1CB6A

Structure of human apolactoferrin at 2.0 a resolution.
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structure of human apolactoferrin at 2.0 A resolution. Refinement and analysis of ligand-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Iron transport
total genus 226
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 1999-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A03
3WAEA 4H8IA 1IIWA 3C9HA 4PE5B 4ESXA 4UACA 4YB7A 4F3PA 1TXFA 4U22A 4DZ1A 2DWJA 5TPAB 1EU8A 2THIA 3H6WA 4ZZEA 2X7PA 3K1NA 4GD5A 1PB7A 4FECA 2RF1A 4O3CA 1PBQA 3TTNA 3C4MA 3MC2A 1LCTA 5ICQA 3EQ1A 4QHQA 5I56B 1DPPA 4ZEFA 3DLNA 1B4HA 3PPPA 3V83A 4O3AA 5KDTB 4R6KA 3TELA 5FTIA 1FQDA 1ANFA 1GTKA 1OLCA 1SBPA 2ZNSA 3IJXB 5K2YA 1R1NA 4BDLA 2XXTA 5H8FB 3PMWA 2ZNTA 3O9PA 2OWSA 1IITA 4MFIA 3T9UA 3C33A 3RN8A 2REGA 3MAMA 4R2BA 1NNFA 1H43A 4F1UA 2Y7RA 3PD8A 1B9JA 3PPRA 4BDNA 1FQAA 4U23A 4FIMA 3K1MA 2DVZA 2ABHA 4X48A 4R74A 1B3GA 1OMPA 3O66A 2RCAA 4NF4A 1VFDA 3T9HB 1N3XA 3LUYA 3IAZA 1URSA 4MH5A 4JSDA 1MQDA 1B32A 4F39A 1D3KA 1JW5A 2OZZA 4KD5A 4DXBA 1SW2A 3LR1A 3VVFA 3V8XB 4DIGA 2ESNA 3WAFA 2XHDA 3B6WA 4QF9A 1P99A 3IK6B 1ZBMA 5J1DA 4BLAA 1MRPA 1A7LA 1B05A 1LAFE 4GFRA 4BDMA 2QMXA 2ONSA 3RT6B 1PBPA 2XD3A 4GL8A 1LAGE 3PUWE 2QS1A 3TFLA 4JXIA 2DQVA 3USDA 2VP1A 3RNNA 4YB5A 1FTJA 3S4UA 1I69A 4EXLA 5HPQA 4N07A 4DCYA 1NMUA 2E1SA 1VSOA 1LLSA 1LAHE 2O51A 1MDQA 1N7XA 3C31A 3ILTB 5TU0A 4BDOA 4LQ2A 4UA8A 2GHAA 2FA7A 2R6GE 4NF4B 1B7HA 3UK4A 3HHGA 3GZGA 3OXNA 4NEDA 3U93A 2D21A 4X1BA 4QFKA 3E4RA 1SQYA 4F22A 3FUZA 3KSXA 1EZOA 5AA4A 3TCGA 4DDDA 3FIRA 1R9LA 3HHFA 4U1ZA 4RPOA 1Y1MA 3OELA 4EF1A 1MS7A 4DCXA 5JEIA 2ZYMA 4NF5B 1PDAA 3N6TA 2I58A 3MPLA 1L5TA 3T9XB 3QUJA 4RA1A 4XTCQ 4JBZA 5CC2A 2P1SA 1R6ZA 4H5FA 1O63A 2DWAA 1IUDA 3FVGA 4GLIA 3MVYA 2QS4A 1TWYA 2DSFA 3KGCA 2RC8A 1P1OA 1USYH 5TP9A 2F97A 4PFTA 3ZS6A 4ZE9A 1SD3A 5HM4B 1PEBA 2O1LA 2DOJA 3VLWA 1B7UA 3TMGA 3RY3A 