1CE2A

Structure of diferric buffalo lactoferrin at 2.5a resolution
Total Genus 207
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
207
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
b'APRKNVRWCTISQPEWLKCHRWQWRMKKLGAPSITCVRRASVLECIRAITEKKADAVTLDGGMVFEAGRDPYKLRPVAAEIYGTKESPQTHYYAVAVVKKGSNFQLDQLQGRNSCHTGLGRSAGWNIPMGILRPYLSWTESLEPLQGAVAKFFSASCVPCVDRQAYPNLCQLCKGEGENQCACSPREPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKETTVFENLPEKADRDQYELLCLNNTRAPVDAFKECHLAQVPSHAVVARSVDGKEDLIWKLLSKAQEKFGKNKSGSFQLFGSPPGQRDLLFKDSALGFLRIPSKVDSALYLGSRYLTALKNLRETAEEVQARRARVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQIVTCATASTTDDCIALVLKGEADALSLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIANQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLNREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSLSERAAHVEQVLLHQQALFGENGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSTSPLLEACAFLTR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure of buffalo lactoferrin at 2.5 A resolution using crystals grown at 303 K shows different orientations of the N and C lobes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LACTOFERRIN)
molecule tags Metal transport
total genus 207
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ce2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ce2A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ce2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ce2A03
1AL3A 4ND9A 3Q28A 3PPOA 3B7DA 1FQDA 4RK9A 3W9VA 5CMBA 2NOOA 2O7IA 3SERA 3TAJA 3S9EA 4NF6A 3KJTA 4U1ZA 3V8XB 3VE1B 1DMBA 5I58B 1Z7ME 4Q8RA 4FECA 2DWHA 3IL1B 5I84A 1H3DA 1MPDA 1QULA 1N7XA 4HCYA 3CVGA 4H0WA 4QFOA 1FTJA 1TFDA 2XXQA 3ILTB 2NVUB 1NL5A 2O51A 2RC9A 2QSXA 4YKPA 1A8EA 3T93B 3I5OA 3SETA 1US4A 1USYE 3MQ9A 3ONMA 4GXSB 4EXKA 1OMPA 1SW5A 1D4NA 2Q9TA 2V25A 3FATA 3PV0E 3K00A 3TTRA 1MQIA 3G3KA 1SW2A 3MJNA 3M3FA 1SYIA 4XKPA 5H8QB 1PB9A 4L17A 2D21A 4XIGQ 4RPNA 3MP1A 1NNKA 4YMBA 1PBPA 4WEDA 4RK2A 3UA8A 2PMSA 5I58A 4OEVA 2H9BA 3TZAA 2UVJA 3O2AA 1B3GA 3SEWA 1LB9A 4XXUA 3VFJA 4JDFA 2Q88A 4FJPA 3FVKA 4HCWA 4EF1A 1M5DA 5TU0A 