The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
48
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSSQNKKAIEELGNLIKANAEAWGADALARLFELHPQTKTYFSKFSGFEACNEQVKKHGKRVMNALADATHHLDNLHLHLEDLARKHGENLLVDPHNFHLFADCIVVTLAVNLQAFTPVTHCAVDKFLELVAYELSSCYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
PROTEIN (HEMOGLOBIN)
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| publication title |
Structures of the deoxy and CO forms of haemoglobin from Dasyatis akajei, a cartilaginous fish.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
48
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-03-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3WCP B; 2ZLX A; 4FC3 A; 2ZLV A; 3QJC A; 1SHR B; 4O2G A; 5HLU A; 1MTJ A; 1VXC A; 1Y35 B; 1QXE A; 2VLY A; 1JW8 A; 3WCW B; 1DTI A; 3TM3 A; 4FC3 B; 3UHX A; 1DXC A; 4X0L A; 2ZSX A; 1DO4 A; 3NML A; 1QXE B; 3MYN A; 1UIW A; 1YOH A; 2HHE A; 4NI0 B; 1NIH A; 1SI4 A; 3PIA B; 4HHB A; 1HBG A; 2BLJ M; 2GDM A; 3PT7 B; 5MBN A; 5HU6 A; 2HHE B; 3UH3 A; 4AVD A; 1XZU B; 2MYB A; 4UZV A; 2H8D A; 2EB8 A; 5EUI A; 3LB4 A; 1YEU B; 1HBB B; 1RQ4 A; 4HSX A; 2ZT3 A; 5JDO C; 2EVK A; 105M A; 3KMF A; 2VEE A; 3DHR B; 2H8D B; 1CIK A; 4U8U B; 4O4Z A; 1RQ4 B; 3CY5 B; 3HHB B; 2XYK A; 3AG0 A; 107M A; 3LQD B; 3A5A A; 3UH7 A; 3RJN B; 3S48 C; 1LFQ B; 3WCW C; 2HBG A; 2V1F A; 1IRD B; 1OFJ A; 6HBW A; 1MOC A; 3GLN A; 4F6J A; 5C6E A; 4VHB A; 4C44 A; 3TLD A; 1MNO A; 1HLM A; 2QU0 B; 1Y09 A; 1Y4P A; 1O1K B; 1HJT A; 1YVT A; 3QZX A; 4L2M A; 1PBX B; 3S1J A; 1CQ2 A; 1YE2 B; 1DUO A; 2B7H A; 1Y0T B; 1GBV A; 4U8U C; 3QJE B; 3M3A A; 1J41 A; 3M39 A; 1NWN A; 1Y31 A; 1HBR B; 4NK2 A; 1I3E A; 1YHU A; 3SZK A; 2GNV A; 2B7H B; 1T1N A; 2GRZ A; 1LJW A; 5CN4 A; 3FS4 A; 2QSS B; 3A59 A; 1AJ9 A; 3K8B A; 1YH9 B; 1XZ4 A; 5CN6 A; 3H58 A; 3IC0 A; 2MYD A; 3HRW A; 1LFL A; 4XS0 B; 1UFJ A; 3ORD A; 2LH7 A; 1AJ9 B; 1HHO B; 1QI8 B; 1QPW A; 1MTK A; 1OUU B; 2Z85 A; 1LFL B; 1G08 A; 2GKM A; 1EMY A; 1DKE A; 3S1I A; 3D1K B; 3PI2 A; 1G08 B; 4MXK A; 1CBM A; 1Y0C A; 1BZP A; 1FN3 A; 2G3H A; 5D5R A; 4PQB A; 1CP5 A; 1HGA A; 1CLS B; 1JL7 A; 1HCO A; 1XQ5 B; 1YOG A; 1X46 A; 2RAO B; 2Z6N A; 1LFY A; 2W31 A; 1GZX A; 4JYQ A; 1VRE A; 1AJH A; 1I3D A; 3DUT A; 3MJU B; 1YMC A; 3PT8 B; 1HBI A; 1VXH