1C92A

Endo-beta-n-acetylglucosaminidase h, e132a mutant
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
265
structure length
265
Chain Sequence
KQGPTSVAYVEVNNNSMLNVGKYTLADGGGNAFDVAVIFAANINYDTGTKTAYLHFNENVQRVLDNAVTQIRPLQQQGIKVLLSVLGNHQGAGFANFPSQQAASAFAKQLSDAVAKYGLDGVDFDDAYAEYGNNGTAQPNDSSFVHLVTALRANMPDKIISLYNIGPAASRLSYGGVDVSDKFDYAWNPYYGTWQVPGIALPKAQLSPAAVEIGRTSRSTVADLARRTVDEGYGVYLTYNLDGGDRTADVSAFTRELYGSEAVRT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords ENDO-BETA-N-ACETYLGLUCOSAMINIDASE H
publication title Mutations of endo-beta-N-acetylglucosaminidase H active site residues Asp130 and Glu132: activities and conformations.
pubmed rcsb
source organism Streptomyces plicatus
total genus 89
structure length 265
sequence length 265
ec nomenclature ec 3.2.1.96: Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase.
pdb deposition date 1999-07-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1c92A00
5I23A 5GNYA 1D3CA 2DQXA 1QNRA 4H04A 1E3ZA 1QNQA 2XVGA 4JHOA 3W25A 4J3XA 4CN6A 3B9AA 2JALA 4OBRA 1QNSA 4Z2IA 3T0AA 2CETA 1EOMA 1WDQA 4E4PA 1H1NA 2ZX9A 4MNJA 3CLWA 4PBGA 1PAMA 3GYCA 3AISA 4S3KA 4U31A 3VX0A 1KFWA 4PUEA 1WE5A 2A3HA 4PYSA 3T2OA 1Z32X 3WQ8A 4F8XA 2GSJA 1V3MA 4ATLA 2WZHA 3PTQA 3CMGA 2EPOA 3VD4A 1LLOA 1J0HA 2DT2A 3VILA 2WVVA 2O9TA 1GQIA 1Q4NX 1UR2A 4BQ5A 4AWEA 1A3HA 5CPQA 2PWEA 3AS3A 4OBSA 2YKKA 3BAXA 1YHTA 1AQMA 3ZR6A 1K9FA 1OBAA 2WNWA 4W89A 3WQ6A 4JKMA 4OOUA 1QI5A 2FDMA 5I77A 3KE0A 3SEPA 1GONA 4M24A 3PZVA 3K8LA 1BVZA 2PI6A 5CZKA 2IXUA 1BG4A 1R7AA 2OWWA 3ZT6A 4OJYA 4D6EA 1E6PA 2BY1A 1CECA 2D3LA 2ZX6A 3VIHA 3SCRA 4GO8A 2DH3A 1CGVA 1JZ5A 2BY0A 2WAGA 1V6WA 1MWOA 3SCUA 1AVAA 1KXHA 1HJVA 1PX8A 3ARZA 4GO9A 4IISA 2WMIA 5JUVA 2CCRA 1VJZA 3MSGA 1FFRA 4Z2HA 1E4LA 2GDUA 5E6ZA 4JFTA 4MADA 4J3WA 3KEHA 1V0NA 2J25A 2PC8A 3EDDA 1PX3A 3AHZA 1XGZA 1I1XA 1CZ1A 1CENA 2WHKA 1JF6A 