1DTGA 4GXAA 3KG2A 3KOSA 4DE8A 2KLFA 1BLFA 4NF5A 4U4SA 3EHUA 4G8MA 3OEKA 3EHSA 3W9WA 3O66A 1L5TA 5H8NB 3S2VA 4BDOA 4XKQA 3CR9A 4PP0A 3U72A 2HCAA 5B7DA 4RYAA 3HV1A 1LAHE 4ZEIA 2PVUA 5DVFA 1MPCA 2ZYKA 3VDFA 3K01A 1GGGA 1OQHA 3JV9A 4H67A 4HS7A 4EQ7A 3O6GA 1GR2A 3K1PA 3KN8A 4Z7EA 4LONB 4ZE9A 4NWDA 3FXQA 3PUYE 1S50A 4IGTA 5CBRA 1M5CA 3OOAA 3U92A 2V3UA 4F22A 3K0VA 1N04A 1I6AA 1P1WA 2HFBA 2IEEA 5DEXB 1QUIA 3VVFA 4F29A 1ZMGA 4IY6A 3KSJA 4OWDA 4OERA 4ZE8A 5ICQA 2I48A 4ZEFA 1B1XA 3OO6A 1ZTYA 4QSEA 3T9UA 1SYHA 3RTWB 3VLVA 5DYHA 5IAIA 3SDFA 4ZEDA 3MZBA 3EF7A 5EHSA 5AA4A 3KFMA 2GRVA 1JEVA 2RF1A 4BDNA 3P7IA 3M3LA 5I2NB 1LFIA 1KWHA 3VVDA 1JW4A 5CMCA 5HM4B 4N13A 2ZNTA 4QFKA 1URGA 3WAEA 5A5XB 3QAXA 1MXVA 4LZ7A 3FIRA 1TXFA 1WDNA 2O84X 2Z22A 1JETA 1MH3A 5CBSA 3K2DA 4OVJA 1S7YA 1SI1A 1MDQA 2VD3A 2RC7A 1MXWA 5IKBA 1WVJA 3OO8A 2QS3A 1VFEA 1QUKA 3E13X 3BBRA 4PFYA 4LZ8A 1URDA 1B4ZA 1GTKA 3LBSA 1NNPA 3IB2A 4LVQA 1RKMA 5TPAA 1MY3A 3CFZA 4KHZE 4AB6A 2O69A 2E0SA 5K2XA 2P0SA 2HZLA 4RA1A 1RYOA 3E4RA 3TQLA 3LSWA 5HPQA 3VV5A 2RINA 4C1UA 1BTJA 3MZ9A 4OMBA 4ECFA 1CE2A 2B65A 5A5XA 4QSDA 5H8FA 5J1DA 1PB8A 2OJTA 3WAFA 1B7ZA 1OVTA 4G68B 1N84A 4C1TA 3USDA 3A09A 2I0BA 2NUVA 1FQEA 3HHFA 4JBZA 4E0XA 3O9PA 1NNFA 3R6UA 2QJEA 2R9JA 3DP4A 3TFLA 2A5TB 3TTMA 1DPPA 3FVNA 1NMUA 1NH8A 3CSBA 4GRKA 3QIMA 5B70A 1EU8A 1US5A 2ZNSA 4P0GA 4LQ2A 5DT6A 1Y20A 4DCYA 4JWYA 5CC2A 3VXCA 2ZYNA 3PMWA 3G3HA 4ELOA 3M8UA 2UVHA 3TTLA 1B3FA 2XX8A 2F7BA 3E9XA 1GV8A 3FJGA 3GLBA 5L9MA 3KN3A 3TUSA 4FAJA 4H65A 1URSA 4KYDA 2XXXA 1P1UA 2R6GE 4RNSA 3RUMA 1A7LA 3EPEA 2I58A 2O68A 2ZYMA 2XD2A 1Y9UA 4G68A 4R72A 3PGFA 2D3IA 3TODA 2QMXA 4NWCA 3RTFB 4H8IA 3UP9A 4H1XA 1IUDA 1EZOA 3IO4A 1YAEA 2XXHA 3VXBA 1WODA 4OYVA 2H99A 3ECRA 4JSDA 2VHAA 4OTEA 4GQOA 4H6DA 1O64A 4GFRA 4EUOA 4EQ9A 3PD9A 5AA3A 4YB6A 1FQBA 2XX9A 1SI0A 1A8FA 5KDTB 4ZECA 3BFTA 2Z8DA 1PDAA 2ZYOA 4R75A 2V3QA 3PUVE 2HAUA 3RT6B 4KCCA 1JW5A 3A3UA 3H4ZA 1AMFA 1VR5A 4QFNA 4NF8B 1MY0A 2HZKA 2OZZA 2GHAA 2XXTA 3QK6A 4PETA 1J1NA 1OVBA 2O6AA 3CSGA 4BLAA 2XXRA 3OO9A 1B1HA 2XXPA 3C34A 2O1MA 3H7MA 3E3KA 3MWBA 1D3KA 1ZKBA 4TLLB 1ATGA 1O63A 3C36A 4I8CA 1IXIA 