1C91A

Endo-beta-n-acetylglucosaminidase h, e132d
Total Genus 96
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
96
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
KQGPTSVAYVEVNNNSMLNVGKYTLADGGGNAFDVAVIFAANINYDTGTKTAYLHFNENVQRVLDNAVTQIRPLQQQGIKVLLSVLGNHQGAGFANFPSQQAASAFAKQLSDAVAKYGLDGVDFDDDYAEYGNNGTAQPNDSSFVHLVTALRANMPDKIISLYNIGPAASRLSYGGVDVSDKFDYAWNPYYGTWQVPGIALPKAQLSPAAVEIGRTSRSTVADLARRTVDEGYGVYLTYNLDGGDRTADVSAFTRELYGSEAVRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Streptomyces plicatus
publication title Mutations of endo-beta-N-acetylglucosaminidase H active site residues Asp130 and Glu132: activities and conformations.
pubmed rcsb
molecule keywords ENDO-BETA-N-ACETYLGLUCOSAMINIDASE H
total genus 96
structure length 265
sequence length 265
ec nomenclature ec 3.2.1.96: Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase.
pdb deposition date 1999-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1c91A00
2YL5A 1EIBA 2GVYA 2J7BA 1CWYA 1WAWA 4NRRA 3VIMA 4UFJA 5BYWA 1E71M 1MFVA 2XYLA 3OIHA 4PSPA 1ZL1A 5A1AA 1U2YA 1NP2A 1CNVA 1AQMA 3VGGA 1XRVA 1NWUA 2E9LA 2YDQA 3EDEA 5GNZA 1MXGA 3WH9A 1H4PA 4JKMA 4J27A 4AIEA 2C7FA 3RM9A 1FFQA 4IUGA 1X1NA 1ZJBA 1W2VA 3UG3A 1GZJA 3LPGA 3MUZ1 5A6KA 1GQLA 3UR7A 4ATWA 3ZMRA 3S6TA 1KXHA 4AEFA 2JIWA 1CPUA 1NOFA 4IPNB 1Q6DA 1SR0A 3AOFA 3G6LA 3M7SA 1QW8A 4UQ9A 3WMSA 4WKAA 1KXVA 4UQBA 3PZUA 1PZ3A 2W91A 5D9OA 5IXEA 1JYNA 5M03A 2XSAA 2EQDA 1J10A 2WMFA 4JCLA 4U3CA 1CTNA 3ZJ7A 1KCLA 1BG9A 2VR4A 1NWSA 1L8NA 2A3BA 2J75A 3HJEA 3SCOA 2V3GA 4MNLA 1JZ5A 5CGMA 3KZSA 4DWSC 2BS9A 2XUCA 2HISA 3WH8A 4P8VA 2X1IA 3ECQA 1HX0A 2RGLA 1V3LA 3NSNA 5A95A 2D23A 3A4WA 1XD0A 2CESA 3WDPP 1H5VA 1EQCA 3T08A 3SCWA 3CMJA 1VBRA 4MAVA 3VKKA 1MQQA 1PX4A 1M7XA 3T2QA 1MW3A 1FP8A 1PIGA 2D3LA 4LGXA 1UKPA 3VX1A 4WSJA 1UR9A 2VCCA 2WVTA 3QOKA 3SCQA 3BH4A 3ZSSA 3W6LA 4BQ4A 1QBAA 