1CB6A

Structure of human apolactoferrin at 2.0 a resolution.
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
b'GRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
publication title Structure of human apolactoferrin at 2.0 A resolution. Refinement and analysis of ligand-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
total genus 226
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 1999-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A03
4RK9A 4WKMA 1B40A 3Q28A 2I3VA 3VVFA 2UVIA 1US5A 4NF6A 3PPPA 4FORA 1MXXA 3QUJA 1MQHA 1QULA 4OEVA 5ICQA 4QRZA 5FTIA 4NF8B 4NWDA 1R1NA 4PFYA 3UGWA 2E0SA 2Z8FA 4U1ZA 4HTGA 4NEDA 1FTKA 4IO6A 4PFUA 3MZBA 5DVIA 3N26A 4OFLA 2NVUB 3O66A 3FJ7A 2I3WA 4F3GA 2XX9A 4LATA 1LGBC 1FTMA 4R73A 5ITPA 1SW5A 4QFKA 5HBCA 2ZNTA 3GLBA 3TODA 4G68C 1SVXB 1LFGA 4EUOA 4G8MA 3PU5A 4OFOA 3TCHA 1JEVA 4C0RA 1DMBA 3W9VA 1D9YA 3B6QA 1MM7A 4PFWA 4I62A 1YCJA 1Y20A 1IXGA 1B51A 2QSXA 4F22A 1M5BA 4MF3A 3S9NC 2PYYA 4JB7A 4U4SA 3KFMA 4YB5A 4OFJA 1BLFA 3E4RA 3C9HA 4RK2A 4DCYA 2DP8A 1AH5A 1JQFA 4F19A 2DWJA 1OLCA 5AA2A 4NF6B 4KPTA 3ZS6A 3D4GA 5AA1A 2IEEA 1PBPA 3FV2A 4GF8A 4KI0E 4QSCA 1ANFA 3PMWA 2ONSA 1ZU0A 2I49A 2OZZA 4JWYA 5EYFA 3HCQA 4EQ9A 2HQ0A 3KOTA 4R75A 2FYIA 2DXYA 3O6GA 4E0WA 4GVOA 5TP9A 4XIGQ 1NNKA 1PEBA 2RC8A 3H6WA 2O1LA 4U1OA 4UACA 5AA2D 3FVOA 4QFLA 5K2XA 4IO3A 5CMBA 1ZTYA 1POTA 4GXAA 3THIA 4IY5A 1P99A 3TCGA 2ONRA 4Z0IA 3HV1A 2OCUA 3A3CA 3WAFA 2AL4A 2NWJA 1IXCA 4GIZA 5DVJA 1FQEA 1JVYA 4PFTA 1N7WA 5DEXA 1H76A 4DXBA 5AA2B 2DWHA 4JDFA 1B5HA 4C1TA 3C33A 3RTWB 2D5WA 4YU0A 4O3BA 1LAFE 1Q35A 3DP6A 3QSLA 3OEMA 3UP9A 3CIJA 2O68A 4BDRA 2CMOA 5A5XA 1CE2A 3EF7A 3S9MC 2HAVA 4RYAA 4JWOA 1UQWA 3CFLA 3UA8A 4U22A 4F3SA 3EN3A 1MH3A 2NXOA 3PPOA 1OLAA 3C34A 2Q9TA 1LFHA 3BFUA 4P0IA 5TP9B 4QFPA 4F29A 1L5TA 3IAZA 4QFNA 3FIRA 1LAGE 3PUWE 1SYIA 5DTBA 1M5FA 5KCJA 3K6VA 4ZEBA 5B70A 1UTBA 2V93A 1MXYA 4GL8A 3Q25A 3OSRA 1XC1A 3VV5A 