1CB6A

Structure of human apolactoferrin at 2.0 a resolution.
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
GRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of human apolactoferrin at 2.0 A resolution. Refinement and analysis of ligand-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule tags Iron transport
molecule keywords Lactotransferrin
total genus 226
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 1999-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A03
4F3SA 1UIVA 3A3UA 4OYVA 4YKJA 2G93A 2Y7PA 1QVSA 3OSRA 1SW2A 4RJZA 2FA7A 4LUBA 4N13A 4OFJA 4DZ1A 3OSQA 3U92A 5DEXA 1MQGA 4WXJA 4Q5TA 4M1VA 1OVTA 1O7TA 1MXZA 3OEMA 3TCGA 4R6KA 1VFEA 4ZS9A 5I59A 4OMBA 4QFLA 3WAEA 2DE2A 4H0WA 5AE4A 2UVJA 1B0LA 1PC3A 1JEUA 3I5OA 3MJNA 1LSTA 2I3VA 2XXRA 4G2ZA 1AOVA 2VOZA 4F1YA 1JW1A 1P1WA 3FXUA 1J1NA 1MQDA 1NNTA 3PUVE 1OVBA 2OZZA 2THIA 1Y3NA 1P1QA 2H5YA 3N5LA 4OWDA 3M3LA 4KR5A 4POXA 4I1DA 4ZDMA 4IO7A 3TYHA 4Z7EA 4YZZA 3C34A 5I58B 1O63A 5FHNA 3U94A 3ILUB 1MH4A 4RPNA 4X1BA 1IXCA 3FATA 3HV1A 3KN7A 1QW0A 4KHZE 3CI8A 4YB7A 5ITOA 1MQIA 2QS3A 1IQ7A 3UK4A 4ZECA 3MAMA 5L9MA 1H44A 2Q89A 1NH8A 3OEKA 3PMWA 2DWHA 2XXUA 3KSJA 1YTVA 1BTJA 5L8DA 2DS9A 5AA2B 5HM4B 4FIMA 3IK6B 3MP8A 3QYTA 4JWYA 4ZEDA 1Y1MA 5JK4A 2E1SA 1N7WA 3GBBA 4KYDA 5I58A 1PB7A 4GLIA 3PGFA 5CBSA 3RY3A 1VFDA 4H67A 3KJ7A 2UYFA 2ONKE 1B3LA 1BLFA 1NMUA 1USYE 1P1OA 1JNFA 2O6AA 3T9UA 3FVOA 3CR9A 3IOWA 1B3EA 2P1SA 3ZKKA 3GXAA 4GRKA 4EUOA 1SW4A 3DP6A 3PPQA 1SQYA 4NF6A 4R75A 4OXVA 3HPIA 3RTWB 3PUWE 5CMMA 1A99A 3A09A 2I58A 4BLAA 4YICA 1A54A 1B05A 4ELPA 2YPNA 4EXKA 2DVCA 3CG1A 1MY1A 2O1LA 1N3WA 4E0XA 4HS7A 2E0SA 4F19A 4DDDA 5F1QA 5DVIA 4PP0A 2RINA 4IB2A 3OO8A 4OZ9A 2PX1A 4QFPA 1YCJA 3SESA 1B58A 3K6VA 3LBSA 3VV5A 1I69A 2HQ0A 2Z23A 4GQOA 3O66A 4IGRA 3UA8A 4Z0IA 2NXOA 2F5XA 1HSLA 1M5FA 1UTHA 2B3FA 2VP1A 4F2OA 1AMFA 2HEUA 3FJMA 4IO5A 2HZLA 1IIWA 3T96B 1BP5A 1AIVA 1P99A 2XXPA 3N94A 4G8MA 