1CB6A

Structure of human apolactoferrin at 2.0 a resolution.
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of human apolactoferrin at 2.0 A resolution. Refinement and analysis of ligand-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
total genus 226
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 1999-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A03
3OELA 5TPAB 1MQHA 2VHAA 5CI5A 1B5IA 4G68B 1DSNA 1NNKA 3M3FA 3IJOB 2ONRA 3MZ1A 5EHMA 2F34A 4OERA 4F22A 2I48A 1JW4A 2XXUA 3AXFA 4ZEIA 3HV1A 3FVNA 3JYRA 2PMSA 1D4NA 5JK4A 5CBSA 5FHNA 4GL8A 4FEDA 2QS1A 3MVXA 1EZPA 2I3WA 5H8QB 3KZGA 4PP0A 4YMAA 1B0HA 1TWYA 4LZ8A 4JBZA 4NF4A 3CVGA 2CMOA 2NUVA 4G68C 1DTGA 3VVDA 3USDA 4OTEA 4H8IA 4NE4A 5JTYB 4LATA 1MXWA 2F97A 5ISUA 1MG1A 3T9UA 1FQAA 3ILUB 4GRKA 3RY3A 5HPQA 1R9QA 2F36A 2I0CA 2B3FA 4OENA 5CMCA 4EXKA 3G3KA 3RN8A 2F5XA 1DMBA 4PFTA 2ZYOA 2H99A 1FTMA 2A5TA 3OOAA 3DM0A 4KYDA 1L5TA 4KHZE 4POXA 3SDFA 3T22A 1MM6A 4RA1A 1FW0A 1B4HA 4OYVA 3JV9A 3N94A 2RC9A 4U1ZA 4MFIA 2HXWA 2I4CA 1QKBA 4M1VA 1AOVA 3UA8A 3MZBA 4G8NA 4R72A 3MP6A 3SEVA 3PMVA 3C35A 1FQBA 4RYAA 1XT8A 4NF4B 3OMBA 1MH3A 4HTGA 4NWCA 3VXCA 2DE2A 3R26A 1D9VA 4KPTA 2RC8A 3BKIB 3IORA 2XXYA 4XIGQ 3CR9A 1SW1A 1FTKA 4OEVA 5CRYA 4KQPA 4GOTA 1TFDA 4OXVA 5DVJA 1YPNA 2YJPA 1J1NA 4X1DA 4GWOA 1PDAA 2GHBA 1VR5A 3TAJA 2A5TB 1ZU0A 3C32A 3PUZE 3U94A 2IA4A 4XTCQ 3IO6A 1JEVA 3M3KA 1B3FA 4P11A 3V5AA 2O84X 3HCQA 2H4IA 2HZLA 1IQ7A 2ESNA 4BDRA 1UTBB 1QULA 4JB7A 1NH8A 3C33A 3FD3A 3T9VA 2DSFA 4EF1A 3QK6A 1BTJA 3C9HA 1OQGA 2YLNA 4YKKA 1LCFA 4RY1A 1LAHE 3OO9A 3U92A 2ALUA 5AE4A 4RPNA 3G3JA 2AYSA 2REGA 1KWHA 2X7PA 2O1MA 3OO8A 5LOMA 5DVFA 3SETA 4PETA 3T93B 1VFEA 4F39A 5I2NB 3L6HA 3CSBA 4O3AA 3E9XA 3A3CA 5F1QA 2THIA 4JWOA 4Z7EA 4ELOA 1FTJA 3IK6B 4ZE8A 3LSXA 4Q8RA 3K00A 3CG3A 3O29A 4QFKA 2Q2AA 3MQ9A 4LQ2A 2I3VA 4XKQA 4H8JA 1EU8A 4XKNA 4U21A 4F3BA 2V3QA 4EQ9A 3IB1A 3O6HA 4LVQA 4QSEA 