1CA3A

Unexpected ph-dependent conformation of his-64, the proton shuttle of carbonic anhydrase ii.
Total Genus 74
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
74
Knots found
sequence length
255
structure length
255
Chain Sequence
WGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Unexpected Ph-Dependent Conformation of His-64, the Proton Shuttle of Carbonic Anhydrase II.
pubmed rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 74
structure length 255
sequence length 255
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1991-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1ca3A00
1TG3A 5JEHB 1CA3A 1CRAA 3RYYA 1IF5A 5SZ5A 1CVBA 3MHMA 3T82A 4RFDA 4Q83A 3D9ZA 1BICA 1OKNA 3R16A 1CAIA 1TEUX 1ZFKA 1RAZA 1CNJA 5E2NA 4KUVA 3DA2A 5E2SA 4QK3A 4Q0LA 2OSFA 3MNHA 5L3OA 2GD8A 5DSMA 4KNNA 2FMZA 4Q7VA 1CNXA 1CAKA 2EZ7A 4Q78A 5EHEA 5FNIA 3B1BA 4QSJA 4Q49A 3MZCA 3MDZA 5BRUA 1CILA 1KOPA 1RJ5A 5JG5B 4XFWA 3RLDA 1CALA 2NWPA 3CA2A 5EH8A 5JG3B 4YVYA 3IEOA 1Z93A 2EU3A 5DSLA 1HCBA 4M2VA 5EZTX 1T9NA 5FNLA 1CNCA 3M2ZA 3IAIA 4MO8A 3D92A 2NXSA 1RZEA 1ZSBA 3RYZA 4CNWA 4L5UA 2Q38A 1CAHA 1CNGA 5G0BA 4KP8A 1G53A 2NN1A 4RUXA 3M98A 5DOGA 4PQ7A 1I9LA 3DC9A 5SZ6A 3U7CA 3RYXB 1FQRA 2CBCA 2HFWA 1BNWA 3V7XA 5DSJA 3PO6A 1CAJA 1TB0X 1ZGEA 4K13A 1XQ0A 4XZ5A 1I8ZA 1UGGA 4YGFA 1CNBA 4PZHA 1ZSCA 4IDRX 4Q87A 6CA2A 5CLUA 1MUAA 3SAPA 3R17B 5EH5A 1RAYA 5SZ7A 3B4FA 1IF8A 4JSZA 3M40A 2QP6A 5FLRA 4KV0A 1LG6A 2FNKA 4YHAA 3DCWA 1H4NA 4FL7A 4KNMA 2FNMA 2NNVA 1FQLA 3DBUA 1CNHA 1BNUA 1RZCA 5BRWA 4YWPA 1UGDA 3P3HA 3OY0A 4QY3A 4RIUA 12CAA 3P5LA 4ZWYA 1YDCA 1HCAA 3DVBA 4Q8XA 4XIXA 5JGSB 4WR7A 4WW8A 1CAOA 5SZ0A 3UYNA 5E28A 3JXHC 2X7SA 3V3HB 2FMGA 3K2FA 3MNUA 3M5TA 5EHVA 1FSNA 3MHCA 4YGKA 4BF1A 3M3XA 5FDCA 4KNJA 4K0SA 4KNIA 3MHOA 3M14A 1CVHA 4ITPA 5J8ZA 5AMDA 4LU3A 1CAYA 3KLDB 1AM6A 3IBUA 5G0CA 3TVNX 3N2PA 1HECA 3DD0A 1G4OA 3CAJA 4CA2A 5SZ1A 4YXIA 4YX4A 5EIJA 4MTYA 4DZ9A 5FL4A 1CCUA 4GL1X 4Q7WA 4FIKA 1CRMA 5EKJA 4Q8ZA 4K0ZA 1ZFQA 4ZX1A 1BZMA 2HL4A 4KUWA 1V9IC 3P55A 1AVNA 3OIKA 4Q8YA 4N16A 3DVCA 3RGEA 3K34A 4CQ0A 5DSOA 3QYKA 1JV0A 5DSIA 4CNXA 4Z0QA 1CNKA 3HS4A 