1CE2A

Structure of diferric buffalo lactoferrin at 2.5a resolution
Total Genus 207
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
207
sequence length
689
structure length
689
Chain Sequence
APRKNVRWCTISQPEWLKCHRWQWRMKKLGAPSITCVRRASVLECIRAITEKKADAVTLDGGMVFEAGRDPYKLRPVAAEIYGTKESPQTHYYAVAVVKKGSNFQLDQLQGRNSCHTGLGRSAGWNIPMGILRPYLSWTESLEPLQGAVAKFFSASCVPCVDRQAYPNLCQLCKGEGENQCACSPREPYFGYSGAFKCLQDGAGDVAFVKETTVFENLPEKADRDQYELLCLNNTRAPVDAFKECHLAQVPSHAVVARSVDGKEDLIWKLLSKAQEKFGKNKSGSFQLFGSPPGQRDLLFKDSALGFLRIPSKVDSALYLGSRYLTALKNLRETAEEVQARRARVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQIVTCATASTTDDCIALVLKGEADALSLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKGKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIANQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLNREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSLSERAAHVEQVLLHQQALFGENGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCSTSPLLEACAFLTR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords PROTEIN (LACTOFERRIN)
publication title Structure of buffalo lactoferrin at 2.5 A resolution using crystals grown at 303 K shows different orientations of the N and C lobes.
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal transport
total genus 207
structure length 689
sequence length 689
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-03-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ce2A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ce2A04
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ce2A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ce2A03
1LFGA 2KLFA 5L8DA 2H25A 5KCJB 1P1NA 1YAEA 3VXCA 4DZ1A 1EZPA 3KJTA 4ZZAA 3Q29A 3PD8A 3TYHA 4QFKA 4PQJA 1LB8A 1IITA 1UQWA 3K1MA 4I62A 3LC8A 4YMBA 3K1PA 1MXXA 2H4IA 4LZ8A 4KFQA 1QVSA 2QS2A 1J1NA 3OSRA 4YAHX 4LP2B 2OZZA 3IJOB 1N76A 2Y7RA 1B5IA 4RJZA 1JETA 3VLUA 5F1QA 2O51A 3PMWA 3HSTA 2XX8A 3I3VA 4F18A 3IOUA 2H98A 2Z8FA 1LAGE 4AQ4A 3C36A 3KEIA 3ZKKA 2V3TA 3PMVA 1M5FA 3U94A 1NH7A 5KDTB 2X7PA 1JNFA 4U21A 2H9BA 3MZ1A 2OWSA 2E0SA 1MQJA 1BKAA 3G3KA 1YTVA 2E1SA 3G7WA 1TWYA 4IO6A 4GLIA 3OO8A 3V83A 3HO7A 