2FYIA 4U2RA 4E0WA 3FATA 3OSQA 2HEUA 1LAFE 4F2OA 4LZ5A 4R9GA 4NEDA 3PPRA 1MY0A 2DVZA 4WEPA 3O9PA 3OEKA 5L9OA 3IR1A 1SYIA 3VLVA 3MWBA 2R9JA 2HAVA 4R6HA 4RK9A 3TQLA 3KGCA 1LFGA 2GH9A 4TLLB 1SQYA 4R9FA 1MRPA 3W15C 3FGSA 3GBBA 4IO6A 1B3LA 3G3HA 1TFAA 1OVTA 5I56B 1URGA 4OFJA 5H8NB 1H45A 1MXXA 3CFLA 4DDDA 1XVYA 3VV5A 4ZZAA 4F1UA 5I2KB 2UYEA 4R75A 1HSLA 1B5HA 3K6VA 3CI8A 3SEXA 3S9EA 2P2AA 1PBQA 4G4PA 4ELRA 3KOTA 4I8CA 3SEWA 5FTIA 3VDFA 2DVCA 2ABHA 4F3PA 2QPQA 4BDLA 4OHNA 5ELVA 2YPNA 2VGQA 4ISUA 4DZ1A 4ESWA 5I84A 1Y1ZA 1QJMA 3EHUA 5CM6A 1HSJA 3N6TA 4QF9A 1A8FA 3K01A 1ZBMA 4QFOA 3ZSFA 1MPDA 4RNSA 3TYHA 4R2BA 1I69A 3VLUA 1M5CA 1IITA 2XD2A 4E0XA 3IAZA 2QRYA 2AL4A 5F7VA 1P1NA 4HW8A 2OZZA 3MP8A 4NMYA 1BKAA 1B1HA 4F2QA 3KFMA 5CMMA 2UYFA 1P1OA 4LQ5A 2V3TA 2Z23A 4YB5A 2D21A 2GRVA 1O64A 4PE5B 3R7XA 1IXGA 2FA7A 1Y9UA 4H0WA 1PB9A 1M5EA 1N0TA 1N04A 3H3GA 4RJZA 3VXBA 1AMFA 4F1VA 3K6WA 3B6WA 2R71A 2LAOA 1BIYA 2Y7KA 1ZMGA 2H5YA 4BDQA 1I6QA 1URSA 3FV2A 1B3GA 3ECRA 2Q9TA 3E13X 3V83A 1QUIA 4KCDA 3W9VA 4FORA 4FATA 3FXUA 3LSWA 3CIJA 5AA2B 2XX7A 3CG1A 1ZLQA 3U1OA 1R1NA 1IUDA 1M5BA 5AA4B 2ZYNA 2HAUA 3GXAA 1SDXA 4JSOA 4OVJA 1BLFA 1R9LA 3K02A 3N5LA 4IGRA 4THIA 5I59A 2DWHA 2ONKE 3FIRA 3V89B 4MH5A 3MPKA 3LR1A 3Q28A 1H76A 1H3DA 4P0IA 3TTKA 4LUBA 4ZEDA 1OLCA 3Q25A 1SW2A 1ATGA 3MZ9A 4F18A 4IY5A 3C31A 3PPQA 4H6DA 4GD5A 3MVYA 3WAFA 5KDTB 2RC7A 1JVXA 4JSDA 3ZKKA 1MQGA 3KJTA 1WVJA 5L8DA 4X48A 1B58A 1SBPA 4GVOA 3I3VA 3RT6B 2ANJA 3OSRA 3PUXE 3MPLA 5ICTA 4TQUQ 2NXOA 3O97A 1LSTA 3M3LA 2O7UA 2HQ0A 1ELJA 2QS2A 1IEJA 4H5FA 4H5GA 1JQFA 4DCYA 4EUOA 4KI0E 3K1MA 1OIBA 1NKXA 3TTLA 2AL5A 1P99A 3OO6A 3T96B 5CMBA 3Q29A 1B9JA 2PX1A 1PC3A 2B3BA 3KEIA 4FE8A 1US4A 3GZGA 3LSFB 4BLAA 2RF1A 1A99A 4Z0IA 4C0RA 2XHDA 1LAGE 2BJJX 4BDOA 3V8XB 1Z7ME 1S50A 3ILTB 1JETA 1F9BA 4NWDA 2OWSA 2DE3A 4NF5A 4POWA 3TDJA 2REJA 4U4SA 1WDNA 1RYOA 1NH7A 3FVOA 4RPOA 3HSTA 2XX8A 3G7WA 4BDMA 1B1XA 4TOZA 