4FVOA 5FL5A 3RZ0B 5A6HA 3F7UA 3DAZA 3M1WA 1LGDA 3RZ1B 3RZ8A 3MNJA 5CA2A 1I91A 4YGNA 2NWOA 4LP6A 4RFCA 1UGAA 2Q1QA 3V2JA 9CA2A 3RYJB 1J9WA 5FNKA 4E3GA 1TE3X 4M2RA 4QSAA 4MDMA 3OYSA 5DSKA 3DCCA 1ZE8A 3ZP9A 2NXRA 3V3JA 3RYVB 3MHLA 3OIMA 2ILIA 1BNQA 4Q9YA 3NJ9A 1G45A 3HKTA 4FVNA 1BN3A 1Y7WA 3PJJA 3V3IB 2HKKA 5EKMA 1I9NA 2FOUA 5E2MA 5EH7A 3S97A 1ZGFA 5SZ2A 2VVAX 3S75B 4Z1NA 5L6KA 7CA2A 3MNKA 4TWLA 3DVDA 4MDGA 3LXEA 3JXGA 1THKA 4ZAOA 3M1KA 4JSWA 3MNAA 2POWA 1CIMA 3ML2A 3GZ0A 1IF9A 2NNGA 5CACA 1TG9A 4WUPA 1IF4A 3IBLA 1G46A 1YO2A 3U45X 1G4JA 5SZ3A 1I9MA 5DVXA 3KKXA 5AMLA 1BNNA 3OKVA 3M2NA 5DSPA 4ZWXA 3U3AX 2AX2A 3FW3A 2GEHA 1CCTA 3T85A 3F7BA 4RH2A 5LMDA 5E2RA 1CVDA 3S77B 1ZNCA 1G54A 3VBDA 3DD8A 5FNJA 4QTLA 1EOUA 5DRSA 1YO0A 5JDVB 4BCWA 1G3ZA 4Q07A 5DSQA 3M5EA 2CBEA 3S8XA 2WEGA 3HKUA 2W2JA 3RZ5A 3M96A 4Z1KA 3HFPA 3RZ7A 2NWYA 1HEAA 4KP5A 3T84A 5IPZA 3P4VA 1BNTA 1A42A 4E3HA 8CA2A 4YXOA 1UGBA 4Q6EA 4E9OX 2FOQA 3TMJA 3T5UA 5EKHA 4UOVA 3MNIA 1H9NA 1XPZA 3P58A 2NNOA 4CACA 4COQA 3IBIA 2FNNA 1I90A 1Z9YA 4FPTA 1YDAA 1TH9A 1AZMA 1I9PA 4R59A 1DCBA 1DMYA 2OSMA 5FLSA 3F8EA 4Q06A 4WUQA 1I9QA 4HBAA 4ZWIA 2FW4A 4Q08A 5E5RA 5JGTB 4HT0A 2NN7A 3RG4A 5JEGB 1I9OA 4PYYA 5E2KA 4Q7PA 4Q81A 4E5QA 3FE4A 4QIZA 1BNMA 4QK2A 3Q31A 1HUHA 4MDLA 3CZVA 3M2XA 3V3FA 5CJFA 4QJPA 2X7TA 2AW1A 5FL6A 1KWQA 3BETA 2QOAA 1CANA 3KNEA 2HOCA 3D8WA 2WEJA 4MLXA 2NMXA 3W6HA 1KEQA 4Q99A 4Y0JA 1Z97A 4QK1A 3V3GB 4DZ7A 3MHIA 4QSBA 3OYQA 4L5VA 5HPJA 3EFIA 2FOSA 3P3JA 1F2WA 4ZWZA 3OKUA 1OQ5A 3FFPX 4YYTA 3S74B 3DV7A 2H15A 4QSIA 4QJ0A 4QJOA 4Z1EA 1YDDA 4M2WA 2WD3A 5EOIA 2CBBA 3S73B 4BF6A 4QJMA 2WD2A 3KWAA 4K1QA 3EFTA 5FNMA 1IF7A 1IF6A 3S72B 4Q90A 3SBHA 1OKMA 1TBTX 5G03A 1XEGA 3DCSA 2VVBX 4E49A 1KWRA 1HEBA 3HKQA 2FOVA 4WW6A 2O4ZA 5JQTA 1BN1A 4CNRA 1FQNA 3S9TA 3M1QA 3W6IA 1ZH9A 2ZNCA 1RZAA 4RUYA 1ZSAA 3V2MA 4MLTA 3KS3A 3KIGA 5FLOA 2FOYA 3V5GA 2X7UA 4C3TA 1LG5A 3JXFA 2H4NA 5C8IA 3BL0A 5JQ0A 4PXXA 5FLQA 4ETQC 1KOQA 3MWOA 1CAZA 4JSAA 1CVCA 1H9QA 3KONA 3C7PA 4Q6DA 3S71B 1CVFA 1V9EA 4FU5A 4HU1A 4RUZA 3HLJA 4ILXA 3OILA 1BV3A 1FSRA 3M67A 4E3FA 4XE1A 3M2YA 1RZBA 2CA2A 3MYQA 4PYXA 4Q09A 5JEPB 1FSQA 1CCSA 