2UVHA 1DOTA 1QKBA 3H4ZA 3ZKLA 1UTBA 4X48A 2D5WA 3SEXA 4G68C 3IX1A 1A99A 2DYXA 1B4HA 4F22A 1DSNA 1UTHA 4OEUA 5I2NB 1BLFA 2OBGA 1N04A 1M5BA 4IGRA 1Y4TA 2F36A 4NF6B 2AYSA 3IOWA 4LVQA 3MQ9A 3O6HA 4ISUA 3DM0A 1ZU0A 5TPAB 4H6DA 4G8HA 2OJTA 3VLVA 3O2AA 1SVXB 2O1LA 4G68A 4OTEA 1TFDA 5L9SA 1CB6A 4ZEFA 5CBRA 2F8DA 2Q8JA 4QFPA 4ZE9A 5I59A 2HAVA 4OWDA 3B6TA 1B3FA 1D9VA 1R9LA 4R2FA 4TLMB 1QULA 4THIA 3IB2A 1EU8A 1AIVA 3KOSA 3SERA 5I58B 3TCGA 2Q2CA 4QSEA 4Q30B 4H5FA 4QF9A 4XXUA 2QS4A 3CFZA 2AIXA 3N6UA 2I3WA 3EN3A 4F3GA 3LSXA 2VHAA 3IOVA 1UTBB 1XVYA 3FXRA 1I69A 1IXGA 1H44A 1FQCA 4NF8A 1F9BA 3A3UA 4TQUQ 2I0BA 1USYE 3K01A 4FORA 5H8QB 2NXOA 3VE1B 2HZKA 1UTHB 3KJ7A 2VP1A 3PUYE 1OMPA 2GH9A 1B4ZA 1VSOA 3K6VA 3UN6A 2ZXTA 3PPQA 4L17A 1M5CA 4WKMA 1MY2A 4OVJA 1Z7NE 1QW0A 1WVJA 4G68B 4HS7A 4BDNA 4QFNA 5H8NA 1TFAA 3UK4A 3OENA 4HCWA 3T9VA 1DMBA 1OLCA 3K4UA 4JSDA 3PUXE 2Z22A 4ELQA 4TOZA 4U22A 4RPOA 3MP1A 3A3CA 4YKIA 3T9XB 4OFJA 1B5HA 2XXXA 3PD9A 1MM6A 1URDA 4HCYA 5HM4B 4RXLA 3U1OA 3K2DA 1XC1A 3OELA 1EZOA 4NF4A 3TQWA 1B0LA 4UA8A 4OQOA 1ZJLA 3CFXA 2VOZA 4U1OA 2NOOA 2GFEA 5TU0A 4NF8B 3ILUB 1SYIA 4LQ5A 2PT2A 4YKJA 2RCAA 1HSLA 1SI1A 3SEVA 1SD3A 3C33A 5ICTA 1LAHE 3C34A 3OSQA 1XS5A 2DE2A 3FUZA 1PBQA 1P1QA 5H8HB 2DE4A 3S9LC 3I6VA 1T0KA 5DVFA 2I58A 3TTNA 1GV8A 3W9VA 2ONRA 5DT6A 2HEUA 1AL3A 4HTGA 1LSTA 2O6AA 4XKNA 2GRVA 3M3LA 3C31A 3WAEA 2UVJA 3KZGA 3PPNA 1H76A 3MP6A 3K1NA 4EQ9A 4OFOA 3TTMA 2I3VA 2XXIA 4F2QA 3OO7A 4XIGQ 1IXIA 2QMXA 5AA1A 1SYHA 2NUVA 4DLDA 4LZ7A 2VD2A 3O28A 4R9GA 3U72A 2G29A 4NF4B 2F7AA 4X1DA 1XT8A 4G8MA 4PFUA 1AOVA 2M8CA 4Z7EA 3O29A 4PFTA 1I6BA 1OIBA 5H8SA 1L5TA 3H6UA 3SDFA 5I56B 4IB2A 1A55A 5L9MA 3K6XA 1BTJA 3KSXA 2UXAA 4EXLA 4NE4A 2RC9A 1WDNA 1ZIUA 3T66A 1SW1A 1SQYA 4R73A 4O3BA 5ISUA 3KN7A 3GBBA 1MS7A 1EH3A 4QHQA 4R6KA 1VR5A 2P0SA 3E4RA 3TTKA 1IQ7A 4Q0CA 5A5XA 4U4SA 1VFEA 3UA8A 3RT6B 4ZEKA 2REJA 3H6WA 1SW4A 4KCCA 1IEJA 5H8FA 2UYEA 4IO2A 3VV5A 1Q35A 2OK2A 3HHFA 2HAUA 5JTYA 1N3XA 4LATA 4QSCA 4F1UA 3C4MA 3TDJA 5HPQA 3BFTA 3FD3A 1Y3NA 1OQGA 3EHTA 3VVEA 4F1YA 1ZTYA 3W9WA 4QSDA 4JWOA 1NNKA 3TCHA 4KYEA 1A7LA 3Q28A 2REGA 4KQPA 2I48A 4G77A 1B7UA 3PMXA 3TMGA 2ZNUA 4KCDA 3FASA 5AA2A 