1CB6A

Structure of human apolactoferrin at 2.0 a resolution.
Total Genus 226
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
226
sequence length
691
structure length
691
Chain Sequence
b'GRRRSVQWCAVSQPEATKCFQWQRNMRKVRGPPVSCIKRDSPIQCIQAIAENRADAVTLDGGFIYEAGLAPYKLRPVAAEVYGTERQPRTHYYAVAVVKKGGSFQLNELQGLKSCHTGLRRTAGWNVPIGTLRPFLNWTGPPEPIEAAVARFFSASCVPGADKGQFPNLCRLCAGTGENKCAFSSQEPYFSYSGAFKCLRDGAGDVAFIRESTVFEDLSDEAERDEYELLCPDNTRKPVDKFKDCHLARVPSHAVVARSVNGKEDAIWNLLRQAQEKFGKDKSPKFQLFGSPSGQKDLLFKDSAIGFSRVPPRIDSGLYLGSGYFTAIQNLRKSEEEVAARRARVVWCAVGEQELRKCNQWSGLSEGSVTCSSASTTEDCIALVLKGEADAMSLDGGYVYTAGKCGLVPVLAENYKSQQSSDPDPNCVDRPVEGYLAVAVVRRSDTSLTWNSVKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLLFNQTGSCKFDEYFSQSCAPGSDPRSNLCALCIGDEQGENKCVPNSNERYYGYTGAFRCLAENAGDVAFVKDVTVLQNTDGNNNEAWAKDLKLADFALLCLDGKRKPVTEARSCHLAMAPNHAVVSRMDKVERLKQVLLHQQAKFGRNGSDCPDKFCLFQSETKNLLFNDNTECLARLHGKTTYEKYLGPQYVAGITNLKKCSTSPLLEACEFLRK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Iron transport
publication title Structure of human apolactoferrin at 2.0 A resolution. Refinement and analysis of ligand-induced conformational change.
pubmed doi rcsb
total genus 226
structure length 691
sequence length 691
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 1999-03-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1cb6A03
1B3GA 3OEMA 2QS3A 4Z7EA 3TMGA 2NVUB 3MP1A 4DZ1A 2I4BA 1YTVA 3ZS6A 3A3UA 3FXUA 4M1VA 4XKNA 1LGBC 4HW8A 3OENA 1S9TA 3VDFA 3G3GA 5I58A 2I49A 1LAGE 2HZKA 4R75A 1A8FA 1B4ZA 3V89B 4F3PA 3LSXA 5A5XA 1MDP1 2OWSA 3S4UA 3PMVA 4OENA 4PFWA 2OBGA 1POTA 1NKXA 3E13X 3ILTB 4KCDA 3MC2A 3TCFA 4E0WA 2Y84A 5I2NB 4JWYA 1JVYA 1IIWA 1SW2A 2P2AA 3CG3A 4OVJA 3FXRA 1MXXA 3SKPA 2IA4A 2OLBA 5CBRA 