1CB6A

Structure of human apolactoferrin at 2.0 a resolution.
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Iron transport
publication title Structure of human apolactoferrin at 2.0 A resolution. Refinement and analysis of ligand-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 226
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 1999-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A03
3TMGA 1OQHA 2UVGA 1ELJA 2F6PA 4WEDA 1IXGA 3Q26A 3PPPA 4NF4B 3UORA 1EZPA 1AIVA 4ESXA 5KZTA 1URDA 1LBBA 1LCFA 4DZ1A 3MAMA 5BUUA 4OYVA 4OZ9A 2NUVA 2OZZA 3G7WA 4EXLA 3KN8A 5CMCA 3U72A 3QUJA 1SD3A 3O66A 1P1UA 1BKAA 3K01A 5CBSA 5I2KA 5KDTB 3KFMA 3KSXA 5B7DA 4EQBA 1JVYA 3CIJA 5HM4B 3K6XA 5L9SA 2GH9A 3A3CA 2F7CA 3FV2A 4LA9A 5DTBA 4HW8A 2PVUA 3FJMA 4GF8A 2XD3A 4GD5A 3TODA 3TELA 3N6TA 3G3HA 1P1OA 1QUJA 1LB9A 2NOOA 3KJTA 3OD7A 4R9GA 3UIFA 3FVGA 2H5YA 1M5DA 2Z8FA 1B32A 4HCWA 3VXCA 4GL8A 4ZDMA 4NF8B 3GXAA 1MG1A 1UTBA 5F1QA 1USYE 3LUYA 3TCHA 4YZZA 4R6KA 3OOAA 1MH3A 1UQWA 2PBWA 1B4ZA 1OQGA 1GTKA 1PBPA 3G3FA 3O28A 4LVQA 5H8NB 2IEEA 5FHNA 4FIMA 4LATA 1QKAA 3T9VA 4ELOA 1ZLQA 5KCJB 1POY1 1TWYA 4AB6A 4RYAA 2DQVA 2PX1A 2W7YA 2QMXA 1SYHA 3OELA 4WXJA 2QL3A 5I2NA 2P0SA 1MY2A 3N26A 4DXBA 3PU5A 3N94A 3HHFA 1MY3A 3TTNA 1MQJA 4LZ5A 4X1BA 3PUYE 1B58A 2I4BA 2F97A 3GLBA 3ECRA 1FW0A 2FNCA 5EYFA 4XKNA 1MQGA 1IXHA 3HCQA 1VR5A 2DWAA 4NF5A 4H0WA 1TT1A 1LFIA 2OWTA 4PFWA 1LBCA 3OEKA 1H45A 3THIA 3CR9A 4KFQA 4MF3A 1N04A 2XXWA 1TFDA 1S7YA 2VHAA 5H8HB 3FIRA 4GL0A 4R72A 1IEJA 3LC8A 3U8QA 4YKPA 4L17A 3O97A 4LZ7A 4JSOA 2DOJA 1XC1A 3QSLA 2ZMBA 1B4HA 4EF2A 1SI1A 4Z0IA 5L8DA 3Q25A 4ZEKA 1OLAA 5H8FB 4XTCQ 3SESA 4KR5A 5CC2A 3FATA 3JV9A 3MPKA 3C32A 4C1UA 2XX9A 3ZKKA 3HSTA 1TFAA 2ALUA 3RT8A 4RY1A 4YKIA 5A5XA 3D4GA 1O63A 1B6HA 1J1NA 4IY5A 1URGA 2AL5A 1FQBA 2NWJA 1ZKBA 2I58A 4U4SA 2GHAA 3SEUA 4ESWA 4IB2A 4O3BA 2QS3A 3TQWA 3K1MA 3SEVA 1WVJA 1PB8A 1ZBMA 2PYYA 4R6YA 1FTKA 