA 1LSGA 4W94A 4ETBA 134LA 3A8ZA 3AYQA 1GDWA 5LA8A 3W6EA 1AM7A 4L41A 1LSAA 2G4NA 1JWRA 1B9OA 3D3DA 1FLUA 1LMQA 4J1BA 4WLXA 1LSNA 1GPQC 1XGUC 4H9FA 4LT1A 1EQEA 1EQ4A 1LJ3A 4Z46A 2DQIY 3BKHA 3ZVQA 1HSWA 4C3WA 4EOFA 4LGKA 3T6UA 3LN2A 3A91A 5LA5A 3FE0A 1LSZA 1B7PA 4GN4A 2YBLA 1LSMA 1LHLA 1YQVY 4NSIA 5IDDA 1HERA 4GLAA 5A3ZA 3AJNA 4LYOA 1GF7A 1B7LA 3AZ5A 3RZ4A 1ZVYB 1HMLA 1OUGA 3IJVA 2HUBA 2ZIKA 1CNSA 4WG7A 3AW7A 1GAZA 2HEBA 4ZIXA 1GF5A 1IP4A 1ZV5L 1JITA 1GEZA 4W96A 4LFXA 3A67Y 1YKYX 4GCEA 5B1FA 4LT2A 1KIPC 1GBOA 3A90A 2Z39A 5DL9A 1EQ5A 1LHKA 1XFPL 4NGVA 4B1AA 4PJ2C 2W1XA 5D5FA 4LYTA 1GFKA 4DDBA 5HNLA 1IOTA 1BB4A 4WM6A 1FN5A 5FDJA 4OWBA 1JKBA 2I6ZA 4NSGA 4BAPA 1B7SA 1IP6A 3TXFA 4CJ2A 5II3A 2HTXA 3IWRA 5KXLA 3EXDA 1IP3A 4OOOA 4HPIA 1GXV2 2BQBA 3A96A 4NFVA 4O34A 3TMWA 5B06A 1YROA 4B4IA 2CGIA 2W1YA 1LMOA 4Z3MA 4H94A 1HSXA 2BQLA 1F10A 4LZTA 1GE0A 4IJ4A 4NGLA 4TUNA 3AB6A 3M18B 1UIGA 3W6CA 135LA 4LT0A 3N9AA 1TCYA 4BS7A 1GBWA 3WPLA 5I4WA 2Z38A 4N5RA 4UWVA 1HEMA 2ZQ3A 4G9SA 4NHSA 1UIHA 1WVVA 1GB0A 4J0LA 153LA 1DI4A 1OQMA 1IIZA 1LTMA 4WLYA 2H9JA 3GXRA 1LYSA 5KXNA 3GXKA 1LKRA 3WPKA 3TMXA 1BVKC 1LJJA 1RJCB 3LZ2A 4DDCA 1G7HC 1QUSA 4BAFA 2BQHA 2BQMA 2LZTA 2XJWA 3W6FA 4RLNA 5KXYA 1LHMA 2BQIA 1GXXA 1IEEA 5I4XA 1Z55A 3A95A 3G3BB 5F9XA 3TMVA 1TDYA 4DC4A 1IWWA 2BQOA 2VB1A 5LVGA 3A6CY 3IJUA 1O23A 2F4AA 1C10A 3T36A 4YOPA 5KJ9A 1CKGA 2XTHA 4H9HA 1UC0A 4Z41A 5C6LA 3AZ7A 1YL0X 1OUCA 5EBHA 1UACY 1WVUA 2DQGY 2B5ZA 2ZNXY 2YBJA 1GE2A 5L3HA 1LZ9A 1J1PY 2Q0MX 1IWXA 1LMAA 3AZ4A 2BQAA 3LZTA 4HTQA 1GF6A 3LYOA 4MSTA 1LJIA 5F14A 1BWIA 2ZQ4A 1UA6Y 5KXZA 5A3EA 5I5QA 5F9UA 4AGAA 2EPEA 3CSZA 3LYTA 1LZ5A 2DBTA 1YAQA 3AGIA 1T3PA 3BKVA 1LCNA 3HBDA 4IATA 1IR7A 1B5VA 4TWSA 1IWVA 4FJRA 4XJFA 2X0AA 3RNXA 2BQGA 1YKXX 1C45A 4LYCA 4ZFPA 5APEA 5M1YA 4QDNA 1HF4A 1GFUA 3B0KA 4GN3A 4OW1A 1I1ZA 3CSQA 2MEAA 1GFEA 2HEAA 2CWIA 5C6IA 1LZGA 4WO9A 4DWXA 3LHMA 1YILA 1AKIA 2N5ZA 2YBHA 5KXTA 1IX0A 5DM9A 4OWHA 2BQJA 4WM4A 3W6AA 5ILFA 1NWGA 1B7NA 4RLMA 1C46A 3TXJA 3TXGA 4BADA 2BQKA 1HC0A 1NMMA 4C5FA 