1BLFA 1UTHB 2GHBA 2NWJA 4MH5A 4O3BA 5K2YA 5M2VA 1O7TA 5TU0A 3VVDA 1MXWA 3V8XB 1A54A 3G3KA 1XHYA 4QFOA 1N3WA 3IJXB 1FW0A 1QVSA 1RKMA 1SW4A 3HO7A 3H6TA 3JV9A 5H8QB 4G68B 3FV1A 4XIGQ 2HXWA 3P7IA 1T0KA 3Q29A 2YLNA 4IO6A 1DTGA 1I6QA 1B0LA 1MY3A 2QMWA 1R6ZA 4JWOA 1NNKA 4XKRA 2CZLA 3USDA 1MM7A 2DE4A 4G68A 4G8NA 1GV8A 3TKDA 3IR1A 1DMBA 1SVXB 4ZZAA 5AA4A 2F6GA 4ELRA 2B65A 1IUDA 2Q2AA 2DVCA 2RC9A 3MP6A 4H5FA 4H8IA 1B52A 2VHAA 1P1QA 2HAUA 2I48A 3KGCA 3K6VA 3MZ9A 4JSDA 1S50A 3VXCA 2V93A 4OWDA 5AA2D 3Q27A 4EQBA 1SW1A 2KLFA 1ZTYA 2VD2A 4GLIA 5AA2B 1ZJLA 4GIZA 4RPNA 2RCBA 3N6UA 3A3CA 2DSFA 5I2KB 1GVCA 2D5WA 5LOMA 1YPNA 4FEBA 4OFLA 1CE2A 3TUSA 1A55A 2G93A 2DE2A 1XVYA 4FAJA 2G29A 2F7CA 3JZJA 1JW1A 3FZVA 4KR5A 5HPQA 3KEIA 3MPKA 1IITA 3ILUB 3N94A 3H7MA 3JYRA 1JEVA 2DE3A 4NF5A 4FORA 1XC1A 4RY1A 2UYEA 3EHSA 3GXAA 4LATA 1MH3A 2OJTA 4RYAA 1TWYA 5ICQA 1DSNA 3GBAA 4GXAA 1PBQA 4PQJA 3UN6A 4ESWA 2NUVA 3IK6B 3HHGA 5AA1A 1B6HA 4EF2A 3K01A 3QYTA 3QUFA 1LB8A 1P1NA 1N0TA 3DLNA 4U4XA 2NXOA 3C9HA 4JSOA 4WEPA 3FD3A 4XKQA 3U92A 1MS7A 5DEXB 3RTFB 3VV5A 3W9WA 2Y7KA 3VFJA 2PT2A 5HBCA 1TXFA 2DWJA 3FVGA 4I9DA 1SD3A 4QFLA 3E4RA 4RA1A 2QS1A 3C35A 3PPQA 4JDFA 3FVKA 3VLWA 2P0SA 3KN3A 2DWHA 4RK9A 4GL8A 3TYHA 1LLSA 5JTYA 4YKIA 5HM4B 2RF1A 2H4IA 1FQBA 4OFJA 2UXAA 4OHNA 1AOVA 3CSGA 4GOTA 3EQ1A 3FASA 1XS5A 5B70A 1MPDA 4BDLA 1QKAA 3MW0A 4NMYA 4Q30B 4KI0E 3FVNA 1IXIA 2DQVA 1CB6A 1UQWA 2D21A 2OWTA 3G3IA 3SESA 1Y9UA 4K3FA 4OQOA 4UA8A 3TDJA 5I56A 1LCFA 2F97A 4OYVA 1NH7A 4RNSA 4DE8A 1OLAA 4RJZA 3MZ1A 1B3FA 1SYHA 3DELB 4N6PA 3UORA 1OQGA 4OERA 4ZEDA 5AA2A 3QAXA 4LZ7A 4QRZA 4F1UA 3RPWA 4F19A 2HAVA 2RKMA 3MZBA 4ZECA 2I58A 2H9BA 3I6VA 4ISUA 3N26A 5ITOA 4WKMA 1AL3A 1LAFE 1M5CA 1A8EA 1XVXA 2QS2A 4I1DA 1NH8A 4XTCQ 5CMKA 1B40A 4IY6A 