3CZJA 4GQRA 3WFLA 4AZ6A 3NSMA 3L4XA 5CJ5A 3A4WA 2CEQA 2GJRA 3EDEA 2G4FA 4LYRA 4URIA 4HA4A 4TTGA 1MW3A 1JXKA 1UWSA 2Y5EA 2UWFA 1H0IA 1SR0A 4AIOA 3LPGA 4AD5A 5A2AA 1DWAM 3ECQA 4UNIA 1JNDA 2X05A 3F5LA 1GZJA 4JFWA 2WWDA 2YJQA 1M04A 1U30A 1E6QM 3MV11 5IHRA 2EQDA 2ZUMA 2C7FA 4XB3A 4QDMA 1OSEA 3O2LA 4PMZA 1HJWA 1OT1A 1UA7A 1ODUA 5D8WA 2BVDA 1C8QA 1WB0A 2W62A 2VI0A 3BMVA 1GOKA 1CWYA 1F4AA 1H4PA 3CO4A 3WDPP 2E9BA 1CYGA 2XYLA 4PCTA 4J3VA 1C7SA 3W26A 2HVMA 1PZ3A 2V3DA 3WDQA 4TVCA 3VIGA 3APGA 5A95A 5ABHA 5AC5A 1TFVA 3PZNA 2YA0A 3AMDA 3WQWA 3ZJKA 8A3HA 2EBNA 1MQPA 1JFXA 3IJ8A 1B3YA 3AS1A 4ATDA 1W1VA 1US2A 1XD0A 2YA2A 3WUFA 3VM5A 3AJ7A 3PHAA 4KGLA 1XCWA 3GZAA 2BHUA 4QCFA 1AMYA 4ZE4A 3THDA 1KWGA 2VURA 2ZWYA 3U5YA 1LG2A 2GDVA 3ZMRA 1EQPA 1LQ0A 2UY5A 3MU7A 4GQQA 4QLKA 2JF6A 3PZTA 2YL6A 2J78A 2BXZA 1VFFA 4WK9A 1C8XA 3AMLA 1UG6A 2GJPA 2OSYA 3VMNA 4Z2LA 1V3IA 1GVIA 1WAWA 1H3GA 2YL8A 1OGGA 1FOBA 4JFSA 1BG9A 3CTTA 3TTOA 1WO2A 3QHMA 4JFVA 3SCTA 4X0NA 4UFJA 3MSDA 3WD3A 1HL8A 3CIVA 3MMUA 2BY3A 1J0YA 2QMJA 1H41A 3N15A 4YHEA 4D6FA 2XIBA 1JZ4A 2WMJA 2V38A 3ARQA 1HVQA 3FNDA 3FW6A 4CVWA 2O92A 4IPNB 1E4NA 3N13A 3CGTA 3T0BA 2VL4A 1C3FA 4U33A 4FMVA 4WJXA 3SCNA 1UH3A 2IUZA 1GHSA 3IANA 3ARWA 2WLZA 4EK7A 2EPKX 2CKSA 2NT0A 1GQLA 4TOQA 4UQAA 5ABEA 3AI0A 1B90A 1FP9A 4PTMA 1FHDA 3NDZA 3WQ5A 1XSKA 1GOIA 2D24A 3SCSA 3VDHA 4PSRA 3UG4A 2DPEA 3WNKA 2ZWZA 1ZJAA 3OGSA 1EOKA 1W9DM 5BROA 2G3NA 5HXMA 1W3HA 1XH1A 5TD4A 2DSUA 3THCA 1EHNA 2D20A 4JCMA 2BFGA 2JEPA 2DT0A 4PCSA 3W53A 2ZXQA 1LG1A 3CHFA 1Y7VA 1WNOA 3WL1A 2WANA 5C71A 2CYGA 5E6YA 4MTVA 2VUYA 1GOOA 4ACYA 2J4GA 2ZUVA 3ZT7A 1BHGA 1GORA 3POCA 2XVNA 2DSKA 2J7HA 2XJ7A 2V5DA 2BNJA 1PEZA 3CBWA 2OYMA 1TZ7A 3WMSA 1TVNA 2VX6A 1VBUA 2X0YA 1JYWA 1HJXA 1TVPA 1ZBKA 3BLPX 3MS8A 1SMDA 3OLIA 1J11A 1HP4A 2AOSA 3EMZA 2QPSA 3A4XA 1K9TA 1EO5A 2ZUNA 3EBVA 4AZGA 1PPIA 1CEOA 4LQ1A 4MB5A 4UCFA 3W37A 2WCAA 