2V93A 3KSJA 3TZAA 5ITPA 3G3GA 4MLVA 4U4XA 1B6HA 4PFUA 5CBRA 1EZOA 1P1UA 4DE8A 1AH5A 3RGYA 1URDA 2XXIA 4G2ZA 4OESA 1S9TA 1I6BA 5HBCA 2QS3A 3OO7A 1A7LA 4L17A 1FTLA 4GXAA 3KOSA 4I1DA 2QL3A 4OEUA 3PMWA 3MAMA 4ELPA 3W9WA 1SVXB 4GFRA 1JVYA 4FECA 1JW1A 3PGFA 3H6WA 1NNPA 3QSLA 3PUWE 3SEUA 3T9XB 3FUZA 2O68A 2OBGA 2Z22A 1EH3A 4ELQA 2VP1A 3B6TA 3MVZA 3MVWA 2XD3A 4XXUA 3I6VA 5A5XA 3S9NC 1B05A 2XXPA 3RTWB 3IJXB 1MDP1 4LONB 1UQWA 4KYSA 3UIFA 3O2AA 4NF6A 3KG2A 3PD9A 1T0KA 5B70A 4ZE9A 1SW5A 5DTBA 1N3XA 4G8MA 4JXIA 1Y3PA 4MLQA 4YKIA 3ODBA 1LB8A 3TTMA 3VVEA 2UVGA 1Y3QA 1MY1A 3IL1B 4GXSB 1MXVA 1B51A 5B7DA 2O51A 2PYYA 3S4UA 3O28A 3MC2A 3LSLA 2OK2A 3PPNA 2XXVA 1B32A 1GV8A 4IO7A 3THIA 1A40A 3OEMA 1GGGA 5BWJA 5CMKA 3LC8A 4R6YA 5H8SA 5K2XA 1FQCA 3PPOA 4YU0A 2QMWA 2Q2CA 3FZVA 1FQEA 3MJNA 3SEYA 5EHSA 1PEBA 2PBWA 1MY3A 2UVJA 2F7BA 4F19A 4OMBA 2HCAA 2XXRA 1A8EA 5CC2A 1R6ZA 5TP9A 3QXMA 1OQHA 4YKPA 1LAXA 2I0BA 1TXFA 3LUYA 3FASA 2XXHA 2VD3A 3K2DA 3HN0A 3TMGA 2I58A 2WKYA 3BFUA 3Q27A 1ZJLA 2DXYA 1AL3A 5DT6A 1B7UA 3MBPA 3TTRA 1MXUA 2Y7PA 4NTLA 3VE1B 1B46A 2GHAA 2H25A 1MPCA 3S9LC 5KCJA 3TTNA 4R2FA 3EHSA 3OENA 3UP9A 2RCAA 1PB8A 4LP2B 1VE4A 1IXHA 4ZEBA 5L9MA 2NWJA 5H8HA 3C4MA 3WAEA 3UK4A 1SYHA 4OETA 3RNNA 3FJGA 3R6UA 2OLBA 4FJPA 1AIVA 4X1BA 3BFTA 2XXTA 2Z8EA 1NMUA 3TQWA 3C34A 1QUKA 5IAIA 2H9BA 1DOTA 3C36A 5H8FA 2Q89A 4EQBA 2Q8JA 5M2VA 4BDNA 4NF8A 4DLDA 3EPEA 3SERA 3FJMA 1MDQA 2XXXA 1B7ZA 3SKPA 1PBPA 5DEXA 5IKBA 3G3IA 2ZYKA 2H98A 4X9TA 4G68A 2PT1A 1B4ZA 2ZNTA 3OXNA 5KCJB 3K4UA 2PVUA 2DYXA 1O7TA 3KBRA 4GIZA 4EDPA 1N7XA 3QYTA 4ECFA 2V25A 2F8DA 3TKDA 4N6PA 1MPBA 4I9DA 1SI1A 4QSDA 4QFLA 2E1SA 4M4GA 4N07A 5H8QA 3TPAA 1MH4A 3VLWA 4EF2A 1B5JA 2XXQA 4QFNA 4ZECA 4C1UA 4LA9A 2D3IA 3ONMA 1CE2A 2F7AA 3DLNA 4NF8B 1CB6A 4F29A 4YKJA 1US5A 1FQDA 1FCKA 4QFPA 4QSCA 1DPEA 2PT2A 2QSXA 3RQTA 2AIXA 3A09A 1Y4TA 3QUJA 4N13A 1YTVA 4WEDA 1IXIA 5DEXB 1YCJA 3IOVA 2X26A 2I6EA 