4X5SA 5BRVA 4K0TA 2NXTA 5FLPA 3D0NA 1UGEA 4WL4A 5FNHA 5DOHA 2POVA 4HEWA 3U47A 3DC3A 1FR4A 1CNIA 2POUA 1HUGA 3PYKA 3N0NA 4YGLA 5E5UA 3T83A 3RG3A 3CYUA 1G0FA 1DCAA 1HVAA 4G7AA 4CNVA 5DSNA 1CVAA 3KOIA 4G0CA 3N4BA 3NB5A 3ML5A 3S78B 1CNWA 1XEVA 4HT2A 5SZ4A 4XIWA 1RJ6A 3S76A 2HNCA 4E4AA 3F4XA 4HF3A 3M1JA 1BNVA 4TWMA 2F14A 1LUGA 1OKLA 5A25A 1CZMA 3BL1A 2QO8A 4YGJA 1RZDA 3IBNA 1G48A 1YO1A 2NWZA 3RJ7A 2NNSA 2WEOA 4R5BA 4QIYA 3K7KA 1TTMA 1G1DA 5DSRA 3T5ZA 1MOOA 1DMXA 3MMFA 1G0EA 3P44A 4HEZA 4JS6A 4Z1JA 4Q7SA 5BYIA 4KAPA 5JESB 1JD0A 4QJWA 3ZNCA 1CINA 4M2UA 4YXUA 4ITOA 4N0XB 1LZVA 2WEHA 3P5AA 2ABEA 2IT4A 4L5WA 4RN4A 2CABA 4IWZA 3KOKA 3SAXA 3TVOX 1CNYA 1G52A 5AMGA 5EHWA 3SBIA 2HD6A 1FQMA 4R5AA 2CBAA 1G6VA 3NI5A 4QEFA 3L14A 3D93A 1FR7A 5G01A 3UYQA 1YDBA 5FDIA 3HKNA 4E3DA 3M5SA 1JCZA 1TEQX 5FNGA 4FRCA 1HEDA 1UGFA 4JSSA 4KUYA 3M04A 4QJXA 4ZX0A 1FLJA 3N3JA 2CBDA 1CVEA 4HEYA 2EU2A 1CAMA 1UGCA 5BNLA 3IGPA 1BCDA 4RIVA 1URTA 1BN4A 4LHIA 5FLTA 2Q1BA 1CA2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1TG3 A;  5JEH B;  1CA3 A;  1CRA A;  3RYY A;  1IF5 A;  5SZ5 A;  1CVB A;  3MHM A;  3T82 A;  4RFD A;  4Q83 A;  3D9Z A;  1BIC A;  1OKN A;  3R16 A;  1CAI A;  1TEU X;  1ZFK A;  1RAZ A;  1CNJ A;  5E2N A;  4KUV A;  3DA2 A;  5E2S A;  4QK3 A;  4Q0L A;  2OSF A;  3MNH A;  5L3O A;  2GD8 A;  5DSM A;  4KNN A;  2FMZ A;  4Q7V A;  1CNX A;  1CAK A;  2EZ7 A;  4Q78 A;  5EHE A;  5FNI A;  3B1B A;  4QSJ A;  4Q49 A;  3MZC A;  3MDZ A;  5BRU A;  1CIL A;  1KOP A;  1RJ5 A;  5JG5 B;  4XFW A;  3RLD A;  1CAL A;  2NWP A;  3CA2 A;  5EH8 A;  5JG3 B;  4YVY A;  3IEO A;  1Z93 A;  2EU3 A;  5DSL A;  1HCB A;  4M2V A;  5EZT X;  1T9N A;  5FNL A;  1CNC A;  3M2Z A;  3IAI A;  4MO8 A;  3D92 A;  2NXS A;  1RZE A;  1ZSB A;  3RYZ A;  4CNW A;  4L5U A;  2Q38 A;  1CAH A;  1CNG A;  5G0B A;  4KP8 A;  1G53 A;  2NN1 A;  4RUX A;  3M98 A;  5DOG A;  4PQ7 A;  1I9L A;  3DC9 A;  5SZ6 A;  3U7C A;  3RYX B;  1FQR A;  2CBC A;  2HFW A;  1BNW A;  3V7X A;  5DSJ A;  3PO6 A;  1CAJ A;  1TB0 X;  1ZGE A;  4K13 A;  1XQ0 A;  4XZ5 A;  1I8Z A;  1UGG A;  4YGF A;  1CNB A; 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