3PZUA 3PTMA 3UERA 1BSIA 4W93A 2E8ZA 3TONA 3GH5A 3AIVA 3WEZA 3GNOA 4P8VA 3QHOA 5ECUA 2ZXBA 1H2JA 3D3AA 3AS2A 1IZKA 2W66A 1CGWA 4UFKA 1XRVA 4AD3A 2VCAA 3CHCA 4KRTA 1J18A 1EH9A 2WM0A 3FXYA 1GUVA 1JIBA 3AICA 1NOUA 4BA0A 1UWIA 3OLDA 5M5DA 3AHTA 1JDCA 1R7OA 3GM8A 1W2PA 3JUGA 4V28A 5HBFA 1CLVA 3W6LA 3OB8A 3NCOA 1X1NA 2YDSA 1V6XA 3A6OA 1KWKA 1XHGA 3VO0A 3ZT5A 1OINA 2Q8XA 3RM4A 5JBEA 3MO4A 2WMHA 3RO8A 1UHVA 2E0PA 4NF7A 2CXGA 1OD0A 4D6JA 4HA1A 4LYQA 1CGXA 5A6MA 3VMPA 1VIWA 1U2YA 2PWGA 4D6IA 2J8GA 5BWFA 3AOFA 3AMKA 5A3HA 4UQEA 1E40A 3BAWA 1FFQA 2RGLA 3KL0A 3SUUA 5I78A 3VTRA 1GPFA 4W87A 1I1WA 2VQTA 4PRWA 1D7FA 1S46A 1PIGA 4CUCA 4TTUA 4RE3A 2B31A 1J12A 4UFLA 3VGFA 3WH9A 4UFHA 2WHMA 3WKZA 4CN4A 1EA9C 4WSJA 3SUWA 3AHXA 4AZCB 5D8ZA 2GUYA 3TA9A 3BGAA 1Q6GA 4IPLA 2D23A 4QLLA 1VJSA 5A2CA 1JI2A 2E9MA 2WKGA 3MUAA 2XVPA 4CCDA 2VR4A 3AIWA 4AD2A 2CIPA 1JYVA 2VX4A 3K4DA 1E70M 3VGGA 3N17A 1W9XA 1CLXA 1MW1A 5ABFB 4HP5A 3U5UA 1P6WA 2ZUSA 2VC9A 4Z2KA 3WBEA 1FH9A 1W9PA 1SFSA 4CU6A 2FHFA 1NWRA 2XWDA 1J01A 5FD0A 4J27A 2WW5A 3F5KA 1W3KA 3VGDA 4DWSC 1QVBA 3RM9A 1R86A 3DYPA 1DEDA 4XZWA 4JL1A 4GZJA 2HISA 2WZEA 1VF8A 3ZJ7A 3CUGA 1J0ZA 2PBOA 3WDIA 4PUDA 3UG3A 1LJYA 1UKSA 3SUVA 1L0PA 2FHCA 3BSGA 3WQ4A 4AXNA 2FH8A 1CXLA 1HNYA 3ZM8A 2VX7A 5DEZA 3CH9A 1GJUA 3WDJA 1TCMA 1EDGA 2W92A 4B3LA 4W7UA 1CPUA 1E4IA 4KWUA 1BYDA 3AIRA 1KB3A 5E0CA 5FL0A 3PZQA 4JHZA 4C7DA 3NYDA 2WLYA 2XSBA 1W1PA 3L4TA 3WSUA 1ZL1A 1V08A 1UR0A 3VVGA 3MANA 1WCGA 3TTQA 3N1AA 1KCKA 4BS0A 2Y8VA 1QPKA 4W5UA 3N18A 1DWFM 1ISYA 1LWHA 4KGJA 4PMQA 3WD4A 2G3IA 4JZ5A 4UZSA 1JD7A 2PBGA 3VD5A 1W9VA 3HJEA 3K8KA 3B8SA 5GQBA 2J62A 1NWUA 1PBGA 1G01A 1J9YA 4A4AA 1UD5A 2W91A 4GI8A 3LPOA 3WUGA 3AIUA 2VZVA 4HZ8A 4TX8A 4CN1A 4W85A 2WBGA 4A3HA 2XG9A 4M1RA 3WF1A 1DTUA 1CNVA 2BS9A 3OLGA 4KMQA 3L2LA 9CGTA 4F9DA 2CBIA 4P8XA 3UETA 4L4OA 4ZXOA 5BRPA 1H09A 4HTYA 1MW0A 3HMCA 1CXEA 3DYMA 