1CAJA

Structural analysis of the zinc hydroxide-thr 199-glu 106 hydrogen bonding network in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 77
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
77
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSDHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural analysis of the zinc hydroxide-Thr-199-Glu-106 hydrogen-bond network in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 77
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1cajA00
3RGEA 3SAXA 1DCBA 2FOQA 1BNMA 5FL4A 1FSRA 3DVDA 4L5WA 4YGFA 5FNKA 3OYSA 4L5VA 4XFWA 1HCBA 1CNBA 2HKKA 1KWRA 3RYZA 5FL5A 4R59A 5BYIA 3D92A 4KNMA 5SZ4A 3MMFA 4E3HA 3PYKA 1G3ZA 1I9OA 4YGLA 3RYJB 2F14A 1CNHA 3P3JA 2NNSA 1URTA 2WEOA 3M3XA 5EKJA 2FOSA 4M2WA 3HKQA 5FNLA 3U45X 5E2SA 1KOPA 3M2YA 4M2RA 4XIXA 4YGKA 4QSAA 3B4FA 4Z1JA 4RIUA 4Q7SA 1CCTA 1RZCA 3M2NA 4RUXA 1CZMA 2POWA 2CBEA 5EKHA 3T5ZA 5E28A 3MNJA 1OKLA 3MNIA 5G01A 2EZ7A 5LMDA 4RFDA 3HKUA 3P5AA 2FMZA 3N0NA 1AVNA 4WL4A 3MDZA 5FDIA 5FDCA 1G0FA 4JS6A 1CVCA 3RG3A 3P3HA 1G48A 4HT0A 3P5LA 5CA2A 5JGSB 1FSNA 1BICA 4FVOA 3MYQA 4G7AA 5DSNA 3S77B 4COQA 2NN7A 3IGPA 4MDMA 1UGAA 4KUVA 3RJ7A 1CILA 4KP8A 1UGDA 1RJ5A 4CNRA 1TG9A 4BF6A 4WUPA 4QSBA 5CACA 1H9NA 3B1BA 5FLTA 3RYXB 4N16A 3DCWA 3ZNCA 1THKA 4ZWZA 4ITOA 4LU3A 3P4VA 5JQTA 3S73B 5J8ZA 1CCUA 5C8IA 1CVFA 4M2VA 5CLUA 3M2ZA 4YXIA 4E9OX 1CANA 3UYQA 4ZWXA 2NWPA 5DSRA 4KV0A 3BL0A 4Z1EA 4JSAA 1V9IC 1CCSA 3KLDB 1YO0A 3M40A 4Q83A 2NNOA 4MLTA 5DOHA 5E5RA 5FNIA 1CIMA 4QJWA 4QJOA 2CBBA 4X5SA 3DD0A 4MLXA 4Y0JA 1RZBA 5AMLA 3R17B 3U47A 4YXOA 4YHAA 4MDGA 4Q6EA 5DSOA 4Q7WA 3OKVA 1CNKA 4MDLA 2WEGA 1XPZA 1G53A 4QJXA 1BNTA 3KONA 1UGFA 3S75B 5SZ0A 5G03A 1JCZA 1CAZA 1G45A 4XZ5A 5E2RA 4QJ0A 4RN4A 3IBUA 5FNGA 4Q7VA 4PYXA 2CABA 3DAZA 1BZMA 1J9WA 1FQNA 4YGJA 2WEJA 1UGCA 2FW4A 3M1WA 4MO8A 4HEZA 3S74B 4E4AA 3S78B 1XEVA 1CA3A 1G1DA 3HKNA 3Q31A 3PO6A 1UGEA 4Q06A 3MHIA 3S76A 5DOGA 3TMJA 4Q09A 1FR4A 3V5GA 3MNUA 3MHCA 1CNGA 5E2MA 4HF3A 1TBTX 1G54A 1TTMA 4DZ9A 3DV7A 1CNCA 1HCAA 3M14A 3MZCA 1A42A 3TVNX 4E49A 3S9TA 2H4NA 4Z1NA 5A25A 3CYUA 4MTYA 5JEGB 2WD3A 