1JVXA 1T0KA 5AA2D 3CG1A 4WKMA 5TP9A 1NFTA 1FQCA 5AA2A 2DQVA 2DYXA 5CM6A 3TMGA 1B5HA 5I59B 2DE3A 3AXFA 3K02A 2X26A 3C32A 2DXYA 1UIUA 4ELRA 3LSFB 1XHYA 4KI0E 4LA9A 1LGBC 1NNTA 2F7CA 4G2ZA 1IZ1A 2F8DA 1TFAA 4GLIA 4R73A 3G3FA 4ZZAA 4KPTA 2F6PA 2VD2A 4Q5TA 3ODBA 2DE4A 2D5WA 1S9TA 2DSFA 4DIGA 3H6UA 3PMVA 3KZGA 2I3VA 4NF8A 2XXUA 3K6XA 1B32A 1Y4TA 2OCUA 4N6PA 4PE5B 4IO6A 4ISUA 1OQGA 3RT8A 3S9LC 2ZMBA 1FW0A 1IXHA 1ZIUA 3Q29A 3GBAA 2DXRA 3O28A 1QKAA 4O3AA 3D4CA 4POWA 1F9BA 2REGA 3MP8A 2GHBA 4NE4A 3CFXA 4R9FA 4OETA 1B7HA 4ELPA 5ELVA 1B5IA 1MDP1 3TTKA 4G8NA 3TQWA 2V3TA 3SEVA 1A55A 5I2KB 2ANJA 3TTNA 3OSRA 2PX1A 3V89B 3R7XA 4JWOA 5H8QA 4KFQA 4POXA 3VLUA 2F34A 1H45A 3TCHA 1H44A 4R9GA 3TPAA 3K6UA 3UGWA 4DXBA 4FORA 1B0HA 1POY1 3LC8A 5JK4A 4F1YA 2O7UA 2H5YA 3S9MC 3JZJA 1DTZA 1Y3NA 1LAFE 2HQ0A 2DE2A 3IJOB 3MVWA 3CIJA 3PPQA 4EQBA 4PFUA 2G93A 1B3HA 5L8DA 2XX7A 3OENA 3T96B 2F36A 1ZBMA 1PBQA 5H8HB 1AOVA 1PB7A 2V84A 5H8NA 4P0IA 2UYFA 1ELJA 2UXAA 1XC1A 4R6YA 5I2KA 3LR1A 1UTBB 2P1SA 3IB0A 3MW0A 1B58A 4K3FA 1B4HA 5FTIA 4DLDA 2VOZA 5DVJA 1Q35A 4NMYA 5BUUA 2FYIA 3GZGA 3U8QA 3SKPA 3PMXA 5AE4A 4LQ5A 2IA4A 1M5FA 1MY4A 1VFDA 4GF8A 3Q26A 4PQJA 1B3LA 1XVXA 4RXLA 2Y7KA 1SQYA 3SEYA 5DEXA 4U1OA 2OLBA 1OLCA 1IQ7A 1JQFA 1B9JA 1ANFA 3L6HA 3KOTA 4IO4A 4U22A 3ZSFA 1UIVA 3CFLA 3KSXA 3T9XB 4IY5A 3MVYA 1DSNA 1A40A 2OWTA 1B51A 3H6TA 2CMOA 5I56B 3JYRA 3C4MA 1N3WA 1UTBA 4X48A 4ZS9A 1MXXA 4JB7A 1LBBA 5I2NA 3B6QA 1JEUA 4UACA 1LSTA 1VSOA 3PD8A 3UORA 1LBCA 3TCFA 3IR1A 3CRBA 1YTVA 4U2RA 4H8JA 4DXUA 2AIXA 1BP5A 3S4UA 3B6TA 2Q8JA 4BDQA 3K1NA 3RN8A 3HCQA 2NWJA 1XVYA 3RQTA 2CZLA 5EHMA 5FHMA 2I4BA 1EZ9A 1P1OA 1MQHA 3QSLA 1I6QA 2QS1A 4IGRA 3FASA 4R2FA 3THIA 4Q30B 2VGQA 2WKYA 4YICA 3BFUA 3T22A 4YB5A 2DP8A 4Q0CA 3OXNA 3MUQA 4YAHX 3SEUA 2HXWA 4KYEA 4F31B 2ESNA 4X9TA 3C35A 3FV1A 5ICTA 2F6GA 3PUXE 4AB5A 1FCKA 3S9NC 4GL0A 4WXJA 2DWAA 3C9HA 2ALUA 2B3BA 3TCGA 4FE8A 1MG1A 2DS9A 1Y1MA 3ZKKA 2Y7PA 1Y3PA 1Q1KA 4KQPA 4U23A 4R74A 1H43A 2Y7WA 1BKAA 1POTA 4KD5A 3RLFE 5DTBA 4G4PA 4QFPA 3G3GA 1SW4A 4MFIA 4UA8A 2ABHA 3BKIB 3O97A 4JSOA 2I49A 3FGSA 4IO3A 1FTKA 3LSLA 1FQAA 1AIVA 3D4GA 3HPIA 4MBPA 3O6HA 