1WDNA 2YPNA 2PMSA 2HZLA 2I0BA 4KCCA 1NNFA 1URDA 3UIFA 4N07A 2GRVA 3FJ7A 4YKKA 4GVOA 3SEXA 2VP1A 4F2OA 4EXLA 5CM6A 1VFDA 1B0HA 1URGA 1URSA 4JBZA 4C1UA 2HQ0A 3TQWA 3KOSA 4P0IA 3SEVA 5AA3A 4OEVA 4KHZE 4ZEFA 5CI5A 3QUJA 1MY2A 2Q8JA 1UTHA 1D3KA 3K1NA 3ZKLA 2R6GE 1ZU0A 3R7XA 3IOVA 3IB1A 3VVFA 2GH9A 2RCAA 1Q1KA 3OSRA 4ZS9A 4ZE8A 1NFTA 4X1BA 1TT1A 5B7DA 5CBSA 3KN7A 1LAHE 3HSTA 3T9XB 1FTOA 1MY0A 2DP8A 1NMUA 2ONSA 1B7ZA 3H6VA 2E0SA 3ECRA 2I4CA 2W7YA 5TP9A 1M5FA 1Y3QA 2A5TA 5K2XA 1QUJA 3IOTA 4I8CA 2UVIA 5FHNA 3K6UA 3S9NC 3IOWA 4IB2A 1P1UA 2A5TB 1GTKA 3PUWE 4R73A 5DVJA 3PUZE 5H8NA 5TP9B 3UP9A 1H76A 3CFXA 4NWCA 1R9QA 1UTBB 3H03A 1BTJA 2Z8EA 3IORA 2AYSA 3CR9A 4GF8A 1ELJA 1N84A 2Y7PA 4NE4A 4PP0A 4GL0A 1EZPA 4LP2B 4R9GA 1B9JA 2XX8A 5J1DA 2DXRA 3D4CA 3S2VA 3FVOA 3O6GA 3PGFA 4EXKA 5ITPA 1VFEA 2ZNSA 5EHSA 5H8HB 5I56B 4H1XA 5KDTA 5DVIA 5CMMA 1SW5A 4F1VA 3MP8A 3SEWA 3B7DA 5FTHA 1ATGA 2H98A 5TPAA 1II5A 4IY5A 4U1OA 1B05A 1QUIA 2A5SA 4NF4A 2PBWA 2DVZA 3G3JA 2VOZA 3IB2A 1ZIUA 1BKAA 2VGQA 4DXBA 2XX7A 4QF9A 2O84X 2HEUA 3OD7A 3Q28A 5H8QA 2RC8A 3HHFA 3B6QA 3M3FA 3CG1A 3C36A 1Y1ZA 1J1NA 3DP4A 2V3TA 4X9TA 4WEDA 1OVTA 4MLVA 4NWDA 2QSXA 3C32A 4G8HA 5ISUA 4R74A 1H44A 3N5LA 2O7IA 5L9SA 2REGA 4PFTA 2QRYA 1YCJA 4BDMA 1KWHA 2F7AA 3EF7A 5FHMA 3RUMA 4ELOA 4LZ8A 5I2NA 4ND9A 1Q35A 4G68C 4NEDA 5L9MA 1LCTA 3OXNA 3W15C 4IGTA 1FQEA 3L6HA 2ZNUA 3SERA 4H6DA 4M4GA 5H8SA 5A5XB 3RQTA 3MUQA 4KYSA 3TTLA 2O1MA 4PE5B 3UA8A 3KG2A 3PUYE 4O3CA 4OEUA 2B3FA 4THIA 4F2QA 1PDAA 5JTYB 5CRYA 1FQFA 2XX9A 3MPLA 2YJPA 4ECFA 4HCWA 3S9MC 3K02A 2O7UA 4NF4B 3VXBA 1M5EA 2V84A 2QMXA 3QK6A 1M5DA 3ONMA 4EQ7A 3OO9A 3HV1A 4YAHX 3TTKA 1GGGA 4OZ9A 4HCYA 3KJ7A 5DT6A 2ALUA 3LSWA 3QIMA 4Q0CA 2V3UA 3TZAA 4Q8RA 4ZZEA 4PFUA 3KJTA 1H3DA 3O2AA 1Y20A 