1CALA

Structural analysis of the zinc hydroxide-thr 199-glu 106 hydrogen bonding network in human carbonic anhydrase ii
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
HHWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLATPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase(oxo-acid)
molecule keywords CARBONIC ANHYDRASE II
publication title Structural analysis of the zinc hydroxide-Thr-199-Glu-106 hydrogen-bond network in human carbonic anhydrase II.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 258
sequence length 258
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 1992-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 1calA00
3F7BA 3OILA 3F4XA 3P3JA 1CVHA 4QJMA 3UYNA 4Q81A 3M1QA 4ZWYA 1YO2A 1CVAA 1KEQA 1Y7WA 3MYQA 4ZAOA 4MLTA 3KIGA 4Q78A 5AMLA 3EFIA 5JQ0A 4QJOA 1HVAA 5DSQA 1XQ0A 3D0NA 3LXEA 4Q49A 6CA2A 1ZSCA 3RZ1B 3K7KA 4G7AA 3CYUA 4WUPA 1ZGFA 3U45X 3M2NA 4XZ5A 3MWOA 3KNEA 3DCSA 3FE4A 5E5RA 3UYQA 1BN4A 1YDDA 3MNIA 3T85A 5EIJA 4LHIA 3HFPA 3U47A 3V3FA 1HCAA 4KNMA 1RJ6A 1JCZA 4E3GA 1G0EA 4COQA 4PQ7A 3DA2A 1KWQA 4Q8YA 5DOGA 4JSWA 1CAHA 4JSSA 1CNBA 5EH8A 2FOSA 1I8ZA 1TH9A 3S74B 4QJ0A 2OSMA 5FNKA 1ZSBA 4E3FA 9CA2A 5FLSA 3V7XA 4YGNA 5A6HA 5LMDA 5FLRA 3N3JA 3MHOA 4HF3A 1BV3A 4KP8A 1AZMA 3CAJA 3M2ZA 4ILXA 3MNKA 2AW1A 3S72B 5EHEA 5FDIA 1FSNA 5FNJA 1CNYA 4KAPA 4Q8ZA 1YO0A 3S77B 3M1KA 3Q31A 4KNNA 4QJXA 4XE1A 2ILIA 5DSOA 3IEOA 5G03A 3DD8A 3JXFA 4Q06A 5EZTX 5CLUA 3PJJA 1CILA 1G52A 4Q07A 3U3AX 3M04A 4JSZA 4Q8XA 1G46A 4YX4A 2NWYA 1BNNA 1BNMA 3FW3A 1CANA 1ZSAA 1BNTA 5DSMA 4Q83A 3IBUA 3IGPA 1G4OA 4LU3A 3NI5A 4HU1A 2HL4A 1EOUA 1IF4A 4K0TA 3N2PA 4Q90A 4MDGA 2NNSA 3OIKA 4M2VA 5FNGA 4N16A 3EFTA 4QK2A 5IPZA 3OYSA 1CNGA 3DVBA 5JEHB 3T5UA 5E2SA 5G0BA 3M67A 3JXGA 4M2WA 2NXRA 2WD2A 5JGSB 3HKTA 5FLOA 3M2XA 5FDCA 4E9OX 4XIXA 3MHCA 3DC3A 1XEVA 4IWZA 1CA2A 3M98A 1BZMA 3CA2A 4JSAA 5E2KA 1I91A 1YDBA 3M96A 3MHMA 2AX2A 2WEGA 1OQ5A 3IBLA 3P5LA 1TB0X 2NXTA 1DMYA 3B4FA 3JXHC 5FL5A 1UGAA 1ZNCA 1THKA 3CZVA 1DMXA 1G54A 3OKVA 5CA2A 5SZ3A 3D9ZA 3MHIA 2CBCA 5G01A 4DZ9A 3RGEA 2VVBX 1BNWA 3P5AA 3L14A 5BYIA 1XEGA 3S9TA 4PZHA 4Y0JA 4QK1A 3MNAA 5FLQA 5SZ2A 