1DPEA 1A40A 3KGCA 4RYAA 3H6UA 3W9WA 2XXHA 1FQAA 4JWXA 5A5XA 5I56A 1NL5A 3O29A 3IR1A 2Z22A 4P0GA 4EQ9A 1R6ZA 1Z7NE 3EHTA 3K1NA 1R1NA 3IO4A 3QXMA 4F2QA 3VVFA 1MXYA 4JBZA 4N6PA 2PMSA 5CRYA 5FHMA 3U8QA 3MPKA 4GD5A 4XTCQ 3KOTA 2DWIA 3D4CA 5CM6A 1ZLQA 3K6UA 1IXGA 1LFGA 1PBPA 4X1DA 2F8DA 2PYYA 5BWJA 1H43A 4NF4B 5AA4A 3BFUA 1B5HA 5AA1A 3LC8A 1LCFA 1Y3PA 1NNFA 4LA9A 4QF9A 4TLMB 4ZEIA 5M2VA 3TKDA 3AXFA 2QPQA 1A8FA 4FORA 1UIUA 4GF8A 4NWDA 4YB6A 3G3KA 3FIRA 4F39A 3C9HA 3QSLA 2OCUA 4PETA 3M3KA 3PU5A 2ZNUA 3PMXA 5L9SA 3FJGA 3RT6B 2O84X 1M5DA 4LZ8A 4U2RA 1GGGA 3I3VA 1SD3A 2DXRA 2Q2AA 1IUDA 1QUKA 1Y4TA 2X7PA 4LQ5A 1I6QA 2DE4A 3E3KA 4O3AA 1ZMGA 4TOZA 3RUMA 2Z8DA 3TZAA 4WEDA 3UORA 1BKAA 4RXLA 1TFDA 4TQUQ 2I4CA 5K2XA 5ELVA 2AL4A 2UVGA 1I6BA 1B4HA 3MVXA 5JTYB 5TPAA 5I84A 1LFIA 4R9GA 2I0CA 2F7CA 2ZXTA 1LBBA 1Z7ME 2H98A 3KN8A 1Y3QA 1MQHA 3EF7A 4BDQA 5KDTA 1MPDA 1Q1KA 5F7VA 1B2HA 3THIA 2VHAA 1MXWA 4XKPA 1CB6A 1OIBA 4ND9A 1B52A 1IXHA 1ZIUA 4PE5B 1JVXA 3OENA 1ELJA 4BDRA 1N84A 1B3GA 4PFUA 4IO6A 4R2BA 1UTBA 3E9XA 1IZ1A 3IAZA 1B3HA 3W9VA 2P0SA 4U4XA 2XXYA 4POWA 4DCYA 1MDP1 1B3FA 3F11A 2F36A 2F34A 3OO6A 4IO3A 2I6EA 2XXIA 3MZ9A 4NTLA 4O3BA 5H8QA 1OQHA 1P1NA 1AL3A 4G8NA 4GOTA 4OVJA 3HHGA 3KEIA 4GXAA 2RF1A 5ICQA 2GHBA 2H99A 2NVUB 3TTKA 5CMCA 4R73A 1Y4CA 2XXTA 1B7UA 4KI0E 4ELRA 5H8NB 1MXVA 3D4GA 1OLAA 5DVJA 2H9BA 3T22A 3QUJA 5I2KB 5L9OA 1YPNA 5A5XB 5I56B 5ICTA 4EDPA 3IJOB 3VLWA 4KD5A 3CFLA 3C33A 3QIMA 3FGSA 2O51A 2XD3A 4G4PA 3G3HA 3KZGA 3L6HA 3S9EA 3IX1A 1N7XA 1LB9A 3ZKLA 2NOOA 4ZE8A 2XXWA 3RNNA 1A7LA 1UTHB 4H6DA 1OLCA 2IA4A 4OENA 3MP1A 5FTHA 4ELOA 4F3BA 4RNSA 3PV0E 3TEPA 1MXUA 2GRVA 2ZYNA 5I2NB 2F35A 3K4UA 5CI5A 2GHAA 3LUYA 4I9DA 5H8QB 4BDMA 4C0RA 5HPQA 1PB9A 4C1UA 1FTLA 1FW0A 3CFZA 2I48A 4QFKA 3H4ZA 1NKXA 3K1MA 4JB7A 4XIGQ 3VXCA 4ELQA 1SYIA 4DLDA 1TFAA 1JW5A 1XOCA 2PBWA 4KCDA 4NWCA 5EHSA 3V8XB 1B1XA 1MY0A 3OO7A 3TUSA 4HCYA 2XD2A 4U1ZA 4DCXA 1XHYA 4ZEFA 1N0TA 2Y84A 