1ZS2A 1F4AA 2D20A 4DWSB 3VD3A 1DHKA 3WQ8A 4HU8A 4DWSD 4LXFA 4AYSA 2BY2A 1DWIM 3FY1A 5ECUA 4P7QA 1JZ2A 1JDAA 1HJUA 1KR1A 4H8UA 4HTYA 2V3DA 2J7DA 2WHMA 5AYIA 1CIUA 2VX7A 5C70A 1LF1A 1BSIA 2CKRA 4E4PA 5A6LA 2VMFA 3QHOA 4P8XA 1CGVA 2XWEA 1R86A 1JFXA 1OBAA 1WZKA 1WZAA 5A8MA 4CD4A 4WLCA 1PX8A 1PBGA 4M1RA 3N17A 1EO7A 3SUSA 3B8SA 3NUKA 4M24A 1GQJA 1TMQA 1W1YA 3QOMA 1UWIA 4HZ7A 4GI8A 4PUDA 1H1NA 1UQZA 3W81A 2Z1SA 4BZYA 2YLLA 4ZEPA 3PZNA 2CITA 1MW2A 5BXSA 4BQ2A 2CHOA 4P8WA 3B9DA 3GNRA 4EAMA 7A3HA 2DT1A 1PPIA 4M80A 1J12A 3I3EA 4PSRA 4MPKA 4UCFA 2PB1A 1HVXA 2DSVA 4OUEA 1UHVA 2WZEA 3WQ4A 4E8DA 2CKSA 1GORA 1GOKA 1JF5A 2BY1A 1E5NA 5I0DA 1H41A 3OLDA 4JIEA 1TCMA 5M17A 3AS1A 1I75A 1UD5A 1KR0A 3OLGA 2GJXB 3QGVA 4K68A 3GM8A 5EFDA 3K8MA 3K4DA 1FP9A 3BAXA 3AZRA 5AC4A 3UETA 9CGTA 1LJYA 1GJWA 2PWFA 1O7AA 4HP5A 2XVGA 4GXPA 3RM4A 3RO8A 2WC4A 1E6ZA 3AIRA 2C0HA 4TXEA 2Q8XA 1UD6A 2DSKA 2QF8A 5D8WA 4XB3A 4PMYA 4JFVA 4R5EA 3MKKA 1EDQA 2MANA 1QI0A 4IM4A 5A8NA 4BCEA 5ABGA 1BYAA 4WKFA 4ZENA 1J0ZA 2A3HA 4W8LA 5HPOA 3WFLA 2DEPA 3ZJ8A 3BMWA 4KMQA 3WDRA 3BGAA 2PC8A 3WDQA 4UFMA 4F8XA 1JD7A 4P8UA 1MYRA 2WK2A 2Y2WA 3AMDA 2WPGA 2F8QA 3EBVA 5BROA 2G41A 2E40A 3VM5A 1M04A 3VX0A 1W9VA 1HVQA 5HBFA 4MDOA 1AMYA 2YDRA 1V02E 1QI3A 2XG9A 2GJRA 1Z32X 1VAHA 1TVPA 4TVUA 4F9JA 1TVNA 1B3ZA 4CU7A 3PZQA 1TE1A 1UH4A 4HA4A 1WDRA 3BCFA 1E6RA 2XM1A 1UG6A 1R8LA 1K9FA 5JIPA 1ISYA 2UY3A 3T0BA 1KGUA 2GSJA 1C3FA 4AD2A 3AS2A 4OJYA 3T0DA 2F2HA 1LLOA 3WQWA 3VU2A 4MNJA 3GZAA 1W91A 4FLSA 3FAXA 3VIGA 3VDCA 1E9LA 1O6IA 2D24A 1OGBA 3RPMA 1XSIA 2AAAA 1JI2A 4WK9A 4Y7EA 2Y5EA 3NIYA 1DWAM 2WAGA 3NJ3A 4N0RA 2VCBA 2VURA 2OYMA 1V08A 3ALGA 1JD9A 2JFEX 3I3BA 4PMRA 1VIWA 3VGDA 3WELA 1V3IA 6A3HA 3F5KA 1E3ZA 3SCSA 1ISWA 1BTCA 2ZX7A 2VZOA 1ZU8A 1HKJA 3EMQA 1BF2A 4D72A 3ZT7A 2CIPA 1BVZA 1J0JA 1PEZA 3UEQA 2E8YA 3VD5A 5A8QA 3N04A 3MSGA 1E3XA 3ARTA 1YHTA 1ZBKA 6CGTA 4J3WA 4L4OA 