2FNNA 1XPZA 1YDAA 3T83A 2H15A 1A42A 4WR7A 1LG6A 1ZFQA 5AMDA 4QJWA 1CAYA 5SZ1A 1CAMA 4X5SA 3P4VA 3S75B 1RAZA 3V3HB 4CNWA 5DSJA 5JEGB 1FLJA 1CNXA 4E5QA 3SAPA 2FNKA 1CCUA 1OKMA 3SBHA 3MNJA 1BICA 1CVBA 1FSRA 1BN1A 4RN4A 4WW6A 4MDLA 4QK3A 5EHVA 5E28A 1CZMA 4CNXA 5JESB 5EH5A 4Q0LA 4UOVA 3HLJA 2X7TA 4MDMA 4QEFA 4CQ0A 1LGDA 2EZ7A 1UGDA 1CVFA 4RUYA 1BNUA 4Q7SA 1TE3X 5DSRA 1UGFA 2NWOA 4ITOA 4M2UA 3RLDA 2FOUA 4KV0A 1CAKA 2NN1A 1RAYA 1CNCA 4RUXA 3V3IB 4Q7WA 3DVDA 2POWA 4TWLA 2FMZA 4K13A 4KUYA 4QY3A 4E4AA 2HKKA 3MMFA 3MDZA 1UGGA 3M40A 3DD0A 4DZ7A 5E2MA 1BCDA 1BNQA 3DCWA 5EOIA 1TEUX 3U7CA 1AM6A 4MTYA 2GD8A 3KOIA 1TEQX 4Z1KA 5C8IA 1I9MA 4CACA 1DCAA 3S73B 3PYKA 2QOAA 3K34A 1CNKA 3SBIA 2GEHA 3B1BA 4PYXA 1H4NA 4ZWIA 4QSAA 5BRWA 4PXXA 4PYYA 4RFCA 5L3OA 1RZEA 3M5TA 4KUWA 3ML5A 1H9NA 4MO8A 1IF9A 4ZX0A 5SZ0A 1G3ZA 1BN3A 1F2WA 4FVNA 1RZDA 3D93A 3HKNA 4HEWA 1CA3A 1HUHA 4FPTA 3D92A 3RYVB 4L5UA 2EU2A 3M14A 4XIWA 3TMJA 3P44A 4Q09A 4WL4A 3KKXA 5JG3B 3RZ7A 2CBBA 2CABA 1YO1A 1JV0A 5SZ7A 1CVEA 4K1QA 3KLDB 3N4BA 3HKUA 4BF6A 5A25A 3N0NA 2CBAA 2ZNCA 4Q6EA 4RH2A 3VBDA 4RIUA 3KONA 4Q99A 1YDCA 3SAXA 2NXSA 5HPJA 4Z1EA 1H9QA 5DSKA 3RYYA 3TVOX 3P55A 2POVA 1J9WA 2FOVA 3S76A 3IBIA 3P3HA 4CA2A 1KOQA 5FNMA 1G0FA 1Z97A 2WEJA 4QSBA 4Q87A 3IAIA 5J8ZA 5JQTA 4BF1A 1T9NA 4N0XB 4MLXA 3R17B 1KOPA 5E2RA 1FQLA 3S97A 2IT4A 1CVCA 3TVNX 4WUQA 4TWMA 4XFWA 4Z0QA 2OSFA 4HT0A 1I9NA 2WD3A 1URTA 2W2JA 3MNHA 1CCSA 3BL0A 3GZ0A 12CAA 1CALA 3OY0A 2NWZA 1RZBA 4ZWXA 1CVDA 3M5SA 1V9EA 1FQMA 5SZ4A 1UGEA 3M5EA 3W6HA 4GL1X 2CBDA 4LP6A 4QIZA 1I90A 5E5UA 5CJFA 5L6KA 3T82A 2VVAX 4QSJA 4YWPA 4KUVA 1IF8A 1KWRA 2Q1QA 1CNJA 1MUAA 3QYKA 7CA2A 2FOYA 2WEHA 5FNHA 2O4ZA 3S78B 5DSIA 4R5BA 3MZCA 2WEOA 3DV7A 1CAIA 4YGLA 4ZX1A 3V2MA 3RYJB 3K2FA 1CAZA 4ZWZA 1G53A 3DCCA 1LUGA 3S8XA 4IDRX 1LG5A 4Z1JA 1OKLA 1V9IC 3ZNCA 2QP6A 4WW8A 4QSIA 4R5AA 4YHAA 5BNLA 1TG9A 4K0SA 2FOQA 2X7UA 2CBEA 3RG3A 4HBAA 4QJPA 5JDVB 3FFPX 1AVNA 3DC9A 1G1DA 3S71B 3RYZA 5E2NA 1IF6A 3T84A 3HS4A 4Q9YA 4L5WA 5EKJA 1TG3A 4FU5A 4YGFA 3V5GA 4YGKA 4HT2A 3V2JA 3RYXB 2CA2A 5BRUA 2H4NA 1HUGA 3RZ5A 3T5ZA 3MNUA 3BETA 4BCWA 1I9LA 1UGBA 2NNVA 5AMGA 1CAJA 1HECA 3F8EA 1Z9YA 4Q6DA 