4F18A 2A5TA 3N26A 5CI5A 1OIBA 4ESXA 3K4UA 3IOWA 4GIZA 4MLVA 1SVXB 1M5BA 3FV2A 2XXWA 2Z8EA 5FHNA 2QS4A 5HBCA 4LP2B 1Y1ZA 4BDMA 4WEPA 3A3CA 3FVOA 3UN6A 4JWXA 4ZDMA 4THIA 4F2OA 4H5GA 1MXUA 1B2HA 4ELQA 2GFEA 4YKJA 1P99A 3I3VA 3FJMA 1USYH 4IO2A 3IOTA 1II5A 2THIA 1QKBA 3OELA 3Q27A 2AL4A 1FTMA 1VE4A 3V83A 4G77A 3KJ7A 2ONSA 3IO6A 4MLQA 4RY1A 2NXOA 5F7VA 3FD3A 4NF5B 4EXLA 1MXYA 2OK2A 3MC2A 4OENA 3T66A 4LATA 3PPPA 1MXZA 1N3XA 2V93A 5KCJB 3IX1A 1ZU0A 3U94A 4N07A 3IK6B 2P2AA 4F3GA 1N76A 4I9DA 3HN0A 3T9HB 4DDDA 4YB7A 1R9LA 5KDTA 4M4GA 2QL3A 4ESWA 2XXIA 4YKKA 2YJPA 3V5AA 3I6VA 1SD3A 1D9YA 1B0LA 1UTHB 3CI8A 4ZEKA 3C31A 4X1DA 4HW8A 1B6HA 1B5JA 4G68C 5F1QA 4DZ1A 2W7YA 3FXUA 3SESA 1BIYA 1Y3QA 1XOCA 3OMBA 3DP8A 4NF4B 4LZ5A 3IJXB 1MPBA 2G29A 2Z8FA 3PU5A 3TDJA 3FZVA 4F1UA 3ZS6A 4ONYA 4F3PA 3IAZA 4LUBA 4P11A 4F3BA 2RCBA 4I62A 1TT1A 4M1VA 4EDPA 3GBBA 1XT8A 5DVIA 4XKNA 1QVSA 1FTLA 4GL8A 1UQWA 3CG3A 5I59A 1LCFA 1MM6A 3DP6A 2ZXTA 4H5FA 5KZTA 5KCJA 4TQUQ 4KCDA 4I1DA 4QRZA 5AA4B 5AA1A 4ZZEA 4BDRA 2PT2A 4F39A 4F2QA 3EQ1A 3G3JA 3PUZE 5EYFA 2DOJA 4TLMB 1P1NA 3HSTA 3L6GA 2ONKE 4OFLA 4O3BA 2O1LA 1UTHA 1R9QA 1A99A 1RYXA 2QMWA 4X1BA 1B46A 4OHNA 4HTGA 2R71A 5CRYA 2H4IA 5JEIA 3G3IA 3HO7A 1TWYA 2HEUA 4O3CA 2ONRA 4NF4A 3MBPA 4U21A 2DVZA 2I3WA 4KYSA 4KR5A 4F19A 4RJZA 4NTLA 4AQ4A 3MZ1A 3U1OA 3GXAA 3C33A 3R26A 1LCTA 2AL5A 3RGYA 3N5LA 1LFHA 1IIWA 3PPRA 2F78A 5FTHA 2DWJA 4MH5A 2H25A 3K6VA 3H6VA 4OZ9A 3MVXA 1B05A 1NKXA 5I57B 1QUJA 4FIMA 4OFJA 3ILUB 1SW1A 3QXMA 4DCXA 3TYHA 2QS2A 5TPAB 1Y4CA 1MQGA 4OESA 3H3GA 3VLWA 2Y84A 1CB6A 4R2BA 1N0TA 2BJJX 2M8CA 1DOTA 3O6IA 2XXYA 1MY1A 3FUZA 2RC8A 3F11A 2DVCA 4OEUA 2B3FA 4RPOA 2A5SA 2XHDA 4QSCA 1SBPA 2OWSA 3N6UA 3H6WA 3TKDA 5H8FB 4GOTA 4QF9A 1XS5A 3DLNA 2YPNA 3IORA 5LOMA 3RNNA 1B7UA 1IEJA 3DELB 4Z0IA 4E0WA 2HAVA 3QYTA 2UVGA 3VVEA 2Q89A 3KBRA 3UK4A 4GD5A 1A54A 1N7WA 2UVIA 4R6KA 2H98A 3IB1A 1EZPA 3KEIA 3MPLA 3IOUA 2X7PA 2PBWA 4U4XA 1O7TA 4XKRA 1QW0A 1YPNA 2YLNA 3K6WA 4ZEBA 4DXCA 1HSJA 4G8HA 5H8HA 4EF2A 1MRPA 3UIFA 5I57A 1JVYA 1IXGA 1MH4A 3LUYA 1MY2A 4F1VA 2QRYA 3M3KA 3OSQA 3W15C 3HHGA 1LAXA 3Q25A 3TEPA 5CMMA 5BWJA 1R6ZA 2E1SA 