2O7IA 2CMOA 4NMYA 4FE8A 3PPOA 1VE4A 4GRKA 3H7MA 5ITPA 2O1LA 1MXZA 1N84A 1IITA 1A7LA 5TP9A 4JXIA 5K2YA 4Z7EA 4BDNA 1BP5A 1SI0A 2Q88A 1NNKA 3IL1B 1O64A 3HO7A 4DIGA 3PMWA 1ZIUA 1DTZA 1XHYA 4YAHX 1ZTYA 3C35A 4R74A 1P1QA 4OERA 2O84X 5ICQA 2QS2A 3O6IA 4ECFA 1MXXA 5TU0A 3BKIB 4JWOA 4THIA 3RTFB 1SVXB 4MBPA 2F78A 3LSLA 4TOZA 3K4UA 4PE5B 1OIBA 4YB7A 3VLWA 1AL3A 1GR2A 2OWSA 4G8NA 4NF8A 3O6GA 4G68A 4H6DA 4PFTA 1RKMA 3IK6B 1RYOA 2ZNSA 3S4UA 4DXUA 4ELPA 4EQ7A 1B5HA 2I3WA 5DVIA 5H8NA 4RK2A 4I9DA 2DXRA 1XVXA 1DPPA 2I4CA 5I57A 4HS7A 3H6VA 3F11A 1EH3A 2QMWA 5AA1A 2HZKA 3LBSA 5AA2A 2Y7IA 4LQ2A 4RNSA 4FEBA 1MY4A 1H76A 2XX7A 3M3FA 2F6GA 2R9JA 4ZEFA 4GVOA 1JQFA 4YB5A 2HXWA 2XD2A 3H06B 3FD3A 4M4GA 1EZ9A 1IXIA 2O69A 4OETA 3SDFA 1MDP1 3SERA 2KLFA 4GXAA 1AH5A 5JTYA 5I59B 3KN7A 4FJPA 1N76A 5AE4A 1XOCA 2X26A 3KJ7A 1PDAA 4F1VA 1MXYA 4EQ9A 1NNTA 4R6HA 4PFYA 2PT2A 4QF9A 4Q30B 2PT1A 5AA2D 5H8HA 1SW4A 4MLQA 3B6TA 4OVJA 3TQLA 1PB9A 2Y7PA 1FQAA 2XX8A 1Y1ZA 2XXIA 2I0CA 1URSA 4MH5A 4QFPA 2ZXTA 2HFBA 2XXYA 5DEXB 3QUFA 4TLMB 4RJZA 1UIUA 3I5OA 3UN6A 3UP9A 3IORA 3VLVA 3C33A 3BFTA 2Y84A 4Q5TA 3S2VA 2XXVA 2Y7RA 1IZ1A 4QSDA 3U94A 4OMBA 1B7UA 3OSRA 1A54A 5H8QA 2DE2A 5FHOA 4KYSA 3CFZA 3T9UA 3MVZA 3TDJA 4IO5A 2ABHA 1Y3QA 5I56A 3BBRA 2OJTA 1RYXA 2UXAA 5CMKA 1QKBA 1NNPA 3S9EA 2Y7KA 4YKKA 2LAOA 4IGTA 1UIVA 4OWDA 2RC9A 3P7IA 1N3WA 3IOUA 3ILTB 4X48A 4HCYA 2XXQA 4QSCA 1M5CA 2E1SA 2QJEA 2QRYA 1CB6A 2H4IA 4ISUA 5FTIA 3MP6A 4U21A 3C31A 2DVZA 3C34A 4PP0A 1LCTA 3U92A 3ZS6A 1S50A 2R6GE 2BJJX 4NE4A 2OBGA 3PPQA 2ANJA 4TLLB 3SKPA 4DCXA 4EDPA 3B6WA 3H03A 3E9XA 1JEUA 3QYTA 2O7UA 1MQIA 3TUSA 3MC2A 3RUMA 4XKPA 4YKJA 3CFLA 3EHSA 4E0XA 1Z7ME 4F3PA 3VVFA 1P99A 5CI5A 1B0HA 3TTLA 2X7QA 3KEIA 5ITOA 2UYEA 3L6HA 2REJA 1D3KA 1D4NA 3H6TA 4DXCA 1NH7A 3FXQA 1B0LA 3IR1A 5TPAB 3CI8A 3FVNA 3UK4A 3EHUA 4F31B 3IOTA 3HN0A 3SEXA 4YU0A 1M5EA 3VVDA 3CSGA 1ANFA 3BFUA 1YTVA 4NWCA 4DDDA 4F19A 4KHZE 1KWHA 3WAFA 