1TTMA 4JS6A 1HEBA 4RFDA 2HOCA 3ZP9A 2HFWA 4CNVA 4RIVA 5EH7A 5CACA 3OKUA 3KOKA 1G4JA 3P58A 1FR4A 3V3JA 5DSPA 1CCTA 3V3GB 1OKNA 3M2YA 1IF5A 3OYQA 4Q08A 3F7UA 4FL7A 4QIYA 1CINA 3R16A 3RG4A 3W6IA 4YXIA 3RZ8A 1HEDA 4KNIA 4FIKA 4K0ZA 5SZ5A 5DRSA 1CNIA 5EKMA 4YYTA 4M2RA 2F14A 4FVOA 1CRAA 2NWPA 1G45A 5EKHA 5FLTA 2NNGA 3ML2A 3DAZA 3NB5A 2Q38A 5FNLA 4YXOA 1ZGEA 1LZVA 1I9OA 2Q1BA 2NN7A 4KNJA 3MHLA 4Q7PA 1FSQA 5FL4A 3IBNA 3M3XA 3PO6A 1Z93A 4E49A 2FMGA 1ZFKA 4Z1NA 5EHWA 1JD0A 2FW4A 3M1WA 4KP5A 2ABEA 5BRVA 4E3HA 1IF7A 1FQRA 3NJ9A 5FNIA 5FL6A 3RZ0B 3KWAA 1TBTX 4E3DA 4ITPA 5DSNA 4FRCA 3D8WA 2HD6A 1FQNA 5JEPB 1ZH9A 2X7SA 4C3TA 2EU3A 1MOOA 1RJ5A 1DCBA 5SZ6A 1I9QA 3BL1A 3DVCA 3RJ7A 1RZCA 4HEZA 5DOHA 3DBUA 4Q7VA 4ETQC 5FLPA 1CIMA 4YGJA 1CAOA 3HKQA 2QO8A 1G48A 1I9PA 3OIMA 4G0CA 5G0CA 1G6VA 5JGTB 4YVYA 5DVXA 4CNRA 1BNVA 4RUZA 2HNCA 8CA2A 1CRMA 4L5VA 4R59A 1CNWA 2POUA 3M1JA 1HEAA 4HEYA 2NMXA 2FNMA 1CNHA 1HCBA 1UGCA 4QTLA 1RZAA 3C7PA 2NNOA 5JG5B 5DSLA 1FR7A 1ZE8A 4YXUA 3KS3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3F7B A;  3OIL A;  3F4X A;  3P3J A;  1CVH A;  4QJM A;  3UYN A;  4Q81 A;  3M1Q A;  4ZWY A;  1YO2 A;  1CVA A;  1KEQ A;  1Y7W A;  3MYQ A;  4ZAO A;  4MLT A;  3KIG A;  4Q78 A;  5AML A;  3EFI A;  5JQ0 A;  4QJO A;  1HVA A;  5DSQ A;  1XQ0 A;  3D0N A;  3LXE A;  4Q49 A;  6CA2 A;  1ZSC A;  3RZ1 B;  3K7K A;  4G7A A;  3CYU A;  4WUP A;  1ZGF A;  3U45 X;  3M2N A;  4XZ5 A;  3MWO A;  3KNE A;  3DCS A;  3FE4 A;  5E5R A;  3UYQ A;  1BN4 A;  1YDD A;  3MNI A;  3T85 A;  5EIJ A;  4LHI A;  3HFP A;  3U47 A;  3V3F A;  1HCA A;  4KNM A;  1RJ6 A;  1JCZ A;  4E3G A;  1G0E A;  4COQ A;  4PQ7 A;  3DA2 A;  1KWQ A;  4Q8Y A;  5DOG A;  4JSW A;  1CAH A;  4JSS A;  1CNB A;  5EH8 A;  2FOS A;  1I8Z A;  1TH9 A;  3S74 B;  4QJ0 A;  2OSM A;  5FNK A;  1ZSB A;  4E3F A;  9CA2 A;  5FLS A;  3V7X A;  4YGN A;  5A6H A;  5LMD A;  5FLR A;  3N3J A;  3MHO A;  4HF3 A;  1BV3 A;  4KP8 A;  1AZM A;  3CAJ A;  3M2Z A;  4ILX A;  3MNK A;  2AW1 A;  3S72 B;  5EHE A;  5FDI A;  1FSN A;  5FNJ A;  1CNY A;  4KAP A;  4Q8Z A;  1YO0 A;  3S77 B;  3M1K A;  3Q31 A;  4KNN A; 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