4K0ZA 5DSPA 4WR7A 4HU1A 2FOYA 5DSLA 3S8XA 1TH9A 4C3TA 5DSJA 3D93A 2CBCA 3R16A 3HKTA 3SBIA 1DMYA 2FNKA 2GD8A 2HFWA 1AM6A 4JSZA 1HEAA 3M1KA 3MHMA 3KOKA 1JD0A 5DSMA 1IF7A 4RFCA 3V2MA 5IPZA 3HFPA 5EH7A 3T5UA 1CNIA 1LG6A 2H15A 3K7KA 1HUGA 4CQ0A 4PZHA 5EKMA 3M98A 4FVNA 5FLPA 1G52A 1H4NA 3JXGA 4XIWA 3L14A 4CNVA 5SZ3A 7CA2A 3D9ZA 5JDVB 4CA2A 5BRVA 5G0CA 3KNEA 4DZ7A 1Z93A 3U7CA 3F7BA 4QTLA 5L6KA 1LUGA 4HBAA 1T9NA 4RIVA 1FR7A 4Q78A 3DCCA 2ZNCA 1HECA 4HEWA 5FLQA 3MWOA 2WEHA 5FNJA 1BNNA 1OKMA 3OIKA 1ZNCA 3V2JA 1YDDA 4E3DA 1ZGEA 2OSMA 1ZSBA 2QP6A 3V3GB 3ZP9A 1I9NA 3P44A 1UGBA 3V3FA 5DSIA 1FQRA 1IF9A 4KUYA 4HT2A 4E5QA 2CBAA 2HD6A 3MHOA 4QJPA 2CA2A 5EHEA 5DVXA 2NMXA 4KNJA 5JEHB 1CVEA 1ZH9A 5E2NA 3TVOX 4TWLA 1RZAA 1KWQA 1CNWA 2GEHA 4JSWA 1BNUA 4QJMA 4Q7PA 4QK1A 2HL4A 1H9QA 3OY0A 5CJFA 4YYTA 3IAIA 1I9MA 1CAMA 4WW6A 1CRAA 4Q8XA 4ZWYA 2POVA 4IWZA 3RYVB 3DCSA 3DC9A 1ZE8A 5SZ2A 1BNVA 5FLOA 4R5BA 1RJ6A 4QIZA 2CBDA 5JG5B 2X7TA 1Z9YA 2OSFA 3KWAA 1BN1A 2HOCA 5G0BA 1OKNA 5EH5A 3W6IA 3IEOA 1LZVA 9CA2A 2O4ZA 3FFPX 1CA2A 3HS4A 5FNMA 4YXUA 4CACA 1BCDA 2POUA 5EOIA 3M1QA 3S97A 4KUWA 1RZDA 3NJ9A 4KP5A 1CVHA 1F2WA 1FLJA 5JEPB 4Q81A 1UGGA 4K0TA 4YWPA 2ILIA 4ZX0A 3M5SA 1OQ5A 1G4OA 4RUZA 3OILA 1BNQA 2NWOA 1V9EA 4YGNA 3V7XA 2Q1QA 1YO2A 2AX2A 3QYKA 2FOUA 1RAYA 1I9QA 1CVBA 4CNXA 3CZVA 5BRUA 4Q87A 3M67A 5DRSA 5BRWA 3N2PA 1ZSCA 1Z97A 4QSIA 3RLDA 2Q38A 2NWZA 4PXXA 3KS3A 3RG4A 4Q07A 4N0XB 3GZ0A 3M04A 1TEQX 3NI5A 4Q49A 4QEFA 1IF6A 4M2UA 5EIJA 3JXHC 4FPTA 1CRMA 1EOUA 1MOOA 1HEBA 1CVAA 3BETA 4FU5A 3F7UA 4KNIA 4Q08A 3DBUA 12CAA 3VBDA 1MUAA 1ZFQA 3ML2A 3N4BA 1RAZA 3T83A 4QSJA 3DC3A 3IBIA 2NXRA 1FSQA 4K13A 1IF5A 4FL7A 1YDCA 4Q99A 2X7SA 3RZ8A 4IDRX 1HEDA 4XE1A 5SZ1A 1CNXA 1BNWA 1CINA 3CA2A 3DA2A 4PQ7A 1HUHA 3K34A 5EHWA 1G46A 3F8EA 2NXSA 1KOQA 1G0EA 3D0NA 2NNVA 4CNWA 1BN4A 3CAJA 1TE3X 5JGTB 4Z1KA 4WW8A 1BN3A 5EHVA 2X7UA 1Y7WA 2FNMA 1JV0A 3MNAA 1YO1A 3T84A 1G6VA 1RZEA 1G4JA 1YDAA 3KKXA 1CAOA 5JG3B 4ZAOA 5AMDA 2FMGA 3NB5A 5E5UA 5JQ0A 5EZTX 4LHIA 4QK3A 5A6HA 2FNNA 3IBNA 3SBHA 4RH2A 1CAYA 3M1JA 2NNGA 1XQ0A 2FOVA 3P55A 4L5UA 5SZ6A 2NN1A 3T82A 3SAPA 3M2XA 5SZ7A 