5JEIA 3KGCA 1QUIA 3B6QA 4FECA 3VVEA 3S9LC 4ZE9A 1MPCA 1FTLA 3MW0A 1OVTA 3TPAA 2F7BA 2ZYOA 1JW1A 4KCCA 2RC8A 2H9BA 4XXUA 3HHGA 4IGRA 2A5SA 3FJGA 4POXA 3PUXE 4R9FA 3K6WA 4H5GA 5EHSA 1VSOA 1YPNA 3PD9A 3B7DA 3I3VA 3K2DA 2F5XA 4OEVA 4P0IA 3PMXA 1R9LA 1POTA 1MRPA 1I6QA 4ZE8A 4Q0CA 1BLFA 5I58B 1PB7A 1YAEA 3QIMA 2GHBA 4F3GA 3IOVA 3VDFA 3DP4A 1H44A 3C36A 4JB7A 1D9YA 1MPBA 1R9QA 3EF7A 1Z7NE 3I6VA 2A5TA 1UTHA 1FQCA 4NF6B 3TTMA 4QRZA 1FTOA 5AA4A 3A3UA 2Z8EA 1SQYA 3OO8A 2V3TA 4N07A 4TQUQ 1B9JA 3DLNA 2GFEA 4QFLA 1SYIA 4G77A 3AXFA 1SDXA 3SEYA 4BDQA 3CFXA 2E0SA 1B3GA 4I62A 2V93A 2OLBA 3G3IA 3OEMA 3QXMA 1Y3PA 2V3UA 1Y3NA 4H65A 4U22A 1A55A 3DELB 4FORA 1M5BA 3KBRA 3LSXA 4NF4A 2HEUA 1P1WA 3ODBA 3K6VA 3TZAA 3ILUB 3FJ7A 2GRVA 1LAHE 2RC7A 1MM6A 4KYEA 1O7TA 1MS7A 4IO7A 3DP6A 1B05A 4ZZEA 3K6UA 1PBQA 4G2ZA 4FAJA 2I49A 3EQ1A 3G3JA 1P1NA 5KDTA 1AMFA 1NFTA 4BLAA 1B1XA 3OMBA 3FV1A 1NNFA 2R71A 3U1OA 2UYFA 2F36A 5DVJA 2VD2A 4KD5A 4P11A 2XXHA 3MVYA 4IO6A 1MH4A 3K00A 3RPWA 4QFNA 3MZBA 2RCAA 2DP8A 4U1ZA 2DVCA 4F3SA 1ZJLA 4JWXA 5I2KB 3O9PA 3R6UA 3W9VA 3K0VA 4LP2B 3H6UA 3OO7A 3UGWA 1HSEA 1Y20A 2HAVA 1NL5A 2F35A 2Z22A 3MP8A 3TCFA 1VFDA 2V3QA 1NMUA 2I6EA 2DE3A 3Q27A 4KQPA 4X9TA 5FHMA 5DVFA 3K02A 1A99A 1Y1MA 1YCJA 4F1UA 3N6UA 1A8EA 4H8IA 4GWOA 4E0WA 2XXUA 4QSEA 3KSJA 4I8CA 3FVKA 2FA7A 3IOWA 3IB0A 5KCJA 1UTBB 1L5TA 3TKDA 4QFOA 4K3FA 5CBRA 1D9VA 3ZKLA 3EN3A 1WODA 4X1DA 1F9BA 5B70A 1PC3A 4R73A 1DOTA 2QS4A 4OESA 1AOVA 3KN3A 3FVOA 1M5FA 3JZJA 4JWYA 3R7XA 2DWJA 1GV8A 3KOTA 5I2NB 2ZYNA 2P2AA 1GVCA 2XXTA 4N6PA 3EHTA 3TCGA 1JW5A 5I58A 1DTGA 4GQOA 3MJNA 1DSNA 5CRYA 3M8UA 4BDRA 4OENA 1N7XA 1FTMA 5DT6A 3S9NC 3MPLA 1MM7A 1B3HA 2G29A 1SW5A 2AL4A 2B65A 1IIWA 1QW0A 1LFGA 1XVYA 3VE1B 2VGQA 3W15C 3T9XB 3M3KA 4HTGA 2O6AA 2B3FA 4ONYA 5DYHA 4ZEDA 1B1HA 4BDMA 4OQOA 4NEDA 4PQJA 1EZOA 2DYXA 3TFLA 4KPTA 5CM6A 1WDNA 4QHQA 4XKQA 5H8FA 5IKBA 4BDOA 3PUWE 4LUBA 1LSTA 4PETA 4RA1A 4Q8RA 