1POY1 3TFLA 1NFTA 4KCCA 3IX1A 4U1OA 4IO2A 4OZ9A 1MXYA 4ONYA 4WXJA 2Z8FA 4GF8A 4IO5A 2Y7RA 1MQDA 5KZTA 4JWYA 3PU5A 4ND9A 3O6GA 4F3GA 4QRZA 2QS4A 2KLFA 1JEUA 1NNFA 4KFQA 1XOCA 3KN8A 5I57A 3QAXA 4MBPA 3K1NA 3QUFA 4JWXA 5AA2D 3CFXA 2F78A 3O66A 2GFEA 1ZIUA 1B3EA 4ZEKA 2OCUA 1ZTYA 2V3UA 3IB0A 3Q26A 4R6KA 3MW0A 4JDFA 5ITOA 5BUUA 4IO3A 3GLBA 1Z7NE 3JZJA 1LCTA 2Z8DA 3MUQA 5FTHA 4KR5A 1M5DA 4OFOA 2OJTA 3FV1A 2NVUB 1LLSA 3HHFA 3K0VA 3PUVE 4ZEFA 4HCWA 3DP8A 5J1DA 1GR2A 3T9HB 4C1TA 5I59B 3N6UA 3H6UA 4OFLA 1DTZA 4IB2A 4FEBA 4DXBA 1UTBA 3M8UA 4YICA 1IIWA 3FXQA 3H6VA 2DP8A 2UVHA 2VD2A 5DVIA 4UA8A 1OMPA 1DPPA 2Y7WA 3S2VA 5I57B 3B6QA 1POTA 4YB6A 3TCGA 1XC1A 2W7YA 4DIGA 3PD8A 2F35A 4UACA 4YB7A 5DYHA 2DQVA 2D5WA 2ZYMA 2XXWA 4KD5A 4DXCA 2F7CA 3H7MA 3IO4A 1I6AA 1GTKA 1O63A 3H03A 2NOOA 1UIUA 3PV0E 4G8HA 3DP4A 1XS5A 3UGWA 4H65A 4R73A 5I2NA 3GBAA 4EQ7A 3E4RA 4OQOA 1H43A 2Y84A 1Y4CA 2G29A 3SESA 4K3FA 1N7WA 4YMBA 3H4ZA 1B0LA 3CRBA 2RINA 3RPWA 2UXAA 3CFZA 2RKMA 3KSXA 2M8CA 4I62A 1Q1KA 3QIMA 3EN3A 1SI0A 4LZ7A 3UN6A 4FIMA 3OD7A 4IY6A 4NF5B 3TUSA 3G3FA 2ZMBA 4IO4A 1RKMA 2V84A 1Y1MA 3T66A 1MY4A 2I4BA 3KN3A 2DWIA 3FJ7A 2DWJA 1ANFA 1VFDA 2UVIA 5I58A 3PMXA 5ICQA 3L6GA 1LGBC 1MY2A 1JW5A 1N3WA 4GL0A 1B52A 2O1LA 3FVGA 5K2YA 1LBBA 1EZ9A 4KYEA 1S7YA 3K1PA 3PPPA 3DP6A 4RXLA 1MXZA 4GLIA 1UIVA 1USYE 1N84A 3K6UA 1P1QA 2ZNSA 4ESXA 4P0GA 4AQ4A 5TU0A 2ZNUA 4G77A 2I49A 3IOWA 4XKRA 4WKMA 1Y3NA 5FHMA 5AA1A 3CSGA 4H67A 5I56A 2O69A 5H8NA 5HM4B 4ZDMA 2QJEA 2IEEA 5I2KA 1N76A 3S9MC 3VFJA 3U93A 1OLAA 1M5FA 2P1SA 2O7IA 3UORA 2X7QA 5A5XB 4PQJA 2F6PA 4MF3A 4DXUA 3E3KA 4TLMB 5I58B 2Y7IA 3HO7A 1II5A 3D4GA 4AB6A 3H06B 1B7HA 1JNFA 3D4CA 4FAJA 4PFYA 4NF6B 3TELA 3RUMA 1YAEA 3KJ7A 1IXCA 2QMXA 4ZS9A 1LFIA 2HZKA 1OVBA 5EYFA 2OWTA 1NL5A 4QHQA 1B40A 3B7DA 3ZS6A 1QUJA 3A3UA 3P7IA 4Q30B 3FXRA 2B65A 3PUYE 3U8QA 2ONSA 4OWDA 1Y20A 3EHTA 4AB5A 5AA3A 2A5SA 3HPIA 3FVKA 3O6IA 4DCXA 2DOJA 4GQOA 