A; 1XZ5 B; 1CH9 A; 1XXT A; 3QJD A; 1CBL A; 1RTX A; 1Y7G A; 3K3U A; 1NQP B; 5EOH A; 2ZLW A; 1TU9 A; 1UT0 A; 1NZ4 A; 1BZ1 A; 1Y4R B; 1THB B; 2DN2 A; 4HRT B; 2VYW A; 2LH3 A; 1DXT A; 3E5O A; 1G0A A; 2DN2 B; 2QFN A; 4M4A B; 3QJB B; 3ONZ A; 1NWI A; 1A6G A; 1Y83 A; 1J3Z B; 2O5S X; 1DXT B; 1JPB A; 4B4Y A; 1V4X B; 1O1I A; 1G0A B; 3W4U B; 1MDN A; 2NSR A; 2V1J A; 1GCW A; 1UX9 A; 1HDB B; 1G9V A; 1MOD A; 2D6C A; 1Y0A B; 3VRE B; 4MQI A; 1M9P B; 5EU2 A; 1FCS A; 2XKG A; 101M A; 4N7O A; 3HEP A; 4BJA A; 2GRF A; 1V4U B; 5CNF A; 2HZ3 A; 4YU4 B; 1O1L A; 2W6X A; 2WY4 A; 1LTW A; 4MQI B; 1XZV B; 2H8F B; 2RI4 B; 1B86 A; 1NZ2 A; 2FAM A; 1MLK A; 1S6A A; 2G10 A; 1J7W A; 3MJP A; 3WCU D; 2KSC A; 5AB8 A; 1S0H B; 3A9M A; 2W6V A; 1CO8 A; 4H0B A; 3BJ2 A; 1O1N B; 5CN7 A; 3WCT D; 3ZHW A; 2R4W A; 1Y8W B; 1OR4 A; 3OO4 A; 1FAW B; 2MGH A; 2HBC A; 1LHS A; 1YEO B; 2VEB A; 1IDR A; 4G1B A; 3NFE A; 3OZU A; 1S56 A; 2HBC B; 3ARK A; 2OHA A; 1DLY A; 2W6Y A; 1FLP A; 1QSH B; 1C7B A; 3ODQ A; 2MGJ A; 3P5Q B; 3UBV A; 103M A; 2D5Z B; 3BA2 A; 1VHB A; 1A6N A; 1CG8 B; 4ODC B; 1Y46 A; 1Y45 A; 2M6Z A; 1Y8K B; 3WCV B; 2QMB A; 1V75 B; 4MXL A; 4NI1 A; 1HBH B; 3ZJS A; 4MU5 A; 5MBA A; 3UHH A; 4MQJ A; 4O4T A; 3BCQ A; 3MKB A; 1DWT A; 1GVH A; 3ED9 A; 2DN3 A; 1LA6 B; 3WFW A; 3HF4 B; 4NZI A; 1JDO A; 3GKT A; 1XYE A; 2ZT0 A; 1YGF B; 2VYY A; 3AQ5 A; 1IT3 A; 3VHB A; 1YGD B; 4MQH A; 1Y5F B; 1YFF A; 1Y4B B; 1Y01 B; 3OK5 A; 110M A; 1A01 B; 2R1H B; 3EOK A; 5JDO D; 2GTL D; 1GCV B; 4O35 A; 1CH4 A; 2BNL A; 1LFT A; 3VRG B; 3WCV C; 1YEN B; 3WCU A; 5JGG B; 1HRM A; 1MNK A; 2H35 B; 2ZS1 A; 1CH3 A; 1MNH A; 2SPM A; 1Y8I A; 1A9W E; 4IRO A; 2ZSR A; 1Y0W A; 1YEQ B; 1PMB A; 2AA1 B; 3WCU B; 4YU3 B; 1J40 B; 3R0G A; 1CMY A; 1Y0W B; 1YOI A; 3IA3 B; 3ZJI A; 2MGC A; 2AUO A; 4PQC A; 1RPS B; 3WCT B; 4O1T A; 3MN0 A; 3EDB A; 1G09 A; 3WHM B; 1O1J B; 1COH B; 4FWZ A; 2BW9 M; 2MGE A; 3GYS A; 3LB3 A; 2HBF B; 4F6B A; 1FHJ A; 1GJN A; 2LH5 A; 1G09 B; 3AT6 B; 2V1K A; 4M4B B; 2ZFB B; 4MQK A; 3A2G A; 2EF2 A; 1G0B A; 2XKH A; 1FSX B; 1RQ3 A; 3S66 A; 1A0U A; 1WLA A; 4MAX A; 3D7O A; 2ZLU B; 5CHR A; 3G4Y A; 1EBC A; 1Y5J B; 2PEG B; 3PI8 B; 3TM9 A; 3VRF B; 2DN1 B; 1YDZ A; 3M3B A; 1O1O A; 1Y4G A; 1MLM A; 1RTE A; 2ZSP A; 3ARL A; 3A0G A; 3BJ3 B; 2GNW A; 1SPE