3ILTB 5I59A 3TMGA 3PGFA 3UK4A 3RY3A 4U23A 3KBRA 5CRYA 3GBAA 4H8IA 3MVWA 4LZ5A 1AIVA 2QS4A 2XD3A 3FVKA 1BTJA 4PETA 1OQGA 3LR1A 2GFEA 2A5TA 5DEXB 4XKQA 2DVCA 1Y3QA 1MDQA 3K6UA 1S9TA 1N76A 3VFJA 1LCFA 2DE3A 1B7ZA 4QF9A 4ELOA 1N84A 1DSNA 1IIWA 2P2AA 2O7IA 4FAJA 1LB9A 4X1DA 4F3BA 4H67A 1URGA 4PP0A 1MQIA 3N6UA 1US4A 2OWTA 3JYRA 1LSTA 1B9JA 3IO6A 5CM6A 2PX1A 4ESXA 2Y7RA 3SDFA 2DE2A 5KCJB 3G3HA 2NOOA 4LZ8A 3E9XA 1FTOA 3TAJA 1UTBB 4NF5A 3K4UA 1D3KA 2VOZA 5B7DA 2ZYMA 5I59B 3KEIA 5AE4A 3FJMA 4BDNA 2F7AA 3CG3A 3PMVA 3CFXA 4JXIA 4ZZEA 4Q30B 2ESNA 3P7IA 3KN7A 2A5TB 2F7BA 1B4ZA 5FHNA 2UVHA 4OVJA 4H8JA 4FATA 3JZJA 2HZKA 3MW0A 3KN3A 4YMAA 3TKDA 3IR1A 2ZYKA 4G77A 2A5SA 3QYTA 1MY3A 1N04A 4UA8A 4LVQA 2F8DA 1QUJA 1NKXA 2X26A 1R9QA 3K1NA 4Q0CA 1EU8A 3ZSFA 1JNFA 3T66A 5JTYA 4LP2B 1II5A 2G93A 4NWCA 5I2KA 4LA9A 4LUBA 3PUYE 2RKMA 2OWSA 4OENA 2ZYOA 5IKBA 1EZOA 3PPRA 2ALUA 3HN0A 3W9WA 2Y84A 4DLDA 2DSFA 4OMBA 3K1MA 1Q1KA 4POXA 3MUQA 1DTGA 1MQJA 4DXUA 2G29A 3PPNA 5H8QA 3S4UA 3VLVA 3SEWA 4KCDA 4MLVA 3CSGA 1LB8A 3T96B 4WEPA 1BKAA 3CSBA 2QJEA 3UIFA 1MXVA 4NF5B 2V3UA 4XKRA 1IXHA 3KZGA 3SEYA 1ELJA 4R2BA 2ZMBA 2ABHA 1QJMA 1USYE 2Z8DA 2AIXA 5I58A 3TFLA 4RPNA 3OO9A 4BDMA 4U2RA 4KCCA 3FXQA 3SETA 4FIMA 3PMXA 2Q8JA 1LAHE 1SDXA 4U4XA 4NF4A 2Y7WA 4YB6A 2RINA 3S9LC 1NH7A 2Y7PA 3EPEA 1JW5A 4LQ5A 3MPKA 1MY0A 1D9VA 4FJPA 2B65A 2Y7IA 3FATA 4MBPA 3LUYA 1TXFA 4G8NA 3HO7A 3U1OA 2FA7A 4XKPA 3IJOB 4IO5A 5L9MA 4BLAA 3RN8A 5I2KB 1QUKA 3O28A 4G4PA 4IO7A 3V5AA 4OQOA 3IB1A 1UIVA 3U72A 5H8QB 2R9JA 4ZS9A 1DTZA 5L9SA 3S9EA 3BKIB 4C1UA 4G68A 3PPQA 1R9LA 2E1SA 4F18A 1B0HA 2RC7A 4MH5A 3TUSA 1HSLA 4XXUA 2ZYNA 1FW0A 5CI5A 1Y1ZA 2YLNA 2GRVA 3MVXA 1RYOA 3O6IA 4TQUQ 3M3LA 5BUUA 3O97A 2DYXA 3G3GA 1TFAA 2W7YA 4ZEKA 5DVFA 2B3FA 1VSOA 3LSFB 5I58B 4L17A 3T9UA 3VVDA 2KLFA 5FHOA 1B1XA 3JV9A 4DCXA 4RPOA 3RUMA 4TLLB 3MPLA 3VLWA 5H8NA 1B2HA 3IOUA 4F3PA 4ELRA 4QFOA 3OSQA 2WKYA 2AL5A 3A3UA 3IJXB 4MLQA 4EXKA 3VXBA 