1IXIA 3HHFA 3IB1A 1FTMA 3K6WA 2OJTA 5KCJA 2UVIA 3OD7A 1LBCA 1NH7A 2F97A 1POY1 4R74A 4EQ7A 4OEVA 5CC2A 3BBRA 3H6VA 1B32A 2ZNSA 4L17A 1OQGA 1US5A 4AB6A 4YKIA 1JW4A 3OXNA 3PD9A 1DTGA 4F3GA 1R9LA 2DP8A 5ISUA 4P0IA 5KZTA 2NUVA 3FASA 4ONYA 2ONSA 2WKYA 4NF6B 3O28A 5DYHA 3ECRA 5DVFA 3C4MA 3T9VA 1US4A 2DYXA 3FXRA 3ILTB 4R72A 4HW8A 3PPPA 3U93A 5IKBA 5JTYA 1UQWA 2VD2A 3E4RA 3GZGA 4XXUA 2H4IA 4RY1A 4ZEKA 3LSWA 2F6GA 1Y9UA 3PPOA 2VD3A 5FTIA 1MRPA 4OFOA 3MW0A 1B51A 2QS2A 1BIYA 3FD3A 1NFTA 5TP9A 3TQLA 4F22A 4MLVA 5DT6A 5BUUA 2V3TA 4DXCA 3B6WA 3USDA 4EF1A 3RN8A 2DOJA 3KJTA 2QL3A 1FQEA 3OMBA 4NF8B 5TPAB 3BKIB 3U1OA 1MPCA 3QUFA 5B7DA 3CIJA 4NF4A 4OERA 4P11A 4YKKA 4EXLA 1GVCA 3DP8A 3TFLA 2UVHA 1ZJLA 2QRYA 3I6VA 3IB0A 4MF3A 3TTRA 1QUJA 4GL8A 4YU0A 3RTFB 4DIGA 3V5AA 3V83A 3CVGA 2PT1A 4OFLA 1JQFA 4U22A 3IOUA 1DMBA 2V3QA 4C1TA 3DP4A 4DXBA 4XKNA 4YMAA 3G3FA 4G77A 1M5EA 2O7IA 4LP2B 4Q30B 5KDTB 2DE3A 2Z8EA 1B5IA 3MZBA 3O97A 4DXUA 3VXBA 4R6HA 3K00A 3MQ9A 1XT8A 2Q8JA 3S9NC 3Q26A 1IITA 2CZLA 2LAOA 4FE8A 5HBCA 3W15C 1D9YA 2RC9A 2RKMA 1MH3A 3T93B 2ALUA 1SW5A 3WAFA 1L5TA 1SYHA 3GBAA 1MDQA 5KCJB 3VLUA 4Q0CA 3TTLA 1A8EA 5TU0A 3FVNA 3FV1A 3SERA 3T9HB 2XX7A 3SEWA 1EH3A 1LLSA 2ZYKA 3TELA 4UA8A 3U72A 4QSDA 2DWAA 5CMBA 3C36A 1Y1ZA 4FAJA 1SVXB 1MXXA 4PFWA 4HCWA 5H8NA 1B6HA 3EQ1A 3LSLA 4QFOA 3TDJA 1M5BA 2Y7IA 1ZU0A 2ANJA 1MM7A 1NNPA 2Y7KA 4YMBA 3UIFA 3S9MC 2AL5A 2ZNTA 4U23A 3QAXA 4LZ7A 1YAEA 1FTKA 1EZ9A 2PVUA 3RLFE 3VDFA 2CMOA 3HCQA 4NE4A 1FQDA 1MY4A 4H5FA 5FHOA 2FNCA 4MLQA 4F31B 4LONB 4H8JA 3EN3A 1TWYA 2OLBA 1DPPA 3HO7A 1TT1A 3PMVA 2D5WA 2HCAA 2HFBA 4N07A 2Y7WA 3JV9A 2NWJA 5J1DA 4NF5A 2DQVA 4BDNA 2Q88A 1M5CA 3M8UA 3N6TA 3O6HA 1SW1A 3L6GA 3MVZA 3R26A 2Y7RA 1QUIA 3MUQA 4KFQA 3FVGA 3CSGA 4R9FA 1LAHE 3GLBA 1S50A 3K1PA 3MWBA 4U1OA 3JZJA 4WKMA 5EHMA 2HAUA 3JYRA 3M3FA 1QKAA 4KQPA 4R2FA 2OWSA 3UGWA 3ODBA 2YJPA 1POTA 2RCBA 4G68C 1F9BA 1URGA 1SI1A 2R71A 2QS4A 3G3JA 4NEDA 3VVDA 1FQBA 