1ZBWA 1HF6A 3W82A 1KXTA 1HL9A 1HKJA 4ACZB 5EFDA 5CQ1A 3CPUA 4M82A 3SCWA 3ZIZA 4IM4A 1UD8A 4H41A 1BAGA 5A2BA 1BF2A 4A3YA 3WNOA 1HN1A 1JD9A 1JI1A 3WDHA 5I6SA 5AC4A 2BHZA 5DT5A 3VNZA 1BLIA 1E6XM 3EDFA 1YQ2A 2BV9A 5D9NA 5FKYA 2QPUA 1G0CA 1QNPA 1MFVA 2W4XA 4U3CA 2VR5A 4V27A 2CBJA 2YOCA 1NM9A 1E43A 5E0FA 1W91A 4Q7NA 2VT0A 3SUTA 2VO5A 3II1A 5A8OA 3GNRA 4M8UA 5IXEA 4X0VA 2DGAA 4AZBA 3A3HA 3BAKA 1W2VA 2ZX8A 1EDQA 3N12A 3CMJA 3ALGA 1N82A 1W3JA 3M7SA 4Z2JA 1J0KA 3L4UA 3EMCA 1OT2A 1JZ6A 3ARVA 1B9ZA 4H8VA 3WEOA 1E9LA 3OZPA 1V3HA 2ZOXA 1BGGA 4AEEA 1MW2A 4QLJA 4MNLA 1UA3A 1OCQA 4W8AA 4LX4A 3T08A 5E70A 2VX5A 1PX4A 1IZJA 1BQCA 3U7BA 2CNCA 1WZMA 3RM8A 3VD7A 1NWTA 1CXHA 3VIIA 2C0HA 3PZIA 1HJQA 1V3JA 3GXFA 2F2HA 2Y2WA 2PWHA 1J0JA 4PTXA 2D0GA 4B16A 4CU8A 4PMUA 4MDPA 5EMYA 7TAAA 3L2MA 4WSKA 3WF3A 3AHYA 3AQUA 1UD4A 3NUKA 1IT0A 1Q6FA 1GOMA 3LPFA 3KWXA 2UY4A 2Y24A 4GINA 4HOZA 4AZ5A 3VIFA 3WMCA 1GHRA 2W61A 4Y7EA 5AY7A 5M17A 1WZKA 5A6JA 2ZICA 3A4AA 3BC9A 5LA1A 2UY3A 1JAKA 2DH2A 2WCGA 1CIUA 1XCXA 5IFTA 3WMBA 1C92A 5IHSA 1W9UA 1BTCA 4ZE5A 1ZBCA 2QLYA 1V03A 1ECEA 3I3BA 4WKAA 1PIFA 3AZSA 3UR8A 5BXRA 2D1ZA 5I5RA 3AXXA 1TMQA 3FAWA 4F79A 3W24A 2CHOA 2YLAA 3SIMA 3T2QA 2YDRA 4UQBA 2WYSA 4HZ7A 3GBDA 1C7TA 1JGIA 4AZIA 4FLSA 1UKQA 4JCLA 1KXVA 2TAAA 5C70A 1JDDA 1HIZA 4CD8A 5D4YA 3WN6A 1WDSA 1RPKA 4AD0A 3MMDA 1JG9A 2YDQA 1WZLA 4W84A 1JXJA 1V0KA 3IAQA 1NOFA 4AZCA 2BVTA 3BCDA 4F9JA 1JAEA 4MJ4A 3OGRA 3OA5A 1QNOA 1QHOA 1V6YA 3CZ8A 4D72A 4UOZA 3UCQA 1E71M 5CSUA 4EE9A 2J47A 3AHVA 1UR1A 4ATWA 5CLWA 1NQ6A 1UR9A 5ABFA 4UOQA 4LGXA 5HDRA 1R8LA 5CG0A 2A3EA 6CGTA 4P7QA 3PN8A 4DM2A 4CVUA 4HMEA 3WDRA 4RE4A 3CUJA 1O6IA 1ISXA 4M81A 1IV8A 2J7CA 4GIAA 2WWCA 4PTWA 3LPPA 1CTNA 4FF5A 5I0DA 2J75A 1J10A 3OGVA 2V3EA 1NP2A 3A47A 3O6AA 2X09A 4M56A 3WY1A 1H0GA 1B3ZA 4AIEA 2DSVA 3G6LA 3W4RA 1TE1A 1UWRA 2XWEA 1HKIA 2O9RA 1G5AA 3ARXA 6A3HA 4AMCA 1JZ7A 