4N13A 2OJTA 3K2DA 3HSTA 4ONYA 3MWBA 2H9BA 1N7XA 4HCYA 3ZKLA 1B4HA 1MPCA 4GQOA 4IGTA 1VR5A 4I9DA 3TTNA 3IK6B 4YKIA 5JK4A 5CMCA 1XOCA 2HAUA 3R7XA 3R26A 4F39A 1GTKA 1ZJLA 2V3QA 4OWDA 1YTVA 4PQJA 1USYH 2OK2A 1RYXA 1R6ZA 1MXWA 4ZE8A 4ZEFA 4P11A 3FV1A 1SYHA 1GR2A 1FTJA 4KHZE 3H06B 1ZBMA 2IA4A 4QSEA 4M4GA 1RKMA 3GBBA 2I4CA 3DM0A 3VLUA 1Y4TA 2H25A 3PV0E 3MVZA 3K0VA 2O51A 4ZE9A 2I48A 5ITOA 3TTLA 3G3FA 4Z7EA 1JETA 4H1XA 3MZ1A 2ZNUA 1ZLQA 5H8NB 2Y7KA 3N6TA 5I56A 1SW2A 2VD2A 2HCAA 4YKJA 5CBRA 3B7DA 3SESA 4BDLA 2REJA 1KWHA 3TYHA 1DOTA 4GFRA 3N5LA 3GZGA 3H6UA 3FVNA 1XVXA 2DE4A 3FASA 2O1MA 1OIBA 1H3DA 4RA1A 5I84A 3S2VA 4JWXA 4ZECA 1WDNA 2F35A 4NMYA 4R6YA 1B3HA 2H99A 2Z22A 1S7YA 1I6BA 4IY6A 4HS7A 2O7UA 3A09A 4LONB 4H6DA 2DS9A 2O84X 4KYEA 1N3XA 4HW8A 4I1DA 1A8EA 4KYDA 3OD7A 4OZ9A 3K6XA 3H7MA 3I6VA 5CMMA 3HPIA 5KDTA 3ILUB 3FVGA 4MFIA 5H8SA 1IUDA 3RT6B 3BFTA 1P1NA 3ECRA 3OO8A 2YPNA 3ODBA 4YKKA 3T9HB 1MM6A 3OEKA 4LQ2A 4TLMB 3OXNA 2H5YA 4YICA 5CBSA 1B05A 5IAIA 3HHGA 5TU0A 2UYFA 1MS7A 1H43A 4NE4A 5M2VA 2VGQA 4AQ4A 3VDFA 2F6PA 2THIA 1Z7ME 3K00A 2P0SA 1BP5A 3C32A 2Q2AA 3EHUA 1IITA 3RPWA 4OEUA 5HPQA 3O29A 4R72A 1LFIA 3BBRA 1FQAA 4H5FA 1PDAA 1SW1A 2OBGA 4F1YA 1F9BA 3FD3A 5EHMA 2F5XA 3SERA 3KSXA 5A5XB 1B52A 4N6PA 1B6HA 4IGRA 1M5CA 1Z7NE 2Q88A 3RLFE 2XXIA 1DPEA 4ELPA 2F7CA 1DPPA 5KDTB 2RCAA 4NTLA 2HZLA 3FJGA 3D4CA 3MAMA 3V83A 3KJTA 3B6WA 1BIYA 1GGGA 2CZLA 2XXRA 2DQVA 3MC2A 4E0XA 4KR5A 1QW0A 1CB6A 2H98A 3R6UA 1Y3NA 1LBCA 4R9GA 5J1DA 3QIMA 3O9PA 2PMSA 1TT1A 3PD9A 2RCBA 1UIUA 1D4NA 1N0TA 2I4BA 1MY4A 1IQ7A 5K2YA 2XXWA 1VE4A 3U93A 1LCTA 3OELA 3MZ9A 3C4MA 3KG2A 3K6WA 4P0GA 3PUZE 4DIGA 3TTMA 3FUZA 5L9OA 1MH4A 1P1UA 1P1WA 2XX7A 1A8FA 3HHFA 2PT1A 4F1VA 1FQBA 4YB7A 3T9VA 2XXPA 4AB6A 4EQBA 1LLSA 1OMPA 5I2NA 1OQHA 2R71A 3KJ7A 2PBWA 3MVYA 2Q89A 2QS1A 4GWOA 1O63A 4M1VA 2NUVA 3W15C 2D3IA 4F31B 2DVZA 3MP8A 1MY2A 4K3FA 3T22A 4PE5B 1I6AA 4X48A 5FTHA 1I69A 1A55A 3I3VA 3IO4A 