2ZE0A 4DWSA 3W29A 5IFPA 1UUQA 1CECA 4HMCA 1IZJA 5D8ZA 3GH7A 3CHDA 2OWCA 3ZT6A 4GINA 3SUWA 2ZX5A 4CKQA 3W38A 1NARA 3W37A 4U3AA 3WKZA 5JBDA 3KL5A 3WEOA 1XYZA 4XUYA 2WCSA 4GQQA 2WHLA 1LL4A 4IPLA 2GFTA 2BY3A 3EYPA 4D6IA 4FLQA 4UTFA 4A3HA 1DTUA 2FH8A 4EK7A 2XIIA 2VZTA 4AC1X 1UR1A 3L4VA 1V6UA 1WDPA 2VC9A 1KB3A 4GIAA 1KBKA 1KGXA 3CIVA 3WNKA 2B31A 5CLTA 5EB8A 3PTQA 4YPJA 4D6HA 4OOZA 4MTVA 3EDDA 4Q22A 3GNPA 1LL7A 5CPQA 1E6PA 1LQ0A 2J62A 4FK9A 3CUHA 2EEXA 1FH8A 2VT0A 2ZOXA 4C7DA 4CD7A 4DUXA 4U5IA 1M01A 3ZSTA 4UOZA 4B9YA 4MJ2A 1UKOA 2CYGA 1W3LA 2CHNA 3NSMA 1VFMA 5BXTA 1EXPA 1U33A 3IJ8A 3CUJA 1MXDA 5CGTA 1J01A 1GVIA 4AD3A 5E0CA 1OSEA 2VCAA 2XVLA 1NWTA 3AHXA 2GJXA 3LPFA 4FF5A 3RILA 3I3DA 4UFLA 2FHFA 1VEPA 1MWOA 1L0PA 3OB8A 3ALFA 3VGHA 5LYRA 3WH7A 1QBBA 5DF0A 4QLKA 3EDFA 2E8ZA 1ZBVA 2J8FA 5A6AA 4URIA 2FHBA 3N12A 5I5RA 4LQ1A 2J74A 1PAMA 3BSHA 1VJZA 2CERA 1J0IA 1W3KA 1IT0A 4J3TA 1WDSA 5CLWA 3BMVA 3NSXA 1JZ6A 3AI0A 4LYRA 4P7NA 4GI9A 2ZXBA 3PN8A 4AZ5A 4QFUA 1H0GA 1UQYA 5KZ6A 1PIFA 2JEPA 3GXMA 4U31A 2ESCA 2QPUA 1GJUA 4A4AA 4D1JA 2V3EA 4N42A 2OYKA 4JFSA 3WD1A 2VZUA 2IUZA 2WKGA 5D4YA 2XVPA 1SYTA 4HA3A 3CHFA 4XZWA 3SIMA 2OWXA 1M03A 8A3HA 4UFIA 3A3HA 5JBFA 1CLXA 1QHOA 2EPKX 2J79A 2QHAA 3O9NA 2CBVA 4WIWA 4LYPA 2W67A 2XTKA 1D7FA 3AZTA 2XVKA 4D71A 1UH2A 1CYGA 3GDBA 3AYSA 2G3NA 1QW9A 3AFBA 3PTKA 1DWGM 1V0NA 3VNZA 4UQEA 4UOJA 2VRJA 1WPCA 3UR8A 4S3JA 4F66A 1UKSA 2WZHA 1E72M 1UD3A 3RM8A 2O9PA 3NCOA 4GZIA 4BF7A 3DYOA 5ABFA 2C8NA 2G3IA 2EPMX 2DSWA 1HKIA 1HF6A 3VGEA 4AZGA 4W7WA 4HOXA 4LYQA 2XFFA 4W93A 2D1ZA 1B3WA 1E6QM 3ARPA 5I24A 1R87A 4Q7NA 2UY4A 2WW5A 2BY0A 5HNNA 2BXYA 3HMCA 1UR8A 4V2XA 2VJXA 3WNLA 1HN1A 4Z2KA 3CMGA 1NOUA 1HKMA 2JF7A 1ODUA 1HNYA 2E9MA 4AD5A 3K4AA 1E56A 3AROA 1V03A 4PMZA 2WLZA 5IFTA 1AQ0A 4V28A 1BPLB 1JAKA 4W85A 1KGWA 3WL0A 2CBJA 4P7OA 4RL3A 1EQPA 2E9BA 3BSGA 4OZOA 3NDYA 2EPOA 1UA3A 4TX8A 3AMCA 