1YCJA 2PYYA 1LLSA 4GVOA 1H76A 2PT1A 2F97A 4XTCQ 1PEBA 5M2VA 3SEXA 2XD3A 3MPKA 2I6EA 1LB8A 3FXRA 3PPNA 3TELA 3FJ7A 2QPQA 3IOVA 4NEDA 3MP6A 4YKIA 2Q2AA 1B52A 2F35A 3RPWA 5JTYB 1MQJA 3N94A 1FQFA 2VP1A 4TOZA 3RY3A 1HSLA 2AYSA 1MM7A 2FNCA 1LFGA 5ITPA 1I6BA 3ZKLA 2X7QA 2RCAA 1HSEA 4F3SA 2F5XA 1JNFA 2ZNUA 3LSXA 1FTOA 2Y7RA 1LAGE 4OQOA 2UYEA 2Y7IA 3OD7A 3B6WA 4MF3A 4QFLA 3OO7A 3N6TA 3G7WA 2I4CA 2XXVA 1OLAA 3MAMA 5FHOA 3EHTA 1PC3A 5L9OA 4FATA 1NH7A 1I69A 2LAOA 4FEDA 1EH3A 1R1NA 5K2YA 5I56A 3DM0A 2GH9A 1MS7A 3U93A 3T9VA 3MVZA 4IO7A 4NF6B 4BDLA 1QJMA 2I0CA 1ZJLA 2FA7A 1AH5A 1ZLQA 4YZZA 4PFWA 1M5EA 3H06B 4OFOA 1SDXA 1B40A 2RKMA 2DWIA 5ITOA 1MQDA 5CMKA 3EN3A 4YMAA 1IXCA 2F7AA 5JTYA 5ISUA 3O29A 3QUJA 3QUFA 4YU0A 4JXIA 2REJA 1DPEA 2Z23A 1B3EA 3OEMA 2Q2CA 4C0RA 4FEBA 5L9SA 4IO5A 3PUWE 1P1QA 4GWOA 4PFTA 4R6HA 1GVCA 3FVGA 5H8SA 1Z7NE 3H03A 1JW1A 1D9VA 5TP9B 4IB2A 5AA2B 4QHQA 2OBGA 3KGCA 3KN7A 1IITA 4OXVA 3K1MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1AL3A 4ND9A 3Q28A 3PPOA 3B7DA 4GWWA 5IZ3A 1NUWA 1FQDA 4RK9A 3W9VA 5CMBA 3MYUA 2NOOA 2O7IA 1DBZA 1EYKA 3SERA 3TAJA 3S9EA 4NF6A 3KJTA 1NV0A 1NV3A 4U1ZA 3V8XB 3VE1B 1DMBA 5I58B 1Z7ME 1NI9A 4JVDA 4Q8RA 4FECA 5A5LA 2DWHA 3IL1B 5I84A 1H3DA 1MPDA 1RDZA 1QULA 1N7XA 4HCYA 3CVGA 4H0WA 4QFOA 1FTJA 1TFDA 2XXQA 3ILTB 3FBPA 2NVUB 1NL5A 2O51A 2RC9A 2QSXA 4YKPA 1A8EA 3T93B 3I5OA 3SETA 1US4A 1USYE 3MQ9A 1D9QA 3ONMA 4GXSB 4EXKA 1OMPA 1SW5A 1D4NA 2Q9TA 2V25A 3FATA 1QGXA 1RDXA 4NG7A 3PV0E 3K00A 3TTRA 1MQIA 3G3KA 2HPGA 1SW2A 4NGUA 3MJNA 4O7IA 3M3FA 1SYIA 4PAKA 4XKPA 1LBWA 1PB9A 4L17A 5H8QB 2D21A 4O94A 4PFRA 4XIGQ 2QVVA 4RPNA 3MP1A 1NNKA 1FBDA 5I7IA 4YMBA 1PBPA 4WEDA 4RK2A 2VT5A 4GWZA 3UA8A 4UABA 2PMSA 5I58A 4OEVA 2H9BA 1YXIA 3TZAA 2UVJA 3O2AA 4P3LA 1B3GA 1BK4A 3SEWA 1LB9A 4XXUA 3VFJA 4JDFA 4NAPA 2Q88A 4FJPA 3FVKA 4GWXA 4HCWA 4EF1A 1M5DA 4MMPA 5TU0A 1DTGA 4GXAA 3KG2A 3KOSA 1IMBA 4DE8A 2KLFA 1BLFA 4NF5A 4U4SA 3EHUA 4G8MA 3OEKA 5ET5A 4QBAA 1Q9DA 5DW8A 3EHSA 3W9WA 3O66A 1L5TA 4IR8A 2XXKA 5H8NB 3S2VA 4BDOA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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