4P11A 3R26A 4EQ7A 2XX7A 1LFIA 5CMBA 3E3KA 1IZ1A 3MVXA 3RUMA 4GVOA 1OVBA 3TELA 5DEXB 4JWYA 3IO4A 2XX9A 5BWJA 4M1VA 2YLNA 2F78A 3SEWA 1FQDA 1B0HA 2ANJA 1A8EA 1Y4CA 2DS9A 4YMAA 4FJPA 2DXYA 4DXUA 2XXYA 3MWBA 1PB9A 3IO6A 1OQHA 1B52A 1FQAA 5A5XB 1RKMA 1OVTA 3UP9A 4OFLA 3WAFA 2VGQA 3OXNA 4XKQA 1O64A 3N5LA 2NWJA 3TTRA 1BP5A 2XXUA 4R6YA 3QK6A 2RCBA 1DTZA 3GBAA 2ONSA 4F3BA 3RY3A 1Q1KA 4IY6A 3S9MC 1D3KA 3MVYA 3LSLA 3TFLA 1N7WA 1PB7A 3T22A 3SESA 4GL0A 1JQFA 3UORA 1B3GA 1MY3A 2RC7A 2DE3A 4GD5A 3FXQA 4NMYA 3E13X 1Y3QA 3PPOA 1IXCA 1MH4A 1NMUA 3OEKA 4I9DA 4FATA 5I2KA 5EYFA 2XXTA 1KWHA 5AE4A 2DWAA 4H0WA 2V93A 3D4GA 1B1HA 1I6AA 1B5JA 3I5OA 3CG3A 3OOAA 3TODA 3VDFA 1P99A 3RTWB 4XKPA 2QPQA 3FIRA 4KD5A 3CG1A 4YB7A 3C32A 2YPNA 3MPKA 1B3HA 2DWJA 1H3DA 4OXVA 2HXWA 1S9TA 2ZYNA 3AXFA 1RYOA 4FEDA 3DELB 2BJJX 3IL1B 4X1BA 5CC2A 1POTA 3TEPA 2XHDA 4N13A 4KR5A 1PB8A 3RPWA 2XXWA 2PX1A 2PYYA 1O7TA 1LBCA 1FCKA 1MY0A 5DVIA 4IO5A 2XXHA 3QXMA 3CFLA 4F29A 2XXVA 2QJEA 4BDOA 1HSJA 3FV1A 3G3IA 4PFWA 3CSGA 2B3FA 3DP6A 4NWCA 1JVYA 2ALUA 4R72A 3FXUA 3T96B 1QKAA 3Q27A 4I8CA 1M5DA 4ELPA 2YJPA 4H5GA 1EZ9A 2W7YA 3RT8A 3IR1A 4OETA 4ZECA 2DXRA 3MUQA 1UIUA 3TQLA 4YICA 3MZBA 1NL5A 4FECA 1NNPA 4ONYA 3R6UA 1YPNA 3QUFA 2G93A 3GLBA 1DTGA 2RKMA 2PT1A 5JEIA 2F7CA 1DPEA 4BDMA 1H45A 2Y7WA 1TT1A 3LBSA 3MJNA 1MDQA 4JBZA 1UIVA 1MH3A 3VFJA 1CE2A 3PUZE 4HW8A 5I59B 3ILTB 1JW1A 1QUJA 2QL3A 1B32A 4R74A 1B6HA 5ITPA 3IJXB 2F5XA 3RNNA 2H5YA 3ZSFA 4MLVA 4BLAA 4MBPA 1JW4A 2OLBA 1H43A 3H6VA 4OESA 3OO9A 3EPEA 4LQ2A 4F19A 5DVJA 3Q26A 2QMWA 1NNTA 3FGSA 4OYVA 4JB7A 1URGA 3HN0A 4XTCQ 4G8NA 1NKXA 3MVWA 3GZGA 3MAMA 2IA4A 1NH8A 4FAJA 2Q89A 3CRBA 2DOJA 1MQGA 1B1XA 3TZAA 5ICQA 3S9EA 1B9JA 4YB6A 4EUOA 1R1NA 4KYDA 3FVOA 3H3GA 4RA1A 4EQBA 3P7IA 3QSLA 3BFUA 4F3PA 5H8NB 1GTKA 3CIJA 3FVKA 1SBPA 5FTHA 4KHZE 1MPCA 4POWA 2R71A 3K02A 4U2RA 3HPIA 4AB6A 2P2AA 1A54A 3IB0A 2HFBA 2XD2A 4U1ZA 1MQDA 4M4GA 4MLQA 4ZDMA 5JK4A 2F7BA 3SEYA 3PPRA 2GHAA 5B7DA 4MF3A 1Y1ZA 3C35A 2ABHA 1ZBMA 3H6TA 2A5SA 2I49A 3TTLA 2QS3A 1SI0A 5CRYA 1ATGA 2HQ0A 1II5A 3SEUA 3USDA 1DPPA 1VFDA 2O7IA 3D4CA 5I57A 2V25A 2Z8DA 4C1TA 3LR1A 4PP0A 3IB1A 4DDDA 3H06B 4H8IA 2DVCA 4KI0E 4ZEIA 