4HMEA 3WEZA 4PMOA 2V3FA 2J7HA 2YDSA 4AZIA 3TTOA 2EPNA 2XFYA 3S2CA 3ARZA 2ZUVA 3AXHA 1E4IA 1KQZA 4WJXA 3SUUA 3IJ9A 4MADA 1RP8A 2VZSA 4CGTA 2V5CA 4B15A 3VGBA 3II1A 2J4GA 4P7LA 1OIFA 1DWHM 2G8ZA 2CBUA 1QNSA 1QI5A 3VDHA 4EKJA 2DGAA 1ZBCA 2PWHA 3BLPX 4JHZA 4HA1A 4HPGA 4PMQA 3ZJKA 1V3MA 2DSZA 3VVGA 2DT0A 3PZIA 1GOIA 5E6ZA 2J8GA 1VRXA 2XSBA 3AJ7A 2HVMA 3ARUA 1JAEA 3POCA 1CXLA 1J11A 1GONA 4H7VA 3THCA 2WSKA 1J0KA 4HOZA 3WQVA 5IHSA 1AQHA 4MAZA 4W84A 2BNJA 1GCYA 3OZPA 2XIBA 4MB1A 3QR3A 3WN6A 4BQ3A 5AC5A 1UKTA 2ZUUA 2BVYA 3MU7A 2CBIA 3VPLA 1UOKA 4M29A 1JNDA 3W4RA 3GXFA 1B90A 2X05A 5DEZA 3PZVA 2X0HA 1BYBA 4Z2IA 7TAAA 3AIWA 5C8BB 1B1YA 4PBGA 1KXQA 3WF2A 2GDVA 1E4NA 1EH9A 2W4XA 2NT0A 4J7RA 3BLKA 2J47A 5F7UA 1W9UA 1B30A 4AIUA 1J18A 2ZXAA 5D9PA 4JL2A 1XCWA 2PBGA 3SCNA 1LWHA 3GNOA 1HJVA 4OOUA 3VMPA 1K9EA 5A2AA 3RMEA 3GTNA 4L4PA 1W1VA 1HP4A 1OCQA 5ABEA 1G1YA 1TUXA 5I79A 3BC9A 3WQ6A 1G9HA 2ZX8A 4GI6A 1ZB5A 2VO5A 3DECA 5FL0A 1E0WA 4HPHA 3WF0A 1V0MA 5E9AA 2PWGA 1OD0A 2XWDA 3AHVA 2ZUNA 1G01A 4TVDA 1E1EA 1HL8A 3KE0A 1HIZA 2WCGA 1WP6A 2JALA 2FGZA 2WMGA 4GPNA 1BGGA 1C7SA 1ZBWA 3DC0A 2D22A 1GUVA 2UY5A 3WFZA 2WVVA 3GBEA 1H09A 3WUGA 4KRUA 1XH0A 5CPSA 4CVUA 1E4LA 1UD4A 1JF6A 2WC3A 3OGRA 3AYRA 3IK2A 2ZWZA 3VD4A 5FIPA 1LG1A 1C8XA 1CGYA 3HU7A 2GUYA 3O6AA 1BHGA 2NT1A 4D6JA 4E2OA 1TA3A 1UWTA 3FXYA 3MMWA 1TG7A 2ZICA 2XJ7A 5HDRA 2YBUA 4UNIA 4CD8A 3K1DA 5IHRA 4X0VA 2YKKA 2DIEA 2O9RA 2DT3A 3EMCA 1HL9A 1UWSA 4B3LA 3CHEA 2WMKA 2BFGA 4BS0A 1KQYA 1G5AA 2VR5A 1I1XA 5GNYA 4Z2GA 2VX6A 1UZ1A 1XH1A 3CTTA 1D3CA 4CUCA 4D6DA 4TTUA 4J3VA 1BLIA 2O92A 3L2LA 1J0HA 1G94A 1V6WA 1P6WA 1QNRA 1HXJA 1H11A 7CGTA 3FNDA 1OT1A 4NZCA 1CDGA 4CVWA 3FN9A 4JFTA 2WC7A 2XM2A 1DWJM 6TAAA 3CZKA 2ZWYA 5CSYA 3AMLA 4RE4A 3W26A 2WKLA 4P7RA 5A2CA 3PZTA 2OSWA 1H3GA 3ARVA 1JZ8A 1KCKA 2WZIA 3AMKA 1E15A 3THDA 4JFWA 1QI4A 1SMDA 1C8YA 1NP0A 3K8LA 1S46A 1VB9A 2A3EA 5BXPA 