3PUYE 1H3DA 1D3KA 1CE2A 3IJXB 4JXIA 4NF5B 1JVYA 1VSOA 2REGA 1IEJA 1TXFA 3T9XB 1B0HA 4GXSB 4FECA 1EU8A 2Z8FA 3MP6A 4I8CA 2V84A 5H8SA 3B6TA 4NF8A 3TTNA 2V93A 1LGBC 3EHUA 3O6GA 2XX9A 4QHQA 4RA1A 3VFJA 2M8CA 4QSEA 3EPEA 1MY2A 4KYEA 1N04A 1WDNA 4PQJA 4WEPA 1N76A 2V3UA 1VR5A 3IB2A 3MBPA 3P7IA 4KCCA 1LAXA 4O3CA 2F6PA 1WVJA 3HSTA 4RPOA 3VE1B 1H45A 3K02A 3SEXA 1S7YA 3CSBA 4GWOA 3N6UA 1ANFA 5TP9B 4E0WA 4PFYA 3OO9A 4FEDA 3FUZA 3FXQA 3KFMA 1B1HA 5EYFA 1UTBB 3KSXA 4H8IA 1PBQA 3OELA 4R6YA 3Q28A 1SDXA 4K3FA 3BFTA 4I62A 2B65A 3B6QA 2ESNA 4F1VA 1JETA 2ONRA 2UYEA 2RC7A 2X26A 3Q27A 5B70A 3S9LC 1ZTYA 4F29A 2F7AA 3IOVA 1PEBA 3SKPA 1N3XA 4JWOA 4U4SA 3VVEA 2D3IA 5IAIA 3LSFB 2V25A 2I3WA 4BDOA 2DVZA 2GH9A 3IL1B 1II5A 3N26A 1MS7A 2G29A 2W7YA 4G68A 4IY6A 3C35A 4OEUA 3RQTA 2BJJX 1HSEA 4QRZA 4IGTA 3SETA 5I59B 4RK9A 1RYXA 4Q8RA 1FTOA 1OMPA 2H25A 4X48A 1LAGE 2OK2A 1FTJA 3H6WA 4TLLB 3SDFA 3TCFA 4XKRA 3V89B 5DEXB 3LSXA 4F3PA 1B4ZA 2D21A 1I6AA 2O68A 2UXAA 3TODA 1B9JA 3C31A 1QULA 4EQBA 4IO2A 5DTBA 2I0BA 4OESA 1ZKBA 2X7QA 1FQFA 3E13X 1B7HA 3MVWA 1DOTA 1B5JA 5I2KA 4OTEA 3TAJA 3SEUA 4UACA 1DTZA 3DM0A 3OOAA 4H65A 1Q35A 1MG1A 1RKMA 1XVXA 3MPLA 2R6GE 3KG2A 4HTGA 2AYSA 4MFIA 4ECFA 2DSFA 1EZPA 3KBRA 3FV2A 3Q29A 1HSJA 2F7BA 3MC2A 4G68B 4EF2A 4LZ5A 4OETA 2A5TB 2OWTA 1XS5A 1D4NA 4LQ2A 3G7WA 2ZMBA 3PUXE 4GVOA 4KPTA 4YAHX 4FJPA 3KOSA 1USYH 3ONMA 3PPNA 2XHDA 2HXWA 3H06B 3RPWA 4AB5A 3FJ7A 3SEVA 1JEVA 4G8HA 5I57A 4AQ4A 2I49A 2O69A 2DWJA 3K6XA 1URDA 1PDAA 2HZKA 3ZS6A 4LATA 3O9PA 4GL0A 1MY3A 2Q2CA 2HAVA 3TCHA 4GIZA 4JSOA 2RC8A 1EZOA 1AH5A 3LR1A 3QK6A 5LOMA 1B40A 2XXQA 3PPRA 1DSNA 2XX8A 3FVKA 4KYSA 3EHSA 1QJMA 4MH5A 1B7ZA 1GTKA 4ISUA 4GFRA 3RGYA 4JDFA 3UN6A 5AA3A 2Q9TA 3PUZE 1Y20A 5ITPA 4ESWA 5H8HA 2IEEA 1FQCA 2B3BA 3UP9A 2O1MA 4F1UA 4ESXA 1URSA 2ZYOA 3C32A 4ZZEA 5H8FA 3H03A 1VE4A 2OBGA 1PB8A 1SBPA 4H5GA 3Q25A 3DELB 3SEYA 3VLVA 1LFHA 2QMXA 2QS1A 3DLNA 3MVYA 1D9VA 5JEIA 1LAFE 1O64A 2REJA 3O6IA 