2Z23A 4N07A 4EDPA 2AL5A 1MG1A 3JYRA 1P1UA 1N7XA 2B3BA 4BDRA 2QRYA 2ZNTA 3RQTA 4G4PA 4AB5A 2ZNSA 4GFRA 4GL8A 3U8QA 1YCJA 1FQFA 3MC2A 3S4UA 1MPDA 3M3KA 3G3FA 2X26A 2RINA 2D3IA 1I6QA 2CMOA 3KG2A 2HZLA 1Y9UA 2RF1A 1ANFA 4FIMA 1LAFE 3FVGA 3TUSA 1QUIA 3S2VA 4IO4A 1SW5A 1MQHA 3PV0E 5AA3A 4NWDA 3VLWA 3TPAA 4ECFA 2ZYMA 1RYXA 3TCFA 4XKRA 1JEUA 2F6GA 4K3FA 2UVIA 3UGWA 5AA4A 3MBPA 1XVXA 2A5TA 2LAOA 5FHMA 3EQ1A 4DCXA 2OCUA 2V84A 3IK6B 3B6WA 3ECRA 5FHNA 1FTJA 4OMBA 2X7QA 1US4A 2V3UA 2ZMBA 2O68A 4Q8RA 3F11A 4LUBA 1FTMA 4GWOA 3GXAA 4ESXA 5I57B 1IUDA 2I4BA 4BDQA 3V89B 5K2YA 3QAXA 3N6TA 2PMSA 5HBCA 2B65A 2DSFA 5I2NA 2Y7KA 4NF6A 2O1MA 4YZZA 4EF2A 2THIA 4RY1A 1LGBC 1LCFA 1A40A 3Q25A 4JDFA 5CM6A 1BIYA 3DP8A 5TPAA 4H67A 4NTLA 1SW2A 1R9QA 1URSA 3H03A 1POY1 3CSBA 5H8FB 4F39A 2DWIA 3CVGA 1QUKA 4YKPA 1D4NA 1WODA 2I6EA 3C9HA 4OEVA 3N94A 5JTYB 4UACA 1USYH 3L6HA 4X9TA 3OEMA 5IKBA 4RK2A 1FQBA 5FTIA 1N0TA 2NVUB 4GXSB 3SKPA 4N6PA 4EXKA 4BDLA 3PU5A 4FEBA 4GIZA 5AA4B 2A5TB 3JZJA 1B40A 1AH5A 5EHSA 1FTLA 4NF5A 3EHUA 4IO3A 1B58A 3RN8A 5I58A 4G2ZA 3IAZA 4NEDA 5FHOA 3HCQA 4ZEDA 4DE8A 4O3AA 3K6UA 4ELRA 3BBRA 3QIMA 2PBWA 4KPTA 3UIFA 5AA2B 1IIWA 3DP4A 2DVZA 3EF7A 3OD7A 2WKYA 5J1DA 2HCAA 4IO7A 3PGFA 4Q5TA 1B51A 1ZMGA 3B7DA 4OERA 2XXQA 1MXUA 1QJMA 5H8QA 4R9FA 4WEPA 5TP9A 2F35A 4KYSA 4RPNA 4O3CA 3HV1A 4DXCA 4GRKA 3FJGA 3T9UA 1LCTA 5F7VA 3M8UA 2Y7PA 2QSXA 2DP8A 2D21A 1R6ZA 1P1WA 4H1XA 4R6HA 2I4CA 2UYFA 3V5AA 4ELOA 4H8JA 3PUVE 3T9HB 5CMCA 1MM7A 3EHSA 3E9XA 3O6IA 2F6PA 3R7XA 4OENA 3U93A 3PPPA 4ZS9A 3LSFB 3LUYA 3VVDA 4RK9A 2F34A 4YB5A 1O63A 1LAXA 4F3SA 1B7HA 5EHMA 3MPLA 4DXBA 2XXPA 3KN3A 4ZE8A 5BUUA 3FJ7A 4NF5B 4Z0IA 3QYTA 1N84A 1MXZA 3HHGA 3FVNA 1A8FA 2DWHA 3FJMA 3O9PA 3KGCA 3KBRA 2F97A 4DIGA 2Y7IA 1MXVA 1Y3PA 3KOTA 3TKDA 2ESNA 5I2KB 5M2VA 4I1DA 1S7YA 3MW0A 5CBSA 1MQIA 1NNFA 1N3WA 2Q9TA 2ZYOA 4C1UA 4FE8A 5TP9B 1B3EA 4GOTA 5DTBA 1MRPA 5AA2D 4RYAA 4JSOA 4PE5B 2CZLA 5CMMA 3S9NC 1FTKA 5H8HA 1MXYA 4U4XA 3T93B 4F2OA 3BKIB 4WEDA 2IEEA 2ZYKA 3IORA 5KZTA 1PBPA 5B70A 2V3QA 3RLFE 3THIA 4ZZEA 5L9OA 3N26A 1Y1MA 4QFOA 3G3JA 2Y84A 5CMKA 1PDAA 5ITOA 4YKKA 2FA7A 2O7UA 1LBBA 3O97A 4QRZA 3OO6A 4TLLB 2DQVA 1FQEA 