5FTHA 1IEJA 4LP2B 1MQHA 1QVSA 1OQHA 4P0GA 4RPNA 2V3UA 1LCFA 2Z8DA 3QUFA 3OO8A 4HW8A 3KOSA 3LSXA 3SEUA 1DTGA 4I8CA 1MXUA 3LSWA 2PMSA 3RTWB 2V3TA 3FVKA 4LUBA 5IAIA 2Y7WA 3K02A 1XVXA 4O3BA 4QSEA 1NNKA 2I48A 4LZ5A 4G2ZA 4PFUA 3MZ9A 4H65A 1UIVA 2XXXA 3CVGA 3R6UA 2VGQA 4ELQA 3CRBA 4ISUA 4DE8A 4HTGA 3G3FA 3TCHA 1B3EA 4EQ7A 1US4A 4TLMB 2E0SA 2QL3A 2RINA 3EHTA 1MQIA 1QW0A 3HCQA 4H5GA 3S9LC 4THIA 3BBRA 1LBCA 5H8QA 1MPCA 2ZMBA 3B6QA 4EXKA 1MH4A 2QPQA 5TP9B 3I3VA 3GXAA 3U72A 3FVOA 1GVCA 5JK4A 3MP1A 3DP8A 2H25A 5DEXA 5M2VA 3EPEA 3UA8A 2FYIA 4IO2A 1Y4TA 5CI5A 1JNFA 4EUOA 4LQ5A 3K00A 1F9BA 3ONMA 3G3KA 3K2DA 1B46A 3OOAA 3S9EA 5CM6A 2NVUB 2OCUA 1SVXB 4JSOA 2F7AA 3F11A 3THIA 3N94A 4Q30B 3Q26A 1A40A 4FE8A 3MP6A 5H8HB 2DWHA 1M5FA 2KLFA 3KN8A 4GL0A 4P11A 2F5XA 3I6VA 4KPTA 1Q1KA 4EDPA 4WKMA 4E0XA 3R26A 1IXCA 5F7VA 4G8HA 1FTOA 1QULA 2QJEA 3FASA 4ELOA 2G29A 3KJ7A 1GGGA 2M8CA 4XKRA 2I6EA 1H76A 4HCWA 2OLBA 2YJPA 2Z22A 2D3IA 1B6HA 1J1NA 1XT8A 3IX1A 3Q25A 1M5BA 3O28A 3SETA 2F8DA 3A09A 3H3GA 3K01A 2B3BA 3SEYA 1M5EA 4C1UA 1FQFA 1MY3A 1WVJA 4ZEBA 5AE4A 3VLVA 2O6AA 5HBCA 1N7WA 1TFAA 1II5A 5L9OA 3KSJA 3PPQA 1MPBA 1VE4A 3G3JA 4PETA 2DXRA 4ZEKA 1JEVA 3KN7A 3RTFB 3TAJA 4ZEIA 4G77A 2QS2A 1IXIA 3VXCA 3U1OA 1S7YA 2DS9A 3TKDA 2I4BA 3GBAA 1MQGA 4IB2A 2PT2A 3UIFA 3TODA 3BKIB 3VXBA 1XS5A 1OVTA 2F35A 3CSBA 3FV2A 1I6BA 2V93A 2H98A 4OVJA 3FJGA 2NUVA 4F3BA 5AA2D 3N26A 2Y7IA 3HPIA 2ONKE 3QXMA 3IORA 1N0TA 1ZJLA 1ZLQA 4X1DA 3C35A 3VFJA 1NH7A 5L8DA 1HSLA 1NH8A 1B0LA 1POTA 1O64A 3MVWA 1Y20A 1NNTA 5ITOA 3SEVA 4R9FA 4LZ7A 3G3HA 4Z0IA 4QFNA 5L9SA 1UIUA 2IEEA 1N84A 2OBGA 3EN3A 3C32A 3FATA 3MZBA 4F3GA 2UXAA 5EHSA 3TQLA 4ZZAA 1B3FA 4GVOA 1OIBA 3IO6A 4G4PA 3IOWA 1VR5A 4U4SA 1A55A 3K1PA 1ZKBA 2GHBA 5CBSA 3TZAA 1FQCA 1Y4CA 4U4XA 4I1DA 3OSRA 1YPNA 4YKPA 5CMCA 1DTZA 4F2OA 1SYHA 4YKIA 4YMAA 2WKYA 1QKAA 3O29A 4IO3A 4XKNA 4U2RA 1B58A 1M5CA 1MDP1 4PQJA 4P0IA 4GXAA 1OLAA 4N13A 4KCCA 