3V83A 5FTHA 2AIXA 2F7AA 1MQHA 2THIA 4O3CA 2PMSA 5I84A 2YJPA 4EUOA 4F29A 2M8CA 1ATGA 3L6GA 1I6BA 1LGBC 2D3IA 1ZMGA 4F2QA 1GGGA 3FXRA 4LONB 1II5A 1BIYA 3E13X 3EPEA 2XXXA 4QFKA 4OHNA 3PPNA 2RINA 1N7WA 1NKXA 1MY0A 3T22A 5A5XB 4F1YA 1QJMA 3RQTA 4M1VA 4YMAA 3IJOB 1SW1A 4ND9A 3K1NA 4P0GA 4XIGQ 4F22A 1I6AA 4R75A 3CG3A 4C0RA 1IXCA 1FQFA 2ZNUA 1NH8A 1B5IA 4LQ5A 1B2HA 2REGA 1B40A 2Z8DA 1CE2A 3OENA 5TP9B 1R1NA 1HSJA 3ONMA 4ZEIA 3MUQA 3FZVA 3H6WA 4AB5A 2RF1A 3OO9A 4N13A 5CMBA 2O1MA 1R6ZA 1US4A 2VP1A 3RNNA 2G93A 1DMBA 4FEDA 5K2XA 2XHDA 2V84A 3MQ9A 4WKMA 2ZNTA 3DM0A 4U2RA 2O68A 5EHMA 1PEBA 3SEWA 4MFIA 3PV0E 3H4ZA 2UVIA 3T9HB 5F7VA 5IAIA 4DE8A 3FUZA 4G68B 3TAJA 1MXWA 2WKYA 3MBPA 2YPNA 4RK9A 2UVJA 1B51A 2QSXA 3IO6A 1JETA 2DWIA 2Q8JA 3A09A 3D4CA 4IO2A 3DP8A 1QULA 3FGSA 5HBCA 3RLFE 5I57B 3UA8A 2NXOA 1JW4A 3CSBA 4PFUA 4RPOA 5AA2B 1US5A 2DE4A 4YMBA 3O6HA 4XKRA 2I0BA 3TTRA 2VD3A 4U4XA 3KZGA 4H1XA 1S9TA 4ZECA 2ESNA 3CRBA 3PMVA 3PGFA 5I59A 3E4RA 3IO4A 2VOZA 1IUDA 3U93A 4KCDA 1FTJA 3Q29A 3T96B 4OFLA 1B46A 4GIZA 1LLSA 1TXFA 4ELQA 3VLUA 1B52A 3W9WA 3V89B 1N3XA 2ONKE 4DLDA 1OVBA 2XXRA 3N5LA 5JTYB 2Q2AA 3VFJA 1VFEA 4EF1A 5DEXA 4F2OA 2FYIA 2H99A 4OTEA 3KG2A 4C1TA 3S9MC 4G8MA 4I1DA 3VV5A 4H67A 3IB2A 2Y7WA 4GLIA 3O2AA 5ELVA 3HV1A 3IB1A 3RT6B 2ZYMA 1DPEA 2QPQA 3CVGA 2RCBA 3MZ9A 4G68C 3OO6A 4H8JA 1Q35A 4U1OA 1B7ZA 3T93B 2HZLA 2AYSA 4OFJA 3V5AA 5H8QB 3PUZE 2ONSA 5ICTA 1QUKA 1MDQA 1MY1A 3LSWA 5I56B 3IJXB 3USDA 1Y4TA 1B7HA 4GFRA 2D5WA 4KYDA 1IQ7A 1A40A 2F34A 3JYRA 3HPIA 3G3KA 1B3FA 4JSDA 3TEPA 3MP1A 1Q1KA 1N0TA 2I48A 3RY3A 3PUVE 3GBAA 3TTKA 1JEVA 2B3BA 1LAGE 5ISUA 2H98A 4F39A 4F3BA 3MZ1A 2HQ0A 3RTWB 4JBZA 2ZYKA 2IA4A 2H25A 4R2FA 3LR1A 5L9MA 2X7PA 1B3LA 4NTLA 5JK4A 4R2BA 5BWJA 1LFHA 1I69A 3OXNA 1SBPA 3WAEA 1MQDA 2DWHA 2OK2A 3SETA 2F8DA 1JNFA 3C4MA 3MVXA 1Y4CA 2DS9A 5TPAA 2OCUA 2NVUB 2HAUA 4WEPA 5LOMA 4MLVA 1SW2A 3LSFB 4RXLA 3IAZA 3MWBA 1T0KA 1LAFE 4UA8A 3E3KA 