A; 4B3W A; 1MZ0 A; 2V1H A; 3WCT C; 1MLF A; 4UUR A; 1MYM A; 1NS9 B; 1RQA A; 3CIU A; 1O1O B; 4H2L B; 4MQC B; 1HBA B; 1HGB A; 3FH9 B; 1RSE A; 3HEN A; 4MQG B; 1YHE B; 1HSY A; 1C40 A; 4F6G A; 1HBS B; 1DWR A; 1MLN A; 1HAB A; 1NPF A; 1Q1F A; 2AV0 A; 1C40 B; 4TWU A; 3WCP A; 5HLQ A; 1CQX A; 2GTL B; 4DWT A; 4F6F A; 1SHR A; 5HY8 B; 4FH6 A; 1Y4Q B; 1HAB B; 2ZSS A; 1Y35 A; 1ECA A; 1A4F B; 3WCW A; 3ZJQ A; 3O89 A; 1ITH A; 3BJ1 B; 5D1V A; 1A0Z B; 1VWT B; 3ZJN A; 1MLL A; 3E4N A; 4NI0 A; 1LFV B; 1B0B A; 3PIA A; 1A6K A; 1OR6 A; 3PT7 A; 2MGM A; 1Y7D B; 1F63 A; 2EKT A; 3GQP B; 1SPG B; 1S5Y B; 1XZU A; 3IXF A; 5CNG A; 1DUK A; 1YEU A; 1HBB A; 2BK9 A; 1NZ5 A; 2MGG A; 4WJG 1; 1YG5 B; 1SDK A; 2FRF A; 3DHR A; 1JZK A; 4AVE A; 4U8U A; 1YIH B; 3CY5 A; 3HHB A; 3LR7 A; 2GTL C; 3LQD A; 1BBB B; 1SDK B; 1MYH A; 1QSI A; 3GDJ B; 3UH5 A; 1LFQ A; 2GLN A; 4DC7 A; 3H57 A; 1UX8 A; 1IRD A; 109M A; 3ARJ A; 3G4R A; 3UGY A; 1MWD A; 2ZT1 A; 1QSI B; 3PEL B; 1LH5 A; 1JP6 A; 3PI9 B; 1IWH B; 5B85 A; 4FWX A; 4WCH D; 1A00 B; 2HHD B; 2QU0 A; 3WR1 B; 1S5X B; 4F69 A; 2MGK A; 1O1K A; 1BVC A; 1MLU A; 1CH7 A; 1PBX A; 1GDI A; 1O1M B; 3RGK A; 1VXF A; 2ZFO B; 3D1A B; 1MLJ A; 1MBO A; 4ROL B; 1YE2 A; 1Y0T A; 2OIF A; 3QJE A; 3ASE A; 1HBR A; 2NSS A; 3ZJH A; 1JZM A; 2Z6S A; 1FSL A; 1CIO A; 2QSS A; 5EYS A; 3D4X A; 4HSW A; 1YH9 A; 4G51 B; 2DC3 A; 1H97 A; 4XS0 A; 2G0X A; 3D4X B; 1HHO A; 1JF4 A; 5B84 A; 1Y8H B; 1QI8 A; 3QM6 A; 1OUU A; 5KER B; 2WTG A; 1KFR A; 1HV4 B; 3A5G A; 3ZJM A; 1C7C B; 2PGH B; 1Y0D B; 1JP8 A; 2YRS B; 2ZFO C; 1N9H A; 3D1K A; 1K0Y B; 1VXG A; 4IT8 A; 5ILP A; 1XCH A; 1CLS A; 1Y5K B; 1F5P A; 2ZSZ A; 5EE4 D; 1XQ5 A; 2RAO A; 3GOU B; 1MLG A; 1N9F A; 5CNB A; 2W72 A; 5E6E B; 2FRI X; 3KUN A; 1F65 A; 2GL3 A; 3MJU A; 1O1P B; 3PT8 A; 3UGZ A; 1XZ5 A; 2W72 B; 4L7Y B; 2OH9 A; 1MYJ A; 1R1X A; 1WMU B; 3IC2 B; 2VLX A; 3NMM B; 1NQP A; 3OZV A; 1GDK A; 1LUE A; 1THB A; 1Y4R A; 4HRT A; 3UHG A; 3WCV D; 1BAB B; 1R1X B; 1MTI A; 2FRJ X; 1IT2 A; 112M A; 2ZLT B; 1BZ0 A; 3KUO A; 3DHT B; 1YCA A; 2ZS0 D; 1YE0 B; 3QJB A; 4M4A A; 1Y4V B; 1Y7Z B; 1J3Z A; 1V4X A; 3GQG B; 1BZ0 B; 3W4U A; 1R1Y A; 4WJG A; 2NRL A; 2DXM A; 4PNJ A; 1HDB A; 1LHT A; 1Y0A A; 1R1Y B; 1A3N B; 3VRE A; 3G4V A; 2HCO A; 1M9P A; 2DXM B; 2W72 C; 3AQ9 A; 4UIQ A; 