3SKPA 1H3DA 1EZ9A 3FD3A 1HSEA 3E9XA 2AL5A 3EHUA 2XXVA 4BDQA 5FHOA 1D9VA 4HCYA 4JWYA 3TTLA 1P1UA 1A54A 3RQTA 5I2NA 1PC3A 4OFLA 4RY1A 3SEXA 1AH5A 2CZLA 2X7QA 4H8JA 4NF5A 4OESA 1B1HA 4U1OA 1NKXA 1IQ7A 2UVHA 4M1VA 4WEDA 1Y3NA 1SW4A 1SI1A 4EQBA 1US5A 3PU5A 4F1YA 1B51A 1XVYA 4OHNA 1BLFA 1JETA 1PB9A 3MVXA 4JB7A 4WEPA 1CB6A 1BKAA 3G3GA 1DOTA 4NE4A 4KYEA 2I3WA 2HXWA 2H99A 4RK9A 4R72A 4FEBA 1N3WA 2DP8A 2QSXA 2HZKA 3SDFA 3QAXA 1NNPA 2B3FA 4OMBA 1LGBC 3K0VA 3H6TA 1DMBA 4HS7A 2RC7A 3KOTA 1LFHA 1NFTA 4QRZA 4YB6A 1SW5A 3ODBA 4POXA 3VVEA 2F6PA 4N6PA 5I2NB 2F36A 2Y84A 3SEWA 3MZ1A 4NTLA 4ONYA 4PFYA 4YKJA 2PX1A 1ZU0A 1ZTYA 2OJTA 5AA3A 3CR9A 1QUIA 3LSLA 2DE2A 2DVCA 4GOTA 1LSTA 2HEUA 2UYEA 3AXFA 2HZLA 1Y1ZA 5K2XA 5L9MA 3TUSA 3KG2A 4KHZE 3CFXA 3FXQA 3OENA 3PV0E 3T22A 2CMOA 4ESWA 5FHMA 2H9BA 2YLNA 4ZDMA 3M3LA 3TTKA 2DE4A 3OEMA 2ONRA 1IZ1A 1MXYA 4GRKA 1Y9UA 2UYFA 4C0RA 3EHSA 3MWBA 1FW0A 4Q5TA 2VOZA 3MQ9A 5B7DA 5B70A 4ZECA 3RT8A 1SW1A 3IO4A 4U21A 3KN3A 4M4GA 4LATA 5H8HA 4K3FA 3ZKLA 4DXUA 5DYHA 3VDFA 3Q27A 1O7TA 2Z8EA 3UGWA 4OXVA 3IOVA 2XXHA 4G68C 3PPNA 2H5YA 2XXRA 4IGRA 4DXCA 3E3KA 3W9VA 4AQ4A 1SDXA 4G68A 4X9TA 3IR1A 3PPOA 4R75A 1SYIA 2VHAA 3TTRA 3FXUA 3MPKA 3OEKA 2I0CA 4OYVA 2A5TB 2XXWA 4RXLA 1ATGA 5CMKA 1VFEA 2XXQA 4JDFA 2B65A 4H1XA 4OFJA 4OWDA 2F34A 1MXWA 1QUKA 4QFOA 1B3LA 4FJPA 3V89B 1WODA 4GIZA 2QS3A 3M3KA 1LFGA 3OO7A 1A99A 1A8EA 1FTMA 2BJJX 3PUVE 3IOUA 3GLBA 4IY6A 4LA9A 1B5JA 1URGA 3SERA 3KFMA 4RNSA 2UVJA 3MW0A 5H8NA 2Y7KA 2F7CA 1TT1A 3D4CA 1OVBA 3U92A 1JEUA 5KCJB 3I5OA 3BFUA 3PMVA 4R9GA 3VE1B 4FAJA 3FXRA 5I84A 2ZXTA 4IGTA 2Q89A 5ELVA 4NF8B 2PVUA 1URDA 4F18A 4TQUQ 2UVGA 1AL3A 3JZJA 3FJ7A 3D4GA 4G68B 1Q35A 3CI8A 4NWCA 3H7MA 3T66A 2G93A 3C36A 1YTVA 1FTKA 4OTEA 1FCKA 4H0WA 4ELPA 2XD2A 5ITPA 2I0BA 3U94A 1D4NA 3MJNA 4YU0A 2XX9A 1FQBA 4EQ9A 5H8SA 2V84A 3S2VA 5H8NB 1I6AA 1MY0A 4TOZA 5FHNA 3K6XA 1JW4A 5CRYA 4XKQA 1MG1A 4QFPA 1BTJA 3ZKKA 3O6GA 1DSNA 