4RDSA 4GCBA 1LZ8A 1FKQA 4NHIA 1IORA 3TXHA 4N8ZA 4I0CA 1OUJA 2BLXA 5F16A 2BQDA 4H9CA 3AGGG 1GBZA 1OUEA 3LYMA 3P65A 4XJBA 2YBIA 3WU7A 1LSEA 1JSFA 1OUIA 1JHLA 1JJ0A 2D6BA 4ETAA 1GHLA 1OUFA 1YAOA 1DI3A 4H8ZA 1LZNA 4ANRA 1IOCA 1XGTC 1GF4A 1JTTL 2HU1A 1GE4A 5KY1A 1WQQA 4H8YA 1GFJA 2F2NA 1B5WA 4J7VA 2LZ2A 1IWYA 1LZYA 1WQPA 5DN5A 2MEFA 1TBYA 1H6MA 194LA 2EKSC 1AT5A 2Z37A 4DT3A 1HENA 1UUZC 2G4PA 1GB5A 2A7DA 3TXDA 4WMGA 1BWHA 2DQEY 1CKCA 2ZILA 4GN5C 3CT0A 3ATNA 3AW6A 4H1PA 1A2YC 1NDGC 1BB7A 1PZYA 1HEOA 1D6PA 5T3FA 1INUA 3FI7A 1RI8B 4II8A 4NSHA 1GB8A 1H87A 1VFBC 4CGEA 1GF3A 1LSBA 4LYMA 3W3EA 1V7TA 3LYZA 4WG1A 4Z98A 3TMUA 1LKSA 1JSEA 1LZBA 1DKJA 4NGWA 4DD2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IWUA 3A3RX 1AZFA 1JKCA 5IELA 4DYGA 143LA 1C6IA 2Z12A 1OVKA 1LHIA 2DKVA 254LA 4NIJA 3HTBA 5D5CA 1QT3A 5KKIA 2OU8A 177LA 1LI3A 5DLAA 3D9AC 1L29A 5LVHA 1C6PA 1BB3A 181LA 3E3DA 3HT9A 1L44A 4NG8A 247LA 2ANVA 1BB6A 1JTOL 4I7KA 5KXWA 3CSRA 3DN2A 5KXRA 2C8OA 2A7FA 1QTKA 1L84A 5E4PA 4IAPA 4XJDA 1L51A 1HFZA 4MR1A 1I20A 123LA 1P2RA 3C7ZA 5LYZA 2RBPA 4NY5A 1QSWA 4H9AA 4RW2A 3HH3A 5LVJA 1CU0A 1QSBA 4LYZA 2CJLA 4WL7A 4N0JA 1IR8A 2BQCA 5HQ1A 5B05A 3B6LA 1G7LC 4LT3A 1TAYA 1DXJA 1L04A 1YIKA 1YL1X 1KS3A 4CFOA 226LA 1OYUA 2ZIJA 1GFAA 1L07A 1NBZC 1C7PA 218LA 246LA 1CJ8A 1L31A 3WMKA 1QQYA 3SB9A 113LA 3DKEX 1CKFA 1LZCA 1UIEA 2B75A 214LA 2W1LA 4HP0A 1JUGA 1L40A 1ALCA 1UICA 4AQNA 1P2CC 2MEDA 1IVMA 2HECA 2W1MA 3JR6A 1QDTA 3P64A 3DN0A 2L78A 2D4JA 1FDLY 248LA 3ATOA 1IC4Y 1GB9A 4XYYA 1DPXA 1L33A 1CKHA 1T6VL 5LYMA 4OO9A 5FHWA 1VDSA 1G0KA 1J1XY 1BB5A 4WM2A 4B49A 5ILFA 1IWZA 1GB3A 3GUPA 4DQ5A 4CFPA 3D4SA 1GFGA 2OTZX 1GFTA 2B6YA 4I7QA 4N9RA 5E9RA 4E97A 3EBAB 1E8LA 4WM3A 1LSYA 3RT5X 1IO5A 5LVKA 1L82A 1L87A 4LZMA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 207L A;  1IWU A;  1LHH A;  3A3R X;  4XJH A;  1HNL A;  1AZF A;  1JKC A;  5IEL A;  2H9K A;  2YSS C;  4DYG A;  5ILC A;  4H93 A;  3HBE X;  2D4I A;  1LAA A;  3CT5 A;  4B4E A;  154L A;  4EMN A;  1TEW A;  4GLV A;  