1TWYA 3SEVA 3U94A 4KYSA 4KQPA 1NFTA 2DWIA 3EHSA 3KN8A 1PB7A 4OHNA 1WODA 4XKNA 3CI8A 2XX8A 3FXUA 1B3LA 4Q8RA 3TPAA 4EF2A 4H65A 4XTCQ 1LBBA 2F78A 2AYSA 1NNTA 2QPQA 5JTYB 3Q26A 2QRYA 2XXTA 3TELA 4GRKA 1AOVA 5I2NB 2GHAA 3T93B 4EQ7A 1PBQA 1H45A 1UTHA 5AA3A 3MP1A 1EZ9A 3K02A 4G8HA 2UXAA 2B3BA 1QKAA 3MP6A 1MRPA 3TTKA 4FECA 3TQWA 1AL3A 5EHSA 4IB2A 2DOJA 1Y1MA 4JSOA 3L6HA 3TEPA 3IL1B 3M8UA 5CC2A 3U92A 3I5OA 4N07A 2R6GE 2O6AA 3PD8A 1ZIUA 3KGCA 3K1PA 1GVCA 4ELQA 2I0BA 1SI0A 3OO6A 1A7LA 5ELVA 4NF4B 4R9FA 4R74A 1B3FA 3B6TA 4ECFA 5I57A 1HSEA 1XHYA 4LZ7A 1B1HA 2REGA 1EH3A 1ATGA 1FQFA 1TFDA 2XD2A 1JW4A 2PVUA 4ESWA 2X7QA 4QHQA 2Z23A 4OXVA 3RT8A 3ZKKA 3CRBA 1AMFA 4F1UA 1MY1A 4AB5A 1UTHB 1VFDA 2Q2CA 1SI1A 1SQYA 4G68B 1O64A 3E3KA 3LSXA 1MG1A 4RY1A 4OESA 1B5JA 3U8QA 1Y9UA 3TQLA 3Q27A 1XT8A 2V3TA 2YJPA 4HCWA 2Z8EA 4O3CA 1YPNA 2QMXA 3G3IA 4BDQA 3MQ9A 3O2AA 4GLIA 4EDPA 3SEXA 5BWJA 3DELB 3H4ZA 1B46A 1HSJA 3RGYA 4FEDA 4OERA 3DLNA 2I6EA 1VFEA 2BJJX 3LSLA 5F1QA 5ISUA 4YKPA 3C31A 2DWAA 5L8DA 3RQTA 1A99A 2ZXTA 5I57B 3G7WA 3OOAA 1MXUA 3IORA 2F34A 2P1SA 2LAOA 2QS3A 3USDA 3TTRA 2ZNSA 3PUXE 2DXRA 3FXRA 2UYEA 1FTLA 2QMWA 5AA4A 4I8CA 4THIA 2PT2A 1IXIA 3M3KA 5ICTA 3QAXA 4ZEIA 2GHBA 1EZPA 4G2ZA 4O3AA 2FNCA 3OO7A 1GV8A 2M8CA 2XXYA 1SBPA 2F36A 4R2FA 3RTFB 1B0LA 1ZKBA 1IEJA 3IB0A 4Q5TA 1A54A 2UVGA 1FQDA 5HM4B 1B7HA 2V25A 2XHDA 1LAXA 3IB2A 1SW4A 3K01A 1PC3A 2X7PA 4IO2A 4RJZA 3LBSA 1M5EA 1Y4CA 5TPAA 1QVSA 4YMBA 4KFQA 3CFZA 1T0KA 4EXLA 3FGSA 3IOTA 3M3FA 3H3GA 2H4IA 4QSDA 3TDJA 5I56B 1ZMGA 1JVXA 2HEUA 3DP8A 3H6VA 4TOZA 3VXCA 4F2OA 1NL5A 2XXXA 3TCFA 3KOSA 2XXVA 3QUFA 5DYHA 1MPBA 1M5DA 4IO4A 3UORA 2XXUA 4DDDA 4YAHX 5AA4B 1B3GA 4R6HA 5CMKA 1FCKA 3V8XB 2VP1A 4ND9A 1N3WA 4ZZAA 3G3JA 2XXQA 1JW1A 4U21A 4BDOA 4EF1A 4JSDA 4OYVA 4X9TA 3G3KA 5H8FA 1XS5A 1SD3A 3CG1A 1QKBA 4OETA 3RNNA 1POY1 1URDA 1JEUA 2VD3A 3AXFA 4GOTA 2V84A 5JEIA 1H44A 3Q29A 4GD5A 1MPDA 4R6KA 3CR9A 5F7VA 4H0WA 3SKPA 