2XXUA 3PUXE 4IO7A 1P1QA 3CFZA 4F2QA 2PYYA 4OQOA 3KBRA 2I49A 1RYXA 1RKMA 4YAHX 4AB6A 3KZGA 2V3QA 3FVNA 3OSQA 1MM6A 4OFOA 3PD9A 3PUZE 4OEVA 1HSJA 1USYE 1IXGA 4I62A 2AL4A 4GXSB 1B5IA 4OENA 5JTYA 2F7BA 4GQOA 5F1QA 3MP8A 2REJA 3M8UA 4YZZA 3U8QA 1B1XA 5DVFA 2FNCA 3RGYA 2H4IA 3K6VA 3P7IA 3C34A 3S9NC 4IO5A 5I2KB 1POY1 1XOCA 1BIYA 3Q28A 1Y3PA 2F78A 2ZYNA 3FGSA 5CBRA 1XHYA 3QSLA 1UQWA 1UTHA 2RKMA 3A3CA 3FJMA 5DT6A 1AIVA 4R2FA 2Z23A 3QYTA 4BDRA 2DXYA 1BP5A 3E13X 2AIXA 3O6IA 1H45A 2XX8A 3OO6A 1KWHA 3H6VA 4KR5A 4IO4A 4MBPA 4H67A 2NOOA 3TTMA 5BUUA 3RUMA 3PGFA 4XIGQ 3CIJA 5CMMA 1D9YA 4MLQA 3ZSFA 2O7IA 3T96B 2P2AA 4F19A 1FTLA 3DP4A 1MQJA 3TYHA 3H6UA 4ZE8A 1N76A 4KYDA 2O1MA 4KYSA 2GH9A 1WDNA 3R7XA 1JVYA 5JTYB 2D5WA 2O69A 5I59A 1MY2A 2PBWA 3TCFA 3HN0A 3S9MC 4ND9A 3VV5A 4G8NA 4Q8RA 1MPDA 4Z7EA 2HAUA 3TQWA 3OO9A 5DTBA 2Y7PA 1ELJA 2XXYA 3JV9A 4KCDA 2O68A 1UTHB 1MY4A 3LBSA 2DWIA 2VD2A 4GF8A 5ICTA 3MUQA 3EF7A 4PP0A 1Z7ME 2GRVA 3KEIA 3QIMA 4R6HA 1NL5A 5AA2A 3Q29A 2W7YA 1S9TA 4RYAA 4TLLB 1MM7A 5AA1A 3IOTA 4DLDA 3M3FA 3O97A 1RYOA 3UORA 3H4ZA 2ZYKA 3ECRA 3OMBA 5IKBA 1QKBA 3DELB 3N5LA 2XXIA 1B0HA 4IY5A 5CMBA 1AMFA 4NF6A 1XC1A 3LSFB 3IB2A 2NXOA 3IJOB 3ILUB 1JVXA 1GR2A 3W9WA 3O2AA 1EZPA 3W15C 3BFTA 3K6WA 3UP9A 3IL1B 4MF3A 2F6GA 5ISUA 5I59B 2QMWA 3SESA 3HV1A 1MY1A 4GWOA 2QRYA 2ALUA 5DVIA 1H44A 2GFEA 3KJTA 3O6HA 3B7DA 3RPWA 3H06B 3IB0A 4KI0E 3V5AA 4QSCA 4LVQA 3L6HA 1ZIUA 1B7ZA 4I9DA 4FEDA 3DP6A 5LOMA 5EHMA 5BWJA 1T0KA 3VLUA 5I58A 1JQFA 3TDJA 1SI0A 1TFDA 2RC9A 2A5TA 2ZYOA 4E0WA 5AA2B 4OEUA 2PT1A 3G7WA 1GV8A 4FATA 3K6UA 4POWA 3RLFE 2YPNA 2OWTA 5EYFA 4QFLA 2Z8FA 3G3IA 3PMXA 1QUJA 2Q2CA 4OETA 4NF6B 4NWDA 5I57A 3B6TA 4KQPA 5KCJA 1CE2A 4YKKA 2XXPA 1LBBA 3JYRA 3CG3A 2O84X 5AA4B 1LAXA 3LC8A 4ECFA 4JWXA 1B4ZA 5A5XA 1N04A 1Y3QA 3DM0A 1MXZA 2HFBA 3FZVA 4NF8A 2R9JA 2RCBA 4ELRA 3CG1A 1DPEA 4F31B 1LB8A 4LONB 2DE3A 3HSTA 4H6DA 3IB1A 1UTBA 4MLVA 1LB9A 4F3SA 1M5DA 