5I57B 5H8HB 3TQWA 4RK2A 1T0KA 5CBRA 3B7DA 2QSXA 4PFTA 5AA4B 3K2DA 1NNKA 2QMWA 1GV8A 4ZE9A 3K01A 3RT8A 2A5TA 2P2AA 2A5SA 4X9TA 5AA2A 2PT2A 2DXYA 2XXXA 3K0VA 2O7UA 4FATA 3G3GA 3KN3A 1FCKA 3PD8A 4YB5A 3T66A 5I2NA 2QJEA 1XC1A 4IY5A 4JSDA 3S2VA 4M4GA 1SI0A 1R9QA 1WODA 4DE8A 3MZ1A 4F18A 2RCAA 4LVQA 5AA2D 4MBPA 1MQJA 3H3GA 4THIA 2ZYMA 1S9TA 2YLNA 2FYIA 1H76A 4ZZAA 1ATGA 4IO4A 1A55A 1MM6A 2VGQA 3IOTA 3O2AA 2F78A 5H8FB 2GFEA 4H1XA 3R6UA 4ZEBA 3CRBA 2ABHA 4QFNA 4NMYA 1P1UA 2KLFA 1MPBA 3CFXA 4OQOA 4QSCA 3S4UA 1B46A 3TPAA 5CMKA 3H6TA 1KWHA 1QKBA 1GR2A 3G3IA 2R9JA 3IORA 1ZBMA 4YKPA 1RYOA 4XKQA 4U21A 3CG3A 3R7XA 1XVYA 4BDLA 1LB8A 4FEBA 2XXVA 3FZVA 2AIXA 3H7MA 4OHNA 3TTMA 5K2YA 3ZSFA 3TMGA 3IO6A 1LCTA 3A3CA 3HN0A 2I4BA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A3UA 4YKJA 3OSRA 1LBYA 3U92A 1NV5A 5DEXA 4Q5TA 1O7TA 1MXZA 1QGXA 3OEMA 4MNIA 2UVJA 1B0LA 1LSTA 1P1WA 1J1NA 4OWDA 5KDTB 2H5YA 4YZZA 5I58B 5FHNA 4QBAA 4X1BA 3V5AA 4KHZE 5ITOA 5L9MA 1BTJA 3MP8A 4ZEDA 1Y1MA 3RY3A 1VFDA 2ONKE 2O6AA 3T9UA 3CR9A 2P1SA 3PPQA 4R75A 5I5PA 3HPIA 3PUWE 5CMMA 3A09A 4YICA 1A54A 4NF0A 4EXKA 3CG1A 4E0XA 4HS7A 4F19A 5DVIA 2RINA 4MAGA 4OZ9A 1B58A 1I69A 3O66A 5EYHA 4PFRA 2NXOA 2F5XA 2B3FA 4F2OA 3FJMA 1BP5A 5ET6A 4G8MA 1DPEA 4MNPA 5I56A 1FBDA 4GWYA 3QXMA 1MXYA 3U8QA 2Q74A 3MPKA 2JJKA 4N8YA 1ZLQA 1PBPA 4X1DA 2XWVA 4PAIA 4GWUA 4PC9A 3LC8A 1NNFA 4TLMB 2QPQA 1A8FA 4GF8A 4PETA 3M3KA 5ESYA 2DXRA 4LQ5A 4O3AA 3UORA 4TQUQ 2I4CA 5K2XA 1B4HA 5JTYB 5I84A 1LFIA 2I0CA 1LBBA 1Y3QA 1MQHA 1CB6A 1ZIUA 5IZZA 1N84A 1UTBA 4PCDA 2P0SA 4POWA 1B3FA 3F11A 4IO3A 3D1RA 5H8QA 1FJ9A 1AL3A 4OVJA 2RF1A 5CMCA 4ELRA 2WX9A 2WYPA 1OLAA 5DVJA 3QUJA 5A5XB 3QIMA 4O7MA 3ZKLA 4ZE8A 1NV7A 5FTHA 3PV0E 2F35A 4I9DA 4C0RA 1PB9A 1FTLA 1NKXA 1SYIA 5EHSA 1MY0A 2XD2A 3KC1A 2Y84A 2OJTA 1LBCA 1NH7A 1POY1 5CC2A 1B32A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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