3GDBA 3MUY1 4D6CA 1B3VA 1EO7A 4KH2A 1VRXA 1ZBVA 1ZU8A 2ESCA 1PZ2A 3QOKA 4H8HA 3WF0A 5DO8A 5FIPA 1CXIA 1JZ2A 3SCOA 4GXPA 4S3JA 3SCQA 1E0XA 5BXSA 2OYLA 4R27A 4UR9A 3GH7A 1MXDA 4HMCA 1Q6EA 2E3ZA 5BCAA 4MDOA 1Q6DA 4NI3A 2O9PA 4PMXA 1Q6CA 4PMVA 1XC6A 4NRSA 4JL2A 3T2PA 4RL3A 4BF7A 2WPGA 1UH4A 4P7RA 2YIHA 4N0RA 3VU2A 4AD4A 1GVYA 2WSKA 2XVKA 3W27A 1LL6A 1ZS2A 3B9DA 3DHUA 1M53A 4D6DA 1B0IA 2WHLA 4DWSB 4P8UA 3IK2A 4P7OA 1GCYA 3LMYA 3AXIA 1HKKA 2E4TA 4NRRA 3W29A 1FHLA 1M03A 4BQ2A 2IXVA 1VFMA 3QR3A 1KQYA 1HJUA 1MQRA 2BXYA 4GPNA 4WF7A 4CGTA 5HOSA 4YHGA 4ACZA 2JIWA 2WMFA 4WIWA 2PF0A 3MV01 3M46A 1KXQA 1HJSA 3BXWA 3K4AA 2QHAA 2D3NA 5M03A 5A6LA 3ARUA 3BH4A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 5I23 A;  5GNY A;  1D3C A;  2DQX A;  1QNR A;  4H04 A;  1E3Z A;  1QNQ A;  2XVG A;  4JHO A;  3W25 A;  4J3X A;  4CN6 A;  3B9A A;  2JAL A;  4OBR A;  1QNS A;  4Z2I A;  3T0A A;  2CET A;  1EOM A;  1WDQ A;  4E4P A;  1H1N A;  2ZX9 A;  4MNJ A;  3CLW A;  4PBG A;  1PAM A;  3GYC A;  3AIS A;  4S3K A;  4U31 A;  3VX0 A;  1KFW A;  4PUE A;  1WE5 A;  2A3H A;  4PYS A;  3T2O A;  1Z32 X;  3WQ8 A;  4F8X A;  2GSJ A;  1V3M A;  4ATL A;  2WZH A;  3PTQ A;  3CMG A;  2EPO A;  3VD4 A;  1LLO A;  1J0H A;  2DT2 A;  3VIL A;  2WVV A;  2O9T A;  1GQI A;  1Q4N X;  1UR2 A;  4BQ5 A;  4AWE A;  1A3H A;  5CPQ A;  2PWE A;  3AS3 A;  4OBS A;  2YKK A;  3BAX A;  1YHT A;  1AQM A;  3ZR6 A;  1K9F A;  1OBA A;  2WNW A;  4W89 A;  3WQ6 A;  4JKM A;  4OOU A;  1QI5 A;  2FDM A;  5I77 A;  3KE0 A;  3SEP A;  1GON A;  4M24 A;  3PZV A;  3K8L A;  1BVZ A;  2PI6 A;  5CZK A;  2IXU A;  1BG4 A;  1R7A A;  2OWW A;  3ZT6 A;  4OJY A;  4D6E A;  1E6P A;  2BY1 A;  1CEC A;  2D3L A;  2ZX6 A;  3VIH A;  3SCR A;  4GO8 A;  2DH3 A;  1CGV A;  1JZ5 A;  2BY0 A;  2WAG A;  1V6W A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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