4ISUA 3IX1A 1FQCA 1P1QA 5TPAB 3CVGA 1B58A 2GH9A 5KZTA 1WVJA 4F2QA 3H03A 1Y3PA 1OVTA 3C35A 2UVJA 1S50A 3DP4A 4DZ1A 1MDP1 3EQ1A 4X1BA 3FZVA 4DE8A 1J1NA 3PUVE 3EHTA 4RXLA 3N94A 1I6QA 3KSJA 3F11A 5H8HA 4YZZA 1OVBA 3MJNA 1B32A 3H6TA 5FHMA 3ONMA 3IOVA 3OENA 4POWA 1NH8A 4ZDMA 3QXMA 2QL3A 3LC8A 5H8FB 2ANJA 4OTEA 3TZAA 1PB9A 3GXAA 4GXSB 3SEUA 1NMUA 1PB8A 1MXZA 4NF8A 3O6HA 1MQGA 3V89B 4WXJA 1A40A 4JBZA 4WEDA 2HXWA 3OMBA 4H5GA 1B5IA 1MQDA 1NNFA 3C36A 3L6GA 2HFBA 2VHAA 2OLBA 2F97A 2ONKE 2I0CA 1NNPA 3UN6A 2D21A 1B7UA 1YAEA 5LOMA 5DT6A 4RNSA 2O69A 3VE1B 1QUIA 2RC9A 3VVEA 1XVYA 2QS2A 4FEBA 3T9XB 4DXCA 4KD5A 3MBPA 2I58A 5H8HB 3LSWA 1O7TA 3E13X 4GL0A 2RF1A 4FE8A 2XXHA 1URSA 3WAEA 2F6GA 3QK6A 1B3EA 4ZEDA 1P1OA 3IOWA 1IZ1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RK9A 4WKMA 1B40A 3Q28A 2I3VA 3VVFA 2F3DA 4HXVA 3ISPA 2UVIA 1US5A 4NF6A 3PPPA 4FORA 1MXXA 3QUJA 1MQHA 1QULA 4OEVA 4GWUA 5ICQA 4QRZA 4UABA 5FTIA 4NF8B 4NWDA 1R1NA 4PFYA 3UGWA 2E0SA 2Z8FA 4U1ZA 4HTGA 2HPGA 1FTKA 4NEDA 1YXIA 4IO6A 4PFUA 2Y5KA 4PBQA 3MZBA 5DVIA 3D1RA 3N26A 4OFLA 2NVUB 1FJ9A 2P3VA 3O66A 3FJ7A 2I3WA 4F3GA 2XX9A 4LATA 2QVRA 1LGBC 4XFEA 1FTMA 4R73A 1FPIA 5ITPA 1SW5A 4QFKA 5HBCA 2ZNTA 3GLBA 4JVIA 4QXDA 4G68C 3TODA 4GBVA 3U65A 1SVXB 1LFGA 4EUOA 4G8MA 3PU5A 4AS4A 4OFOA 3TCHA 1JEVA 4C0RA 1DMBA 3W9VA 1D9YA 3B6QA 5I7IA 1MM7A 4PFWA 4I62A 1YCJA 1Y20A 1IXGA 1B51A 2CZKA 2QSXA 4I40A 4F22A 1M5BA 3PTYA 4MF3A 3S9NC 2PYYA 4JB7A 4U4SA 3KFMA 4YB5A 4P56A 4OFJA 1BLFA 2Y5LA 3E4RA 3C9HA 4IR8A 4RK2A 4MHFA 4DCYA 2DP8A 1AH5A 1JQFA 4F19A 2DWJA 4P3LA 1OLCA 5AA2A 4NF6B 4KPTA 3ZS6A 2WBDA 3D4GA 5AA1A 2IEEA 1PBPA 3FV2A 4GF8A 4KI0E 4QSCA 1ANFA 3MYUA 4H45A 3PMWA 2ONSA 1NUYA 1ZU0A 2I49A 2OZZA 4JWYA 5EYFA 3HCQA 4GX4A 4EQ9A 2HQ0A 3KOTA 4R75A 2FYIA 2DXYA 3O6GA 4E0WA 4GVOA 5TP9A 1KA0A 4XIGQ 1NNKA 1PEBA 2RC8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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