4IGTA 1QVSA 2Q88A 4Q0CA 4XKPA 5JEIA 3N26A 1D9YA 2DXRA 1USYH 1A54A 3TCFA 1MQJA 4U22A 1FTOA 4O3CA 3HHGA 1FQFA 4ZZEA 2RCBA 4F1YA 1LB9A 1IZ1A 3EF7A 1SD3A 1MQIA 3RT8A 2DS9A 3TCHA 3U72A 1A55A 5TP9B 2XX9A 3EQ1A 3RLFE 1TT1A 4U23A 1MM7A 1UTHA 2DE4A 1QKAA 3IOTA 5TPAA 1SW4A 4YAHX 1VSOA 3H6TA 5AA2A 1WODA 2G93A 2ZXTA 3DELB 3F11A 3BBRA 5AA4A 4H1XA 1HSEA 3VVFA 1MS7A 5H8HB 5L9SA 3RTFB 1PB7A 4F31B 1LBCA 3K6XA 1XVXA 3LBSA 2DWAA 1QW0A 2F6GA 1NNTA 4RK2A 1ZKBA 2HFBA 1RYXA 4F3SA 3IB2A 1P1WA 1LFHA 3I5OA 2R6GE 4R74A 4YZZA 5H8FB 4HCYA 1B2HA 1B3HA 5FHOA 1Q35A 3ZKLA 1GVCA 4O3BA 4EXLA 2E0SA 3TODA 1XHYA 1BP5A 3IOUA 4PFWA 5JTYA 5KDTA 3KN7A 3TEPA 4Q5TA 2FNCA 2VOZA 2O6AA 3MP1A 1D3KA 2CZLA 1H44A 4HS7A 2P0SA 1UTHB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4N8GA 4MAGA 4O8MA 3OELA 5TPAB 4MIJA 1MQHA 2VHAA 5CI5A 1B5IA 4G68B 4P1EA 1DSNA 1NNKA 3M3FA 3IJOB 2ONRA 3MZ1A 5EHMA 2F34A 4OERA 4F22A 2I48A 1JW4A 2HPGA 2XXUA 3AXFA 4ZEIA 3HV1A 3FVNA 2V4CA 1IMDA 4NQ8A 3JYRA 5IM2A 2PMSA 1D4NA 5JK4A 5CBSA 5FHNA 4GL8A 4FEDA 2QS1A 3MVXA 1EZPA 2I3WA 5H8QB 3KZGA 4PP0A 4YMAA 1B0HA 1TWYA 4LZ8A 4JBZA 4NF4A 3CVGA 2CMOA 2NUVA 4G68C 1DTGA 3VVDA 3USDA 4OTEA 4H8IA 4NE4A 5JTYB 4LATA 1MXWA 2F97A 5ISUA 1MG1A 3T9UA 1FQAA 3ILUB 4GRKA 3RY3A 1FBEA 5HPQA 1R9QA 5IZ1A 2F36A 4OVRA 2I0CA 2B3FA 4MNIA 4OENA 5CMCA 4EXKA 3G3KA 3RN8A 4JVIA 2F5XA 1DMBA 4PFTA 2ZYOA 2H99A 1FTMA 2A5TA 4N4UA 3OOAA 3DM0A 4KYDA 1L5TA 1FBDA 4KHZE 4POXA 3SDFA 2FIXA 3T22A 1MM6A 4NF0A 4RA1A 1FW0A 1B4HA 4OYVA 2CEYA 3JV9A 3N94A 2RC9A 1FTAA 4U1ZA 4X04A 4MFIA 2HXWA 2I4CA 1QKBA 4M1VA 1AOVA 3UA8A 3MZBA 5DW8A 4G8NA 4R72A 3MP6A 2CEXA 3SEVA 4PTKA 3PMVA 3C35A 1FQBA 4RYAA 1XT8A 4NF4B 3OMBA 1MH3A 4HTGA 4NWCA 3VXCA 2DE2A 3R26A 1D9VA 4KPTA 5F24A 2RC8A 3BKIB 3IORA 2XXYA 4XIGQ 3CR9A 1SW1A 1FTKA 4GX6A 4OEVA 5CRYA 4QXDA 4KQPA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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