3OIMA 1I90A 5HPJA 3OYQA 4RUYA 3V3HB 4Q0LA 2EU3A 4ZWIA 2ABEA 4ITPA 1FQLA 1DCAA 3U3AX 2Q1BA 3RZ1B 3DVBA 1CALA 8CA2A 4GL1X 3MNKA 3HLJA 3KIGA 3DD8A 3LXEA 4BF1A 1IF4A 2IT4A 3S71B 1CAJA 3K2FA 3M96A 1AZMA 5DSKA 1HVAA 1TEUX 3BL1A 3W6HA 3S72B 5AMGA 1TG3A 4FIKA 1CNJA 3PJJA 2NWYA 4UOVA 3OKUA 2EU2A 2AW1A 4PYYA 5L3OA 4QK2A 4TWMA 3RYYA 3UYNA 5SZ5A 4YX4A 4Q6DA 5E2KA 3M5TA 4YVYA 4E3GA 1I91A 3KOIA 1ZFKA 1DMXA 1IF8A 2QOAA 5BNLA 4Q90A 1CAIA 3F4XA 4E3FA 5EH8A 3MHLA 1KEQA 4WUQA 1XEGA 2HNCA 1LG5A 4K0SA 3RZ7A 1ZSAA 1CAHA 3D8WA 4QY3A 3RZ0B 4KAPA 4R5AA 1BV3A 1FQMA 1LGDA 3JXFA 4QIYA 4LP6A 4JSSA 5DSQA 3FW3A 3M5EA 2NXTA 6CA2A 5FLRA 5FLSA 1TB0X 4FRCA 2W2JA 5FL6A 3N3JA 5FNHA 3EFIA 1I9PA 2VVBX 3C7PA 3DVCA 3MNHA 4BCWA 1CAKA 3ML5A 1I9LA 3T85A 2VVAX 3V3JA 4Q9YA 4KNNA 1CNYA 4HEYA 3FE4A 3EFTA 3V3IB 4Z0QA 4Q8YA 2WD2A 1I8ZA 1YDBA 2QO8A 4G0CA 4K1QA 4ZX1A 4Q8ZA 3RZ5A 5JESB 4ILXA 3IBLA 1CVDA 3P58A 1ZGFA 4ETQC
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3RGE A;  3SAX A;  1DCB A;  2FOQ A;  1BNM A;  5FL4 A;  1FSR A;  3DVD A;  4L5W A;  4YGF A;  5FNK A;  3OYS A;  4L5V A;  4XFW A;  1HCB A;  1CNB A;  2HKK A;  1KWR A;  3RYZ A;  5FL5 A;  4R59 A;  5BYI A;  3D92 A;  4KNM A;  5SZ4 A;  3MMF A;  4E3H A;  3PYK A;  1G3Z A;  1I9O A;  4YGL A;  3RYJ B;  2F14 A;  1CNH A;  3P3J A;  2NNS A;  1URT A;  2WEO A;  3M3X A;  5EKJ A;  2FOS A;  4M2W A;  3HKQ A;  5FNL A;  3U45 X;  5E2S A;  1KOP A;  3M2Y A;  4M2R A;  4XIX A;  4YGK A;  4QSA A;  3B4F A;  4Z1J A;  4RIU A;  4Q7S A;  1CCT A;  1RZC A;  3M2N A;  4RUX A;  1CZM A;  2POW A;  2CBE A;  5EKH A;  3T5Z A;  5E28 A;  3MNJ A;  1OKL A;  3MNI A;  5G01 A;  2EZ7 A;  5LMD A;  4RFD A;  3HKU A;  3P5A A;  2FMZ A;  3N0N A;  1AVN A;  4WL4 A;  3MDZ A;  5FDI A;  5FDC A;  1G0F A;  4JS6 A;  1CVC A;  3RG3 A;  3P3H A;  1G48 A;  4HT0 A;  3P5L A;  5CA2 A;  5JGS B;  1FSN A;  1BIC A;  4FVO A;  3MYQ A;  4G7A A;  5DSN A;  3S77 B;  4COQ A;  2NN7 A;  3IGP A;  4MDM A;  1UGA A;  4KUV A;  3RJ7 A;  1CIL A;  4KP8 A;  1UGD A;  1RJ5 A;  4CNR A;  1TG9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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