2ZNUA 3TPAA 3FV1A 1S50A 1B5HA 2ANJA 5I58B 1IXHA 3PUYE 2LAOA 4PFWA 3CFLA 4LZ8A 2AYSA 1EH3A 1AOVA 3T93B 2Q2AA 2HAVA 1ZMGA 2P0SA 2HQ0A 1YCJA 3N6UA 2A5SA 1PB8A 3UN6A 5I57B 4ZS9A 1FQEA 5DVJA 2OK2A 1MH3A 1MXVA 4IO6A 1YAEA 3OD7A 3TEPA 1OQGA 3MBPA 3VVDA 4EF2A 4YICA 5TPAA 4KFQA 5A5XB 3GBBA 2V25A 3MVZA 1B3HA 4G8MA 4F29A 2O7UA 2XX7A 4OZ9A 1P1NA 1I6QA 4L17A 1Z7NE 4F1VA 1QJMA 4R6YA 4ZEDA 4FORA 4XKPA 2R71A 2I4CA 1UTBB 4NMYA 4QSDA 3L6GA 4RK2A 2X26A 3T9VA 3QK6A 4C1TA 2Q88A 5H8QB 3K4UA 2UVIA 2Q8JA 2DYXA 4XXUA 4OERA 2NWJA 1R9QA 1JW1A 1B2HA 5I56A 4YMBA 3H03A 2Q9TA 1B40A 3HO7A 1A8FA 5DEXB 5KDTA 5KZTA 1MXXA 3CSGA 4AB5A 3A3UA 1LFIA 4WXJA 4RJZA 5I2KA 4JWOA 2VD3A 1P1WA 2I3VA 4Q0CA 2HCAA 2IA4A 5H8FA 1B52A 4R73A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3WAEA 4H8IA 1IIWA 3C9HA 4PE5B 4ESXA 1RDYA 4UACA 4YB7A 4F3PA 1TXFA 4U22A 4DZ1A 2DWJA 5TPAB 1EU8A 1XI6A 2THIA 3H6WA 4ZZEA 4MX6A 4MEVA 2X7PA 3K1NA 4GD5A 1PB7A 4FECA 1FBFA 2RF1A 4O3CA 1PBQA 3TTNA 2XWIA 3C4MA 4AS4A 3MC2A 1LCTA 5ICQA 3EQ1A 3KC1A 4P47A 3BIHA 4QHQA 1AWBA 5I56B 1DPPA 4ZEFA 3DLNA 1B4HA 3PPPA 3V83A 4O3AA 5KDTB 4R6KA 3TELA 1BK4A 2XWKA 1D9QA 5FTIA 1FQDA 5LDZA 1ANFA 1GTKA 1OLCA 1SBPA 2ZNSA 1NV1A 3IJXB 5K2YA 4GWUA 1R1NA 4BDLA 2XXTA 1FPBA 3B50A 5H8FB 3PMWA 5IZ3A 2ZNTA 3O9PA 2OWSA 1IITA 1FPDA 4MFIA 3T9UA 4NN3A 3C33A 3RN8A 2REGA 3MAMA 4R2BA 3FBPA 5J16A 1NNFA 1LEVA 1H43A 5ET5A 4F1UA 2Y7RA 3PD8A 1B9JA 3PPRA 4IR8A 4BDNA 1FQAA 4U23A 4FIMA 3K1MA 2DVZA 2ABHA 4I40A 4X48A 4R74A 1B3GA 4X8RA 1OMPA 3O66A 2CZHA 2RCAA 4NF4A 1VFDA 3T9HB 1N3XA 3LUYA 3IAZA 1URSA 4MH5A 4JSDA 1MQDA 1B32A 4F39A 1D3KA 1JW5A 2OZZA 4KD5A 2FHYA 4DXBA 1LBYA 1SW2A 3LR1A 3VVFA 3V8XB 4DIGA 2ESNA 3WAFA 2XHDA 3B6WA 4NX1A 4MNPA 4QF9A 2WYPA 4P56A 1P99A 3IK6B 1ZBMA 2P3NA 5J1DA 4BLAA 1MRPA 1A7LA 1B05A 1LAFE 4GFRA 4BDMA 2QMXA 2ONSA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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