4AB5A 5BWJA 1B3HA 2PYYA 1UIUA 2XXQA 2Z8FA 1FQDA 1OIBA 2ZYOA 2PT1A 3IJOB 4L17A 1P1OA 1B2HA 1B58A 3KN8A 5I57A 3FGSA 2H25A 1MPBA 4GD5A 4IO4A 4QSEA 4KD5A 5JEIA 1B51A 4G77A 3LBSA 3LSLA 4NF5B 5ICTA 1SI1A 4MF3A 3V83A 4YB7A 1AMFA 4ZDMA 1Z7NE 2DYXA 3BFUA 1PEBA 4JXIA 3TQLA 4YZZA 4R72A 4TOZA 2XHDA 3BBRA 3K4UA 4G8MA 4OMBA 5IKBA 3LSFB 2ONRA 1N3XA 3OO7A 2RC7A 3VE1B 4F22A 5CMCA 3SEUA 1JETA 2DWIA 2XXWA 3B6TA 1B7UA 5F1QA 2XXXA 3MBPA 3RT8A 4DXCA 1SBPA 2XXUA 1MY1A 2Z23A 4JB7A 4R6YA 4OFOA 2ZNTA 3O9PA 2IEEA 1SDXA 4QFPA 4U22A 1HSJA 4IO3A 1B3EA 4RPOA 4LONB 5I59A 2OZZA 3PPOA 4QSCA 1B3LA 3A09A 2Q9TA 2QS4A 3IOUA 2HCAA 5AA4B 2GFEA 3HN0A 4ZE9A 3U72A 1L5TA 1JW5A 3O97A 2O51A 4KFQA 2CMOA 1Y3PA 1B5HA 4C1TA 1IXCA 1Y4TA 3H4ZA 3PMXA 4BDNA 5IAIA 2Z22A 2PVUA 3CIJA 3KFMA 4ELPA 1MM6A 1FTMA 3BKIB 2GHAA 3GZGA 2ZYNA 1JEUA 1MG1A 1FQCA 2ZXTA 3CI8A 3IAZA 3KSXA 3OOAA 2F5XA 2HFBA 2Q88A 1B46A 3RNNA 3RY3A 1ZBMA 1ZLQA 5H8FA 3S9EA 1MH4A 4UACA 4JWXA 3RGYA 1MQIA 3IX1A 1HSLA 1Y1MA 3EHUA 3T93B 3TCHA 1TFAA 2FYIA 5F7VA 1QULA 3G3FA 4G2ZA 2V25A 4LA9A 3RLFE 2O69A 1XT8A 4E0XA 4OTEA 4R2FA 3U8QA 1MPCA 1FCKA 3FATA 3MJNA 4H8JA 2RINA 2ABHA 2OK2A 4KQPA 2ZMBA 1MXYA 4PFYA 1FTLA 2XXTA 1A99A 1B1HA 1DPPA 3OSQA 4KYDA 5CMBA 4LQ2A 3UK4A 1H45A 1LFHA 1I6BA 2DXYA 4P11A 5I57B 4IGRA 1FQAA 3SEYA 1JW4A 3CSBA 3MAMA 1MQDA 4FEDA 4EQ9A 1IZ1A 2O68A 1XOCA 3U94A 3LR1A 2XD3A 1OQHA 3EPEA 3FJMA 2X7PA 1NNPA 3H06B 1LBCA 2Q2CA 3I5OA 3IO4A 3PMWA 4GWOA 3RN8A 3T96B 1B32A 1S7YA 4F3GA 4AQ4A 4Z0IA 4R6KA 3H6UA 2DS9A 3R6UA 3KBRA 3OMBA 1D9YA 3KOTA 4U1ZA 3TAJA 3PUXE 3QSLA 4BDQA 2F6PA 2LAOA 2XXIA 3EN3A 4XXUA 3THIA 3M3KA 3MWBA 2XXVA 4FE8A 5I84A 1RYXA 5FHOA 1FTJA 1IXHA 4NF6B 3SDFA 3VLUA 4Q5TA 2Y7IA 1VE4A 3PV0E 2FNCA 4FECA 4BLAA 5KCJA 1EZ9A 2UVJA 1LAXA 2ONKE 2BJJX 4AB6A 3K0VA 