4PCSA 5ABFB 1XYFA 3VMNA 2XHYA 1WZMA 2WVSA 3MUIA 2BVDA 4UQAA 4YHEA 5I23A 4KH2A 2DT2A 4D6EA 1YQ2A 2J7EA 4OBSA 1HJXA 2CXGA 4E8CA 1GVYA 1MW0A 4WF7A 5CSUA 1WB0A 2D0GA 3VMOA 1OB0A 3ZOAA 5A8PA 4UZSA 1MFUA 2UY2A 1BQCA 4D6CA 3CUIA 2D2OA 4U5KA 1BAGA 2OSXA 1K9DA 2D0HA 3IAQA 3D5HA 2PF0A 4AZCA 3CH9A 3AXIA 4MNKA 1CGTA 1GNXA 1FH7A 3AS0A 3WF3A 3ZM8A 4NSBA 1MQPA 1QHPA 3U57A 1BGAA 4FLRA 1WNOA 4HZ8A 3L4ZA 4W86A 3WNNA 1N82A 3KWXA 4AD1A 2W62A 1JDCA 3ZJ6A 2QPSA 4YHGA 3NDZA 1GHSA 1GOMA 3CZJA 1W2PA 2QMKA 3RJXA 1JGIA 2WHJA 2X09A 1PZ2A 3WD4A 3CZLA 3K8KA 3D3AA 4M82A 1ISZA 1JXKA 3VGFA 3RJYA 5A3HA 3DYPA 3MANA 3VOCA 1FH9A 1FA2A 1ECEA 3O2LA 4IISA 4AZBA 3U7VA 2JE8A 1EDGA 1MQRA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YL5 A;  1EIB A;  2GVY A;  2J7B A;  1CWY A;  1WAW A;  4NRR A;  3VIM A;  4UFJ A;  5BYW A;  1E71 M;  1MFV A;  2XYL A;  3OIH A;  4PSP A;  1ZL1 A;  5A1A A;  1U2Y A;  1NP2 A;  1CNV A;  1AQM A;  3VGG A;  1XRV A;  1NWU A;  2E9L A;  2YDQ A;  3EDE A;  5GNZ A;  1MXG A;  3WH9 A;  1H4P A;  4JKM A;  4J27 A;  4AIE A;  2C7F A;  3RM9 A;  1FFQ A;  4IUG A;  1X1N A;  1ZJB A;  1W2V A;  3UG3 A;  1GZJ A;  3LPG A;  3MUZ 1;  5A6K A;  1GQL A;  3UR7 A;  4ATW A;  3ZMR A;  3S6T A;  1KXH A;  4AEF A;  2JIW A;  1CPU A;  1NOF A;  4IPN B;  1Q6D A;  1SR0 A;  3AOF A;  3G6L A;  3M7S A;  1QW8 A;  4UQ9 A;  3WMS A;  4WKA A;  1KXV A;  4UQB A;  3PZU A;  1PZ3 A;  2W91 A;  5D9O A;  5IXE A;  1JYN A;  5M03 A;  2XSA A;  2EQD A;  1J10 A;  2WMF A;  4JCL A;  4U3C A;  1CTN A;  3ZJ7 A;  1KCL A;  1BG9 A;  2VR4 A;  1NWS A;  1L8N A;  2A3B A;  2J75 A;  3HJE A;  3SCO A;  2V3G A;  4MNL A;  1JZ5 A;  5CGM A;  3KZS A;  4DWS C;  2BS9 A;  2XUC A;  2HIS A;  3WH8 A;  4P8V A;  2X1I A;  3ECQ A;  1HX0 A;  2RGL A;  1V3L A;  3NSN A;  5A95 A;  2D23 A;  3A4W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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