4IO3A 1B3EA 4IO4A 4O3AA 2UVHA 1HSLA 3KOSA 2QS1A 4JDFA 3C9HA 2RKMA 5J1DA 4LZ8A 4YICA 4ZEBA 4EXKA 2V25A 4AQ4A 2YLNA 5H8SA 3RN8A 1A8FA 4FATA 3Q28A 3ZSFA 4KI0E 1EU8A 4G8HA 4GOTA 4OXVA 3FASA 3T66A 4GXSB 3K1PA 4RPNA 2DXYA 3PPRA 1Y9UA 5HPQA 3OSQA 4ELRA 1USYH 2O51A 3PD8A 3O29A 5L9OA 3GZGA 1FQEA 3VXBA 3M3LA 4UACA 3MVWA 1XS5A 4YB6A 5CMMA 2Z23A 3V8XB 2CZLA 1ZU0A 1MXVA 2I3VA 1JVXA 3GBBA 4IY6A 4NF6A 4BDLA 4G4PA 4NF5B 2XXPA 4ZZAA 3RGYA 1XT8A 2P1SA 1MPDA 1H3DA 3IX1A 2Q2CA 5AA3A 1MXUA 1OLCA 4DCYA 3G3GA 4POWA 5M2VA 4F18A 2Q9TA 3QAXA 4ZS9A 3FXUA 2Q89A 2A5TB 1UTHB 3CG1A 3TYHA 3H3GA 1FCKA 5AA4B 1QVSA 2DSFA 1LB8A 4NWDA 3QK6A 2D21A 2HCAA 4OEUA 1B5JA 2ONRA 4OFOA 1LAXA 1BTJA 1OMPA 4U23A 1H43A 3R26A 4H5FA 1FQDA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3TMGA 1OQHA 2UVGA 1ELJA 2F6PA 4WEDA 1IXGA 3Q26A 1FPFA 3PPPA 4NF4B 4GX3A 3UORA 1EZPA 2MKZA 1AIVA 4ESXA 5KZTA 1URDA 1LBBA 1LCFA 4PAFA 4DZ1A 3MAMA 3IFAA 3MSTA 2ZZWA 5BUUA 4OYVA 4OZ9A 2NUVA 3E79A 2OZZA 3G7WA 4EXLA 2PFZA 4HE0A 3KN8A 5CMCA 3RYDA 3U72A 3QUJA 1SD3A 2Q74A 3O66A 1P1UA 1BKAA 3K01A 4H46A 5CBSA 5I2KA 5KDTB 3KFMA 4MX6A 3KSXA 5B7DA 4EQBA 1JVYA 3CIJA 5HM4B 3K6XA 5L9SA 2GH9A 3A3CA 2F7CA 3FV2A 4LA9A 5DTBA 4HW8A 2PVUA 3FJMA 4GF8A 2XD3A 4GD5A 5IZ3A 4P56A 3TODA 5ET6A 3TELA 3N6TA 2WBDA 3G3HA 1P1OA 1QUJA 1LB9A 2NOOA 3KJTA 3OD7A 4R9GA 3UIFA 3FVGA 1KZ8A 1M5DA 2H5YA 2Z8FA 1B32A 4HCWA 3VXCA 4GL8A 4ZDMA 4NF8B 3GXAA 1MG1A 1UTBA 5F1QA 4NGUA 1USYE 3LUYA 3TCHA 4YZZA 4R6KA 3OOAA 1MH3A 1UQWA 2PBWA 1B4ZA 1OQGA 1GTKA 1PBPA 1YYZA 3G3FA 3O28A 4LVQA 5H8NB 3T1BA 2IEEA 1NUZA 5FHNA 4FIMA 4LATA 1QKAA 3T9VA 4ELOA 4N81A 1ZLQA 5KCJB 1POY1 1TWYA 5ET5A 1DCUA 4AB6A 4RYAA 2DQVA 2PX1A 2W7YA 2QMXA 3IFCA 1SYHA 3OELA 4WXJA 2QL3A 5I2NA 1YXIA 4P9KA 4X8RA 2P0SA 1MY2A 3N26A 4DXBA 3PU5A 3N94A 3HHFA 1MY3A 2VPOA 3TTNA 1MQJA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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