2DWAA 4NF8A 5FTIA 1EU8A 3E9XA 3U1OA 1LBBA 1UIVA 1POY1 4ZEKA 2WKYA 3L6GA 3K6XA 3RTWB 1Z7ME 4YMBA 2ZYKA 4FJPA 3FV2A 1USYE 3CFZA 4XKPA 5I2KA 2XXHA 2Q89A 1IQ7A 1R9LA 4FIMA 4H0WA 2PX1A 4IO2A 1VSOA 4U23A 4YU0A 3VVEA 1N76A 3TELA 5BUUA 1QJMA 5JK4A 4ZEBA 4O3AA 1LFGA 4FATA 3IL1B 4F29A 1DOTA 1LB9A 1LFIA 1P99A 2THIA 3F11A 2F78A 4F3SA 1SQYA 2V3QA 2M8CA 3ZKKA 1WVJA 1EH3A 2X26A 3LUYA 1D9VA 4ESXA 4F1YA 1OLCA 3OEKA 4LUBA 1F9BA 3MVWA 3SETA 3TEPA 2O6AA 2R9JA 3KSJA 4NF6A 3R26A 3IB0A 1LSTA 4DLDA 1ZKBA 1PB8A 3TODA 5L8DA 1VR5A 4R6HA 1MQHA 1JNFA 2Y7WA 3OO8A 4RK2A 1PC3A 4F39A 2I0CA 2ANJA 3K2DA 5TPAB 2Z8DA 2F36A 4IO7A 5DEXA 4ELQA 3T9HB 1US5A 3TCGA 3DP6A 4KYEA 3H3GA 1IEJA 2AL5A 3M3LA 1B1XA 3PD8A 3B6WA 3I3VA 4POWA 3OELA 4GXSB 5KZTA 4TQUQ 2QPQA 3O28A 4X48A 4YICA 4LZ5A 3ZSFA 4EDPA 4OESA 5DYHA 4PETA 3TTNA 4BDOA 4F31B 3C33A 3PPRA 1MY4A 1UTBA 3C4MA 4X1DA 1B4HA 1D4NA 1YAEA 1I6AA 1TFDA 5EHMA 3WAEA 3Q25A 5H8NB 1MXZA 1N7WA 3MVYA 1SYIA 3PUVE 4LQ5A 4MFIA 4QSDA 4OETA 3TTMA 4I62A 4MBPA 2XXYA 3V5AA 3PU5A 4DXUA 1PBPA 4EF1A 1A40A 2UYFA 1M5BA 1DPEA 1N04A 3BFTA 1IXGA 3DM0A 3H6WA 3K6WA 4G4PA 4QHQA 4DDDA 4YMAA 1Y4CA 3O6IA 3T9VA 1I69A 3FUZA 1R1NA 4QFNA 5DTBA 2UVHA 3TTRA 2FA7A 2H99A 4ONYA 5DVFA 4U21A 5H8FB 1PB9A 2QL3A 3C31A 2AIXA 1MXVA 3FXQA 1MXUA 3W9VA 1QKBA 2F8DA 4GFRA 1QUKA 4BDRA 2XD2A 3O66A 4ZEIA 2DOJA 1GR2A 2Y7RA 1PB7A 2QJEA 1Y3NA 3OO6A 4H5GA 2XXRA 2REJA 4IO5A 4POXA 3MVZA 4HS7A 4YB6A 4DCXA 3D4GA 3C34A 1O64A 1BP5A 2I3WA 3HCQA 3K1PA 4H67A 2OCUA 5CC2A 3WAFA 1B5JA 3LC8A 1AH5A 4U2RA 4WXJA 1DTZA 3DP8A 4U4SA 1RYOA 3O6HA 3PPPA 5L9OA 1BIYA 2D3IA 2F34A 4TLMB 5I59B 2O1LA 3CRBA 3KZGA 3T66A 1AIVA 2F7BA 2I6EA 3ODBA 4MLQA 2ESNA 1A7LA 4R9FA 4NTLA 3FIRA 4R2BA 2UVGA 4KPTA 4F3BA 4EUOA 2F35A 1EZOA 1SI0A 3MVXA 4DIGA 1MQJA 1MQGA 