2P1SA 4C0RA 4RNSA 3M3FA 3W15C 4F31B 4ZEBA 3K6WA 5IAIA 4MFIA 3O66A 1NFTA 1D9YA 4H65A 4OZ9A 5I84A 5K2XA 1MPBA 4R2BA 1ZKBA 2ONKE 3CI8A 1GR2A 3FZVA 1B7ZA 3MP8A 5I56A 3DLNA 4MH5A 1LB9A 3QUJA 5LOMA 3PUWE 2Q2AA 4GXAA 3FV2A 1IXHA 1PEBA 1SDXA 1XOCA 1ZLQA 1HSEA 4GQOA 3U92A 3ZS6A 3O6GA 3VVFA 2O84X 2R6GE 1MY4A 3L6GA 2XD3A 1AMFA 4LZ5A 4P0IA 3V8XB 1B05A 4JWXA 3RGYA 4PFYA 2RC8A 2OWTA 5ELVA 1OLAA 1FTOA 4EF1A 1P1OA 1MXWA 1MY1A 1FW0A 3RTFB 2XXRA 1GGGA 1US5A 2O69A 3CR9A 1JVXA 4YU0A 3K0VA 4ESWA 1GVCA 3KSJA 3OMBA 1XHYA 5KCJA 4GF8A 2VD3A 1JEVA 1TXFA 4R75A 3LSWA 1Z7ME 1PC3A 1B3LA 2H99A 4IGTA 3SETA 3JV9A 1LFHA 4JXIA 4OHNA 3B6QA 4QFLA 4DCYA 3K00A 4IY5A 2R9JA 5DEXA 4P0GA 3VXBA 2QS1A 1JW5A 3ODBA 2UVGA 3IOTA 4LONB 3G3GA 4PETA 1LLSA 3MZ9A 4POXA 4WXJA 4E0WA 3MVZA 3ONMA 1VE4A 3FATA 1MDP1 4U23A 2GHBA 3G3HA 5DYHA 4E0XA 1Y20A 4LA9A 5CI5A 3KFMA 3KN8A 2FYIA 1B46A 4ND9A 3TAJA 1B2HA 2PVUA 2I0CA 1S50A 2AL4A 4F1VA 5KDTA 1M5EA 2Z8EA 3A09A 1ELJA 2Q88A 3H7MA 2FNCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LFGA 2KLFA 5L8DA 2H25A 5KCJB 4PTKA 1P1NA 1YAEA 3FBPA 3VXCA 4DZ1A 1EZPA 3KJTA 4ZZAA 4GWSA 2XWOA 3Q29A 3PD8A 3TYHA 2KQZA 4QFKA 4PQJA 1LB8A 1IITA 1BK4A 4QBAA 1IMAA 1DK4A 1UQWA 3K1MA 3A29A 4I62A 3LC8A 4YMBA 3K1PA 1MXXA 2H4IA 4LZ8A 4KFQA 1QVSA 2QS2A 1J1NA 3OSRA 4YAHX 4LP2B 2OZZA 3IJOB 1N76A 2Y7RA 1B5IA 4LN5A 4RJZA 1JETA 3VLUA 5F1QA 4DI3D 1LBZA 2O51A 3PMWA 3HSTA 4AS5A 2XX8A 3I3VA 4F18A 3IOUA 2H98A 2Z8FA 1LAGE 2P3VA 4AQ4A 3C36A 3KEIA 4P9KA 2V4CA 3ZKKA 2V3TA 3PMVA 1M5FA 3U94A 1NH7A 2MKZA 5KDTB 1FPDA 2X7PA 5IZ3B 1JNFA 4U21A 2H9BA 3MZ1A 2OWSA 2E0SA 3E78A 1FPFA 4PDDA 1MQJA 1BKAA 3G3KA 4NN3A 1VDWA 1YTVA 4N17A 2XWKA 2E1SA 3G7WA 1TWYA 3IFAA 2CZHA 4IO6A 1RDZA 4GLIA 3OO8A 3V83A 3HO7A 4JVCA 2UVHA 1DOTA 1QKBA 3H4ZA 3ZKLA 1UTBA 4X48A 2D5WA 3SEXA 2FIEA 4G68C 3IX1A 1A99A 2DYXA 1B4HA 1FBEA 4F22A 1DSNA 1UTHA 4OEUA 4N91A 5I2NB 1BLFA 1G0IA 2OBGA 1N04A 1M5BA 4IGRA 1Y4TA 2F36A 4NF6B 2AYSA 3IOWA 4LVQA 4GWUA 3MQ9A 3O6HA 1XI6A 4ISUA 3DM0A 1ZU0A 4OANA 5TPAB 1FPJA 4G8HA 4H6DA 2OJTA 3EKIA 3VLVA 3O2AA 1SVXB 2O1LA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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