1V4U A; 1KR7 A; 3OO5 B; 5CMV A; 4YU4 A; 2MGF A; 1UFP A; 1EBT A; 2HCO B; 4NS2 A; 1XZV A; 1GDJ A; 1YVQ B; 2H8F A; 3UH6 A; 2RI4 A; 1F5O A; 3QM9 A; 5HBI A; 2G12 A; 2HBS B; 5E29 B; 1ABY A; 1Y22 B; 2HBD B; 1S0H A; 1M6M A; 1GLI B; 4ROM B; 1ECN A; 1O1N A; 1ABY B; 2D60 A; 1Y8W A; 1MBC A; 2WTH A; 3NG6 B; 3UHK A; 1BIJ A; 1FAW A; 1MOH A; 2BMM A; 1NXF A; 1URV A; 2D60 B; 1YEO A; 1V4W B; 1MYZ A; 2D2N D; 1BIJ B; 4N7P B; 3UHI A; 1Y7C A; 3ZJJ A; 1QSH A; 1J3Y B; 3G46 A; 1JZL A; 1Y85 B; 3P5Q A; 1KD2 B; 2D5Z A; 1Y7C B; 3OZW A; 1CPW A; 3HXN B; 1CG8 A; 1JP9 A; 4ODC A; 1YCB A; 4N7N B; 4DC8 A; 1Y8K A; 3WCV A; 1V75 A; 1HBH A; 1GDL A; 2HZ1 A; 1HDS B; 2SPO A; 1XZ7 B; 4HBI A; 1AZI A; 2G0S A; 3BOM B; 1HGC B; 5SW7 B; 1MNJ A; 4KMW A; 1A6M A; 1LA6 A; 108M A; 2V1E A; 3HF4 A; 2ZS0 B; 5JOM A; 1YGF A; 4NXA A; 1ECD A; 2DHB B; 1HDA A; 5CNC A; 6HBI A; 3UHR A; 1YGD A; 5EE4 C; 2FRK X; 1Y5F A; 4NK1 A; 1Y4B A; 4FH7 A; 2HZ2 A; 5CN5 A; 1A01 A; 2R1H A; 1HDA B; 2VM0 A; 1W92 A; 4ESA B; 1GCV A; 3B75 B; 4TWV A; 4DWU A; 2QLS A; 1XZ2 B; 1NS6 B; 3VRG A; 1DXV B; 1YEN A; 1HAC A; 2IN4 A; 3RJ6 A; 5JGG A; 1BUW B; 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2Z6T A; 1J7Y B; 3BJ1 A; 1DXU B; 1A0Z A; 1VWT A; 1CG5 A; 1YHR A; 3HYU B; 2BKM A; 1LFV A; 1DO3 A; 2OHB A; 1BZR A; 1CG5 B; 1YHR B; 1Y7D A; 3OGB A; 3GQP A; 1SPG A; 3EU1 B; 4ILZ A; 1FDH G; 1S5Y A; 4KN3 A; 3D17 B; 3G4W A; 1ABW B; 1YHU D; 1YG5 A; 1YIE B; 2D2M A; 1IBE A; 3WFX A; 1YIH A; 2AUP A; 2ZLX B; 1GBU A; 2G0R A; 3UHB A; 2ZLV B; 1BBB A; 3QJC B; 2D2M B; 1IBE B; 3GDJ A; 1DWS A; 5EYJ A; 2G14 A; 1GBU B; 2G11 A; 2O5B X; 1ABS A; 4X0L B; 1MGN A; 1MWC A; 2LH6 A; 2BLH A; 1X3K A; 3PEL A; 3PI9 A; 1UIW B; 2MYE A; 1IWH A; 1NIH B; 1SI4 B; 4FWY A; 3G52 A; 4GZG A; 4HHB B; 7HBI A; 5ILM A; 1A00 A; 1S61 A; 2HHD A; 1MBI A; 5EV5 A; 3WR1 A; 1S5X A; 1ECO A; 5HU6 B; 1YMA A; 1LH2 A; 3QM7 A; 4KJT A; 2JHO A; 5EUI B; 1O1M A; 2ZFO A; 3QMA A; 3D1A A; 1NZ3 A; 2CMM A; 4ROL A; 2MB5 A; 2ZSY A; 2D2M C; 1CO9 A; 1BJE A; 1UVX A; 3NL7 A; 1UVY A; 3MYM A; 2G0Z A; 4G51 A; 6HBW B; 3E55 A; 1DLW A; 3UI0 A; 2O5L X; 3NL7 B; 5C6E B; 1TES A; 1Y8H A; 2EKU A; 1Y09 B; 5KER A; 2O58 X; 1JL6 A; 1Y4P B; 1HV4 A; 3VAU A; 1C7C A; 1YVT B; 2PGH A; 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