4YEM A;  2Z12 A;  1YAM A;  1LHI A;  2DKV A;  2DQD Y;  1NDM C;  5HNC A;  2LHM A;  1JIY A;  1VAU A;  2LYM A;  2Z2E A;  3A94 A;  4NIJ A;  4WLT A;  5D5C A;  5LAF A;  3WVY A;  5APC A;  5KKI A;  1YAP A;  2HEE A;  1JPO A;  1LHJ A;  1LPI A;  1QUT A;  3TXB A;  2XBS A;  4QY9 A;  6LYT A;  4ET8 A;  4G4H A;  1LZS A;  5L9J A;  5DLA A;  3WL2 A;  1GF0 A;  3D9A C;  1UID A;  1SQ2 L;  2IHL A;  4UWU A;  5LVH A;  4NHQ A;  4PGJ B;  1WQO A;  1BB3 A;  1LZT A;  4OOT A;  3TXE A;  4MCK A;  2GV0 A;  3A92 A;  3E3D A;  1GB6 A;  4WLD A;  3ZEK A;  1XSF A;  1C43 A;  6LYZ A;  5B1G A;  1LJH A;  1IP5 A;  1GFR A;  1KXX A;  1GB7 A;  4NGZ A;  4NG8 A;  5KKJ A;  1WTN A;  1D0L A;  3P4Z A;  1JEF A;  1NHE A;  1N4F A;  1REZ A;  1BB6 A;  3A93 A;  4RW1 A;  1JTO L;  4WM5 A;  1LYY A;  5KXW A;  1LOZ A;  3CSR A;  1XGR C;  1KIR C;  3HBH A; 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 1HF4 A;  1GFU A;  3B0K A;  4GN3 A;  4OW1 A;  1I1Z A;  3CSQ A;  2MEA A;  1GFE A;  2HEA A;  2CWI A;  5C6I A;  1LZG A;  4WO9 A;  4DWX A;  3LHM A;  1YIL A;  1AKI A;  2N5Z A;  2YBH A;  5KXT A;  1IX0 A;  5DM9 A;  4OWH A;  2BQJ A;  4WM4 A;  3W6A A;  5ILF A;  1NWG A;  1B7N A;  4RLM A;  1C46 A;  3TXJ A;  3TXG A;  4BAD A;  2BQK A;  1HC0 A;  1NMM A;  4C5F A;  4RDS A;  4GCB A;  1LZ8 A;  1FKQ A;  4NHI A;  1IOR A;  3TXH A;  4N8Z A;  4I0C A;  1OUJ A;  2BLX A;  5F16 A;  2BQD A;  4H9C A;  3AGG G;  1GBZ A;  1OUE A;  3LYM A;  3P65 A;  4XJB A;  2YBI A;  3WU7 A;  1LSE A;  1JSF A;  1OUI A;  1JHL A;  1JJ0 A;  2D6B A;  4ETA A;  1GHL A;  1OUF A;  1YAO A;  1DI3 A;  4H8Z A;  1LZN A;  4ANR A;  1IOC A;  1XGT C;  1GF4 A;  1JTT L;  2HU1 A;  1GE4 A;  5KY1 A;  1WQQ A;  4H8Y A;  1GFJ A;  2F2N A;  1B5W A;  4J7V A;  2LZ2 A;  1IWY A;  1LZY A;  1WQP A;  5DN5 A;  2MEF A;  1TBY A;  1H6M A;  194L A;  2EKS C;  1AT5 A;  2Z37 A;  4DT3 A;  1HEN A;  1UUZ C;  2G4P A;  1GB5 A;  2A7D A;  3TXD A;  4WMG A;  1BWH A;  2DQE Y;  1CKC A;  2ZIL A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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