1ANFA 2X7QA 1N7XA 1OVBA 1P1WA 2NOOA 2P1SA 3EHTA 1HSEA 3Q26A 4F18A 3G3HA 4DCYA 3O29A 3S9LC 3T22A 2VD3A 4NF8B 2XXPA 3AXFA 3U93A 1H43A 3GLBA 1B5IA 1MDQA 2ZYMA 3UGWA 3PD9A 5KCJB 4GQOA 3T9UA 1B7HA 3CFLA 4P0GA 2H5YA 5I58B 1NNTA 1QW0A 3HPIA 5EYFA 3N6TA 4GRKA 4LVQA 4N13A 1WODA 3K1MA 3QXMA 3FJGA 1OMPA 3E3KA 1US4A 4RXLA 3K00A 3M8UA 3TPAA 2E1SA 2AL4A 1ZMGA 2R71A 3G7WA 4TLLB 3VLVA 4OXVA 4HTGA 4YB5A 5AE4A 1JQFA 1JVXA 3IO6A 3TFLA 3GBBA 4C0RA 1FTKA 2B3BA 4H65A 5ELVA 1NL5A 3MQ9A 5KDTB 3CVGA 4QFKA 4YKJA 3RT6B 4YKPA 2I3VA 5H8HA 1USYH 1O63A 1MRPA 3PPNA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3ZS6A 4XKNA 1S9TA 2QVRA 2HZKA 4R75A 4F3PA 5A5XA 4PFWA 2OBGA 4JWYA 3CG3A 1UTHB 4MH5A 3VVDA 3G3KA 4QFOA 1FW0A 3HO7A 1T0KA 2HXWA 3P7IA 4OVQA 4P3LA 4XKRA 1MY3A 1NNKA 3USDA 1LBWA 2F6GA 2CZKA 2RC9A 4H8IA 1FTAA 1FPIA 1GVCA 1CE2A 1A55A 1XVYA 3RYDA 3FZVA 3H7MA 3JYRA 4FORA 2UYEA 3EHSA 1P1NA 3C9HA 3W9WA 2Y7KA 1FPKA 5HBCA 4I9DA 1SD3A 2HXRA 3C35A 4JDFA 3VLWA 3FVKA 2DWHA 1LLSA 2H4IA 4OFJA 2UXAA 3EQ1A 1XS5A 1MPDA 4BDLA 3MW0A 3FVNA 1IXIA 3G3IA 4UA8A 3MZ1A 1B3FA 4N6PA 5AA2A 5IZ1A 4LZ7A 4QRZA 2I58A 4WKMA 1AL3A 1A8EA 5CMKA 1B40A 2I0BA 3SEXA 1VFDA 2HQ0A 3KOSA 3SEVA 1XI6A 5EQAA 3R7XA 1ZU0A 3OSRA 1TT1A 5IZZA 3HSTA 3T9XB 1INPA 4N17A 3H6VA 2DP8A 3D1RA 2W7YA 2A5TA 5K2XA 1QUJA 3S9NC 1FBHA 4NWCA 1R9QA 1UTBB 4NE4A 4P8BA 5J1DA 3PGFA 4EXKA 4PGNA 5EHSA 5DVIA 1SW5A 5FTHA 2H98A 1II5A 1ZIUA 1BKAA 2VGQA 4DXBA 4QF9A 2JJKA 3OD7A 4LN5A 3B6QA 4PBQA 1OVTA 4NWDA 3C32A 1H44A 2O7IA 4N6DA 4PFTA 1YCJA 1KWHA 3EF7A 3RUMA 5I2NA 4NEDA 3W15C 4IGTA 2P3NA 5A5XB 4KYSA 2O1MA 3UA8A 4OEUA 1FQFA 3MPLA 2YJPA 3S9MC 4XFEA 3ONMA 3HV1A 4YAHX 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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